| Titre : | Towards built-in capture-recapture mixed models in program E-SURGE |
| Auteurs : | R. Choquet, Auteur ; O. Gimenez, Auteur |
| Type de document : | Article |
| Dans : | Journal of Ornithology (152 FEB 2012) |
| Article en page(s) : | S625-S639 |
| Langues: | Anglais |
| Résumé : | We consider the first steps towards implementing capture-recapture mixed models (CR2Ms) in program E-SURGE. The main issue when estimating the parameters of mixed models is that integrals associated with the random effects distributions need to be dealt with. Rather than using a Bayesian approach with Markov chain Monte Carlo and in line with Gimenez and Choquet (Ecology 91: 951-957, 2010), we show that a frequentist approach using numerical integration can be tractable when independent clusters of individuals can be identified. In this case, the maximum likelihood approach is time-efficient because the dimension of the integral for the likelihood is small. This allows us to integrate the likelihood by an efficient and appropriate quadrature method with a procedure for error control. Building on program E-SURGE (Choquet et al. in Modeling demographic processes in marked populations, volume 3 of Springer series: environmental and ecological statistics. Springer, Dunedin, 2009b), we extend the GEMACO language (Choquet in Can J Stat 36: 43-57, 2008) to incorporate random effects in a large set of capture-recapture models, including multievent models (Pradel in Biometrics 61: 442-447, 2005). To illustrate the flexible implementation of CR2Ms in E-SURGE, we consider two real examples, one with an individual random effect and one with group random effects. Future developments and limitations are also discussed. |
Bibliothèque Tour du Valat
Se connecter
La Tour du Valat
Institut de recherche pour la conservation des zones humides méditerranéennes- Les publications récentes de la Tour du Valat
- Catalogue en ligne du centre de ressources
- A la une
-
Sélections
- Les écrits de Luc Hoffmann, fondateur de la Tour du Valat
- Des références récentes sur les zones humides méditerranéennes
- Quelques exemples d'impact du changement climatique sur les zones humides
- Quelques références bibliographiques sur la grippe aviaire
- Les recherches de la Tour du Valat sur le saturnisme
- De récentes publications sur la Camargue
- Le fonds Camargue de la bibliothèque
- Coordination géographique
- Nous contacter
Infos pratiques
Heures d'ouverture et contact
Lundi , mardi et jeudi de 9h à 12h et de 13h à 17h00 : ouverture au public ...
Liens utiles
- 1 - Le site Internet de la Fondation Tour du Valat
- 2 - La base documentaire du Pôle-relais lagunes méditerranéennes
- 3 - Le site Internet consacré aux Oiseaux d'eau en région Méditerranée
- 4 - Le site Internet ObsNature Camargue -Crau-Alpilles - recueil de données d'observations naturalistes
- 5 - Le site Internet de MedWet, l’initiative pour les zones humides méditerranéennes
