| Titre : | Characterizing the phylogenetic structure of communities by an additive partitioning of phylogenetic diversity |
| Auteurs : | Olivier J. Hardy, Auteur ; Bruno Senterre, Auteur |
| Type de document : | Article |
| Dans : | Journal of Ecology (95(3) MAY 2007) |
| Article en page(s) : | 493-506 |
| Langues: | Anglais |
| Résumé : | 1 Analysing the phylogenetic structure of natural communities may illuminate the processes governing the assembly and coexistence of species in ecological communities. 2 Unifying previous works, we present a statistical framework to quantify the phylogenetic structure of communities in terms of average divergence time between pairs of individuals or species, sampled from different sites. This framework allows an additive partitioning of the phylogenetic signal into alpha (within-site) and beta (among-site) components, and is closely linked to Simpson diversity. It unifies the treatment of intraspecific (genetic) and interspecific diversity, leading to the definition of differentiation coefficients among community samples (e.g. I-ST, P-ST) analogous to classical population genetics coefficients expressing differentiation among populations (e.g. F-ST, N-ST). 3 Two coefficients which express community differentiation among sites from species identity (I-ST) or species phylogeny (P-ST) require abundance data (number of individuals per species per site), and estimators that are unbiased with respect to sample size are given. Another coefficient (Pi(ST)) expresses the gain of the mean phylogenetic distance between species found in different sites compared with species found within sites, and requires only incidence data (presence/absence of each species in each site). 4 We present tests based on phylogenetic tree randomizations to detect community phylogenetic clustering (P-ST > I-ST or Pi(ST) > 0) or phylogenetic overdispersion (P-ST |
Bibliothèque Tour du Valat
Se connecter
La Tour du Valat
Institut de recherche pour la conservation des zones humides méditerranéennes- Les publications récentes de la Tour du Valat
- Catalogue en ligne du centre de ressources
- A la une
-
Sélections
- Les écrits de Luc Hoffmann, fondateur de la Tour du Valat
- Des références récentes sur les zones humides méditerranéennes
- Quelques exemples d'impact du changement climatique sur les zones humides
- Quelques références bibliographiques sur la grippe aviaire
- Les recherches de la Tour du Valat sur le saturnisme
- De récentes publications sur la Camargue
- Le fonds Camargue de la bibliothèque
- Coordination géographique
- Nous contacter
Infos pratiques
Heures d'ouverture et contact
Lundi , mardi et jeudi de 9h à 12h et de 13h à 17h00 : ouverture au public ...
Liens utiles
- 1 - Le site Internet de la Fondation Tour du Valat
- 2 - La base documentaire du Pôle-relais lagunes méditerranéennes
- 3 - Le site Internet consacré aux Oiseaux d'eau en région Méditerranée
- 4 - Le site Internet ObsNature Camargue -Crau-Alpilles - recueil de données d'observations naturalistes
- 5 - Le site Internet de MedWet, l’initiative pour les zones humides méditerranéennes
