Grippe aviaire / Avian influenza

Effect of a previous high pathogenicity avian influenza (HPAIV) infection on the breeding success of Northern Gannets (Morus bassanus)

Wed, 18 Mar 2026 15:40:08

Effect of a previous high pathogenicity avian influenza (HPAIV) infection on the breeding success of Northern Gannets (Morus bassanus) [Article] / Sue Lewis, Auteur ; Emily Burton, Auteur ; James Butcher, Auteur ; Ian Cleasby, Auteur ; Amy King, Auteur ; Emma Marriott, Auteur ; Dave O'Hara, Auteur ; Maggie Sheddan, Auteur ; Mal Watson, Auteur ; Saskia Wischnewski, Auteur ; Lucy Wright, Auteur ; Sarah Wanless, Auteur ; Jude V. Lane, Auteur . - 2026 . - 361-368.Langues : Anglais (eng)in Ibis > 168(1) (January, 2026) . - 361-368

Mots-clés libres :	bird flu demography disease reproductive performance seabird ecology
Résumé :	Highly pathogenic avian influenza (HPAIV) caused widespread mortality and breeding failure among many wild, avian populations in Europe and North America in 2021–2023, but most populations exhibited a marked reduction in mortality in the year following an outbreak, suggesting that surviving individuals may have developed immunity. A critical mechanism for population resilience is whether individuals that have survived the disease show reduced breeding success because of the potential costs associated with recovery, notably elevated immune defence. We found that, at two UK colonies, the breeding success of Northern Gannets Morus bassanus with black eyes (an indicator of past exposure to HPAIV) was similar to those with normal blue eyes in the year following a severe disease outbreak, suggesting that population recovery may not be hampered by lower reproductive performance of recovered individuals compared to those that were unexposed. However, breeding success, irrespective of past exposure, was lower than the long-term average, suggesting potential carry-over effects on all individuals from the extensive disruption caused by the epidemic the previous year.
DOI :	DOI : 10.1111/ibi.13449
En ligne :	https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/ibi.13449
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356 - Autumn, 2025 (Bulletin de BTO News)

Wed, 10 Sep 2025 14:41:29

est un bulletin de BTO News 356 - Autumn, 2025 [Périodique] . - 2025.Langues : Anglais (eng)

Mots-clés :	Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Europe:Europe Occidentale:Royaume-Uni
Index. décimale :	[Plan de classement] 2B/8 - revue d'ornithologie
Résumé :	Sommaire Editorial - Musings from the magazine Editor. News - The latest B10 stories and snippets. Insight - Views from our CEO, Juliet Vickery, and readers' letters. Youth - News and views from and for our younger supporters. On the wing - Seasonal birding nighlights and activities. Opinion - Why it's important to build connected lives. Garden BirdWatch - Looking back and forward as GBW turns 30. Nest predation - Camera traps shed light on nest predators. Farmland birds - BTO work on the Welsh agri-environment scheme. Masterclass - Marc Gilles on avian olfaction. Gull feeding - How gulls are responding to human changes Field craft - Making birding accessible for everyone. Bird flu - BTO's role and learnings from the last four years. Membership - A member remembers BTO in her will
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Immature Northern Gannets (Morus bassanus) increase colony attendance following highly pathogenic avian influenza

Wed, 3 Dec 2025 12:11:45

Immature Northern Gannets (Morus bassanus) increase colony attendance following highly pathogenic avian influenza [Article] / Madeline P. Sceviour, Auteur ; Christopher R. E. Ward, Auteur ; Sabina I. Wilhelm, Auteur . - 2025 . - 711-719.Langues : Anglais (eng)in Ibis > 167(3) (July, 2025) . - 711-719

Mots-clés libres :	avian flu immature population recruitment seabirds
Résumé :	The emergence of Highly Pathogenic Avian Influenza (HPAI) H5N1 in wild bird populations in 2020 changed the landscape of this disease for seabird populations, including Northern Gannets Morus bassanus. In 2023, we photographed the three Northern Gannet colonies in Newfoundland and Labrador, Canada (Funk Island, Baccalieu Island and Cape St Mary's), following an HPAI outbreak in 2022 and documented an overall 43% decline in apparently occupied sites (AOS) from the last population survey in 2018. During the photo analyses, we assigned immature birds present in the core breeding area to one of four age categories according to their plumage characteristics, and estimated that 9% (inter-colony variance ranging from 7 to 14%) of all AOS in 2023 hosted at least one immature bird, an increase compared with rates of 2% or less before the outbreak. Further, 16% of all immature birds present in the core breeding area showed evidence of breeding and were probably 2- and 3-year-old birds. Our results support the social competition theory whereby a higher proportion of immature and/or younger immature birds occupying an AOS within the core breeding area is observed following significant reductions in numbers of established breeders, suggesting the presence of a pool of immature birds capable of recruiting into the Newfoundland Northern Gannet breeding population and help its recovery.
DOI :	DOI : 10.1111/ibi.13390
En ligne :	https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/ibi.13390
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Emergence and interstate spread of highly pathogenic avian influenza A(H5N1) in dairy cattle in the United States

Wed, 14 May 2025 15:51:26

Emergence and interstate spread of highly pathogenic avian influenza A(H5N1) in dairy cattle in the United States [Article] / Thao-Quyen Nguyen, Auteur ; Carl R. Hutter, Auteur ; Alexey Markin, Auteur ; Megan Thomas, Auteur ; Kristina Lantz, Auteur ; Mary Lea Killian, Auteur ; Garrett M. Janzen, Auteur ; Sriram Vijendran, Auteur ; Sanket Wagle, Auteur ; Blake Inderski, Auteur ; Drew R. Magstadt, Auteur ; Ganwu Li, Auteur ; Diego G. Diel, Auteur ; Elisha Anna Frye, Auteur ; Kiril M. Dimitrov, Auteur ; Amy K. Swinford, Auteur ; Alexis C. Thompson, Auteur ; Kevin R. Snevkik, Auteur ; David L. Suarez, Auteur ; Steven M. Lakin, Auteur ; Stacey Schwabenlander, Auteur ; Sara C. Ahola, Auteur ; Kammy R. Johnson, Auteur ; Amy L. Baker, Auteur ; Suelee Robbe-Austerman, Auteur ; Mia Kim Torchetti, Auteur ; Tavis K. Anderson, Auteur . - 2025 . - page 380.Langues : Anglais (eng)in Science > 388(6745) (25 April 2025) . - page 380

Mots-clés :	Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé:Maladie:Transmission maladie
Résumé :	Le sous-type H5N1 de la grippe aviaire hautement pathogène est désormais présent dans tous les États-Unis, et peut-être même au-delà. La multiplication des infections bovines accroît le risque de transmission interhumaine du virus, potentiellement associée à des taux de mortalité élevés. Nguyen et al. montrent qu'à partir d'une seule transmission d'un oiseau sauvage à des vaches laitières en décembre 2023, il y a eu une transmission du bétail à la volaille, du bétail à l'oiseau péridomestique et du bétail à d'autres mammifères. Le déplacement de vaches laitières asymptomatiques a facilité la dissémination rapide du virus H5N1 du Texas à travers les États-Unis. L'évolution au sein des bovins, évaluée à l'aide de données de séquençage profond, a permis de détecter des variants de séquences à basse fréquence qui étaient auparavant associés à l'adaptation et à l'efficacité de la transmission des mammifères.—Caroline Ash
En ligne :	https://www.science.org/doi/10.1126/science.adq0900
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Global influenza threatens conservation

Fri, 22 Nov 2024 11:34:53

Global influenza threatens conservation [Article] / Jonathan Runstadler, Auteur . - 2024 . - 618-619.Langues : Anglais (eng)in Science > 386(6722) (8 November 2024) . - 618-619

Mots-clés :	Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Animalia:Aves ; Impact environnement ; Biodiversité
DOI :	DOI : 10.1126/science.adj1190
En ligne :	https://www.science.org/doi/10.1126/science.adj1190
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H5N1 Avian Influenza Outbreak Caused Massive Mortality of Chicks of Sandwich Tern Thalasseus sandvicensis in the Lagoon of Venice

Fri, 6 Dec 2024 10:40:06

H5N1 Avian Influenza Outbreak Caused Massive Mortality of Chicks of Sandwich Tern Thalasseus sandvicensis in the Lagoon of Venice [Article] / Roberto G. Valle, Auteur ; Giovanni Carretta, Auteur ; Stefano Zelco, Auteur ; Vittorio Selle, Auteur ; Francesco Scarton, Auteur . - 2024.Langues : Anglais (eng)in Ardea > 112(2) (October, 2024)

Mots-clés :	Europe:Europe Occidentale:Italie ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Animalia:Aves:Charadriiformes:Laridae:Thalasseus sandvicensis
DOI :	DOI : 10.5253/arde.2024.a5
En ligne :	https://bioone.org/journals/ardea/volume-112/issue-2/arde.2024.a5/H5N1-Avian-Inf [...]
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Predicting bird flu

Thu, 4 Jan 2024 10:36:56

Predicting bird flu [Article] / Stephen R. Baillie, Auteur ; Jacob Davies, Auteur ; R. Robinson, Auteur . - 2024 . - 12-15.Langues : Anglais (eng)in BTO News > 349 (Winter 2023) . - 12-15

Mots-clés :	Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Outil technique:SIG:Cartographie ; Outil technique:Statistique:Modèle
Résumé :	Avian flu represents both a serious problem for bird conservation and a significant threat to domestic poultry. Now, for the first time, we have a system for predicting outbreaks on a European scale in close to real time.
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High pathogenicity avian influenza (H5N1) in Northern Gannets (Morus bassanus): Global spread, clinical signs and demographic consequences

Tue, 24 Oct 2023 18:08:18

High pathogenicity avian influenza (H5N1) in Northern Gannets (Morus bassanus): Global spread, clinical signs and demographic consequences [Article] / Jude V. Lane, Auteur ; Jana W.E. Jeglinski, Auteur ; Stephanie Avery-Gomm, Auteur ; Elmar Ballstaedt, Auteur ; Ashley C. Banyard, Auteur ; Tatsiana Barychka, Auteur ; Ian H. Brown, Auteur ; Brigitte Brugger, Auteur ; Tori V. Burt, Auteur ; Noah Careen, Auteur ; Johan H.F. Castenschiold, Auteur ; Signe Christensen-Dalsgaard, Auteur ; Shannon Clifford, Auteur ; Sydney M. Collins, Auteur ; Emma Cunningham, Auteur ; Jóhannis Danielsen, Auteur ; Francis Daunt, Auteur ; Kyle J.N. D'entremont, Auteur ; Parker Doiron, Auteur ; Steven Duffy, Auteur ; Matthew D. English, Auteur ; Marco Falchieri, Auteur ; Jolene Giacinti, Auteur ; Britt Gjerset, Auteur ; Silje Granstad, Auteur ; David Grémillet, Auteur ; Magella Guillemette, Auteur ; Gunnar T. Hallgrimsson, Auteur ; Keith C. Hamer, Auteur ; Sjúrður Hammer, Auteur ; Katherine Harrison, Auteur ; Justin D. Hart, Auteur ; Ciaran Hatsell, Auteur ; Richard Humpidge, Auteur ; Joe James, Auteur ; Audrey Jenkinson, Auteur ; Mark Jessopp, Auteur ; Megan E.B. Jones, Auteur ; StéPhane Lair, Auteur ; Thomas Lewis, Auteur ; Alexandra A. Malinowska, Auteur ; Aly McCluskie, Auteur ; Gretchen McPhail, Auteur ; Børge Moe, Auteur ; William A. Montevecchi, Auteur ; Greg Morgan, Auteur ; Caroline Nichol, Auteur ; Craig Nisbet, Auteur ; Bergur Olsen, Auteur ; Jennifer Provencher, Auteur ; Pascal Provost, Auteur ; Alex Purdie, Auteur ; Jean-Francois Rail, Auteur ; Greg Robertson, Auteur ; Yannick Seyer, Auteur ; Maggie Sheddan, Auteur ; Catherine Soos, Auteur ; Nia Stephens, Auteur ; Hallvard Strøm, Auteur ; Vilhjálmur Svansson, Auteur ; T. David Tierney, Auteur ; Glen Tyler, Auteur ; Tom Wade, Auteur ; Sarah Wanless, Auteur ; Christopher R.E. Ward, Auteur ; Sabina I. Wilhelm, Auteur ; Saskia Wischnewski, Auteur ; Lucy J. Wright, Auteur ; Bernie Zonfrillo, Auteur ; Jason Matthiopoulos, Auteur ; Stephen C. Votier, Auteur . - 2023 . - 18.Langues : Anglais (eng)in Ibis > Online October (October, 2023) . - 18

Mots-clés :	Oiseaux marins ; Santé:Maladie ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Animalia:Aves:Suliformes:Sulidae:Morus bassanus ; Physiologie animale:Métabolisme:Immunité
Mots-clés libres :	avian flu disease immunity seabirds virus outbreak
Résumé :	During 2021 and 2022 High Pathogenicity Avian Influenza (HPAI) killed thousands of wild birds across Europe and North America, suggesting a change in infection dynamics and a shift to new hosts, including seabirds. Northern Gannets Morus bassanus appeared to be especially severely impacted, but a detailed account of the data available is required to help understand how the HPAI virus (HPAIV) spread across the meta-population, and the ensuing demographic consequences. Accordingly, we analyse information on confirmed and suspected HPAIV outbreaks across most North Atlantic Gannet colonies and, for the largest colony (Bass Rock, UK), provide impacts on population size, breeding success, and preliminary results on apparent adult survival and serology. Unusually high numbers of dead Gannets were first noted at colonies in Iceland during April 2022. Outbreaks in May occurred in many Scottish colonies, followed by colonies in Canada, Germany and Norway. By the end of June, outbreaks had occurred in colonies in Canada and the English Channel. Outbreaks in 12 UK and Ireland colonies appeared to follow a clockwise pattern with the last infected colonies recorded in late August/September. Unusually high mortality was recorded at 40 colonies (75% of global total colonies). Dead birds testing positive for HPAIV H5N1 were associated with 58% of these colonies. At Bass Rock, the number of occupied nest-sites decreased by at least 71%, breeding success declined by c. 66% compared with the long-term UK mean and the resighting of marked individuals suggested that apparent adult survival between 2021 and 2022 could have been substantially lower than the preceding 10-year average. Serological investigation detected antibodies specific to H5 in apparently healthy birds, indicating that some Gannets recover from HPAIV infection. Further, most of these recovered birds had black irises, suggestive of a phenotypic indicator of previous infection. Untangling the impacts of HPAIV infection from other challenges faced by seabirds is key to establishing effective conservation strategies for threatened seabird populations as the likelihood of further epizootics increases, due to increasing habitat loss and the industrialization of poultry production.
DOI :	DOI : 10.1111/ibi.13275
En ligne :	https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/ibi.13275
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=62355

Highly pathogenic avian influenza in wild birds in the United Kingdom in 2022 (2023)

Mon, 13 Mar 2023 15:16:58

Highly pathogenic avian influenza in wild birds in the United Kingdom in 2022 : impacts, planning for future outbreaks, and conservation and research priorities. [Ouvrage] / James W. Pearce-Higgins, Auteur ; Elizabeth M. Humphreys, Auteur ; Niall H.K. Burton, Auteur ; Philip W. Atkinson, Auteur ; Chris Pollock, Auteur ; Gary D. Clewley, Auteur ; Daniel T. Johnston, Auteur ; Nina J. O’Hanlon, Auteur ; Dawn E. Balmer, Auteur ; Teresa M. Frost, Auteur ; Sarah J. Harris, Auteur ; Helen Baker, Auteur ; British Trust for Ornithology, Auteur . - British Trust for Ornithology, 2023 . - 92.ISBN : 978-1-912642-47-2Report on virtual workshops held in November 2022Langues : Anglais (eng)

Mots-clés :	Europe:Europe Occidentale:Royaume-Uni ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Biodiversité:Faune sauvage ; Protection environnement:Protection faune
Résumé :	The Joint Nature Conservation Committee (JNCC) / British Trust for Ornithology (BTO) organised a virtual workshop to develop thinking to support ongoing efforts to manage the avian influenza outbreak and also to consider longer-term evidence requirements to enable positive conservation actions and species recovery. The UK workshop on wild birds sought to bring practitioners and experts together to: (i) identify whether there are any short- or medium-term (conservation) management interventions that could be beneficial; ii) consider whether there are novel longer-term management interventions that could be prioritised to address HPAI impacts and increase population resilience in impacted species; (iii) share experiences in collecting data on mortality in different species groups and consider what future mortality monitoring could look like; (iv) discuss what developments would be beneficial for UK bird monitoring schemes for improving understanding of impacts, including demographic parameters, and identify where these schemes are unlikely to meet these needs; (v) assess the impact of loss of data, resulting from restrictions to field work in 2022, from national monitoring schemes and research on species assessments, indicators, and marine management and, (vi) outline what new research areas could help us understand the effects of HPAI on populations, improve risk assessments, and how it could improve management for species conservation and recovery in future.
En ligne :	https://www.bto.org/hpai-workshop-report
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=61169

Surveillance of Highly Pathogenic Avian Influenza Viruses (H5Nx Subtypes) in Wild Birds in Iran, 2014-2019

Mon, 25 Oct 2021 14:36:39

Surveillance of Highly Pathogenic Avian Influenza Viruses (H5Nx Subtypes) in Wild Birds in Iran, 2014-2019 [Article] / S. M. Marashi, Auteur ; N. Sheykhi, Auteur ; H. Modirrousta, Auteur ; Gh Nikbakht Broujeni, Auteur ; M. Vasfimarandi, Auteur ; S. Fereidouni, Auteur . - 2021 . - 487-498.Langues : Anglais (eng)in Archives of Razi Institute > 76(3) (September, 2021) . - 487-498

Mots-clés :	Asie:Moyen-Orient:Iran ; Animalia:Aves ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Biodiversité:Faune sauvage
Résumé :	After the emergence of the highly pathogenic avian influenza viruses (HPAIV) subtypes H5N6 in 2013 and H5N8 in 2014, a surveillance study using molecular epidemiology approaches was carried out during 2014 – 2019 in Iran to discover any potential introduction or outbreak of HPAIV in wild bird populations. All sick and dead wild birds found in nature, or in cases of an outbreak, a collection of representative samples was tested using the specific molecular methods for HPAIV H5 subtypes. Additionally, wild bird species in wetlands, several zoos, zoological gardens, or rehabilitation centers were tested for HPAIV. During the active surveillance plan, several individual and outbreak cases of HPAIV and orthoavulaviruses were identified. In general, more than 900 fecal materials, cloacal and oropharyngeal swabs, and/or tissue samples were collected from apparently healthy live birds representing several different species and families. In addition, tissue and swab samples were collected and investigated from any reported wild birds’ mortality cases in different parts of Iran in the framework of this study. No positive bird was found among apparently healthy live birds; however, the highly pathogenic influenza viruses of H5N1, H5N2, H5N6, and H5N8 were found in individual dead birds or mass die-off cases.
DOI :	DOI : 10.22092/ari.2020.341897.1441
En ligne :	https://archrazi.areeo.ac.ir/article_122407.html
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État de l’art des données disponibles sur le lac de Grand-Lieu en vue d’une modélisation de la dynamique des virus influenza A par une approche hydrologique et épidémiologique. (2019)

Wed, 25 Sep 2019 16:48:39

État de l’art des données disponibles sur le lac de Grand-Lieu en vue d’une modélisation de la dynamique des virus influenza A par une approche hydrologique et épidémiologique. [Mémoire] / David Centis, Auteur . - Montpellier : Université de Montpellier, 2019 . - 31.Master 1, Emergence des maladies parasitaires et infectieusesLangues : Français (fre)

Mots-clés :	TdV ; Europe:Europe Occidentale:France:Pays de la Loire ; Ecosystème aquatique:Milieu dulçaquicole:eau douce:lac ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Dynamique population:Dispersion ; Outil technique:Statistique:Modèle
Index. décimale :	D1 Écologie de la santé
Encadrants :	Marion Vittecoq, Olivier Boutron
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Modélisation du devenir des virus Influenza A au sein des zones humides : coupler hydrodynamique et épidémiologie (2018)

Mon, 3 Feb 2020 17:39:09

Modélisation du devenir des virus Influenza A au sein des zones humides : coupler hydrodynamique et épidémiologie [Mémoire] / Hélène Baudel, Auteur . - Toulouse, France : Université Paul Sabatier, 2018 . - 29.Master 2 - Modélisation des Systèmes EcologiquesLangues : Français (fre)

Mots-clés :	TdV ; Europe:Europe Occidentale:France:Provence-Alpes-Côte d'Azur:Camargue ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé:Maladie:Transmission maladie ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae ; Hydrologie:hydrobiologie ; Gestion milieu:Gestion eau
Résumé :	Les oiseaux sauvages sont le principal réservoir des virus influenza A (VIA) et peuvent les transmettre aux volailles d’élevage, chez lesquelles certaines souches hautement pathogènes entraînent des pertes économiques considérables. La connaissance de la transmission et de la persistance des VIA dans le milieu naturel demeure lacunaire. Nous avons développé un modèle mathématique qui tient compte à la fois de l’épidémiologie des VIA chez leurs hôtes et de leur circulation et persistance dans l’eau. Les paramètres sur lesquels se base notre modèle sont les effectifs de colverts et leur distribution, les volumes d’eau, les températures et salinité de l’eau et la prévalence d’infection virale dans la région Camargue, site majeur d’hivernage pour les oiseaux sauvages. L’originalité du modèle est la précision spatiale et temporelle avec laquelle notre système, l’hydro-système Vaccarès, est décrit. Les résultats suggèrent que la voie de transmission qui influe majoritairement sur la dynamique d’infection sur notre site d’étude est la voie oro-fécale via l’ingestion d’eau contaminée par des fèces de canards infectés. Quelques zones spatialement réduites expliquent la plupart de la dynamique de transmission sur le site, associant effectifs importants et concentration de virus élevée. Les flux d’eau ainsi que les conditions de température et de salinité de l’hydrosystème, extrêmement variables, influent de façon notable sur la dynamique de transmission. Ces résultats soulignent l’importance d’intégrer le compartiment aquatique à la surveillance de la circulation du virus au sein des populations d’oiseaux sauvages afin d’optimiser la détectabilité du virus.
Encadrants :	Marion Vittecoq/Olivier Boutron
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Modeling the spread of avian influenza viruses in aquatic reservoirs: A novel hydrodynamic approach applied to the Rhône delta (southern France)

Fri, 21 Apr 2017 11:54:11

Modeling the spread of avian influenza viruses in aquatic reservoirs: A novel hydrodynamic approach applied to the Rhône delta (southern France) [Article] / Marion Vittecoq, Auteur ; Hermann Gauduin, Auteur ; Thibault Oudart, Auteur ; Olivier Bertrand, Auteur ; Benjamin Roche, Auteur ; Matthieu Guillemain, Auteur ; Olivier Boutron, Auteur . - 2017 . - 787-800.Langues : Anglais (eng)in Science of The Total Environment > 595 (octobre 1, 2017) . - 787-800

Mots-clés :	TdV
Mots-clés libres :	Avian influenza viruses Hydrodynamic model Wetlands Wild birds mallards
Résumé :	Wild aquatic birds represent a natural reservoir of avian influenza viruses (AIV) that can be spread to poultry. AIV epizootics were associated with huge economic impacts during the last decades and are still of major concern. Within aquatic bird populations AIV are transmitted either by direct contact or through the ingestion of water that has been contaminated by infected individuals. This second route involving environmental transmission is of utmost importance in AIV dynamics, yet it has received far less attention than direct bird-to-bird contamination. Our objective was to combine a hydrodynamic model with data on mallard abundance and AIV infection rate within the population, so as to characterize virus dissemination within a complex wetland network. We chose the Vaccarès hydrosystem as a wetland model since it represents a large part of the Camargue region, which is a major wintering site for a large diversity of aquatic birds including AIV hosts. We aimed to identify the environmental parameters that drive AIV dynamics within this system and the spatio-temporal pattern of dispersion and persistence of viruses. Our results show that in a complex hydrosystem we can expect a great heterogeneity in AIV risk among wetlands. Our simulations underline how a simple “homogeneous box” approach could in the case of deltaic ecosystems minimize the expected risk by diluting it in the whole system. Moreover, such undermining of the risk perception could affect the predictions relative to risk duration. We present a new approach to identify hotspots of virus concentrations within deltaic areas that could take advantage of the duck count data, AIV surveys and hydrodynamic models that may already be available in several major duck wintering areas comprised of complex hydrosystems, such as the large European deltas. Our method could be of particular interest to optimize surveillance strategies in the current context of highly pathogenic AIV diffusion within wild bird populations. / Les auteurs ont modélisé le devenir des virus des grippes aviaires dans l’hydrosystème Vaccarès selon différents scénarios.Ils ont couplé les données hydrologiques du système avec celles dont nous disposons sur la présence des canards hôtes des virus Influenza A, agents des grippes aviaires, sur leur taux d’infection par ces virus et sur la persistance dans l’eau de ces derniers. Ils ont ensuite étudié comment se répartissaient les virus dans les différentes parties de l’hydrosystème Vaccarès en fonction de leur lieu et de leur date d’arrivée. Il s’agit d’une première étape dans le développement d’un outil de modélisation des dynamiques des VIA dans l’eau en Camargue qui pourra à terme contribuer à optimiser la surveillance et à guider les prises de décision en cas de crise.
DOI :	DOI : 10.1016/j.scitotenv.2017.03.165
En ligne :	http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0048969717306848
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Épisode H5N8 d’influenza aviaire en France en 2016-2017: quel rôle pour la faune sauvage? / Avian influenza H5N8 episode in France in 2016-2017: what was the role of wildlife?

Fri, 8 Sep 2017 11:53:47

Épisode H5N8 d’influenza aviaire en France en 2016-2017: quel rôle pour la faune sauvage? / Avian influenza H5N8 episode in France in 2016-2017: what was the role of wildlife? = Épisode H5N8 d’influenza aviaire en France en 2016-2017 [Article] / Anne Van De Wiele, Auteur ; Antoine Humeau, Auteur ; Anne Bronner, Auteur ; Matthieu Guillemain, Auteur ; Guillaume Le Loc’h, Auteur ; Jean-Luc Guérin, Auteur ; Julien Cauchard, Auteur ; Alizé Mercier, Auteur ; Didier Calavas, Auteur . - 2017.Langues : Français (fre)in Bulletin épidémiologique : santé animale, alimentation > 79 (Juillet 2017)

Mots-clés :	Animalia:Aves ; Europe ; Biodiversité:Faune sauvage ; Agriculture:Elevage ; Suivi:Captivité ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire
Mots-clés libres :	Avian influenza, H5N8 virus, Wildbirds, Influenza aviaire, virus H5N8, avifaune
Résumé :	L’influenza aviaire (IA) est une menace permanente, qui arrive parfois en Europe par le biais des oiseaux migrateurs. Un dispositif de surveillance est en place en permanence pour surveiller les mortalités dans l’avifaune, et particulièrement celles des oiseaux d’eau migrateurs. En octobre 2016, un épisode d’IA H5N8 qui était surveillé depuis sa survenue en République de Touva (Fédération de Russie, avril 2016) s’est déclaré en Europe. Il a entraîné des pertes conséquentes dans certaines populations d’oiseaux sauvages en Europe, ainsi que dans des filières avicoles. La situation en France s’est révélée paradoxale : l’atteinte a été majeure dans la filière avicole de canards gras du Sud- Ouest, mais les cas dans la faune sauvage sont restés peu nombreux et circonscrits. Ce n’est pas faute d’avoir renforcé la surveillance, soit événementielle (analyse des oiseaux trouvés morts) soit active autour des foyers domestiques. Plus de 800 cadavres d’oiseaux sauvages ont été analysés, dont beaucoup d’anatidés, 90 ont été détectés infectés regroupés en 55 cas dans l’avifaune libre et captive, et dix sites stratégiques ont fait l’objet d’une recherche intensifiée des cadavres et n’ont permis de trouver aucun cas positif supplémentaire. Plus de 300 oiseaux commensaux des élevages domestiques foyers ont été analysés et se sont tous révélés négatifs. Les performances du système de surveillance ne semblent pas pouvoir être mises en cause, et il apparaît donc qu’il y a bien eu des différences de circulation du virus par rapport à nos voisins d’outre-Rhin, mal expliquées à ce stade mais la situation en France est similaire à celle observée en Italie et en Espagne cet hiver, et correspond assez bien à l’épisode H5N8 qui avait circulé en Europe fin 2014/début 2015, sans toucher la France./ Avian influenza (AI) is a constant threat that sometimes enters Europe through migratory wild birds. A surveillance system is in place to continuously monitor the mortality of wild birds, particularly migratory waterbirds. In October 2016, an AI H5N8 episode that had been monitored since its emergence in the Tuva Republic (Russian Federation, April 2016) was found to have reached Europe. It has led to substantial losses in some wild bird populations throughout Europe, as well as in the poultry sector. The situation in France has proved to be contradictory: there was a significant impact on the fattening-duck industry in the southwest, but the cases in wild birds were few in number and geographically limited to specific areas. This was not due to a lack of surveillance which had been enhanced at that time, both event-based (analysis of wild birds found dead) and active surveillance around infected farms. Over 800 wild bird cadavers were analysed, mainly from the Anatidae: 90 were found H5N8 positive and regrouped into 55 cases in wild and captive wild birds. Ten sentinel sites were thoroughly monitored for cadavers but no additional positive cases were detected. Over 300 commensal birds found near infected farms were analysed and were all negative. The performance of the surveillance system does not seem to be at fault. The circulation of the virus appears to be different from that observed in Germany and Switzerland although these differences remain to be clarified at this point. The situation in France is similar to that observed in Italy and Spain this winter, and corresponds in many ways to the H5N8 episode that circulated in Europe in late 2014 and early 2015, without affecting France.
En ligne :	http://bulletinepidemiologique.mag.anses.fr/sites/default/files/N-010_2017-08-11 [...]
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Role for migratory wild birds in the global spread of avian influenza H5N8

Tue, 31 Jan 2017 10:20:27

Role for migratory wild birds in the global spread of avian influenza H5N8 [Article] / The Global Consortium for H5N8 and Related Influenza Viruses, Auteur . - 2016 . - 213-217.Langues : Anglais (eng)in Science > 354(6309) (13 October 2016) . - 213-217

Résumé :	Migration of influenza in wild birds Virus surveillance in wild birds could offer an early warning system that, combined with adequate farm hygiene, would lead to effective influenza control in poultry units. The Global Consortium for H5N8 and Related Influenza Viruses found that the H5 segment common to the highly pathogenic avian influenza viruses readily reassorts with other influenza viruses (see the Perspective by Russell). H5 is thus a continual source of new pathogenic variants. These data also show that the H5N8 virus that recently caused serious outbreaks in European and North American poultry farms came from migrant ducks, swans, and geese that meet at their Arctic breeding grounds. Because the virus is so infectious, culling wild birds is not an effective control measure. Science, this issue p. 213; see also p. 174 Avian influenza viruses affect both poultry production and public health. A subtype H5N8 (clade 2.3.4.4) virus, following an outbreak in poultry in South Korea in January 2014, rapidly spread worldwide in 2014–2015. Our analysis of H5N8 viral sequences, epidemiological investigations, waterfowl migration, and poultry trade showed that long-distance migratory birds can play a major role in the global spread of avian influenza viruses. Further, we found that the hemagglutinin of clade 2.3.4.4 virus was remarkably promiscuous, creating reassortants with multiple neuraminidase subtypes. Improving our understanding of the circumpolar circulation of avian influenza viruses in migratory waterfowl will help to provide early warning of threats from avian influenza to poultry, and potentially human, health. High pathogenicity avian H5 influenza disperses around the Northern Hemisphere in long-distant migrant geese and ducks. High pathogenicity avian H5 influenza disperses around the Northern Hemisphere in long-distant migrant geese and ducks.
DOI :	DOI : 10.1126/science.aaf8852
En ligne :	http://science.sciencemag.org/content/354/6309/213
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Role for migratory wild birds in the global spread of avian influenza H5N8

Fri, 14 Oct 2016 16:40:33

Mots-clés :	Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Oiseaux d'eau ; Dynamique population:Migration ; Santé:Maladie:Transmission maladie
Résumé :	Avian influenza viruses affect both poultry production and public health. A subtype H5N8 (clade 2.3.4.4) virus, following an outbreak in poultry in South Korea in January 2014, rapidly spread worldwide in 2014–2015. Our analysis of H5N8 viral sequences, epidemiological investigations, waterfowl migration, and poultry trade showed that long-distance migratory birds can play a major role in the global spread of avian influenza viruses. Further, we found that the hemagglutinin of clade 2.3.4.4 virus was remarkably promiscuous, creating reassortants with multiple neuraminidase subtypes. Improving our understanding of the circumpolar circulation of avian influenza viruses in migratory waterfowl will help to provide early warning of threats from avian influenza to poultry, and potentially human, health.
En ligne :	http://science.sciencemag.org/content/354/6309/213
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Entretien avec françois renaud « l'élevage intensif favorise la grippe aviaire »

Mon, 30 Jan 2017 11:11:56

Entretien avec françois renaud « l'élevage intensif favorise la grippe aviaire » [Article] / Sophie Coisne, Auteur . - 2016 . - 50-53.Langues : Français (fre)in La Recherche > HS 19 (Octobre-novembre 2016) . - 50-53

Résumé :	En 2005, 150 millions de morts de la grippe aviaire étaient prédits. Dix ans plus tard, le bilan s'établit à moins de 500 morts, mais le virus réapparaît régulièrement dans les élevages. Le parasitologue François Renaud nous dresse un état des lieux.
En ligne :	http://www.larecherche.fr/entretien-avec-fran%C3%A7ois-renaud-%C2%AB-l%C3%A9leva [...]
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The role of breeding phenology and aggregation of waterfowl on avian influenza dynamics in southern Africa

Tue, 18 Oct 2016 13:48:35

The role of breeding phenology and aggregation of waterfowl on avian influenza dynamics in southern Africa [Article] / Josphine Mundava, Auteur ; Alexandre Caron, Auteur ; Michel de Garine-Wichatitsky, Auteur ; Celia Abolnik, Auteur ; Peter Mundy, Auteur ; Nicolas Gaidet, Auteur . - 2016 . - 762-775.Langues : Anglais (eng)in Ibis > 158(4) (October 2016) . - 762-775

Mots-clés libres :	Afrotropics host density host ecology juvenile immunological naïvety maintenance hosts
Résumé :	Recent outbreaks of highly pathogenic avian influenza virus (AIV) in birds, humans and other mammalian species calls for a better understanding of virus dynamics in wild bird species and populations that act as maintenance hosts. Host ecology influences the transmission of pathogens and can be used to explore and infer pathogen dynamics. Most of the ecological processes proposed to explain AIV transmission in wild birds have been derived from studies conducted in the temperate and boreal regions of the northern hemisphere. We evaluate the role of two key drivers of AIV dynamics in a waterfowl community in Zimbabwe (southern Africa): (1) the recruitment of young birds and (2) the seasonal aggregation of birds. We analyse the seasonal variation of AIV prevalence in waterfowl and overlay these data with the phenology of reproduction and the seasonal variation in the local abundance of these species. We find that the breeding period of southern Afrotropical waterfowl species is more extended and somewhat less synchronized among species in the community than is the case in temperate and boreal waterfowl communities. Young birds are recorded at most times of the year, and these immunologically naïve individuals can therefore act as new hosts for AIV throughout the year within the wild bird population. Although host aggregation peaks in the cold-dry to hot-dry season, birds still aggregate throughout the year and this potentially spreads the opportunities for first infection of juveniles and other naïve birds temporally. We did not find a relationship between season, AIV prevalence in waterfowl, the influx of juveniles or the gradual aggregation of birds during the dry season. Therefore, the main drivers of AIV dynamics (juvenile influx and host abundance/aggregation), although present in Afrotropical regions, could not explain the AIV seasonal patterns in our study in contrast to results reported from temperate and boreal regions. These differences imply variation in the risk of AIV circulation in waterfowl and in the risk of spread to poultry, other animals or humans.
En ligne :	http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/ibi.12404/abstract
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Blood and cloacal swab sampling for avian influenza monitoring has no effect on survival rates of free-ranging ducks

Mon, 17 Oct 2016 16:01:24

Blood and cloacal swab sampling for avian influenza monitoring has no effect on survival rates of free-ranging ducks [Article] / Matthieu Guillemain, Auteur ; Jocelyn Champagnon, Auteur ; Marie-Lucile Gourlay-Larour, Auteur ; Francois Cavallo, Auteur ; Anne-Laure Brochet, Auteur ; Jean Hars, Auteur ; Gregoire Massez, Auteur ; Thierry George, Auteur ; Pierre-Yves Perroi, Auteur ; Veronique Jestin, Auteur ; Alain Caizergues, Auteur . - 2016 . - 743-753.Langues : Anglais (eng)in Ibis > 158(4) (October 2016) . - 743-753

Mots-clés :	TdV ; Europe:Europe Occidentale:France ; Biotope:Zone humide ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae:Aythya:Aythya fuligula ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae:Aythya:Aythya ferina ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae:Anas:Anas platyrhynchos ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae:Anas:Anas crecca ; Suivi:Capture ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Suivi ; Méthodologie:Echantillonnage
Mots-clés libres :	Anatidae Avian influenza France Surveillance capture–recapture
Résumé :	Concerns about the spread of avian influenza viruses (AIVs) have led to cloacal swab sampling of hundreds of thousands of birds worldwide as part of AIV surveillance schemes, but the effects of cloacal swabbing have not been adequately evaluated. We tested for differences between swabbed, swabbed and bled, and non-sampled wild ducks in terms of live re-encounter and dead recoveries for Common Pochard Aythya ferina and Tufted Duck Aythya fuligula, and also determined re-encounter and recovery rates for Mallard Anas platyrhynchos and Common Teal Anas crecca. No effects of sampling methods were detected, except in Teal. Re-encounter rates were lower in sampled Teal than in controls, with annual re-encounter probabilities being 25% and 35% lower in males and females, respectively. Teal possibly left or avoided sampling sites, or sought sites where they were less detectable after sampling. In general, no deleterious effects were found, suggesting that cloacal swabbing and blood sampling are suitable methods for conducting AIV surveillance in ducks.
DOI :	Pubmed : 10.1111/ibi.12280
En ligne :	http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/ibi.12280/abstract
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Modelling the species jump: towards assessing the risk of human infection from novel avian influenzas

Mon, 22 Oct 2018 16:53:19

Modelling the species jump: towards assessing the risk of human infection from novel avian influenzas = Modelling the species jump [Article] / A. A. Hill, Auteur ; T. Dewé, Auteur ; R. Kosmider, Auteur ; S. Von Dobschuetz, Auteur ; O. Munoz, Auteur ; A. Hanna, Auteur ; A. Fusaro, Auteur ; M. De Nardi, Auteur ; W. Howard, Auteur ; K. Stevens, Auteur ; L. Kelly, Auteur ; A. Havelaar, Auteur ; K. Stärk, Auteur . - 2015 . - 150173.Langues : Anglais (eng)in Royal Society Open Science > 2(9) (2015/09/01) . - 150173

Résumé :	The scientific understanding of the driving factors behind zoonotic and pandemic influenzas is hampered by complex interactions between viruses, animal hosts and humans. This complexity makes identifying influenza viruses of high zoonotic or pandemic risk, before they emerge from animal populations, extremely difficult and uncertain. As a first step towards assessing zoonotic risk of influenza, we demonstrate a risk assessment framework to assess the relative likelihood of influenza A viruses, circulating in animal populations, making the species jump into humans. The intention is that such a risk assessment framework could assist decision-makers to compare multiple influenza viruses for zoonotic potential and hence to develop appropriate strain-specific control measures. It also provides a first step towards showing proof of principle for an eventual pandemic risk model. We show that the spatial and temporal epidemiology is as important in assessing the risk of an influenza A species jump as understanding the innate molecular capability of the virus. We also demonstrate data deficiencies that need to be addressed in order to consistently combine both epidemiological and molecular virology data into a risk assessment framework.
DOI :	DOI : 10.1098/rsos.150173
En ligne :	http://rsos.royalsocietypublishing.org/content/2/9/150173
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Interdisciplinarity and Infestious Diseases: an Ebola Case Study (2015)

Mon, 26 Oct 2015 10:02:24

Interdisciplinarity and Infestious Diseases: an Ebola Case Study [Article] / V. O. Ezenwa ; A.-H. Prieur-richard ; B. Roche ; X. Bailly ; P. Becquart ; G. E. Garcia-pena ; P. R. Hosseini ; F. Keesing ; A. Rizzoli ; G. Suzan ; M. Vignuzzi ; Marion Vittecoq ; J. N. Mills ; J.-F. Guegan . - 2015.

Mots-clés :	TdV ; Santé ; Santé:Virus ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Ecologie:Ecologie microbienne
DOI :	DOI : 10.1371/journal.ppat.1004992
Publisher :	Plso Pathog 11(8) open access
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Does the weather play a role in the spread of pandemic influenza? A study of H1N1pdm09 infections in France during 2009–2010 (2015)

Mon, 26 Oct 2015 10:02:23

Does the weather play a role in the spread of pandemic influenza? A study of H1N1pdm09 infections in France during 2009–2010 [Article] / Marion Vittecoq ; B. Roche ; J.-M. Cohen ; F. Renaud ; F. Thomas ; Michel Gauthier-Clerc . - 2015.

Mots-clés :	TdV ; Europe:Europe Occidentale:France ; Santé ; Climatologie:Climat ; Outil technique:Statistique:Modèle ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire
DOI :	DOI : 10.1017/S0950268815000941
Publisher :	Epidemiol Infect
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Laridae: A neglected reservoir that could play a major role in avian influenza virus epidemiological dynamics (2014)

Mon, 26 Oct 2015 10:02:30

Laridae: A neglected reservoir that could play a major role in avian influenza virus epidemiological dynamics [Article] / Audrey Arnal ; Marion Vittecoq ; J. Pearce-duvet ; Michel Gauthier-Clerc ; T. Boulinier ; E. Jourdain . - 2014.

Mots-clés :	TdV ; Animalia:Aves ; Animalia:Aves:Charadriiformes:Laridae ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Dynamique population:Dispersion
Publisher :	Crit Rev Microbiol
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Les canards colverts lâchés pour la chasse interagissent-ils avec les populations sauvages

Fri, 23 Feb 2018 11:56:59

Les canards colverts lâchés pour la chasse interagissent-ils avec les populations sauvages [Article] / Jocelyn Champagnon, Auteur ; Michel Gauthier-Clerc, Auteur ; Jean-Dominique Lebreton, Auteur ; Jean-Baptiste Mouronval, Auteur ; Matthieu Guillemain, Auteur . - 2013 . - 4-9.Langues : Français (fre)in Faune sauvage > 298 (2013) . - 4-9

Mots-clés :	TdV ; Europe:Europe Occidentale:France:Provence-Alpes-Côte d'Azur:Camargue ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae:Anas:Anas platyrhynchos ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé:Pathologie:Pathologie animale ; Dynamique population:mortalité ; Biologie:Génétique:Génétique population ; Chasse
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Understanding the ecological drivers of avian influenza virus infection in wildfowl: a continental-scale study across Africa

Thu, 10 Aug 2017 15:43:34

Understanding the ecological drivers of avian influenza virus infection in wildfowl: a continental-scale study across Africa = Understanding the ecological drivers of avian influenza virus infection in wildfowl [Article] / N. Gaidet, Auteur ; A. Caron, Auteur ; J. Cappelle, Auteur ; G. S. Cumming, Auteur ; G. Balanca, Auteur ; S. Hammoumi, Auteur ; G. Cattoli, Auteur ; C. Abolnik, Auteur ; R. Servan de Almeida, Auteur ; P. Gil, Auteur ; S. R. Fereidouni, Auteur ; V. Grosbois, Auteur ; A. Tran, Auteur ; J. Mundava, Auteur ; B. Fofana, Auteur ; A. B. Ould El Mamy, Auteur ; M. Ndlovu, Auteur ; Jean-Yves Mondain-Monval, Auteur ; Patrick Triplet, Auteur ; W. Hagemeijer, Auteur ; W. B. Karesh, Auteur ; S. H. Newman, Auteur ; T. Dodman, Auteur . - 2012 . - 1131-1141.Langues : Anglais (eng)in Proceedings of the Royal Society of London B: Biological Sciences > 279(1731) (2012/03/22) . - 1131-1141

Mots-clés :	Afrique ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Animalia:Aves ; Biodiversité:Faune sauvage
Résumé :	Despite considerable effort for surveillance of wild birds for avian influenza viruses (AIVs), empirical investigations of ecological drivers of AIV prevalence in wild birds are still scarce. Here we used a continental-scale dataset, collected in tropical wetlands of 15 African countries, to test the relative roles of a range of ecological factors on patterns of AIV prevalence in wildfowl. Seasonal and geographical variations in prevalence were positively related to the local density of the wildfowl community and to the wintering period of Eurasian migratory birds in Africa. The predominant influence of wildfowl density with no influence of climatic conditions suggests, in contrast to temperate regions, a predominant role for inter-individual transmission rather than transmission via long-lived virus persisting in the environment. Higher prevalences were found in Anas species than in non-Anas species even when we account for differences in their foraging behaviour (primarily dabbling or not) or their geographical origin (Eurasian or Afro-tropical), suggesting the existence of intrinsic differences between wildfowl taxonomic groups in receptivity to infection. Birds were found infected as often in oropharyngeal as in cloacal samples, but rarely for both types of sample concurrently, indicating that both respiratory and digestive tracts may be important for AIV replication.
DOI :	DOI : 10.1098/rspb.2011.1417
En ligne :	http://rspb.royalsocietypublishing.org/content/279/1731/1131
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Eco-Virological Approach for Assessing the Role of Wild Birds in the Spread of Avian Influenza H5N1 along the Central Asian Flyway

Mon, 7 Dec 2020 17:17:31

Eco-Virological Approach for Assessing the Role of Wild Birds in the Spread of Avian Influenza H5N1 along the Central Asian Flyway [Article] / Scott H. Newman, Auteur ; Nichola J. Hill, Auteur ; Kyle A. Spragens, Auteur ; Daniel Janies, Auteur ; Igor O. Voronkin, Auteur ; Diann J. Prosser, Auteur ; Baoping Yan, Auteur ; Fumin Lei, Auteur ; Nyambayar Batbayar, Auteur ; Tseveenmyadag Natsagdorj, Auteur ; Charles M. Bishop, Auteur ; Patrick J. Butler, Auteur ; Martin Wikelski, Auteur ; Sivananinthaperumal Balachandran, Auteur ; Taej Mundkur, Auteur ; David C. Douglas, Auteur ; John Y. Takekawa, Auteur ; Stephen G. Willis, Auteur . - 2012 . - e30636.Langues : Anglais (eng)in PLOS ONE > 7(2) (February, 2012) . - e30636

Mots-clés :	Biodiversité:Faune sauvage ; Animalia:Aves ; Dynamique population:Migration ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Dynamique population:Distribution
Mots-clés libres :	Animal migration Animal sexual behavior Asia Birds H5N1 Mongolia Phylogeography Poultry
Résumé :	A unique pattern of highly pathogenic avian influenza (HPAI) H5N1 outbreaks has emerged along the Central Asia Flyway, where infection of wild birds has been reported with steady frequency since 2005. We assessed the potential for two hosts of HPAI H5N1, the bar-headed goose (Anser indicus) and ruddy shelduck (Tadorna tadorna), to act as agents for virus dispersal along this ‘thoroughfare’. We used an eco-virological approach to compare the migration of 141 birds marked with GPS satellite transmitters during 2005–2010 with: 1) the spatio-temporal patterns of poultry and wild bird outbreaks of HPAI H5N1, and 2) the trajectory of the virus in the outbreak region based on phylogeographic mapping. We found that biweekly utilization distributions (UDs) for 19.2% of bar-headed geese and 46.2% of ruddy shelduck were significantly associated with outbreaks. Ruddy shelduck showed highest correlation with poultry outbreaks owing to their wintering distribution in South Asia, where there is considerable opportunity for HPAI H5N1 spillover from poultry. Both species showed correlation with wild bird outbreaks during the spring migration, suggesting they may be involved in the northward movement of the virus. However, phylogeographic mapping of HPAI H5N1 clades 2.2 and 2.3 did not support dissemination of the virus in a northern direction along the migration corridor. In particular, two subclades (2.2.1 and 2.3.2) moved in a strictly southern direction in contrast to our spatio-temporal analysis of bird migration. Our attempt to reconcile the disciplines of wild bird ecology and HPAI H5N1 virology highlights prospects offered by both approaches as well as their limitations.
DOI :	DOI : 10.1371/journal.pone.0030636
En ligne :	https://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0030636
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Circulation d'agents pathogènes en populations naturelles : approches éco-épidémiologiques chez le Goéland leucophée (Larus michaellis) (2012)

Tue, 25 Sep 2018 11:02:13

Circulation d'agents pathogènes en populations naturelles : approches éco-épidémiologiques chez le Goéland leucophée (Larus michaellis) [Thèse] / Audrey Arnal, Auteur . - Montpellier 2, 2012 . - 360.Thèse soutenue le 30-10-2012 à Montpellier 2 , dans le cadre de Systèmes Intégrés en Biologie, Agronomie, Géosciences, Hydrosciences, Environnement (Montpellier ; École Doctorale ; 2009-2015) , en partenariat avec Centre d'écologie fonctionnelle et évolutive (Montpellier) (laboratoire) Langues : Français (fre)

Mots-clés :	TdV ; Animalia:Aves:Charadriiformes:Laridae:Larus:Larus michahellis ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Pays méditerranéens ; Santé:Maladie:Transmission maladie ; Développement biologique:Oeuf ; Processus écologique:Parasitisme ; Physiologie animale:Métabolisme:Immunité ; Santé:Pathologie:Pathologie animale
Mots-clés libres :	Agents infectieux Antibodies Anticorps Eco-epidemiology Eco-épidémiologique Effets maternel Elisa Evolution, Ecologie, Ressources Génétiques, Paléontologie Flavivirus Goéland leucophée Infection Infectious agents Influenzavirus Maladies infectieuses Maternal effects Yellow-legged gull Zoonoses
Index. décimale :	D1 Écologie de la santé
Résumé :	L'émergence des zoonoses est à relier directement avec les perturbations générées par l'Homme sur son environnement naturel à plus ou moins grande échelle. Sur l'ensemble des zoonoses émergentes chez l'Homme, la majorité provient d'animaux sauvages. L'étude du rôle de la faune sauvage dans la circulation des agents pathogènes est donc cruciale en particulier quand les interfaces faune sauvage/Homme sont fortes. L'objectif de cette thèse a été de comprendre par des approches éco-épidémiologiques à large échelle, la circulation d'agents pathogènes dans les populations d'un oiseau sauvage en contact étroit avec l'Homme, le goéland leucophée (Larus michahellis). Le premier chapitre présente les différentes méthodes utilisées dans la surveillance d'agents pathogènes ainsi que leurs limites lorsqu'elles sont menées en populations naturelles. Ce chapitre met en évidence au travers d'une étude portant sur les virus influenza aviaires, que la quantification des anticorps maternels dans les œufs est un outil efficace. Le second chapitre consiste à élargir l'échelle spatiale de l'étude afin de mettre en évidence plus finement les facteurs éco-épidémiologiques influençant la transmission des virus influenza aviaires dans et entre les populations de goéland leucophée de l'ouest méditerranéen. Enfin, le dernier chapitre repose sur la comparaison des patrons d'expositions obtenus pour des agents pathogènes au mode de transmission vectoriel : les flavivirus. Cette thèse permet de mettre en évidence les patrons d'exposition de certains agents pathogènes (virus influenza aviaire et flavivirus) et d'appréhender les facteurs éco-épidémiologiques potentiellement impliqués dans leurs circulations. Les résultats permettent d'envisager de futurs axes de recherches, nécessaires pour évaluer plus précisément la dispersion de ces virus en Méditerranée. / The emergence of zoonotic diseases is directly linked to the noise generated by humans on the natural environment to a greater or lesser extent. Of all the emerging zoonoses in humans, the majority comes from wild animals. The study of the role of wildlife in the circulation of pathogens is crucial, especially when wildlife/human interfaces are prominent. The aim of this thesis is to understand, using large scale eco-epidemiological approaches, the circulation of pathogens in a close to human population of wild bird, the yellow-legged gull (Larus michahellis). The first chapter presents the different methods used in the monitoring of pathogens and their limitations when they are conducted in natural populations. This chapter further highlights, through a study of avian influenza viruses, that the quantification of maternal antibodies in eggs is an effective tool. The second chapter expands the spatial scale of the study to highlight the finer eco-epidemiological factors influencing the transmission of avian influenza viruses within and between populations of Western Mediterranean yellow-legged gull. Finally, the last chapter is based on the comparison of exposition patterns obtained for vectorial transmission mode pathogens: flaviviruses. This thesis highlights patterns of exposure for certain pathogens (avian influenza virus and flaviviruses) and enables the understanding of the eco-epidemiological factors potentially involved in their circulations. The results allow to consider future areas of research needed to more accurately assess the dispersion of these viruses over the Mediterranean.
En ligne :	http://www.biu-montpellier.fr/florabium/jsp/nnt.jsp?nnt=2012MON20139
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Maternal antibody transmission in relation to mother fluctuating asymmetry in a long-lived colonial seabird: the yellow-legged gull Larus michahellis (2012)

Mon, 26 Oct 2015 10:05:05

Maternal antibody transmission in relation to mother fluctuating asymmetry in a long-lived colonial seabird: the yellow-legged gull Larus michahellis [Article] / A. Hammouda ; Slaheddine Selmi ; J. Pearce-duvet ; M.A. Chokri ; Audrey Arnal ; Michel Gauthier-Clerc ; T. Boulinier . - 2012.

Mots-clés :	TdV ; Afrique:Afrique Nord:Tunisie ; Animalia:Aves ; Animalia:Aves:Charadriiformes ; Animalia:Aves:Charadriiformes:Laridae ; Animalia:Aves:Charadriiformes:Laridae:Larus:Larus michahellis ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé:Pathologie:Pathologie animale ; Physiologie animale:Métabolisme:Immunité ; Biotope:Zone littorale
Publisher :	PLoS One 7(5): e34966
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Birds and viruses at a crossroad: surveillance of influenza A virus in portuguese waterfowl (2012)

Mon, 26 Oct 2015 10:02:36

Birds and viruses at a crossroad: surveillance of influenza A virus in portuguese waterfowl [Article] / C. Tolf ; D. Bengtsson ; D. Rodrigues ; N. Latorre-margalef ; M. Wille ; M.E. Figueiredo ; M. Jankowska-hjortaas ; A. Germundsson ; P.Y. Duby ; C. Lebarbenchon ; Michel Gauthier-Clerc ; B. Olsen ; J. Waldenström . - 2012.

Mots-clés :	TdV ; Europe:Europe Occidentale:Portugal ; Animalia:Aves ; Animalia:Aves:Anseriformes ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae:Anas:Anas platyrhynchos ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé:Pathologie:Pathologie animale ; Santé:Maladie:Transmission maladie ; Dynamique population:Migration ; Oiseaux d'eau ; Biotope:Zone humide
Publisher :	PLoS One 7(11): e49002
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=556

High influenza A virus infection rates in mallards bred for hunting in the Camargue, south of France (2012)

Mon, 26 Oct 2015 10:02:35

High influenza A virus infection rates in mallards bred for hunting in the Camargue, south of France [Article] / Marion Vittecoq ; V. Grandhomme ; Jocelyn Champagnon ; Matthieu Guillemain ; B. Crescenzo-chaigne ; F. Renaud ; F. Thomas ; Michel Gauthier-Clerc ; S. Van Der Werf . - 2012.

Mots-clés :	TdV ; Europe:Europe Occidentale:France:Provence-Alpes-Côte d'Azur:Camargue ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Animalia:Aves ; Animalia:Aves:Anseriformes ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae:Anas:Anas platyrhynchos ; Santé:Pathologie:Pathologie animale ; Santé:Maladie:Transmission maladie ; Suivi:Captivité
Publisher :	PLoS One 7(8): e43974
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=549

Maladies infectieuses émergentes au sein des zones humides méditerranéennes dans le contexte des changements globaux (2012)

Mon, 26 Oct 2015 10:02:35

Maladies infectieuses émergentes au sein des zones humides méditerranéennes dans le contexte des changements globaux [Thèse] / Marion Vittecoq . - Thèse doctorat: biologie de l'évolution et écologie: Université Montpellier 2, 2012 . - * 114p.

Mots-clés :	TdV ; Pays méditerranéens ; Europe:Europe Occidentale:France:Provence-Alpes-Côte d'Azur:Camargue ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé:Virus:Virus West Nile ; Animalia:Aves ; Animalia:Aves:Charadriiformes ; Animalia:Aves:Charadriiformes:Laridae ; Animalia:Aves:Charadriiformes:Laridae:Larus:Larus michahellis ; Animalia:Aves:Anseriformes ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae ; Santé:Pathologie:Pathologie animale ; Santé:Maladie:Transmission maladie ; Santé ; Changement climatique ; Biotope:Zone humide
Index. décimale :	TdV Publications TdV
Publisher :	Thèse doctorat: biologie de l'évolution et écologie: Université Montpellier 2 (FRA)* 114p
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=529

Study of the influenza A virus in wild boars living in a major duck wintering site (2012)

Mon, 26 Oct 2015 10:02:35

Study of the influenza A virus in wild boars living in a major duck wintering site [Article] / Marion Vittecoq ; V. Grandhomme ; G. Simon ; S. Herve ; Thomas Blanchon ; F. Renaud ; F. Thomas ; Michel Gauthier-Clerc ; S. Van Der Werf . - 2012.compléter

Mots-clés :	TdV ; Europe:Europe Occidentale:France:Provence-Alpes-Côte d'Azur:Camargue ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Animalia:Mammalia ; Animalia:Mammalia:Artiodactyla:Suidae ; Animalia:Mammalia:Artiodactyla:Suidae:Sus scrofa ; Animalia:Aves ; Animalia:Aves:Anseriformes ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae ; Santé:Pathologie:Pathologie animale ; Santé:Maladie:Transmission maladie ; Biotope:Zone humide
Publisher :	Infect Genet Evol 12 p483-486
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=548

Etude de la transmission du virus influenza au sein de populations d'Anatidae (2011/12/20)

Mon, 12 Mar 2018 15:41:23

Etude de la transmission du virus influenza au sein de populations d'Anatidae [Thèse] / Aymen Mamlouk, Auteur . - Grenoble, 2011/12/20.

Mots-clés :	Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire
Résumé :	Les virus influenza A ont suscité à partir de l’année 1997 un intérêt sanitaire et économique mondial considérable après l’émergence d’une forme hautement pathogène d’un virus influenza aviaire H5N1. Cette épizootie a mis en évidence le danger majeur que constitue la proximité entre espèces sensibles sauvages et domestiques. En effet, pouvant présenter les caractéristiques de réservoirs de ces virus, les canards étaient les plussoupçonnés de transmettre l’infection, grâce à une pratique migratoire importante et d’un portage asymptomatique fréquent. Ce portage associe dans la plupart des cas des virus faiblement pathogènes de sous-types multiples. Ces virus peuvent se transmettre aux volailles domestiques et émerger en épizootie à virus hautement pathogène dans le cas particulier des sous-types H5 et H7. Ces épizooties peuvent avoir des conséquences économiques considérables, avec une mortalité avoisinant les100%, et sanitaire avec un possible passage à l’homme. Notre projet vise à caractériser l’infection et la transmission des virus influenza faiblement pathogènes, après inoculation expérimentale à une population de canards de surface et plongeurs. Il répond également à la nécessité d’établir des méthodes de surveillance des virus influenza aviaires à l’arrivé des oiseaux migrateurs dans des zones humides à riche patrimoine ornithologique, et situées à proximité de régions à fort potentiel en matière de production avicole (La Dombes comme exemple).
En ligne :	http://www.theses.fr/2011GRENS031
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Contacts between wild birds and domestic poultry - a serious factor in transmission of avian influenza?

Tue, 29 Jan 2019 10:49:55

Contacts between wild birds and domestic poultry - a serious factor in transmission of avian influenza? [Article] / Alexander Roemer, Auteur ; Wolfgang Fiedler, Auteur . - 2011 . - 149-161.Langues : Allemand (ger)in Vogelwarte > 49(3) (AUG 2011) . - 149-161

Résumé :

Waterbirds are seen to be the main reservoir for many subtypes of low pathogenic avian influenza A virus. There is also evidence for a potential spread of high pathogenic subtypes through waterbirds. Transmission of avian influenza virus from wild birds into poultry and vice versa therefore is seen as a risk factor for the spread of the disease and a prohibition of keeping poultry outdoors is among the standard repertoire in veterinary disease defense.Data about the extent of contacts between wild birds and poultry until now are only available through single anecdotes. Within the framework of project Constanze" (exploration of the bird flu risk at the example of Lake Constance) between October 2007 and January 2008 Swiss poultry farms with open air enclosures were searched for contacts between poultry and wild birds. It was aimed to estimate the extent of these contacts in the light of a potential transmission risk of influenza virus.Observations were made on

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Circulation des virus influenza A: apports de la modélisation (2011)

Mon, 26 Oct 2015 10:07:05

Circulation des virus influenza A: apports de la modélisation [Article] / Audrey Arnal ; M. Ottmann ; R. Garnier . - 2011.

Mots-clés :	Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé ; Santé:Maladie:Transmission maladie ; Outil technique:Statistique:Modèle
Publisher :	Virologie 15 p363-370
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=9497

Prevalence of influenza A antibodies in yellow-legged gull (Larus michahellis) eggs and adults in southern Tunisia (2011)

Mon, 26 Oct 2015 10:05:05

Prevalence of influenza A antibodies in yellow-legged gull (Larus michahellis) eggs and adults in southern Tunisia [Article] / A. Hammouda ; J. Pearce-duvet ; M.A. Chokri ; Audrey Arnal ; Michel Gauthier-Clerc ; T. Boulinier ; Slaheddine Selmi . - 2011.

Mots-clés :	TdV ; Afrique:Afrique Nord:Tunisie ; Animalia:Aves ; Animalia:Aves:Charadriiformes ; Animalia:Aves:Charadriiformes:Laridae ; Animalia:Aves:Charadriiformes:Laridae:Larus:Larus michahellis ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé:Pathologie:Pathologie animale ; Santé:Maladie:Transmission maladie ; Dynamique population:Colonisation:Colonie
Publisher :	Vector-Borne Zoonot Dis 11 p1583-1590
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=6058

Avian influenza viruses: environmental influence. In: Encyclopedia of environmental health. NRIAGU J. (2011)

Mon, 26 Oct 2015 10:02:47

Avian influenza viruses: environmental influence. In: Encyclopedia of environmental health. NRIAGU J. [Chapitre] / Marion Vittecoq ; F. Thomas ; F. Renaud ; Michel Gauthier-Clerc . - Elsevier, 2011 . - pp. 253-261.

Mots-clés :	TdV ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Animalia:Aves ; Animalia:Aves:Anseriformes ; Santé:Pathologie:Pathologie animale ; Santé:Maladie:Transmission maladie ; Agriculture:Elevage:Aviculture ; Conservation nature ; Oiseaux d'eau
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=1027

Persistance des virus influenza A en fonction des paramètres environnementaux (2011)

Mon, 26 Oct 2015 10:02:47

Persistance des virus influenza A en fonction des paramètres environnementaux [Article] / Marion Vittecoq ; M. Ottmann ; F. Renaud ; F. Thomas ; Michel Gauthier-Clerc . - 2011.

Mots-clés :	TdV ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé:Maladie:Transmission maladie ; Ecosystème aquatique ; Ecosystème terrestre
Publisher :	Virologie 15 p371-379
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=1028

Avian influenza and wetlands guidance on control of and responses to highly pathogenic avian influenza (2010)

Mon, 7 Dec 2020 17:17:31

Avian influenza and wetlands guidance on control of and responses to highly pathogenic avian influenza [Ouvrage] / Ramsar Convention Bureau, Auteur . - Gland (Switzerland) : Ramsar Convention Bureau, 2010 . - 82.Langues : Anglais (eng)

Mots-clés :	Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Biotope:Zone humide ; Animalia:Aves ; Biodiversité:Faune sauvage ; Dynamique population:mortalité ; Méthodologie
Résumé :	Highly pathogenic avian influenza, sub-type H5N1 (HPAI H5N1) is a viral zoonotic disease that emerged in poultry in southeast Asia between 1997 and 2003. A series of outbreaks of the virus, historically unprecedented in their virulence and in their geographical spread across Asia, the Middle East, Africa and Europe, had major impacts on rural livelihoods linked to the keeping of domesticated birds (mainly poultry) and on nature conservation values (including major mortality of waterbirds on several Ramsar Sites). A lack of understanding of the role of wild birds in the epidemiology of the disease gave rise to some high-profile negative public attitudes toward waterbirds and their habitats.. It also noted a need to broaden the traditional perspectives of public health and their epidemiological approaches into one more closely aligned with the science of ecology, and for approaches to be more cross-sectoral in nature. The approach taken in this Handbook to providing a “guide to guidance” may offer elements of a model for other Ramsar guidance in future on similarly complex technical issues.
En ligne :	https://www.ramsar.org/sites/default/files/documents/pdf/lib/hbk4-04.pdf
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Ecologie de la santé et biodiversité (2010)

Mon, 26 Oct 2015 10:09:51

Ecologie de la santé et biodiversité [Ouvrage] / Michel Gauthier-Clerc ; F. Thomas . - De Boek Bruxelles, 2010 . - 538p.ISBN : 978-2-8041-3508-9

Mots-clés :	TdV ; Santé:Virus:Virus West Nile ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé ; Biodiversité ; Changement climatique
Index. décimale :	D1 Écologie de la santé
Publisher :	De Boek Bruxelles (BEL) 538p
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Les virus Influenza A et l'avifaune sauvage: recherche sur l'influenza aviaire et sa propagation (2010)

Mon, 26 Oct 2015 10:05:24

Les virus Influenza A et l'avifaune sauvage: recherche sur l'influenza aviaire et sa propagation [Article] / Michel Gauthier-Clerc ; V. Grandhomme ; C. Lebarbenchon ; Marion Vittecoq ; Yves Kayser ; F. Renaud ; F. Thomas ; S. Van Der Werf . - 2010.

Mots-clés :	TdV ; Europe:Europe Occidentale:France ; Europe:Europe Occidentale:France:Provence-Alpes-Côte d'Azur:Camargue ; Animalia:Aves ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé:Maladie:Transmission maladie
Publisher :	Ornithos 17 p322-328
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Avian influenza circulation in the Camargue (South of France) during the 2006-2007 season (2010)

Mon, 26 Oct 2015 10:04:20

Avian influenza circulation in the Camargue (South of France) during the 2006-2007 season [Article] / C. Lebarbenchon ; C.M. Chang ; V. Grandhomme ; M. Dietrich ; Yves Kayser ; E. Elguero ; F. Renaud ; F. Thomas ; S. Van Der Werf ; Michel Gauthier-Clerc . - 2010.

Mots-clés :	TdV ; Europe:Europe Occidentale:France:Provence-Alpes-Côte d'Azur:Camargue ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Animalia:Aves ; Animalia:Aves:Anseriformes ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae:Anas:Anas querquedula ; Animalia:Aves:Passeriformes ; Animalia:Aves:Charadriiformes ; Santé:Pathologie:Pathologie animale ; Santé:Maladie:Transmission maladie ; Dynamique population:Migration
Publisher :	Avian Dis 54 p446-449
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=4580

Persistence of highly pathogenic avian influenza viruses in natural ecosystems (2010)

Mon, 26 Oct 2015 10:04:20

Persistence of highly pathogenic avian influenza viruses in natural ecosystems [Article] / C. Lebarbenchon ; C.J. Feare ; F. Renaud ; F. Thomas ; Michel Gauthier-Clerc . - 2010.

Mots-clés :	TdV ; Animalia:Aves ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé:Pathologie:Pathologie animale ; Santé:Maladie:Transmission maladie
Publisher :	Emerg Infect Dis 16 p1057-1062
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=4578

Avian influenza surveillance: on the usability of FTA (R) cards to solve biosafety and transport issues

Thu, 31 Aug 2017 13:37:38

Avian influenza surveillance: on the usability of FTA (R) cards to solve biosafety and transport issues [Article] / Robert H. S. Kraus, Auteur ; Pim Van Hooft, Auteur ; Jonas Waldenström, Auteur ; Neus Latorre-Margalef, Auteur ; Ronald C. Ydenberg, Auteur ; Herbert H. T. Prins, Auteur . - 2009 . - 215-223.Langues : Anglais (eng)in Wildfowl > 2 (2009) . - 215-223

Résumé :

Many zoonotic diseases have birds as their natural hosts. Waterfowl are the natural hosts of avian influenza Viruses (AIVs) and most avian influenza infections of wild birds appear mild, with infected inviduals displaying no or few symptoms. It is clear that the epidemiology of avian influenza cannot be fully understood without taking the ecology of its hosts into account. However, large scale studies and surveillance are still hampered by issues about preservation, transport and storage of AIVs, including bio-safety regulations and maintaining samples. This complicates the possibilities of the many small projects across the world if they are not done within the framework of one of the few big projects. Here, evidence is provided of the potential for using Whatman FTA (R) cards as a new preservation method to solve the above mentioned issues. Its efficiency is comparable to that of a standard method in virology,and saves time and money In both large scale AIV sampling and small scale independent projects this method might be the means by which the field of the AIV ecology will be lifted beyond the constraints of difficult and expensive sampling, storage and laboratory facilities.

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Spatial and temporal analysis of the highly pathogenic avian influenza H5N1 outbreak in the Dombes Area, France, in 2006

Thu, 31 Aug 2017 13:36:51

Spatial and temporal analysis of the highly pathogenic avian influenza H5N1 outbreak in the Dombes Area, France, in 2006 [Article] / Delphine Doctrinal, Auteur ; Sandrine Ruette, Auteur ; Jean Hars, Auteur ; Marc Artois, Auteur ; Dominique J. Bicout, Auteur . - 2009 . - 202-214.Langues : Anglais (eng)in Wildfowl > 2 (2009) . - 202-214

Résumé :

In February 2006, the highly pathogenic H5N1 strain of the avian influenza virus was confirmed as being the cause of death for three Common Pochard Aythya ferina recovered at the same time from a pond in the Dombes, France. The subsequent epizootic lasted for 65 days in the Dombes region, with the last occurrence of the H5N1 strain of the virus confirmed on 18 April. Data recorded for dead wild birds collected on ponds and confirmed as being positive for the H5N1 strain of avian influenza were used to develop a pond-level analysis of the H5N1 Outbreak. The outbreak was found to be limited mainly to Common Pochard and Mute Swan Cygnus olor, which were found dead at 20 of about 1,200 ponds in the Dombes. The outbreak was confined to an area of about 15 km in diameter, with two spatio-temporal clusters of ponds where birds had contracted the disease. The findings are used to assess the potential role played by wild waterfowl in avian influenza epidemiology and to suggest possible scenarios for the introduction and spread of the virus at a local scale based on analysis of its occurrence in the Dombes.

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Possibilité de présence des virus Influenza A en Camargue (France) en fonction des milieux et de la période: un outil d'aide à la surveillance (2009)

Mon, 26 Oct 2015 10:10:58

Possibilité de présence des virus Influenza A en Camargue (France) en fonction des milieux et de la période: un outil d'aide à la surveillance [Mémoire] / L. Bournez . - Master 2: surveillance épidemiologique des maladies humaines et animales: Universités Paris XI-XII, 2009 . - 72p.stage Tour du Valat

Mots-clés :	TdV ; Europe:Europe Occidentale:France:Provence-Alpes-Côte d'Azur:Camargue ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Animalia:Aves ; Animalia:Aves:Anseriformes ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae:Anas ; Santé:Pathologie:Pathologie animale ; Santé:Maladie:Transmission maladie
Index. décimale :	TdV Publications TdV
Publisher :	Master 2: surveillance épidemiologique des maladies humaines et animales: Universités Paris XI-XII (FRA) 72p
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=14911

2nd Pan-European Duck Symposium, Arles (France), 23-26/03/2009. Abstract booklet (2009)

Mon, 26 Oct 2015 10:08:24

2nd Pan-European Duck Symposium, Arles (France), 23-26/03/2009. Abstract booklet [Congrès] / Pan-european Ducks Symposium. 2. 2009. Arles (fra) . - Office National de la Chasse et de la Faune Sauvage ONCFS Auffargis, 2009 . - 73p.

Mots-clés :	Animalia:Aves ; Dynamique population ; Animalia:Aves:Anseriformes ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé:Pathologie:Pathologie animale ; Santé:Maladie:Transmission maladie ; Ecologie:Autoécologie:Autoécologie animale ; Dynamique population:Migration ; Habitat ; Dynamique population:Dispersion ; Chasse
Index. décimale :	O/ANS Ornithologie - Ansériformes
Publisher :	Office National de la Chasse et de la Faune Sauvage ONCFS Auffargis (FRA) 73p
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The potential distance of highly pathogenic avian influenza virus dispersal by mallard, common teal and Eurasian pochard (2009)

Mon, 26 Oct 2015 10:06:33

The potential distance of highly pathogenic avian influenza virus dispersal by mallard, common teal and Eurasian pochard [Article] / A.L. Brochet ; Matthieu Guillemain ; C. Lebarbenchon ; G. Simon ; H. Fritz ; A.J. Green ; F. Renaud ; F. Thomas ; Michel Gauthier-Clerc . - 2009.

Mots-clés :	TdV ; Europe:Europe Occidentale:France:Provence-Alpes-Côte d'Azur:Camargue ; Animalia:Aves ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae:Anas:Anas crecca ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae:Anas:Anas platyrhynchos ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae:Aythya:Aythya ferina ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé:Pathologie:Pathologie animale ; Santé:Maladie:Transmission maladie ; Dynamique population:Déplacement
Publisher :	EcoHealth 6 p449-457
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=8598

Molecular surveillance for avian influenza A virus in king penguins (Aptenodytes patagonicus) (2009)

Mon, 26 Oct 2015 10:06:19

Molecular surveillance for avian influenza A virus in king penguins (Aptenodytes patagonicus) [Article] / C.M. Chang ; C. Lebarbenchon ; Michel Gauthier-Clerc ; C. Le Bohec ; D. Beaune ; Y. Le Maho ; S. Van Der Werf . - 2009.

Mots-clés :	TdV ; Europe:Europe Occidentale:France:TAAF ; Europe:Europe Occidentale:France:TAAF:Crozet ; Animalia:Aves ; Animalia:Aves:Sphenisciformes ; Animalia:Aves:Sphenisciformes:Spheniscidae ; Animalia:Aves:Sphenisciformes:Spheniscidae:Aptenodytes patagonicus ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé:Pathologie:Pathologie animale
Publisher :	Polar Biol 32 p663-665
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H9N2 Avian influenza virus in a Mediterranean gull (2009)

Mon, 26 Oct 2015 10:04:20

H9N2 Avian influenza virus in a Mediterranean gull [Article] / C. Lebarbenchon ; C.M. Chang ; Michel Gauthier-Clerc ; F. Thomas ; F. Renaud ; S. Van Der Werf . - 2009.

Mots-clés :	TdV ; Europe:Europe Occidentale:France:Provence-Alpes-Côte d'Azur:Camargue ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Animalia:Aves ; Animalia:Aves:Charadriiformes ; Animalia:Aves:Charadriiformes:Charadriidae ; Animalia:Aves:Charadriiformes:Laridae:Larus:Ichthyaetus melanocephalus
Publisher :	J Mol Genet Med 3 p121-123
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Spread of avian influenza viruses by common teal (Anas crecca) in Europe (2009)

Mon, 26 Oct 2015 10:04:20

Spread of avian influenza viruses by common teal (Anas crecca) in Europe [Article] / C. Lebarbenchon ; F. Albespy ; A.L. Brochet ; V. Grandhomme ; F. Renaud ; H. Fritz ; A.J. Green ; F. Thomas ; S. Van Der Werf ; P. Aubry ; Matthieu Guillemain ; Michel Gauthier-Clerc . - 2009.

Mots-clés :	TdV ; Europe ; Europe:Europe Occidentale:France:Provence-Alpes-Côte d'Azur:Camargue ; Animalia:Aves ; Animalia:Aves:Anseriformes ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae:Anas:Anas crecca ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé:Maladie:Transmission maladie ; Dynamique population:Migration ; Outil technique:Statistique:Modèle
Publisher :	PLoS One 4(10): e7289
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=4583

2nd Pan-European Duck Symposium. Arles (FRA) 23-26/03/2009 (2009)

Mon, 26 Oct 2015 10:03:49

2nd Pan-European Duck Symposium. Arles (FRA) 23-26/03/2009 [Congrès] / Office national de la chasse et de la faune sauvage, . - ONCFS Paris, 2009 . - 73p.

Mots-clés :	TdV ; Europe ; Animalia:Aves ; Animalia:Aves:Anseriformes ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé:Pathologie:Pathologie animale ; Santé:Maladie:Transmission maladie
Publisher :	ONCFS Paris (FRA) 73p
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=3529

Maternal antibody transfer in yellow-legged gulls (2009)

Mon, 26 Oct 2015 10:03:42

Maternal antibody transfer in yellow-legged gulls [Article] / J.M.C. Pearce-duvet ; Michel Gauthier-Clerc ; E. Jourdain ; T. Boulinier . - 2009.

Mots-clés :	TdV ; Europe:Europe Occidentale:France:Occitanie ; Animalia:Aves ; Animalia:Aves:Anseriformes ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae ; Animalia:Aves:Charadriiformes:Laridae:Larus:Larus michahellis ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé:Maladie:Transmission maladie
Publisher :	Emerg Infect Dis 15(7) p1147-1148
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Water-borne transmission drives avian influenza dynamics in wild birds: The case of the 2005-2006 epidemics in the Camargue area (2009)

Mon, 26 Oct 2015 10:03:24

Water-borne transmission drives avian influenza dynamics in wild birds: The case of the 2005-2006 epidemics in the Camargue area [Article] / B. Roche ; C. Lebarbenchon ; Michel Gauthier-Clerc ; C.M. Chang ; F. Thomas ; F. Renaud ; S. Van Der Werf ; J.F. Guegan . - 2009.

Mots-clés :	TdV ; Europe:Europe Occidentale:France:Provence-Alpes-Côte d'Azur:Camargue ; Animalia:Aves ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé:Pathologie:Pathologie animale ; Santé:Maladie:Transmission maladie ; Outil technique:Statistique:Modèle
Publisher :	Infect Genet Evol 9 p800-805
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=2533

La dispersion des virus influenza A à partir de la Camargue, via les déplacements locaux et migratoires des sarcelles d'hiver (Anas crecca) (2008)

Mon, 26 Oct 2015 10:11:30

La dispersion des virus influenza A à partir de la Camargue, via les déplacements locaux et migratoires des sarcelles d'hiver (Anas crecca) [Mémoire] / F. Albespy . - Master 2: biostatistiques et modélisation: Université Paul Sabatier Toulouse 3, 2008 . - * 60p ill.stage Tour du Valat

Mots-clés :	TdV ; Europe:Europe Occidentale:France:Provence-Alpes-Côte d'Azur:Camargue ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Animalia:Aves ; Animalia:Aves:Anseriformes ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae:Anas:Anas crecca ; Santé:Maladie:Transmission maladie ; Dynamique population:Déplacement ; Outil technique:Statistique:Modèle
Index. décimale :	TdV Publications TdV
Publisher :	Master 2: biostatistiques et modélisation: Université Paul Sabatier Toulouse 3 (FRA)* 60p ill
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=15559

Avian influenza research progress (2008)

Mon, 26 Oct 2015 10:11:29

Avian influenza research progress [Ouvrage] / E.P. Allegra . - Nova Science Publishers New York, 2008 . - 161p.ISSN : 978-60021-617-6

Mots-clés :	Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Animalia:Aves ; Santé:Pathologie:Pathologie animale ; Santé:Maladie:Transmission maladie ; Santé
Index. décimale :	D1 Écologie de la santé
Publisher :	Nova Science Publishers New York (USA) 161p
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=15537

Maladies infectieuses et écosystèmes: écologies des virus influenza aviaires en Camargue (2008)

Mon, 26 Oct 2015 10:09:02

Maladies infectieuses et écosystèmes: écologies des virus influenza aviaires en Camargue [Thèse] / C. Lebarbenchon . - Thèse doctorat: systèmes intégrés en biologie, agronomie, géosciences, hydrosciences, environnement: Université Montpellier 2, 2008 . - : 227p.

Mots-clés :	TdV ; Europe:Europe Occidentale:France:Provence-Alpes-Côte d'Azur:Camargue ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Animalia:Aves ; Animalia:Aves:Anseriformes ; Animalia:Aves:Anseriformes:Anatidae ; Animalia:Aves:Charadriiformes:Laridae ; Animalia:Aves:Charadriiformes:Laridae:Larus:Ichthyaetus melanocephalus ; Ecologie:Ecologie animale ; Processus écologique:Parasitisme ; Santé:Maladie:Transmission maladie ; Ecosystème aquatique
Index. décimale :	TdV Publications TdV
Publisher :	Thèse doctorat: systèmes intégrés en biologie, agronomie, géosciences, hydrosciences, environnement: Université Montpellier 2 (FRA): 227p
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=12355

Avian influenza (2008)

Mon, 26 Oct 2015 10:07:42

Avian influenza [Ouvrage] / D.E. Swayne . - Blackwell Publishing Ames, 2008 . - 605p.ISBN : 978-0-8138-2047-7

Mots-clés :	Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Animalia:Aves ; Santé:Pathologie:Pathologie animale ; Santé ; Santé:Maladie:Transmission maladie
Index. décimale :	D1 Écologie de la santé
Publisher :	Blackwell Publishing Ames (USA) 605p
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=10414

Recent expansion of highly pathogenic avian influenza H5N1: a critical review

Thu, 10 Aug 2017 14:55:51

Recent expansion of highly pathogenic avian influenza H5N1: a critical review [Article] / Michel Gauthier-Clerc, Auteur ; C. Lebarbenchon, Auteur ; F. Thomas, Auteur . - 2007 . - 202-214.in Ibis > 149(2) (APR 2007) . - 202-214

Résumé :	Wild birds, particularly waterfowl, are a key element of the viral ecology of avian influenza. Highly pathogenic avian influenza (HPAI) virus, subtype H5N1, was first detected in poultry in November 1996 in southeast China, where it originated. The virus subsequently dispersed throughout most of Asia, and also to Africa and Europe. Despite compelling evidence that the virus has been dispersed widely via human activities that include farming, and marketing of poultry, migratory birds have been widely considered to be the primary source of its global dispersal. Here we present a critical examination of the arguments both for and against the role of migratory birds in the global dispersal of HPAI H5N1. We conclude that, whilst wild birds undoubtedly contribute to the local spread of the virus in the wild, human commercial activities, particularly those associated with poultry, are the major factors that have determined its global dispersal.
DOI :	DOI : 10.1111/j.1474-919X.2007.00699.x
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=22057

The spread of avian influenza

Thu, 29 Jun 2017 11:03:51

The spread of avian influenza [Article] / Chris J. Feare, Auteur . - 2007 . - 424-425.in Ibis > 149(2) (APR 2007) . - 424-425

DOI :	DOI : 10.1111/j.1474-919X.2007.00711.x
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=21624

Les virus influenza A chez les oiseaux sauvages. Détection chez les oiseaux migrateurs et nicheurs en Camargue (2007)

Mon, 26 Oct 2015 10:05:49

Les virus influenza A chez les oiseaux sauvages. Détection chez les oiseaux migrateurs et nicheurs en Camargue [Mémoire] / M. Dietrich . - Master 1: écologie et éthologie appliquées: Université Jean Monnet St Etiennne, 2007 . - * 35p.stage Tour du Valat

Mots-clés :	Europe:Europe Occidentale:France:Provence-Alpes-Côte d'Azur:Camargue ; TdV ; Animalia:Aves ; Animalia:Aves:Passeriformes ; Animalia:Aves:Charadriiformes ; Animalia:Aves:Charadriiformes:Laridae ; Animalia:Aves:Charadriiformes:Laridae:Larus:Larus michahellis ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire
Publisher :	Master 1: écologie et éthologie appliquées: Université Jean Monnet St Etiennne (FRA)* 35p
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=7415

Recent expansion of highly pathogenic avian influenza H5N1: a critical review (2007)

Mon, 26 Oct 2015 10:05:24

Recent expansion of highly pathogenic avian influenza H5N1: a critical review [Article] / Michel Gauthier-Clerc ; C. Lebarbenchon ; F. Thomas . - 2007.

Mots-clés :	TdV ; Animalia:Aves ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé:Maladie:Transmission maladie ; Dynamique population:Migration ; Conservation nature
Publisher :	Ibis 149 p202-214
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=6671

Bird migration routes and risk for pathogen dispersion into Western Mediterranean wetlands (2007)

Mon, 26 Oct 2015 10:04:36

Bird migration routes and risk for pathogen dispersion into Western Mediterranean wetlands [Article] / E. Jourdain ; Michel Gauthier-Clerc ; D.J. Bicout ; P. Sabatier . - 2007.

Mots-clés :	Europe:Europe Occidentale:France:Provence-Alpes-Côte d'Azur:Camargue ; TdV ; Animalia:Aves ; Santé:Virus:Virus West Nile ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Ecologie:Autoécologie:Autoécologie animale ; Dynamique population:Migration ; Santé:Maladie:Transmission maladie ; Biotope:Zone humide
Publisher :	Emerg Infect Dis 13(3) p365-372
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=5151

Ecoregional dominance in spatial distribution of avian influenza (H5N1) outbreaks (2007)

Mon, 26 Oct 2015 10:04:36

Ecoregional dominance in spatial distribution of avian influenza (H5N1) outbreaks [Article] / E. Jourdain ; Michel Gauthier-Clerc ; P. Sabatier . - 2007.

Mots-clés :	TdV ; Animalia:Aves ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Dynamique population:Distribution
Publisher :	Emerg Infect Dis 13(8) p1269-1271
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=5148

Absence of detection of highly pathogenic H5N1 in migratory waterfowl in southern France in 2005-2006 (2007)

Mon, 26 Oct 2015 10:04:20

Absence of detection of highly pathogenic H5N1 in migratory waterfowl in southern France in 2005-2006 [Article] / C. Lebarbenchon ; S. Van Der Werf ; F. Thomas ; J.T. Aubin ; S. Azebi ; F. Cuvelier ; P. Jeannin ; V. Roca ; C.M. Chang ; Yves Kayser ; B. Roche ; J.F. Guegan ; F. Renaud ; Michel Gauthier-Clerc . - 2007.

Mots-clés :	TdV ; Europe:Europe Occidentale:France:Provence-Alpes-Côte d'Azur:Camargue ; Animalia:Aves ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé:Pathologie:Pathologie animale ; Oiseaux d'eau ; Dynamique population:Migration
Publisher :	Infect Genet Evol 7 p604-608
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=4575

Influenza A virus in birds during spring migration in the Camargue, France (2007)

Mon, 26 Oct 2015 10:04:20

Influenza A virus in birds during spring migration in the Camargue, France [Article] / C. Lebarbenchon ; C.M. Chang ; S. Van Der Werf ; J.T. Aubin ; Yves Kayser ; M. Ballesteros ; F. Renaud ; F. Thomas ; Michel Gauthier-Clerc . - 2007.

Mots-clés :	TdV ; Europe:Europe Occidentale:France:Provence-Alpes-Côte d'Azur:Camargue ; Animalia:Aves ; Animalia:Aves:Charadriiformes ; Animalia:Aves:Charadriiformes:Laridae ; Animalia:Aves:Charadriiformes:Laridae:Larus:Ichthyaetus melanocephalus ; Animalia:Aves:Passeriformes ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire
Publisher :	J Wildlife Dis 43 p789-793
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=4579

Urgent preliminary assessment of ornithological data relevant to the spread of avian influenza in Europe (2006)

Mon, 26 Oct 2015 10:11:39

Urgent preliminary assessment of ornithological data relevant to the spread of avian influenza in Europe [Document audiovisuel] / S. Delany ; J. Veen ; J. Clark . - European Union for Bird Ringing EURING & Wetlands International Wageningen, 2006 . - 346p.Report to the European Commission Contract n°07010401/2005/425926/MAR/B4* participation M. Gauthier-Clerc & A. Johnson

Mots-clés :	Europe ; Europe:Europe Occidentale:Pays-Bas ; Europe:Europe Occidentale:France:Provence-Alpes-Côte d'Azur:Camargue ; TdV ; Europe:Europe orientale:Ukraine ; Afrique:Afrique Occidentale:Sénégal ; Animalia:Aves ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé:Pathologie:Pathologie animale ; Suivi:Dénombrement ; Dynamique population:Distribution ; Oiseaux d'eau
Publisher :	European Union for Bird Ringing EURING & Wetlands International Wageningen (NLD) 346p
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=15737

Current topics in avian disease research: Understanding endemic and invasive diseases (2006)

Mon, 26 Oct 2015 10:11:15

Current topics in avian disease research: Understanding endemic and invasive diseases [Numéro spécial] / R.K. Barraclough . - American Ornithologists' Union AOU Washington, 2006 . - 111p* Ornithological Monographs 60.ISBN : 978-0-943610-67-2

Mots-clés :	Animalia:Aves ; Santé:Virus:Virus West Nile ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé:Pathologie:Pathologie animale ; Santé
Index. décimale :	O4 Ornithologie - Amérique du Nord
Publisher :	American Ornithologists' Union AOU Washington (USA) 111p* Ornithological Monographs 60
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=15249

Bird flu. A virus of our own hatching (2006)

Mon, 26 Oct 2015 10:09:42

Bird flu. A virus of our own hatching [Article] / M. Greger . - M. Greger & Lantern books New York, 2006 . - 465p.

Mots-clés :	Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé ; Santé:Pathologie:Pathologie animale
Index. décimale :	D1 Écologie de la santé
Publisher :	M. Greger & Lantern books New York (USA) 465p
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=13277

Avian influenza and wild birds. What is their actual role in the spread of the virus? (2006)

Mon, 26 Oct 2015 10:04:59

Avian influenza and wild birds. What is their actual role in the spread of the virus? [Rapport] / R. Hepworth ; B. Lenten . - Bonn [Germany] : AEWA, UNEP African-Eurasian Waterbird Agreement, 2006 . - 8p.

Mots-clés :	Animalia:Aves ; Santé:Virus:Virus grippe aviaire ; Santé:Maladie:Transmission maladie
Publisher :	UNEP-CMS & UNEP-AEWA Secretariat Bonn (DEU) 8p
Permalink :	https://centredoc.tourduvalat.app/opac_css/index.php?lvl=notice_display&id=5915