Camargue: recent publications / Camargue : de récentes publications

A multi-stage framework for detection and decoding of wildlife ring identifiers in real-world conditions (2027)

Wed, 28 Oct 2026 15:44:10

de Tom Bourbon, Thomas Blanchon, Jocelyn Champagnon, Cédric Pradalier, Ida-Maria Sintorn, Umapada Pal, Shijian Lu
Cham : Springer Nature Switzerland, 2027, 354-363

Recent advances in automated wildlife monitoring have greatly increased the availability of ecological image data, creating a strong need for scalable analysis methods. In this work, we address the automated identification of Eurasian spoonbills (Platalea leucorodia) using camera trap imagery collected in long-term monitoring programs in the Camargue (Southern France). Each bird is equipped with a unique four-character PVC ring, enabling individual identification.

Assessing the effects of restoration and conservation on gaseous carbon fluxes and climate mitigation potential across six European coastal wetlands

Fri, 17 Jul 2026 15:48:27

de Miguel Cabrera-Brufau, Camille Minaudo, Katrin Attermeyer, Alba Camacho-Santamans, Rafael Carballeira, Benjamin Misteli, Jorge Montes-Pérez, Daniel Morant, Biel Obrador, Antonio Picazo, et al.
In Ecological Engineering, 232 (November, 2026), 108080
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

Coastal wetlands play a substantial role in regulating Earth's climate through exchanges of greenhouse gases (GHGs). Current European policies promote widespread coastal wetland restoration to reverse historical losses and ongoing pressures. However, substantial uncertainty remains regarding how carbon dioxide (CO2) and methane (CH4) fluxes respond to restoration across different coastal wetland types and whether these responses translate into net climate mitigation in terms of CO2 equivalents (CO2-eq). We measured simultaneous CO2 and CH4 fluxes using static chambers across four seasons at multiple locations spanning preserved, altered and restored sites within six European coastal wetlands of different ecological types. By comparing GHG exchanges and resulting CO2-eq balances across wetlands, we identified dominant biogeochemical drivers of CO2 and CH4 dynamics and assessed the climate mitigation potential of conservation and restoration actions. CO2 fluxes were primarily controlled by landscape-scale vegetation cover and inundation, whereas CH4 emissions responded to less evident changes in water quality, salinity and wetland hydrodynamics. Comparisons of CO2-eq balances between altered and restored sites showed that seagrass replantation was associated with significant mitigation potential under both 100-year and 20-year CH4 warming scenarios, while eutrophication reversal through improved water treatment was only significant under the 20-year scenario. In contrast, other restoration measures modified CO2 and CH4 fluxes in opposing directions, resulting in no significant net change in combined CO2-eq balances. Overall, our results demonstrate that climatic responses to coastal wetland restoration are both GHG-specific and wetland-type dependent, underscoring the need for tailored restoration strategies and robust, multi-GHG monitoring to detect and accurately quantify potential climatic benefits.

Jean Jalbert, l'urgence de réconcilier l'homme et la nature

Wed, 28 Oct 2026 15:44:20

de Philippe Grissac (de)
In Oiseau Mag[Azine] (L'), 164 (Automne, 2026), 28-31

Jean Jalbert est depuis plus de vingt ans aux commandes de la Tour du Valat, Institut de recherche pour la conservation des zones humides méditerranéennes, fondé en 1954 par Luc Hoffmann et qui se situe sur un domaine de près de 3 000 ha au coeur de la Camargue. Fort de 72 années d'expériences, l'Institut irradie aujourd'hui bien au-delà des pays méditerranéens et noue des partenariats avec de nombreuses régions dans le monde. Jean Jalbert a reçu L'OISEAU MAG et a bien voulu revenir sur son parcours personnel et les projets de l'Institut, les difficultés rencontrées et les espoirs.

Effects of non-breeding conditions on the survival of the Collared Pratincole, an Afro-Palearctic migrant

Wed, 26 Aug 2026 11:40:12

de Sandra Hodić, Pablo Vera, Pedro Marin Prado, Wouter M.G. Vansteelant, Leo Zwarts, Jocelyn Champagnon
In Ibis, (en ligne) (August, 2026)
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

Afro-Palearctic migrant populations are declining in Europe, and non-breeding conditions in Africa have been shown to be important in determining the population size of long-distance migrants. Overwintering conditions and prenuptial migration may both influence population growth through direct effects on survival. However, studies examining the impact of environmental factors on species survival remain limited, as this requires data over several years. The Collared Pratincole Glareola pratincola is an insectivorous and strictly migratory wader that nests in grasslands and steppes in Europe and overwinters in savannas, mainly in the Sahel. In this study, we used a 13-year mark–recapture dataset collected at the breeding site in L'Albufera, Valencia (Spain), to estimate annual survival rates of Collared Pratincole. We found a high mean annual survival probability of 0.84 ± 0.01 se, though this varied from year to year. Wet years, as indicated by large maximum floods over the inner Niger delta, the Senegal river and delta, and the NDVI (a remotely sensed measure of vegetation based on primary production) in West Africa, positively affected the survival of the species, explaining respectively 49%, 50% and 62% of the survival temporal variation. Contrary to our prediction, unfavourable winds during prenuptial migration periods were not correlated with survival. Our study supports the hypothesis that drought conditions experienced by migratory birds in the Sahel (e.g. the Great Drought in 1969–1992) may have negatively impacted their populations.

Clonal amplification and weak genetic structuring in the rumen fluke Calicophoron daubneyi at a regional scale in the French Pyrenees

Wed, 26 Aug 2026 11:40:06

de Pilar Alda, Juliette Langand, Dominique Faugère, Antonio A. Vázquez, Elodie Chapuis, Marion Vittecoq, Thierry De Meeûs, Sylvie Hurtrez-Boussès
In International Journal for Parasitology, (en ligne) (July, 2026), 104923
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

Calicophoron daubneyi is an emerging rumen fluke of ruminants whose prevalence and geographic range have increased markedly across Western Europe over recent decades. Despite its growing veterinary importance, population-level genetic studies of this trematode have been hampered by the absence of suitable multilocus markers, with previous work relying on mitochondrial or ribosomal sequences that provide limited resolution for epidemiological inference. In this study, we developed and validated the first panel of polymorphic microsatellite markers for C. daubneyi and applied them to assess genetic diversity, clonality, and population structure in natural populations from the eastern French Pyrenees. Using Illumina-based genomic sequencing, we isolated 16 candidate loci, of which 10 robust and polymorphic microsatellites were retained after stringent quality filtering. We used these markers to genotype 187 adult parasites collected from cattle originating from seven localities spanning a maximum pairwise distance of approximately 50 km. Analyses explicitly accounted for the strong clonal amplification characteristic of trematode life cycles. We observed high levels of genetic diversity and a pronounced but variable clonal signal among sites. After attempting to correct for clonality and null alleles, genetic differentiation among populations was low and no significant isolation by distance was detected, consistent with substantial genetic exchange occurring at the regional spatial scale examined. These findings suggest that definitive host movement contributes importantly in shaping parasite gene flow within this interconnected livestock system. By providing the first validated microsatellite toolkit and baseline population-genetic data for C. daubneyi, this study establishes a foundation for future molecular epidemiological investigations of transmission dynamics, host–parasite interactions, and parasite dispersal in European livestock systems.

Evidence for a relationship between bird body size and uncertainty in individual morphological measurements at ringing

Fri, 26 Jun 2026 10:30:15

de Yanaël Martinais, Elie Gaget, Matthieu Guillemain, Charlotte Francesiaz
In Bird Study, (en ligne) (June, 2026), 1-13
En ligne : doi.org[...]

Operator errors when taking morphometric measurements are more important for larger species and for mass measurements. To quantify operator effects on morphometric measurements during ringing sessions, depending on species size and morphometric characters. Three morphometric characters (wing length, body mass and body condition index) had been measured during ringing sessions on 17,818 individuals of 14 different species in southern France. The deviation from the mean and the variation, both absolute and by percentage, of measurements taken by operators were estimated for each bird species and age and sex categories. We detected operator effects on measurements. Wing length showed a deviation from the mean, reaching less than 1% of total measurement and a small variation. However, body mass showed a large deviation from the mean, and a large variation reaching up to 10% of total measurement. Body condition index showed broadly the same results as body mass, with the same proportion. Larger species were the most affected by measurement errors, both in absolute and in percentage terms. Errors in morphological measurements are common during ringing sessions and are related to the characteristics of the species, particularly their size, the tools used (such as dynamometers for body mass) and the characteristics of the operators.

European coastal wetlands datasets and their use in decision-support tools for policy restoration objectives

Tue, 5 May 2026 09:56:21

de Bruna R. F. Oliveira, Antonio Camacho, Anis Guelmami, Christoph Schröder, Nina Bègue, Martynas Bucas, Constantin Cazacu, Elisa Ciravegna, João Pedro Coelho, Relu Giuca Constantin, et al.
In Environmental Science & Policy, 179 (May, 2026), 104386
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

Ecosystem restoration is a paramount policy priority for this decade, with ambitious global and European targets requiring unprecedented levels of data-driven implementation. Achieving effective and equitable restoration, particularly for coastal wetlands, hinges on spatially explicit socio-ecological information - maps that integrate habitats, ecosystem services, human activities, and pressures to guide prioritization, stakeholder negotiation, and adaptive management. This study, grounded in the RESTORE4Cs initiative, introduces an innovative multi-layered dataset that bridges science and policy for six emblematic European coastal wetlands: Ria de Aveiro (Portugal), Valencian Wetlands (Spain), Camargue (France), Southwest Dutch Delta (Netherlands), Curonian Lagoon (Lithuania), and the Danube Delta (Romania). The dataset consolidates ecological mapping (EUNIS 2021, 2022), human activity and pressure documentation (aligned with EU Habitats Directive, Water Framework Directive, Marine Strategy Framework Directive), comprehensive ecosystem services mapping (CICES v5.1), alongside robust participatory community and stakeholder data. Altogether, the database encapsulates 97 habitat records, 23,160 activity-pressure associations, and 1,668 ecosystem service records—enabling robust cross-regional analyses and direct integration into evidence-based decision support tools. By illustrating practical pathways for participatory engagement, trade-off negotiation, and cross-scale integration, this research equips scientists, policymakers, practitioners, and communities with the scientific foundation to propel the Nature Restoration Regulation and Biodiversity Strategy 2030 objectives, fortifying Europe’s climate adaptation trajectory. The approach showcased signals a new era for restoration science – where spatially explicit, multi-actor data supports policy, mobilizes citizen stewardship, and accelerates the transformative ambitions of Europe’s restoration decade.

Detection of a Merbecovirus with potential ACE2 usage in France

Tue, 5 May 2026 09:56:18

de Océane Rieu, Stéphane Descorps-Declère, Anaïs Dufau, Jordan Meliani, Lionel Brazier, Marion Vittecoq, Carole Leray, Anthony Olivier, Illich Mombo, Frederic Thomas, et al.
In Emerging Microbes & Infections, (en ligne) (April, 2026), 2651469
En ligne : www.tandfonline.com[...]

A novel Merbecovirus, designated Cam-2023, has been identified in Pipistrellus pipistrellus in France through non-invasive surveillance. Phylogenetic analysis demonstrates that Cam-2023 belongs to a Merbecovirus clade previously associated with ACE2 usage in closely related viruses detected in the Netherlands and Russia. While the receptor usage of Cam-2023 remains to be functionally validated, sequence similarities within the Spike protein, particularly the receptor-binding domain, suggest a putative association with a Merbecovirus clade previously associated with ACE2 usage. This discovery broadens the known host diversity of this lineage and extends its geographical range to Western Europe. Our findings highlight the importance of continuous surveillance in European bat populations to better characterize the distribution and zoonotic potential of such high-risk coronaviruses.

Is managing horses ‘as wild’ beneficial for dung beetle assemblages and their associated ecological functions?

Tue, 5 May 2026 09:56:22

de Clémentine Mutillod, William Perrin, Elise Buisson, Laurent Tatin, François Mesléard, Pierre Jay-Robert, Thierry Dutoit
In Journal of Environmental Management, 406 (April, 2026), 129756
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

In Europe, where livestock has largely replaced wild ungulates over the centuries, dung beetle assemblages have become largely dependent on livestock farming. The radical changes in livestock farming practices during the 20th century have therefore had a profound impact on these assemblages. Trophic rewilding with large herbivores is an important focus in European rewilding projects, and dung beetle assemblages appear to be good indicators of the success of rewilding. By comparing the composition of dung beetle assemblages and the rate of dung disappearance in three neighboring grassland habitats in southern France, maintained respectively by a population of Przewalski horses managed by natural selection and two herds managed for production purposes (a flock of sheep and a herd of endurance horses), our study shows a) significant differences in the composition of the dung of the three animals; b) a single pool of dung beetle species; c) but a different assemblage structure. While tunnelers dominated across all the sampled habitats, rollers were the second most abundant group in domestic farms, and were replaced by dwellers in the Przewalski horse rangelands. Differences in dung beetle assemblages and dung composition between the three grazers could both explain that sheep droppings were removed faster than horse dung. Understanding how herbivore types and management shape these assemblages helps refine decisions for conservation and/or rewilding. However, the place of ecological heritage and species co-occurences in these changes need to be examined, since in this region the history of dung beetles is closely linked to that of sheep pastoralism as for other types of semi-natural grasslands in Europe.

Protocole de suivi des populations de Lestes macrostigma (Eversmann, 1836) : un compromis entre niveau d’information et effort investi (Odonata : Lestidae)

Fri, 10 Apr 2026 15:31:50

de Philippe Lambret
In Martinia, 40(4) (Avril, 2026), 21-36
En ligne : martinia.insectes.org[...]

Method for the monitoring of Lestes macrostigma (Eversmann, 1836) populations: a trade-off between level of information and effort invested (Odonata: Lestidae). Lestes macrostigma (Eversmann, 1836) is threatened at the French and European Union scales, and as such should be included in the Habitats Directive. This species is integrated into the French National Action Plan for dragonflies and implementing its national monitoring is a priority action. We present here a method offering trade-off between gathered information and invested effort. This method focuses on the autochthony of the studied population and aims to estimate the total number of imagos emerging from a breeding site. To do so, the site is surveyed along a walk determined by the operator and imagos are counted over a width of 3 m, distinguishing the tenerals which are used as a proxy for evidence of autochthony. This count is then extrapolated to the site scale considering the area of habitat favourable to the species oviposition and emergence, and finally over the season in order to assess the minimal size of the autochthonous population. This size is expressed in classes on an exponential scale: 0 – no individual; 99 – tens of individuals; 999 – hundreds of individuals; 9999 – thousands of individuals, etc. To allow analysis at different scales, we argue that this specific monitoring should be mutualised with a general dragonfly monitoring scheme, such as the French “Steli”, at least at one of the monitored stations.

Vegetation trajectories over 150 years of temporary ponds created in the Camargue delta (Southern France)

Wed, 18 Mar 2026 15:40:14

de Hugo Fontes, Patrick Grillas, Thierry Dutoit, Antoine Gazaix, Elie Gaget, François Mesléard
In Restoration Ecology, (en ligne) (March, 2026), e70372
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

Temporary ponds in the Mediterranean climate have a high conservation value, but many have been severely destroyed or degraded. Pond restoration and new pond creation have been engaged widely. Evaluations of the success of such operations are generally carried out over 10–15 years and show divergent results over this timeframe. In the Camargue (Rhône delta, South of France), several temporary ponds were created with various objectives since the second half of the 19th century.
Study the long-term trajectory of plant communities in created temporary ponds and compare them with those of reference temporary ponds.
We carried out vegetation surveys and measured environmental parameters in 25 ponds created in the 19th, 20th, and 21st centuries, as well as in 27 natural reference ponds (space-for-time substitution approach).
Submerged macrophyte communities (composition, abundance, and species-richness) converged toward the reference communities after one or several decades. Emergent plant communities (terrestrial plants and helophytes) converged more slowly toward the reference communities (composition and abundance). Even after 150 years, the emergent plant communities with the highest conservation interest (in particular Natura 2000 habitat) were not found in created ponds.
The creation of temporary ponds in the Camargue is of conservation interest but cannot compensate for the loss of natural temporary ponds.

Exposure to a mixture of organic pollutants in a threatened freshwater turtle Emys orbicularis: effects of age, sex, and temporal variation

Wed, 11 Mar 2026 16:05:55

de Leslie-Anne Merleau, Olivier Lourdais, Anthony Olivier, Marion Vittecoq, Fabrice Alliot, Sira Traore, Carole Leray, Aurélie Goutte
In Peer Community Journal, 6 (March, 2026)
En ligne : peercommunityjournal.org[...]

Freshwater ecosystems constitute major sinks for organic contaminants, increasing anthropogenic pressures and threatening the unique biodiversity they harbour. In addition to persistent legacy compounds, such as polychlorinated biphenyls (PCBs) and organochlorine pesticides (OCPs), various pollutants are less persistent but are chronically released, including polycyclic aromatic hydrocarbons (PAHs), phthalate diesters (PAEs), pyrethroid pesticides, and insect repellent. Heretofore, these pollutants have received insufficient attention in freshwater reptiles, considering their potential to trigger detrimental effects on organisms. During two years (2019 and 2020), we quantified plasma levels of 46 compounds from 7 chemical families in two monitored populations of the protected European pond turtle (Emys orbicularis) in the Camargue wetland, France. PAHs and PAEs were found predominantly and concomitantly, with similar occurrences and levels in the two populations. We observed similar inter-annual variations in PAHs and PAEs with differences between males and females, highlighting the need for a better assessment of the role of sex in the exposure pathway and the toxicokinetics of contaminants, especially in turtles. The negative relationship between PAH levels and age, as well as the high intra-individual variation in levels of both contaminant families, provides further evidence of limited bioaccumulation of these pollutants in the blood of E. orbicularis. This could be explained by the metabolic biotransformation of parent compounds, highlighting the need to quantify the levels of PAH metabolites and phthalate monoesters. Finally, our work underscores the importance of long-term monitoring to better determine the vulnerability of turtle populations already exposed to a wide range of contaminants.

Integrated modelling of sediment and organic carbon fluxes in a large catchment: quantifying riverine contributions to the Mediterranean Sea

Tue, 20 Jan 2026 10:48:26

de Clément Fabre, Yoann Copard, Sabine Sauvage, Olivier Radakovitch, Hervé Piégay, Jose Miguel Sanchez-Perez, Mathieu Fressard, Olivier Boutron
In Catena, 264 (March, 2026), 109794
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

Within the Land Ocean Aquatic Continuum, the export of dissolved and particulate organic carbon (DOC, POC) is crucial for various processes in aquatic ecosystems and a primary source of greenhouse gas emissions in hydrosystems. Quantifying DOC and POC fluxes at high spatiotemporal resolution is complex because numerous sources and processes influence their dynamics, including climate, geological, and anthropogenic activities. Such quantifications at the catchment scale can be performed using hydrological models that consider OC processes. This study employed the Soil and Water Assessment Tool – Carbon (SWAT-C) to simulate OC dynamics in the large Mediterranean catchment of the Rhône River from 2002 to 2020. We represent hydrological and sediment fluxes at the catchment scale by accounting for sub-catchment diversity and dam operations. The average resulting exports reach 5.52 Mt. y−1, 78.8 kt y−1, and 95.1 kt y−1 with 54.4 %, 71.5 %, and 44.3 % exported during the highest discharges for sediment, POC, and DOC, respectively. The contributions of the southern sub-basins to POC and DOC fluxes are significant, while the northern sub-basins do not show significant patterns. Regarding OC quality, the proportions of labile/refractory OC at the Rhône outlet are 85/15 and 5/95 for POC and DOC, respectively. Global changes could alter flows, such as the labile/refractory OC proportions, which should be quantified using the tool developed in this article to anticipate their impacts on biogeochemical dynamics in the Mediterranean Sea. Finally, our study demonstrates the potential and limitations of SWAT-C for modelling OC dynamics in a large Mediterranean catchment under multiple anthropogenic pressures.

Nasal saddles reduce survival rate in Eurasian teal

Tue, 3 Feb 2026 11:22:37

de Matthieu Guillemain, Marion Gelin, Betty Plaquin, Emilienne Gregorczyk, Jocelyn Champagnon, Léo Bacon
In The Journal of Wildlife Management, (en ligne) (March, 2026), e70181
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

Nasal marks are used to study duck behavior and demography. Earlier tests detected no negative effects on dabbling duck physiology and behavior, but the potential deleterious effect on annual survival probability remained to be evaluated. We relied on multistate capture-mark-recapture models applied to 11,874 Eurasian teal (Anas crecca) banded in France from 2002 to 2021, of which 308 were recaptured alive at least once and 1,390 yielded dead band recoveries. Of the banded individuals, 6,770 teal (57.0%) were also marked with a plastic nasal saddle to evaluate the cost-benefit trade-off of the technique. Saddled teal had a lower annual survival probability (ranging from 0.30 ± 0.02 [SE] in hatch-year females to 0.45 ± 0.02 in after hatch-year males) than banded-only individuals (0.44 ± 0.03 to 0.53 ± 0.02). Incorporating live nasal saddle resighting information in life histories of the individuals did not improve precision of annual survival probability estimates. The mechanism behind such reduced annual survival remains unclear, and a potential greater influence of hunting on saddled birds cannot be excluded, either through greater exposure to hunting owing to birds’ behavior or through greater targeting by hunters. In any case, there were clear drawbacks to bird survival, with very limited benefits for the biologists, so this technique should be abandoned when the unique goal of fitting nasal saddles is to evaluate long-term demographic parameters in dabbling ducks. The method could remain valuable for other purposes such as shorter-term monitoring of brood-rearing females, evaluation of stopover duration, or some migration studies, but even then, results should be interpreted with caution and animal welfare issues should be considered.

Dynamique spatiale et temporelle littorale de la Réserve de Camargue (2026)

Wed, 28 Oct 2026 15:44:14

de Elodie Potier
La Rochelle : Université de La Rochelle, 2026, 127

Les côtes sableuses représentent 26 % du linéaire côtier méditerranéen en France. Elles sont très fragmentées dans la partie orientale de la région PACA, où l’on trouve plutôt des plages de poches. La majeure partie des cordons dunaires sont situés sur les côtes languedociennes et à l’ouest des Bouches du Rhône, ainsi que le long de la plaine orientale de Corse (UICN, 2020). L’enjeu est donc fort sur la Réserve de Camargue de comprendre et préserver un système littoral sableux aujourd’hui protégé des pressions urbanistiques et touristiques. Le présent travail a permis à la fois de valoriser des connaissances existantes sur la Réserve, de produire des jeux de données actualisés et utilisables et de poser les bases d’un suivi à long terme. Ce dernier pourrait consister en trois volets : - la poursuite des suivis topographiques plages et dunes par la technique validée dans le présent travail, avec une fréquence annuelle ou saisonnière (avant/après tempêtes) - l’actualisation régulière (tous les 10 ans par exemple) des données LiDARs et ortho photos produites afin de surveiller l’évolution des variables retenues comme pertinentes (volumes de sable des dunes et barycentres des masses de sable, dynamiques d’érosion/accrétion, surface couverte par la végétation) en reproduisant les méthodes ici établies - L’entretien des ganivelles et le suivi de leur impact sur l’apport sédimentaire des dunes et leur couvert végétal 56 Par ailleurs, les données produites pourront constituer la base de futurs travaux complémentaires sur la gestion des ganivelles et l’impact éolien notamment. Naturellement dynamiques, les dunes et les plages se situent aujourd’hui dans un contexte de changement climatique, avec en particulier la montée du niveau marin et l’augmentation d’événements extrêmes (tempêtes). Actuellement, une stratégie littorale est en cours d’élaboration en Camargue, portée par le SYMADREM. Avec un volet submersion et un volet trait de côte, les orientations globales de gestion influenceront le littoral de la Réserve. Pour le gestionnaire de la Réserve, il apparait nécessaire de poursuivre l’installation et l’entretien de ganivelles dans les zones d’érosion. Ainsi, le stage aura permis de mettre à jour et de développer une base de données destinée au suivi des profils topographiques, ainsi qu’en posant les bases d’étude de la géomorphologie du littoral de la Réserve et de l’évolution de son couvert végétal.

Suivi de la reproduction de la Glaréole à collier Glareola pratincola en Camargue et actions de conservation pour l’année 2026 (2026)

Fri, 2 Oct 2026 15:01:34

de Alexis Cartier, Julien Birard, Alexandre Crestey, Jocelyn Champagnon
Arles : Tour du Valat, 2026, 30

En 2026, le suivi de la Glaréole à collier en Camargue a recensé 205 couples, soit le deuxième plus gros effectif depuis le début du suivi (après les 223 couples de 2024), confirmant la forte croissance de la population ces dernières années, même si le succès de reproduction apparaît faible, en partie à cause d'une détection difficile des poussins dans les milieux naturels et d'un suivi rendu compliqué par l'explosion du nombre de colonies. Avec 16 colonies découvertes — un record — grâce notamment aux données GPS de 10 individus équipés en 2024, dont deux présents en Camargue ayant permis d'identifier trois nouveaux sites, le suivi devient plus chronophage, d'autant que les fortes chaleurs réduisent la plage horaire d'observation (75 % des colonies étant en région PACA, 25 % en Occitanie). L'origine de cette augmentation reste incertaine, mais pourrait résulter des actions de protection et de sensibilisation, de conditions hivernales favorables au Sahel, ou d'échanges avec les populations espagnoles, confirmés par l'observation d'individus bagués d'origine espagnole. Les espaces naturels protégés, qui accueillaient 8 colonies sur 16, jouent un rôle clé pour la nidification, et la quasi-absence d'échec de couvée liée au dérangement humain témoigne de l'efficacité de la sensibilisation, illustrée notamment par la convention signée entre l'EARL Les Alouettes et la Tour du Valat, qui a permis la reproduction de la plus grosse colonie de l'année (57 couples, 70 poussins) contre une compensation de 823 euros à l'agriculteur. Le suivi de la reproduction ne sera pas reconduit en 2027 (il n'a lieu que tous les deux ans), mais les actions de sensibilisation et de protection seront maintenues afin d'assurer la conservation de cette espèce fragile et sensible. [résumé rédigé à l'aide de l'IAG)

Analyse des trajectoires d'évolution d'une lagune méditerranéenne dans le delta du Gediz en Turquie (2026)

Mon, 28 Sep 2026 11:08:18

de Marie-Lou Corbin
Brest : Université de Bretagne occidentale, 2026, 48

L'utilisation de l'indice spectral NDWI a largement permis d'accélérer le processus de vectorisation du trait de côte à partir des images satellites, tout en standardisant la délimitation sable/eau selon des valeurs normalisées. Cette méthode est intéressante pour une étude à large comme à petite échelle, et elle a fait ses preuves sur la lagune de Homa dont le littoral présente une variété interessante de faciès. L'analyse des indicateurs a permis de mettre en évidence la fragmentation des îles barrières, dont le recul et les pertes de surface ne semblent pas permettre une conservation du littoral sur le long terme si la dynamique actuelle persiste. De plus, au regard de l'évolution des autres lagunes du delta du Gediz, qu'il serait intéressant d'étudier aussi finement, il est fort peu probable que la forme actuelle du littoral de la lagune soit maintenue dans les prochaines décennies, de manière naturelle du moins. A court-terme, les risques sont d'avantage liés aux usages de la lagune. Même si certaines îles barrières semblent maintenir une part de leur stock sédimentaire par la création de flèches littorales, la fragmentation des îles permet le passage des poissons, et les mesures de gestion mises en place pour tenter d'atténuer ce phénomène ne semblent provoquer que d'avantage de pressions sur le littoral, comme l'ouverture de graux supplémentaires et l'envasement. Les mesures actuellement appliquées étant centrées autour d'interventions humaines, comme les enrochements, et et au vu des enjeux économiques et professionnels découlant du maintien de cette lagune, il est fort probable que la future gestion soit orientée vers des actions anthropiques pour tenter de contrer les trajectoires d'évolution du littoral. Au vu de la faible évolution du littoral pour le secteur qui contenait des marais littoraux végétalisés, il pourrait être intéressant de poursuivre l'analyse sur ce type de trait de côte présent dans d'autres portions du littoral du delta du Gediz afin de déterminer si la végétalisation serait une solution adaptée pour tenter de conserver les avantages de la lagune de Homa de manière durable.

Nouvelles données sur quatre espèces de Lépidoptères inventoriées en Camargue (France)(Lepidoptera, Blastobasidae, Gelechiidae, Sesiidae)

Fri, 25 Sep 2026 13:55:47

de Jacques Nel, Elie Gaget, Fany Jariod, Marc Thibault, Luc Belenguier
In Revue de l’Association Roussillonnaise d’Entomologie, 119 (2026), 50-53

De nouvelles données (répartition, biologie et genitalia) sont présentées pour quatre espèces de Lépidoptères observées en Camargue (France, Bouches-du-Rhône) : Xenopathia novaki (Rebel, 1891) [Blastobasidae], Monochroa moyses Uffen, 1991 [Gelechiidae, Anomologini], Synanthedon theryi Le Cerf, 1916 et Bembecia ichneumoniformis ([Denis & Schiffermüller], 1775) [Sesiidae].

Cartographie des habitats potentiellement favorables au Phragmite aquatique sur le pourtour méditerranéen continental français (2026)

Fri, 25 Sep 2026 13:55:43

de Stéphane Debien
Brest : Université de Bretagne occidentale, 2026, 70

Le Phragmite aquatique (Acrocephalus paludicola) est un passereau migrateur transsaharien mondialement menacé, classé « Vulnérable » par l'UICN. Alors que sa halte post-nuptiale sur la façade atlantique est bien documentée, sa migration pré-nuptiale printanière via le littoral méditerranéen français, caractérisée par une vitesse de progression rapide liée à l’urgence de la reproduction, demeure très méconnue. Ce travail s’intègre dans l'Action 3 du Plan National d'Actions (PNA) et le projet européen LIFE AWOM, avec pour objectif d’identifier et de cartographier les habitats potentiellement favorables à l’espèce sur ce littoral. La méthodologie a reposé sur l’harmonisation de données cartographiques hétérogènes de 42 sites d'étude vers la typologie européenne EUNIS, puis sur le développement d'une passerelle typologique spécifique vers le référentiel d'évaluation écologique « ACROLA ». Pour les sites dépourvus de cartographie locale, les données prédictives du programme national CarHab ont été mobilisées. Au total, 38 sites ont été cartographiés, couvrant 154 800 hectares d'habitats naturels. Les habitats considérés comme les plus favorables occupent 12,3 % de cette surface globale (soit 12 426,50 ha), confirmant un potentiel d'accueil significatif. Une enquête menée auprès des gestionnaires d’espaces naturels (13 répondants pour 18 sites) a permis de confronter ces cartes aux réalités de terrain. Si 53,9 % jugent la pré-cartographie fiable dans son ensemble, 84,6 % valident la pertinence écologique des polygones de favorabilité maximale (représentés en vert), faisant de cet outil un guide d’aide à la décision pour cibler les futurs inventaires de terrain. Enfin, l'enquête révèle que l'espèce est encore très peu intégrée dans les stratégies locales (seuls 15,4 % des sites l'inscrivent dans leur Formulaire Standard de Données) et fait face à des menaces critiques comme l'assèchement précoce des zones humides (61,5 %) et la prolifération d'espèces exotiques envahissantes. Néanmoins, l’intérêt unanime (100 %) des gestionnaires pour intégrer un réseau interrégional offre de formidables perspectives pour coordonner la conservation à l'échelle de ce corridor de migration.

Á propos de l’écologie d’Eristalinus megacephalus (Rossi, 1794) (Diptera, Syrphidae)

Fri, 25 Sep 2026 13:55:40

de Elie Gaget
In Revue de l'Association Roussillonnaise d'Entomologie, 121 (2026), 207-210

Eristalinus megacephalus (Rossi, 1794) a été observée pour la première fois en Camargue (delta du Rhône, France) en 2015, où elle y est désormais très abondante. Cette note rassemble des observations et expérimentations sur l’écologie de l’espèce, en particulier de la ponte à l’imago. La ponte a été observée dans une prairie inondée, avec oviposition directement dans de la bouse de vache. La durée d’incubation observée est de trois jours et les imagos ont émergé entre 20 et 40 jours après la ponte. La durée de développement larvaire ne semble pas être influencée par la présence ou l’absence d’immersion du substrat.

Prédation d’une Anguille d’Europe par une Couleuvre vipérine en Camargue

Wed, 23 Sep 2026 11:46:18

de Fany Jariod
In Bulletin de la société herpétologique de France, 188 (2026)
En ligne : lashf.org[...]

Cet article décrit l’observation, réalisée le 8 juillet 2025 dans la réserve naturelle nationale de Camargue, d’une Couleuvre vipérine s’attaquant à une anguille européenne. La connaissance actuelle fait état d’un seul cas similaire de prédation, recensé en France jusqu’à présent. Trois cas similaires avaient été signalés en Espagne.

Apport de la télédétection à la caractérisation des habitats humides pour l’étude de l’abondance et de la distribution d’oiseaux d’eau au Sahel : Cas du Parc National de Zakouma et du lac Fitri (Tchad) (2026)

Wed, 23 Sep 2026 11:46:14

de Razy Badji
Marseille : Université Aix-Marseille, 2026, 50

Les zones humides sahéliennes constituent des milieux essentiels pour les oiseaux d’eau migrateurs notamment en dehors de la période de reproduction. Leur caractérisation spatiale et temporelle permettrait de mieux comprendre, analyser et modéliser la distribution des oiseaux d’eau en dehors de cette période. Ce travail, réalisé dans le cadre du partenariat entre la Tour du Valat (TdV) et l’Office Français de la Biodiversité (OFB). Les dénombrements réalisés dans cette étude sont cofinancés par le projet RESSOURCE+, coordonné par la Food and Agriculture Organization (FAO) et financé par l’Union Européenne (UE) et le Fonds français pour l’environnement mondial (FFEM). Il vise à cartographier par télédétection deux zones : les surfaces en eau du Parc National de Zakouma (PNZ) en février 2024 ; et les types d’habitats du lac Fitri entre 2018 et 2025 à partir d'images Sentinel-2 et d'une classification supervisée par Random Forest. Les cartes produites permettront de caractériser la disponibilité spatiale des habitats et de fournir des covariables pour la modélisation de l'abondance des populations d'oiseaux d'eau. L’approche utilisée repose sur des images Sentinel-2, des indices spectraux, ainsi que sur l’algorithme de classification supervisée Random Forest, mis en œuvre dans Google Earth Engine. Dans le PNZ, la cartographie réalisée en février 2024 a permis de distinguer les surfaces en eau, la végétation humide et les autres couvertures avec une précision globale de 93,3 % et un coefficient Kappa de 0,90. Les résultats mettent notamment en évidence la présence de marigots dont une partie importante est associée à de la végétation humide. Sur le lac Fitri, huit classifications ont été réalisées entre 2018 et 2025 présentent des précisions globales comprises entre 90,63 % et 96,64 %, avec des coefficients Kappa compris entre 0,88 et 0,95. Cinq grandes classes d’habitats ont été cartographiées : l’eau permanente, l’eau temporaire, les marais à hélophytes, la forêt inondée et les sols nus et secs. Les résultats montrent une relative stabilité des surfaces en eau permanente, tandis que celles temporaires présentent de fortes variations selon les dates. Ce comportement est caractéristique des zones humides temporaires sahéliennes, dont l'inondation dépend largement de la pluviométrie de la saison précédente. Les marais à hélophytes restent globalement étendus, alors que la forêt inondée présente une dynamique plus irrégulière. Ces variations mettent en évidence une forte dynamique spatiale et temporelle des habitats du lac Fitri, en lien avec les variations de mise en eau observées au cours de la période étudiée. Cette variabilité rend nécessaire une cartographie propre à chaque année, une seule date ne pouvant représenter l'étendue réelle des habitats au moment de chaque campagne. Les cartes produites, associées au NDVI, pourront ainsi être utilisées comme covariables pour modéliser l’abondance des populations d’oiseaux d’eau dénombrés par échantillonnage systématique aérien.

Etude des facteurs influençant la dynamique de population de la Glaréole à collier (Glareola pratincola) en Camargue, issus de 25 années de suivi (2026)

Mon, 31 Aug 2026 16:43:28

de Alexis Cartier
Rennes : Université de Rennes, 2026, 33

La Camargue est l’une des plus vastes zones humides méditerranéennes (150 000 hectares), abritant une richesse exceptionnelle d’espèces à enjeu de conservation. Ces habitats restent malgré tout soumis aux activités anthropiques, la majorité restant exploitée par des acteurs privés. La Glaréole à collier est un oiseau limicole se reproduisant en France uniquement en Camargue, nichant à même le sol sur des habitats agricoles (labours) ou naturels (sansouires), rendant la réussite de la reproduction très dépendante des dérangements humains ou naturels. De faible effectif, la population nicheuse française est suivie tous les ans depuis 2000, témoignant ainsi de l’évolution des effectifs reproducteurs sur les 25 dernières années. Des actions de sensibilisation et de protection ont été entrepris au cours de cette période afin de favoriser la reproduction des oiseaux sur des colonies exemptes de dérangement. L’objectif de cette étude était d’analyser la tendance de la population camarguaise au cours de ces 25 dernières années et de comprendre les facteurs principaux influençant cette tendance. Ainsi, les résultats ont montré une croissance annuelle de la population française de 4,3±0,3%, avec une récente explosion de la population par 2 sur les cinq dernières années, passant de 94 couples en 2020 à 205 couples en 2026. Si l’augmentation de l’utilisation des sites protégés pour la nidification couplée à l’efficacité des mesures de protection et de sensibilisation, bénéfiques à l’augmentation du succès reproducteur semblent pouvoir expliquer en partie la croissance observée, d’autres facteurs semblent plus influents dans la tendance observée. La mise en place d’une analyse matricielle a révélé la contribution plus importante de la survie adulte, par rapport au succès reproducteur ou la survie juvénile sur les taux de croissance asymptotiques observés entre 2008 et 2020. La survie adulte, dépendante des conditions climatiques hivernales au Sahel semble être le facteur majeur influençant la dynamique de la population française.

CISTOX – Les reptiles exposés aux produits phytopharmaceutiques : intégration des effets chez une tortue d’eau douce protégée à l’échelle nationale (2026)

Mon, 31 Aug 2026 16:43:21

de Olivier Lourdais, Aurélie Goutte, Leslie-Anne Merleau, Marion Vittecoq, Anthony Olivier, Frédéric Beau, Marc Gillingham
[S.l.] : Centre d'Etudes Biologiques de Chizé / Ecole Pratique des Hautes Etudes / Tour du Valat, 2026, 34

Nous avons pu échantillonner un nombre important de populations (15) en 2 ans de suivis (311 individus). Le projet CISTOX a permis des mises au point méthodologiques pour les dosages des contaminants, du stress oxydatif et des comptages des cellules sanguines, pour lesquels les validations n’étaient pas disponibles auparavant pour les échantillons de Cistude d’Europe. Nous avons pu produire des résultats sur de nombreux marqueurs physiologiques, permettant d’avoir une vision intégrative des réponses à la pollution. Nous avons mis en évidence une corrélation claire entre la contamination en pesticides de l’eau, notamment par la bentazone, et la proportion d’individus contaminés dans les populations de Camargue. Nous soulignons ainsi le rôle majeur de la riziculture sur les risques d’exposition aux pesticides pour la Cistude d’Europe. Les réponses physiologiques semblent complexes chez cette espèce, mais nous avons pu observer une perturbation de l’immunité fonctionnelle, avec des variations de certaines lignées leucocytaires comme les basophiles. Enfin, des approches originales sont en cours pour tenter de comprendre les relations tripartites entre la contamination en éléments traces métalliques, l’immunité et le microbiome des cistudes. La valorisation scientifique a été au cœur de nos préoccupations avec trois articles publiés et plusieurs articles en soumission ou en cours de rédaction pour la fin 2026. La réalisation d’un documentaire est également prévue pour diffuser les travaux et communiquer sur le rôle de sentinelle des zones humides de la Cistude d’Europe. Nos travaux ont fait l'objet de nombreuses communications auprès de publics variés (colloques scientifiques, ANSES, grand public) et ont aussi servi de support pour les enseignements de Licence et de Master de l’Ecole Pratique des Hautes Etudes.

Bilan carbone d'un institut de recherche : approche combinée Labos 1point5 et diagnostic agricole (2026)

Mon, 31 Aug 2026 16:43:17

de Massinissa Sadji
Toulouse : Université de Toulouse, 2026, 25

Le changement climatique, largement dû aux émissions anthropiques de gaz à effet de serre, impose aux organisations d’évaluer leur empreinte carbone pour orienter leur actions de réduction. Ce stage a eu pour objectif de réaliser le premier bilan carbone des émissions de gaz à effet de serre de la Fondation Tour du Valat (TDV), institut de recherche pour la conservation des zones humides méditerranéennes, pour l’année de référence 2024. L’étude s’appuie sur l'outil GES 1.5, développé par le collectif Labos 1.5, complété par l'outil ‘Je diagnostique ma ferme’ pour évaluer les émissions et le stockage de carbone liés aux activités agricoles de l’institut. Les données d’achats, de déplacements, d’alimentation et de consommations énergétiques ont été collectées, vérifiées et structurées à partir des fichiers comptables et de questionnaires diffusés au personnel. Hors activités agricoles, l’empreinte carbone de la TDV s'élève à 522 tCO2e, les achats, les déplacements professionnels et domicile-travail constituent les principaux postes émetteurs. En intégrant les activités agricoles (818 tCO2e brut), l’empreinte totale atteint 1 340 tCO2e, en partie compensée par un stockage de carbone estimé à 461 tCO2e, ramenant le bilan net à 879 tCO2e. Les scénarios de réductions explorés avec l'outil Scénario 1.5 ainsi qu'une réflexion plus large autour d'autres pistes d'amélioration permettraient une réduction globale de 6 à 7 % des émissions. Ce travail permet également d'identifier des pistes concrètes pour faciliter la réalisation et l'actualisation des futurs BGES de la TDV.

The Zone Atelier Camargue (ZACAM) (2026)

Wed, 26 Aug 2026 11:40:17

de Nathalie Boutin, Raphael Mathevet, Delphine Destoumieux-Garzon, Marion Vittecoq, Frederic Thomas
[S.l.] : John Wiley & Sons, Ltd, 2026, 293-312
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

The Zone Atelier Santé Environnement Camargue (ZACAM), created in January 2024 by the French National Scientific Research Committee (CNRS), is responding to this challenge by focusing research on the prevention of environment-related diseases in this delta region. Its objective is to coordinate research efforts and promote an integrated approach to health, including ecological, sociological, psychological, political, economic, legal and ethical dimensions based on the “One Health” and “Full Health” approaches. The CNRS has collaborated with the Tour du Valat since its creation. The ZACAM benefits from partnerships through the networks hosted by its units. At the Réseau des Zones Ateliers (RZA) level, shared discussions must be conducted within Working Groups such as the health and environment WG, which encourages collaboration between the ZA. ZACAM is completing its construction phase and has just been certified. It is now part of the RZA.

Suivi et gestion du Marais restauré de Petit Badon : bilan de période 2023-2025 (2026)

Wed, 26 Aug 2026 11:40:14

de Pauline Rocarpin, Hugo Fontes, Morgan Garnodon, Emilie Laurent, Philippe Lambret, Marion Lourenço, Anthony Olivier, Loic Willm, Thomas Blanchon, Yves Kayser
Arles : Tour du Valat, 2026, 1 vol. (51 p.)

Le projet de restauration du marais de Petit Badon, situé en Camargue, a été lancé en 2017. L'objectif était de recréer un marais temporaire méditerranéen (14 ha) sur une ancienne friche agricole, afin de :
- Restaurer des habitats favorables à la biodiversité (flore, oiseaux, odonates, amphibiens, etc.)
- Étudier la dynamique écologique du site
- Créer un terrain de démonstration pour la pédagogie et la recherche.

Un suivi de la biodiversité a été réalisé de 2023 à 2025 :
- Paysage : Un protocole de suivi photographique (vues aériennes et au sol) a permis d’observer l’évolution de la végétation, notamment l’expansion d’espèces halophytes et aquatiques.
- Flore : La végétation aquatique est dominée par Chara vulgaris et Riella cossoniana, avec une progression d’espèces typiques des marais temporaires (Ranunculus peltatus, Zannichellia palustris). Cependant, des espèces envahissantes comme les tamaris et les massettes se développent, menaçant les espèces annuelles.
- Odonates : 13 espèces ont été recensées, dont Lestes macrostigma (en danger en France), favorisée par les remises en eau tardives. Le site est devenu un refuge pour cette espèce rare.
- Amphibiens : 4 espèces sont présentes, dont la Rainette méridionale (Hyla meridionalis), dont les effectifs ont explosé en 2025. Cependant, des espèces invasives comme les grenouilles vertes (Pelophylax ridibundus) dominent.
- Chiroptères : 13 espèces de chauves-souris ont été identifiées, dont des espèces rares comme la Noctule commune et la Barbastelle d’Europe, confirmant l’importance du site pour ce taxon.
- Oiseaux : 158 espèces ont été observées, dont des nicheurs comme l’Échasse blanche (Himantopus himantopus) et des migrateurs comme la Glaréole à collier (Glareola pratincola). Les effectifs varient selon les années et les conditions hydrologiques.

Gestion hydrologique et actions complémentaires :
- Gestion de l’eau : un plan de pompage adaptatif a été mis en place pour mimer le cycle méditerranéen (mise en eau tardive en automne, assec estival). Cela a permis de réduire les coûts énergétiques et de limiter les nuisances sonores.
- Lutte contre les espèces invasives :
- Végétales : arrachage manuel de Baccharis halimifolia (Sénéçon en arbre), Paspalum distichum, et surveillance des jussies (Ludwigia sp.).
- Animales : Contrôle des grenouilles vertes envahissantes.
- Pâturage : un troupeau de chevaux sauvages de Camargue en rotation permet de limiter la végétation hélophyte et de maintenir un marais "ouvert", favorable aux macrophytes aquatiques.
[résumé rédigé par une IA]

Plan d’adaptation de la gestion au changement climatique : Réserve naturelle régionale de la Tour du Valat (2026)

Tue, 21 Jul 2026 14:45:58

de Noémie Nojaroff, Ophélia Abis, Maëlle Gatel, Laureen Keller, Damien Cohez
Arles : Natur'Adapt Sud, 2026, 34 p. (Projet d’adaptation de la gestion des réserves naturelles de Provence-AlpesCôte d’Azur au changement climatique (2024 – 2026))

Le présent document s’inscrit dans la démarche d’adaptation au changement climatique Natur’Adapt, menée par la Réserve naturelle régionale de la Tour du Valat dans le cadre du projet Natur’Adapt Sud. Cette démarche vise à comprendre et anticiper les impacts possibles du changement climatique sur le site afin d’adapter la gestion de la réserve à ces évolutions futures. Un Diagnostic de vulnérabilité et d’opportunité (DVO) au changement climatique (Nojaroff et al., 2026) a été réalisé lors de la première étape de cette démarche. Ce premier livrable a permis de réfléchir aux évolutions possibles induites par le changement climatique sur la réserve. A la suite de ce travail, le plan d’adaptation permet de réfléchir à une stratégie d’adaptation globale de la gestion. Cette dernière s’appuie sur le constat que la gestion actuelle, dans le contexte d’un delta endigué, repose déjà sur un accompagnement interventionniste du fonctionnement de certains milieux, notamment par le biais de la gestion hydraulique et l’apport artificiel d’eau douce. En revanche, ce n’est pas le cas pour tous les milieux, et la gestion actuelle a surtout pour objectif de réduire les pressions qui pèsent sur le patrimoine naturel du site. La stratégie d’adaptation de la Tour du Valat consiste donc à s'appuyer sur la résilience des écosystèmes fonctionnels déjà présents (voire améliorer leur résilience), et adapter la gestion des sites déjà gérés pour leur laisser et nous laisser plus de temps face aux pressions climatiques. La stratégie d’adaptation est ensuite déclinée par thématiques. Pour chacune d’entre elles, la gestion actuelle est questionnée au regard du DVO, ce qui permet de faire émerger des orientations envisagées pour le futur. Ces dernières sont ensuite traduites en propositions de mesures d’adaptation. Les thématiques ciblées dans le plan d’adaptation de la RNR de la Tour du Valat sont les suivantes : - Diversité des mares et marais temporaires ; - Etendues de pelouses, prés salés et sansouïres ; - Communautés d’oiseaux d’eau ; - Patrimoine naturel d’origine fluviatile ; - Dunes de la Commanderie ; - Gestion pastorale ; - Gestion quotidienne. En cohérence avec la stratégie d’adaptation, les mesures d’adaptation identifiées sont variées, allant du maintien de la gestion de certains secteurs tant que c’est possible, à l’abandon de certaines stratégies de gestion, en passant par la réflexion à des stratégies de repli ou l’adaptation de la gestion actuelle à l’évolution des conditions et des enjeux. L’amélioration des connaissances et le suivi des évolutions sont également bien représentés parmi les mesures proposées. Un des leviers principaux et transversaux identifiés dans ce plan d’adaptation est la nécessité de renforcer les échanges entre gestionnaires d’espaces naturels (et acteurs plus largement), pour plus de cohérence et d’efficacité dans les études, actions et projets d’adaptation à l’échelle territoriale. Plus globalement, la démarche Natur’Adapt a été l’occasion pour le gestionnaire de prendre conscience des évolutions climatiques locales à venir et de leurs conséquences possibles sur les écosystèmes, les activités socio-économiques et la gestion de la réserve. Ce travail a ainsi permis de renforcer la vision d’une gestion dynamique et adaptative. Les réflexions menées au cours de la démarche ont vocation à alimenter les prochaines étapes de vie du plan de gestion, et guider le gestionnaire tout au long de la vie de la réserve.

Plan d’adaptation de la gestion au changement climatique : Réserve naturelle nationale des Marais du Vigueirat (2026)

Tue, 21 Jul 2026 14:45:54

de Noémie Nojaroff, Ophélia Abis, Maëlle Gatel, Laureen Keller, Leïla Debiesse
Arles : Natur'Adapt Sud, 2026, 47 p. (Projet d’adaptation de la gestion des réserves naturelles de Provence-AlpesCôte d’Azur au changement climatique (2024 – 2026))

Le présent document s’inscrit dans la démarche d’adaptation au changement climatique Natur’Adapt, menée par la Réserve naturelle nationale des Marais du Vigueirat dans le cadre du projet Natur’Adapt Sud. Cette démarche vise à comprendre et anticiper les impacts possibles du changement climatique sur le site afin d’adapter la gestion de la réserve à ces évolutions futures. Un Diagnostic de vulnérabilité et d’opportunité (DVO) au changement climatique (Nojaroff et al., 2026) a été réalisé lors de la première étape de cette démarche. Ce premier livrable a permis de réfléchir aux évolutions possibles induites par le changement climatique sur la réserve. A la suite de ce travail, le plan d’adaptation permet de réfléchir à une stratégie d’adaptation globale de la gestion. Cette dernière s’appuie sur le constat que la gestion actuelle, dans le contexte d’un delta endigué et d’un site géré depuis longtemps, repose déjà sur un accompagnement interventionniste du fonctionnement de certains milieux, notamment par le biais de la gestion hydraulique et l’apport artificiel d’eau douce. En revanche, ce n’est pas le cas pour tous les milieux, et la gestion actuelle a surtout pour objectif de réduire les pressions qui pèsent sur le patrimoine naturel du site. La stratégie d’adaptation des Marais du Vigueirat consiste donc à maintenir dans un premier temps les moyens permettant la gestion du site, tout en préparant l’accompagnement des évolutions à venir, pour pouvoir à terme laisser-faire beaucoup plus la nature et assurer un rôle de témoin des changements. La stratégie d’adaptation est ensuite déclinée par thématiques. Pour chacune d’entre elles, la gestion actuelle est questionnée au regard du DVO, ce qui permet de faire émerger des orientations envisagées pour le futur. Ces dernières sont ensuite traduites en propositions de mesures d’adaptation. Les thématiques ciblées dans le plan d’adaptation de la RNN des Marais du Vigueirat sont les suivantes : - Les mares temporaires méditerranéennes ; - Les marais semi-permanents et les anatidés hivernants ; - Les roselières et l’avifaune associée ; - Les laro-limicoles nicheurs ; - Le Leste à grands stigmas ; - La Nivéole d’été ; - La Scorzonère à petites fleurs ; - Le Lapin de garenne ; - La Cistude d’Europe ; - La gestion pastorale ; - La gestion hydraulique ; - La gestion des espèces exotiques envahissantes ; - L’accueil du public et la sensibilisation ; - La chasse ; - La gestion quotidienne. En cohérence avec la stratégie d’adaptation, les mesures d’adaptation identifiées sont variées, allant du maintien de la gestion de certains secteurs tant que c’est possible à la réflexion à des stratégies de recul stratégique, en passant par l’adaptation d’opérations actuelles à l’évolution des conditions et des enjeux. L’amélioration des connaissances et le suivi des évolutions sont également bien représentés parmi les mesures proposées. Un des leviers principaux et transversaux identifiés dans ce plan d’adaptation est la nécessité de renforcer les échanges entre gestionnaires d’espaces naturels (et acteurs plus largement), pour plus de cohérence et d’efficacité dans les études, actions et projets d’adaptation à l’échelle territoriale.

Plan d’adaptation de la gestion au changement climatique : Réserve naturelle nationale de Camargue (2026)

Tue, 21 Jul 2026 14:45:41

de Noémie Nojaroff, Ophélia Abis, Maëlle Gatel, Laureen Keller, Luc Belenguier
Arles : Natur'Adapt Sud, 2026, 37 p. (Projet d’adaptation de la gestion des réserves naturelles de Provence-AlpesCôte d’Azur au changement climatique (2024 – 2026))

Le présent document s’inscrit dans la démarche d’adaptation au changement climatique Natur’Adapt, menée par Société Nationale de Protection de la Nature, gestionnaire de la Réserve naturelle nationale de Camargue, dans le cadre du projet Natur’Adapt Sud. Cette démarche vise à comprendre et anticiper les impacts possibles du changement climatique sur le site afin d’adapter la gestion de la réserve à ces évolutions futures. Un Diagnostic de vulnérabilité et d’opportunité (DVO) au changement climatique (Nojaroff et al., 2026) a été réalisé lors de la première étape de cette démarche. Ce premier livrable a permis de réfléchir aux évolutions possibles induites par le changement climatique sur la réserve. A la suite de ce travail, le plan d’adaptation permet de réfléchir à une stratégie d’adaptation globale de la gestion. Cette dernière repose sur une logique d’acceptation des évolutions liées au changement climatique sur la réserve. Les axes principaux sont donc d’améliorer les connaissances pour mieux comprendre ses effets sur l’aire protégée et documenter les évolutions en cours, et d’accompagner la transition vers un laisser-faire à long terme. L’accent est aussi mis sur l’accompagnement des acteurs locaux, afin de limiter le cumul des impacts liés aux activités humaines et des effets du changement climatique. La stratégie d’adaptation est ensuite déclinée par thématiques. Pour chacune d’entre elles, la gestion actuelle est questionnée au regard du DVO, ce qui permet de faire émerger des orientations envisagées pour le futur. Ces dernières sont ensuite traduites en propositions de mesures d’adaptation. Les thématiques ciblées dans le plan d’adaptation de la RNN de Camargue sont les suivantes : • Complexe lagunaire ; • Bois des Rièges ; • Sansouïres ; • Pelouses ; • Littoral ; • Mares temporaires méditerranéennes ; • Ancrage territorial ; • Amélioration des connaissances ; • Gestion quotidienne et fonctionnement. Les principaux leviers d’action identifiés dans ce plan d’adaptation sont l’amélioration des connaissances et les échanges favorisant l’ancrage territorial, le travail en réseau et la sensibilisation du territoire et des acteurs aux enjeux liés au changement climatique sur la Réserve naturelle nationale de Camargue. Plus globalement, la démarche Natur’Adapt a été l’occasion pour le gestionnaire de prendre conscience des évolutions climatiques locales à venir et de leurs conséquences possibles sur les écosystèmes, les activités socio-économiques et la gestion de la réserve. Ce travail a ainsi permis de renforcer la vision d’une gestion dynamique et adaptative. Les réflexions menées au cours de la démarche ont vocation à alimenter la conception du prochain plan de gestion, et guider le gestionnaire tout au long de la vie de la réserve.

Diagnostic prospectif de vulnérabilité et d’opportunité au changement climatique : Réserve naturelle régionale de la Tour du Valat (2026)

Tue, 21 Jul 2026 14:45:33

de Noémie Nojaroff, Ophélia Abis, Maëlle Gatel, Laureen Keller, Damien Cohez
Arles : Natur'Adapt Sud, 2026, 56 p. (Projet d’adaptation de la gestion des réserves naturelles de Provence-AlpesCôte d’Azur au changement climatique (2024 – 2026))

Le présent document s’inscrit dans la démarche d’adaptation au changement climatique Natur’Adapt, menée par la Réserve naturelle régionale de la Tour du Valat dans le cadre du projet Natur’Adapt Sud. Cette démarche vise à comprendre et anticiper les impacts possibles du changement climatique sur le site afin d’adapter la gestion de la réserve à ces évolutions futures. Le Diagnostic de vulnérabilité et d’opportunité au changement climatique (DVO) constitue la première étape de cette démarche, complétée par un plan d’adaptation disponible dans un second document. Située au cœur du delta du Rhône dans le département des Bouches-du-Rhône, la Réserve naturelle régionale de la Tour du Valat est gérée par la Fondation Tour du Valat, qui est aussi propriétaire des parcelles. Le site est constitué d’une mosaïque de milieux caractéristiques de la Camargue, comme des marais, des montilles, des prés salés ou des sansouïres. L’analyse du climat passé et des projections dans le futur aux horizons 2050 et 2100 suggère une évolution vers des automnes plus tardifs, des hivers plus doux et humides, ainsi que des étés précoces, plus secs, plus intenses et plus longs. En parallèle, le niveau marin continuera d’augmenter fortement, le recul du trait de côte se poursuivra, et les submersions marines deviendront de plus en plus fréquentes et importantes en Camargue. Ces phénomènes accentueront le processus de salinisation des sols et des eaux superficielles et souterraines. Pour comprendre l’impact des évolutions climatiques sur la RNR, 25 objets ont été sélectionnés puis analysés : 14 relevant du patrimoine naturel, 6 outils et moyens de gestion et 5 activités humaines. Les résultats de l’analyse de vulnérabilité et d’opportunité sont synthétisés dans le récit prospectif de la Réserve naturelle régionale de la Tour du Valat, dernier chapitre de ce diagnostic. Globalement, en l’absence d’évènements extrêmes (submersion marine ou inondations majeures du Rhône), l’ensemble du patrimoine naturel actuel de la réserve se maintiendrait à court terme, avec des variations selon les habitats ou les cortèges d’espèces. Malgré une certaine résilience, l’état de certains habitats et espèces pourrait se dégrader à moyen terme sous l’influence du changement climatique. L’analyse montre par exemple que les mares temporaires méditerranéennes, ainsi que les cortèges qu’elles abritent, font partie des habitats les plus vulnérables aux évolutions à venir (principalement à cause de la salinisation dans ce cas). Les marais pourraient aussi voir leurs cortèges évoluer, en lien avec l’évolution du climat mais aussi des activités présentes dans le delta. Dans l’ensemble, l’analyse montre la dépendance importante d’une partie des éléments caractéristiques de la Tour du Valat à l’alimentation en eau douce du site, dont le maintien n’est pourtant pas garanti à moyen terme. Il est à noter que le présent diagnostic de vulnérabilité présente quelques limites liées au manque de connaissances scientifiques concernant les évolutions climatiques ou leurs impacts sur certains objets. Ce travail constitue tout de même un outil intéressant de projection dans le futur, qui permet au gestionnaire de s’approprier la thématique du changement climatique et de questionner sa gestion dans un contexte plus large.

Diagnostic prospectif de vulnérabilité et d’opportunité au changement climatique : Réserve naturelle nationale des Marais du Vigueirat (2026)

Tue, 21 Jul 2026 14:45:30

de Noémie Nojaroff, Ophélia Abis, Maëlle Gatel, Laureen Keller, Leïla Debiesse
Arles : Natur'Adapt Sud, 2026, 58 p. (Projet d’adaptation de la gestion des réserves naturelles de Provence-AlpesCôte d’Azur au changement climatique (2024 – 2026))

Le présent document s’inscrit dans la démarche d’adaptation au changement climatique Natur’Adapt, menée par le gestionnaire des Marais du Vigueirat dans le cadre du projet Natur’Adapt Sud. Cette démarche vise à comprendre et anticiper les impacts possibles du changement climatique sur la Réserve naturelle nationale des Marais du Vigueirat afin d’adapter la gestion du site à ces évolutions futures. Le Diagnostic de vulnérabilité et d’opportunité au changement climatique (DVO) constitue la première étape de cette démarche, complétée par un plan d’adaptation disponible dans un second document. Située entre le delta du Rhône et la plaine de la Crau dans le département des Bouches-du-Rhône, la Réserve naturelle nationale des Marais du Vigueirat est constituée d’une mosaïque de milieux caractéristiques de la Camargue (marais, roselières, mares temporaires, ...). Propriété du Conservatoire du Littoral (CdL), le site était géré par les Amis des Marais du Vigueirat (AMV) jusqu’en 2025, avant d’être cogéré par la Ligue pour la Protection des Oiseaux (LPO France) et la Ligue pour la Protection des Oiseaux de Provence-Alpes-Côte d’Azur (LPO PACA) depuis le 1er janvier 2026. L’analyse du climat passé et des projections dans le futur aux horizons 2050 et 2100 suggère une évolution vers des automnes plus tardifs, des hivers plus doux et humides, ainsi que des étés précoces, plus secs, plus intenses et plus longs. En parallèle, le niveau marin continuera d’augmenter fortement et le processus de salinisation des sols et des eaux superficielles et souterraines se poursuivra. Pour comprendre l’impact des évolutions climatiques sur la RNN, 23 objets ont été sélectionnés puis analysés : 12 relevant du patrimoine naturel, 6 outils et moyens de gestion et 5 activités humaines. Les résultats de l’analyse de vulnérabilité et d’opportunité sont synthétisés dans le récit prospectif de la Réserve naturelle nationale des Marais du Vigueirat, dernier chapitre de ce diagnostic. Globalement, l’ensemble du patrimoine naturel actuel de la réserve se maintiendrait à court terme, avec des variations selon les habitats ou les cortèges d’espèces. Malgré une certaine résilience, l’état de certains habitats et espèces pourrait se dégrader à moyen terme sous l’influence du changement climatique. L’analyse montre par exemple que les mares temporaires méditerranéennes, ainsi que les cortèges qu’elles abritent, font partie des habitats les plus vulnérables aux évolutions à venir (principalement à cause de la salinisation dans ce cas). Les marais pourraient aussi voir certaines fonctions se dégrader, en lien avec l’évolution du climat mais aussi des activités présentes dans le delta. Dans l’ensemble, l’analyse révèle la dépendance d’une grande majorité des éléments caractéristiques des Marais du Vigueirat à l’alimentation en eau douce du site, dont le maintien n’est pourtant pas garanti à moyen terme. Il est à noter que le présent diagnostic de vulnérabilité présente quelques limites liées au manque de connaissances scientifiques concernant les évolutions climatiques ou leurs impacts sur certains objets. Ce travail constitue tout de même un outil intéressant de projection dans le futur, qui permet au gestionnaire de s’approprier la thématique du changement climatique et de questionner sa gestion dans un contexte plus large.

Diagnostic prospectif de vulnérabilité et d’opportunité au changement climatique : Réserve naturelle régionale de l'Ilon (2026)

Tue, 21 Jul 2026 14:45:21

de Ophélia Abis, Maëlle Gatel, Laureen Keller, Noémie Nojaroff
Arles : Natur'Adapt Sud, 2026, 51 p. (Projet d’adaptation de la gestion des réserves naturelles de Provence-AlpesCôte d’Azur au changement climatique (2024 – 2026))

Située dans le département des Bouches-du-Rhône et gérée par le Parc des Alpilles, la Réserve Naturelle Régionale de l’Ilon, mosaïque d’habitats naturels constituée de milieux de marais, de forêts anciennes et de milieux plus secs, représente un véritable réservoir de biodiversité. L’analyse des projections climatiques futures jusqu’à la fin du siècle met en évidence une poursuite du réchauffement, un allongement d’une saison estivale encore plus chaude et sèche, ainsi qu’une variabilité accrue des précipitations, marquée notamment par une intensification attendue des épisodes méditerranéens. Ces évolutions pourraient affecter le fonctionnement des écosystèmes et certaines composantes du patrimoine naturel, en particulier les milieux humides, qui apparaissent comme les plus vulnérables, notamment la roselière et les espèces paludicoles. Bien que les apports en eau, notamment ceux liés aux canaux et aux activités agricoles du territoire, devraient se maintenir à court terme, il apparait nécessaire d’envisager des scénarios intégrant une disponibilité en eau plus réduite. Quant aux habitats xériques de la réserve, tels que le coussoul et la Coustière, ils semblent certes moins sensibles au changement climatique ; toutefois, leur composition pourrait progressivement évoluer et perdre de leur typicité. Par ailleurs, les risques liés aux incendies et aux éboulements de la falaise, susceptibles d’affecter durablement les habitats, les espèces, et plus largement la gestion et la sécurité du site, devraient également augmenter. Ce diagnostic constitue une première étape de réflexion sur l’adaptation de la gestion de la réserve naturelle au changement climatique et servira ainsi de base à la construction d’un plan d’adaptation. Malgré les incertitudes et les lacunes de connaissances persistantes, ce travail fournit tout de même un outil de projection utile, permettant au gestionnaire de s’approprier pleinement la thématique du changement climatique et de requestionner sa gestion actuelle.

Diagnostic prospectif de vulnérabilité et d’opportunité au changement climatique : Réserve naturelle nationale de Camargue (2026)

Tue, 21 Jul 2026 14:45:16

de Noémie Nojaroff, Ophélia Abis, Maëlle Gatel, Laureen Keller
Arles : Natur'Adapt Sud, 2026, 62 (Projet d’adaptation de la gestion des réserves naturelles de Provence-AlpesCôte d’Azur au changement climatique (2024 – 2026))

Le présent document s’inscrit dans la démarche d’adaptation au changement climatique Natur’Adapt, menée par la Société Nationale de Protection de la Nature, gestionnaire de la Réserve naturelle nationale de Camargue (RNNC) dans le cadre du projet Natur’Adapt Sud. Cette démarche vise à comprendre et anticiper les impacts possibles du changement climatique sur le site afin d’adapter la gestion de la réserve à ces évolutions futures. Le Diagnostic de vulnérabilité et d’opportunité au changement climatique (DVO) constitue la première étape de cette démarche, complétée par un plan d’adaptation disponible dans un second document. Située au cœur du delta du Rhône dans le département des Bouches-du-Rhône et gérée par la Société Nationale de Protection de la Nature (SNPN), la Réserve naturelle nationale de Camargue est constituée en grande majorité de lagunes et d’étangs. D’autres habitats remarquables sont également présents, tels que les dunes littorales à genévrier, les montilles (pelouses méditerranéennes) ou les sansouïres. L’analyse du climat passé et des projections dans le futur aux horizons 2050 et 2100 suggère une évolution vers des automnes plus tardifs, des hivers plus doux et humides, ainsi que des étés précoces, plus secs, plus intenses et plus longs. En parallèle, le niveau marin continuera d’augmenter fortement, le recul du trait de côte se poursuivra, et les submersions marines deviendront de plus en plus fréquentes et importantes en Camargue. Ces phénomènes accentueront le processus de salinisation des sols et des eaux superficielles et souterraines. Pour comprendre l’impact des évolutions climatiques sur la RNNC, 27 objets ont été sélectionnés puis analysés : 15 relevant du patrimoine naturel, 7 outils et moyens de gestion et 5 activités humaines. Les résultats de l’analyse de vulnérabilité et d’opportunité sont synthétisés dans le récit prospectif de la Réserve naturelle nationale de Camargue, dernier chapitre de ce diagnostic. Globalement, en l’absence d’évènements extrêmes (tempêtes marines ou inondations majeures du Rhône), l’ensemble du patrimoine naturel actuel de la réserve se maintiendrait à court terme, avec des variations selon les habitats ou les cortèges d’espèces. Malgré une certaine résilience, l’état de certains habitats et espèces pourrait se dégrader à moyen terme sous l’influence du changement climatique. L’analyse montre par exemple que les mares temporaires méditerranéennes et les dunes (ainsi que les cortèges qu’elles abritent) font partie des habitats les plus vulnérables aux évolutions à venir. Les lagunes pourraient aussi voir certains éléments fonctionnels évoluer défavorablement, en lien avec l’évolution du climat mais aussi des activités présentes dans le delta. L’horizon de long terme est aussi envisagé, avec des évolutions bien plus marquées liées notamment à la hausse du niveau marin et la marinisation du site (processus d’évolution vers des conditions abiotiques et des cortèges plus proches de ce que présente la mer Méditerranée). Il est à noter que le présent diagnostic de vulnérabilité présente quelques limites liées au manque de connaissances scientifiques concernant les évolutions climatiques ou leurs impacts sur certains objets. Ce travail constitue tout de même un outil intéressant de projection dans le futur, qui permet au gestionnaire de s’approprier la thématique du changement climatique et de questionner sa gestion dans un contexte plus large.

Ecology of a threatened nomadic duck species in Morocco, the Marbled Duck (Marmaronetta angustirostris) : implications for conservation (2026)

Fri, 17 Jul 2026 15:48:30

de Haytem Bouchri
Paris : Ecole pratique des hautes études, 2026, 160
En ligne : theses.hal.science[...]

Les zones humides méditerranéennes comptent parmi les écosystèmes les plus menacés à l’échelle mondiale. Elles subissent des pressions croissantes liées aux prélèvements d’eau, aux changements d’usage des sols et à la raréfaction de la ressource hydrique sous l’effet du changement climatique. Ces pressions sont particulièrement aiguës en Afrique du Nord, où les oiseaux d’eau qui en dépendent présentent une vulnérabilité accrue. Parmi les espèces les plus concernées figure la Marmaronette marbrée (Marmaronetta angustirostris), une espèce quasi menacée, caractérisée par des déplacements nomades, et dont la population ouestméditerranéenne a décliné de 46 % entre 2008 et 2018. Malgré cela, plusieurs dimensions de son écologie demeurent encore mal documentées, notamment la taille de sa population nicheuse, ses stratégies de déplacement et ses modalités d’utilisation de l’habitat. Les principaux objectifs de cette thèse sont donc d'établir une première référence robuste de la taille de la population nicheuse de la Marmaronette marbrée au Maroc; d’analyser la manière dont ses déplacements et son comportement sont structurés dans le temps et l’espace; et comment son utilisation de l’habitat est influencée par la variabilité climatique et par la transformation anthropique des zones humides, à travers trois chapitres complémentaires. Dans un premier chapitre, à l'aide d'un échantillonnage aléatoire à deux niveaux analysé par des modèles hiérarchiques, tenant compte de la détection imparfaite, nous avons estimé la population nicheuse nationale à 382 nichées [ICr 95 % : 280–484], fournissant la première estimation robuste à l'échelle nationale pour cette espèce au Maroc. La végétation émergente et le type de zone humide sont les principaux prédicteurs de l'abondance des nichées. Dans un second chapitre, en combinant télémétrie GPS et accélérométrie triaxiale, nous avons développé des modèles d’apprentissage supervisé permettant de classifier cinq catégories de comportements. La cartographie des zones de repos et d'alimentation révèle une organisation marquée entre remise diurne et alimentation nocturne, mais avec une forte variabilité interindividuelle dans l’utilisation fonctionnelle de l’espace. Enfin, dans un troisième chapitre, à partir du suivi de 24 individus capturés au Maroc et en Espagne, nous avons montré que le type de zone humide est le principal déterminant de l’utilisation de l’habitat, l’espèce utilisant majoritairement des zones humides d’origine anthropique. L’utilisation de l’habitat est également modulée par la pluviométrie. Dans son ensemble, ce travail apporte des connaissances nouvelles sur l’écologie spatiale de la Marmaronette marbrée en Afrique du Nord et fournit des bases scientifiques utiles à l’orientation des stratégies de suivi, de restauration et de conservation de l’espèce.

Elaboration d’une stratégie de communication réseaux sociaux pour le dispositif “Adopte un flamant” (2026)

Fri, 17 Jul 2026 15:48:30

de Miguel Fallabrino
Montpellier : Université de Montpellier, 2026, 27

Ce stage réalisé au sein de la Tour du Valat, avait pour objectif d’élaborer une stratégie de communication réseaux sociaux pour le dispositif “Adopte un flamant”. Un diagnostic de la communication existante a été mené à partir d’une analyse des publications, complété par un benchmark de structures environnementales et une étude des performances des supports numériques. Ces travaux ont permis d’identifier plusieurs axes d’amélioration et de construire une stratégie reposant sur des objectifs de communication, une segmentation des publics, une ligne éditoriale, un calendrier éditorial et des indicateurs de suivi. Cette stratégie constitue une base opérationnelle pour renforcer la visibilité du dispositif, développer l’engagement des internautes et assurer un suivi de son efficacité grâce à des indicateurs de performance.

Pelouses et montilles de la Réserve naturelle nationale de Camargue (2026)

Thu, 25 Jun 2026 11:44:06

de Gaël Hemery, Fanny Ricque
Arles : Réserve naturelle nationale de Camargue, 2026, 1 vol. (14 p.)
En ligne : www.snpn.com[...]

En 2025, les pelouses et montilles de la Réserve de Camargue ont fait l'objet de deux stages de fin d'études, afin d'évaluer d'une part la dynamique de fermeture des pelouses sur montilles et d'étudier leur substrat, ainsi que de caractériser d'autre part la végétation des montilles de la réserve.

Les reptiles face aux pollutions anthropiques : bilan actuel des connaissances en Camargue (2026)

Wed, 13 May 2026 15:59:19

de Anthony Olivier, Francois Brischoux, Leslie-Anne Merleau, Aurélie Goutte, Marion Vittecoq, Olivier Lourdais
2026, 200-203

Les oiseaux nicheurs rares et menacés en France en 2024

Fri, 24 Apr 2026 11:46:26

de Gwenael Quaintenne, Antoine Arnaud, Arnaud Béchet, Maurice Benmergui, Baptiste Boutilleux, Christian Boutrouille, Jean-Jacques Boutteaux, Bernard Cadiou, Pierre Camberlein, Gaëtan Cavitte, et al.
In Ornithos, 174 (Janvier, Février, Mars 2026), 04-35

L’observatoire des oiseaux nicheurs « rares et menacés » s’intéresse depuis 1994 à suivre l’évolution d’espèces à l’état de conservation jugé fragile ou préoccupant, mais aussi aux espèces rares, localisées ou nouvellement nicheuses dont certaines montrent depuis quelques années des dynamiques de population singulières, illustrées entre autres par des essors numériques fulgurants. Cette 25e publication des résultats des suivis des espèces nicheuses rares et menacées présente les éléments clés de la saison 2023 de reproduction de ces espèces, rendue possible par la contribution de près de 200 structures et associations naturalistes et d’un millier d’observateurs.

Face au crabe bleu en Méditerranée : nouveaux jalons pour la connaissance et l’action : 4ème Conférence interrégionale sur le crabe bleu (Callinectes sapidus) : synthèse (2026)

Fri, 27 Mar 2026 17:01:51

de Laurent Basilico
Arles (FRA) : Pôle-relais lagunes méditerranéennes, 2026, 14
En ligne : pole-lagunes.org[...]

Synthèse des échanges tenus lors de la quatrième conférence interrégionale sur le crabe bleu, organisée à Mauguio et Palavas-les-Flots (Occitanie) les 6 et 7 novembre 2025 par le Pôle-relais lagunes méditerranéennes, l’Office Français de la Biodiversité, la DREAL Occitanie en partenariat avec l’Office de l’Environnement de la Corse et les DREAL Provence-Alpes-Côte-d’Azur et Corse.
Sommaire :
1. La propagation se poursuit : une forte dynamique mais non linéaire
2. Pêcheurs, scientifiques, gestionnaires et institutionnels : actions de connaissance et de lutte en lagunes
3. De la régulation à la valorisation : quelle(s) filière(s) économique(s) pour le crabe bleu ? Conclusion

Assessing geographic changes in hunting pressure on wildfowl through ring recovery locations

Wed, 7 Jan 2026 15:52:06

de Betty Plaquin, Matthieu Guillemain, Jocelyn Champagnon, Adrien Tableau
In Wildfowl, 75 (December, 2025), 146-158
En ligne : tidsskrift.dk[...]

Management of exploited populations needs to account for hunting pressure, yet estimating this parameter remains challenging. The study presented here compares the geographic distribution of dead recovery sites between the mid-20th century (1953–1983) and early 21st century (2002–2025), for birds all ringed in the same initial area (the Camargue in southern France) and proposes that this approach be used as a method for evaluating changes in relative hunting pressure over time. Analysis of ring recovery data from Common Teal Anas crecca, used as an example, suggests that hunting pressure on these birds has become increasingly concentrated in France in the 21st century, highlighting the responsibility of the country for hunting management of this species.

Évolution des effectifs nicheurs des ardéidés coloniaux arboricoles et paludicoles en Camargue et sur la façade méditerranéenne française

Wed, 22 Oct 2025 15:17:45

de Yves Kayser, Thomas Blanchon, Antoine Arnaud, Olivier Pineau, Michel Gauthier-Clerc, Jean-Laurent Lucchesi, Gregoire Massez, Christophe Pin, Clément Pappalardo, Jérémiah Petit, et al.
In Ornithos, 172 (Juillet, août, septembre 2025), 16-33

Les suivis des populations reproductrices d’ardéidés coloniaux sont réalisés chaque année sur la bordure méditerranéenne française depuis 1968 pour les hérons paludicoles ainsi qu’en Camargue depuis 1969 pour les espèces arboricoles. Neuf espèces de hérons se reproduisent dans cette région dont sept sont concernées par ces recensements : le Bihoreau gris Nycticorax nycticorax, le Crabier chevelu Ardeola ralloides, le Héron garde-bœufs Ardea ibis, le Héron cendré Ardea cinerea, le Héron pourpré Ardea purpurea, la Grande Aigrette Ardea alba et l’Aigrette garzette Egretta garzetta.

Shifting the baseline for waterbird and seabird conservation in europe, risk assessment over one century

Mon, 6 Oct 2025 11:40:14

de Elie Gaget, Jon E. Brommer, Thomas Galewski
In Biodiversity and conservation, (en ligne) (September, 2025)
En ligne : doi.org[...]

European waterbird and seabird populations have been threatened by anthropogenic activities for decades. Effective strategies are needed to restore both populations and their habitats. However, the temporal period used to define the state of reference when setting restoration targets requires careful considerations to avoid the risk of shifting baseline. A risk of shifting baseline occurs if a population decreases before the time period used to set a baseline. In Europe, most bird monitoring schemes started after the 1970s, yet significant changes in population trends were already reported earlier in the 20th century. We assessed the risk of shifting baseline for 88 out of 170 waterbird and seabird species breeding in Europe. Building on historical ecology, we reconstructed population trends between 1900 and 2018 from information collected in both historical literature and monitoring scheme reports. Historical trends confirm variations in population trends for several waterbird and seabird species over the period 1900-1970, with 35 decreasing species, 38 fluctuating species, 15 increasing species and 82 species with unknown trends. A high risk of shifting baseline was identified for 28 species, for which restoration targets must consider historical trends spanning at least a century. The risk was low for 12 species, probably low for 41 species, probably high for 7 species and uncertain for 82 species. Our study highlights the crucial role of historical data collected prior to the large-scale implementation of standardized abundance monitoring, as it allows for the identification of appropriate baselines to guide the restoration of waterbird and seabird breeding populations.

Is malathion oncogenic for mosquitoes? A transcriptomic and histological study of adults derived from malathion exposed larvae

Mon, 30 Jun 2025 13:55:34

de Audrey Arnal, Erika Burioli, Lisa Jacquin, Sophie Labrut, Stéphane Duchon, Marie Rossignol, Delphine Nicolas, Beata Ujvari, Antoine Dujon, Jordan Meliani, et al.
In Ecotoxicology and Environmental Safety, 301 (August, 2025), 118449
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

Malathion is a widely used pesticide with potentially oncogenic properties and may have deleterious effects on organism health and fitness. Although malathion use is now restricted in the European Union, it remains widely used for public health campaigns in other parts of the world, particularly for mosquito control. Understanding its sublethal and long-term effects is thus essential, both for evaluating its ecotoxicological impacts and for anticipating resistance mechanisms. However, empiric data on its effects in wild organisms - especially in invertebrates - remain limited. Here, we quantitatively investigated whether larval exposure to environmentally realistic concentrations of malathion could affect mosquito tissue structure and gene expression profiles of adult Aedes aegypti (yellow fever mosquitoes), using both RNA-seq and histological approaches. Results show no neoplastic or pre-neoplastic lesions in adults exposed to malathion during larval development, contrary to previous studies in other organisms showing carcinogenic effects of malathion. However, our differential gene expression analyses revealed significant changes in genes related to mitochondrial function, energy metabolism, and detoxification pathways, suggesting significant physiological impacts of malathion in adults after early-life pesticide exposure. Notably, females exhibited stronger transcriptomic responses than males, including the upregulation of genes involved in detoxification (e.g., P450 cytochromes), olfactory perception, and stress response, with potential consequences for resistance mechanisms. Our findings underscore the ability of mosquitoes to mount transient molecular responses to environmental pollutants, potentially contributing to the long-term selection of metabolic resistance traits – an outcome with important implications for vector control strategies.

Contrasting effects of agriculture and urbanisation on bird and reptile communities in a Mediterranean delta (Gediz Delta, Türkiye)

Wed, 4 Jun 2025 15:53:31

de Dilara Arslan, Elie Gaget, Kerim Cicek, Anthony Olivier, Thomas Galewski, Ömer Döndüren, Anis Guelmami, Lisa Ernoul, Arnaud Béchet
In BMC Ecology and Evolution, 25(1) (June, 2025), 58
En ligne : doi.org[...]

Wetlands have been some of the most destroyed ecosystems over the last century, with important land-use changes resulting from agricultural, industrial, and urban development. Gediz Delta is a large wetland on the Aegean coast of Western Türkiye with natural areas affected by conversion to agriculture and urban developments from the Izmir metropolis. We assessed the effects of landscape type (natural, agricultural, and urban) on the composition of breeding bird (90 species) and reptile (14 species) communities in the Gediz Delta between 2019 and 2021. We used generalized linear models to estimate the effect of landscape types on community indexes and joint species distribution models to assess how species-specific habitat preferences explained their responses to landscape type.

Mieux évaluer l’état de conservation des lagunes méditerranéennes

Wed, 11 Jun 2025 14:43:18

de Katia Lombardini, Nathalie Barre, Marie Garrido, Nathalie Chokier, Virginie Mauclert
In Biodiversité, des clés pour agir, 9 (Avril-Juin 2025), 26

Présentation des actions du Pôle lagunes pour mieux évaluer l’état de conservation des lagunes méditerranéennes dans le cadre du projet Marha.

Status of Lestes macrostigma in Bulgaria

Thu, 5 Jun 2025 15:45:10

de Philippe Lambret, Stanimira Deleva, Spas Uzunov, Dimitar Popov
In Odonatologica, 54(1/2) (2025), 53-84

Measuring population trends of freshwater insects helps to assess their conservation status and to design management protocols for wetlands. Lestes macrostigma is restricted to temporary brackish waters, a limited and fragmented habitat. Throughout its range this species is threatened at different levels, and, in Bulgaria, it has been assessed as “Critically Endangered”. In the past, along the Black Sea coast, it was known to be abundant and reproducing at two sites: Shablenska Tuzla Lake and Poda Protected Area. At a third site, Pomorie Lake, only a few individuals were recorded without clear evidence of reproduction. We aimed at updating its distribution along the Bulgarian Black Sea coast and determining the conservation status of its populations by conducting surveys from 2021 to 2024 at 53 localities, mainly within coastal lagoons and estuaries. We recorded all Odonata species along with their various life stages and reproductive behaviour. Other resident species recorded in association with L. macrostigma were Lestes barbarus, L. dryas, Ischnura elegans, Aeshna affinis, Sympetrum fonscolombii, S. meridionale, and S. striolatum. We counted L. macrostigma adults along walks and extrapolated abundance over the entire sites and season. Lestes macrostigma population size reached hundreds of thousands of adults at Shablenska tuzla and Pomorie Lake. At Nanevska tuzla and Atanasovsko Lake, two new sites for the species, thousands of adults were present. However, we found that L. macrostigma had disappeared from at least a part of Poda Protected Area, most likely because of a change in water management practices. As the timing of the flooding period is a key feature of the species’ habitat, we found that its presence in the temperate Bulgarian estuaries was unlikely. As conservation management plans are still lacking for Shablenska tuzla and Pomorie Lake, the future of the two largest L. macrostigma populations of Bulgaria of international importance seems tenuous and uncertain. Therefore, key actions for the conservation of L. macrostigma are the proper management of its existing reproductive sites and restoring or recreating temporary wetlands.

Monitoring coastal dynamics after working with nature practices in the Rhone delta

Wed, 4 Jun 2025 15:53:40

de Morgane Jolivet, Cecile Puigserver, Olivier Boutron, Francois Sabatier, Samuel Meulé, Philippe Larroude, Loic Willm, Emilie Luna-Laurent
In Coastal Engineering Proceedings, 38 (June, 2025), 50
En ligne : icce-ojs-tamu.tdl.org[...]

The site of the “Étangs et Marais des Salins de Camargue” (EMSC) is located southern France in the Rhône Delta, facing Mediterranean sea, at the heart of the Camargue Regional Natural Park. This site, formerly dedicated to salt production, is now owned by the Coastal Conservatory and co-managed by the Camargue Regional Natural Park, Tour du Valat, and the French National Society for the Protection of Nature. A habitat restoration project was initiated in 2011 and continues as part of the development of a 2023-2032 management plan and the site's participation in the European H2020 Rest-Coast project. This restoration aims to facilitate the recolonization of the area by plant (seagrass, salt marsh) and animal species, reestablishing the natural hydrological processes of the site. An adaptive coastal management strategy is also applied on this site, with the decision to no longer maintain the historical dikes of the salt production site facing the sea, leading to their gradual collapsing. Protection against the risk of marine submersion is ensured by an landward seawall, which will be elevated, as part of the coastal strategy defined for the greater Rhône Delta. Natural hydro-morphodynamic processes are reestablishing locally, creating new connections with the sea and the formation of beach and barrier areas through overwash. This results in the emergence of a natural buffer zone that will better address the consequences of climate change or storms, such as marine submersion and salinization.

How does the efficiency of Nanopore compare to Illumina sequencing in tracking the spread of aquatic invasive species?

Fri, 6 Jun 2025 16:01:52

de Théo Deremarque, Rodolphe Elie Gozlan, Ravo Ravaozafindrasoa, Giuliano Mucci, Lucie Delalex, Jean-Michel Foissy, Michael Cagnant, Mathieu Clair, Justina Givens, Fabienne Justy, et al.
In Water Biology and Security, (en ligne) (May, 2025), 100423
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

eDNA-based methods offer a non-invasive, easy-to-use approach for monitoring aquatic biodiversity, particularly for tracking invasive or cryptic species. While Illumina sequencing is commonly used, few studies have explored pairing eDNA sampling with Nanopore sequencing, a third-generation technology that allows for on-site sequencing but with a higher error rate. Here, we compared the performance of both technologies in detecting the invasive host-parasite complex Pseudorasbora parva-Sphaerothecum destruens. Water samples were collected from sites in Camargue and Corsica (Southern France), followed by DNA extraction, PCR amplification, and sequencing using either Illumina or Nanopore. Both technologies showed similar detection rates of P. parva, but only when Nanopore sequencing was performed under optimal conditions. However, for S. destruens, results varied: Illumina failed to detect the parasite, while Nanopore identified its DNA in multiple sites. We suggest that this discrepancy may be due to the different bioinformatic approaches used to process the reads and/or the higher error rate of Nanopore sequencing which could result in misassignments during species identification.

Do older parents do better? Relationships between parental age, chick body condition and migratory behaviour in a colonial-breeding waterbird

Wed, 18 Jun 2025 15:13:45

de Hugo R. S. Ferreira, Jocelyn Champagnon, Thomas Blanchon, Tamar Lok, José A. Alves
In Journal of Avian Biology, 2025(3) (May, 2025), e03387
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

Animals' performance of basic functional behaviours, such as foraging and movement, may improve with age as a result of past experiences. In migratory birds, for example, due to earlier or more efficient migration, older and likely more experienced individuals tend to arrive at breeding sites earlier and enjoy better breeding conditions than younger conspecifics, resulting in a higher reproductive success. Yet, despite the advantages of early arrival for breeding adults, the long-term effects of fledging early and/or with a higher body condition on chicks' future fitness prospects remain largely unexplored. In differential migration systems, low-quality or socially subordinate individuals may be constrained to sub-optimal migratory behaviours associated with lower demographic rates. Therefore, producing high-quality chicks may enhance the survival of offspring. In this study, we analysed data from the long-term ringing programme on the breeding population of Eurasian spoonbills in the Camargue (southern France) to investigate how breeder age may influence the timing of breeding and, in turn, how this may affect chick body condition and their subsequent migratory behaviour. Using breeding resightings of birds individually marked as a chick since 2008, combined with chick biometric measurements and subsequent winter resightings of offspring, we show that older spoonbills tend to breed earlier in the season than younger individuals, and that early breeders, regardless of age, are more likely to produce chicks with higher body condition than late breeders. Finally, migratory behaviour of juveniles appears to be influenced by the timing of breeding, with later-born juveniles tending to undertake less demanding migrations (without crossing major ecological barriers) than juveniles born earlier in the breeding season. Our study therefore highlights the relevance of long-term studies to better understand the complex breeding phenology of migratory species, which can lead to changes in population-level patterns and processes.

Une balade arachnologique autour des Rièges

Tue, 3 Jun 2025 11:41:18

de Anne Bounias Delacour
In Courrier de la Nature (Le), 345 (Mai, 2025), 55 - 57

Les plus anciennes données concernant les araignées aux bois des Rièges datent de 1913. De récents inventaires, réalisés entre 2023 et 2024 sur les secteurs alentours, sont venus mettre au jour une liste d'espèces rares et menacées.

Host-feeding preferences of Culex pipiens and its potential significance for flavivirus transmission in the Camargue, France

Wed, 2 Apr 2025 15:56:40

de Victor Rodriguez-Valencia, Marie-Marie Olive, Gilbert Le Goff, Marine Faisse, Marie Bourel, Grégory L'Ambert, Benjamin Vollot, María José Tolsá-García, Christophe Paupy, David Roiz
In Medical and Veterinary Entomology, (en ligne) (April, 2025)
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

The spread of the West Nile (WNV) and Usutu (USUV) flaviviruses in Europe in recent decades highlights the urgent need to understand the transmission networks of these pathogens as a basis for effective decision-making. These viruses are part of a complex disease cycle that involves birds as principal hosts and humans and horses as dead-end hosts. Our study aims to uncover the intricate relationships between the main mosquito vector of these viruses, Culex pipiens L. (Diptera: Culicidae) and its feeding preferences based on the forage ratio among several host species, primarily birds in a land-use gradient. We estimated the bird host potential to act as a host for flavivirus, the reservoir capacity index, based on forage ratios and potential host competence based on molecular prevalence. We sampled mosquitoes and, at the same time, conducted bird censuses in the Camargue region in southern France, where co-circulation of these viruses has been reported. Several localities were sampled along a land-use gradient in peri-urban, agricultural and natural areas from May to November 2021. We identified 55 vertebrate species in 110 engorged Cx. pipiens by PCR amplification and sequencing of mitochondrial 12S and 16S Ribosomal DNA genes. Culex pipiens feeds primarily on 51 bird species and secondarily on two mammals, one amphibian and one reptile. Based on forage ratios, we found a preference of Cx. pipiens in the Camargue for the order Passeriformes and, more specifically, for Columba livia domestica L. (Columbiformes: Columbidae) in agricultural areas, and for Passer domesticus/montanus L. (Passeriformes: Passeridae), in agricultural and peri-urban areas. The natural habitats had significantly higher forage ratio values than agricultural and peri-urban areas. We suggest that certain key species, such as Passer sp., Columba livia and Turdus sp., might be potentially considered locally relevant hosts for transmission in this area, as they are important for mosquito feeding and also potentially important hosts for flavivirus amplification. These data will be beneficial in understanding host–vector interactions and the relationships between bird communities, mosquito feeding preferences and emerging mosquito-borne diseases.

Persistent lead poisoning of waterfowl in the Camargue (southern France) 10 years after the ban on the use of lead ammunition in wetlands

Wed, 16 Apr 2025 09:44:46

de Arnaud Béchet, Anthony Olivier, Francois Cavallo, Lou Sauvajon, Jocelyn Champagnon, Pierre Defos du Rau, Jean-Yves Mondain-Monval
In Conservation Science and Practice, (en ligne) (April, 2025), e70045
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

Lead pollution is a worldwide environmental and health issue causing persistent detrimental effects on humans and wildlife. Despite having been identified as detrimental to waterfowl a century ago, in France lead shotgun pellets for hunting were banned only in 2006 and only in wetlands. We used long-term monitoring data from the Camargue (southern France) to (1) assess the local effectiveness of the French regulation at reducing the ingestion of lead shotgun pellets by waterfowl and to (2) assess local hunter compliance with the regulation. We used data on 2187 gizzards from 13 waterfowl species collected from 38 hunters in the Camargue over 20 hunting seasons (1998 to 2017). In addition, from 2008 to 2019, we systematically collected shotgun shell cases at three communal wetland hunting sites and used the ratio of cases indicating lead versus nontoxic shotgun shells to estimate hunter compliance with the ban. Across the 20-year study period that spanned pre- and post-ban, gizzards of harvested waterfowl had a mean lead shotgun pellet prevalence of 12% across the 13 species with no significant reduction over time. There was a slow increase in the use of nontoxic shot shells after the ban; lead shells continued to be used widely, suggesting inadequate policy enforcement. Because the ban was only applied for hunting in wetlands, hunters have to be caught with lead shells in the shotgun while in wetland to be fined. It is still legal to carry lead shells, favoring the circumvention of the regulation. Our results support the need for a complete ban of lead shotgun shells for both wetland and terrestrial hunting. A complete ban would facilitate policy enforcement and would favor compliance, eventually leading to a phase-out of lead shell production and use.

Transcriptomic and biochemical analysis of Procambarus clarkii upon exposure to pesticides: Population-specific responses as a sign of pollutant resistance?

Fri, 28 Feb 2025 10:08:42

de Diana Martínez-Alarcón, Celine M. O. Reisser, Montserrat Solé, Jehan-Hervé Lignot, Georgina Rivera-Ingraham
In Environmental Research, 270 (April, 2025), 120963
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

The effects that anthropogenic stressors may have on modulating species’ plasticity has been relatively unexplored; however, it represents a scientific frontier that may offer insights into their ability to colonize new habitats. To explore the advantage that inhabiting polluted environments may offer to invasive species, we selected the crayfish Procambarus clarkii, a species that can colonize and thrive in a wide range of aquatic environments, including heavily polluted ones. Here, we studied the molecular and physiological responses of crayfish when experimentally exposed to a pesticide mix of azoxystrobin and oxadiazon at sublethal concentrations. We compared these responses in three isolated crayfish populations in Southern France that are established in areas with different pollution levels: i) Camargue, seasonally affected by pesticide pollution; ii) Bages-Sigean, impacted all year-round by domestic effluents and; iii) Salagou, a more pristine site. Gene expression analyses revealed that the response to the pesticide mix was the strongest in the Camargue crayfish. In this population, a total of 88 differentially expressed genes (DEGs) were identified in hepatopancreas and 78 in gills between exposed and control laboratory groups. Among genes that were differentially expressed and successfully annotated, those involved in stress response, DNA repair, immune response, and translation and transcription processes stand out. Interestingly, the hepatopancreas responded mainly with up-regulation, while the gills showed down-regulation. Our results demonstrate population-specific responses to pesticide stress in populations with different life-history of exposure to pollutants. The high regulation of the aforementioned mechanisms indicates that they play a crucial role in the adaptation of this invasive species to polluted environments.

Lower Bird Evenness and Diversity Are Associated With Higher Usutu Prevalence in Culex pipiens Mosquitoes

Fri, 14 Mar 2025 16:37:03

de Victor Rodriguez-Valencia, Marie-Marie Olive, Gilbert Le Goff, Marine Faisse, Christophe Paupy, David Roiz
In Zoonoses and Public Health, (en ligne) (March, 2025)
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

Introduction The mosquito-transmitted Usutu virus has spread in the last few years, becoming endemic in several areas of Europe, such as in the southern French region of the Camargue. Our aim was to study the relationships between the presence of the viral agent in Culex mosquitoes and the structure of bird communities in the context of the dilution effect. Methods We carried out mosquito and bird censuses in several selected localities across a land-use gradient and screened mosquito pools for flaviviruses. We focused on exploring how host bird diversity, richness, abundance and evenness were associated with Usutu detection in Cx. pipiens. Results Usutu virus was detected in seven pools of Cx. pipiens, and phylogenetic analysis identified Usutu lineage Africa 3, confirming its circulation. The probability of detection in mosquitoes is associated with areas with lower bird evenness and diversity but higher bird abundance and richness and higher Cx. pipiens abundances. Conclusions Bird evenness was the variable with the greatest explanatory power, being negatively related to the probability of detecting Usutu in Cx. pipiens, supporting a dilution effect. These results will help us better understand the relationships between bird community structure and the risk of Usutu mosquito-borne disease.

Characterizing governance models for upscaling wetland restoration

Wed, 5 Mar 2025 16:40:09

de Arnaud Terrisse, Michael Karner, Julia Kaufmann, Lisa Ernoul
In Environmental Management, (en ligne) (March, 2025)
En ligne : doi.org[...]

Governance is a key element for effective conservation, sustainable management and restoration of ecosystems. Improving governance is essential for upscaling restoration actions around the world. Governance systems were studied in eleven on-going European wetland restoration sites using a two-step process. First, an in-depth examination of seven sites from six countries was made using key informant interviews. This information provided the basis for developing four governance models (Monocentric, Polycentric, Community-based and Networking). Most of the sites presented a dominant governance model, but also incorporated some dimensions of the other models to a lesser degree. The models were tested and evaluated in an additional seven sites in five countries. The analysis revealed that the governance models were highly subject to the geographical features, land ownership structures and different histories of the sites. Strengths, weaknesses, and supporting and limiting factors were associated with each model. This research shows how governance models are adapted to site specific conditions and how these adaptations can be used to enhance governance processes in existing sites, upscale restoration efforts or set the groundwork in new restoration sites.

Presence and potential impact of anthropogenic nesting materials on a colonial breeding waterbird

Wed, 29 Jan 2025 15:10:34

de Hugo Rafael Soares Ferreira, Ana C. Hadden, Jocelyn Champagnon, Tamar Lok, Marion Vittecoq, José A. Alves
In Science of The Total Environment, 964 (February, 2025), 178588
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

Despite the vital importance of wetlands globally, these habitats have increasingly received anthropogenic materials, such as plastics, which can impact the wildlife these habitats support. Despite commonly found in the nests of Eurasian spoonbill (Platalea leucorodia), the presence of such materials has never been quantified. Here, we monitored the occurrence of anthropogenic nesting materials (ANM) in spoonbill nests in the Camargue wetland in Southern France during two breeding seasons (2021−2022). We also investigated their potential function by associating their presence with breeder experience (based on their age) and hatching success. Out of 439 nests, 39 % contained at least one anthropogenic material item, usually plastic of sheet-like shape and white-transparent colours. Throughout the breeding season, the proportion of ANM in the nest lining increased, coinciding with a decrease in natural materials (i.e. vegetation). A higher proportion of natural green materials was detected during the egg phase compared to other phases of nest development. Our results did not support a correlation between the proportion of ANM and breeder experience, nor with hatching success. Further studies (e.g., physiological through necropsy or fine temperature nest assessment) may disentangle the benefits and adverse effects of such materials on waterbird breeding success.

Pathogenic bacterial taxa constitute a substantial portion of fecal microbiota in common migratory bats and birds in Europe

Wed, 5 Mar 2025 16:40:15

de Anbu Poosakkannu, Yanjie Xu, Kati M. Suominen, Melissa B. Meierhofer, Iben H. Sørensen, Jesper J. Madsen, Betty Plaquin, Matthieu Guillemain, Emmanuel Joyeux, Oskars Keišs, et al.
In Microbiology Spectrum, 13(3) (February, 2025), e01948-24
En ligne : journals.asm.org[...]

Identifying the wildlife reservoirs of bacterial pathogens, spatially and temporally, is important for assessing the threats to human and the rest of the biosphere. Our objective was to study Europe-wide characteristics of the fecal microbiota of four highly mobile migratory vertebrates, that is, one bat (Pipistrellus nathusii) and three bird species (Turdus merula, Anas platyrhynchos, Columba palumbus). The 351 sample PacBio data set of almost the entire 16S rRNA gene with 438,997 amplicon sequence variants (ASVs) assigned 3,277 bacterial species. A significant proportion of the ASVs were assigned to bacterial genera having species pathogenic to human or animals. These pathogen ASVs accounted for 45% of all the ASVs and statistically were more frequent at higher latitudes and in younger age groups. In 36 samples, more than >90% of all the PacBio reads were assigned to these pathogenic genera. We designate to individuals of these samples a new term, that is, a pathogen bloomer. The pathogen bloomers, which did not display apparent macroscopic disease symptoms, were detected in Nathusius bat (n = 8; Finland and Latvia), blackbird (n = 6; Finland, Latvia and Denmark), and wood pigeon (n = 22; Finland and France), but not in mallard. Key species-level taxonomic assignments in the pathogen bloomers were the two well-known enteropathogens (Campylobacter jejuni or Escherichia coli) and one emerging enteropathogen (Escheri chia marmotae). Our data imply that the studied common migratory vertebrates may contribute to the transmission of bacterial pathogens across the European continent.

Investigating the quality of European silver eels by quantifying contaminants and parasite infestation in a French Mediterranean lagoon complex

Wed, 29 Jan 2025 15:10:29

de Amélie Hoste, Raphaël Lagarde, Elsa Amilhat, Colin Bouchard, Paco Bustamante, Adrian Covaci, Elisabeth Faliex, Emmanuelle Migne, Giulia Poma, Claire Tetrel, et al.
In Environmental Science and Pollution Research, (en ligne) (January, 2025)
En ligne : doi.org[...]

Coastal lagoons are diverse habitats with significant ecological gradients, which provide crucial ecosystem services but face threats from human activities such as invasive species and pollution. Among the species inhabiting the lagoons, the critically endangered European eel (Anguilla anguilla) is an emblematic species strongly impacted by contamination and parasitism. Several indicators were developed to assess the quality of eel at a large geographic scale. Most indicators are based on the concentration of individual pollutant and/or abundance of parasites separately without considering individual variations. This study assessed the quality of 59 eels captured at three different sites inside a Mediterranean lagoon complex (the Camargue, South of France), by integrating multiple degradation factors (POPs, TEs, and A. crassus infestation) and considering individual eel characteristics (length, age, growth rate, and sex). Using multivariate TOPSIS analysis including these degradation factors, this study found that eel quality decreased with age but did not significantly vary between sites. When focusing on each degradation factor, A. crassus infestation rates were lower in older eels, independently to the site; however, the POPs and TEs contaminations were lower in the Grandes Cabanes site compared to the Vaccarès and Fumemorte sites even if smaller and younger eels were more contaminated by POPs. These findings reveal the fine-scale spatial variability in eel quality, with TOPSIS analysis providing a robust method to rank and score scenarios. This approach enhances the understanding of habitat degradation sources affecting eel contamination and parasitic infestation, supporting more effective strategies for sustainable habitat management.

L’impact de la gestion littorale et des changements globaux sur la distribution des habitats en zone humide côtière méditerranéenne (2025)

Mon, 28 Sep 2026 11:08:23

de Coline Carteron
La Rochelle : La Rochelle Université, 2025, 119

Les zones humides côtières sont aujourd’hui confrontées aux impacts du changement climatique et aux pressions liées aux activités humaines, menaçant leur qualité écologique et entraîne une régression de leur superficie. La Camargue illustre particulièrement ces dynamiques, notamment par les phénomènes de salinisation, d’érosion, de gestion hydraulique ou encore de fixation du trait de côte. Afin d’accompagner l’adaptation des milieux littoraux et des activités qui en dépendant, le projet Life Adapto+ met en place des Solutions d’adaptation fondées sur la Nature (SafN) sur plusieurs sites pilotes, dont celui de Brasinvert/Grand Radeau en Camargue. Dans ce cadre, un outil, l’Indice Littoral Ecologique (ILE) est développé pour évaluer l’impact des changements climatiques et des modes de gestion sur l’évolution des habitats. Cet indice permet de produire des cartographies prédictives des habitats selon différents scénarios, combinant conséquences du changement climatique (salinisation, recul du trait de côte, hausse du niveau marin, etc.) et choix de gestion (reconnexion à l’eau douce, libre évolution, restauration dunaire, etc.). Il permet également d’estimer, à partir de l’évolution de la superficie des habitats, l’évolution des services écosystémiques qui leurs sont associés, offrant ainsi un suivi de la qualité écologique du site en fonction des scénarios étudiés.

Projet : Restauration écologique des zones humides : convention n°22043 (2025)

Wed, 25 Mar 2026 13:21:55

de Florence Daubigney, Hugo Fontes, Philippe Lambret, Delphine Nicolas, Anthony Olivier, Loic Willm, Leïla Debiesse
Arles : Tour du Valat, 2025, 1 vol. (82 p.)

A retenir :
- Restauration des sites du Cassaïre et de la Petite Forêt en Camargue
- Restauration de zones humides dégradées et conservation de Lestes macrostigma et autres libellules menacées
- Evaluation de deux projets de restauration de continuité hydroécologique intra-lagunaire avec l’anguille européenne, espèce emblématique et menacée

Dynamique des populations d’oiseaux d’eau de la Réserve naturelle nationale de Camargue (RNNC) : analyse de 35 ans de données (2025)

Fri, 20 Feb 2026 16:03:29

de Ana Pires Saraiva
Lempdes : VetAgro Sup, 2025, 114

Les zones humides, et en particulier les sites d’importance internationale pour les oiseaux d’eau comme la Camargue, figurent parmi les habitats les plus menacés à l’échelle mondiale. Ces milieux étant essentiels pour les oiseaux d’eau, il est donc nécessaire de comprendre comment leurs populations évoluent et réagissent aux changements de ces habitats. Cette étude analyse la dynamique des populations d’oiseaux d’eau de la Réserve naturelle nationale de Camargue (RNNC) sur 35 ans (1989-2024) en lien avec les tendances à des échelles plus larges (Camargue, littoral méditerranéen français et voie de migration). Les analyses, menées à la fois à l’échelle de la communauté et des espèces, sur les périodes d’hivernage et de reproduction, s’appuient sur des comptages mensuels et sur des variables climatiques et hydrologiques locales. Les résultats montrent un déclin marqué des effectifs hivernaux et une relative stabilité estivale. Plusieurs espèces (ex. Anatidés, Foulque macroule et Ardéidés) déclinent fortement, tandis que le Flamant rose et le Tadorne de Belon progressent. Au-delà des effets du réchauffement climatique sur la phénologie migratoire et de pressions anthropiques, les divergences de tendances entre la RNNC et la Camargue suggèrent un rôle déterminant de facteurs locaux, tel que l’augmentation de la salinité du Vaccarès. Ces résultats soulignent la vulnérabilité de la RNNC et la nécessité d’une gestion adaptative pour maintenir la fonctionnalité écologique de ce site d’importance internationale.

Démarche de connaissance de flux admissibles- Application de GAMELag à l’étang de Campignol : phase II : situation repère et phase III : scénarisation ([2025])

Tue, 20 Jan 2026 10:48:23

de Columba Martínez-Espinosa, Julie Regis, Annie Fiandrino, Laurent Benau, Nicolas Mañas, Anaïs Giraud
Arles : Tour du Valat / Ifremer, [2025], 64

La mission Flux Admissibles a joué un rôle essentiel dans la gestion durable de l’étang de Campignol en fournissant des données scientifiques fiables pour la planification à long terme. L’utilisation du modèle GAMELag permet de simuler divers scénarios de gestion et d'évaluer les conséquences d’un changement climatique. Ce modèle aide à estimer les flux admissibles d’azote et de phosphore, tout en respectant les objectifs écologiques de la Directive Cadre sur l’Eau. Un suivi rigoureux est crucial pour mesurer l’efficacité des actions et ajuster les stratégies de restauration. Les sédiments ne constituent pas une source majeure de nutriments, indiquant que la réduction des apports nutritifs pourrait améliorer rapidement la qualité de l’eau. La gestion doit inclure l’ensemble du bassin versant, favorisant la collaboration entre les acteurs locaux pour une efficacité optimale. Une approche intégrée combinant modélisation et gouvernance est recommandée pour lutter contre l’eutrophisation. Enfin, il est nécessaire de coordonner les efforts à différentes échelles pour protéger durablement les initiatives locales face à la croissance démographique.[résumé rédigé par IA]

MIGRALION - Caractérisation de l’utilisation du golfe du Lion par les migrateurs terrestres et l’avifaune marine à l’aide de méthodes complémentaires : rapport final du Lot 6 « Développement de méthodes permettant l’analyse des différentes données produites dans le cadre du programme et issues d’autres projets ». Livrables L36 et L37 (2025)

Wed, 14 Jan 2026 10:46:41

de Coline Canonne, Marion Queroue, Sébastien Roques, V. Lauret, L. Schroll, V. Cat, N. Courbin, Yann Planque, Jocelyn Champagnon, O. Duriez, et al.
Marseille : Office Français de la Biodiversité, 2025, 169 (Migralion)

La mer Méditerranée, riche en biodiversité marine, fait face à des pressions humaines croissantes, notamment à cause du tourisme, de l'urbanisation, et des changements climatiques. Dans ce contexte, la planification de projets d'éolien flottant dans le golfe du Lion soulève des préoccupations sur leurs impacts écologiques. Le programme MIGRALION vise à comprendre l'utilisation de l'espace par les oiseaux marins et migrateurs afin de développer des méthodologies d'analyse des données recueillies. Les recherches se concentrent sur trois questions clés : l'utilisation de l'espace, l'intensité des flux migratoires, et les altitudes de vol des oiseaux migrateurs.
Des modèles statistiques combinant différents types de données ont permis de créer des cartes d'utilisation relative et de vulnérabilité des oiseaux face aux projets éoliens. Les résultats indiquent que certaines zones côtières et ouvertes du golfe présentent des niveaux élevés de vulnérabilité, en particulier durant la période de reproduction. De plus, les intensités migratoires des oiseaux montrent une forte superposition avec les zones envisagées pour les parcs éoliens. Concernant les hauteurs de vol, un modèle intégré a révélé que de nombreux oiseaux migrateurs volent à des altitudes qui les exposent aux risques de collision avec les éoliennes. Des données précises collectées grâce à la télémétrie offrent un nouvel aperçu des stratégies migratoires et soulignent l'importance d'une évaluation continue lors de la planification de ces infrastructures.

MIGRALION - Caractérisation de l’utilisation du golfe du Lion par les migrateurs terrestres et l’avifaune marine à l’aide de méthodes complémentaires : rapport final d’analyses du Lot 3 « Télémétrie, migrateurs terrestres et oiseaux marins ». Livrable L19. (2025)

Wed, 14 Jan 2026 10:46:37

de Jocelyn Champagnon, N. Courbin, Paul Dufour, Stephan Tillo, L. Denoual, David Grémillet, Frédéric Jiguet, O. Duriez
Marseille : Office Français de la Biodiversité, 2025, 168 (Migralion)

Le programme MIGRALION utilise la télémétrie pour suivre 40 espèces d'oiseaux grâce à des balises miniaturisées : 3 espèces marines, 12 espèces de zones humides, 25 migrateurs terrestres dont 3 espèces de rapaces et 17 passereaux.
Ces dispositifs, équipés de GPS et de géolocalisateurs, permettent de collecter des données sur les déplacements des oiseaux marins et migrateurs terrestres dans le golfe du Lion. Entre 2021 et 2024, 824 individus ont été équipés, et les résultats montrent un chevauchement important des aires utilisées par certaines espèces avec des projets d'éoliennes flottantes, posant des risques de conflits pour la conservation. Les puffins yelkouans et de Scopoli volent majoritairement en dessous des pales d'éoliennes, tandis que les sternes, volent à des altitudes plus élevées, ce qui les expose potentiellement à des collisions. Pour les oiseaux terrestres, des stratégies migratoires variées ont été observées, avec une majorité volant à moins de 300 mètres.
Les résultats soulignent l'importance de continuer le suivi post-installation des éoliennes pour évaluer leur impact sur ces populations.

MIGRALION - Caractérisation de l’utilisation du golfe du Lion par les migrateurs terrestres et l’avifaune marine à l’aide de méthodes complémentaires : rapport de synthèse final (2025)

Wed, 14 Jan 2026 10:46:32

de Yann Planque, Constance Audiffren
Marseille : Office Français de la Biodiversité, 2025, 100 (Migralion)

Ce document correspond à une synthèse des principaux résultats finaux du programme MIGRALION, construite sur la base des résumés (en français) et des abstracts (en anglais) des rapports finaux des lots d’acquisition des données (lots 3, 4 et 5) et du lot d’analyses globales (lot 6). Il présente les principaux résultats finaux acquis à l’issue du programme MIGRALION, obtenus à l’issue de quatre années du programme (2021 – 2025), incluant trois années consécutives d’acquisition de données.

Cartographie des tourbières du delta du Rhône (2025)

Wed, 14 Jan 2026 10:46:29

de Antoine Gazaix, Arsène Marquis-Soria
Arles : Tour du Valat, 2025

En 2024 et 2025, la Tour du Valat a piloté un projet visant à localiser les tourbières du delta du Rhône. Au-delà de la cartographie, les données collectées sur le terrain ont permis d’évaluer : la surface, la profondeur maximale, le stock de carbone retenu, l’état de dégradation des tourbières. Les tourbières du delta du Rhône restent encore mal connues. Ce projet constitue une première étape : un effort d’inventaire inédit qui doit se poursuivre afin d’acquérir une connaissance complète du territoire.

Caractérisation des tourbières du delta du Rhône (2025)

Wed, 14 Jan 2026 10:46:26

de Violette Perret
Montpellier : Université de Montpellier, 2025, 69

Grâce à un engorgement en eau quasi permanent, les tourbières accumulent de la matière organique très peu dégradée sous forme de tourbe. Elles jouent alors, lorsqu’elles sont intactes, un rôle de puits de carbone, et constituent le principal stock de carbone des sols à l’échelle mondiale. Pourtant, 10 % des tourbières mondiales et 48 % des tourbières européennes sont dégradées, principalement à cause du drainage, qui entraîne la minéralisation de la matière organique. Ces tourbières drainées sont actuellement responsables d’environ 5 % des émissions anthropiques de gaz à effet de serre. Il est donc essentiel de mieux les connaître pour limiter leur dégradation. Néanmoins, en France, les données manquent, notamment dans la région du delta du Rhône, où aucune tourbière n’est recensée malgré plusieurs indices de présence. Notre étude a permis d’estimer la surface en tourbières et leurs stocks de carbone dans le delta du Rhône. L’inventaire réalisé recense pour l’instant sept tourbières et porte ces estimations à 2010 ha, et entre 3,1 et 3,4 Mt C ; soit respectivement 1,5% et 2% des valeurs obtenues à l’échelle nationale. A travers des analyses de densité apparente de la tourbe, notre étude a également permis de dresser pour six tourbières, leur profil de dégradation en fonction de la profondeur, révélant différentes priorités de restauration ou de conservation.

Écologie spatiale des oiseaux marins méditerranéens dans un cadre de santé globale (2025)

Tue, 13 Jan 2026 09:54:33

de Charly Souc
Montpellier : Université de Montpellier, 2025, 171

Les déplacements jouent un rôle central dans l’écologie et l’évolution des espèces. Ils incluent notamment la recherche alimentaire, la migration, la prospection et la dispersion. Chez les oiseaux marins, les déplacements conditionnent l’accès aux ressources, les interactions intra et interspécifiques et, d’une manière ultime, le succès reproducteur et la survie. Les stratégies de déplacements adoptées par les individus résultent de compromis façonnés par la sélection naturelle et modulés par la plasticité comportementale. Elles permettent aux individus d’ajuster leurs déplacements en fonction de leur état actuel, de celui de l’environnement et de leurs expériences passées. Cependant, l’intensification rapide des activités humaines peut modifier ces stratégies, avec des conséquences potentielles d’ordre écologique et sanitaire. Mes recherches ont exploré l’influence des activités anthropiques sur les déplacements des oiseaux marins et l’interaction entre ces déplacements, les parasites et l’exposition aux polluants. Le Goéland leucophée (Larus michahellis), une espèce opportuniste tirant profit des activités humaines, a servi de principale espèce modèle. Les analyses se sont appuyées sur une combinaison de méthodes : capture-marquage-recapture (CMR), suivi GPS, cartographie des contaminants et suivi approfondi de la reproduction et de l’état de santé individuel. Les résultats ont mis en évidence une variabilité des comportements migratoires selon l’âge et la colonie : les juvéniles sont plus mobiles que les adultes et la proportion de migrants varie d’une colonie à l’autre. Ce dernier point semble lié à la survie des juvéniles, suggérant un rôle des dynamiques locales liées aux stress environnementaux et aux activités humaines dans les décisions de migrer ou non. En effet, les estimations obtenues par une approche CMR comparant deux périodes temporelles, ont montré que la fermeture d’une décharge était corrélée à une augmentation de la proportion de migrants dans une colonie située à proximité, comparée à une colonie témoin. Mes recherches ont également abordé l’exposition à la pollution plastique. En combinant des modèles de distribution océanographique des microplastiques avec des positions GPS de quatre espèces d’oiseaux marins dans le Golfe du Lion, j’ai montré que les puffins et les sternes exploitent préférentiellement les zones où s’accumulent les plastiques. Cette interaction résulte probablement de processus marins concentrant à la fois les proies et les plastiques. À l’inverse, les Goélands leucophées tendent à éviter ces zones, bien que leur exposition reste élevée en raison d’autres sources de pollution plastique. Enfin, une dernière étude au sujet d’un parasite sanguin (Babesia sp. YLG) a révélé que l’infection n’affectait pas les déplacements des juvéniles malgré un impact négatif sur leur croissance. En revanche, l’infection des adultes réduisait significativement leur succès reproducteur, suggérant un coût accru lié aux efforts de recherche alimentaire. Dans l’ensemble, les résultats de cette recherche fournissent une base de réflexion sur l’influence de l’anthropisation sur les déplacements des oiseaux marins, ainsi que sur la nature des rétroactions potentielles entre mobilité, exposition aux contaminants et circulation des pathogènes. Plus largement, ils contribuent à la compréhension des liens entre activités humaines, faune sauvage et fonctionnement des écosystèmes dans une perspective de santé globale.

Etude de la COnnectivité écologique intra-LAGunaire : suivis des déplacements des ANGuilles européennes produites par deux bassins versants de l’étang du Vaccarès (Projet COLAGANG, 2021-2025) (2025)

Wed, 7 Jan 2026 15:52:13

de Delphine Nicolas, Amélie Hoste, Pascal Contournet, B. Girard, Samuel Hilaire, Emilie Laurent, Émilie Raynard, Claire Tetrel
Arles : Tour du Valat, 2025, 137

Ce projet avait pour objectif d'améliorer la compréhension de la démographie, de la phénologie et des migrations de deux sous-populations d’anguilles dans la région camarguaise. Les deux bassins étudiés, le canal de drainage de l’ASA du Fumemorte et le bassin des Grandes Cabanes, présentent des environnements différents : l’un est connecté à l’hydrosystème du Vaccarès, l’autre était déconnecté jusqu'à sa reconnexion récente. Les chercheurs ont mené une analyse des facteurs influençant l’échappement des anguilles, observant notamment qu’un pourcentage significatif d’anguilles des Grandes Cabanes cherchait à rejoindre la mer via le Petit Rhône. Les résultats indiquent que le passage des anguilles est influencé par des facteurs environnementaux tels que la température et la phase lunaire. Malgré la reconnexion de 2023, les anguilles continuent d'utiliser plusieurs voies d'échappement, et des obstacles écologiques persistent. Les études soulignent la nécessité d'un suivi continu pour mieux comprendre ces dynamiques migratoires et optimiser les mesures de gestion. [résumé rédigé par IA]

Stratégie d'échantillonnage et protocoles d'acquisition des données permettant de caractériser les conditions stationnelles et les communautés végétales, d'acquérir des indicateurs fonctionnels et d'habitat d'espèces pour évaluer l'état de conservation de prairies et pelouses semi-naturelles de huit régions métropolitaines mises en oeuvre dans le cadre du projet SurPas (2018-2021) (2025)

Wed, 29 Oct 2025 15:34:47

de Didier Alard, Bernard Amiaud, Anne Bonis, Olivier Chabrerie, Sylvain Diquelou, Thierry Dutoit, Hugo Fontes, Servane Lemauviel-Lavenant, Grégory Loucougaray, François Mesléard, et al.
[S.l.] : UMR 6042 GEOLAB CNRS Université Clermont Auvergne, 2025, 20
En ligne : hal.science[...]

Document de travail sur les protocoles d’acquisition des données du projet SURPAS,

Modélisation hydrodynamique de l’hydrosystème Vaccarès et génération de lois statistiques associées à l’influence du vent pour l’outil de modélisation GAMELag (2025)

Wed, 22 Oct 2025 14:43:13

de Daniel Leonardo Raba Amaya
Alès : École nationale supérieure des mines d'Alès, 2025, 58

Ce projet de fin d’études s’inscrit dans la mission « Flux admissibles » appliquée à l’hydrosystème Vaccarès (Camargue) dont objectif principal consiste sur l’évaluation de l’influence du vent dans l’outil de modélisation à réservoirs GAMELag. L’approche de ce projet concerne la modélisation hydrodynamique (TELEMAC-2D et TELEMAC-3D) et analyses statistiques des séries temporelles. Un modèle 3D du système a été adapté à partir de données topo-bathymétriques, hydrométriques et météorologiques de 20 novembre 2019 à 9 janvier 2020. Un modèle 2D déjà validé a été utilisée pour générer les séries de volume et d’échanges d’eau entre les étangs. L’année 2023 a été identifiée comme représentative du régime de vent sur la période 2000-2024, et des familles directionnelles ont été définies pour le vent moyen et les rafales. Les simulations 3D montrent, en validation, des corrélations supérieures à 0.75 pour la majorité des stations (et > 0.95 pour quelques stations), malgré une calibration moins performante, probablement liée à des conditions initiales défavorables. Les relations statistiques obtenus expliquent de manière robuste les variations de niveaux et les échanges en fonction du vent, avec des corrélations très élevées pour certaines sections (jusqu’à 0.95). Ces résultats, malgré d’être améliorables dans la classification des vents, sont jugés fonctionnels pour être intégrés dans GAMELag et ainsi améliorer la représentation de l’hydrosystème.

Proceedings of the Third Mediterranean Symposium on Ecology and Conservation of Marine and Coastal Bird Species (13-15 February 2024, Djerba, Tunisia) (2025)

Wed, 15 Oct 2025 16:27:57

de Mediterranean Action Plan United Nations Environment Programme, Specially Protected Areas Regional Activity Centre (SPA/RAC), Claudia Feltrup-Azafzaf, Nicola Baccetti, Benjamin J. Metzger, Ghassan Ramadan-jaradi, Hichem Azafzaf
Tunis (Tunisie) : SPA/RAC publications, 2025, 199
En ligne : www.spa-rac.org[...]

The Mediterranean Symposium on Ecology and Conservation of Marine and Coastal Bird Species provides a vital platform for sharing knowledge and promoting collaboration on bird conservation in the region. The first edition was held in 2005 in Vilanova i la Geltrú, Spain, and the second took place a decade later, in 2015, in Hammamet, Tunisia. Both editions played a catalytic role in inspiring regional and national initiatives to enhance the protection of these vulnerable bird species. The third edition aimed to continue this important work. The third Symposium took place in February 2024 in Djerba, Tunisia and aimed to review current knowledge on the 25 bird taxa listed in Annex II of the SPA/BD Protocol and to discuss the latest research findings and conservation efforts. Particular attention was given to ongoing conservation challenges, current projects across the Mediterranean, and endeavors to mitigate threats to these species’ populations. The symposium offers Mediterranean ornithologists a unique opportunity to exchange information, share experiences, and foster collaboration.

Non-marine Ostracoda (Crustacea) collected from the Camargue, southern France, with four species new to France

Wed, 15 Oct 2025 16:27:53

de Musée national d’ histoire naturelle Luxembourg - Naturmusée, Claude Meisch, Burkhard Scharf, Monika Czajkowska, Institute of Geography and Spatial Organization, Polish Academy of Sciences, Marie-Béatrice Forel, Muséum national d’ histoire naturelle, CR2P, Marlene Hoehle, Institute of Geography and Geology, University of Greifswald, Bertrand Lefebvre, et al.
In Bulletin de la Société des Naturalistes luxembourgeois, 127 (2025), 107-138
En ligne : www.snl.lu[...]

We report on the collection of 21 non-marine Ostracoda (Crustacea) species, mainly in July 2022, in the Rhône delta (Grande Camargue). The material comprises nine species new to the Camargue region (Grand delta du Rhône), of which four are new to France. These four are considered exotic in origin, and we suggest that they have been passively introduced in the Camargue during the second half of the 20th century: Bradleytriebella spinulosa (Akatova, 1958) nov. comb., Candonocypris novaezelandiae (Baird, 1843), Cypris granulata Daday, 1898, and Ilyodromus viridulus (Brady, 1886). Notes on these four species, and two previously recorded exotic species, i.e. Bradleycypris vittata (Sars, 1903) and Strandesia reticulata (Daday, 1898) from the Camargue are presented. Scanning electron micrographs of the carapaces and/or valves of all the species recorded are given. A checklist of the 44 non-marine ostracod species recorded from the Grand delta du Rhône is presented. A new taxonomic combination is provided: Bradleytriebella spinulosa (Akatova, 1958) nov. comb.

Breeding and wintering population trends of the Greater Flamingo in the Mediterranean over a 30-year period (1990-2021). (2025)

Wed, 15 Oct 2025 16:27:50

de Laura Dami, Wed Abdou, Antoine Arnaud, Hichem Azafzaf, Arnaud Béchet, Nadjiba Bendjedda, Khalil Baddour, Mohamed Dakki, Ugoline Godeau, Khaled Etayeb
Tunis (Tunisie) : SPA/RAC publications, 2025, 44-57
En ligne : www.spa-rac.org[...]

The Greater Flamingo (Phoenicopterus roseus) is listed in the appendices of several international conservation agreements including the Barcelona Convention. We combined 30 years of data from the International Waterbird Censuses (IWC) across North Africa, coordinated by the Mediterranean Waterbirds Network (MWN), with over 30 years of monitoring by the “The Network for the study and conservation of the Greater Flamingos in the Mediterranean and West Africa” to assess trends of the species in the Mediterranean basin. Wintering bird count data were analysed using a new statistical approach called LORI, while breeding data were summarized through descriptive analyses. The number of breeding pairs in the Camargue, as well as across the broader Mediterranean region, has generally increased over the past few decades. A similar trend has been observed for wintering flamingos in North Africa. In the last five years, both breeding and wintering populations appear to stabilize despite important fluctuations from year to year. Strengthening the link between breeding and wintering monitoring networks could provide critical insights into emerging trends and underlying causes of these changes.

Synthèse des retours d’expériences de gestion des zones humides en faveur du Butor étoilé, Botaurus stellaris dans le Paléarctique occidental dans le cadre du nouveau Plan National d’Actions (2025-2034) pour l’espèce (2025)

Wed, 17 Sep 2025 15:35:36

de Damien Lerouge
Lille : Université catholique de Lille, 2025, 130

Dans un contexte de perte mondiale de la biodiversité, le Butor étoilé Botaurus stellaris est également impacté. En France, ses populations déclinent fortement malgré la mise en place de plusieurs projets visant à inverser la tendance. Ainsi, les effectifs de mâles chanteurs sont passés d’environ 500 en 1970 à une centaine seulement en 2023. Une situation similaire a été observée au Royaume-Unis. Deux projets LIFE ont alors été initiés pour restaurer et créer des milliers d’hectares de roselières permettant une augmentation des effectifs de 11 mâles chanteurs en 1997 à 283 en 2025. Inspirée par cette réussite, une nouvelle initiative est lancée sous la forme d’un Plan National d’Actions (2025-2034) en faveur du butor pour enrayer le déclin, stabiliser la population actuelle et planifier son retour notamment par la création et la restauration de roselières. Cette étude s’inscrit dans le cadre de cette initiative et vise à synthétiser les retours d’expériences de gestion des zones humides en faveur de l’espèce dans le Paléarctique occidental avec l’objectif d’en tirer des recommandations pour établir une gestion des zones humides françaises favorables au Butor étoilé. Une méthodologie a été mise en place pour obtenir des informations sur le Butor étoilé et la gestion des zones humides à l’échelle européenne. La première étape de cette méthodologie fût la définition précise des modèles d’études : le Butor étoilé et son habitat, la roselière. La deuxième étape de la méthodologie concerne la collecte de données. Elle comporte la création d’un questionnaire à destination des gestionnaires de zones humides européens, la recherche et la prise de contacts pour transmettre ce dernier et l’acquisition d’informations complémentaires à celles apportées par le questionnaire via l’utilisation de différents portails de recherches bibliographiques. L’application de cette méthodologie a permis d’obtenir des informations dans14 pays : l’Autriche, l’Allemagne, la Belgique, la Bulgarie, la Croatie, le Danemark, l’Estonie, la Finlande, la Hongrie, la Lettonie, les Pays-Bas, le Royaume-Unis, la Slovaquie, la Turquie. Ces derniers ont pu être regroupés dans quatre secteurs géographiques différents : nord-est, sud-est, Europe centrale et ouest. Du nord-est à l’ouest, un gradient d’interventionnisme lié à des enjeux plus fort pour le butor et ses habitats à l’ouest qu’à l’est a été constaté. Parmi les pays qui agissent en faveur du butor, différentes actions ont été recensées, portant sur l’habitat du butor, ses interactions avec la biodiversité, la gestion du dérangement anthropique, le suivi de l’impact de la gestion déployée et la communication mise en place. Certaines problématiques rencontrées en Europe sont similaires à celles évoquées par les gestionnaires français au sein du nouveau Plan National d’Actions. Ce parallèle a permis d’établir des recommandations de gestion basée sur les retours d’expériences étrangers. Cependant, certaines problématiques observées en France n’ont pas été retrouvées dans le cadre de cette étude mettant ainsi en évidence ses limites. Cette étude fera l’objet d’une restitution auprès des gestionnaires de zones humides français en automne afin de discuter de l’adéquation des résultats obtenus avec leurs attentes.

Des Solutions Fondées Sur la Nature : une réponse aux défis environnementaux et sociétaux (2025)

Wed, 17 Sep 2025 15:35:26

de Freddy Rey
1e éd. Versailles : Quae, 2025, 119 (Matière à débattre et Décider Series)

Depuis le début des années 2010, le concept de Solutions fondées sur la Nature s’intègre dans les projets d’aménagement du territoire pour concilier les enjeux environnementaux avec les besoins de la société. Mais ce concept soulève encore de nombreuses interrogations. Comment préserver notre environnement tout en soutenant le développement socio-économique ? Comment s’adapter à un contexte climatique changeant, sans renoncer à un certain confort de vie ?
La préservation ou la restauration de la biodiversité constitue un prérequis à la mise en œuvre de toute initiative, qu’elle concerne la réduction des risques naturels, la sécurité de l’approvisionnement en eau, le développement économique et social, la sécurité alimentaire, la santé humaine, ou l’atténuation et l’adaptation au changement climatique. L’auteur détaille l’application du concept des Solutions fondées sur la Nature pour répondre à ces six grands défis sociétaux, à travers le partage d’initiatives aussi diverses que la restauration de zones humides pour réduire les inondations, la réouverture des milieux pour lutter contre les incendies, l’installation de noues végétalisées pour limiter l’imperméabilisation des sols et ombrager les milieux urbains ou encore la diversification des cultures pour limiter les pesticides tout en préservant leur rentabilité économique.

Revisiter les relevés phytosociologiques des marais tourbeux de Raphèle (2025)

Fri, 12 Sep 2025 16:13:49

de Simon Galmiche
Lille : Université de Lille, 2025, 43

Les végétations tourbeuses des marais de Raphèle, au moins sur les bordures externes, ont subi de profondes modifications au cours des 70 dernières années. En cause : le changement d’usage des terres, notamment dû à l’agriculture et à l’installation de nouvelles infrastructures routières, mais aussi l’appropriation des ressources en eau douce et l’invasion par des espèces exotiques. L’accélération des impacts des facteurs de changements globaux n’est pas prévue de s’arrêter au cours du XXIe siècle. Ainsi, sans mesures de conservation adaptées et une réelle volonté politique, les tourbières alcalines méditerranéennes risquent de continuer à se dégrader. Cependant, à l’échelle locale, le projet de classement des marais de Raphèle en Réserve Naturelle Régionale et le processus déjà en cours de rachat des parcelles du marais par le Conservatoire du Littoral permettent d’être optimistes. Néanmoins, les habitats liés aux tourbières alcalines en Méditerranée restent encore très mal connus et il est important de poursuivre les études allant dans ce sens afin de préserver ce patrimoine exceptionnel.

Quelle utilisation du concept d’écosystème de référence pour évaluer le succès de création de mares temporaires en Camargue ? (2025)

Fri, 12 Sep 2025 16:13:47

de Hugo Fontes
[S.l.] : Université d'Avignon, 2025, 182
En ligne : theses.hal.science[...]

Face à la dégradation des espaces naturels et la perte de biodiversité, la restauration écologique est considérée comme un des outils majeurs de la conservation biologique. Cette discipline récente, fait encore l’objet de controverses en particulier concernant le concept d’« écosystème de référence » considérée comme trop fixiste. Il est cependant aujourd’hui communément admis que la définition d’un écosystème de référence consiste non pas à figer une représentation d’un écosystème « idéal » passé, mais à explorer ses variations tant historiques qu’actuelles. Malgré ces avancées conceptuelles, des lacunes méthodologiques sont encore à combler afin de mieux prendre en compte la variabilité des écosystèmes de référence dans l’évaluation du succès d’opérations de restauration écologique.Pour répondre à ce besoin, nous avons choisi comme cas d’étude les mares temporaires méditerranéennes de Camargue, un écosystème dont les conditions environnementales et les communautés végétales sont particulièrement variables, notamment en raison de l’intermittence des phases aquatiques et sèches. Malgré leurs enjeux de conservation, les mares temporaires méditerranéennes ont connu et connaissent encore de forts impacts anthropiques. En réponse, des opérations de restauration et de création ont été réalisées et nécessitent maintenant d’être évaluées.Dans un premier temps, nous avons développé un indicateur, le « Distance to References Communities Index » (DRCI) qui permet de comparer un site ou une communauté en cours de restauration avec un panel de sites ou de communautés de référence. Cette méthode considère que chaque situation de référence est un objectif potentiel, contrairement aux méthodes couramment utilisées qui considèrent une situation moyenne de référence comme objectif optimal. Le DRCI est un indicateur intégratif qui, focalisé sur les communautés, utilise un indice de distance ou de similarité. Il est particulièrement adapté aux systèmes écologiques variables comme les mares temporaires.Nous avons ensuite exploré la diversité spatio-temporelle des mares de Camargue, au travers de toutes les données floristiques anciennes disponibles et des relevés réalisés dans le cadre de cette thèse dans 27 mares de références en avril, mai, juin et août 2019 et 2020. Les relevés ont permis de retrouver l’essentiel des espèces connues depuis les années 50, avec des proportions comparables. Les mares contemporaines peuvent donc être considérées comme des écosystèmes de référence pertinents, comparables aux mares inventoriées dans la seconde moitié du 20ème siècle. Néanmoins, certains changements mineurs dans la végétation des mares peuvent être interprétés comme des dégradations, avec notamment l’apparition d’espèces exotiques envahissantes et des phénomènes de salinisation potentiellement liés au changements climatiques.Enfin, nous avons comparé la végétation de 25 mares créées aux 19ème, 20ème et 21ème siècle (inventoriées en avril, mai, juin et juillet 2020) avec celle des 27 mares de références. Les communautés végétales (composition et abondance des espèces) des mares créées au 21ème siècle sont bien distinctes des communautés de références, contrairement aux communautés des mares créées antérieurement. Les communautés en conditions inondées sont plus proches des communautés de références que les communautés de la phase sèche. En particulier, les espèces émergentes protégées et menacées sont généralement absentes des mares créées, contrairement aux macrophytes submergés. L’intérêt de la création de mares temporaires méditerranéennes est donc important pour les communautés aquatiques, mais reste limité pour certaines communautés terrestres et amphibies.Le choix du modèle de référence et des variables mesurées peuvent fortement influencer les résultats et les conclusions de l’évaluation. La définition d’un modèle de référence revient à définir les objectifs de projets de restauration et rend donc plus ou moins flexible leur évaluation.

Gestion du site des étangs et marais des salins de Camargue. Bilan des activités de la Tour du Valat. Année 2024 (2025)

Fri, 12 Sep 2025 16:13:38

de Tour du Valat
Arles (FRA) : Tour du Valat, 2025, 74

It's time we make the world's oceans and seas a "Mare Nostrum" again (2025)

Thu, 11 Sep 2025 13:40:46

de André Hoffmann
Paris, France : JBE books, 2025, 176-177

Ce texte évoque l'importance de la collaboration pour préserver les océans et les ressources maritimes, soulignant que la pollution affecte tous ceux qui dépendent de ces écosystèmes. Il rappelle que les mers ont historiquement été essentielles au développement des civilisations humaines. Aujourd'hui, la dégradation des océans menace non seulement la biodiversité, mais aussi les économies qui en dépendent. Les entreprises ont un rôle crucial à jouer en adoptant des pratiques durables et en investissant dans des modèles économiques circulaires. Enfin, une prospérité durable nécessite l'engagement collectif de tous les acteurs de la société pour protéger notre planète.

Dynamique de dévalaison de l’Anguille Européenne dans un hydrosystème lagunaire en Camargue (2025)

Thu, 11 Sep 2025 10:59:11

de Émilie Raynard
Pau : Université de Pau et des pays de l'Adour, 2025, 1 vol. (58 p.)

L’anguille européenne (Anguilla anguilla), classée « en danger critique d’extinction », fait l’objet de suivis renforcés dans le cadre du Plan de Gestion National (PGN Anguille). Le projet COLAGANG a visé à caractériser la dévalaison des anguilles argentées dans l’hydrosystème du Vaccarès (Camargue), en se concentrant sur deux bassins versants : le canal du Fumemorte et le domaine des Grandes Cabanes. À l’aide de la télémétrie acoustique, 112 femelles argentées ont été marquées et 115 d’entre elles ont été suivies durant deux saisons de dévalaison (2023-2024 et 2024-2025). Les résultats révèlent une forte variabilité interindividuelle et interannuelle. La saison 2023-2024, marquée par une sécheresse exceptionnelle et la fermeture prolongée des ouvrages, a fortement limité les possibilités de dévalaison, la plupart des individus demeurant dans le Vaccarès ou dans leurs bassins respectifs sans atteindre la mer. En 2024-2025, malgré un contexte hydro climatique plus favorable, les sorties aux pertuis de la Fourcade et de la Comtesse sont restées très peu utilisées, alors que le Petit Rhône s’est imposé comme la principale voie d’échappement, avec 42 % des anguilles détectées à l’amont (25) et 15 atteignant l’aval. L’analyse bayésienne des probabilités de transition a confirmé ces tendances, mettant en évidence l’importance de la connectivité effective avec le Petit Rhône et le rôle contraignant des ouvrages. Ces résultats suggèrent que la gestion hydraulique, couplée aux conditions hydro climatiques, conditionnent fortement l’issue de migration de l’anguille en Camargue, mais ils ouvrent également d’autres questionnements, notamment sur la pêche professionnelle et la mortalité des individus. Ils mettent aussi en lumière le caractère imprévisible et adaptatif des trajectoires individuelles. Cette étude souligne la nécessité de poursuivre le suivi sur davantage d'années et d’améliorer la prise en compte des contraintes écologiques dans la gestion des ouvrages, afin de favoriser l’échappement des femelles argentées, déterminantes pour le succès reproducteur de l’espèce.

Dynamique de population de Lestes macrostigma en Camargue (2025)

Fri, 5 Sep 2025 15:54:20

de Sibylle Roger
Dijon : Université de Bourgogne, 2025, 30 p.-VII p.

Lestes macrostigma est une demoiselle classée « En danger » en France et « Vulnérable » en Provence-Alpes-Côte-d’Azur. Son aire de répartition est large mais très fragmentée. Cette espèce sténoèce dépend d’habitats rares : les eaux temporaires saumâtres, caractérisées par l’alternance de phases d’inondation et d’assèchement au cours de l’année. Elle est également connue pour les fortes fluctuations de ses effectifs d’une année à l’autre. Pour mieux comprendre ces variations, nous avons modélisé sa dynamique de population en Camargue, en étudiant si le ciblage de l’espèce dans un plan de gestion effectuée dans des aires protégées a un effet sur l’occurrence et l’abondance de l’espèce, indépendamment et en plus des régimes de précipitations. Ce travail repose sur des données de suivi collectées au cours des 15 dernières années, par des protocoles standardisés ou dans le cadre de sciences participatives. Elles ont été confrontées à des facteurs explicatifs comme les bilans hydriques automnale et printanier, ainsi que la gestion hydraulique des aires protégées. Trois modalités de gestion hydraulique ont été distinguées : absence de gestion, gestion favorable à L. macrostigma, et gestion non ciblée sur l'espèce. Nos modélisations montrent l’influence des conditions climatiques sur la probabilité de présence de L. macrostigma. L’espèce est davantage observée si l’automne est sec ou le printemps humide. Toutefois, indépendamment des conditions climatiques, sa probabilité de présence reste nettement plus élevée et régulière dans les sites bénéficiant d’un plan de gestion ciblé en faveur de l’espèce. Ce ciblage, associé à une gestion hydraulique présente dans ces sites, atténue les bilans hydriques, surtout printaniers, et maintient une présence régulière de l’espèce même lors d’années sèches. En effet, en dehors des sites ciblant l’espèce, L. macrostigma n’est observé que lors de printemps très humides. Ces résultats sont corroborés par l’analyse des preuves d’autochtonie. De plus, l’abondance suit une dynamique similaire. Elle est plus stable dans les milieux à gestion favorable et particulièrement élevée dans les aires protégées après un automne sec. La combinaison d’une gestion favorable et d’un printemps humide crée des conditions optimales pour l’espèce. Ces résultats montrent que les aires protégées et leur gestion hydraulique ciblée jouent un rôle essentiel pour la conservation de L. macrostigma. Face aux changements climatiques, marqués par une plus grande imprévisibilité des pluies et une hausse de l’évaporation liée aux températures, cette gestion garantit la présence d’eau dans les habitats clés. Elle permet ainsi de maintenir les effectifs, d’assurer l’autochtonie et de préserver les cœurs de population.

Domestic water buffaloes: an unexpected basking support for two sympatric freshwater turtles, Emys orbicularis (Linnaeus, 1758) and Mauremys rivulata (Valenciennes, 1833) in Türkiye

Fri, 5 Sep 2025 15:54:17

de Ömral Ünsal Özkoç, Cem Akın, Anthony Olivier, Dilara Arslan
In Herpetology Notes, 18 (2025), 839-843
En ligne : figshare.com[...]

This study aims to present new data on the relationships between domestic water buffaloes and reptiles.

Atlas et herbier de Camargue (2025)

Thu, 3 Jul 2025 16:05:30

de Luc Douzon, Hugo Fontes
Arles : Actes Sud, 2025, 1 vol. (401 p.)

Herbier des plantes rares, menacées et protégées, de Camargue réalisé en utilisant la technique du cyanotype. Une notice accompagne chaque taxon pour apporter plus de précisions géographiques et scientifiques.

La valeur ajoutée par la modernisation du portail documentaire, le cas d'un centre de documentation spécialisé (2025)

Tue, 24 Jun 2025 16:51:46

de Pierrick Courtin
Lyon (France) : Université Lyon 3 Jean Moulin, 2025, 43 p.

Ce rapport de stage s'interroge sur la valeur ajoutée par le centre de documentation à l'institut de recherche de la Tour du Valat. A partir d’une synthèse des différentes méthodes d’analyse de la valeur, le centre de ressources devra adapter les indicateurs qu’il souhaite évaluer en fonction de ses objectifs. Afin d'augmenter cette valeur, il a entrepris de moderniser son portail documentaire pour obtenir plus de visibilité et mieux répondre aux besoins des usagers. L’objectif de ce stage était donc d’amorcer ce processus de modernisation en proposant une méthode d’analyse des besoins et de l’existant afin de réaliser un cahier des charges.

Demographic processes of a long–distant migratory waterbird facing global changes (2025)

Mon, 24 Mar 2025 15:52:43

de Hugo Rafael Soares Ferreira
Aveiro (Portugal) : Universidade de Aveiro, 2025, 423

Les changements globaux se produisent à un rythme alarmant en raison du développement humain continu et croissant. Les activités anthropiques entraînent non seulement une perte directe et significative des habitats, et donc de la biodiversité, mais elles influencent également, de manière indirecte, la capacité des espèces à répondre aux changements globaux. Les oiseaux migrateurs, qui connaissent actuellement un déclin important et rapide à l'échelle mondiale, font partie des taxons les plus touchés par les changements climatiques mondiaux et la perte d'habitat. Cependant, toutes les espèces de ce groupe ne sont pas en déclin et certaines semblent se rétablir, au moins localement, comme l’atteste plusieurs espèces d'oiseaux d'eau en Europe. Étudier la manière dont ces espèces en voie de rétablissement s’adaptent aux changements actuels, que ce soit au niveau du climat ou de leur habitat, peut fournir des indications sur la capacité de résilience des espèces d’oiseaux migrateurs. Un exemple notable d'une croissance de la population après des années de déclin est celui de la Spatule blanche, une espèce partiellement migratrice qui s'étend de la côte est de l'Atlantique à l'Asie du Sud-Est. Dans cette thèse, j'ai étudié le rôle des conditions environnementales, du comportement et de l'expérience dans l'influence de la réponse de cet oiseau d'eau aux changements globaux et locaux induits par des facteurs anthropiques directs et/ou indirects. Plus précisément, cette thèse comprend six chapitres visant à (i) explorer la façon dont le succès de reproduction est associé aux conditions environnementales rencontrées localement ; (ii) évaluer l'impact des facteurs anthropiques tout au long du cycle annuel et selon l'âge ; et (iii) comprendre l'effet du comportement migratoire sur la survie et la productivité. Alors que l'on s'attendait à ce que la phénologie de la reproduction, la condition corporelle des poussins et le volume des œufs soit influencés par des patrons géographiques ou climatiques à l'échelle continentale, seule une tendance latitudinale globale dans la phénologie de la reproduction a été détectée, les spatules des latitudes plus basses commençant généralement à pondre plus tôt que celles des latitudes plus élevées (Chapitre 2). En outre, les résultats suggèrent que les adultes expérimentés se reproduisent plus tôt et produisent probablement des poussins de meilleure qualité que les adultes inexpérimentés (Chapitre 3).
Les spatules répondent à la pollution existante en Camargue (Midi de la France) par l'utilisation croissante de matériels artificiels dans les nids (chapitre 4). Bien que la Camargue présente un paysage fragmenté avec plusieurs perturbations d’origine anthropiques et différents niveaux de protection, les spatules bénéficient des zones gérées pour les oiseaux d'eau, que ce soit à des fins de conservation ou de chasse (chapitre 5). Enfin, je montre comment la migration sur de longues distances, impliquant le franchissement de barrières écologiques importantes, peut être coûteuse pour la survie et la productivité des spatules et comment elles sont plus à même de faire face à ces défis en vieillissant (chapitres 3, 6 et 7). J'explore également l'impact de la dégradation des zones humides sur les taux démographiques je questione le recrutement potentiel des spatules dans les régions de reproduction le long des routes migratoires, ce qui pourrait expliquer la philopatrie apparemment faible chez cette espèce (chapitre 7). Cette thèse explore comment une espèce d'oiseau d'eau modérément spécialisée peut bénéficier des changements globaux actuels en exploitant de nouvelles opportunités, telles que l'utilisation d'espèces envahissantes comme nouvelles sources de nourriture et l'utilisation de zones humides gérées pour des activités économiques et récréatives. Elle souligne également comment l'amélioration des performances (par exemple, la reproduction et la migration), avec l'âge et grâce aux signaux sociaux des congénères plus âgés, renforce la capacité de la spatule à prospérer dans des environnements changeants. Enfin, cette thèse examine la rapidité avec laquelle un scénario actuellement positif (affichés par les oiseaux d'eau) peut changer face à une grave dégradation des zones humides ou à un manque de souplesse d’adaptation aux changements mondiaux en cours.

Role of protected areas for a colonial-breeding waterbird in a fragmented landscape throughout its annual cycle

Mon, 6 Jan 2025 15:32:43

de Hugo Rafael Soares Ferreira, José A. Alves, Frédéric Jiguet, Olivier Duriez, Thomas Blanchon, Tamar Lok, Jocelyn Champagnon
In Landscape Ecology, 40(1) (December, 2024), 6
En ligne : doi.org[...]

Throughout their annual cycle and life stages, animals depend on a variety of habitats to meet their vital needs. However, habitat loss, degradation, and fragmentation are making it increasingly difficult for mobile species such as birds to find suitable habitats. Wetlands are highly productive systems of great importance to many animals, but their continued degradation threatens their capacity to support different species, including waterbirds. In this context, waterbirds are likely to benefit not only from the creation and management of protected wetlands, but also from the existence of anthropogenic wetlands, managed for economic or recreational activities.
/ Cette étude explore comment la spatule, une espèce modérément spécialisée, bénéficie des changements globaux actuels grâce à sa capacité à exploiter des habitats appropriés, qu’ils soient naturels ou artificiels, au sein de paysages fragmentés. Cependant, sa dépendance aux zones humides gérées par le secteur privé soulève des questions importantes, car elle peut avoir de lourdes conséquences pour les espèces fortement tributaires de ces habitats. Ainsi, promouvoir la gestion des habitats favorisant des conditions naturelles apparaît crucial pour préserver la résilience des espèces.
Comprendre comment des actions de gestion spécifiques influencent la présence des oiseaux d’eau et l’utilisation de leur habitat est essentiel non seulement pour accroître l’efficacité des efforts de conservation, mais aussi pour renforcer la connectivité des zones humides et la résilience des espèces, en particulier dans des paysages fragmentés.

Life-history traits of the invasive and biggest European freshwater fish, the wels catfish (Silurus glanis) show high potential for colonisation in Southern Europe

Mon, 6 Jan 2025 15:32:51

de Jacques Panfili, Delphine Nicolas, Khady Diop, Alain J. Crivelli
In Marine and Freshwater Research, 75(18) (December, 2024)
En ligne : www.publish.csiro.au[...]

The invasive wels catfish is spreading to many European waterbodies and is the subject of controversy concerning its environmental impact.The objective was to investigate its life-history traits (growth and reproduction) for the first time in southern France. A culling action was used to assess the key life-history traits, using sections of pectoral spines for age and growth estimations, and gonad macroscopic examination for the reproduction parameters. The biggest individual was a 227-cm male. The age was accurately estimated from clear translucent marks on spines, with a maximum of 13years for both sexes. The growth appeared to be extremely rapid and was the highest at old ages recorded from both the native and the invasive distribution range. The length and age at first sexual maturity, 70.1cm for 4–5-year-old females, and 54.1cm for 2–3-year-old males, were the lowest recorded in Europe, indicating an early maturity. The life-history parameters (rapid growth, early maturation, high fecundity) showed a very high potential for adaptation and colonisation. The cost and management required to regulate the species appear not easily feasible, particularly when combined with its high growth rate.

Ease and Limitations in Using Environmental DNA to Track the Spread of Invasive Host–Parasite Complexes: A Case Study of the Freshwater Fish Pseudorasbora parva and the Cryptic Fungal Parasite Sphaerothecum destruens

Wed, 27 Nov 2024 16:25:17

de Théo Deremarque, Rodolphe Elie Gozlan, Ravo Ravaozafindrasoa, Giuliano Mucci, Lucie Delalex, Jean-Michel Foissy, Michael Cagnant, Mathieu Clair, Justina Givens, Fabienne Justy, et al.
In Fishes, 9(12) (December, 2024), 477
En ligne : www.mdpi.com[...]

The spread of non-native species threatens biodiversity and exacerbates societal challenges like food security. To address this, effective conservation programs require detection methods that are easy to implement, accurate, and non-invasive. Over the past 15 years, environmental DNA (eDNA) techniques have gained popularity, surpassing traditional sampling methods. In this context, our study focused on tracking the invasive host–pathogen complex Pseudorasbora parva and Sphaerothecum destruens using eDNA metabarcoding. We collected water samples from freshwater canals over five months in the Camargue region, and once in Corsica Island, both in southern France. Total DNA was extracted from filtered water samples, and PCR-amplicons were sequenced using Illumina or Nanopore technologies. Our results revealed a high detection rate of P. parva in lentic ecosystems, aligning with habitat preferences of this small freshwater fish. Additionally, the detection rate in Camargue increased in May and June, likely due to the peak of the spawning season, which leads to more DNA being released into the environment (i.e., concentration and interaction of individuals). While eDNA successfully detected this invasive fish, we were unable to detect its cryptic fungal parasite, S. destruens, highlighting the challenges of identifying intracellular and cryptic fungal pathogens through eDNA methods.

Blood levels of metallic trace elements are influenced by sex, age and habitat in the European pond turtle (Emys orbicularis)

Fri, 22 Nov 2024 11:34:53

de Leslie-Anne Merleau, Aurélie Goutte, Anthony Olivier, Marion Vittecoq, Paco Bustamante, Carole Leray, Olivier Lourdais
In Science of The Total Environment, 954 (December, 2024), 177487
En ligne : linkinghub.elsevier.com[...]

Metallic trace elements (MTEs) constitute a major source of chemical pollution and represent a threat to aquatic ecosystems and organisms. Important variation in contamination may exist at a local scale in relation to the environment (hydrosystem, trophic ressources) and individual traits (age, sex). Heretofore, the factors influencing MTEs exposure of freshwater reptiles in temperate regions are not fully understood. Freshwater turtles have a relatively high trophic position and a long lifespan, thus being potentially highly exposed due to bioaccumulation and bioamplification processes. We investigated MTE blood concentrations from two populations of the European pond turtle (Emys orbicularis) in the Camargue wetland (France). These populations, monitored since 1997, differ in their habitat and exposure (irrigation versus drainage canal). In this study, we detected 7 MTEs (Cu, Fe, Hg, Mn, Pb, Se, and Zn) which levels depended on site and individual characteristics. Hg was positively related to body size and age, indicating an increase of exposure in older individuals. We found differences between males and females with the interaction with body size for Pb and Se and with age for Pb. Nitrogen and carbon stable isotopes varied only marginally between individuals and were poorly associated with MTEs concentrations, showing that trophic position might not explain MTEs contamination for these populations. At the individual level, Hg, Pb, and Se blood values were repeatable over years. Further studies should concentrate on potential ecophysiological effects to such exposure, especially since we recently evidenced that these populations of E. orbicularis are highly exposed to organic contaminants, which can lead to synergistic effects.

Spatial variation of mercury contamination in yellow-legged gulls (Larus michahellis) in the Western Mediterranean

Thu, 3 Oct 2024 11:30:11

de Laura Patier, Paco Bustamante, Karen D. McCoy, Gaël Guillou, Abdessalem Hammouda, Carole Leray, Gonzalo Fernando Martínez Salcedo, Ana Payo-Payo, Gauthier Poiriez, Raul Ramos, et al.
In Environmental Pollution, 362 (December, 2024), 124992
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

Mercury (Hg) is a global pollutant of major concern in marine and coastal environments. In the Mediterranean Sea, Hg concentrations in biota are higher than in other seas, even when seawater concentrations are similar. Seabirds, as marine top predators, can reflect Hg contamination on a large spatial scale. By sampling seabirds at 17 different breeding colonies, we evaluated Hg concentrations of yellow-legged gulls (Larus michahellis) in the occidental Mediterranean basin in 2021 and 2022. More specifically, we investigated spatial variation of Hg contamination in both chicks and adults as well as associated toxicological risks through the use of blood and feathers, which reflect contamination over different periods of the year. The highest concentrations in chicks were found in Djerba (Tunisia) with blood Hg values of (mean ± SD) 1.69 ± 0.51 μg g−1 dry weight (dw). Adults were most contaminated in Djerba and Dragonera (Balearic Islands, Spain) with blood Hg concentrations of respectively 3.78 ± 2.54 and 5.25 ± 3.73 μg g−1 dw. Trophic ecology was investigated using stable isotope analyses (δ13C, δ15N and δ34S as proxies of feeding habitat and diet), and showed that spatial variation in Hg was mainly driven by foraging habitat in both chicks and adults. Low Hg concentrations were related to the use of anthropogenic food sources. An effect of colony location was also found, suggesting spatial differences in local environmental pollution transfer up to seabirds. Our results also supported the use of δ34S to discriminate between marine and continental foraging habitats in generalist seabirds. This study provides new insights onto the spatial distribution of Hg contamination in a widespread seabird, reporting some of the highest Hg values recorded for this species. Populations with highest concentrations are of potential concern regarding toxicological risks.

Salinity tolerance of the invasive blue crab Callinectes sapidus: From global to local, a new tool for implementing management strategy

Thu, 19 Sep 2024 16:11:59

de Guillaume Marchessaux, Nathalie Barre, Virginie Mauclert, Katia Lombardini, Eric D. H. Durieux, Dimitri Veyssiere, Jean-José Filippi, Jérémy Bracconi, Antoine Aiello, Marie Garrido
In Science of The Total Environment, 954 (December, 2024), 176291
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

The latest report from the Intergovernmental Platform on Biodiversity and Ecosystem Services (IPBES) raises concerns about the global proliferation of non-native species (NIS) driven by increasing temperatures. In 2023, the invasive blue crab Callinectes sapidus experienced a significant range expansion in the French Mediterranean lagoons, now present in over 20 lagoons and numerous estuaries with different invasion gradients. It has been established that this species is eurytherm (tolerates a wide range of temperatures; 0–40 °C), rendering temperature a non-limiting factor for its proliferation. On the other hand, salinity is a critical factor to consider, as C. sapidus requires brackish water for copulation and saline water for egg maturation. In this study, we present the salinity tolerance of C. sapidus using the metabolic performance to define the tolerance of the species to a large range of salinities (13 levels from 0 to 65 psu). Results showed that C. sapidus tolerates a large range of salinities with a minimum critical threshold (CTmin) at 0 psu, an optimum at 18.5 psu, and a CTmax at 62.4 psu. Using the performance curve equation, we applied the curve to real salinity data measured each month in 2023 in 20 lagoons invaded. Using this approach, we were able to map, on a fine spatial scale, the distribution of suitable habitats for C. sapidus in the year 2023. Additionally, we have developed a tool to prioritize the lagoons based on their suitability, thereby providing a decision-making framework for management measures in each lagoon. It emerged that 50 % of lagoons were priority areas, 10 % were intermediate and 40 % required monitoring. On the basis of this approach, we can respond to European regulations to help decision-makers implement action plans and/or early detection programs for invasive species management.

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Le dernier rapport de la Plateforme intergouvernementale scientifique et politique sur la biodiversité et les services écosystémiques (IPBES) souligne l’inquiétude croissante concernant la prolifération mondiale des espèces non indigènes (ENI), exacerbée par l’augmentation des températures. En 2023, le crabe bleu invasif Callinectes sapidus a considérablement étendu son aire de répartition dans les lagunes méditerranéennes françaises (plus de 20 lagunes et plusieurs estuaires présentant différents gradients d’invasion). Il a été établi que cette espèce est eurytherme (tolérant une large gamme de températures allant de 0 à 40 °C), rendant la température non limitante pour sa prolifération. En revanche, la variation de salinité est un paramètre essentiel pour assurer sa reproduction et pour la maturation des œufs jusqu’à la ponte en milieu marin.
Cette étude présente la tolérance à la salinité de C. sapidus, en utilisant la performance métabolique pour définir sa tolérance à un large éventail de niveaux de salinité (13 niveaux allant de 0 à 65 PSU). Les résultats montrent que C. sapidus tolère une large gamme de salinités avec un seuil critique minimal (CTmin) à 0 PSU, un optimum à 18,5 PSU, et un CTmax à 62,4 PSU. En appliquant une courbe de performance aux données de salinité réelles mesurées mensuellement en 2023 dans 20 lagunes envahies, il a été possible de cartographier, à une échelle spatiale fine, la distribution des habitats favorables pour C. sapidus en 2023 (SHS). De plus, un outil de priorisation des lagunes selon leur degré d’habitabilité a été développé, fournissant ainsi un cadre décisionnel pour les mesures de gestion dans chaque lagune. Il en ressort que 50 % des lagunes sont des zones prioritaires, 10 % sont intermédiaires et 40 % nécessitent une surveillance. Cette approche permet de répondre aux réglementations européennes en aidant les décideurs à mettre en œuvre des plans d’action et/ou des programmes de détection précoce pour la gestion des espèces invasives.

Assessing methane emissions and soil carbon stocks in the Camargue coastal wetlands: Management implications for climate change regulation

Wed, 21 Aug 2024 14:29:14

de Maite Martínez-Eixarch, Pere Masqué, Anna Lafratta, Paul Lavery, Samuel Hilaire, Lluís Jornet, Cyrille Thomas, Arnaud Boisnard, Néstor Pérez-Méndez, Carles Alcaraz, et al.
In Science of The Total Environment, 950 (November, 2024), 175224
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

Coastal wetlands are crucial in climate change regulation due to their capacity to act as either sinks or sources of carbon, resulting from the balance between greenhouse gas (GHG) emissions, mainly methane (CH4), and soil carbon sequestration. Despite the paramount role of wetlands in climate regulation few studies investigate both aspects. The Camargue is one of the largest wetlands in Europe, yet the ways in which environmental and anthropic factors drive carbon dynamics remain poorly studied. We examined GHG emissions and soil organic carbon (SOC) stocks and accumulation rates in twelve representative wetlands, including two rice fields, to gain insights into the carbon dynamics and how it is influenced by hydrology and salinity. Mean CH4 rates ranged between – 87.0 and 131.0 mg m−2 h−1and the main drivers were water conductivity and redox, water table depth and soil temperature. High emission rates were restricted to freshwater conditions during summer flooding periods whereas they were low in wetlands subjected to summer drought and water conductivity higher than 10 mS cm−1. Nitrous oxide emissions were low, ranging from – 0.5 to 0.9 mg N2O m−2 h−1. The SOC stocks in the upper meter ranged from 17 to 90 Mg OC ha−1. Our research highlights the critical role of low-saline wetlands in carbon budgeting which potentially are large sources of CH4 but also contain the largest SOC stocks in the Camargue. Natural hydroperiods, involving summer drought, can maintain them as carbon sinks, but altered hydrology can transform them into sources. Artificial freshwater supply during summer leads to substantial CH4 emissions, offsetting their SOC accumulation rates. In conclusion, we advocate for readjusting the altered hydrology in marshes and for the search of management compromises to ensure the compatibility of economic and leisure activities with the preservation of the inherent climate-regulating capacity of coastal wetlands.

European eel (Anguilla anguilla) survival modeling based on a 22-year capture-mark-recapture survey of a Mediterranean subpopulation

Thu, 10 Oct 2024 11:42:03

de Amélie Hoste, Colin Bouchard, Jean-Christophe Poggiale, Delphine Nicolas
In Journal of Fish Biology, Online version (October, 2024)
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

Since the 1980s, the European eel (Anguilla anguilla) has declined by over 90% in recruitment across its European and North African distribution area. This diadromous fish spawns at sea and migrates into continental waters, where it grows for three to more than 30 years, depending on habitat conditions and location. During their growth, different habitat use tactics can locally influence the life-history traits of eels, including their survival rates. Thus, the spatio-temporal dimension of this species is crucial for management. Based on a rare Mediterranean long-term survey of more than 20 years (2001–2022) in an artificial drainage canal connected to a vast brackish lagoon (the Vaccarès lagoon), we aimed to study the dynamics of one subpopulation's life-history traits. We used Bayesian multistate capture-mark-recapture (CMR) models to assess the temporal variability in survival and abundance at both seasonal and inter-annual scales, considering life-stage structure. High survival rates and low detection probabilities were found for the undifferentiated and female yellow stages. In contrast, female silver eels exhibited lower survival rates and higher capture probabilities. Estimating detection probabilities and survival rates enabled accurate assessment of relative abundance across different life stages and time periods. Our findings indicated a substantial decrease in the abundance of undifferentiated and female yellow eels in the early 2000s, whereas the abundance of female silver eels remained consistently low yet stable throughout the study period. Considering the life stage seemed essential to study the dynamics of the eel during its continental growing period. The present results will provide key elements to propose and implement suitable sustainable environmental management strategies for eel conservation.

4(2024) - Novembre, 2024 - Exploitation minière des fonds marins : une nouvelle ruée vers l'or menace les océans (Bulletin de Magazine WWF)

Fri, 13 Dec 2024 09:59:47

Exploitation minière des fonds marins : une nouvelle ruée vers l'or menace les océans
Bulletin de Magazine WWF, 4(2024) (Novembre, 2024)
En ligne : bc.pressmatrix.com[...]

Sommaire :

Good news

Exploitation minière des fonds marins
- Les trésors des abysses

Le monde en chiffres

Actuel
- Partenariat gagnant : Grands acteurs pour grandes actions
- Des perspectives pour toute le monde
- Le menu du futur : plus de variétés à table

Mon WWF
- Portrait : Tobias Salathé, biologiste, a longtemps oeuvré en faveur des zones humides. Amoureux de la Camargue, pour les 70 ans de la Tour du Valat créée par Luc Hoffmann, le Bâlois publie Les Terres d'eau.

La Spatule blanche Platalea leucorodia en Dombes : origine, déplacements, place dans le contexte ouest-européen

Mon, 16 Sep 2024 16:18:41

de Maurice Benmergui, Marine Galy, Thomas Blanchon, Jocelyn Champagnon, Lok Tamar, Stefano Volponi
In Alauda, 92(3) (Septembre, 2024), 203-224

La Spatule blanche se reproduit depuis 2006 dans Ia Dombes, région composée de plus de 1 300 étangs piscicoles extensifs situés à quelques dizaines de kilomètres de l’agglomération lyonnaise. Sa population est l’une des plus petites et des plus fragiles de France, car soumise a l’aléa d’un système particulier d’exploitation des étangs, d’assèchement (a assec ii) et de drainage estival, qui semble compromettre Ia stabilité des colonies. La Dombes est historiquement Ia première et reste l’une des régions les plus continentales où se reproduit Ia Spatule blanche en France : le littoral le plus proche est celui de Ia Méditerranée, avec Ia Camargue, située à environ 300 km au Sud. Depuis 1991, cette espèce est baguée dans le cadre de plusieurs programmes européens de conservation. Plusieurs de ces oiseaux bagués fréquentent Ia Dombes. A partir des observations réalisées d’après 53 individus, entre 1991 et 2020, nous tentons de remonter aux origines géographiques des individus présents en Dombes. Les résultats révèlent, que les oiseaux contrôlés et bagués au nid proviennent de Camargue (67,9 %), des Pays-Bas (11,3 %), d’Italie (9,4 %), de Croatie (3,8 %), d’Allemagne (3,8 %) et de Belgique (1,9 %). Hormis Ia France, 13 pays accueillent des spatules en escale : l’Espagne (28,3 %); les Pays-Bas (20,8 %); l’Allemagne (9,4 %); l’Italie, Ia Belgique et la Mauritanie (7,5 % chacun); le Maroc (5,7 %); le Portugal et la Tunisie (3,8 % chacun); Ia Suisse, l’Autriche, le Sénégal et l’Algérie (1,9 % chacun). Les étapes migratoires correspondent globalement à celles des oiseaux camarguais qui empruntent Ia route côtière pour rejoindre I ’Espagne, le Maroc et le Banc d’Arguin mauritanien pour y hiverner. L’âge de première visite des Spatules en Dombes est dominé par Ia classe des oiseaux de 3-4 ans (39,6 %), puis celle des 5-6 ans (24,5 %). La durée minimale de séjour postnuptial est de 33 jours mais reste variable et 26 % des spatules restent plus de deux mois. Bien que marginales par rapport au nombre élevé d’oiseaux bagués en Europe du Nord, en Camargue, en Italie ou en Croatie, les contrôles réalisés dans Ia Dombes démontrent de possibles échanges entre : ces populations. Celle de Ia Dombes apparait, comme celle de Camargue, comme une population d’origine mixte, issue du groupe Mer du Nord-Atlantique d’une part et, du groupe Méditerranée Centrale d’autre part (Champagnon et al., 2019). Les oiseaux italiens et croates quant à eux appartiennent au groupe de Ia Méditerranée centrale, mais leur présence dans Ia Dombes, fortuite, témoigne d’une certaine fidélité à Ia région tant en migration qu’en période de reproduction. A ce jour, seuls deux oiseaux d’origine camarguaise sont nicheurs dans les colonies de Ia Dombes confirmant l’influence de Ia population camarguaise sur celle reproductrice de Ia Dombes. Un autre événement original est Ia dispersion postnuptiale d’une fraction des oiseaux camarguais vers les étangs de Ia Dombes et qui peut atteindre ponctuellement 200 à 300 individus. Nous discutons l’intérêt pour Ia Dombes de rejoindre les régions et pays réunis sur Ia question de Ia conservation de l’espèce dans un contexte climatique pouvant fragiliser notamment certaines populations littorales, ainsi que d’affirmer l’importance écologique et régionale de Ia biodiversité d’une région qui vient d’être désignée parmi les 18 zones humides emblématiques de France dans le nouveau Plan d’Action Zones Humides 2022-2026.

Mercury contamination and potential health risk to French seabirds: a multi-species and multi-site study

Mon, 16 Sep 2024 14:08:25

de Prescillia Lemesle, Alice Carravieri, Gauthier Poiriez, Romain Batard, Aurélie Blanck, Armel Deniau, Gilles Faggio, Jérôme Fort, Fabrice Gallien, William Jouanneau, et al.
In Science of The Total Environment, 952 (November, 2024), 175857
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

Mercury (Hg) is a naturally occurring, highly toxic element whose circulation in ecosystems has been intensified by human activities. Hg is widely distributed, and marine environments act as its main final sink. Seabirds are relevant bioindicators of marine pollution and chicks are particularly suitable for biomonitoring pollutants as they reflect contamination at short spatiotemporal scales. This study aims to quantify blood Hg contamination and identify its drivers (trophic ecology inferred from stable isotopes of carbon (δ13C) and nitrogen (δ15N), geographical location, chick age and species) in chicks of eight seabird species from 32 French sites representing four marine subregions: the English Channel and the North Sea, the Celtic Sea, the Bay of Biscay and the Western Mediterranean. Hg concentrations in blood ranged from 0.04 μg g−1 dry weight (dw) in herring gulls to 6.15 μg g−1 dw in great black-backed gulls. Trophic position (δ15N values) was the main driver of interspecific differences, with species at higher trophic positions showing higher Hg concentrations. Feeding habitat (δ13C values) also contributed to variation in Hg contamination, with higher concentrations in generalist species relying on pelagic habitats. Conversely, colony location was a weak contributor, suggesting a relatively uniform Hg contamination along the French coastline. Most seabirds exhibited low Hg concentrations, with 74 % of individuals categorized as no risk, and < 0.5 % at moderate risk, according to toxicity thresholds. However, recent work has shown physiological and fitness impairments in seabirds bearing Hg burdens considered to be safe, calling for precautional use of toxicity thresholds, and for studies that evaluate the impact of Hg on chick development.

Among-colony variation in plastic ingestion by Yellow-legged gulls (Larus michahellis) across the western Mediterranean basin

Wed, 5 Jun 2024 15:49:23

de Florence Nono Almeida, Carole Leray, Charly Souc, Sara Scotto, Slaheddine Selmi, Abdessalem Hammouda, Raul Ramos, Alexandra ter Halle, Karen D. McCoy, Marion Vittecoq
In Marine pollution bulletin, 204 (July, 2024), 116508
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

The Mediterranean region is both a hotspot for biodiversity and for the accumulation of plastic pollution. Many species are exposed to this pollution while feeding, including a wide diversity of seabirds. Our objective was to investigate spatial variation in the quantity and types of plastic ingested by Yellow-legged gulls using information obtained from regurgitated pellets collected in 11 colonies. Anthropogenic debris, and particularly plastic, was found in pellets from all colonies, but the amount varied considerably. This among-colony difference was stable over the two years of study. The presence of marine prey and the proportion of agricultural area around the colonies significantly influenced the number of ingested plastics. As landfills close and garbage management improves, the availability of anthropogenic waste should decline. Following the response of gulls to these changes will be particularly useful for monitoring plastic pollution and for understanding the response of opportunistic wildlife to environmental modifications.

No detrimental effects of wing-harnessed GPS devices on the breeding performance of Yellow-legged Gulls (Larus michahellis): A multi-colony evaluation

Wed, 26 Jun 2024 16:19:01

de Charly Souc, Carole Leray, Thomas Blanchon, Thomas Dagonet, Marion Vittecoq, Raul Ramos, Karen D. McCoy
In Ibis, (en ligne) (June, 2024)
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

A recent study revealed that wing-harnessed tracking devices negatively affected reproductive success of Great Black-backed Gulls Larus marinus. To evaluate the generality of this effect in large gulls, we investigated the reproductive performance associated with the same type of GPS-mounted system in four Mediterranean breeding colonies of the Yellow-legged Gull Larus michahellis in 2022. We found no significant difference in reproductive parameters among adults handled with a mounted device, adults handled with no device, and controls, and no interaction with colony of origin. The impact of the GPS harness system on short-term reproduction is therefore not generalizable among larid species, and should be tested and reported whenever a new tracking programme is employed.

Population-specific responses to pollution exposure suggest local adaptation of invasive red swamp crayfish Procambarus clarkii along the Mediterranean French coastline

Wed, 26 Jun 2024 16:19:02

de Marie-Catherine Raffalli, Ana María Bojórquez-Sánchez, Jehan-Hervé Lignot, Diana Martínez-Alarcón
In Environmental Science and Pollution Research, (en ligne (June, 2024)
En ligne : doi.org[...]

Anthropogenic stressors can have an impact in a broad range of physiological processes and can be a major selective force leading to rapid evolution and local population adaptation. In this study, three populations of the invasive crayfish Procambarus clarkii were investigated. They are geographically separated for at least 20 years, and live in different abiotic environments: a freshwater inland lake (Salagou lake) with no major anthropogenic influence and two other coastal wetlands regularly polluted by pesticides along the Mediterranean coast (Camargue region and Bages-Sigean lagoon). Collected adults were genetically characterized using the mitochondrial COI gene and haplotype frequencies were analyzed for genetic variability within and between populations. Results revealed a higher genetic diversity for these invasive populations than any previous report in France, with more than seven different haplotypes in a single population. The contrasting genetic diversity between the Camargue and the other two populations suggest different times and sources of introduction. To identify differences in key physiological responses between these populations, individuals from each population were maintained in controlled conditions. Data on oxygen consumption rates indicate that the Salagou and Bages-Sigean populations possess a high inter-individual variability compared to the Camargue population. The low individual variability of oxygen consumption and low genetic diversity suggest a specific local adaptation for the Camargue population. Population-specific responses were identified when individuals were exposed to a pesticide cocktail containing azoxystrobin and oxadiazon at sublethal concentrations. The Salagou population was the only one with altered hydro-osmotic balance due to pollutant exposure and a change in protease activity in the hepatopancreas. These results revealed different phenotypic responses suggesting local adaptations at the population level.

153 - 2023 - Jahresbericht 2023 (Bulletin de Ornithologische Gesellschaft Basel. Jahresbericht)

Thu, 6 Jun 2024 14:53:22

Jahresbericht 2023
Bulletin de Ornithologische Gesellschaft Basel. Jahresbericht, 153 (2023)
En ligne : www.ogbasel.ch[...]

Sommaire :

Bericht des Präsidenten

Avifauna Regio Basiliensis
- Ornithologischer Rückblick für die Region Basel: 2023
- Verbreitung und Biotope der Zaunammer (Emberiza cirlus) in der Region Basel
- 365 Tage Birdrace vor der eigenen Haustüre: Local Patch Big Year

Projekte, Natur- und Vogelschutz
- Gebäudebrüter im Kanton Basel-Stadt
- Ein neuer Nistkasten für Wanderfalken in der Stadt Basel
- Neuigkeiten aus der Petite Camargue Alsacienne
- Bericht über das OGB-Reservat Grendelmatte
- OGB-Nisthilfen im Kannenfeld- und Schützenmattpark

Vorträge, Exkursionen, Reisen und Kurse
- Vorträge
- Exkursionen
- Naturwiesenmarkt auf dem Meret Oppenheim-Platz
- Endlich die Jubiläumsreise an den Neusiedlersee
- Zwei Reisen in der Flussebene von Rhone und Drau
- Die OGB und die Vögel der Rheinaue unterhalb Basels
- Einführungskurs in die Ornithologie
- Bibliothek 46
- Bird Race 2023 – Team «La Cage aux Folles»

Jugendgruppe BebbiBabbler
- Bird Race 2023 – Team «Bebbi Babbler»
- Nistkastenkontrolle auf dem Bruderholz

Protokoll, Mitgliederwesen und Finanzen
- Protokoll der Generalversammlung
- Jahresrechnung und Vermögensbericht
- Revisorenbericht
- Mitgliederbestand
- Freiwillige Beiträge
- Jahresbeiträge

The Distance to Reference Communities Index (DRCI): a new tool to assess communities' restoration success

Mon, 27 May 2024 15:18:01

de Hugo Fontes, Christian Marquis, Franck Torre, Patrick Grillas, Thierry Dutoit, François Mesléard
In Restoration Ecology, (Online version) (May, 2024), e14194
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

The concept of a reference ecosystem is fundamental in restoration ecology, especially in assessing the success of ecological restoration projects. In response to criticism, it has undergone conceptual evolutions in its definition and use in the last decades. Even though there is still a need to develop statistical methods and analyses to account for reference variability. Here, we focus on two original and one literature-based calculation methods for designed indexes, which all aim to compare a community to be assessed (undergoing restoration) with a variable set of reference communities. These methods either use the average reference situation (species composition and abundance) as the restoration target or on the contrary, allow any reference site to be considered a relevant target. We compare the results of these methods by analyzing a simulated dataset. We then illustrate the application of the most relevant index by a real case study that compared a created Mediterranean temporary pond to a panel of 27 reference ponds located in the south of France. The results show that the Distance to Reference Communities Index (DRCI) correctly measures differences in species composition and abundance between an assessed and a reference panel of communities. It takes into account the variability of the reference communities, while the use of other indexes focuses on unrealistic average and fixed reference values. DRCI is complementary to a detailed ecological interpretation and to the use of other commonly used indexes, by giving a synthetic metric.

Exposure of wetlands important for nonbreeding waterbirds to sea-level rise in the Mediterranean

Fri, 17 May 2024 16:11:40

de Fabien Verniest, Thomas Galewski, Olivier Boutron, Laura Dami, Pierre Defos du Rau, Anis Guelmami, Romain Julliard, Nadège Popoff, Marie Suet, Loic Willm, et al.
In Conservation Biology, 2024 (May, 2024), e14288
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

Sea-level rise (SLR) is expected to cause major changes to coastal wetlands, which are among the world's most vulnerable ecosystems and are critical for nonbreeding waterbirds. Because strategies for adaptation to SLR, such as nature-based solutions and designation of protected areas, can locally reduce the negative effects of coastal flooding under SLR on coastal wetlands, it is crucial to prioritize adaptation efforts, especially for wetlands of international importance for biodiversity. We assessed the exposure of coastal wetlands important for nonbreeding waterbirds to projected SLR along the Mediterranean coasts of 8 countries by modeling future coastal flooding under 7 scenarios of SLR by 2100 (from 44- to 161-cm rise) with a static inundation approach. Exposure to coastal flooding under future SLR was assessed for 938 Mediterranean coastal sites (≤30 km from the coastline) where 145 species of nonbreeding birds were monitored as part of the International Waterbird Census and for which the monitoring area was delineated by a polygon (64.3% of the coastal sites monitored in the Mediterranean region). Thirty-four percent of sites were threatened by future SLR, even under the most optimistic scenarios. Protected study sites and study sites of international importance for waterbirds were, respectively, 1.5 and 2 times more exposed to SLR than the other sites under the most optimistic scenario. Accordingly, we advocate for the development of a prioritization scheme to be applied to these wetlands for the implementation of strategies for adaptation to SLR to anticipate the effects of coastal flooding. Our study provides major guidance for conservation planning under global change in several countries of the Mediterranean region.

Dynamique très positive pour les laro-limicoles coloniaux méditerranéens de 2011 à 2021

Thu, 11 Jul 2024 11:57:39

de Olivier Scher, Arnaud Béchet, Christophe Pin, Thomas Blanchon, Elvin Miller, Florian Escot, Rémi Tiné, Rémi Jullian, Florian Ollivier, Dominique Clément, et al.
In Ornithos, 31(3) (Mai-Juin, 2024), 113-137

Huit espèces de laridés et de limicoles nicheurs se rencontrent le long du littoral sableux de la cóte méditerranéenne française continentale. Leur écologie est variée mais, dans Ia mesure où ils nichent en colonies mono- ou plurispécifiques sur des îlots, ils sont confrontés aux mêmes problématiques de conservation durant la saison de reproduction. Ces espèces, que nous nommons ici par convenance "laro limicoles coloniaux", rassemblent le Goéland railleur Chroicocephalus genei, la Mouette rieuse C. ridibundus, la Mouette mélanocéphale lchthyaetus melanocephalus, les Sternes pierregarin Sterna hirundo, naine Sternula albifrons, caugek Thalasseus sandyicensis, hansel Gelochelidon nilotica et l’Avocette élégante Recurvirostra avosetta. A l'exception de la Mouette rieuse, toutes sont inscrites à l’annexe I de Ia Directive Oiseaux, parmi lesquelles deux — le Goéland railleur et la Sterne hansel — ont un statut "Vulnerable" sur la liste rouge de l'UICN à l'échelle nationale. Compte tenu de l’abondance de ces oiseaux sur leur façade méditerranéenne, les régions Occitanie et Provence-Alpes-Cóte-d’Azur ont une responsabilité particulière pour leur conservation.

Human–Wild Boar Coexistence: A Role-Playing Game for Collective Learning and Conflict Mitigation

Wed, 22 May 2024 10:13:06

de Deborah Coz, Raphael Mathevet
In Sustainability, 16(9) (April, 2024), 3551
En ligne : www.mdpi.com[...]

Wild boars have become a common yet controversial species in France, where the main response to the species’ development and the problems it may cause is an increased hunting effort. However, wild boars are an extremely adaptive species, and their response to human activities (including hunting) is not fully understood. Moreover, hunting may be a source of conflict with other stakeholders and a topic for public debate, which questions its sustainability. To discuss wild boar behaviour, as well as (other) means to coexist with these animals, we developed a role-playing board game framed around wild boars and hunting. In this paper, we outline the design of the WILD BOAR(D) GAME and reflect on the first three game sessions, which we conducted in our research areas (Gorges du Gardon and Camargue Biosphere Reserves, France). We show that a continuous back and forth between the game and reality allows the participants to elicit their knowledge as well as learn from the other participants, which contributes to filling in the knowledge gaps identified previously in the game design as well as mitigating conflicts regarding wild boars. Finally, we discuss the interest of including wild boars as a role in itself to reflect on their agency.

Compte rendu ornithologique : Camargue, Crau, Alpilles, pour les années 2013 à 2018

Fri, 8 Mar 2024 16:35:40

de Yves Kayser, Thomas Blanchon, Thomas Galewski, Jocelyn Champagnon, Marc Thibault, Gregoire Massez, Christophe Pin, Nicolas Sadoul, Rémi Tiné, Jérémiah Petit, et al.
In Alauda, 92(1) (2024), 3-96

Ce 26e rapport ornithologique de Camargue s'inscrit dans la continuité d'une longue tradition commencée en 1930, peu après la création de la Réserve Botanique et Zoologique de Camargue, devenue par la suite Réserve Nationale de Camargue. L'ornithologie a toujours tenu une place importante en Camargue. Entre 1930 et 2012, 25 rapports ont été publiés. Ce rapport ornithologique couvre l'ensemble de la Camargue, de la Crau et des Alpilles et les années 2013 à 2018. La pression d'observation n'a cessé d'augmenter avec l'augmentation des données disponibles. Alors que l'édition précédente était basée sur 400 000 données d'observation, plus de 900 000 données d'observation ont été réalisées sur la période 2013 à 2018. Certains faits importants comme le déplacement de la colonie de Flamants roses Phoenicopterus roseus de l'étang du Fangassier (Salin-de-Giraud) sur les salins d'Aigues-Mortes. Ce constat est toujours lié aux difficultés de mise en eau suite au démantèlement des stations pompages ayant eu lieu après la vente progressive de 6500 ha de terrains par la Compagnie des Salins du Midi au Conservatoire du Littoral. À cela, s'est ajouté la présence régulière de prédateurs sur le site du Fangassier comme le Renard roux Vuipes vulpes ou le Grand-duc d’Europe Bubo bubo. Ces six années ont vu l’apparition de neuf nouvelles espèces sur la zone étudiée. En hivernage, une nette baisse du nombre d'Oies cendrées Anser anser été constatée avec des effectifs passant de 4800 individus en 2013 à 2400 en 2018. Les effectifs de Fuligule milouin Aythya ferina sont également en chute constante. Quant à l'hivernage du Fuligule morillon Aythya fuligula, il est pour ainsi dire devenu relictuel. Plusieurs nouvelles observations hivernales de Crabiers chevelus Ardeola ralloides ont été effectuées sur la période. Le nombre de Grues cendrées Grus grus hivernantes poursuit sa progression pour dépasser les 15000 oiseaux en 2018. Une nette baisse des effectifs nicheurs de Crabier chevelu Ardeola ralloides a été observée. L'effectif est passé de plus de 600 couples en 2014 à 189 en 2018. Il en est de même pour le Héron cendré Ardea cinerea qui voit le nombre de nicheurs passer de 793 couples en 2014 à 418 en 2018. En revanche, certaines espèces comme le Grand Cormoran Phalacrocorax carbo, la Spatule blanche Platalea leucorodia ou la Cigogne blanche Ciconia ciconia montrent des augmentations progressives du nombre de reproducteurs et d’autres, comme l'Ibis falcinelle Plegadis faicinellus continue leur progression spectaculaire. La Talève sultane Porphyrio porphyrio est à nouveau présente dans bon nombre de marais d’eau douce suite à la vague de froid de 2012 qui avait nettement freiné son expansion. Il a été constaté en Crau un fort taux de consanguinité chez le Ganga cata Pterocles alchata induisant un nombre de jeunes peu élevé survivant au premier hiver. La Glaréole à collier Glareola pratincola se maintient autour de 70 couples chaque année, par contre, un nombre important de jeunes a été élevé en 2017 (1,9 jeune à l'envoi par couple). Chez les laro-limicoles coloniaux de Camargue, la baisse du nombre de nicheurs continue chez le Goéland leucophée Larus michahellis alors que l'Avocette élégante Recurvirostra avosetta, le Goéland railleur Chroicocephalus genei et la Sterne naine Sternula albifrons ont connu des effectifs records depuis 1956. L’Aigle de Bonelli Aquila fasciata a connu une très mauvaise année de nidification en 2018 avec aucun jeune à l'envol. Durant les périodes hivernales et migratoires, il a été mis en évidence une très forte augmentation du nombre de données concernant le Busard pâle Circus macrourus et le Pouillot à grands sourcils Phylloscopus inornatus. Les observations de Pouillot sibérien Phyloscopus collybita tristis ont aussi augmenté. Enfin, une très forte hausse du nombre de contacts (tant au niveau des sites où l'espèce est présente qu'à celui du nombre de données) a été enregistrée chez le Bruant proyer Emberiza calandra en période de nidification.

92(1) - 2024 - Camargue, Crau-Alpilles : compte-rendu ornithologique pour les années 2013-2018 (Bulletin de Alauda)

Fri, 8 Mar 2024 16:29:15

Camargue, Crau-Alpilles : compte-rendu ornithologique pour les années 2013-2018
Bulletin de Alauda, 92(1) (2024)

Ce 26e rapport ornithologique de Camargue s'inscrit dans la continuité d'une longue tradition commencée en 1930, peu après la création de la Réserve Botanique et Zoologique de Camargue, devenue par la suite Réserve Nationale de Camargue. L'ornithologie a toujours tenu une place importante en Camargue. Entre 1930 et 2012, 25 rapports ont été publiés.
Ce rapport ornithologique couvre l'ensemble de la Camargue, de la Crau et des Alpilles et les années 2013 à 2018. La pression d'observation n'a cessé d'augmenter avec l'augmentation des données disponibles. Alors que l'édition précédente était basée sur 400 000 données d'observation, plus de 900 000 données d'observation ont été réalisées sur la période 2013 à 2018. Certains faits importants comme le déplacement de la colonie de Flamants roses Phoenicopterus roseus de l'étang du Fangassier (Salin-de-Giraud) sur les salins d'Aigues-Mortes. Ce constat est toujours lié aux difficultés de mise en eau suite au démantèlement des stations pompages ayant eu lieu après la vente progressive de 6500 ha de terrains par la Compagnie des Salins du Midi au Conservatoire du Littoral. À cela, s'est ajouté la présence régulière de prédateurs sur le site du Fangassier comme le Renard roux Vuipes vulpes ou le Grand-duc d’Europe Bubo bubo. Ces six années ont vu l’apparition de neuf nouvelles espèces sur la zone étudiée. En hivernage, une nette baisse du nombre d'Oies cendrées Anser anser été constatée avec des effectifs passant de 4800 individus en 2013 à 2400 en 2018. Les effectifs de Fuligule milouin Aythya ferina sont également en chute constante. Quant à l'hivernage du Fuligule morillon Aythya fuligula, il est pour ainsi dire devenu relictuel. Plusieurs nouvelles observations hivernales de Crabiers chevelus Ardeola ralloides ont été effectuées sur la période. Le nombre de Grues cendrées Grus grus hivernantes poursuit sa progression pour dépasser les 15000 oiseaux en 2018. Une nette baisse des effectifs nicheurs de Crabier chevelu Ardeola ralloides a été observée. L'effectif est passé de plus de 600 couples en 2014 à 189 en 2018. Il en est de même pour le Héron cendré Ardea cinerea qui voit le nombre de nicheurs passer de 793 couples en 2014 à 418 en 2018. En revanche, certaines espèces comme le Grand Cormoran Phalacrocorax carbo, la Spatule blanche Platalea leucorodia ou la Cigogne blanche Ciconia ciconia montrent des augmentations progressives du nombre de reproducteurs et d’autres, comme l'Ibis falcinelle Plegadis faicinellus continue leur progression spectaculaire. La Talève sultane Porphyrio porphyrio est à nouveau présente dans bon nombre de marais d’eau douce suite à la vague de froid de 2012 qui avait nettement freiné son expansion. Il a été constaté en Crau un fort taux de consanguinité chez le Ganga cata Pterocles alchata induisant un nombre de jeunes peu élevé survivant au premier hiver. La Glaréole à collier Glareola pratincola se maintient autour de 70 couples chaque année, par contre, un nombre important de jeunes a été élevé en 2017 (1,9 jeune à l'envoi par couple). Chez les laro-limicoles coloniaux de Camargue, la baisse du nombre de nicheurs continue chez le Goéland leucophée Larus michahellis alors que l'Avocette élégante Recurvirostra avosetta, le Goéland railleur Chroicocephalus genei et la Sterne naine Sternula albifrons ont connu des effectifs records depuis 1956. L’Aigle de Bonelli Aquila fasciata a connu une très mauvaise année de nidification en 2018 avec aucun jeune à l'envol. Durant les périodes hivernales et migratoires, il a été mis en évidence une très forte augmentation du nombre de données concernant le Busard pâle Circus macrourus et le Pouillot à grands sourcils Phylloscopus inornatus. Les observations de Pouillot sibérien Phyloscopus collybita tristis ont aussi augmenté. Enfin, une très forte hausse du nombre de contacts (tant au niveau des sites où l'espèce est présente qu'à celui du nombre de données) a été enregistrée chez le Bruant proyer Emberiza calandra en période de nidification.

Relationship between wintering site and survival in a migratory waterbird using different migration routes

Thu, 29 Feb 2024 17:03:41

de Hugo Rafael Soares Ferreira, Jocelyn Champagnon, José A. Alves, Tamar Lok
In Oecologia, February (February, 2024)
En ligne : doi.org[...]

When wintering at different sites, individuals from the same breeding population can experience different conditions, with costs and benefits that may have implications throughout their lifetime. Using a dataset from a longitudinal study on Eurasian Spoonbills from southern France, we explored whether survival rate varied among individuals using different wintering sites. In the last 13 years, more than 3000 spoonbills have been ringed as chicks in Camargue. These birds winter in five main regions that vary in both migratory flyway (East Atlantic vs. Central European) and migration distance (long-distance vs. short-distance vs. resident). We applied Cormack–Jolly–Seber models and found evidence for apparent survival to correlate with migration distance, but not with flyway. During the interval between the first winter sighting and the next breeding period, long-distance migrants had the lowest survival, independently of the flyway taken. Additionally, as they age, spoonbills seem to better cope with migratory challenges and wintering conditions as no differences in apparent survival among wintering strategies were detected during subsequent years. As dispersal to other breeding colonies was rarely observed, the lower apparent survival during this period is likely to be partly driven by lower true survival. This supports the potential role of crossing of natural barriers and degradation of wintering sites in causing higher mortality rates as recorded for a variety of long-distance migrants. Our work confirms variation in demographic parameters across winter distribution ranges and reinforces the importance of longitudinal studies to better understand the complex demographics of migratory species.

On the need and difficulty of evaluating management strategies improving species persistence

Fri, 1 Mar 2024 15:22:39

de Elie Gaget, Thomas Galewski, Jon E. Brommer, Isabelle Le Viol, Frédéric Jiguet, Nicola Baccetti, Tom Langendoen, Blas Molina, Filipe Moniz, Caroline Moussy, et al.
In Animal Conservation, 27(1) (February, 2024), 21-22
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

Discussion élargie sur les besoins d'évaluer les mesures de gestion favorisant la persistance des espèces, mais aussi des difficultés à mettre en place de telles évaluations sur les canards.

Managed as wild, horses influence grassland vegetation differently than domestic herds

Thu, 8 Feb 2024 11:47:00

de Clémentine Mutillod, Elise Buisson, Laurent Tatin, Gregory Mahy, Marc Dufrene, François Mesléard, Thierry Dutoit
In Biological Conservation, 290 (January, 2024), 110469
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

The urgent need to preserve ecosystems over vast areas has placed rewilding with wild herbivores to the forefront. However, there are still few scientific experimental field studies dealing with its effects on biodiversity and ecosystem services. Since 1993, in France, a socially natural population of wild horses (Equus ferus przewalskii) has been managed for its conservation. This introduction is an opportunity to compare this new management system with the multi-secular extensive sheep breeding and the more recent conventional domestic horse breeding. We sought to discover if plant communities show differences depending on the grazers and the managing system. We surveyed 208 plots divided into six grazed sites (two sites per type of grazer), where all plants species and their percent cover were listed within 1m², and environmental variables – such as stones percent cover, slope - were measured within 100m². To focus on the grazer effects, we used a subsample of plots with similar environmental variables. To study the grazing system - management choices - effects, we ran the analyses using all the plots. At both scales, our results show that species richness, evenness and heterogeneity are significantly higher with wild horses than with sheep grazing. Intermediate value is measured for evenness concerning domestic horses at the grazing system scale. Species richness is significantly higher for domestic horses than sheep focusing on the grazer; intermediate values are measured for evenness and heterogeneity. At both scales, wild horses also favour dicots rather than monocots. Our results indicate that grazing by horses maintains and promotes grassland diversity, especially when horses are managed ‘as wild’ - allowing them to express their natural behaviour. However, further studies are needed focusing on populations of patrimonial plant species over time, other taxonomical groups and/or on functional diversity and ecosystem services to compare and test more finely the effects of an animal bred extensively and ‘as wild’.

Habitat management favouring hunted waterbird species prevents distribution changes in response to climate warming

Mon, 10 Apr 2023 18:04:06

de Elie Gaget, Thomas Galewski, J. E. Brommer, Isabelle Le Viol, F. Jiguet, N. Baccetti, T. Langendoen, B. Molina, F. Moniz, C. Moussy, et al.
In Animal Conservation, 27(1) (February, 2024), 5-16
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

Climate warming is driving species to shift their geographical distribution poleward to track suitable climatic conditions. Two strategies have been suggested to help species respond to climate warming: facilitating distribution change or improving persistence. We questioned whether habitat management in favour of duck hunting activities interacted with duck responses to climate warming. We studied non-breeding waterbird community changes (110 species) over 28 years at 851 sites in South-West Europe, where habitat management is a common practice to attract and hunt ducks. We hypothesized that duck species targeted by habitat management do not need to track temperature changes as much as non-hunted species, because of the availability of suitable habitats provided by hunting land managers. We used the community temperature index (CTI) to assess the temporal responses of communities and species to climate warming. We compared the effect of hunting status with other functional traits on species responses, controlling for phylogenetic relatedness. The CTI trend has increased over the study period, indicating a community adjustment to climate warming. However, hunted ducks contributed to almost 40% of the negative contributions to this community adjustment, suggesting that hunted ducks do not shift their distribution as much as the other waterbirds do. Winter fidelity associated with the provision of attractive feeding grounds might explain why ducks did not seem to shift their distribution in response to climate warming. This study suggests the broad impact of human activities on wildlife, including on large-scale distribution processes, and questions the long-term consequences on duck populations.

Plan de gestion 2024-2033 Réserve Naturelle Régionale de la Tour du Valat (2024)

Fri, 2 Oct 2026 15:01:29

de Noémie Nojaroff, Damien Cohez
Arles : Tour du Valat, 2024, 157

Le présent plan de gestion est le 7e document de ce type, et fait suite au plan de gestion 2016-2020 et à la notice de gestion intermédiaire 20212023. Il couvre la période 2024-2033, soit 10 ans, contrairement aux plans de gestion précédents qui étaient élaborés pour 5 ans.
Ce plan de gestion est constitué d’un volume unique découpé en 3 parties :
- Partie 1 : Synthèse du diagnostic du site
- Partie 2 : Gestion du site
- Partie 3 : Plan de travail
Il couvre la Réserve naturelle régionale de la Tour du Valat (2164 ha) ainsi que les terrains limitrophes également propriété de la Fondation Tour du Valat et non classés en RNR (665 ha). L’ensemble de ces terrains (2829 ha) est regroupé sous la dénomination « Domaine de la Tour du Valat ».

Projet : Restauration écologique des zones humides : convention n°22043 (2024)

Wed, 25 Mar 2026 13:21:58

de Florence Daubigney, Hugo Fontes, Philippe Lambret, Delphine Nicolas, Anthony Olivier, Olivier, Loic Willm
Arles : Tour du Valat, 2024, 115

A retenir :
- Restauration des sites du Cassaïre et de la Petite Forêt en Camargue
- Restauration de zones humides dégradées et conservation de Lestes macrostigma et autres libellules menacées
- Evaluation de deux projets de restauration de continuité hydroécologique intra-lagunaire avec l’anguille européenne, espèce emblématique et menacée

Gestion du site des étangs et marais des salins de Camargue. Bilan des activités de la Tour du Valat. Année 2023 (2024)

Fri, 12 Sep 2025 16:13:36

de Tour du Valat
Arles (FRA) : Tour du Valat, 2024, 57

Croissance de l'anguille européenne en milieu lagunaire méditerranéen : comparaison inter-habitats de la démographie, des tactiques d'utilisation de l'habitat et de la condition des futurs géniteurs (2024)

Mon, 24 Mar 2025 15:52:53

de Amélie Hoste
Aix-Marseille : Aix-Marseille Université, 2024, 279
En ligne : theses.fr[...]

L'anguille européenne (Anguilla anguilla) est une espèce panmictique au cycle de vie complexe, se reproduisant en mer et grandissant dans les eaux continentales, sur une vaste zone allant des côtes nord-africaines au nord de l'Europe. Comme d'autres poissons migrateurs diadromes, elle est confrontée à de multiples menaces. Depuis les années 1980, son recrutement a chuté de plus de 95 %. Classée en danger critique d'extinction, l'anguille bénéficie depuis 2007 d'un règlement européen visant à reconstituer son stock, avec notamment des mesures axées sur l'augmentation du nombre d'anguilles argentées, futurs reproducteurs. Une meilleure compréhension de la croissance de l'anguille durant sa phase continentale est cruciale, car c'est à ce stade que des mesures de gestion efficaces peuvent être appliquées. Lors de cette phase, l'anguille peut coloniser une grande diversité d'habitats que ce soit entre individus ou pour un même individu, illustrant sa remarquable plasticité phénotypique. En effet, les traits d'histoire de vie de l'anguille varient en fonction des conditions environnementales. Des tendances générales montrent une croissance plus rapide de l'anguille dans le sud de son aire de répartition, ainsi que dans les milieux saumâtres comparés à ceux d'eau douce. La majorité des études sur la croissance de l'anguille s'est concentrée sur les milieux d'eau douce, saumâtres ou marins de la façade atlantique, laissant les écosystèmes méditerranéens largement sous-étudiés. Les milieux lagunaires méditerranéens, qui favorisent la croissance rapide de l'anguille et possèdent un potentiel élevé de production de futurs géniteurs, joueraient un rôle essentiel dans la reconstitution du stock mondial. Au sein de ces milieux, la diversité des habitats présents, allant d'oligohalins à hyperhalins, contribue à l'expression d'une grande variabilité des traits d'histoire de vie de l'anguille. Cette thèse explore la croissance de l'anguille à l'intérieur d'un complexe lagunaire méditerranéen, le delta du Rhône (France), en étudiant l'influence du type d'habitat sur la production d'anguilles argentées, en termes de quantité et de qualité, et en examinant les tactiques d'utilisation de l'habitat par l'anguille durant sa croissance. Ces travaux se sont basés sur une variété de méthodes dont la modélisation, la schlérochronologie, les quantifications microchimiques, et les analyses écotoxicologiques et épidémiologiques. Cette approche multidisciplinaire a montré l'existence de sous-populations distinctes en termes d'abondance, de sex-ratio et de traits d'histoire de vie, avec une forte variabilité entre et au sein des sites étudiés. L'étang du Vaccarès, une lagune mésohaline à euhaline, semble offrir les meilleures conditions pour la production d'anguilles argentées, en bonne condition corporelle, un taux de croissance élevé, un âge à l'argenture précoce et une abondance significative en faveur des mâles. En revanche, les anguilles du canal d'eau douce du Fumemorte montrent les taux de croissance et les abondances les plus faibles avec un sex-ratio en faveur des femelles, mais des taux de survie élevés. La diversité des habitats dans le complexe lagunaire de Camargue apparaît essentielle pour maintenir la variabilité des traits d'histoire de vie de l'anguille. Certains habitats propices à la croissance de l'anguille sont fortement pollués, entraînant une contamination des individus, et souligne l'urgence d'améliorer la qualité de l'eau. Les connaissances acquises offrent une base de référence pour envisager des actions visant à améliorer la production d'anguilles en bonne condition corporelle et sanitaire, tout en tenant compte des spécificités des types d'habitat.

Apport des études en écologie des communautés d’oiseaux à la conservation des zones humides Méditerranéennes (2024)

Mon, 13 Jan 2025 10:32:19

de Thomas Galewski
Tour du Valat, Arles : Université de Montpellier, école doctorale Gaïa, 2024, 250

L’axe de recherche, que l'auteur coordonne et qu'il présente dans les chapitres suivants, cherche à étudier la réponse de la biodiversité des zones humides méditerranéennes aux facteurs de changement. La première tâche a été d’identifier un modèle biologique bénéficiant d’un suivi sur le long terme et sur l’ensemble du bassin méditerranéen, qui soit intimement lié aux zones humides et qui présente un intérêt pour la conservation. Le choix s’est porté sur les oiseaux.
Dans le Chapitre 2, Thomas Galewski présente comment les recherches menées avec ses étudiants ont permis à l’OZHM d’améliorer l’utilisation d’indices multispécifiques pour estimer l’état de conservation et les tendances de la biodiversité des zones humides méditerranéennes, et comment, à l’échelle locale, ils ont pu mieux gérer deux contraintes inhérentes à l’utilisation de ces indices, à savoir des données hétérogènes entre espèces d’une même communauté et un état de référence trop récent.
Le Chapitre 3 illustre comment ils ont cherché à mieux comprendre les mécanismes d’impact de deux pressions majeures pour la biodiversité des zones humides méditerranéennes à savoir les changements d’usage des sols et le changement climatique. A l’échelle de la Camargue, ils se sont plus particulièrement intéressés à l’intensification des systèmes rizicoles, une culture majeure dans les zones humides méditerranéennes. A l’échelle méditerranéenne, ils se sont intéressés à l’impact du changement climatique mais également à l’impact de l’interaction entre changement climatique et changements d’usage des sols sur la capacité des communautés d’oiseaux d’eau à répondre aux changements en cours. Ces résultats ont permis de mieux identifier certains des leviers qui permettraient de conserver ou restaurer les communautés d’oiseaux et leurs habitats.
Dans le Chapitre 4, ils évaluent le rôle des politiques publiques dans la conservation des oiseaux d’eau hivernants en Méditerranée. Ils ont d’abord cherché à mesurer l’efficacité du réseau d’aires protégées par la Convention de Ramsar et/ou de certains accords internationaux pour améliorer l’état de conservation des oiseaux et permettre leur ajustement au changement climatique. Puis ils ont évalué les lacunes dans le réseau d’aires protégées actuel, y compris pour relever les défis de demain, un travail qui pourrait aider à orienter les futures politiques de conservation.

De l’exposition aux contaminants à l’évaluation des effets chez la Cistude d’Europe (Emys orbicularis) : le cas des pesticides et des éléments traces métalliques (2024)

Mon, 6 Jan 2025 15:32:54

de Leslie-Anne Merleau
Paris : Ecole pratique des hautes études, 2024, 1 vol. (398 p.)

Les zones humides (ZH) abritent une biodiversité très riche mais font face à de nombreuses menaces dont la pollution. Les pesticides et les éléments traces métalliques (ETM) peuvent atteindre les ZH, cependant la contamination des vertébrés en milieu naturel reste insuffisamment étudiée en regard du risque de déclin des populations. La sous-évaluation des effets de ces contaminants est particulièrement manifeste pour les reptiles aquatiques, un des taxons les moins étudiés en écotoxicologie, et pourtant l’un des plus menacés. En France, la Cistude d’Europe (Emys orbicularis) est une espèce native de tortue dulçaquicole en déclin, présente dans plusieurs régions à forte pression agricole. L’objectif central de la thèse est de comprendre l’exposition aux pesticides et aux ETM et leurs effets chez quinze populations de Cistudes dans trois régions de France (Camargue, Nouvelle-Aquitaine et Brenne). Grâce à deux types d’approches, longitudinale et transversale, nous avons (1) quantifié une grande diversité de molécules dans l’environnement et une importante contamination plasmatique à la bentazone (herbicide) en Camargue, pour laquelle l’eau semblait la voie d’exposition majeure ; (2) détecté d’importantes variations spatiales au niveau inter et intra-régional dans la contamination des individus par les pesticides, ainsi qu’une forte variabilité temporelle de cette contamination, saisonnière et annuelle, alors que cette variabilité spatio-temporelle était modérée pour les ETM ; (3) déterminé que les caractéristiques individuelles (sexe, taille, âge) expliquaient de façon importante les niveaux sanguins d’ETM mais pas de pesticides ; et enfin (4) exploré des réponses physiologiques qui ont révélé un lien entre pesticides environnementaux et profil leucocytaire ainsi qu’entre niveaux sanguins d’ETM et stress oxydant et neurotoxicité. L’étude de ces réponses physiologiques, en particulier au niveau immunitaire, devra être approfondie pour mieux appréhender les impacts des contaminations observées. La poursuite des suivis à long terme sera par ailleurs nécessaire pour évaluer les effets populationnels de ces contaminations. Les zones humides (ZH) abritent une biodiversité très riche mais font face à de nombreuses menaces dont la pollution. Les pesticides et les éléments traces métalliques (ETM) peuvent atteindre les ZH, cependant la contamination des vertébrés en milieu naturel reste insuffisamment étudiée en regard du risque de déclin des populations. La sous-évaluation des effets de ces contaminants est particulièrement manifeste pour les reptiles aquatiques, un des taxons les moins étudiés en écotoxicologie, et pourtant l’un des plus menacés. En France, la Cistude d’Europe (Emys orbicularis) est une espèce native de tortue dulçaquicole en déclin, présente dans plusieurs régions à forte pression agricole. L’objectif central de la thèse est de comprendre l’exposition aux pesticides et aux ETM et leurs effets chez quinze populations de Cistudes dans trois régions de France (Camargue, Nouvelle-Aquitaine et Brenne). Grâce à deux types d’approches, longitudinale et transversale, nous avons (1) quantifié une grande diversité de molécules dans l’environnement et une importante contamination plasmatique à la bentazone (herbicide) en Camargue, pour laquelle l’eau semblait la voie d’exposition majeure ; (2) détecté d’importantes variations spatiales au niveau inter et intra-régional dans la contamination des individus par les pesticides, ainsi qu’une forte variabilité temporelle de cette contamination, saisonnière et annuelle, alors que cette variabilité spatio-temporelle était modérée pour les ETM ; (3) déterminé que les caractéristiques individuelles (sexe, taille, âge) expliquaient de façon importante les niveaux sanguins d’ETM mais pas de pesticides ; et enfin (4) exploré des réponses physiologiques qui ont révélé un lien entre pesticides environnementaux et profil leucocytaire ainsi qu’entre niveaux sanguins d’ETM et stress oxydant et neurotoxicité. L’étude de ces réponses physiologiques, en particulier au niveau immunitaire, devra être approfondie pour mieux appréhender les impacts des contaminations observées. La poursuite des suivis à long terme sera par ailleurs nécessaire pour évaluer les effets populationnels de ces contaminations.

Gestion des marais chassés de Camargue. Savoirs pratiques & scientifiques (2024)

Tue, 3 Dec 2024 14:03:33

de Francois Cavallo, Jocelyn Champagnon, Matthieu Guillemain, Anthony Olivier, Claire Tetrel, Raphael Mathevet
Paris : Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), 2024, 103
En ligne : ofb.hal.science[...]

La chasse en Camargue tient une place singulière dans la gestion des milieux. Elle détermine largement leur état de conservation, ainsi que celui des nombreuses espèces qu’ils abritent. Les marais chassés, qu’ils soient protégés ou non, contribuent largement à la préservation du patrimoine naturel et culturel du grand delta du Rhône. Au-delà des controverses sur les pratiques de gestion ou les niveaux de prélèvements, cet ouvrage est le fruit d’un dialogue soutenu lors d’une série de visites de terrain en 2024 entre des gestionnaires de territoires de chasse ou d’espaces naturels protégés, des experts et des chercheurs. À partir de leurs expériences respectives et de données scientifiques, ce livret souhaite apporter, à tous gestionnaires – ou personnes désireuses de mieux apprécier les enjeux et aspects techniques – des principes de gestion des principaux habitats du grand delta du Rhône et des espèces invasives. Ce livret montre qu’il y a autant de marais différents que de pratiques de gestion, autant de trajectoires historiques que d’héritages écologiques et de choix de gestion possibles qui demandent désormais de prendre en compte le dérèglement climatique et l’érosion de la biodiversité.

Suivi de la reproduction de la Glaréole à collier : année 2024 (2024)

Wed, 27 Nov 2024 16:25:27

de Yves Kayser
Le Sambuc, Arles : Tour du Valat, 2024, 19

2024 a été une année exceptionnelle pour la reproduction de la Glaréole à collier en Camargue malgré un début d’année difficile du fait des précipitations. La Glaréole à collier est une espèce en danger qui niche au sol surtout dans les marais asséchés ou les labours, ce qui fait qu’elle est particulièrement vulnérable à la submersion d’origine naturelle ou anthropique. 223 couples se sont reproduits cette année en Camargue au sein de 11 colonies, c’est le plus important effectif de couples jamais répertorié depuis le début du suivi en 2000 (maximum de 130 couples en 2022). Il est suggéré que les conditions hivernales en Afrique subsaharienne ont été à l’origine du nombre important d’individus présents cette année, et que les mesures de protection mises en place en Camargue ont permis leur installation.

Suivi temporel de l'écologie trophique du silure glane et de l'anguille européenne dans un canal de drainage en Camargue. Analyses isotopiques de janvier 2017 à janvier 2019 (2024)

Fri, 18 Oct 2024 09:55:39

de Camille Musseau, Pascal Contournet, Stéphane Mutel, S Nahon, Delphine Nicolas
Le Sambuc, Arles : Tour du Valat, 2024, 37
En ligne : hal.science[...]

Le silure glane (Silurus glanis) est un top prédateur introduit dans de nombreux cours d’eau et lacs français à des fins récréatives depuis les années 1970. L’introduction de ce prédateur opportuniste de grande taille, ayant un très large spectre de proies, soulève des questions quant à son impact sur les espèces natives. Cette étude examine le régime alimentaire et les interactions trophiques du silure glane dans un canal du sud de la France, en particulier avec un autre top prédateur, l'anguille européenne, une espèce native et en danger critique d’extinction (Anguilla anguilla). Durant deux années consécutives (de janvier 2017 à janvier 2019), ces deux espèces et leurs proies potentielles, notamment les écrevisses de Louisiane, les poissons d'eau douce et les poissons saumâtres, ont été échantillonnées à chaque saison. Les tissus des prédateurs et des proies potentielles ont été échantillonnés afin d’étudier le réseau trophique grâce aux analyses des isotopes stables du carbone (δ13C) et de l’azote (δ15N). La variabilité saisonnière des niches isotopiques (tailles et chevauchements) et des régimes alimentaires du silure et de l’anguille ont été particulièrement étudiés. L’utilisation de modèles de mélange bayésiens ont été utilisés pour estimer les quantités relatives de proies consommées. Les résultats de cette étude mettent en évidence une forte variabilité saisonnière et ontogéniques pour le régime alimentaire du silure. Les plus grands individus consomment plus d'espèces de poissons saumâtres. Une forte compétition intra-spécifique, c’est-à-dire entre les classes de taille (<30 cm ; 31-50 cm ; 51-80 cm et >80 cm), a été observée. A ce stade, cette étude ne montre pas un effet de prédation significatif du silure sur l'anguille européenne. Un chevauchement de niche substantiel (> 80%) indique que les deux prédateurs consomment souvent préférentiellement les mêmes proies, en particulier l’écrevisse de Louisiane (Procambarus clarkii). Notre étude souligne l'importance de comprendre les interactions trophiques intra- et inter-spécifiques sur le long terme pour mieux prédire les répercussions de l’introduction de nouvelles espèces.

Mise en place et calibration d’un modèle XBeach : modélisation d’overwash sur un littoral restauré (2024)

Fri, 18 Oct 2024 09:55:34

de Thomas Faraon
[S.l.] : Université de Montpellier, 2024, 35

La restauration des écosystèmes côtiers, tels que le littoral camarguais, nécessite une compréhension fine des dynamiques sédimentaires et des processus hydrodynamiques. Ce mémoire présente la mise en place et la calibration du modèle XBeach pour simuler l’ ́évolution d’un littoral restauré et évaluer les effets des phénomènes d’overwash face aux tempêtes. Ce travail illustre le processus de calibration permettant d’obtenir des projections fiables des scénarios d’ évolution littorale. Bien que XBeach possède des limites numériques, il s’avère particulièrement adapté pour modéliser des évènements extrêmes. L’ ́etude met en ́evidence la nécessité de disposer de nombreuses données de calibration et de validation, qui font actuellement défaut. Des campagnes d’acquisition de données in-situ supplémentaires seraient nécessaires pour valider pleinement le modèle. Les résultats obtenus offrent des perspectives intéressantes pour la gestion et la protection des littoraux face aux changements climatiques et aux tempêtes.

Suivi de la macrofaune benthique et évaluation de l’état écologique des milieux lagunaires des étangs et marais des salins de Camargue (2024)

Fri, 18 Oct 2024 09:55:30

de Flavien Jouan
[S.l.] : Université Lumière, Lyon 2, 2024, 71

Les lagunes sont des écosystèmes fragiles et importants pour leurs nombreux services écosystémiques. La transformation de ces milieux en exploitation salicole a, selon le concept de confinement, pour conséquence la création d’un milieu paralique confiné. Ces altérations résultant des aménagements et de la gestion pour la production de sel, engendrent des dégradations de l’état écologique des milieux. Dans l’objectif de l’atteinte du bon état des masses d’eau de la DCE, il est important de restaurer ces milieux et de les évaluer. L’évaluation des milieux lagunaires, des étangs et marais des salins de Camargue s’effectue notamment en utilisant les indices AMBI et M-AMBI, indicateurs de la pollution des milieux côtiers, qui s’appuient sur les macroinvertébrés benthiques. La réalisation de l’étude pour quatre étangs du site des EMSC, qui sont Beauduc, Sablons, Rascaillan et Galabert, montre que les modifications apportées par la dynamique littorale jouent au moins à court terme un rôle très positif dans la restauration, car les Sablons et Beauduc ont des états écologiques en Bon ou Très Bon état. Leur communauté est en constante évolution, ce qui est normal considérant que l’écosystème lagunaire, en particulier en domaine climatique méditerranéen est par définition très instable. Les états écologiques mesurés pour les étangs de Galabert et Rascaillan ne montrent quant à eux pas d’évolution majeure dans leurs peuplements. D’après les indices AMBI et M-AMBI mesurés, leurs classes d’états écologiques sont maintenues à des niveaux pauvres, ce qui indique un milieu pollué. La salinité reste cependant le facteur principal expliquant cet état écologique. Ainsi, les travaux de restauration active n’auront pas permis de mettre en évidence leur succès pour cette année 2024, ce résultat va dans la continuité des précédentes campagnes d’échantillonnage. Finalement, le projet de restauration écologique s’inscrit sur un temps long, il est tout de même difficile d’assister à des changements significatifs dans les communautés, surtout lorsque le milieu a subi des périodes de sursalure et d’assèchement plusieurs années de suite, après les travaux visant à restaurer les habitats. Les étangs du sud des anciens salins ne nécessitent pas de nouvelles actions. Pour les étangs de Rascaillan et Galabert, il est prioritaire de trouver des solutions permettant un meilleur équilibre entre eau salée et eau douce, en veillant à la conservation de la qualité physico-chimique.

Conception d'une représentation numérique et spatialisée pour la modélisation intégrée de l'île de Camargue (2024)

Fri, 18 Oct 2024 09:55:26

de Aurore Moulin
[S.l.] : Université de Montpellier / Montpellier SupAgro, 2024, 43

L’Ile de Camargue est caractérisée par l’interdépendance hydrologique entre les milieux naturels et agricoles, avec l’irrigation artificielle qui s’est développée depuis l’endiguement de ce delta méditerranéen au 19ème siècle. Mais ce système socio-écologique fait face à des changements climatiques et des évolutions de pratiques agricoles qui influencent la gestion de l’eau. Il est alors nécessaire d’anticiper leurs impacts sur la durabilité des activités et des ressources pour garantir l’adaptabilité du territoire. La modélisation intégrée permet de considérer les interactions entre composantes d’un socio-écosystème, pour tester des scénarios prospectifs et révéler des tendances. Nous avons donc conçu un outil de modélisation numérique et spatialisé capable d’intégrer la complexité de l’Ile de Camargue. Cette représentation de la zone d’étude servira de référence pour modéliser les conséquences des changements climatiques, agricoles, et hydrologiques et ainsi favoriser une gestion adaptative de l’eau en Camargue.

Intelligence artificielle appliquée à la détection d’individus chez des populations ornithologiques (2024)

Fri, 27 Sep 2024 10:04:45

de Tom Bourbon
[S.l.] : Ecole des mines de Saint-Etienne, 2024, 35

Ce rapport porte sur l’application de l’intelligence artificielle, plus particulièrement la computer vision, dans le domaine de la conservation des zones humides méditerranéennes, au sein de l'institut de recherche de La Tour du Valat. En effet, celui-ci utilise des images satellites et des caméras pour collecter des données sur l'évolution des écosystèmes, mais l'analyse des images reste majoritairement manuelle. Le projet de stage visait à automatiser ce processus à l'aide de technologies d'apprentissage automatique, en développant un système capable d'analyser ces images visuelles.
L'auteur du rapport a travaillé sur l’ensemble du processus, depuis la récupération et la labellisation des données, jusqu’à l'entraînement des modèles d'intelligence artificielle et leur optimisation. Le projet lui a permis de comprendre les différentes étapes nécessaires à la mise en place d’un système intelligent, y compris son déploiement via une interface logicielle. Grâce à ce travail, l'institut pourrait à terme améliorer l'efficacité de l'analyse de données environnementales en s'appuyant sur des outils d'IA performants et automatisés.

Milieux humides littoraux méditerranéens face au changement climatique : quelles connaissances et actions de préservation pour une gestion adaptative ? (2024)

Fri, 14 Jun 2024 15:05:35

de Office de l’Environnement de la Corse
Corte : Office de l’Environnement de la Corse, 2024, 9
En ligne : pole-lagunes.org[...]

Dans le bassin méditerranéen, l’évolution du climat est déjà une réalité très concrète. Demain elle le sera plus encore, alertent les experts. Comment les bouleversements annoncés – réduction des cumuls de pluie, réchauffement, élévation du niveau de la mer – vont-ils se traduire pour les lagunes et les zones humides littorales, leurs écosystèmes et les services qu’elles nous offrent ? Quelles trajectoires de gestion faut-il envisager, avec quels outils, pour atténuer les impacts écologiques et sociétaux sur ces milieux ? La 8ème plateforme « Recherche-Gestion » de l’Office de l’Environnement de la Corse et du Pôle-relais lagunes méditerranéennes, centrée sur ces questions cruciales, a alimenté les réflexions, le temps d’une journée d’échanges.
La journée, répondant à une attente forte des participants des précédentes plateformes, a d’abord proposé un état des lieux des connaissances sur le changement climatique en cours et à venir en zone méditerranéenne, et ses implications possibles sur le fonctionnement des lagunes. Outre un bilan d’étape des outils disponibles et des projets de recherche en cours, visant à préciser les impacts à venir du changement climatique sur l’hydrologie des lagunes, elle a élargi la discussion aux dimensions politiques et sociétales de la gestion de ces systèmes complexes, et ouvert quelques pistes opérationnelles pour la co-construction de leur avenir dans un contexte marqué par l’incertitude.

Les dénombrements et le baguage des oiseaux (2024)

Fri, 14 Jun 2024 10:09:06

de Jocelyn Champagnon
Le Sambuc, Arles : Tour du Valat, 2024, 97

L'érosion de la biodiversité a conduit à l'émergence des sciences de la conservation il y a une quarantaine d’années. Ce domaine de recherche scientifique interdisciplinaire vise à fournir les fondements nécessaires pour enrayer la perte de biodiversité. Dans une première partie, l'auteur présente comment deux activités de recherche, les dénombrements et le baguage, contribuent aux enjeux de conservation des oiseaux. Pour cela, il développe, selon trois axes, plusieurs travaux auxquels il a participé relatifs à : 1) l’évaluation de la tendance des populations et l’importance de prendre en compte statistiquement les biais d’observations; 2) l’identification des menaces qui pèsent sur les populations ; 3) des propositions pour inverser la tendance au déclin ou des tests de pratiques de gestion pour conserver les espèces d’oiseaux. Même si les sciences de la conservation ont conduit à des résultats notables, elles n’ont cependant pas réussi à atteindre l’objectif d’inverser la tendance au déclin de la biodiversité. Face à ce constat, l'auteur s’interroge, dans une deuxième partie, sur le rôle que le chercheur peut jouer pour agir en faveur de la biodiversité. Il y présente des activités de recherche-action développées avec les parties prenantes, de communication auprès de publics ciblés, ou de participation à des groupes d’experts afin de conseiller les décisionnaires. Enfin, il conclut sur les axes de recherche qu'il développera à moyen terme, en particulier pour la conservation des oiseaux d’eau et leurs habitats en Afrique du Nord. L’étude des déplacements des oiseaux dans cette région pourra être réalisée par le développement de suivis télémétriques qui prennent en compte les questionnements éthiques liés à la capture et la pose d’équipements embarqués.

Conservation ecology of the threatened damselfly Lestes macrostigma (2024)

Fri, 14 Jun 2024 10:08:56

de Philippe Lambret
Louvain : Katholieke Universiteit Leuven, 2024, 202

Les insectes constituent le groupe d’espèces déclinant le plus rapidement et sont parmi les plus menacés par les activités humaines. Malgré cela, ils sont largement négligés par les politiques de conservation et la recherche en biologie de la conservation. Les zones humides ont fortement disparu durant le dernier siècle et demeurent à ce jour menacées, ce qui impacte tous les groupes taxonomiques de la biodiversité, dont les insectes. Les odonates (les demoiselles et les libellules) sont de bons indicateurs de l’état de conservation des zones humides. La restauration d’habitats (recréation incluse) a été érigée comme une stratégie prioritaire durant la décennie en cours. De telles actions de conservation sont facilitées par l’usage d’une espèce étendard ; mais pour être efficaces, une connaissance solide de leurs exigences écologiques est nécessaire. Cette thèse de doctorat s’est focalisée sur la demoiselle menacée Lestes macrostigma, en tant qu’espèce étendard pour la conservation et la restauration des mares temporaires saumâtres. Les connaissances étaient lacunaires quant à l’influence du régime hydrologique et du niveau de salinité de l’eau sur les œufs et les larves, qui sont pourtant des stades clés de la dynamique des populations d’odonates. Dans le but d’entreprendre des actions de conservation basée sur des preuves, nous avons taché de combler ces lacunes en menant quatre études en Camargue, dans le sud de la France. Cette zone géographique se caractérise par des dépôts de sel et un climat méditerranéen, qui favorise l’apparition de zones humides temporaires et saumâtres abritant des populations reproductrices de L. macrostigma.
Afin d’améliorer notre connaissance de la biologie de l’œuf, nous avons étudié le développement embryonnaire ainsi que la phénologie et le succès d’éclosion dans deux mares temporaires saumâtres. Nous avons trouvé que les œufs – pondus dans des tiges de plantes durant le printemps précédent – restent à un stade de développement embryonnaire précoce durant l’été, l’automne et l’hiver. Ceci augmente probablement leur résistance aux températures extrêmes et illustre l’adaptation de L. macrostigma aux milieux temporaires dont la temporalité de submersion est incertaine. Cependant, la prise dans la glace des tiges de plantes contenant les œufs diminue leur survie, suggérant que des niveaux d’eau plus hauts au-dessus des tiges réduirait la mortalité des œufs en les protégeant des plus basses températures hivernales. L’éclosion s’est étalée de mi-mars à mi-avril et a été très synchronisée. Les différences de phénologie entre les deux mares s’expliquent probablement par des différences de température de leurs eaux.
La salinité de l’eau est un facteur pilote majeur des communautés d’insectes. Aussi avons-nous étudié en conditions de laboratoire les effets des niveaux de salinité vécus durant les stades embryonnaire et larvaire. Nous n’avons pas trouvé d’effet de la concentration en sel de mer sur la survie des œufs (succès d’éclosion) dans la gamme 2–9.5 g/L. En revanche, la survie larvaire a augmenté avec le niveau de salinité entre 0,5 et 8 g/L mais a chuté à zéro à 16 g/L. Les niveaux de salinité croissants ont augmenté la durée de développement larvaire jusqu’à l’âge adulte, et ont diminué les taux de croissance ainsi que la taille des adultes à l’émergence. Le niveau de salinité vécu durant la phase larvaire n’a eu d’effet ni sur la masse de muscles thoraciques des adultes, ni sur leur aptitude au vol, ni sur leur investissement dans les fonctions immunitaires, ni sur l’énergie qui leur était disponible. Toutefois, la consommation énergétique des adultes a augmenté avec les niveaux de salinité, résultant en un bilan énergétique plus faible. Nos résultats ont donc indiqué que, par rapport à la salinité de l’eau, L. macrostigma est un généraliste (niche écologique fondamentale) dont la niche écologique réalisée s’est déplacée vers les eaux saumâtres.
D’autres facteurs, comme les interactions biologiques, vécues durant la phase larvaire peuvent avoir des effets sur les larves et se répercuter sur les adultes. Nous avons donc mené une étude de terrain sur 33 mares et marais, en évaluant l’effet de 14 variables biotiques et abiotiques sur l’abondance des larves de L. macrostigma et sur la taille des adultes à l’émergence. Nous avons trouvé que les larves étaient plus abondantes dans les mares de plus petite taille et dont les dates de submersion étaient plus tardives durant l’automne et l’hiver. Ceci semblait s’exprimer par les larves prédatrices de libellules de la famille des Aeshnidae, qui étaient plus grandes et plus abondantes dans les mares à submersion plus précoce. Une grande vulnérabilité des larves de L. macrostigma aux prédateurs pourrait être liée à un haut niveau d’activité, qui serait associé à une croissance rapide et un fort taux de développement qu’impose l’assèchement de leur habitat temporaire. En outre, les adultes de L. macrostigma ont eu tendance à être plus grands lorsqu’ils émergeaient de mares ayant de plus hauts niveaux d’eau, probablement du fait que les eaux plus froides allongent la période de développement larvaire. En revanche, nous n’avons trouvé aucun effet des niveaux de salinité ni de la disponibilité en plantes hôtes de ponte sur l’abondance des larves de L. macrostigma.
Afin d’évaluer si la préférence que montrent les adultes pour certains types de plantes lors de la ponte sont bénéfiques à leur progéniture, nous avons étudié en conditions semi-contrôlées les effets de la date de submersion des pontes et du type de plante dans lequel les œufs ont été pondus sur leur succès d’éclosion. Nous avons trouvé que la submersion des pontes est nécessaire à l’éclosion. Les œufs ont été capables de supporter – bien qu’avec un faible taux de survie – la sécheresse jusqu’au mois d’avril (c’est-à-dire 10 mois sans submersion), mais aucun œuf n’a pu éclore dans le cas d’une submersion plus tardive. Les œufs pondus dans le Scirpe maritime Bolboschoenus maritimus ont eu un taux de survie plus grand et un développement embryonnaire plus rapide. Puisque B. maritimus pousse dans des parties des mares plus profondes, et est par conséquent submergé plus tôt que les autres plantes hôtes de ponte, cela suggère que la préférence que montrent les adultes pour B. maritimus lors de la ponte est une réponse adaptative à l’incertitude des conditions de submersion de l’habitat typique de L. macrostigma.
Les résultats de ces études, qui intègrent les stades clés du cycle de vie de L. macrostigma, fournissent une base scientifique sur laquelle développer les actions de conservation visant non seulement l’espèce, mais aussi la restauration de mares méditerranéennes temporaires saumâtres en utilisant L. macrostigma comme espèce étendard. La mise en place d’une hydropériode s’étendant de novembre à juin est cruciale pour réduire le risque de dessiccation de ses œufs et pour favoriser ses larves par rapport à celles d’autres espèces d’odonates dans la région étudiée. Ceci pourrait nécessiter des travaux d’ingénierie écologique à l’échelle du bassin versant des mares, basés sur la modélisation de leur hydrologie en utilisant des données météorologiques et topographiques. Compte tenu des changements climatiques, et notamment de l’augmentation de l’imprévisibilité des précipitations dans la zone méditerranéenne, la mise en eau artificielle par un réseau d’irrigation pourrait être la garantie du maintien d’un nombre minimal de sites de reproduction pérennes pour l’espèce. L’irrigation pourrait également aider à contrôler les niveaux de salinités et à maintenir des niveaux d’eau élevés durant la phase inondée afin d’augmenter la valeur sélective des individus. La colonisation des mares créées par B. maritimus devrait être accélérée par la transplantation de tubercules et de rhizomes collectés sur le terrain. La végétation existante devrait être entretenue par la mise en place d’un pâturage dont le calendrier et la pression soient liés au régime hydrologique visé. Compte tenu de la dégradation passée des milieux temporaires saumâtres, un réseau de mares de ce type devrait être restauré ou recréé en utilisant L. macrostigma comme espèce étendard. Leur suivi sur le long terme aiderait à identifier les facteurs de succès ou d’échec de ces actions de conservation, et à améliorer la conception des projets à venir. À cet égard, de nouvelles recherches portant sur la réintroduction de L. macrostigma dans certaines mares restaurées sont nécessaires. Cette thèse représente une importante étude de cas sur la manière de prendre en considération les insectes menacés dans les stratégies de conservation de la biodiversité.

Première étude des syrphes du domaine du Canavérier (Camargue gardoise, Saint-Laurent-d’Aigouze) et nouvelles espèces pour le département du Gard (Diptera, Syrphidae)

Tue, 14 May 2024 09:33:46

de Timothée Gonier
In RARE, 111 (2024), 115-134

Cet article présente une première liste de 43 espèces de syrphes recensées sur la zone humide du domaine du Canavérier, située en Camargue gardoise. Cet inventaire, mené au filet entomologique entre 2022 et 2023, permet de préciser les cortèges d’espèces associés aux habitats naturels présents sur le littoral méditerranéen. Il contribue à l’amélioration des connaissances sur la syrphidofaune de France en apportant des précisions sur l’écologie de certains taxons et en ajoutant 17 espèces supplémentaires à la liste des syrphes cités du département du Gard

Tracking Changes and Shifting Homes: Within-Season Displacement of Greater Flamingos Phoenicopterus roseus between Mediterranean Colonies

Thu, 28 Mar 2024 15:44:11

de Abdennour Boucheker, Riad Nedjah, Mouloud Boulkhssaim, Christophe Germain, Araceli Garrido, Miguel Angel Rendón, Juan A. Amat, Manuel Rendón-Martos, Roger Prodon, Arnaud Béchet, et al.
In Ardeola, 71(1) (January, 2024), 43-60
En ligne : bioone.org[...]

Las variaciones en la calidad del hábitat en el espacio y el tiempo llevan a las aves a rastrear estos cambios para optimizar su estado físico. Investigamos los movimientos entre colonias de los flamencos comunes Phoenicopterus roseus entre colonias de cría del norte del Mediterráneo, establecidas desde hace décadas, y una nueva colonia de cría en el sur del Mediterráneo, en un sitio bastante impredecible (Ezzemoul, Argelia). Entre los flamencos observados como reproductores en Ezzemoul en 2006 y 2009, 59 y 26 individuos anillados, respectivamente, fueron observados antes durante la misma temporada de cría en otra colonia del norte del Mediterráneo y posteriormente en la colonia del sur del Mediterráneo, proporcionando así la primera evidencia de desplazamientos a gran escala dentro de la temporada (> 1.000 km) de una colonia a otra. Sugerimos que el fracaso de la cría y una densidad de nidos mucho mayor en las colonias del norte, establecidas desde hace mucho tiempo, desencadenaron estos movimientos. El éxito reproductivo y la condición corporal de los polluelos en Ezzemoul fueron mayores que en Fuente de Piedra (España), lo que indica que a gran escala espacial y en un marco de tiempo más largo, el éxito de reproducción dependiente de la densidad en las colonias de flamencos comunes puede inducir un cambio de una distribución despótica ideal a una distribución libre ideal.—Boucheker, A., Nedjah, R., Boulkhssaïm, M., Germain, Ch., Garrido, A., Rendón, M.A., Amat, j.A., Rendón-Martos, M., Prodon, R., Béchet, A. y Samraoui, B. (2024). Rastreando cambios y desplazamientos entre sitios de nidificación: Desplazamientos de flamencos comunes Phoenicopterus roseus entre colonias mediterráneas dentro de la temporada de cría. Ardeola, 71: 43-60.

Diversity of major histocompatibility complex (MHC) and natural killer cell receptor (NKR) genes and their interactions in domestic horses

Thu, 29 Feb 2024 17:03:38

de Jana Bubenikova, Martin Plasil, Jan Futas, Karla Stejskalova, Marie Klumplerova, Jan Oppelt, Franz Suchentrunk, Pamela A. Burger, Petr Horin
In HLA, 103(2) (February, 2024), e15387
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

The immunogenome is the part of the genome that underlies immune mechanisms and evolves under various selective pressures. Two complex regions of the immunogenome, major histocompatibility complex (MHC) and natural killer cell receptor (NKR) genes, play an important role in the response to selective pressures of pathogens. Their importance is expressed by their genetic polymorphism at the molecular level, and their diversity associated with different types of diseases at the population level. Findings of associations between specific combinations of MHC/NKR haplotypes with different diseases in model species suggest that these gene complexes did not evolve independently. No such associations have been described in horses so far. The aim of the study was to detect associations between MHC and NKR gene/microsatellite haplotypes in three horse breed groups (Camargue, African, and Romanian) by statistical methods; chi-square test, Fisher's exact test, Pearson's goodness-of-fit test and logistic regression. Associations were detected for both MHC/NKR genes and microsatellites; the most significant associations were found between the most variable KLRA3 gene and the EQCA-1 or EQCA-2 genes. This finding supports the assumption that the KLRA3 is an important receptor for MHC I and that interactions of these molecules play important roles in the horse immunity and reproduction. Despite some limitations of the study such as low numbers of horses or lack of knowledge of the selected genes functions, the results were consistent across different statistical methods and remained significant even after overconservative Bonferroni corrections. We therefore consider them biologically plausible.

Un cadre spatial et fonctionnel pour des politiques zones humides : du défi conceptuel et technique aux enjeux praticiens. Application à des sous-bassins versants des fleuves côtiers méditerranéens français (2024)

Fri, 23 Feb 2024 14:56:58

de Suzanne Catteau, François Chambaud, Laurent Couderchet, Patrick Grillas
Toulouse : Presses Universitaires du Midi, 2024, 241-258 (Paysage & environnement)

L’article retrace l’élaboration d’un outil spatialisé destiné à être un support de négociation pour la prise en compte des fonctions et du fonctionnement des zones humides dans les territoires. Il interroge la complémentarité des traductions spatiales de ces écosystèmes et met en regard la production de l’outil avec sa réception auprès d’acteurs œuvrant pour la préservation de ces écosystèmes, au niveau des bassins et sous-bassins versants des fleuves côtiers méditerranéens français.

Identifying generic proxies for assessing ecosystem properties and conservation status of semi-natural grasslands

Mon, 22 Jan 2024 13:39:09

de Marine Pacé, Anne Bonis, Didier Alard, Cian Blaix, Maxime Burst, Manuella Catterou, Sylvain Diquelou, Thierry Dutoit, Hugo Fontes, Servane Lemauviel-Lavenant, et al.
In Ecological Indicators, 158 (January, 2024), 111586
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

Despite the recommendations of the 1992 European Habitat Directive regarding the evaluation of the conservation status of ecosystems, information on ecosystem functioning is still poorly integrated in long-term monitoring of European semi-natural grasslands. We investigated how to evaluate several ecosystem properties in relation to services provided by grasslands - plant and litter biomass and chemical composition, soil C and N content – by identifying non-destructive proxies involving little or no additional field sampling effort, or calculated from vegetation species composition. These proxies need to be i) informative, i.e. that can be used to approach one or more ecosystem properties based on linear or non-linear relationship models, and ii) generic, i.e. applicable across a wide range of semi-natural grassland habitats and environmental conditions. Based on a large set of field data collected in a variety of semi-natural grasslands in France, we showed that good proxies for ecosystem properties can be identified when the range of climate or soil moisture conditions was reduced. This suggests that these environmental factors influenced the functional pattern of semi-natural grassland ecosystems. The majority of proxies identified so far, including the community weighted mean of leaf dry matter content (LDMCCWM), the height of the herb layer, and litter thickness, are linked to ecosystem properties through non-linear relationships. They are generic in that they are applicable to several grassland habitat types. The height of the herb layer reflects standing plant biomass relatively well, but different non-linear models have to be used depending on climate and soil moisture conditions. Calculating LDMCCWM from species composition data provides a good approximation of the digestibility and P content of plant biomass. Similarly, litter thickness can be used to approach the digestibility and K content of plant biomass in wet grasslands. No generic proxy was found to approximate litter and soil characteristics across the wide range of grasslands habitats under study. By identifying generic and low-constraint proxies for several ecosystem properties, this work provides guidelines for assessing the functioning of semi-natural grasslands - a key criterion of their conservation status - with limited additional field effort and cost compared to plant community monitoring programs.

A multi-sensor approach to monitor the ongoing restoration of edaphic conditions for salt marsh species facing sea level rise: An adaptive management case study in Camargue, France

Mon, 13 Nov 2023 17:02:48

de Aurélie Davranche, Céline Arzel, Pierre Pouzet, A. Rita Carrasco, Gaëtan Lefebvre, Dimitri Lague, Marc Thibault, Alice Newton, Cyril Fleurant, Mohamed Maanan, et al.
In Science of The Total Environment, 908 (January, 2024), 168289
En ligne : hal.science[...]

The Camargue or Rhône delta is a coastal wetland in southern France of which parts formerly devoted to salt production are undergoing a renaturation process. This study assessed a multisensor approach to investigate the link between sediment size distribution, habitat development mapped with Worldview 2, flooding durations estimated with time series of SENTINEL 2 images and elevation modelled with a LIDAR point cloud in former saltworks. A Random Forest classification algorithm was used to map the vegetation distributions of Sarcocornia fruticosa and Arthrocnemum macrostachyum, main representatives of the NATURA 2000 “Mediterranean and thermo-Atlantic halophilous scrubs (Sarcocornetea fruticosi)” habitat on the site. The best habitat map was obtained when considering the species separately. The random forest Out-of-bag errors were 1.43 % for S. fruticosa and 2.18 % for A. macrostachyum. Both species were generally distributed on different elevation and flooding duration zones considering mean values. Flooding duration was estimated with the Water In Wetland index (WIW) based on 15 Sentinel-2 scenes. Two models related to sediment grain size distribution were developed: one predicting the flooding duration and one predicting the halophilous scrub distribution. Maps of flooding duration, sediment grain size distribution and elevation highlighted two main zones in the study area: a western section with coarser sediments, shorter flooding durations and higher elevations under sea influence; an eastern section with finer sediments, longer hydroperiods and lower elevations under a historic river influence. This multidisciplinary approach offers perspectives for using space-based data over large scales to monitor changes in edaphic conditions of coastal areas facing natural and anthropogenic forcings. The results call for further investigations to predict the dynamic distribution of other coastal habitats following climate change impacts, such as sea level rise.

Differential mapping of ringed bird distributions from live resightings versus dead recoveries: an illustration using Eurasian Teal Anas crecca

Tue, 16 Jan 2024 15:00:27

de Matthieu Guillemain, Betty Plaquin, Adrien Tableau
In Wildfowl, 73 (2023), 167-180
En ligne : wildfowl.wwt.org.uk[...]

Ringing and visual marking have long been used to delineate bird distribution ranges, but neither method is free from biases linked with differential re-encounter probabilities over the landscape, which may also differ among data collection methods. Modern statistical techniques enable two-dimensional smoothing of the capture/re-encounter information compared with earlier raw ring recovery location maps, improving geographical presentation of areas of greater bird encounter density. However, such technological tools do not solve the issue of the potential biases associated with different data collection methods. We used ring recovery and nasal saddle resighting data from over 14,000 Eurasian Teal Anas crecca ringed in France since 2002 to produce flyway-scale kernel distribution maps to highlight differences between distributions dependent on whether they were derived from recoveries or resighting information, despite abundant data in both cases. Results show that neither large datasets nor modern analytical tools are sufficient to overcome re-encounter probability biases, which require serious evaluation and future dedicated research.

Silent domestication of wildlife in the Anthropocene: The mallard as a case study

Tue, 21 Nov 2023 15:28:51

de Jocelyn Champagnon, Johan Elmberg, Matthieu Guillemain, Philip Lavretsky, Robert G. Clark, Par Soderquist
In Biological Conservation, 288 (December, 2023), 10
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

In the Anthropocene, human activities have been a dominant force affecting wildlife, natural habitats, and climate worldwide. Over time, increasing incidences of wildlife-human interactions may have positive outcomes for some generalist species, but studies continue to uncover that most predictably these generalist wild species also suffer from such interactions. In particular, the line between domestic and wild continues to blur as gene flow between these groups intensifies in the Anthropocene. We explore the meaning of wildness, focusing on the mallard, currently the most abundant duck species in the world. Mallard has been connected to humans for tens of thousands of years. Considered an exemplary generalist species with the capacity to adapt to rapidly changing environments, evidence gathered from a variety of disciplines suggests that some management efforts over the last centuries have resulted in the deterioration of the mallard's prolific nature, and that the apparent success in terms of current population size and wide distribution could mask a genetic collapse. Highlighting warning signs from the mallard system, in this Perspectives paper we discuss how active management of habitats and populations runs the risk of compromising species' wildness, and we suggest precautionary and counter-measures in the context of species management and conservation.

Première mention de Microrhagus pyrenaeus Bonvouloir, 1872 (Coloptera, Eucnemidae) en région Provence-Alpes-Côte-d'Azur

Fri, 12 Jan 2024 11:37:49

de Gabriel Nève, Jean-Pierre Hébrard, Fabien Soldati
In Bulletin de la Société Linnéenne de Provence, 74 (2023), 35-36
En ligne : hal.science[...]

Un spécimen de Microrhagus pyrenaeus Bonvouloir, 1872 (Coleoptera, Eucnemidae) a été capturé à Fos-sur-Mer en 2012. Il figurait dans une publication récente sous le nom de Eucnemis capucina Ahrens, 1812. M. pyrenaeus est ici nouvellement signalé pour le département des Bouches-du-Rhône mais également pour la Région Provence-Alpes-Côte-d’Azur. Cette espèce à indice patrimonial national élevé et considérée presque menacée à l’échelle européenne se rencontre dans les peuplements ayant atteint un certain degré de maturité, et notamment en ripisylve, qu’il convient donc de préserver.

Effects of mosquito control using the microbial agent Bacillus thuringiensis israelensis (Bti) on aquatic and terrestrial ecosystems: a systematic review

Fri, 5 Jan 2024 09:31:36

de Magnus Land, Mirco Bundschuh, Richard J. Hopkins, Brigitte Poulin, Brendan G. McKie
In Environmental Evidence, 12(1) (2023-11-22), 26
En ligne : environmentalevidencejournal.biomedcentral.com[...]

The bacterium Bacillus thuringiensis serovar israelensis (Bti) is commercially produced in various formulations for use as a larvicide worldwide, targeting especially the aquatic larval stage of mosquitoes. However, there is a concern that repeated Bti treatments may have both direct and indirect impacts on non-target organisms (NTOs) and the ecosystems they inhabit. This review evaluates the evidence for such impacts.
Literature was searched using six bibliographic databases, two search engines, and on specialist web sites. Eligibility screening was performed in two steps on (1) title/abstract, with consistency among reviewers assessed by double-screening 557 articles and (2) full text. Articles included after full text screening were critically appraised independently by two reviewers. Disagreements were reconciled through discussions. Key parameters of included studies are presented in narrative synthesis tables, including risk of bias assessments. Meta-analyses comparing treated with untreated ecosystems and using either the raw mean difference or log response ratio as effect size were performed.
Ninety-five articles covering 282 case studies were included in the review. From these, we identified 119 different response variables, which were divided into nine outcome categories. Most studies investigated NTO abundance or life history (reproduction related outcomes), but diversity and community composition are also well represented as outcome categories. The studies are highly variable in methodology, rigor, and spatiotemporal scale, spanning 1 day to 21 years and from < 1 m2 to > 10,000 m2. Our metanalyses revealed a consistent negative effect of Bti treatment on abundances of Chironomidae and Crustacea, and also on chironomid emergence, although from a more restricted set of studies and regions. For most remaining response variables, we judged metaanalysis unfeasible, due to low study numbers or insufficient reporting of methods and results.
There is now a significant body of studies documenting effects of mosquito control using Bti on NTOs or other ecosystem properties, especially associated with negative effects on Chironomidae, as apparent from our meta-analyses. Accordingly, we suggest the potential for negative NTO or other ecosystem effects of Bti treatment should not be discounted a priori. Once a decision to proceed with Bti treatment has been taken, priority should be given to a well-designed program of ongoing monitoring and assessment. The paucity of rigorous studies conducted with low bias risk for most response variables undermines our capacity for evaluating how common many

Pesticide concentrations in a threatened freshwater turtle (Emys orbicularis): Seasonal and annual variation in the Camargue wetland, France

Tue, 21 Nov 2023 15:28:58

de Leslie-Anne Merleau, Olivier Lourdais, Anthony Olivier, Marion Vittecoq, Gabriel Blouin-Demers, Fabrice Alliot, Louisiane Burkart, Yvann Foucault, Carole Leray, Emmanuelle Migne, et al.
In Environmental Pollution, Online November (November, 2023), 11
En ligne : linkinghub.elsevier.com[...]

Wetlands are among the most threatened ecosystems on the planet and pollution is a major factor causing the decline of wetland biodiversity. Despite the increasing use of pesticides, their fate and effects on freshwater reptiles remain largely unknown. We studied the European pond turtle (Emys orbicularis), a long-lived species at risk with a high exposure potential to pesticides. Between 2018 and 2020, we measured 29 pesticides and metabolites in 408 blood samples of turtles from two populations in the Camargue wetland (France). We were able to quantify 24 compounds and at least one pesticide or one degradation product in 62.5% of samples. Pesticide occurrences and concentrations were low, except for a herbicide widely used in rice cultivation and locally detected in water: bentazone that reached high blood concentrations in E. orbicularis. The occurrence and the concentration of pesticides in E. orbicularis blood depended mainly on the site and the sampling date in relation to pesticide application. Individual characteristics (sex, age, body condition) did not explain the occurrence or the concentration of pesticides found in turtle blood. Assessing the exposure of aquatic wildlife to a cocktail of currently-used pesticides is a first and crucial step before studying their effects at the individual and population levels.

Distribution des grenouilles vertes du système perezi-grafi et des autres espèces du genre Pelophylax (Amphibia : Ranidae) dans leur aire méditerranéenne française à l’ouest du Rhône

Tue, 7 Nov 2023 15:56:19

de Jérémie DEMAY, François Ciavatti, Angelica Cuevas, Paul Doniol-Valcroze, Aimeric Eble, Elise Leblanc, Yoann Mansier, Ivain Martinossi-Allibert, Jean Nicolas, Adrien Pineau, et al.
In Bulletin de la société herpétologique de France, 182 (Novembre, 2023), 1-11
En ligne : lashf.org[...]

Nous présentons ici l’ensemble des connaissances disponibles sur la distribution des grenouilles vertes (genre Pelophylax) dans leur aire méditerranéenne française à l’ouest du Rhône (départements des Pyrénées-Orientales, de l’Aude, de l’Hérault, du Gard). Pour le système perezi-grafi (PG), nous donnons aussi les informations disponibles pour le département de l’Ardèche afin de fournir une synthèse exhaustive sur la distribution de ce système entre le fleuve Rhône et l’ex-région Midi-Pyrénées. Nous n’avons retenu que des données basées sur la génétique ou la bioacoustique qui sont les seules techniques permettant actuellement une séparation fiable des Grenouilles rieuses et des grenouilles du système PG. Le système PG représente la quasi-totalité des populations de grenouilles vertes entre le fleuve Hérault, la frontière espagnole, la haute vallée de l’Aude à l’ouest des Corbières et le versant méditerranéen de la montagne Noire (Minervois), où la Grenouille rieuse n’est présente que de manière localisée. A l’opposé, à partir de la vallée de l’Hérault en allant vers l’est, la Grenouille rieuse domine et le système PG persiste uniquement dans les marais littoraux ou dans quelques isolats en garrigue dont certains ont disparu durant la période d’étude (depuis 1996). Nous discutons brièvement les implications de ces résultats pour la conservation du système.

Estimating breeding population size of the red-crested pochard (Netta rufina) in the Camargue (southern France) taking into account detection probability: implications for conservation

Tue, 29 Aug 2017 11:30:53

de Pierre Defos du Rau, C. Barbraud, Jean-Yves Mondain-Monval
In Animal Conservation, 6 (November, 2003), 379-385

The red-crested pochard (Netta rufina), a Eurasian diving duck, has seen its numbers declining and has received strong conservation concern. Data on population size and rate of decline are required to establish management plans, none of which is available for this species. Here we present the first population size estimate taking into account detection probability and habitat use in the Camargue, southern France. A non-random sample of 33 lakes was used to estimate detection probability from point-counts. Detectability was low, with only 57.5% of individual broods detected. A random sample of 37 lakes was then used to estimate brood densities. Adjusted densities (taking into account detection probability) were 0.1106 broods per ha of reedbed. Adjusted densities were extrapolated to the entire surface area of reedbeds in the Camargue estimated from a GIS to obtain abundance estimates of the brood population. A minimum estimate of 559 breeding pairs was obtained (95% confidence interval: 436-855). This estimate is much higher than previous ones (80-100 pairs for the Camargue, 250 pairs for France), and indicates strong underestimation of the population size when not taking into account detectability. Our results suggest that the red-crested pochard may require a reassessment of its conservation status for France and Europe. They further suggest that taking detection probability into account in population estimates of other cryptic species, and notably those of conservation concern, may help clarify their conservation status and may even affect the setting of conservation priorities.

La Camargue, un delta face au défi climatique

Mon, 13 Nov 2023 17:02:52

de Jean Jalbert
In Annales des mines - Responsabilité et environnement., 112 (Octobre 2023), 104-107
En ligne : www.annales.org[...]

Le delta du Rhône, comme tous les deltas du monde, est sur la ligne de front des changements climatiques. À la suite de son endiguement consécutif à des inondations majeures à la fin de XIXe siècle, cette vaste plaine deltaïque a été le siège d’un extraordinaire récit de conquête et de maîtrise : digues, pompes et réseaux hydrauliques ont permis de dompter ce pays rétif, de s’affranchir des principales contraintes – inondations, sel, submersions marines – pour enfin « mettre en valeur » ce territoire, y développer une agriculture productive, sécuriser ses habitants. Pourtant cette période de stabilité touche probablement à son terme. Sous les effets puissants du changement climatique, ce territoire rappelle aux humains que la richesse d’un delta vient précisément de sa dynamique, des flux qui le traversent. Flux d’eau douce et de sédiments, flux d’eau salée, flux biologiques, flux humains... Il nous rappelle sa nature profonde : un territoire mouvant, mobile par essence, siège de l’impermanence des choses. Et si la Camargue était un parfait laboratoire pour inventer un nouveau récit, celui de l’adaptation et de la résilience ?

Que sont les solutions fondées sur la nature pour la gestion du risque inondation ? Appropriations d'un concept international en France et aux États-unis

Tue, 7 Nov 2023 15:56:25

de J Guerrin, A Serra-Llobet, M Bonnefond, A Brochet, L Drapier, S Fernandez, M Fournier, C Heitz
In TSM. Techniques Sciences Méthodes, 10 (Octobre 2023), 99-121
En ligne : astee-tsm.fr[...]

Les « solutions fondées sur la nature » (SFN) ont été définies et promues à l’échelle internationale, et leur déploiement dans différents contextes institutionnels demeure encore peu étudié. Nous proposons dans cet article d’étudier la déclinaison de ce concept à différentes échelles, en France et aux États-Unis. Grâce à une recherche ancrée en sciences sociales dans le cadre d’un projet international, nous étudions la définition et la mise en oeuvre de SFN pour les politiques de gestion des inondations dans les deux pays, aux échelles nationale/fédérale, et locales. Nos résultats préliminaires montrent qu’en France, le concept semble très lié à la définition de l’Union internationale pour la conservation de la nature (UICN) et est surtout soutenu par les acteurs du monde de la conservation de la nature. Au contraire, le concept semble encore peu approprié par les acteurs de la gestion des inondations. En revanche, aux États-Unis, c’est l’organisation The Nature Conservancy (TNC) qui promeut le concept. Le concept semble davantage mobilisé par les politiques publiques liées à la gestion des inondations. Son appropriation semble néanmoins l’éloigner de l’ambition de préservation de la biodiversité. / Nature-based Solutions (NbS) have been defined and promoted at the international level, and their implémentation in different institutional contexts remains little studied In this article, we propose to analyze the appropriation of the concept across multiple scales in France and the United States. Through social science research anchored in an international research project, we study the définition and implémentation of NBS for flood management policies in both countries, at national/federal and local scales. Our preliminary results show that in France, the concept seems to be very much linked to the définition of the International Union for Conservation of Nature (IUCN) and is mainly supported by biodiversity stakeholders. However, the concept still seems to be little used by flood management stakeholders. On the other hand, in the United States, the concept is being developed by The Nature Conservancy (TNC). The concept seems to be more mobilized by public policies related to flood management. Its appropriation nevertheless distances it from the ambition of preserving biodiversity to embrace the préservation of the environment, a term understood differently by actors and organizations.

Sensitivity analysis of erosion on the landward slope of an earthen flood defense located in southern France submitted to wave overtopping

Mon, 13 Nov 2023 17:02:50

de Clément Houdard, Adrien Poupardin, Philippe Sergent, Abdelkrim Bennabi, Jena Jeong
In Natural Hazards and Earth System Sciences, 23(9) (September, 2023), 3111-3124
En ligne : nhess.copernicus.org[...]

The study aims to provide a complete analysis framework applied to an earthen dike located in Camargue, France. This dike is regularly submitted to erosion on the landward slope that needs to be repaired. Improving the resilience of the dike calls for a reliable model of damage frequency. The developed system is a combination of copula theory, empirical wave propagation, and overtopping equations as well as a global sensitivity analysis in order to provide the return period of erosion damage on a set dike while also providing recommendations in order for the dike to be reinforced as well as the model to be self-improved. The global sensitivity analysis requires one to calculate a high number of return periods over random observations of the tested parameters. This gives a distribution of the return periods, providing a more general approach to the behavior of the dike. The results show a return period peak around the 2-year mark, close to reported observation. With the distribution being skewed, the mean value is higher and is thus less reliable as a measure of dike safety. The results of the global sensitivity analysis show that no particular category of dike features contributes significantly more to the uncertainty of the system. The highest contributing factors are the dike height, the critical velocity, and the coefficient of seaward slope roughness. These results underline the importance of good dike characterization in order to improve the predictability of return period estimations. The obtained return periods have been confirmed by current in situ observations, but the uncertainty increases for the most severe events due to the lack of long-term data.

Influence of changes in local environmental variables on the distribution and abundance dynamics of wintering Teal Anas crecca

Mon, 25 Sep 2023 15:02:39

de David Vallecillo, Matthieu Guillemain, Colin Bouchard, Sébastien Roques, Jocelyn Champagnon
In Biodiversity and conservation, 32 (Septembre, 2023), 23
En ligne : link.springer.com[...]

Explaining changes in waterfowl distribution and abundance is requested by wetland managers for a better understanding of their population dynamics and habitat use. The objective of this study was to assess the influence of interannual changes in wetland management, both through direct data and proxies, on the distribution dynamics of Teal day-roosts in the Camargue, a large wetland complex in southern France. We constructed a statespace model accounting for a conditional detection probability by aerial observers during duck counts, since changes in observers have a strong influence on variations in detection probability. First, we showed that the distribution of Teal day-roosts within the Camargue delta has changed over the last 35 years. Second, on a sub-sample of 18 years, we showed that annual changes in Teal abundance depended on salinity and open water area at the day-roost, and on the availability of potential feeding grounds surrounding the day-roost (available wetland area within 5 km). No association was detected between changes in Teal abundance and changes in the typology of wetland hydrology, or with changes in site protection status (i.e. hunted to protected). Our results reinforce the importance of considering management at the scale of functional units, by considering the complementarity of nocturnal feeding areas (mainly hunted areas) specifically managed for waterfowl, and diurnal roosts (mainly nature reserves, which have high conservation value for other animal and plant species). A good understanding of the factors affecting the localisation of waterfowl day-roosts is becoming more important in the context of climate change, which is likely to redistribute local birds with rising sea levels and increasing salinity in wetlands.

Direct and indirect estimates of dispersal support strong juvenile philopatry and male-biased dispersal in a freshwater turtle species (Emys orbicularis)

Fri, 22 Sep 2023 15:36:57

de Remi Fay, Sébastien Ficheux, Arnaud Béchet, Aurélien Besnard, Pierre-André Crochet, Raphael Leblois, Alain Crivelli, Remi Wattier, Anthony Olivier
In Freshwater Biology, Online (September 2023), 12
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

Dispersal has major impacts on population dynamics, population genetics and evolution, and also is critical for population management and conservation. Dispersal is frequently sex- and age-specific, but current knowledge is strongly taxonomically biased toward birds and mammals. Here, we provide estimates of dispersal in a threatened freshwater turtle species, the European pond turtle Emys orbicularis. Based on 15 years of capture-mark-recapture (CMR) monitoring and DNA samples from 194 individuals, we quantified both demographic and genetic dispersal between three sites separated by 1.5–3.5 km. We also investigated the effect of age and sex on dispersal. Direct (CMR) and indirect (genetic) approaches provided consistent results, showing that the studied sites are connected with a flow of about one to three dozen migrants per generation. Dispersal was both age- and sex-biased in this species, with frequent dispersal of adult males and a strong philopatry of juveniles (of both sexes) and adult females. The network of canals and marshes allow effective dispersal to occur among the three study sites despite the relatively large distance separating them (≤3.5 km). The strong philopatry of juveniles contrasts with the frequently higher dispersal rate in young birds and mammals and shows the relevance of investigating dispersal in various taxonomic groups. Our results provide useful information for the conservation of European pond turtle populations.

Trente ans après, un nouvel éclairage sur la situation du Râle d’eau Rallus aquaticus en Alsace

Fri, 22 Sep 2023 15:36:47

de Benoît Wassmer, Alain Willer
In Ciconia, 47(1-2) (Septembre, 2023), 51-75

Il y a 30 ans, l’Alsace fut l’une des rares régions européennes à avoir tenté d’apprécier la situation du Râle d’eau sur l’ensemble de son cycle annuel. Retenu comme espèce cible des « Roselières » dans le cadre du programme Interreg Ramsar Biodiversité 2019-2021 (LPO, NABU, ILN), l’occasion s’offrait de renouveler l’opération. En 2020-21, dans 34 sites des bras morts du Rhin au étangs du Sundgau, 12 observateurs ont consacré plus de 200 heures de terrain, effectué 1 030 stations de repasse (usage de l’enregistrement du cri dit de « porcelet qu’on égorge ») et cartographié 54 territoires avec un duo (TD) et 169 territoires avec un individu (TI) en automne, 23 (TD) et 104 (TI) en hiver, 12 (TD) et 46 (TI) au printemps et 21 (TD) et 68 (TI) en été. Le contexte météorologique est à l’origine de la différence de physionomie inter saisonnière constatée à 30 ans d’intervalle : analogue pour ce qui est du maximum automnal et de la baisse hivernale, certes atténuée, il en fut tout autrement de la période printanière et estivale qui vit en lieu et place d’une baisse modérée (– 29 %) encore accentuée (- 19 %), une forte baisse (- 61 %) et un phénomène de rebond de niveau comparable (+ 52 %). Phragmitaies couchées par les lourdes chutes de neige de la mi-janvier, reprise de la végétation retardée par un printemps froid, et conditions pluvieuses et très fraîches qui ont perduré, ont engendré un report de la nidification en deuxième partie de saison. À cet égard, 2021 constitue une nouvelle illustration de l’opportunisme de l’espèce. Un minimum de 41 territoires de nidification a été obtenu sur 18 sites : en en détenant 78 %, le bilan est en faveur des sites protégés qui ont été renaturés. À la plus forte progression enregistrée en Petite Camargue alsacienne (doublement à minima), le plus fort déclin noté sur le Schafskoepfel (perte de 80 à 90 %) qui accueillait il y a 30 ans, la densité la plus forte d’Alsace (11 à 13 couples sur 2,5 ha). Les dates de ponte, estimées à partir des observations de 64 nichées extraites de la base de données (1978-2021), s’étalent d’avril à début août avec un maximum en mai (n = 28) et lors des deux premières décades de juin (n = 21). En 1991, les sites témoins représentaient près de 60 % de l’effectif nicheur régional. Sur cette base, l’Alsace aurait accueilli 58 à 163 couples en 2021. Lors des meilleures années, le minimum est de 150 couples. Alors que la situation du Râle d’eau est devenue précaire dans les bras morts du Rhin soumis au déclin des roselières et à la pénétration croissante par l’homme et les sangliers, veiller à la pertinence des mesures conservatoires et améliorer la connectivité des dernières zones humides sont une priorité.

Natal colony influences age-specific movement patterns of the Yellow-legged gull (Larus michahellis)

Tue, 24 Oct 2023 18:08:30

de Charly Souc, Nicolas Sadoul, Thomas Blanchon, Marion Vittecoq, Christophe Pin, Eric Vidal, Alain Mante, Remi Choquet, Karen D. McCoy
In Movement Ecology, 11(1) (August, 2023), 11
En ligne : doi.org[...]

As for other life history traits, variation occurs in movement patterns with important impacts on population demography and community interactions. Individuals can show variation in the extent of seasonal movement (or migration) or can change migratory routes among years. Internal factors, such as age or body condition, may strongly influence changes in movement patterns. Indeed, young individuals often tend to move across larger spatial scales compared to adults, but relatively few studies have investigated the proximate and ultimate factors driving such variation. This is particularly the case for seabirds in which the sub-adult period is long and difficult to follow. Here, we examine migration variation and the factors that affect it in a common Mediterranean seabird, the Yellow-legged gull (Larus michahellis).

Weather, sex and body condition affect post-fledging migration behaviour of the greater flamingo Phoenicopterus roseus

Fri, 8 Sep 2023 18:21:32

de Davide Scridel, Simone Pirrello, Simona Imperio, Jacopo G. Cecere, Giuseppe Albanese, Alessandro Andreotti, Giovanni Arveda, Fabrizio Borghesi, Giuseppe La Gioia, Luisanna Massa, et al.
In Movement Ecology, 11(1) (August, 2023), 51
En ligne : doi.org[...]

Understanding which intrinsic and extrinsic factors dictate decision-making processes such as leaving the natal area or not (migratory vs resident strategy), departure time, and non-breeding destination are key-issues in movement ecology. This is particularly relevant for a partially migratory meta-population in which only some individuals migrate.

A soft tick vector of Babesia sp. YLG in Yellow-legged gull (Larus michahellis) nests

Mon, 11 Dec 2023 14:18:11

de Claire Bonsergent, Marion Vittecoq, Carole Leray, Maggy Jouglin, Marie Buysse, Karen D. McCoy, Laurence Malandrin
In Peer Community Journal, 3 (August, 2023)
En ligne : peercommunityjournal.org[...]

Babesia sp. YLG has recently been described in Yellow-legged gull (Larus michahellis) chicks and belongs to the Peircei clade in the new classification of Piroplasms. Here, we studied Babesia sp. YLG vectorial transmission by ticks in the simplified environment of a single seabird breeding colony where the Yellow-legged gull is the sole vertebrate host, Ornithodoros maritimus (syn. Alectorobius maritimus) the sole tick species, and Babesia sp. YLG is the only blood parasite species detected in chicks of the colony. We collected ticks over four years, maintained certain individuals through moulting or oviposition, and dissected fresh ticks to isolate different organs and test for the presence of the parasite using molecular assays. We report the first strong evidence of a Piroplasmidae transmitted by a soft tick. Indeed, Babesia sp. YLG DNA was detected in the salivary glands of nymphs, females and males, a necessary organ to infect for transmission to a new vertebrate host. Parasite DNA was also found in tick ovaries, which could indicate possible transovarial transmission. Our detection of Babesia sp. YLG DNA in several male testes and in endospermatophores, and notably in a parasite-free female (uninfected ovaries and salivary glands), raise the interesting possibility of sexual transmission from infected males to uninfected females. Future work in this system will now need to focus on the degree to which the parasite can be maintained locally by ticks and the epidemiological consequences of infection for both O. maritimus and its avian host.

Field margins as substitute habitat for the conservation of birds in agricultural wetlands

Mon, 21 Aug 2023 15:21:50

de Pierre Mallet, Arnaud Béchet, Clelia Sirami, François Mesléard, Thomas Blanchon, Francois Calatayud, Thomas Dagonet, Elie Gaget, Carole Leray, Thomas Galewski
In Peer Community Journal, 3 (August, 2023)
En ligne : peercommunityjournal.org[...]

Breeding birds in agricultural landscapes have declined considerably since the 1950s and the beginning of agricultural intensification in Europe. Given the increasing pressure on agricultural land, it is necessary to identify conservation measures that consume little productive land. We tested the compensation hypothesis which states that field margins may represent substitute habitats for bird species in agricultural wetlands. We monitored bird species in 86 crop fields in rice paddy landscapes of Camargue (southern France), a wetland of international importance for birds. We investigated whether the area of three types of field margins (reed strips, grass strips and hedgerows) within a 500 meter buffer around the centroid of each crop fields had an effect on the abundance of bird species from three groups defined based on their primary habitat (reedbeds, grasslands, and forest edge species). We controlled for the area of each type of semi-natural habitat (wetlands, grasslands, and woodlands), crop diversity (rice, wheat, alfalfa, rape, and market gardening) and mean crop field size. Results show partial support of the compensation hypothesis with species-dependent responses to primary and substitute habitat area. Some species within the reedbed and grassland bird guilds are favored by the area of their primary habitat as well as by the area of field margins, in line with the compensation hypothesis. Eurasian reed warbler is favored by the area of both wetlands and reed strips. Corn bunting is favored by grassland and grass strip areas. We could not confirm the compensation hypothesis for other species. However, this may be due to the fact that most of these species did not respond to their primary habitat. These results therefore suggest that field margins may represent substitute habitats for some species but further studies, in contexts where species are strongly associated with their primary habitat, would be needed to confirm the generality of this hypothesis. Our results also suggest that species response to increasing the area of a field margin type may vary among guilds and even within guilds. Therefore, it may be difficult to favor all species within a given landscape and management actions may need to be tailored to whichever species are locally associated with the highest conservation priority. To tackle this challenge, it may be necessary to design landscape management actions at different spatial scales.

Estimating migration speed of glass eels during their colonization of a Mediterranean lagoon

Thu, 31 Aug 2023 12:06:19

de Colin Bouchard, Delphine Nicolas
In Journal of Fish Biology, 103(5) (November, 2023), 9
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

Migration speed can have important evolutionary consequences as it can affect the timing of arrival, remaining energy reserves, and habitat choice. Environmental conditions and individual phenotypic traits can impact the migration speed of individuals. In this way, estimating migration speed is of particular importance, especially for species under strong management strategies and colonizing highly diversified habitats, as is the case for the European eel. However, estimating the migration speed of glass eels, which is the life stage when eels colonize continental habitats, presents challenges due to typically low re-capture probabilities and difficulties in tagging individuals. Using recruitment time series at two sites, one at the sea connection and another inland, we estimated the temporal lag between the two migration peaks to compute migration speed. Because we worked on the Mediterranean coasts and in a lagoon, the weak tidal amplitudes may inhibit individuals from efficiently performing the selective tidal stream transport. We obtained migration speed values coherent with the few values available in the literature for Atlantic estuaries. The values we obtained that are lower than those obtained for Atlantic estuaries are also coherent with the weak tides along the Mediterranean coasts and lead to necessary further studies to understand the migratory behavior of glass eels in such hydro-systems.

First North African record of a melanistic rabbit, Oryctolagus cuniculus (Linnaeus, 1758)

Mon, 21 Aug 2023 15:18:12

de Farid Bounaceur, Djamel Abdelhamid, Mohamed Djilali, Fatine Lasgaa, Fatima Zohra Bissaad, Stéphane Aulagnier
In Mammalia, Online (2023-06-26)
En ligne : www.degruyter.com[...]

Although melanism is common in some mammal species, particularly in domestic forms, its occurrence in lagomorphs is rare. We report the first records of melanistic wild rabbit, Oryctolagus cuniculus in North Africa. These were obtained from a camera-trap set in Tiaret governorate, Algeria, in 2019 and 2020. Melanism is restricted to few species of Leporidae, genera Sylvilagus and Lepus . Dark rabbits have been reported to a new subspecies from Camargue (France), however this status is not recognized any longer.

Impact across ecosystem boundaries – Does Bti application change quality and composition of the diet of riparian spiders?

Fri, 21 Apr 2023 16:31:55

de Sara Kolbenschlag, Eric Bollinger, Verena Gerstle, Carsten A. Brühl, Martin H. Entling, Ralf Schulz, Mirco Bundschuh
In Science of The Total Environment, 873 (May, 2023), 162351
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

Emerging aquatic insects link aquatic and adjacent terrestrial food webs by subsidizing terrestrial predators with high-quality prey. One of the main constituents of aquatic subsidy, the non-biting midges (Chironomidae), showed altered emergence dynamics in response to the mosquito control agent Bacillus thuringiensis var. israelensis (Bti). As riparian spiders depend on aquatic subsidy, they may be affected by such changes in prey availability. Thus, we conducted a field study in twelve floodplain pond mesocosms (FPMs), six were treated with Bti (2.88 × 109 ITU/ha, VectoBac WDG) three times, to investigate if the Bti-induced shift in chironomid emergence dynamics is reflected in their nutritional value and in the diet of riparian spiders. We measured the content of proteins, lipids, glycogen, and carbohydrates in emerged Chironomidae, and determined the stable isotope ratios of female Tetragnatha extensa, a web-building spider living in the riparian vegetation of the FPMs. We analysed the proportion of aquatic prey in spiders' diet, niche size, and trophic position. While the content of nutrients and thus the prey quality was not significantly altered by Bti, effects on the spiders' diet were observed. The trophic position of T. extensa from Bti-treated FPMs was lower compared to the control while the aquatic proportion was only minimally reduced. We assume that spiders fed more on terrestrial prey but also on other aquatic organisms such as Baetidae, whose emergence was unaffected by Bti. In contrast to the partly predaceous Chironomidae, consumption of aquatic and terrestrial primary consumers potentially explains the observed lower trophic position of spiders from Bti-treated FPMs. As prey organisms vary in their quality the suggested dietary shift could transfer previously observed effects of Bti to riparian spiders conceivably affecting their populations. Our results further support that anthropogenic stressors in aquatic ecosystems may translate to terrestrial predators through aquatic subsidy.

Ecological Basis of Ecosystem Services and Management of Wetlands Dominated by Common Reed (Phragmites australis): European Perspective

Fri, 22 Sep 2023 15:37:06

de Hana Čížková, Tomáš Kučera, Brigitte Poulin, Jan Kvĕt
In Diversity, 15(5) (May, 2023), 629
En ligne : www.mdpi.com[...]

The common reed (Phragmites australis) is a frequent dominant species in European wetlands. Yet, its performance can vary in response to different combinations of environmental factors. This accounts for P. australis decline on deep-water sites, its stable performance in constructed wetlands with subsurface horizontal ﬂow and its expansion in wet meadows. Reed stands provide habitats for nesting, feeding or roosting of vulnerable bird species. Conservation measures aim at preventing or stopping the decline of P. australis stands, increasing their micro-habitat heterogeneity and reducing the reed penetration into wet meadows. Service-oriented measures aim at providing suitable conditions for direct use of reed stalks for roof thatching or as a renewable energy crop or the use of the reed-dominated habitats for waterfowl hunting, cattle grazing or ﬁshing. The compatibility between nature conservation and different socioeconomic uses can be promoted by collective agreements, agri-environmental contracts or payments for ecosystem services of the reedbeds. In situations with multiple uses, a modelling approach considering the participation of all the stakeholders concerned can be a useful tool for resolving conﬂicts and developing a shared vision of the respective socio-ecosystem.

Antimicrobial-Resistant Bacteria Carriage in Rodents According to Habitat Anthropization

Thu, 15 Jun 2023 16:17:49

de Marion Vittecoq, Eric Elguero, Lionel Brazier, Nicolas Renaud, Thomas Blanchon, François Roux, François Renaud, Patrick Durand, Frederic Thomas
In EcoHealth, 20 (May, 2023)
En ligne : doi.org[...]

It is increasingly suggested that the dynamics of antimicrobial-resistant bacteria in the wild are mostly anthropogenically driven, but the spatial and temporal scales at which these phenomena occur in landscapes are only partially understood. Here, we explore this topic by studying antimicrobial resistance in the commensal bacteria from micromammals sampled at 12 sites from a large heterogenous landscape (the Carmargue area, Rhone Delta) along a gradient of anthropization: natural reserves, rural areas, towns, and sewage-water treatment plants. There was a positive relationship between the frequency of antimicrobial-resistant bacteria and the level of habitat anthropization. Although low, antimicrobial resistance was also present in natural reserves, even in the oldest one, founded in 1954. This study is one of the first to support the idea that rodents in human-altered habitats are important components of the environmental pool of resistance to clinically relevant antimicrobials and also that a “One Health” approach is required to assess issues related to antimicrobial resistance dynamics in anthropized landscapes.

Assessing the Effectiveness of Qista Baited Traps in Capturing Mosquito Vectors of Diseases in the Camargue Region (France) and Investigating Their Diversity

Wed, 20 Dec 2023 15:41:07

de Mehdi Boucheikhchoukh, Ismail Lafri, Anlamina Chamssidine Combo, Christophe Regalado, César Barthés, Hamza Leulmi
In Animals, 13(11) (May, 2023), 1809
En ligne : www.mdpi.com[...]

Nuisance, allergy, and vector role: mosquitoes are responsible for numerous inconveniences. Several strategies have been employed to fight against this confirmed vector. To record the diversity of mosquito vectors in Camargue (France) and assess the effectiveness of the Qista trap, six BAMs were deployed as a belt barrier to protect the Espeyran Castle (Saint-Gilles, Camargue). Prior to evaluating the reduction in the nuisance rate, recovery nets from the traps and human landing catches (HLC) were utilized twice a week in the treated and control areas. Overall, 85,600 mosquitoes were captured, belonging to eleven species, namely Aedes albopictus, Aedes caspius, Aedes detritus, Aedes dorsalis, Aedes rossicus, Aedes vexans, Anopheles maculipennis, Culex pipiens, Culex modestus, Culiseta annulata and Culiseta longiareolata. The six BAM devices trapped 84,461 mosquitoes. The average capture rate per BAM is 76.92 mosquitoes per day. The rate of nuisance has decreased from 4.33 ± 2.88 before the deployment to 1.59 ± 2.77 after BAM implantation. The Qista BAM trap seems to be an excellent tool for reducing the nuisance rate and may help researchers to optimize trapping methods by obtaining more significant sample sizes. It may also allow the updating of the host-seeking mosquito species’ reported biodiversity in the south of France.

Patterns of genetic variation in native and non-native populations of European catfish Silurus glanis across Europe

Fri, 21 Apr 2023 16:31:45

de Paul Castagné, Ivan Paz-Vinas, Stéphanie Boulêtreau, Jessica Ferriol, Geraldine Loot, Charlotte Veyssière, Robert Arlinghaus, Robert Britton, Marlène Chiarello, Emili Garcia-Berthou, et al.
In Biodiversity and conservation, Online April (April, 2023)
En ligne : link.springer.com[...]

Biological invasions are a major component of global change worldwide. But paradoxically, an invasive species might also have threatened populations within its native range. Designing efficient management policies is needed to prevent and mitigate range expansions of invasive alien species (IAS) in non-native areas, while protecting them within their native range. Characterizing genetic variation patterns for IAS populations and deciphering the links between their native and introduced populations is helpful to (i) assess the genetic state of both native and non-native populations, (ii) reveal potential invasion pathways, (iii) define IAS management strategies in invaded areas, and (iv) identify native populations requiring conservation measures. The European catfish (Silurus glanis) is the largest European predatory fish. Introduced since the seventies from Eastern to Western Europe, it has colonized many waterbodies. Yet, little is known about the genetic status of non-native populations and the invasion pathways used by the species. Besides, some native populations are threatened, requiring conservation actions. Here, we describe current patterns of genetic variability of native and non-native S. glanis populations across Europe. Using microsatellite markers, we first assessed genetic variation within and between native and non-native populations. Second, we performed genetic clustering analyses to determine the genetic structure of multiple catfish populations across Europe and highlight their potential links. We revealed that native populations are more genetically diverse than non-native populations, and highlight complex introduction pathways involving several independent sources of introduction, which likely explain the invasion success of this large predatory fish across western Europe.

34 - Avril, 2023 (Bulletin de L'Envol des Chiros)

Mon, 14 Apr 2025 16:14:17

34 - Avril, 2023
Bulletin de L'Envol des Chiros, 34 (Avril, 2023)

Sommaire :

Actualités nationales
o L'atlas des Chiroptères de France / Rencontres inter-associatives médiation faune sauvage du 1er et 2 décembre 2022
o Actes de la XVIIIème Rencontre Nationale Chauves-souris de la SFEPM
o Première année du projet AMI Surveillance nationale du Minioptère de Schreibers

Actualités régionales
o Rhinolophe euryale et cas de mortalité massive intentionnelle dans une cavité en Gironde (33)
o Premières observations en groupe pour le Minioptère de Schreibers en région Centre-Val de Loire
o Rénovation des maisons individuelles et chauves-souris / Equipement d'une nouvelle femelle allaitante
o Recherche d'arbres-gîtes et de terrains de chasse de Chiroptères forestiers dans le massif forestier de Crécy-en-Ponthieu (80) et le Beauvaisis (60)
o Évolution sanitaire des arbres-gîtes en Corse
o Nouveau gîte de reproduction pour le Murin de Capaccini / Découverte du Murin cryptique en Camargue
o Opération Refuge pour les chauves-souris dans un petit coin de paradis dans le Var
o Comptages hivernaux mutualisés avec les spéléologues du Gard et observations remarquables de murins à oreilles échancrées
o « Chauves-souris, un regard francilien » Compte-rendu des premières rencontres chiroptérologiques d'Île-de-France

Actualités européennes
• 26ême Réunion du Comité Consultatif d'Eurobats (Vidéoconférence 9-11 mai 2022)

La reproduction de l’Épervier d’Europe Accipiter nisus en Camargue (sud de la France)

Sat, 18 Mar 2023 19:15:13

de Yves Kayser
In Nos Oiseaux, 551 (March, 2023), 39-49

La reproduction de l’Épervier d’Europe a été étudiée en Camargue sur 19 sites entre 1988 et 2010. Cette étude a permis de cerner différents aspects de la nidification et du régime alimentaire de ce rapace, qui sont comparables à ceux décrits dans d’autres travaux réalisés en Europe.

Factors driving larval abundance and adult size of the threatened Lestes macrostigma (Odonata): keys for water management and habitat restoration

Mon, 27 Feb 2023 15:20:41

de Philippe Lambret, Martin Jeanmougin, Robby Stoks
In Journal of Insect Conservation, 27 (February, 2023)
En ligne : link.springer.com[...]

Freshwater insects have dramatically declined during the last decades. Lestes macrostigma is a damselfly of temporary brackish ponds, and is threatened in Europe. Better understanding its larval ecological requirements is imperative to inform conservation management measures and habitat restoration programs. We studied in a set of 33 temporary ponds the effect of 14 biotic and abiotic variables (including hydroperiod, pond surface area, water salinity, oviposition plant availability and predator relative abundance) on L. macrostigma larval abundance and adult size at emergence. Contrarily to our expectations, salinity level and oviposition plant availability did not drive the species larval abundance. Instead, the later the flooding date of the pond in autumn/winter the higher the larval abundance in the next spring. This effect seemed mediated by the aeshnid dragonfly larvae, as the size and relative abundance of these predators were lower in later flooded ponds. Larval abundance of L. macrostigma also increased with decreasing pond surface area. Lestes macrostigma adults tended to be bigger when they emerged from ponds with higher water levels, likely because deeper waters have lower water temperatures; this larger size may positively affect adult lifespan and fecundity. Our results contribute to explaining the species strong inter-annual variation in population abundance and further illustrate the threat of artificial early flooding of ponds for Mediterranean species.

Les oiseaux nicheurs rares et menacés en France en 2021

Tue, 23 May 2023 17:45:53

de Gwenael Quaintenne, Arnaud Béchet, Maurice Benmergui, Hervé Bergère, Bernard Cadiou, Pierre Camberlein, Virginie Couanon, Fabrice Croset, Emmanuelle Csabai, Gérard Debout, et al.
In Ornithos, 30(1) (Janvier- Fevrier, 2023), 1-41

National wetland mapping using remote-sensing-derived environmental variables, archive field data, and artificial intelligence

Fri, 10 Feb 2023 17:39:52

de Sébastien Rapinel, Léa Panhelleux, Guillaume Gayet, Rachel Vanacker, Blandine Lemercier, Bertrand Laroche, François Chambaud, Anis Guelmami, Laurence Hubert-Moy
In Heliyon, 9(2) (February, 2023), 17
En ligne : www.cell.com[...]

While wetland ecosystem services are widely recognized, the lack of fine-scale national inventories prevents successful implementation of conservation policies. Wetlands are difficult to map due to their complex fine-grained spatial pattern and fuzzy boundaries. However, the increasing amount of open high-spatial-resolution remote sensing data and accurately georeferenced field data archives, as well as progress in artificial intelligence (AI), provide opportunities for fine-scale national wetland mapping. The objective of this study was to map wetlands over mainland France (ca. 550,000 km2) by applying AI to environmental variables derived from remote sensing and archive field data. A random forest model was calibrated using spatial cross-validation according to the precision-recall area under the curve (PR-AUC) index using ca. 135,000 soil or flora plots from archive databases, as well as 5 m topographical variables derived from an airborne DTM and a geological map. The model was validated using an experimentally designed sampling strategy with ca. 3000 plots collected during a ground survey in 2021 along non-wetland/wetland transects. Map accuracy was then compared to those of nine existing wetland maps with global, European, or national coverage. The model-derived suitability map (PR-AUC 0.76) highlights the gradual boundaries and fine-grained pattern of wetlands. The binary map is significantly more accurate (F1-score 0.75, overall accuracy 0.67) than existing wetland maps. The approach and end-results are of important value for spatial planning and environmental management since the high-resolution suitability and binary maps enable more targeted conservation measures to support biodiversity conservation, water resources maintenance, and carbon storage.

Exploring the speciation continuum of slow worms: location and extent of the Anguis fragilis/veronensis hybrid zone in southeastern France

Thu, 26 Jan 2023 15:09:13

de Christophe Dufresnes, Patricia Sourrouille, Anthony Olivier, Jean-Marie Ballouard, Marie-France Leccia, Rémi Tiné, Marc Cheylan, Maxime Le Henanff, Jean Nicolas, Sébastien Caron, et al.
In Amphibia-Reptilia, Online (January, 2023), 1-13
En ligne : brill.com[...]

With five currently recognized species that form several secondary contact zones, slow worms (Anguidae: Anguis) offer a valuable model to study the fate of evolutionary lineages in the face of hybridization and genetic introgression. The relationships between the Western Slow Worm Anguis fragilis and the Italian Slow Worm Anguis veronensis are particularly puzzling. Their respective distributions remain poorly known on the edges of their parapatric ranges, as both species lack external differentiation. Contra earlier mitochondrial phylogenies, new phylogenomic inferences have shown that A. fragilis and A. veronensis are sister taxa, thus casting doubts on their specific status. In this study, we analyze the A. fragilis/veronensis transition in southeastern France, based on one mitochondrial (ND2) and two nuclear (PRLR and HA1) genetic markers in 81 specimens from 61 localities. The ranges of A. fragilis and A. veronensis roughly extends northwest and southeast of the Rhône-Durance valleys, respectively, with clear signs of introgressive hybridization in the areas of contact (notably the eastern parts of the lower Rhône valley). Based on the three molecular markers analyzed, gene flow does not seem to reach outside the narrow hybrid zone, which likely indicates (incomplete) intrinsic reproductive isolation. Hence, we provisionally suggest maintaining A. veronensis as a separate species from A. fragilis. More generally, patterns of genetic divergence, external differentiation, and hybridization (both historical and contemporary) in Anguis ssp. supports a speciation continuum spanning from cryptic, genetically compatible alloparapatric lineages to phenotypically distinct, deeply diverged and fully reproductively isolated taxa able to coexist in sympatry.

Invasives (DL 2023)

Tue, 21 Oct 2025 16:48:15

de Céline Curiol
Arles : Actes Sud, DL 2023, 1 vol. (274 p.) ("Mondes sauvages")

"Ma bouche était maintenant grande ouverte et dès lors mon cou s'allongea d'une façon qui me parut inquiétante et démesurée, amenant mon visage à l'orée des petites feuilles charnues, mes lèvres bientôt touchant leur glacis, mon nez respirant de près un parfum vaseux et herbacé, jusqu'à ce que j'éprouve, sur ma langue, une fra^cheur sirupeuse, un goût de verdure légèrement amère, de haricots verts crus, de persil léger." Dans la réserve des Marais du Vigueirat, où Céline Curiol se restrouve en immersion solitaire sur une période d'un an, l'invasive jussie est partout, au point de hanter ses rêves. Au fil de rencontre avec tout un écosystème de plantes, d'animaux, de femmes et d'hommes, c'est le paradoxe de la protection de la nature que l'écrivain explore : pour préserver les espèces patrimoniales, les humains doivent déployer des efforts démesurés bien loin de la spontanéité supposée du sauvage. Avec sensibilité et force, Céline Curiol raconte une expérience extraordinaire tissée d'étonnements, d'enthousiasmes, de craintes et de doutes, et interroge les concepts de nature et d'invasion qui orientent nos rapports avec tout milieu. Une épopée vers l'intime métamorphose d'une écrivaine ainsi qu'à travers une Camargue inédite, très loin des clichés touristiques, et d'autant plus attachante ...
Au terme d'une résidence d'un an dans une cabane nichée au coeur des marais du Vigueirat, en Camargue, l'autrice propose le récit d'un changement de milieu qui brouille les pistes entre nature et culture.

Mas de la Cure : mise à jour de l’inventaire floristique (2023)

Fri, 12 Sep 2025 16:13:41

de Hugo Fontes
Arles : Tour du Valat, 2023, 26

Le domaine du Mas de la Cure accueille une grande diversité de milieux naturels remarquables et originaux localement : montilles, marais permanents et temporaires, boisements, prairies, milieux halophiles, etc. La flore y est diversifiée et riche en espèces à forte valeur patrimoniale. Si ces espèces ne semblent pas directement menacées, il convient de prendre en compte leur présence et leurs exigences écologiques afin de favoriser leur persistance, notamment en lien avec la gestion de l’eau. Certaines espèces exotiques envahissantes méritent d’être surveillées, voire contrôlées, afin que leur impact reste le plus faible possible sur les espaces naturels. Au regard des dates de prospections déjà réalisées, des inventaires estivaux pourraient peut-être permettre l’identification d’espèces à enjeux nouvelles pour le domaine

Gestion du site des étangs et marais des salins de Camargue. Bilan des activités de la Tour du Valat. Année 2022. (2023)

Fri, 12 Sep 2025 16:13:33

de Tour du Valat
Arles (FRA) : Tour du Valat, 2023, 72

Note technique : besoins d’adaptation de l’outil GAMELag aux lagunes oligo-mesohalines (2023)

Wed, 29 Jan 2025 15:10:38

de Columba Martínez-Espinosa, Olivier Boutron, Annie Fiandrino
Le Sambuc, Arles : Tour du Valat, 2023, 26

Cette note technique présente un bilan des modifications qu’il faudrait apporter à l’outil de modélisation GAMELag, initialement développé pour les lagunes poly- et euh-alines, pour qu’il soit applicable aux lagunes oligo- et méso-halines.

Conservation de la biodiversité dans les territoires : appréhender les dynamiques (2023)

Wed, 22 Jan 2025 16:14:44

de Cecile H. Albert, Francois Sarrazin, Aurelie Delavaud, Lydie Doisy, Benoît Geslin, Véronique Gouraud, Anna Gourlia, Patrick Grillas, Fanny Guillet, Stéphanie Huc, et al.
2023, 1 vol. (119 p.)
En ligne : amu.hal.science[...]

Comment aller vers une meilleure prise en compte des dynamiques de biodiversité et de territoires dans les problématiques de conservation et d'aménagement ? Comment articuler les deux ? Découvrez au travers de ce document, les principales conclusions et pistes de recherche issues d'un Club « recherche-action » de la FRB. En croisant leurs visions et pratiques, décideurs, entrepreneurs, gestionnaires et chercheurs se sont notamment intéressés à la naturalité, à la séquence « Éviter, réduire, compenser » et aux métriques de dynamiques de biodiversité. Ils ont échangé autour d'exemples de mise en oeuvre dans différents types d'écosystèmes, et pour des niveaux d'anthropisation variables. 15 fiches présentent ainsi des retours d'expérience, côté « recherche » et /ou « action ».

Sommaire :
- Territoire(s), mais de quoi parle-t-on ?
- Les dynamiques de biodiversité : de l'état aux processus
- Les enjeux des politiques publiques et le cadre réglementaire : des points de friction
- Quelles prises en compte des dynamiques par les acteurs ?
- Quelles approches scientifiques pour répondre à ces enjeux ?
- Vers des indicateurs plus adaptés...
- Conclusion
- Fiches Renaturation des anciens salins de Camargue pour mieux s'adapter au changement climatique Patrick Grillas (LPO), Brigitte Poulin (Tour du Valat)
- Les nouvelles modalités de compensation intègrent-elles les dynamiques de biodiversité ? Brian Padilla (MNHN), Fabien Quetier (Biotope)
- Mieux prendre en compte les continuités écologiques dans les projets d'aménagement, notamment dans la séquence Éviter, réduire, compenser Sylvie Vanpeene (Inrae), Simon Tarabon (Université d'Avignon)
- Les limites écologiques, juridiques et politiques de la séquence ERC Fanny Guillet (MNHN), Brian Padilla (MNHN)
- La méthode Merci-Cor : de l'évaluation des impacts au dimensionnement de la compensation écologique en milieux coralliens Mathieu Pinault (GIE Marex)
- Création, en Normandie, du Programme régional d'espaces en libre évolution. Lydie Doisy (CEN de Normandie)
- Solutions fondées sur la nature en milieu marin : exemple d'éco-conception des mouillages côtiers Sylvain Pioch (Université de Montpellier 3)
- Mettre en oeuvre la séquence éviter réduire compenser à l'échelle d'un département : le cas de la Drôme Céline Moutet (Conseil départemental de la Drôme)
- La biodiversité dans les projets d'énergies renouvelables Anna Gourlia (Changeons notre Vision de l'Energie)
- Prendre en compte les abeilles sauvages dans la protection des pollinisateurs Benoît Geslin (Aix-Marseille Université) -81 Revégétaliser les montagnes alpines avec des semences issues d'espèces sauvages d'origine locale Stéphanie Huc (Conservatoire botanique national alpin)
- Le Pavillon Vendôme : un parc écologique à la française Cécile Albert (CNRS), Patrick Pot et Didier Pauner ( Ville d'Aix-en-Provence)
- Le réseau Frene : la libre évolution comme choix de gestion durable Frédérique Zelmire (Office national des forêts)
- Comprendre la dynamique des peuplements aquatiques au voisinage des aménagements de production d'électricité Véronique Gouraud, Anthony Maire et Laurence Tissot (EDF R&D)
- L'équarrissage naturel de grands animaux : une solution fondée sur la nature source de biodiversité Thierry Lecomte (Conservateur de la réserve naturelle des Courtils de Bouquelon)

Méthode d’évaluation de l’état de conservation des « Lagunes côtières » d’intérêt communautaire (UE 1150) : étude cartographique mutualisée « Surface des herbiers » (indicateur n°3) : marché n° 615854 (2023)

Fri, 14 Jun 2024 15:05:31

de i-Sea
[S.l.] : Office français de la biodiversité; Pôle-relais lagunes méditerranéennes, 2023, 72
En ligne : pole-lagunes.org[...]

L’Office Français de la Biodiversité (OFB) pilote le projet Life Marha 2018-2025 (LIFE 16 IPE FR001), possédant une action centrée sur l’évaluation de l’état de conservation des habitats marins (action D1). Dans le cadre du projet et de cette action, le consortium Pôle-relais lagunes méditerranéennes, constitué de la Tour du Valat, du Conservatoire d’Espaces Naturels d’Occitanie et de l’Office de l’Environnement de la Corse, accompagne et coordonne les évaluations de l’état de conservation de l’habitat « Lagune côtière » sur l’ensemble de la façade méditerranéenne en régions Corse, Occitanie et Sud. Dans ce contexte, plusieurs structures animatrices des sites N2000 littoraux des régions Occitanie et PACA ont manifesté leur intérêt à réaliser une cartographie des herbiers de macrophytes des lagunes permanentes. Cette cartographie a pour but l’évaluation de la surface des herbiers, qui constitue l’indicateur n°3 de la méthode d’évaluation de l’état de conservation de l’habitat d’intérêt communautaire « Lagune côtière méditerranéenne ». L’OFB a fait appel à l’expertise d’i-Sea pour la production de la cartographie des herbiers de magnoliophytes sur 8 sites Natura 2000 : Canet, Salses Leucate, Vendres, Grand Bagnas, Thau, les Palavasiens, Camargue et Villepey. Pour traiter le besoin d’une cartographie actuelle et exhaustive des herbiers, des données d’imagerie satellitaire à très haute résolution spatiale, combinées à des observations terrain acquises par les structures gestionnaires des sites, ont été exploitées dans un processus de traitement automatique robuste, fiable et reproductible basé sur des méthodes de machine learning (procédé Biocoast). Cette étude tient compte de la densité (ou taux de recouvrement) des herbiers, de leur présence seuls ou en mélange avec d’autres espèces (algues vertes, rouges et/ou brunes). L’étude s’est déroulée sur 2 ans, avec des millésimes de réalisation cartographique différents selon les lagunes (Tableau 1). Le présent rapport rend compte : • Des méthodes de traitement et des données utilisées pour caractériser l’habitat d’intérêt sur les secteurs étudiés. • Des résultats obtenus concernant la typologie retenue ainsi que la précision de la cartographie de l’habitat naturel étudié sur les différents sites. Les zones d’intérêt concernées par l’étude (Figure 1) couvrent une surface totale de 27 528ha, réparties sur les 8 sites (Figure 2 à Figure 9) dont les surfaces individuelles sont détaillées dans le Tableau 1. La réalisation de la cartographie des lagunes des Palavasiens de l’année 2022 ayant une qualité insuffisante, un travail complémentaire a été effectué en 2023.

Ripisylve de Tourtoulen : suivi de la structure forestière 2023 (2023)

Fri, 14 Jun 2024 10:08:51

de Loic Willm, Patrick Grillas, Christophe Germain, Raquel Ambrosio
Le Sambuc, Arles : Tour du Valat, 2023, 77

La ripisylve de Tourtoulen, entièrement dominée par le Peuplier blanc depuis la dernière coupe des années 1940-1950, se trouve à une période charnière, à la fin du stade pionnier et le début d'une phase de mortalité des individus dominants, plus rapidement dans les conditions les plus hydromorphes. Si les objectifs de gestion établis en 1990 prônent la non-intervention, un suivi à long terme de la structure forestière a été mis en place à partir de 2003 notamment pour s'assurer de l'évolution de la structure du peuplement et du besoin éventuel d'interventions de gestion. Les résultats du suivi confirment la persistance de la mortalité des grands peupliers même si celle-ci reste assez progressive. Les espèces de bois durs (Laurier, Chêne vert) contribuent de plus en plus à la régénération et au sous-étage forestier. Elles devraient prendre une place beaucoup plus importante dans la strate dominante dans le futur si des crues catastrophiques ne viennent pas les détruire. Dans les zones plus basses où la mortalité des peupliers a formé des trouées, on observe malgré l'effet potentiellement freinant des Amorpha sur la régénération - l'installation d'un nouveau peuplement arborescent constitué principalement de Saule blanc. La ripisylve de Tourtoulen est donc dans une phase de transition dûe au vieillissement de sa strate dominante. L’évolution va vers une diversification du peuplement en fonction de la topographie et de l'hydromorphie et une réduction de la dominance du Peuplier blanc. Dans les parties basses la mortalité des Peupliers blancs continue et ces derniers sont remplacés par du Saule blanc (plus tolérant à l’inondation). Dans les parties hautes, les bois durs augmentent avec localement de très fortes densités de Laurier noble. Cette transition va probablement durer plusieurs décennies et conduira à une forte réduction de la dominance du Peuplier blanc et une plus grande diversité du peuplement.

L’adaptation de la Camargue au changement climatique (2023)

Fri, 8 Mar 2024 16:35:41

de Bruno Cinotti, Bruno Depresle, Christophe Patier
2023
En ligne : www.igedd.developpement-durable.gouv.fr[...]

Territoire fragile exposé aux conséquences du changement climatique, la Camargue présente des enjeux complexes, à l’image d’autres grands deltas, avec leurs contraintes hydrogéomorphologiques, les risques associés et les concurrences entre usages des territoires générant des conflits, notamment à l’occasion de crises.
Le changement climatique provoque l’élévation du niveau marin, dont les conséquences sur le trait de côte, la submersion marine, les intrusions salines et la gestion des eaux pèsent d’ores et déjà sur les activités et l’occupation du territoire. L’aggravation de cette situation est inscrite dans les prévisions climatiques, aux échéances de 2030, 2050 ou 2100. L’adaptation au changement climatique en Camargue apparait comme un thème de cristallisation d’oppositions d’intérêts locaux divergents entre lesquels les arbitrages sont compliqués par l’éclatement de la gouvernance du territoire qui rend les arbitrages des pouvoirs publics plus difficiles. Les modes de gouvernance sont une clé essentielle pour répondre à tous ces défis, exacerbés par le changement et les adaptations qu’il nécessite. Les conclusions de la mission s’inscrivent dans la ligne de celles du rapport rédigé en 2017 par l’IGF, l’IGA et le CGEDD sur la « recomposition spatiale du littoral » et dans les dispositions correspondantes de la loi Climat et résilience. L’élévation du niveau de la mer de 63 à 102 cm, anticipée d’ici 2100 selon le scénario tendanciel (SSP-8.5) du Groupe d’experts intergouvernemental sur l’évolution du climat (GIEC), signifie que la plus grande partie de la Camargue sera exposée à l’élévation de la mer à marée haute et lors des tempêtes. Dès lors que des mesures d’adaptation seront prises, cette situation ne rendra pas impossible son occupation et ses usages, lesquels seront néanmoins davantage contraints dans une mesure variable.

Eco-grazing and vegetation restoration in Mediterranean wetlands (2023)

Wed, 21 Feb 2024 15:53:46

de François Mesléard
Le Sambuc, Arles : Tour du Valat, 2023, 166
En ligne : s.42l.fr[...]

How can extensive grazing be used to restore Mediterranean wetlands according to the specific features and constraints of a site and the objectives being pursued? What approach should be adopted before implementing pastoral management? What choices should be made considering medium- and long-term possibilities? How can we ensure that current restoration work is running smoothly, so that we can change the methods being used as needed? How can we measure success? This document was written to help those facing these questions. It does not, however, offer a universal recipe or one that can be applied as is. Every site is unique and is characterised by numerous specificities, which means that grazing-based management that is appropriate for one site is unlikely to be so for another if it is reproduced identically.

Éco-pâturage et restauration de la végétation dans les zones humides méditerranéennes (2023)

Fri, 16 Feb 2024 11:22:38

de François Mesléard
Le Sambuc, Arles : Tour du Valat, 2023, 168
En ligne : tourduvalat.org[...]

Comment, sous différentes modalités, le pâturage extensif peut-il être utilisé pour la restauration de zones humides méditerranéennes en fonction du site, de ses spécificités et contraintes, des objectifs visés ? Quelle approche adopter avant de mettre en place une gestion pastorale ? Quels choix effectuer en fonction des possibilités à moyen et long terme ? Comment s’assurer du bon déroulé de la restauration en cours afin d’opérer, si nécessaire, d’éventuelles modifications dans les modalités choisies ? Comment en mesurer le succès ? Le document se propose d’accompagner la réflexion des personnes confrontées à ces questions. Il n’offre cependant pas de recette universelle ou applicable telle quelle. Chaque site est singulier, défini par de nombreuses particularités en raison desquelles une gestion par le pâturage adéquate pour un site a peu de chance de l’être pour un autre si elle est reproduite à l’identique.

Autour de la Méditerranée, ensemble pour les zones humides (2023)

Thu, 8 Feb 2024 11:47:03

de Patrick Blandin, Frédéric Ducarme, Damien Marage
Ivry-sur-Seine : Editions de l'Atelier, 2023

Évaluation de l'état de conservation de l'HIC (UE 1150) « Lagunes côtières » du site N2000 Camargue : indicateur I02 macrophytes (2023)

Tue, 16 Jan 2024 11:27:44

de Hugo Fontes, Nicolas Borel
Arles : Tour du Valat, 2023, 24 p.

L’objectif de la présente étude, coordonnée par le Pôle-relais lagunes méditerranéennes, financée par la Dreal PACA, est d’évaluer l’état de conservation d’un échantillon de lagunes du site Natura 2000 « Camargue » selon l’indicateur « Macrophytes ». Cet indicateur se base sur les communautés macrophytiques des lagunes et utilise :
• la structure des communautés végétales (abondance, composition et diversité floristique), qui renseigne sur le fonctionnement de la masse d'eau,
• la persistance dans le temps des espèces caractéristiques de l’habitat.
Sur le long terme, la mesure de cet indicateur pourra permettre d’avoir une vision de la trajectoire écologique des lagunes suivies.

Bulles de dialogue et cellules raster. Spatialiser les fonctions et le fonctionnement des zones humides par SIG dans le bassin Rhône-Méditerranée Corse (2023)

Tue, 16 Jan 2024 11:27:40

de Suzanne Catteau, Laurent Couderchet
Bordeaux, France : Université de Bordeaux I, 2023, 337
En ligne : www.theses.fr[...]

Les périmètres de zones humides font l’objet de tensions depuis plus d’une trentaine d’années. Comment dès lors penser la protection indépendamment de ces zonages ? L’Agence de l’Eau Rhône-Méditerranée-Corse propose de concevoir des supports de concertation territoriale basés sur des représentations raster, plutôt que vectorielles, permettant de traduire les fonctions de ces écosystèmes et la continuité de leur fonctionnement. À cette fin, une convention Cifre réunit l’Agence de l’Eau, la Tour du Valat et l’UMR Passages, trois institutions aux cultures scientifiques contrastées. Dans ce dispositif de recherche-action, je conçois différents prototypes pour répondre à la demande de l’Agence. Mes propositions initiales font apparaître des désaccords conceptuels entre les trois postures scientifiques des institutions partenaires. Le SIG provoque néanmoins un dialogue entre les sciences de l’ingénieur, les sciences de la conservation et les sciences critiques à l’origine de propositions transmises aux experts locaux, qui demandent à leur tour des ajustements adaptés à leurs pratiques. Les bulles de dialogue avec les différents interlocuteurs conduisent à une démultiplication des propositions techniques. Le SIG n’est ni neutre, ni factuel, il est utilisé par les experts alternativement comme outil d’autorité ou de dialogue. Le recours au SIG critique permet également d’identifier des jeux de pouvoir qui tiennent les élus locaux à l’écart du processus cartographique. C’est pourquoi une expérimentation propose la co-construction d’un prototype avec ce public pour une intégration plus fonctionnelle des zones humides dans les stratégies territoriales. L’ouverture de la boîte noire des modélisations permet une démystification de l’outil SIG et de la carte, replaçant les élus en position d’acteurs dans le dispositif.

Le Centre d’Ecologie de Camargue (2023)

Wed, 20 Dec 2023 15:41:16

de Jacques Blondel
2023, 3 p.

Histoire et épisodes cocasses du Centre d'écologie de Camargue créé par le CNRS au début des années 1970 racontés par le premier directeur du Centre, Jacques Blondel.

An illustrated guide to birds of the Camargue, the Crau and Mediterranean lagoons (2023)

Mon, 11 Dec 2023 15:25:19

de Cyril Girard, Jeanette Freyney, Alan Roy Johnson
Arles : Mediterraneus, 2023, 1 vol. (112 p.)

A clear, concise and richly illustrated field guide: indispensable for the amateur birdwatcher wishing to identify the principal species found around the wetland environments in and around the Camargue.
– Descriptions of typical habitat types found in the Camargue
– A general introduction to the world of birds: their systematics, evolution, feathers, migrations…
– 40 pages of detailed colour illustrations
- 181 detailed descriptions of bird species
– Detailed information on the ecology of each bird, along with its habitat and the dates that it can be observed
– Local maps to help you find your way to the main information centres

Guide illustré des oiseaux de Camargue, de Crau et du littoral méditerranéen (2023)

Mon, 11 Dec 2023 15:17:52

de Cyril Girard
5e éd. Arles : Mediterraneus, 2023, 1 vol. (112 p.)

Cette cinquième édition a fait l’objet d’une mise à jour complète des informations sur les espèces traitées. De nouvelles illustrations viennent agrémenter la description des espèces. L'ouvrage décrit ainsi 181 espèces d’oiseaux qui peuplent la Camargue, le littoral et les diverses zones humides méditerranéennes. La première partie est consacrée à une introduction générale sur les oiseaux, la migration, et les milieux naturels qu’ils fréquentent. Puis, sur 80 pages, chaque espèce est abondamment illustrée dans tous ses plumages (mâle, femelle, juvénile), et un texte vient parfaire la description et donne des éléments sur les mœurs de l’espèce, les dates propices à son observation et où l’observer. L’ouvrage s’accompagne de cartes pour découvrir les sites propices à l’observation et les coordonnées des structures de protection et de conservation situées autour de la Camargue.

Projet de cartographie nationale des milieux humides – Rapport méthodologique de la prélocalisation des milieux et des zones humides, de la cartographie des habitats et de l’évaluation des fonctions (2023)

Mon, 27 Nov 2023 11:31:59

de Sébastien Rapinel, Léa Panhelleux, Blandine Lemercier, François Chambaud, Guillaume Gayet, Anis Guelmami, Bertrand Laroche, Rachel Vanacker, Laurence Hubert-Moy
[S.l.] : Patrinat (OFB-MNHN-CNRS-IRD), 2023
En ligne : mnhn.hal.science[...]

Contexte et objectifs : face aux multiples enjeux associés à la gestion des milieux et zones humides, le besoin d'une carte nationale précise et exhaustive de ces écosystèmes est fréquemment exprimé. Dans ce contexte, les objectifs de cette étude sont de pré-localiser et caractériser les milieux et zones humides sur l'ensemble de la France métropolitaine afin de constituer un socle cartographique au 1 :10 000ème (c’est-à-dire avec une résolution spatiale de 5 m) à destination des parties prenantes de la gestion de ces milieux. L’approche mise en œuvre pour atteindre ces objectifs comprend trois volets : 1- la pré-localisation des milieux et zones humides sur toute la métropole ; 2- la cartographie des habitats semi-naturels et anthropiques des milieux humides sur 10 bassins versants tests ; 3- la production d’indicateurs fonctionnels dérivés d’images satellitaires sur les 10 bassins versants tests en concertation avec les collectivités locales. L’originalité de cette approche repose sur l’utilisation exclusive de données terrain et de télédétection ouvertes, le recours à l'intelligence artificielle et à l’expertise des auteurs de cette étude et acteurs territoriaux impliqués dans la gestion de ces écosystèmes. Volet 1 - Pré-localisation des milieux et zones humides sur toute la métropole : Ce volet opérationnel mobilise cinq variables environnementales caractérisant la topographie, le réseau hygrographique et le matériau parental (géologie). Des relevés terrain de sol et de flore ont été extraits de bases de données (BD) d'archives et combinés aux variables environnementales pour déterminer, par intelligence artificielle et expertise, la probabilité d’appartenance de pixels d’une résolution de 5 m aux milieux et zones humides ainsi que leur présence/absence avec un modèle random forest. La précision des cartes des milieux et zones humides a été quantifiée avec de données de terrain indépendantes, collectées en 2021 et 2022. La précision de la carte des milieux humides a ensuite été comparée à celle de 10 cartes existantes de milieux ou zones humides ayant une couverture mondiale, européenne ou nationale.

Emissions de gaz à effet de serre et stocks de carbone organique dans les sédiments d’un échantillon de zones humides en Camargue sur un gradient d’hydrologie et de salinité (2023)

Mon, 13 Nov 2023 17:02:41

de Patrick Grillas, Maite Martinez Eixarch, Samuel Hilaire, Arnaud Boisnard, Cyrille Thomas, Carles Alcaraz, Carles Ibáñez, Pere Masque Barri, Anna Lafratta, Paul Lavery, et al.
Lyon (FRA) : Agence de l'eau Rhône Méditerranée Corse, 2023, 91

Les émissions de deux gaz à effet de serre (GES), le méthane (CH4) et le protoxyde nitreux (N2O), et les stocks de carbone organique dans les sols ont été étudiés dans 10 zones humides et deux rizières représentatives de la gamme des conditions hydrosalines rencontrées en Camargue. Les principaux objectifs du projet étaient les suivants : - Évaluer les taux d'émission de CH4 et N2O, ainsi que le schéma temporel de ces émissions. - Déterminer les principaux facteurs environnementaux corrélés aux émissions de GES. - Déterminer l'effet du régime hydrologique et de la salinité sur les émissions de GES. - Evaluer les stocks de carbone organique sur une profondeur de 1m et les taux d’accumulation moyens Les teneurs en carbone organique trouvées dans les sédiments étaient très variables entre sites, comprises en surface entre 0,27% et 7,98% et convergentes vers des valeurs faibles (gamme 0,24 0,94%) à un mètre de profondeur. Ces teneurs en carbone organique dans les sols sont faibles comparées à de nombreux types de zone humide, probablement du fait des conditions hydrosalines (assèchement estival et présence de sel) peu favorables à la production primaire et facilitant la décomposition de la matière organique (oxydation des sols). Les vitesses moyennes d’émissions de méthane par station mesurées couvrent une gamme très large (-6,10-1 à 6,102 mg.m-2.h-1, moyenne : 6,84 ± 18,72 mg CH4.m-2.h-1). Les vitesses d’émissions de méthane sont faibles pour la plupart des stations mais atteignent sur certains sites des valeurs équivalentes ou supérieures à celles trouvées dans la littérature scientifique dans une large diversité de zones humides dans le Monde. Les vitesses d’émissions moyennes de N2O par station mesurées (3,1 ± 14,6 μgN2O.m-2.h-11) montrent une variation importante entre stations (gamme : -6,4 à 47 μg.m2.h-1). Cette gamme est moins grande que pour le méthane et peu de sites ont des émissions positives de N2O. Les vitesses d’émissions de gaz à effet de serre (GES) dans les rizières étaient significatives mais plus faibles que celles rencontrées dans la littérature scientifique. La gestion hydrosaline joue un rôle prépondérant dans les émissions de GES. Les apports d’eau douce en période estivale, favorisent une production primaire forte mais génèrent des conditions idéales pour la production de méthane (fortes températures, potentiel redox très bas, faible salinité, matière organique abondante). L’assèchement estival, correspondant au fonctionnement hydrologique naturel, maintien les sols oxydés pendant la période chaude et une salinité plus élevée défavorables à la méthanogénèse. Des vitesses d’émissions élevées ont été rencontrées ponctuellement sur certains sites, attribuées à une forte disponibilité de l’azote et une dénitrification incomplète. Dans un objectif de conciliation de la réduction des émissions de GES avec les usages et avec le maintien des activités économiques, la modification de la gestion hydrosaline pourrait au minimum s’appliquer dans les espaces protégés et dans le cadre de gestions dédiées aux activités de loisirs. Un assèchement estival des marais doux et peu salés permettrait de réduire très sensiblement les émissions de méthane. Des travaux complémentaires seraient nécessaires (1) pour mesurer les taux d’émissions de GES dans une gamme plus restreinte de conditions hydrosalines, en partenariat avec les acteurs du territoire dans la recherche de compromis de gestion, (2) pour mieux comprendre la microbiologie du sol (pour mieux appréhender les mécanismes biogéochimiques régissant les émissions GES) et notamment les interactions entre la méthanotrophie et la dénitrification en relation avec les usages.

Fiche 1 : Renaturation des anciens salins de Camargue pour mieux s’adapter au changement climatique (2023)

Mon, 2 Oct 2023 11:24:24

de Patrick Grillas, Brigitte Poulin
Paris : Fondation pour la recherche sur la biodiversité, 2023, 22-25

Conservation de la biodiversité dans les territoires. Appréhender les dynamiques (2023)

Mon, 2 Oct 2023 11:09:30

de Cécile Albert, Aurelie Delavaud, Doisy Lydie, Benoît Geslin, Véronique Gouraud, Anna Gourlia, Patrick Grillas, Fanny Guillet, Stéphanie Huc, Thierry Lecomte, et al.
Paris : Fondation pour la recherche sur la biodiversité, 2023, 119
En ligne : www.fondationbiodiversite.fr[...]

Comment aller vers une meilleure prise en compte des dynamiques de biodiversité et de territoires dans les problématiques de conservation et d’aménagement ? Comment articuler les deux ? Découvrez au travers de ce document, les principales conclusions et pistes de recherche issues d’un Club « recherche-action » de la FRB. En croisant leurs visions et pratiques, décideurs, entrepreneurs, gestionnaires et chercheurs se sont notamment intéressés à la naturalité, à la séquence « Éviter, réduire, compenser » et aux métriques de dynamiques de biodiversité. Ils ont échangé autour d’exemples de mise en œuvre dans différents types d’écosystèmes, et pour des niveaux d’anthropisation variables. 15 fiches présentent ainsi des retours d’expérience, côté « recherche » et /ou « action ».

Mise en œuvre de l’évaluation de l’état de conservation des lagunes côtières méditerranéennes (1150- 2) à l’échelle du site Natura 2000 ‘’Camargue’’ - 2023 (2023)

Mon, 2 Oct 2023 10:27:38

de Clara Lalauze
Arles (FRA) : Parc naturel régional de Camargue, 2023, 42
En ligne : pnr-camargue.n2000.fr[...]

La préservation et la conservation de la biodiversité et plus précisément des espèces et habitats naturels sont une urgente priorité des décennies à venir, notamment pour les services écosystémiques rendus (épuration de l’eau, contrôle des crues, stockage CO2…) mais également pour la richesse culturelle et patrimoniale. Les lagunes côtières méditerranéennes s’inscrivent dans cette dynamique puisqu’elles sont classées « habitat prioritaire » dans la liste des habitats de la Directive Habitat Faune et Flore (DHFF) de 1992. Les lagunes côtières méditerranéennes à l’étude dans ce rapport font partie de la zone Natura 2000 « Camargue » (classée ZPS et ZSC). Dans ce cadre là, l’état de conservation (EC) des lagunes doit être étudié et rapporté à l’échelle biogéographique tous les 6 ans pour la DHFF et à l’échelle du site Natura 2000 , tous les ans, à travers le Formulaire Standard de Données. L’EC des lagunes se définit à travers une méthodologie standardisée et selon 12 différents indicateurs dont 5 étudiés dans ce rapport : les espèces végétales exotiques envahissantes (EVEE), les espèces animales exotiques envahissantes (EAEE), la connectivité à la mer, la nature des berges et le fonctionnement hydrologique. L’EC de 9 des 16 lagunes d’intérêt est étudié en 2023 dans ce rapport. L’état de conservation global de chaque lagune sera normalement obtenu courant 2024. Cependant, il est d’ores et déjà possible de dire que 4 des 9 lagunes à l’étude ne présentent aucune perturbation pour les 5 indicateurs donnés, qu’aucune n’est colonisée par du cascail (EAEE), une seule est colonisée par des EVEE, les lagunes des EMSC (ancien salins) sont celles qui présentent le plus de perturbations (hydrologique, artificialisation des berges, connectivité à la mer) et enfin, les notes pour la connectivité à la mer sont hétérogènes sur le territoire. A l’échelle du site Natura 2000 , l’état de conservation global ne pourra être connu que l’année prochaine, quand l’EC du reste des lagunes aura été étudié. Cependant, même si l’EC est reporté à l’échelle du site entier, il est important de regarder l’EC de chaque lagune afin de définir des meilleures stratégies de gestion à l’échelle locale.

Rapport de restitution du projet MediCyn (2023)

Mon, 2 Oct 2023 10:27:31

de Antoine Gazaix, Hugo Fontes, Louise-Anne Audo, Pauline Rocarpin, Lisa Ernoul, Philippe Lambret
Arles (FRA) : Tour du Valat, 2023, 46

Le projet MediCyn, porté par le GPMM en partenariat avec la Tour du Valat, s’est fixé pour objectif de comparer sur deux sites (le Grand Clos et le Relai) trois modes de gestion hydraulique, revenant à tester un mode de gestion intermédiaire entre la gestion cynégétique et la gestion méditerranéenne. L'hypothèse était que cette gestion favorise la biodiversité et la valeur pastorale des milieux sans modifier de façon significative leur intérêt cynégétique. Pour tester cette hypothèse, des travaux ont été réalisés sur le Relai (création de mares et mise en place des trois modes de gestion) et sur le Grand Clos (aménagements permettant la mise en place d’une gestion intermédiaire au nord du site et le maintien d’une gestion cynégétique au sud). Les effets de ces trois modes de gestion ont été mesurés à travers différents suivis concernant des paramètres de milieux, les activités cynégétique et pastorale, et la biodiversité

Etude du succès d’éclosion des flamants roses (Phoenicopterus roseus) en fonction des sites de nidification à Aigues-Mortes (2023)

Mon, 25 Sep 2023 11:24:21

de Julie Itty
Pau, France : Université de Pau et des pays de l'Adour, 2023, 52

La Tour du Valat effectue, depuis 1954, un suivi de la reproduction de la colonie de flamants roses (Phoenicopterus roseus) dans les Salins du Midi en Camargue, unique lieu de nidification de cette espèce en France. Le suivi par observations à la longue-vue est possible grâce au marquage des flamants, qui se voient équipés d’une bague en plastique avec un code alphanumérique lisible à 300m et d’une bague en métal. Les flamants nichent l’accoutumée sur des îlots et une digue mais il a été remarqué, en 2022 et 2023, que ces oiseaux se reproduisaient sur un nouveau site : le substrat gypseux (constitué d’un minéral appelé le gypse) qui affleure de l’étang. Seulement, cette stratégie semblait comporter des risques car les œufs peuvent être facilement submergés par l’eau. Les analyses ont permis, dans un premier temps, de montrer que la propension des individus à nicher sur le gypse dépendait de leur âge et de leur origine. Ensuite, il s’est avéré que le succès d’éclosion des flamants ne dépendait finalement pas du site de nidification. Mais les analyses devront être poursuivies en même temps que le suivi originel, afin de vérifier ces résultats. Enfin, des propositions de gestion du site ont été présentées.

Evaluation du succès de création de mares temporaires en Camargue Ce qui est restauré et ce qui ne l’est pas (2023)

Fri, 22 Sep 2023 15:37:26

de Hugo Fontes, Patrick Grillas, Thierry Dutoit, Antoine Gazaix, François Mesléard
Arles (FRA) : Tour du Valat, 2023, 131

L’objectif de la présente étude est de réaliser une évaluation du succès de la création de 25 mares temporaires en Camargue, en comparant ces écosystèmes à un ensemble varié de mares de références et en intégrant leur variabilité temporelle. Cette évaluation analysera notamment ce qui a été restauré et ce qui ne l’a pas été.

Influence des conditions environnementales sur la dynamique de succession des communautés végétales de mares temporaires méditerranéennes (2023)

Fri, 22 Sep 2023 15:37:16

de Louise-Anne Audo
Clermont-Ferrand (FRA) : Université Clermont Auvergne, 2023, 54

Dans le cadre du projet MediCyn, porté par le Grand Port Maritime de Marseille (GPMM), la Tour du Valat (institut de recherche pour la conservation des zones humides méditerranéennes) a pour but d’améliorer l’état de conservation et la valeur écologique de deux sites à enjeux de conservation (le Grand Clos et le Relai) de la couronne agri-environnementale du GPMM. Un des objectifs fixés afin d’atteindre ce but a été l’étude de l’influence de la gestion et de certains facteurs environnementaux non maîtrisés sur la succession des communautés végétales des mares temporaires créées sur le site du Relai. La dynamique de la végétation a été comparée entre trois modes de gestion hydraulique. Pour cela on réalise des relevés de végétation sur le terrain ainsi qu'une analyse de la banque de graine de chaque mare. Les données obtenues ont été étudiées et comparées grâce à des analyses multivariées. Une comparaison des espèces présentes dans les relevés a complété l’analyse. Les résultats font ressortir deux facteurs environnementaux structurants pour la végétation des mares : la salinité et l'hydropériode. Ces deux facteurs sont à relier à la gestion des mares qui joue un rôle dans l’expression et la répartition des communautés végétales. On observe des communautés de mares temporaires dans les mares à gestion cynégétique. En revanche, on observe aussi des communautés typiques des milieux lagunaires dans les mares à gestion intermédiaires et méditerranéennes.

Fiches descriptives des « habitats » en milieu lagunaire méditerrannéen (2023)

Fri, 22 Sep 2023 15:37:10

de Vincent Ouisse, Arthur Miramont, Touria Bajjouk, Nicolas Cimiterra, Valerie Derolez, Hugo Fontes, Anaïs Giraud, Sandrine Vaz
[S.l.] : Ifremer, 2023, 36

Ces fiches « habitats » reprennent les caractéristiques principales des 15 groupes d’habitats décrits dans les milieux lagunaires méditerranéenns français des habitats. Ceux-ci sont répréenté dans l’Atlas cartographique des habitats. Ces fiches s’accompagnent d’un guide décrivant le contexte, les méthodes utiilisées pour définir les habitats et l’analyse des données de distribution de ces habitats.

Restauration du Marais de Petit Badon. Initiation du projet, travaux et résultats des deux premières années de suivi (2023)

Fri, 22 Sep 2023 15:36:36

de Hugo Fontes, Anthony Olivier, Yves Kayser, Emilie Laurent, Marion Lourenço, Olivier Pineau, Pauline Rocarpin, Loic Willm, Patrick Grillas
Arles : Tour du Valat, 2023, 71

Le site du Petit Badon se situe au sud-est de l’ile de Camargue, sur le cours d’un ancien bras du Rhône, celui du Bras de Fer. Le site prend place dans un contexte paysager agricole et de marais, à environ 11km de la mer au sud et à 3,5km à l’est du Rhône actuel. Le terrain est la propriété de la SCA du Domaine du Petit Badon dont les propriétaires sont à l’origine du projet de création de ce marais. Le site, avait été aménagé en exploitation agricole avec une production céréalière (riz notamment) depuis le XIXème siècle jusque dans les années 2000 et a ensuite été pâturé par des chevaux. L'activité agricole avait été certifiée Agriculture Biologique depuis le début des années « 90 » (entre 1990 et 1993). A la demande de la SCA du Domaine du Petit Badon, un projet de création de marais a été initié en 2017 et confié à la Fondation Tour du Valat.
Les objectifs de ce projet sont les suivants :  Recréer un marais temporaire (14 ha) sur une friche agricole avec un fonctionnement proche du cycle hydrologique méditerranéen ;  Reconstituer des habitats favorables pour la biodiversité, notamment méditerranéenne (flore, oiseaux d’eau, odonates, amphibiens, reptiles aquatiques, ...) ;  Etudier la dynamique de reconstitution de l’écosystème ;  Disposer d’un terrain de démonstration pour la restauration des zones humides à des fins pédagogiques et scientifiques. Les opérations de création rentrent dans le cadre conceptuel de l’écologie de la restauration au sens large. Ici, le modèle de référence est un marais temporaire, écosystème bien connu en Camargue, largement détruit par le développement de l’agriculture au cours du siècle dernier et à forte valeur patrimoniale. Le présent projet ne peut cependant pas être qualifié de restauration stricto sensu car il ne vise pas à retrouver la ou les écosystèmes présents tel qu’ils étaient avant leur destruction par l’agriculture, mais s’en inspirent pour concevoir le projet de création.

Restaurer les zones humides méditerranéennes : Le nouveau guide du décideur politique pour une gestion durable et une restauration des écosystèmes d'ici 2030 (2023)

Mon, 18 Sep 2023 17:57:05

de Wetland-Based Solutions initiative, Bruno Boz, Giuseppe Dodaro, Lisa Ernoul, Francesca Etzi, Javier J. Forray, Teresa Gil, François Mesléard, Alessio Satta, Vania Statzu, et al.
[S.l.] : The Mava Foundation, 2023, 62
En ligne : www.wetlandbasedsolutions.org[...]

La restauration des zones humides méditerranéennes est un nouveau manuel à l'usage des décideurs politiques pour la gestion durable et la conservation de l'eau d'ici à 2030. Il s'agit d'un résultat des partenariats intersectoriels partageant le savoir-faire dans le cadre de la Décennie des Nations Unies pour la restauration des écosystèmes 2021-2030. Coordonné par le WWF Espagne, MedWet et la Tour du Valat en partenariat avec l'initiative PIM et MEDSEA, le manuel fait partie de l'initiative Wetlands-Based Solutions et est financé par la Fondation MAVA. Les lecteurs y trouveront des conseils sur l'élaboration et la mise en œuvre d'initiatives de restauration des zones humides ainsi que des critères de sélection des sites. Des experts dans le domaine partagent leurs expériences et études de cas de restauration intégrée utilisant des solutions.

Etude de l’impact des contaminants et de caractéristiques individuelles sur différents biomarqueurs physiologiques chez la Cistude d’Europe (Emys orbicularis) (2023)

Mon, 11 Sep 2023 17:26:18

de Sidonie Girard
[S.l.] : AgroParisTech Paris, 2023, 50

Les zones humides, espaces sensibles et réservoirs de biodiversité, sont contaminées par des polluants d’origine variée. Les effets des contaminants sur la biodiversité restent encore peu ou mal connus et notamment les effets sublétaux sur la physiologie. Une meilleure évaluation de ces effets est primordiale et requiert l’utilisation de biomarqueurs pertinents à différentes échelles biologiques. L’objectif de cette étude est d’étudier les liens entre l’exposition aux pesticides et des marqueurs physiologiques sanguins chez 9 populations de Cistude d’Europe (Emys orbicularis), des départements des Bouches-du-Rhône, Gironde et Indre. La Cistude d’Europe est une espèce ectotherme longévive d’eau douce potentiellement indicatrice de la contamination des zones humides. Plusieurs marqueurs sont étudiés : le nombre total de leucocytes et la formule leucocytaire (nombre d’éosinophiles et ratio hétérophiles/lymphocytes). Les variations de ces marqueurs ont été examinées entre les 9 populations, entre les sexes et en fonction de la masse. Nous avons pu mettre en évidence un effet significatif de ces différents paramètres, notamment un dimorphisme entre mâles et femelles. Dans un second temps, les liens avec la contamination en pesticides dans le plasma des individus ont été étudiés pour 5 des 9 populations. Les variations des marqueurs ne sont pas expliquées par la contamination des individus, à l’exception du compte total de leucocytes, plus faible chez un individus contaminé par au moins deux pesticides que chez un individu non contaminé.

Contamination du milieu et niveau plasmatique de pesticides chez la Cistude d’Europe, Emys orbicularis : une étude comparative entre cinq populations en Camargue (2023)

Mon, 11 Sep 2023 16:14:01

de Mickaël Charriot
[S.l.] : Université de La Rochelle, 2023, 47

Les écosystèmes aquatiques sont exposés à de nombreux polluants, et notamment aux pesticides, fortement utilisés en agriculture. Les risques pour les espèces non-cibles, et particulièrement sur les reptiles, restent très peu évalués. La Cistude d’Europe, Emys orbicularis, est une espèce de tortue aquatique, sédentaire vivant dans les rivières et marais, longévive, omnivore, se nourrissant d’Ecrevisse de Louisiane. Le projet CISTOX vise à évaluer l’exposition aux pesticides chez cette espèce en fonction du contexte environnemental, agricole et hydraulique de sites d’échantillonnage ainsi que les effets à différents niveaux physiologiques et écologiques. La première année du projet (2022) s’est focalisée sur la Camargue, une région particulièrement concernée par l’agriculture et les rejets d’importantes quantités de pesticides dans l’environnement. Cette étude vise à (i) explorer les différences de contaminations et d’occurrence aux résidus de pesticides entre les sites d’étude, (ii) étudier la contamination de l’environnement (eau, sédiments) et la mettre en lien avec celle des cistudes, (iii) expliquer les variations interindividuelles des niveaux de pesticides circulant dans le sang en fonction du sexe, des stades d’usure du plastron (âge) et de la condition corporelle des individus. Les résultats de cette étude montrent que les cistudes vivant dans les canaux de drainage sont plus contaminées que les cistudes capturées dans les canaux d’irrigation. Cette contamination est principalement due à un herbicide, la bentazone, fortement utilisé en riziculture. Aucun effet du stade d’usure du plastron (proxy de l’âge), de la condition corporelle ou du sexe des individus n’a été observé sur la contamination des cistudes. Une corrélation nette entre la contamination de l’eau et celle des cistudes a été observée : plus l’eau est contaminée plus le nombre de cistudes contaminées est grand. Cette étude met ainsi en avant la voie principale d’exposition au pesticide : l’eau. L’alimentation ne semble pas être une voie de contamination car aucune Ecrevisse de Louisiane n’est contaminée par la bentazone. Le projet se poursuit actuellement avec la recherche des effets potentiels à différentes échelles biologiques, ainsi que le prélèvement d’échantillons dans d’autres régions pour affiner les comparaisons entre les sites.

Optimiser la plantation de haies en Camargue dans le cadre de la conservation de la Glaréole à collier (Glareola Pratincola) (2023)

Fri, 7 Jul 2023 17:58:46

de Sébastien Thomas
Marseille, France : Université Aix-Marseille, 2023, 41

L’objet de ce mémoire est de préciser la corrélation négative qui semble exister entre la fermeture du paysage par les haies et l’installation de colonies de Glaréoles à collier en s’intéressant à deux éléments : • la présence ou l’absence de colonies de Glaréoles à collier sur des sites identifiés comme potentiellement favorables à sa nidification ; • la taille des colonies mesurée en nombre de couples nicheurs. En fonction des résultats, nous discuterons de la pertinence d’intégrer à CAMGIS des critères permettant la prise en compte dans le choix des emplacements les plus propices à la plantation de haies des besoins écologiques des espèces, telle la Glaréole à collier, qui recherchent des habitats ouverts pour nicher.

Rapport d'activité 2022 (2023)

Fri, 9 Jun 2023 18:28:38

de Pôle-relais lagunes méditerranéennes
Arles (FRA) : Tour du Valat, 2023, 22
En ligne : pole-lagunes.org[...]

Les parasites au coeur de la biodiversité modelée par les activités humaines (2023)

Fri, 26 May 2023 19:14:10

de Marion Vittecoq
Montpellier : Université de Montpellier, 2023, 123

Marion Vittecoq a développé ses recherches depuis sa thèse, soutenue en 2012, jusqu’à aujourd’hui sous l’angle de la conservation des zones humides, écosystèmes associant grande biodiversité, forts liens avec les activités humaines et grande vulnérabilité. L'objectif, in fine, de ces recherches est de contribuer à concilier dans ces écosystèmes conservation et santé publique et vétérinaire. Les travaux de M. Vittecoq suivent depuis douze ans la même ligne, toutefois, elle l’aborde à travers de multiples modèles d’hôtes et de parasites. Toutes les questions auxquelles elle s’intéresse sont liées à la dynamique des communautés hôtes-parasites au sein des zones humides dans le temps, l’espace et à l’épreuve des activités humaines. Actuellement elle développe, avec ses partenaires, deux grands projets associant suivis à long-terme individuels d’histoire de vie d’animaux longévifs et caractérisation de leur exposition à différents polluants et pathogènes afin de comprendre les impacts combinés de ces différentes pressions. Un premier projet, mené à l’échelle nationale est centré sur la cistude d’Europe et les milieux d’eau douce, le second se déploie à l’échelle de l’Ouest du bassin Méditerranéen et est centré sur le goéland leucophée et les milieux littoraux. M Vittecoq travaille par ailleurs sur le rôle de la faune sauvage dans la dynamique des antibiorésistances en étudiant ces bactéries chez les rongeurs, les oiseaux et dans l’eau, principalement en Camargue. Elle s'’intéresse également à la diversité des trématodes dans le delta du Rhône et aux facteurs associés à leur transmission chez la faune sauvage et les bovins. L’originalité de l’approche choisie dans ces différents travaux est de coupler l’étude de différentes pressions (pollution, multiples pathogènes, gestion du milieu par les humains) avec les suivis à long-terme des espèces hôtes et de leur milieu.

Realignment Strategy in the Rhone Delta: Consequences for Geomorphological Dynamics in a Context of Climate Change (2023)

Fri, 26 May 2023 19:14:03

de Cecile Puigserver, Francois Sabatier, Philippe Larroude, Olivier Boutron
[S.l.] : World Scientific, 2023, 2293-2306
En ligne : www.worldscientific.com[...]

The Former Saltworks, located in the south-eastern part of the Rhone delta with an area of about 6500 ha was acquired by French State between 2008 and 2012. A large-scale realignment strategy has been implemented: the sea-dikes protection of the former salt production site is no longer maintained. This induced since 2008 a complex geomorphological dynamic. In this paper we aim to qualitatively estimate the specific contribution of storms on the dynamics of the site’s connections with the sea and of the beaches areas. A statistical analysis allowed us to identify the occurrence of storms in this area based on data from the ERA5 model. Two calibrated and validated models were used (TOMAWAC and XBeach) to understand the geomorphological evolution due to the storm of the site after this strategic realignment. The results for the simulations show a predominance for erosion and channel creation. However, these results must be qualified because the unmaintained dike, composed of rocks and pieces of geotextile torn and scattered in a non-uniform manner, is represented in the modelling approach as being entirely composed of sand. This site with riprap presents an exceptional opportunity to observe a. The results of the shoreline leave-behind operation at this site with riprap has implications for re-naturalization in terms of ecological, economic and political interests

Les apports des méthodes d’évaluation de l’exposition aux changements climatiques et d’usage des sols à la planification des aires protégées – Le cas des oiseaux d’eau hivernant en Méditerranée (2023)

Thu, 11 May 2023 10:11:27

de Fabien Verniest
Paris : Muséum national d'histoire naturelle, 2023, 350

Climate change and land-use changes are major direct drivers of biodiversity loss, whose future impact must be anticipated. Mediterranean wetlands, which host an outstanding biodiversity, are highly vulnerable to these drivers but are not sufficiently targeted by conservation measures. The designation of new protected areas in these habitats can locally reduce the impact of climate and land-use changes on biodiversity, and especially on waterbird communities. It is necessary to identify wetlands of importance for biodiversity conservation for which the future changes are expected to be most severe in order to make the most of the effectiveness of protected areas. Assessing the exposure of Mediterranean wetlands to these drivers can help anticipate future variations of intensity and distribution of climate and land-use changes under several pathways of our societies.
In this thesis, I aimed to assess whether existing protected areas cover the wetlands of importance for conservation most exposed to future climate and land-use changes in the Mediterranean region, and to identify where to designate new protected areas in order to lessen the future impact of these two drivers on waterbird communities. To this end, I computed various metrics of exposure to these drivers, derived from late 21st century projections under four future scenarios used by the IPCC. These metrics were intersected with winter abundance data of 151 waterbird species collected over 25 years at 5891 sites (25 countries) as part of the International Waterbird Census.
First, I highlighted the high exposure to climate and land-use changes of Key Biodiversity Areas - sites of importance for biodiversity conservation - in the Mediterranean region, especially in countries where the protection of this network is low. In order to complement our knowledge on sites of importance for waterbirds, I subsequently applied three criteria of identification of wetlands of international importance to winter count data. As a result, I identified 161 sites of international importance for waterbirds whose status is not officially acknowledged, of which 95 are not protected. Then, I assessed the potential thermal adjustment limitations of waterbird communities to future temperature changes by combining their thermal specialization with their exposure to climate warming and natural habitat conversion. I thereby demonstrated the relevance of the location of existing protected areas that should overall be able to facilitate the future thermal adjustment of waterbird communities. However, I also identified 490 non-protected wetlands at risk, including 32 of international importance for waterbirds. Finally, assessing the exposure of coastal wetlands to sea-level rise highlighted the high threats to these sites, especially those protected and of international importance for waterbirds.
Taken together, these exposure assessments to climate and land-use changes highlighted the overall relevance of the location of existing protected areas network in the Mediterranean region. However, these methods also identified important protection gaps of highly exposed wetlands of importance for waterbird conservation, especially in Maghreb countries. The results of this thesis could help guide the implementation of protection measures in Mediterranean wetlands and thereby improve the conservation of waterbird communities.

Développement d'un indicateur poissons en lagune adapté au contexte français. Rapport final. (2023)

Mon, 10 Apr 2023 18:04:01

de Vincent Ouisse, Catherine Aliaume, Elsa Amilhat, V. Badts, Jean-Herve Bourdeix, Isabelle Cheret, Nicolas Cimiterra, Audrey Darnaude, Valerie Derolez, Elisabeth Faliex, et al.
[S.l.] : Projet INPOLAG, 2023, 71p + Annexes

Dans le contexte réglementaire de la DCE et au vu des développements récents des indicateurs européens focalisés sur les poissons en milieu lagunaire, le projet INPOLAG vise à développer un indicateur « poissons » DCE-compatible adapté au contexte français.
Ainsi, ce projet s'attache particulièrement à : (1) recenser et analyser de manière critique les indicateurs aujourd'hui appliqués au sein des lagunes méditerranéennes afin de les adapter au contexte français, (2) acquérir des données permettant le calcul d'un indicateur choisi, (3) réaliser un travail d'intercalibration avec les indicateurs déjà validés par ECOSTAT (Italie, Grèce, etc.).
Après une description de la stratégie d’acquisition des données dans le cadre de ce projet (partie 2), ce rapport présente les résultats : • de l’analyse de la variabilité environnementale (partie 3) et de la diversité des peuplements de poissons et de crustacés et de leur distribution au sein des habitats lagunaires en lien avec leur environnement (partie 4) • de l’analyse critique des pressions aujourd’hui identifiées et quantifiées (partie 5) • des indices de diversité calculés en lien avec les pressions (partie 6).

Le dynamisme récent de l'Hirondelle russeline Cecropis daurica rufula en Europe et en Afrique du nord

Mon, 13 Mar 2023 15:16:59

de Paul Isenmann
In Alauda, 91(1) (2023), 55-64

Le dynamisme récent de l’Hirondelle rousseline Cecropis daurica rufula en Europe et en Afrique du Nord.— Depuis la seconde moitié du XX° siècle, l’espèce a connu une extension spectaculaire de son aire de distribution et augmenté en nombre en Europe méditerranéenne : Péninsule ibérique, Sud de la France, Italie et Europe du Sud-Est dont l’ex-Yougoslavie, Bulgarie, Roumanie et même pour la première fois Ia Hongrie en 2017. L’expansion de l'espèce a également été frappante dans la Turquie côtière de la mer Noire, l'aire de reproduction atteignant désormais l’ex-Russie (Crimée, Ukraine, Géorgie...). Dans Ia péninsule arabique, l’espèce a été trouvée se reproduisant en 1998 aux Emirats arabes unis. Le dynamisme a été moins impressionnant en Afrique du Nord. Le Maroc abrite toujours I’essentiel de la population, quelques petits changements ont été remarqués en Algérie et l’espèce s'est reproduite pour la première fois en 2019 en Tunisie. L’augmentation des températures printanières et I'adoption de sites de nidification artificiels en croissance sont les principaux facteurs identiﬁés comme ayant joué un rôle dans le dynamisme récent de l'espèce.

Habiter la pollution industrielle : expériences et métrologie citoyennes (2023)

Tue, 7 Feb 2023 15:47:00

de Christelle Gramaglia
Paris : Presses des Mines, 2023, 1 (Sciences sociales)

Fondée sur une série d'enquêtes menées en France, en Espagne et au Portugal, une analyse des expériences quotidiennes vécues par les personnes qui vivent à proximité d'usines polluantes. S'intéressant aux conséquences sociales et écologiques de la contamination chronique et aux changements de pratiques censés les contenir, l'auteure identifie également les pistes de récupération collective.

HYDRINDIC – Suivi et évaluation de la restauration/création de zones humides avec un indicateur hydrologique – version 1 (2023)

Thu, 26 Jan 2023 15:09:08

de Hugo Clément, Stephanie Gaucherand, Guillaume Gayet, Florence Baptist, Jérôme Porteret, Caessteker Pierre, Claire Magand, Anne Vivier
[S.l.] : INRAE - OFB, 2023, 91
En ligne : hydrindic-inrae.shinyapps.io[...]

Un indicateur développé aux États-Unis, appelé « HYDRINDIC » ici, a été testé en métropole dans une variété de zones humides durant le projet du même nom (2020-2021, appelé « Hydrindic »). Les résultats obtenus avec cet indicateur permettent d’alerter sur la trajectoire d’évolution des zones humides en voie de restauration/création vis-à-vis de l’objectif de restauration/création. Nous proposons donc l’utilisation de l’indicateur HYDRINDIC en France métropolitaine pour suivre et évaluer le succès des opérations de restauration/création de zones humides. HYDRINDIC se veut basse technologie (« low-tech ») et rapide en terme de temps de réponse1 afin de prendre en compte les contraintes budgétaires (moyens humains et techniques limités pour la réalisation de suivis) et temporelles rencontrées par les pétitionnaires lors des projets de restauration/création de zones humides. Cet indicateur possède une réponse fiable, qui complètent ceux basés uniquement sur la végétation. HYDRINDIC permet d’informer et d’alerter, après un temps limité (1 à 7 ans après le démarrage du projet), sur l’efficacité des opérations de restauration/création (ne concerne pas l’évaluation des gains fonctionnels) en zones humides, d’un point de vue hydrologique, vis-à-vis de l’objectif visé. Les résultats qui en découlent permettent éventuellement de justifier l’ajustement des opérations de restauration/création mises en œuvre (déplacement d’un seuil en amont, bouchage d’un plus grand nombre de drains, etc.).
L'outil en ligne de visualisation de données- https://hydrindic-inrae.shinyapps.io/hydrindic-inrae/ - vise à représenter les chroniques piézométriques d'un site en voie de restauration/création vis-à-vis d'une enveloppe de référence, définit à partir de chroniques piézométriques de sites correspondant à l'objectif de restauration/création (SCORs). Un tableur type est à télécharger, remplir et importer dans l'outil pour permettre l'affichage dynamique du graphique et le calcul de l'indicateur HYDRINDIC.

Conservation de Sebkhet Séjoumi (Tunisie) (2023)

Tue, 10 Jan 2023 15:54:50

de Anis Guelmami, Anlamina Chamssidine Combo, Imen Labidi, Claudia Feltrup‐Azafzaf
Arles : Tour du Valat, 2023, 27

La mise en œuvre de ce projet comporte trois volets (ou objectifs spécifiques) :

a) Renforcement du suivi spatialisé de Sebkhet Séjoumi initié en 2018, en analysant certains des impacts potentiels du PAV sur la zone humide, au cas où il est adopté dans sa forme actuelle ;
b) Promotion de la lutte écologique contre les nuisances provoquées par les moustiques, avec l’installation de Borne Anti-Moustiques, développés par l’entreprise QISTA, au niveau de deux sites pilotes autour de Sebkhet Séjoumi ;
c) Sensibilisation et plaidoyer auprès des autorités institutionnelles, mais également des riverains, afin de favoriser une gestion plus rationnelle de Sebkhet Séjoumi, tout en garantissant son intégrité et le maintien de son état naturel.

Table des matières : années 1994 à 2022 - volume 1 à 29

Fri, 3 Feb 2023 18:23:40

de LPO
In Ornithos, 29(6) (Nov-Décembre, 2022), 50

Conservation Status of the Hispaniolan Slider, Trachemys decorata, at Lake Trou Caïman, Eastern Haiti: First Data on an Endemic, Poorly Studied, and Endangered Species

Wed, 4 Jan 2023 11:14:29

de Jeffey M Paul, Lens J Saint-Louis, Anthony Olivier, Wilson Célestin, Frank Cézilly
In Herpetological Conservation and Biology, 17(3) (December, 2022), 612-622
En ligne : www.herpconbio.org[...]

The Hispaniolan Slider (Trachemys decorata) is a freshwater turtle of conservation interest, endemic to the island of Hispaniola. Although the species is known to be threatened with habitat destruction, hybridization with congeneric species, and commercial harvesting, little information is available on natural populations. Here we report the results of a pilot study conducted at Lake Trou Caïman, Haïti. From October 2017 to February 2018, we captured 44 individuals (mostly in areas dominated by cattails, Typhaceae) and had access to 48 additional individuals held in captivity by fishers and local people. Captive individuals were significantly larger than wildcaught ones. Based on individuals with a carapace length > 100 mm, sex-ratio did not differ from parity in either wild-caught or captive individuals. Females tended to be larger and heavier than males. The frequency of damaged carapace or plastron and/or wounds was significantly higher in captive individuals compared to individuals freshly captured in the lake, indicating poor husbandry. About 10% of all individuals showed orange supratemporal stripes, suggestive of hybridization with the Central Antillean Slider (T. stejnegeri) or the Red-eared Slider (T. scripta elegans). Based on interviews with 31 local fishers, we estimated that at least 1,600 T. decorata are harvested each year at Lake Trou Caïman. We discuss our results in relation to the conservation and management of T. decorata in Haiti

Evaluation of the distance sampling technique to monitor gregarious species: A simulation exercise

Wed, 30 Nov 2022 10:44:44

de Arthur Jacquemin, David Vallecillo, Matthieu Guillemain, Pierre Defos du Rau, Jocelyn Champagnon
In Wildlife Society Bulletin, Online (November, 2022), 19
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

Wildlife count data are used to provide estimates of population abundance. To quantify changes in the size of populations, it is necessary to determine the precision of abundance estimates. Ground or aerial survey methods are often intended to be a census and thus do not provide estimates of precision. One solution is to switch approaches to a different sampling and estimation procedure, such as distance sampling. Using an example of the long-term waterfowl censuses in the Camargue, a major wintering area in southern France, we used simulation to quantify the precision and cost effectiveness of transitioning to a distance sampling approach. Based on abundance and distribution data for 14 species of waterbirds (Anatidae and coot [Fulica atra]) in the Camargue, we evaluated 5 distance sampling scenarios with parallel line transects corresponding to 5 different sampling intensities. Our results suggested that, if the objective of counts is to estimate the abundance of all waterfowl together, switching from pseudo-total to distance sampling counts would be realistic on both statistical and financial grounds. The most advantageous scenario would correspond to a sampling effort with transect lines spaced 1,000 m apart, which would allow a coefficient of variation of 0.20 for total waterfowl abundance with a 27% increase in flight costs compared to the current method. Heterogeneity in the size of detected bird groups contributed to the variability in our results, however, adjusting sampling effort from 1,750 m spaced transect to 760 m allowed reduced variation by 55%. We recommend proceeding to test flights which would allow some site-specific parameters to be refined before changing methods. However, the distance sampling method as simulated here would prove impractical to evaluate the abundance and distribution of one species alone.

The International Waterfowl (and Wetlands) Research Bureau: c. 1945–1995

Thu, 17 Nov 2022 11:22:45

de David A. Stroud, Jean-Yves PIROT, Mike Smart
In Wildfowl, 72(72) (November, 2022), 3-60
En ligne : wildfowl.wwt.org.uk[...]

The International Waterfowl and Wetlands Research Bureau (IWRB) – an international network of networks co-ordinated by a small Secretariat – was the most important international motivator for wetland conservation of the 20th century. Its legacy includes the International Waterbird Census (IWC) – one of the largest internationally harmonised biodiversity monitoring schemes in the world; advocacy for, and drafting of, the first multilateral environmental agreement – the “Ramsar” Convention on wetlands; the production of multiple contextual data syntheses, including a global series of regional wetland inventories and waterbird flyway atlases; providing mechanisms through which international concerns regarding “unwise use” of wetlands could be highlighted and raised with governments; and the establishment of a wide range of global standards for conservation, notably the selection of protected areas which remains fundamental to contemporary wetland conservation. This is the story of the organisation, from its origins in the 1920s to its eventual merger with other regional wetland conservation organisations in 1995, told in relation to its structures, staffing, activities and achievements. Whilst much has been taken forward since 1995 and continues to this day, through legacy initiatives and successor bodies, much has also been lost – which is regrettable, especially given the biodiversity crisis now facing the world.

Impacts of environmental conditions and management of sluice gates on glass eel migration

Tue, 15 Nov 2022 17:40:58

de Colin Bouchard, Olivier Boutron, Jordane Labremon, Hilaire Drouineau, Patrick Lambert, Delphine Nicolas
In Estuarine, Coastal and Shelf Science, Online (November, 2022), 108139
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

Anthropogenic barriers such as tidal gates impair animal migration and ecological continuity. For migratory fishes, barriers may alter or impeach both upstream and downstream migrations. Juveniles of European eels, namely glass eels, have to pass those barriers when migrating upstream, whereas they have limited swimming capacities and are dependent on several environmental variables. Hydrological conditions, which can be modified by barrier management, are critical for glass eels. Here, we investigated the links between hydrological conditions and barrier management and the recruitment of glass eels at a connection between the Mediterranean Sea and a lagoon. To do that, we modeled the recruitment of glass eels over ten seasons accounting for temporal variations and co-variable effects. We modeled three aspects of recruitment: presence, level, and composition. We found that monthly and inter-annual effects explained the main part of the variations in glass eel recruitment but accounting for environmental effects improved our models, with a positive effect of temperature, for instance. We associated low levels of catches and recruitment of rather old individuals to high water flow rates when water flows out of the lagoon. Those results call for further studies on how sluice gate management may improve glass eel recruitment and seem to indicate that local stakeholders should adjust the number of open gates depending on the water level on both sides of the barrier.

Analysis of trapped mosquito excreta as a noninvasive method to reveal biodiversity and arbovirus circulation

Thu, 27 Oct 2022 17:36:01

de Grégory L'Ambert, Mathieu Gendrot, Sébastien Briolant, Agnès Nguyen, Sylvain Pages, Laurent Bosio, Vincent Palomo, Nicolas Gomez, Nicolas Benoit, Hélène Savini, et al.
In Molecular Ecology Resources, n/a(n/a) (2022)
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

Emerging and endemic mosquito-borne viruses can be difficult to detect and monitor because they often cause asymptomatic infections in human or vertebrate animals or cause nonspecific febrile illness with a short recovery waiting period. Some of these pathogens circulate into complex cryptic cycles involving several animal species as reservoir or amplifying hosts. Detection of cases in vertebrate hosts can be complemented by entomological surveillance, but this method is not adapted to low infection rates in mosquito populations that typically occur in low or nonendemic areas. We identified West Nile virus circulation in Camargue, a wetland area in South of France, using a cost-effective xenomonitoring method based on the molecular detection of virus in excreta from trapped mosquitoes. We also succeeded at identifying the mosquito species community on several sampling sites, together with the vertebrate hosts on which they fed prior to being captured using amplicon-based metabarcoding on mosquito excreta without processing any mosquitoes. Mosquito excreta-based virus surveillance can complement standard surveillance methods because it is cost-effective and does not require personnel with a strong background in entomology. This strategy can also be used to noninvasively explore the ecological network underlying arbovirus circulation.

Does hydrological connectivity control functional characteristics of artificial wetland communities? Evidence from the Rhône River

Fri, 20 Jan 2023 16:13:47

de Maxine Thorel, Pierre Marmonier, Céline Bertrand, Cécile Claret, Stéphanie Fayolle, Maxime Logez, Jean-Michel Olivier, Benjamin Oursel, Antonin Vienney, Hervé Piégay, et al.
In Aquatic Sciences, 84(4) (October, 2022), 66
En ligne : doi.org[...]

The importance of artificial wetlands for the biodiversity of the Rhône River floodplain was assessed at twelve stations along two sections of the river. The relative roles of the local characteristics of the wetlands (e.g. available nutrients, dissolved oxygen, sediment quality) and of their connectivity with the main channel were considered for three different groups of organisms (benthic microbes, benthic invertebrates and phytoplankton communities). The functional characteristics of these organisms were determined through their enzymatic activities (for microbes) and biological traits (for invertebrates and phytoplankton). The predicted major role of connections between the wetlands and the river channel was confirmed for environmental characteristics (water and sediment) and benthic invertebrates. Connectivity appeared to be less of a driver of benthic microbial communities and phytoplankton, which were partly or mainly controlled by wetland geometry (water depth, light penetration, and resulting organic matter production). We conclude that connectivity with the river channel needs to be considered jointly with the geometry of wetlands to provide functional solutions when defining management and restoration plans.

Using literature and expert knowledge to determine changes in the bird community over a century in a Turkish wetland

Thu, 27 Oct 2022 17:35:55

de Dilara Arslan, Lisa Ernoul, Arnaud Béchet, Ömer Döndüren, Mehmet Sıkı, Thomas Galewski, Dilara Arslan, Lisa Ernoul, Arnaud Béchet, Ömer Döndüren, et al.
In Marine and Freshwater Research, Online (October, 2022)
En ligne : www.publish.csiro.au[...]

Bird species have been studied and documented abundantly in the past decades and are good indicators of ecosystem conditions, providing useful information of the changes in the ecological state of wetlands over time. However, monitoring data for birds in wetland sites are often disparate and not homogeneous over time and among species, which complicates the interpretation of trends.
We examined historical literature from 1835 to 2019, complemented by an expert knowledge survey and citizen-science databases to estimate the abundance of species, and evaluated changes in the structure and composition by average bird abundances.Key results Our results suggested that land-cover and land-use changes have shaped the local bird community, with a decline in agricultural and grassland bird species as a result of changes in agricultural practices. Coastal wetland and marine birds have increased in abundance, most probably linked to the extension of saltpans and successful conservation measures.
hese trends in bird communities demonstrate the impacts of different land management strategies on biodiversity.Implications This methodology can be replicated in other Ramsar and wetland sites around the world to raise new conservation issues and improve site conservation.

Systematic review of a RAMSAR wetland and UNESCO biosphere reserve in a climate change hotspot (Ichkeul Lake, Tunisia)

Thu, 20 Oct 2022 15:52:32

de Sabrine Sahbani, Béchir Béjaoui, Sihem Benabdallah, Rachid Toujani, Afef Fathalli, Noureddine Zaaboub, Jalel Aouissi, Zeineb Kassouk, Nabil Hamdi, Nabiha Ben Mbarek, et al.
In Journal of Sea Research, Online (October, 2022), 102288
En ligne : linkinghub.elsevier.com[...]

Tunisia’s Ichkeul Lake is among the most productive ecosystems in the Mediterranean, with a great regional value thanks to its diversity of habitats. It is an important overwintering area for waterfowl species. It is a RAMSAR wetland, a National Park, a UNESCO World Heritage, and a Biosphere Reserve. This review paper provides a broad overview of the climatic, hydraulic, biogeochemical features, bio-resources, and bio-productivity of the Lake. The interconnectivity between the different environmental components of the lake is presented, highlighting the main characteristics of this vital ecosystem. Its ecosystem consists of a permanent lake bordered by temporary marshes. It is connected to the Mediterranean Sea via Bizerte Lagoon under a typical semi-arid to sub-humid bio-climate with wet and dry seasons. The winter rainfall fills up the rivers and lake with freshwater that overflows into the Tinja River. In summer, high evaporation reduces the water level and allows seawater to enter the wetland from Bizerte Lagoon. The ecosystem is threatened by pollution, the damming of its main rivers, and climate change. The unsustainable water management has resulted in fundamental environmental modifications, as evidenced by the large variation in the salinity, water level, productivity of water plants, and the decline in venue and stop-overs of waterbirds. The current situation is a warning that indicates a general perturbation of the resources of this particular site and of Tunisian wetlands in general, especially that the Mediterranean region has been designated as a climate change hotspot. Accurate hydrological management is needed to boost the physical functioning of the ecosystem, and to gain deeper knowledge of the different phases of the water cycle and its relationship to other long-term environmental cycles for sustainable water management strategies in the most water-scarce region in the world.

Efficacy of created and restored nesting sites for the conservation of colonial Laridae in the south of France

Thu, 6 Oct 2022 10:32:17

de Timothée Schwartz, Aurélien Besnard, Christophe Pin, Olivier Scher, Thomas Blanchon, Arnaud Béchet, Nicolas Sadoul
In Conservation Biology, Online (September, 2022)
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

By rapidly modifying key habitat components, habitat restoration is at risk of producing attractive cues for animals without providing habitats of sufficient quality. As such, individual fitness components such as reproduction could be reduced and restored habitats could become ecological traps. This risk notably appears by using artificial constructions in restoration projects, yet few studies have evaluated their efficacy in a robust way. In this study, we investigated this by analysing 154 islets that were created or restored in order to improve the conservation status of seven colonial Laridae species in the south of France. During a 10-year study period (2007 to 2016), we compared occupancy dynamics and breeding parameters of these species between the restored sites and 846 unmanaged nesting sites. We also explored species’ preference for different nesting site characteristics and their respective effect on breeding parameters. We found that restored nesting sites were more attractive than unmanaged sites for all species except the black-headed gull. Colonization probability was higher in sites already used by other species the previous year. Abandonment probability was lower when breeding was successful the previous year in all species except the Sandwich tern, and decreased with the size of the colony the previous year in four of the seven species. Breeding parameters were significantly higher on managed sites. Distance from the shore was an important attractive characteristic of artificial nesting sites in all species. Other nesting site characteristics had species-specific effects on colonization, abandonment and breeding success. These results indicate that managed nesting sites are successful conservation tools for colonial Laridae in the Mediterranean and do not act as ecological traps. Our study shows that the test of the ecological trap hypothesis is a robust way to evaluate the success of restoration projects of breeding habitats.

Importance and Winter Ornithological Value of Lake El-Golea (Ghardaïa, Algerian Sahara

Thu, 6 Oct 2022 10:32:12

de Biad Radhia, Bounab Choayb, Guergueb El Yamine, Biad Mohamed Fetheddine, Houhamdi Moussa
In Journal of Bioresource Management, 9(3) (September, 2022), 149-62
En ligne : corescholar.libraries.wright.edu[...]

This study is carried out on two winter period (2018-2019 and 2019-2020) in Lake El-Golea (Ghardaïa, northern Sahara of Algeria). Its objective is to determine the ornithological value of this lake and to in ferits importance in maintaining aquatic avifauna during the winter season. This inventory shows a diversity equivalent to forty-one species belonging to thirteen families and nine orders of which eighteen are protected by various Algerian and international laws. The most represented family is that of the Anatidae with twelve species while the family with the highest number is that of the Phenicopteridae represented only by one species, the Greater Flamingo (Phenicopterus roseus). These waterbirds occupy the lake in different ways: the insectivores are distributed on the banks and in the shallow areas of the lake while, the herbivores, polyphages and piscivores are concentrated in the deepest areas and in the centre of the lake. It is important to note, however, the presence of two vulnerable species, the Common Pochard (Aythya ferina) and the Marbled Duck (Marmaronetta angustirostris) and anear-threatened species, the Greater Ring- Ferruginous Duck (Aythya nyroca).

Is hunting nonintentionally selective? A test using game bird capture‐dead recoveries

Wed, 21 Sep 2022 12:01:42

de Emilienne Grzegorczyk, Léa Bézier, Kévin Le‐Rest, Alain Caizergues, Charlotte Francesiaz, Jocelyn Champagnon, Matthieu Guillemain, Cyril Eraud
In Ecology and Evolution, 12(9) (September, 2022), 12
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

Selective hunting has various impacts that need to be considered for the conservation and management of harvested populations. The consequences of selective harvest have mostly been studied in trophy hunting and fishing, where selection of specific phenotypes is intentional. Recent studies, however, show that selection can also occur unintentionally. With at least 52 million birds harvested each year in Europe, it is particularly relevant to evaluate the selectivity of hunting on this taxon. Here, we considered 211,806 individuals belonging to 7 hunted bird species to study unintentional selectivity in harvest. Using linear mixed models, we compared morphological traits (mass, wing, and tarsus size) and body condition at the time of banding between birds that were subsequently recovered from hunting during the same year as their banding, and birds that were not recovered. We did not find any patterns showing systematic differences between recovery categories, among our model species, for the traits we studied. Moreover, when a difference existed between recovery categories, it was so small that its biological relevance can be challenged. Hunting of birds in Europe therefore does not show any form of strong selectivity on the morphological and physiological traits that we studied and should hence not lead to any change of these traits either by plastic or by evolutionary response.

Quelques Lépidoptères peu cités ou nouveaux pour la faune de France (Lepidoptera, Meessiidae, Lyonetiidae, Depressariidae, Batrachedridae, Coleophoridae, Urodidae, Crambidae, Geometridae, Noctuidae)

Mon, 19 Sep 2022 11:25:05

de Jacques Nel, Yves Doux, Lionel Turand, Marc Thibault, Thierry Varenne
In RARE. Revue de l'Association roussillonnaise d'entomologie, 31(2) (2022), 136-142

Cinq espèces de Lépidoptères sont nouvelles pour la France : Infurcitinea minuscula Gozmány, 1960 [Meessiidae], Agonopterix carduncelli Corley, 2017 [Depressariidae], Batrachedra confusella Berggen & al., 2022 [Batrachedridae], Coleophora septembra Tabell, 2017 et Coleophora sarehma Toll, 1956 [Coleophoridae], et cinq autres peu citées : Leucoptera aceris (Fuchs, 1903) [Lyonetiidae] dans les Hautes-Alpes, Wockia asperipunctella (Bruand, 1850) [Urodidae] en région P.A.C.A, Eudonia laetella (Zeller, 1846) [Crambidae] dans les Alpes-de-HauteProvence, Paraboarmia viertlii (Bohatsch, 1883) [Geometridae] dans les Hautes-Alpes et Episema hispanica Boisduval, 1828 [Noctuidae] dans les Bouches-du-Rhône. Habitus et genitalia sont illustrés.

Description d’Hypenodes occidentalis sp. n. découverte dans les Bouches-du-Rhône (France) (Lepidoptera, Erebidae, Hypenodinae)

Mon, 19 Sep 2022 11:25:01

de Jacques Nel, Marc Thibault, Thierry Varenne
In RARE. Revue de l'Association roussillonnaise d'entomologie, 31(2) (2022), 120 – 125.

Une nouvelle espèce du genre Hypenodes Doubleday, 1850, liée à des biotopes humides dans les Bouches-du-Rhône (France), Hypenodes occidentalis sp. n., est décrite et essentiellement comparée à H. pannonica Fibiger & al., 2010.

Long-term persistence and recycling of Bacillus thuringiensis israelensis spores in wetlands sprayed for mosquito control

Thu, 1 Sep 2022 16:58:24

de Brigitte Poulin, Gaëtan Lefebvre, Samuel Hilaire, Laurence Després
In Ecotoxicology and Environmental Safety, 243 (September, 2022), 10
En ligne : linkinghub.elsevier.com[...]

Bacillus thuringiensis subsp. israelensis (Bti) is the main larvicide used to control mosquitoes worldwide. Although there is accumulating evidence of Bti having environmental effects on non-target fauna, relatively few field studies have documented the fate of Bti spores in the environment. Spore density was quantified over a 6-yr period (2012–2017) in Mediterranean marshes sprayed with Vectobac 12AS (32 ITU/ha) since 2006 to reduce the nuisance caused by Aedes caspius. Bti spores were naturally found in all habitat types. Spore density expressed as colony-forming units per gram of soil (CFU g− 1) increased significantly at treated sites by a factor of 22 to 500 times relative to control sites, with mean values of 7730 CFU g− 1 in halophilous scrubs, 38,000 in reed beds, 49,000 in bulrush beds and 50 000 in rush beds. Spore density varied little in the first months after the spraying season (April-October), but increased sharply in spring, just before the annual launch of mosquito control. Considering that Bti is an insect pathogen that cannot proliferate without a suitable insect host, this unexpected recrudescence in spring could be related to the warming of water that triggers activity and development of benthic organisms such as chironomids, which may contribute to Bti proliferation by ingesting accumulated spores at the surface of sediments. While spore density tends to decrease over time, presumably during the summer period as a result of increased UV exposure, three to four years were necessary for spore density to return to normal levels after mosquito-control interruption. This study is important because it demonstrates that environmental effects of mosquito-control using Bti can far exceed the short period of Bti efficacy against lentic mosquitoes. Considering that Bti is a microbial agent, these long-term effects should be addressed at multiple levels of ecosystem organization from a one-health perspective.

Spatio-temporal variations in glass eel recruitment at the entrance pathways of a Mediterranean delta

Thu, 8 Dec 2022 16:03:27

de Colin Bouchard, Hilaire Drouineau, Patrick Lambert, Olivier Boutron, Delphine Nicolas
In ICES Journal of Marine Science, 79(6) (August, 2022), 1874-1887
En ligne : doi.org[...]

Understanding spatio-temporal dynamics of glass eel recruitment is necessary to characterize eel population status and the stock of future elvers. Despite numerous studies that have characterized recruitment across Europe, multiple systems along the Mediterranean coasts need a deeper look. We built a Bayesian State-Space Model to investigate the temporal variations in glass eel recruitment in the Rhône delta (France). The model was suited to address the spatial heterogeneity due to the complexity of this system constituted by numerous entrance pathways. Over 13 years, we found inter-annual variations without a particular trend. Here, an overall migration peak occurred in February–March for the system, but substantial spatial variations in the resulting recruitment were visible. Spatial variations in the inter-annual dynamics and migration peak pointed out the necessity to account for spatial heterogeneity in the dynamics of glass eel recruitment. The highlighted inter-annual variations are consistent with analysis of coincident time-series in other sites in Europe (e.g. WGEEL), and the migration peak’s timing is similar to peaks observed in other estuaries. Spatial variations in the migration peak suggest a potential effect of local environment conditions on the recruitment. Our model provided a suitable approach to investigate temporal variations while accounting for spatial heterogeneity.

Site fidelity and determinants of wintering decisions in the Dalmatian pelican (Pelecanus crispus)

Thu, 21 Jul 2022 15:57:06

de Anastasios Bounas, Giorgos Catsadorakis, Theodoros Naziridis, Taulant Bino, Dionyssia Hatzilacou, Myrsini Malakou, Ortaç Onmuş, Mehmet Siki, Pavel Simeonov, Alain J Crivelli
In Ethology Ecology & Evolution, Online (July, 2022), 1-15
En ligne : doi.org[...]

Wintering site selection is a major decision in a bird’s annual life cycle since conditions experienced by individuals within a wintering site can influence individual fitness and ultimately population dynamics. If individuals show strong fidelity to specific sites, annual environmental effects can be reinforced. In this study we analyse winter resightings of ringed Dalmatian pelicans, collected during a 35-year-long ringing survey, to identify winter movement patterns of Dalmatian pelicans, assess the level of site fidelity both within and among consecutive wintering events and examine environmental factors that may contribute to an individual’s decision to move towards a specific site during the winter period. Our results showed that the decision of Dalmatian pelicans to move towards a specific site was mainly driven by the site’s size and temperature conditions. Larger wetlands can provide birds with higher resource abundance and offer more opportunities to exploit optimal roosting and feeding habitats, whereas wetlands that do not freeze during the winter are a definite requirement. Wintering movements were more likely to occur at short distances from a bird’s natal colony, whereas it was uncommon for birds born in wetlands located in the Adriatic and Ionian coast to move eastwards during the winter, suggesting a level of spatial substructure. Furthermore, we showed that the species exhibits very strong within-year and among-year wintering site fidelity, with birds moving less during the winter, whereas juvenile birds travel greater distances than the rest of the age classes examined. Our conclusions could guide an effective approach to site-based conservation management at key wintering sites.

The genus Callitriche (Plantaginaceae, Callitricheae) in Morocco

Thu, 21 Jul 2022 15:57:03

de Richard V. Lansdown, Laïla Rhazi, Er-riyahi Saber, Mohammed El Madihi, Patrick Grillas
In Phytotaxa, 555(1) (July, 2022), 53-72
En ligne : www.biotaxa.org[...]

This article presents information on the distribution and ecology of Callitriche species in Morocco, based on field survey, literature review, and examination of herbarium specimens. Taxa reported erroneously from the country are discussed and new information is presented on the morphology of C. mathezii and C. truncata subsp. truncata.

The Cassaïre wetland restoration project: defining the reference ecosystem

Tue, 20 Sep 2022 11:33:53

de Isabelle Muller, Johan Friry, Elise Buisson, François Mesléard
In Ecologia Mediterranea, 48(1) (June, 2022), 10

Defining a reference ecosystem for ecological restoration project is an essential step. The reference can correspond to the historical ecosystem, can be defined to solve environmental issues or can correspond to a socioecosystem. For the restoration of the Cassaïre site in the Camargue delta in southern France, the reference ecosystems chosen are: Mediterranean temporary wetlands and Mediterranean meso-xeric grasslands. The choice of these two reference ecosystems appears logical considering their contribution to regional biodiversity. Temporary wetlands and meso-xeric grasslands are rare, adapted to the Mediterranean climate, seriously endangered and host a high species richness. They are potentially achievable restoration targets because patches of these ecosystems remain in the Camargue area and close to the Cassaïre site. Moreover, an ecological history approach reveals deep human imprints on ecosystems and ensures that historical restoration targets (the state prior to human impacts) cannot be reached, because they are associated with hydraulic functioning (flooding of the Rhône and Durance) that no longer exists. The restored site is planned to be suitable for livestock grazing, thus presenting a new agricultural opportunity, while simultaneously offering new services, such as hunting.

Le Vautour percnoptère Neophron percnopterus, proie du Grand-Duc d'Europe Bubo bubo, dans le département du Tarn (sud de la France)

Wed, 6 Jul 2022 16:00:36

de Gilles Tavernier, Yves Kayser
In Nos Oiseaux, 69(2) (Juin 2022), 95-97

L'opportunisme alimentaire du Grand-duc est largement documenté, de même que l'impressionnant éventail de la grandeur de ses proies. Malgré cela, la capture d'un Vautour percnoptère, de surcroît hors de l'aire de reproduction de ce dernier, demeure exceptionnelle/

Lapin et Lezard occelé : une curieuse alliance

Fri, 24 Jun 2022 11:45:30

de Marc Cheylan, Florian Doré, Pierre Grillet, Anthony Olivier, Jean-Marc Thirion
In Espèces, 44 (Juin 22), 24-31
En ligne : especes.org[...]

Découverte d’une nouvelle espèce de chiroptère pour la Camargue : le Murin cryptique (Myotis crypticus)

Wed, 22 Jun 2022 09:46:10

de Lionel Bruhat, Anthony Olivier, Emmanuel Cosson
In Plume de naturalistes, 6 (Juin, 2022), 101-116
En ligne : www.plume-de-naturalistes.fr[...]

The Cryptic myotis is a recently described species that is still poorly known. In order to best assess its conservation status, it is important to specify its range. In the Camargue, despite a significant historical sampling effort, the species had never been contacted. In 2018, an acoustic survey conducted in relict alluvial forests revealed the presence of the species. Although contacted every month from March to October, the species seems to be rare in the Camargue and, in general, in the anthropised plain of the lower Rhône valley. We assume that the reduction and fragmentation of woodland areas could be one of the main causes. Further studies are needed to clarify the distribution and status of the species in the Camargue. In the future, land development projects impacting habitats favourable to the Cryptic myotis should take into account the issues inherent to this species.

Multiresistant Enterobacteriaceae in yellow-legged gull chicks in their first weeks of life

Fri, 17 Jun 2022 12:21:51

de Marion Vittecoq, Lionel Brazier, Eric Elguero, Ignacio G. Bravo, Nicolas Renaud, Alejandro Manzano-Marín, Franck Prugnolle, Sylvain Godreuil, Thomas Blanchon, François Roux, et al.
In Ecology and Evolution, 12(6) (June, 2022), 10
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

Wild animal species living in anthropogenic areas are commonly carriers of antimicrobial-resistant bacteria (AMRB), but their role in the epidemiology of these bacteria is unclear. Several studies on AMRB in wildlife have been cross-sectional in design and sampled individual animals at only one point in time. To further understand the role of wildlife in maintaining and potentially transmitting these bacteria to humans and livestock, longitudinal studies are needed in which samples are collected from individual animals over multiple time periods. In Europe, free-ranging yellow-legged gulls (Larus michahellis) commonly live in industrialized areas, forage in landfills, and have been found to carry AMRB in their feces. Using bacterial metagenomics and antimicrobial resistance characterization, we investigated the spatial and temporal patterns of AMRB in a nesting colony of yellow-legged gulls from an industrialized area in southern France. We collected 54 cloacal swabs from 31 yellow-legged gull chicks in 20 nests on three dates in 2016. We found that AMRB in chicks increased over time and was not spatially structured within the gull colony. This study highlights the complex occurrence of AMRB in a free-ranging wildlife species and contributes to our understanding of the public health risks and implications associated with ARMB-carrying gulls living in anthropogenic areas.

Les oiseaux nicheurs rares et menacés en France en 2020

Fri, 20 May 2022 18:18:45

de Gwenael Quaintenne, Arnaud Béchet, Maurice Benmergui, Hervé Bergère, Jean-Jacques Boutteaux, Bernard Cadiou, Pierre Camberlein, Jocelyn Champagnon, Frederic Chapalain, Virginie Couanon, et al.
In Ornithos, 29(2) (Mars-Avril, 2022), 73-111

Generating population estimates for migratory shorebird species in the world’s largest flyway

Mon, 10 Jan 2022 16:08:37

de B.D. Hansen, D.I. Rogers, D. Watkins, D.R. Weller, R.S. Clemens, M. Newman, E.J. Woehler, T. Mundkur, R.A. Fuller
In Ibis, 164(3) (July, 2022), ibi.13042
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

Population estimates are widely used to underpin conservation decisions. However, determining accurate population estimates for migratory species is especially challenging, since they are often widespread and it is rarely possible to survey them throughout their full distribution. In the East Asian-Australasian Flyway (EAAF), this problem is compounded by its size (85 million square kilometres) and the number of migratory species it supports (nearly 500). Here, we provide analytical approaches for addressing this problem, presenting a revision of the EAAF population estimates for 37 migratory shorebird species protected under Australian national environmental legislation. Population estimates were generated by (i) summarising existing count data in the nonbreeding range, (ii) spatially extrapolating across uncounted areas, and (iii) modelling abundance on the basis of estimates of breeding range and density. Expert review was used to adjust modelled estimates, particularly in under-counted areas. There were many gaps in shorebird monitoring data, necessitating substantial use of extrapolation and expert review, the extent of which varied among species. Spatial extrapolation to under-counted areas often produced estimates that were much higher than the observed data, and expert review was used to cross-check and adjust these where necessary. Estimates of population size obtained through analyses of breeding ranges and density indicated that 18 species were poorly represented by counts in the non-breeding season. It was difficult to determine independently the robustness of these estimates, but these breeding ground estimates were considered the best available data for ten species, that mostly use poorlysurveyed freshwater or pelagic habitats in the non-breeding season. We discuss the rationale and limitations of these approaches to population estimation, and how they could be modified for other applications. Data available for population estimates will vary in quality and extent among species, regions and migration stage, and approaches need to be flexible enough to provide useful information for conservation policy and planning.

Concentrations and fluxes of suspended particulate matter and associated contaminants in the Rhône River from Lake Geneva to the Mediterranean Sea

Fri, 20 Jan 2023 16:13:51

de Hugo Lepage, Alexandra Gruat, Fabien Thollet, Jérôme Le Coz, Marina Coquery, Matthieu Masson, Aymeric Dabrin, Olivier Radakovitch, Jérôme Labille, Jean-Paul Ambrosi, et al.
In Earth System Science Data, 14(5) (May, 2022), 2369-2384
En ligne : essd.copernicus.org[...]

The Rhône River is among the main rivers of western Europe and the biggest by freshwater discharge and sediment delivery to the Mediterranean Sea. Its catchment is characterized by distinct hydrological regimes that may produce annual sediment deliveries ranging from 1.4 to 18.0 Mt yr⁻¹. Its course meets numerous dams, hydro and nuclear power plants as well as agricultural, urban and industrial areas. Moreover, with the climatic crisis we are currently facing, it is proven that the occurrence and the intensity of extreme events (floods or droughts) will increase. Therefore, it is crucial to monitor the concentrations and fluxes of suspended particulate matter (SPM) and associated contaminants to study the current trends and their evolution. In the Rhône River (from Lake Geneva to the Mediterranean Sea), a monitoring network of 15 stations (3 on the Rhône River and 12 on tributaries) has been set up in the past decade by the Rhône Sediment Observatory (OSR) to investigate the concentrations and the fluxes of SPM and associated contaminants as well as their sources. The main purpose of the OSR is to assess the long-term trend of the main contaminant concentrations and fluxes, and to understand their behavior during extreme events, such as floods or dam flushing operations. The dataset presented in this paper contains the concentrations and fluxes of SPM as well as the concentrations and fluxes of several particle-bound contaminants of concern, e.g., polychlorinated biphenyl (PCB), trace metal elements (TME) and radionuclides, the particle size distribution and the particulate organic carbon of SPM. Sediment traps or continuous flow centrifuges were used to collect sufficient amount of SPM in order to conduct the measurements, and data completion was applied to reconstruct missing values. This observatory is on-going since 2011 and the database is regularly updated.

Gestion raisonnée des traitements antiparasitaires vétérinaires dans le sud-est de la France dans une approche One Health EcoHealth

Wed, 15 Jun 2022 15:35:06

de Ilyes Bouasla, Aurélie Binot, Philippe Jacquiet
In Revue d’élevage et de médecine vétérinaire des pays tropicaux, 75(2) (May, 2022)
En ligne : revues.cirad.fr[...]

The ecotoxicity of veterinary antiparasitic treatments and the emergence of resistance to several families of antiparasitic molecules have led to the need to consider the proper use of these products in order to reduce their ecological impact while controlling sanitary and economic issues within the herd. The present study explores these notions within the framework of the support of nineteen breeders from two French departments (Gard and Hérault) engaged in a process of wise management of the parasite risk through the respect of a schedule of conditions of environmental protection, relating in particular to the preservation of threatened species such as the ocellated lizard (Timon lepidus). These farmers practice various activities as well as different types of breeding (sheep or beef cattle, Camargue cattle, dairy goats, racehorses). Semi-structured interviews were used to describe their practices and to understand how they integrated the wise management of parasite risk into their strategy. Coprologies were conducted to determine the rate of infestation of the herds by gastrointestinal endoparasites, and to recommend targeted treatments using molecules that are not ecotoxic for the environment, and/or effective alternatives, whose strategy must be adapted according to the type of farm and the species. Eighty percent of the farmers were heading toward a wise strategy without necessarily being aware of it since they rarely treated their animals and were generally concerned about applying the right treatment methods. Nevertheless, they seemed to need close support for the diagnosis, treatment timing and molecules to be used, as well as for the management of animals’ movements between plots. The study showed the crucial role of veterinary practitioners in this type of approach. However, awareness raising and training must be organized to encourage their involvement.

Les aires protégées françaises face aux approches conceptuelles « Une seule santé – Ecohealth »:

Tue, 2 Aug 2022 16:43:24

de Thierry Durand, Olivier Fleury, Marie Heuret, Thierry Mougey, Christian Schwoehrer, Marion Vittecoq
In Environnement, Risques & Santé, 21(3) (May, 2022), 227-234
En ligne : www.jle.com[...]

One health and Ecohealth in protected areas in France Protected areas (PAs) are intended to preserve the health of humans, animals and ecosystems and to meet the global challenges of biodiversity and climate change. The key role of French PAs as preferential sites for turning the “One health” concept into practice is highlighted.

Mediterranean Temporary Lagoon: proposal for a definition of this endangered habitat to improve its conservation

Fri, 20 May 2022 18:18:44

de Mathilde Latron, Aubin Allies, Olivier Argagnon, Nadine Bosc, Karine Faure, Hugo Fontes, Patrick Grillas, James Molina, Rutger de Wit, Guillaume Papuga
In Journal for Nature Conservation, Online (May, 2022), 126193
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

Coastal lagoons have been recognised as a priority habitat for conservation and have benefited from several conservation plans. Under the Mediterranean climate, some of these lagoons might dry out during summer due to drought events. We propose the term Mediterranean Temporary Lagoons (MTLs) for these ephemeral water bodies and discuss their definition and characteristics. This term emerged in France among its coastal zone managers, who now commonly use it for conservation purposes. It is used in both natural systems as well as most artificial salt ponds in abandoned saltworks. In Europe, two directives have integrated lagoons as key targets to be preserved. Nonetheless, a certain discrepancy in the different definitions of lagoons has constrained joint actions. Indeed, while institutional definitions were originally derived from the scientific concept, their legislative and managerials meanings have been gradually modified and nowadays often differ from the original concept to create difficulties in the field. In addition, while it has been recommended to consider MTLs as a coastal lagoon habitat in the European Habitat Directive, its interpretation among EU member states is unsettled. Thus, clarifying lagoon habitats' terminology is required to ensure better management, monitoring and planning, and coordinate conservation actions. We discuss the inclusion of MTLs in habitat 1150 by confronting scientific and institutional literature and propose a new framework to better delimitate lagoon habitat around the Mediterranean basin, integrating MTLs. MTLs represent a specific habitat that hosts a pool of stenoecious macrophytes of conservation interest like Althenia filiformis, Riella helicophylla or Tolypella salina.

Hotspots in the grid: Avian sensitivity and vulnerability to collision risk from energy infrastructure interactions in Europe and North Africa

Wed, 20 Apr 2022 16:10:04

de Jethro G. Gauld, João P. Silva, Philip W. Atkinson, Paul Record, Marta Acácio, Volen Arkumarev, Julio Blas, Willem Bouten, Niall Burton, Ines Catry, et al.
In Journal of Applied Ecology, 59(6) (June, 2022)
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

Wind turbines and power lines can cause bird mortality due to collision or electrocution. The biodiversity impacts of energy infrastructure (EI) can be minimised through effective landscape-scale planning and mitigation. The identification of high-vulnerability areas is urgently needed to assess potential cumulative impacts of EI while supporting the transition to zero carbon energy. We collected GPS location data from 1,454 birds from 27 species susceptible to collision within Europe and North Africa and identified areas where tracked birds are most at risk of colliding with existing EI. Sensitivity to EI development was estimated for wind turbines and power lines by calculating the proportion of GPS flight locations at heights where birds were at risk of collision and accounting for species' specific susceptibility to collision. We mapped the maximum collision sensitivity value obtained across all species, in each 5 × 5 km grid cell, across Europe and North Africa. Vulnerability to collision was obtained by overlaying the sensitivity surfaces with density of wind turbines and transmission power lines. Results: Exposure to risk varied across the 27 species, with some species flying consistently at heights where they risk collision. For areas with sufficient tracking data within Europe and North Africa, 13.6% of the area was classified as high sensitivity to wind turbines and 9.4% was classified as high sensitivity to transmission power lines. Sensitive areas were concentrated within important migratory corridors and along coastlines. Hotspots of vulnerability to collision with wind turbines and transmission power lines (2018 data) were scattered across the study region with highest concentrations occurring in central Europe, near the strait of Gibraltar and the Bosporus in Turkey. Synthesis and applications. We identify the areas of Europe and North Africa that are most sensitive for the specific populations of birds for which sufficient GPS tracking data at high spatial resolution were available. We also map vulnerability hotspots where mitigation at existing EI should be prioritised to reduce collision risks. As tracking data availability improves our method could be applied to more species and areas to help reduce bird-EI conflicts.

Estimation des populations d’oiseaux nicheurs de France métropolitaine

Mon, 7 Mar 2022 13:21:35

de Jacques Comolet-Tirman, Gwenael Quaintenne, Jean-Philippe Siblet, Stanislas Wroza, Guillaume Bal, Jocelyn Champagnon, Laurent Couz, Michel-Alexandre Czajkowski, Pascal Denis, Bernard Frochot, et al.
In Alauda, 90(2) (Juin, 2022), 130-150

Connaître le nombre absolu d'oiseaux dans une population donnée peut sembler secondaire si l'on sait quantifier sa tendance ou décrire son état de conservation. Pourtant, il s'agit d'un paramètre crucial pour évaluer les risques d'extinction ou pour prendre des décisions en termes de politiques de conservation. Une connaissance détaillée de la taille des populations est également très utile pour contribuer au processus de rapportage européen. Cet article est une première réponse aux objectifs fixés par le CEPO: présenter les estimations les plus récentes et les plus fiables pour l'avifaune nicheuse de France métropolitaine et faire de ce document publié à intervalles réguliers une référence officielle et reconnue. 307 espèces nicheuses sont couvertes. Pour 300 espèces, une estimation est publiée ici avec son indice qualité allant de 1 (médiocre) à 3 (bon). Grâce aux indices qualité, le travail du CEPO permet de définir des priorités pour l'amélioration des connaissances.

Phenology and Diurnal Behaviour of Ruddy Shelduck at Oglat Eddaira (Ain Ben Khlil) Wetland, Southwest of Algeria

Wed, 4 May 2022 17:26:47

de Abdelkrim Benaradj, Nabil Charchar, Hafida Boucherit, Mohamed-Laid Ouakid, Moussa Houhamdi
In Ekológia (Bratislava), 41(1) (March, 2022), 70-77
En ligne : sciendo.com[...]

The ecological study (phenology and daytime budget) of ruddy shelduck Tadorna ferruginea (Anatidae) at Lake Oglat Eddaira (Ain Ben Khlil), Southwest of Algeria, was carried out for three consecutive years from August 2017 to July 2020. While ruddy shelduck has the status of a sedentary species, it was found all year round, persisting at low numbers in mid-summer months (July–August). The numbers of ruddy shelduck began to increase from the first decade of September with the arrival of the wintering and breeding populations. High numbers of ruddy shelduck were mainly recorded between late January and early March. During our monitoring, the balance sheet of the rhythms of daytime activities was dominated by feeding in water and on banks (68%), followed by preening (16.77%), swimming (9.85%,), sleeping (4.67%) and flying (1.22%). Therefore, we can conclude that Oglat Eddaira wetland plays the role of a diurnal grazing ground for this Anatidae.

Patterns of microbial abundance and heterotrophic activity along nitrogen and salinity gradients in coastal wetlands

Fri, 22 Apr 2022 18:02:33

de Gema L. Batanero, Andy J. Green, Juan A. Amat, Marion Vittecoq, Curtis A. Suttle, Isabel Reche
In Aquatic Sciences, 84(2) (March, 2022), 22
En ligne : doi.org[...]

Coastal wetlands are valuable aquatic ecosystems with high biological productivity, which provide services such as a reduction in nitrogen loading into coastal waters and storage of organic carbon acting as carbon dioxide sinks. The predicted rise of sea level or freshwater extractions, particularly in the arid Mediterranean biome, will salinize many coastal wetlands. However, there is considerable uncertainty about how salinization will affect microbial communities and biogeochemical processes. We determined the abundance of total prokaryotes, cyanobacteria, and viruses and quantified the heterotrophic production of prokaryotes sensitive- (predominantly Bacteria) and resistant- (predominantly Archaea) to erythromycin in 112 ponds from nine coastal wetlands. We explored the main drivers of prokaryotic abundance and heterotrophic production using generalized linear models (GLMs). The best GLM, including all the wetlands, indicated that the concentration of total dissolved nitrogen (TDN) positively affected the total abundance of prokaryotes and the heterotrophic erythromycin-resistant (ery-R) production. In contrast, heterotrophic erythromycin-sensitive (ery-S) production was negatively related to TDN. This negative relationship appeared to be mediated by salinity and virus abundance. Heterotrophic ery-S production declined as salinity and virus abundance increased. Consequently, we observed a switch from heterotrophic ery-S production towards ery-R production as salinity and virus abundance increased. Our results imply that microbial activity will change from heterotrophic bacterial-dominated processes to archaeal-dominated processes with anthropogenic nitrogen and salinization increases. However, more studies are required to link the mineralization rates of dissolved nitrogen and organic carbon with specific archaeal taxa to enable more accurate predictions on future scenarios in coastal wetlands.

Au bois des Rièges (Camargue, Bouches-du-Rhône), à la recherche de l'Ernobius juniperi (Chobaut, 1899) (Coleoptera Ptinidae Anobiinae)

Fri, 20 May 2022 18:18:50

de Philippe Ponel, Silke Befeld
In L'Entomologiste, 78(1) (January-February, 2022), 77-78
En ligne : hal-amu.archives-ouvertes.fr[...]

Composition and Distribution on a Host of Avian Lice of White Storks in North-Eastern Algeria

Sun, 30 Jan 2022 16:52:12

de Laïd Touati, Mohammed Athamnia, Riad Nedjah, Abdennour Boucheker, Farrah Samraoui, Hamed A. El-Serehy, Boudjema Samraoui
In Diversity, 14(2) (February, 2022), 77
En ligne : www.mdpi.com[...]

The diversity and spatial distribution of ectoparasites of a large colony of white stork Ciconia ciconia at Dréan, in north-eastern Algeria, were investigated during two consecutive breeding seasons. The results indicated that nestlings were infested by the following four louse species: Colpocephalum zebra (Burmeister, 1838), Neophilopterus incompletus (Denny, 1842), Ardeicola ciconiae (Linnaeus, 1758), and Ciconiphilus quadripustulatus (Burmeister, 1838). Overall, the distribution of chewing lice exhibited a clustered distribution, with C. zebra being the most frequent species, with a prevalence of 39.6% and 41.0% in 2011 and 2012, respectively. Our results also suggested niche partitioning among the four louse species within the host’s body parts. A generalized additive model indicated that size, sex, and year influenced the abundance of ectoparasites; the abundance of chewing lice increased with the size of the host and was greater in females, as well as in the first year of study. Further studies are needed to explore the spatio-temporal variability in white storks’ lice infestations.

Notice intermédiaire de Gestion : 2022-2023 : Réserve Naturelle Régionale Tour du Valat (2022)

Fri, 2 Oct 2026 15:01:18

de Tour du Valat
Arles : Tour du Valat, 2022, 32

Le 6ème plan de gestion du site a été élaboré pour la période 2016-2020, afin de suivre le même pas de temps que les programmes de la Tour du Valat. Toutefois, l’utilisation de la méthode des « Conservation Standards » (anciennement dénommé « Open Standards »), dont il s’agissait de la 1ère utilisation en France de cette méthode de gestion adaptative, a permis de fixer les buts, stratégie et objectifs sur le pas de temps nécessaire à l’efficacité de la gestion. Aussi, la plupart des objectifs sont déjà fixés sur des échéances au-delà de 2020. Une évaluation du plan de gestion a été réalisée courant 2020 dans le cadre d’un stage de Master II. Le contexte particulier lié à la crise sanitaire n’a toutefois pas permis de finaliser ce stage par un rapport complet d’évaluation. Nous prévoyions donc d’intégrer les résultats de l’évaluation dans le prochain plan de gestion. L’élaboration du 7ème plan de gestion a débuté courant 2021 avec l’ambition d’y intégrer une composante essentielle et dans l’ère du temps : les conséquences du changement climatique. Un stage de Master 2 a donc permis d’avancer sur ce concept mais n’a, lui non plus, malheureusement pas permis de finaliser le document complet. Dans le même temps, un projet d’extension du domaine de la Tour du Valat avec l’acquisition de la partie nord du marais du Grenouillet est en cours et devrait donc également conduire à terme à l’extension de la RNR. Pour toutes ces raisons, la révision du plan de gestion a pris du retard et actuellement, la RNR n’est donc plus officiellement dotée d’un plan de gestion, nécessitant donc d’approuver cette notice intermédiaire.

Télédétection et modélisation spatiale : applications à la surveillance et au contrôle des maladies liées aux moustiques (2022)

Wed, 17 Sep 2025 15:35:39

de Annelise Tran, Éric Daudé, Thibault Catry
Versaille : éditions Quae, 2022, 147 (Collection Update Sciences & Technologies)

Les moustiques sont vecteurs de nombreux agents pathogènes responsables de maladies, telles que le paludisme, la dengue, le chikungunya ou la fièvre jaune. Selon l’Organisation mondiale de la santé, ils provoquent plusieurs centaines de milliers de décès chaque année. Ils sont aussi à l’origine de zoonoses, comme la fièvre de la vallée du Rift et la fièvre du Nil occidental. Dans ce contexte, les besoins en outils opérationnels permettant d’orienter les actions de surveillance et de contrôle sont importants, à la fois dans les pays du Sud — les zones tropicales et subtropicales sont les plus touchées par les maladies causées par les moustiques —, mais également dans les pays du Nord, où l’installation de nouvelles espèces comme le moustiquetigre augmente le risque d’émergence de maladies. Pour répondre à ces besoins, les images d’observation de la Terre présentent un fort intérêt : la distribution dans l’espace et la dynamique temporelle des moustiques sont influencées par des variables climatiques (températures, précipitations, humidité) et environnementales (disponibilité de zones en eau, végétation), dont les indicateurs peuvent être dérivés d’images satellite. De nombreuses études récentes ont permis de développer des méthodes innovantes couplant télédétection et modélisation spatiale pour prédire la dynamique spatiale et temporelle des moustiques vecteurs et des maladies associées. Au-delà de l’étude de faisabilité, certaines de ces méthodes ont abouti à des outils et à des chaînes de traitement aujourd’hui opérationnels, utilisés par les acteurs de santé publique et les opérateurs chargés de la lutte antivectorielle.

Le modèle GAMELag pour l’étude du fonctionnement des écosystèmes lagunaires méditerranéens : synthèse des caractéristiques techniques et utilisation (2022)

Wed, 29 Jan 2025 15:08:12

de Annie Fiandrino, Romain Pete, Anaïs Giraud, Lucille Picard, Stéphane Stroffek
2022, 1 vol. (81 p.)
En ligne : archimer.ifremer.fr[...]

Le modèle gamelag est un outil d’analyse et de compréhension du fonctionnement des écosystèmes lagunaires eutrophisés et d’aide à la décision pour tester des actions/aménagements en vue de leur restauration. depuis sa conception initiale en 2009, la démarche mise en œuvre en matière de développement de l’outil a volontairement été pragmatique en proposant une conceptualisation simple de l’écosystème et en la complexifiant en tant que de besoin, au regard des limites d’utilisation de l’outil. Le présent document regroupe les éléments de synthèse des connaissances sur l’outil et vise à donner une vision générale, à l’échelle du bassin, des conditions de son déploiement, de ses limites d’utilisation et du soutien technique opérationnel qu’il peut apporter dans la mise en œuvre de la démarche « flux admissibles » portée par le schéma directeur d’aménagement et de gestion des eaux (sdage) rhône méditerranée corse. Une première version de ce rapport, rédigée en novembre 2019 dans le cadre d’un contrat de collaboration entre l’agence de l’eau rhône méditerranée corse et l’ifremer (n°2018 0158 - gamelag ii), proposait une synthèse des connaissances acquises durant les phases de développement de l’outil et de déploiement sur le site pilote de la lagune de Bages-Sigean. Cette seconde version constitue une mise à jour réalisée dans le cadre du contrat de collaboration entre l’agence de l’eau Rhône Méditerranée corse et l’Ifremer (n°20/1000831 – gamelag iii) et intègre les améliorations apportées à l’outil notamment sur les compartiments « macrophyte » et « sédiment ». les nouvelles méthodes d’analyse de scénario élaborées pour la détermination des flux admissibles sont également intégrées. Ce document n’est pas un rapport scientifique et technique en tant que tel mais il constitue un point d’étape actualisé sur le contenu du modèle Gamelag et son utilisation. il pourra également servir de base à l’élaboration de différents documents de communication autour de l’outil.

Estimer les flux de nutriments apportés aux lagunes méditerranéennes: une étape clé pour définir une stratégie de maîtrise de leur eutrophisation : préconisations méthodologiques (2022)

Wed, 29 Jan 2025 15:08:05

de Agence de l’eau Rhône Méditerranée Corse
Lyon : Agence de l'eau Rhône Méditerranée et Corse, 2022, 44 (Eau & connaissance - Lagunes)
En ligne : www.eaurmc.fr[...]

Le SDAGE Rhône-Méditerranée identifie les masses d’eau fragiles vis-à-vis des phénomènes d’eutrophisation dans son orientation fondamentale 5B - Lutter contre l’eutrophisation des milieux aquatiques. Il s’agit de milieux qui présentent déjà des phénomènes d’eutrophisation et/ou qui sont fragiles compte tenu des pollutions par les nutriments qu’ils subissent, de leurs caractéristiques morphologiques, hydrologiques et des effets du changement climatique. Cette orientation préconise notamment d’engager des démarches « flux admissibles » sur les bassins versants concernés par ces masses d’eau fragiles. Les lagunes sont toutes concernées par cette orientation fondamentale. En effet, ces masses d’eau sont des milieux riches, au fonctionnement complexe et particulièrement exposés aux pressions physiques et aux pollutions. Les enjeux de restauration de ces écosystèmes sont forts, notamment dans un contexte de changement climatique. Ce document propose des éléments méthodologiques et techniques pour progresser sur l’estimation des flux de nutriments apportés aux lagunes, première étape pour définir une stratégie de maitrise de leur eutrophisation.

Notice de gestion préalable du marais du Petit Badon 2022 – 2025 (2022)

Fri, 22 Sep 2023 15:36:59

de Patrick Grillas, Olivier Boutron, Pauline Rocarpin, Hugo Fontes, Yves Kayser, Marion Lourenço, Emilie Luna-Laurent, Anthony Olivier, Olivier Pineau, Loic Willm
Arles (FRA) : Tour du Valat, 2022, 47

Le marais du Petit Badon se situe au sud-est de l’ile de Camargue, sur le cours d’un ancien bras du Rhône, celui du Bras de Fer. Le site se trouve dans un contexte de parcelles agricoles et de marais, à environ 11km de la mer et à 3km des Marais et Etangs des salins de Camargue. Le terrain est la propriété de la SCA du Domaine du Petit Badon dont les gérants sont à l’origine du projet de restauration de ce marais. Le site avait été aménagé en exploitation agricole avec une production céréalière jusque dans les années 2000 et a ensuite été pâturé par des chevaux. L'activité agricole avait été certifiée Agriculture Biologique depuis le début des années « 90 » (entre 1990 et 1993)
L’objectif de cette notice de gestion préalable est de définir les grandes orientations de gestion du site, le programme de travaux et de suivis scientifiques et de partager ces informations avec l’ensemble des parties prenantes. Dans une étape ultérieure l’accumulation d’information sur le fonctionnement écologique du marais permettra d’établir un plan de gestion.

Plan de gestion des étangs et marais des salins de Camargue 2023-2032 - Volet 1 : Etat des lieux – diagnostic (2022)

Tue, 23 May 2023 17:46:00

de Parc naturel régional de Camargue, Tour du Valat, Société nationale de protection de la nature, CPIE Rhône Pays d’Arles
Aix en Provence : Conservatoire de l'Espace Littoral et des Rivages Lacustres, 2022, 393
En ligne : cnl.storage.orange-business.com[...]

Plan de gestion des étangs et marais des salins de Camargue 2023-2032 - Volet 1 : Etat des lieux – diagnostic (2022)

Tue, 23 May 2023 17:45:59

de Loïc Wilm, Emilie Luna-Laurent, Marie-Lou Degez
Aix en Provence : Conservatoire de l'Espace Littoral et des Rivages Lacustres, 2022, 88
En ligne : cnl.storage.orange-business.com[...]

Plan de gestion des étangs et marais des salins de Camargue 2023-2032 - Volet 2 : Enjeux, orientations, objectifs de gestion et programme d’actions (2022)

Tue, 23 May 2023 17:45:57

de Parc naturel régional de Camargue, Tour du Valat, Société nationale de protection de la nature, CPIE Rhône Pays d’Arles
Aix en Provence : Conservatoire de l'Espace Littoral et des Rivages Lacustres, 2022, 246
En ligne : cnl.storage.orange-business.com[...]

Plan de gestion des étangs et marais des salins de Camargue 2023-2032 . Annexes (2022)

Tue, 23 May 2023 17:45:56

de Parc naturel régional de Camargue, Tour du Valat, Société nationale de protection de la nature, CPIE Rhône Pays d’Arles
Aix en Provence : Conservatoire de l'Espace Littoral et des Rivages Lacustres, 2022, 112
En ligne : cnl.storage.orange-business.com[...]

Effet du pâturage équin sur le cortège des passereaux paludicoles d’une Réserve naturelle nationale du littoral méditerranéen. (étang de l'Estagnol). (2022)

Thu, 11 May 2023 10:11:34

de Anaïs Marquilly
[S.l.] : Université de Lille, 2022, 26

Dans le cadre du plan de gestion de la Réserve naturelle nationale de l’Estagnol, une gestion des roselières par du pâturage équin extensif est mise en place. L’objectif de cette étude est de déterminer si ce pâturage va impacter d’une manière positive ou négative les passereaux paludicoles présents au sein de ces roselières. L’utilisation d’une méthode de « Capture, Marquage, Recapture », a permis de quantifier et de déterminer les espèces présentes au niveau de deux layons de roselières gérés par du pâturage équin ou non. Des conclusions ont pu être tirées à plusieurs échelles. Le pâturage et la fragmentation du milieu qui l’accompagne a eu un effet négatif sur la quantité de passereaux paludicoles du milieu lors de la migration postnuptiale. Certaines espèces ont été particulièrement impactées, la Rousserolle turdoïde (Acrocephalus arundinaceus) et la Lusciniole à moustaches (Acrocephalus melanopogon) ont vu leurs populations décroitrent et cela également lors de la période de reproduction. Par ailleurs, aucune augmentation significative d’oiseaux non paludicole n’a été déterminée. Il y a donc une régression globale des oiseaux présents sur le site en gestion, et la perte d’oiseaux paludicoles n’est pas compensée par l’arrivée d’oiseaux non paludicoles qui pourraient être plus adaptés au milieu hétérogène. Cette diminution de l’abondance des passereaux paludicoles a été accompagnée par une diminution de la richesse en oiseaux paludicoles sur les sites pâturés.

Suivi scientifique d’une colonie de Flamants roses en Camargue (2022)

Fri, 3 Feb 2023 19:09:03

de Lucas Benaiche
[S.l.] : Ecole de la gestion et de la protection de la nature, 2022, 54

Un effort particulier est mis en place sur l’observation des individus bagués, ainsi que sur la mise en place d’un marquage annuel des poussins, au travers d’un programme de Capture-Marquage-Recapture avec des bagues Darvic. Plusieurs programmes de baguage de l’espèce sont déployés simultanément depuis plusieurs décennies en Méditerranée (France, Espagne, Italie, Algérie, Turquie, Tunisie), permettant d’étudier les déplacements individuels des flamants et leur écologie. En complément du suivi de terrain, certaines analyses photogrammétriques sont utilisées, au moyen d’images aériennes prises par drone. Pour la première fois cette année, certains poussins sont équipés avec des balises GPS en complément du marquage Darvic, dans le cadre d’une étude réglementaire portant sur le golfe du Lion.

Rôle des infrastructures et des pratiques agroécologiques pour la conservation de la biodiversité dans les systèmes de grandes cultures en Camargue (2022)

Mon, 23 Jan 2023 11:21:06

de Pierre Mallet
Avignon : Université d'Avignon, 2022, 227

L’intensification de l’agriculture est une menace majeure pour la biodiversité. L’homogénéisation des paysages et les changements de pratiques réduisent la quantité et la qualité des habitats disponibles. Dans ce contexte, l’écologie des paysages peut être utilisée dans le but de proposer des modes de gestion agroécologique favorables à la biodiversité.
Dans cette thèse j’ai étudié les effets des interactions entre les bordures de parcelles et les pratiques agricoles ainsi qu’entre les bordures de parcelles et les milieux semi-naturels. J’ai pris pour modèle d’étude les paysages rizicoles du delta du Rhône en Camargue. Les paysages camarguais se caractérisent par de grands espaces de zones humides protégés en réserve, des zones de pâturage extensif et de marais à vocation cynégétique et des parcelles de grande culture. Selon leur localisation, ces cultures sont entourées de milieux semi-naturels ou dans des paysages d’openfields. En tant que zone humide majeure du bassin méditerranéen, il existe dans le delta du Rhône des enjeux de conservation de la biodiversité très importants. La Camargue est donc une zone d’étude intéressante pour travailler sur des modes de gestion agroécologique qui permettent de concilier la production alimentaire et la conservation de la biodiversité.
En étudiant l’effet de l’hétérogénéité du paysage le long d’un gradient d’intensité d’utilisation de produits phytopharmaceutiques, je montre que la présence de milieux semi-naturels surfaciques et de bordures de parcelles a un effet positif plus important pour la biodiversité dans les paysages agricoles intensifs. Ces milieux sont utilisés comme des zones refuges par différentes espèces. J’ai ensuite étudié l’effet des surfaces de bordures de parcelles le long d’un gradient de surface de milieux semi-naturels dans des paysages en agriculture biologique. J’ai ainsi mis en évidence le rôle d’habitat de substitution que peuvent avoir les bordures de parcelles pour les oiseaux nicheurs ainsi que leur utilisation comme habitat complémentaire pour les oiseaux hivernants. Cependant, la diversité des niches des espèces rencontrées dans les milieux agricoles camarguais induit des réponses contrastées aux variations de la quantité des différents types d’infrastructures agroécologiques. Afin de prendre en compte ces variations, j’ai modélisé l’effet de la plantation de haies dans le but d’optimiser la conservation de la biodiversité et la fourniture de services écosystémiques.
En conclusion, l’intensification agricole est une menace majeure pour la biodiversité, mais l’adoption de pratiques agroécologiques peut permettre de réduire ces impacts et même offrir des milieux favorables aux espèces. La prise en compte des milieux agricoles dans les programmes de conservation de la biodiversité en Europe est donc nécessaire.

Rapport d'activités annuel WWF France 2022 (2022)

Fri, 20 Jan 2023 16:13:39

de Tour du Valat, Marais du Vigueirat
2022, 44

- Restauration des sites du Cassaïre et de la Petite Forêt en Camargue
- Restauration de zones humides dégradées et conservation de Lestes macrostigma et autres libellules menacées
- Evaluation de deux projets de restauration de continuité hydroécologique intra- lagunaire avec l’anguille européenne, espèce emblématique et menacée

Suivi de la reproduction de la Glaréole à collier - année 2022 (2022)

Wed, 30 Nov 2022 10:44:34

de Yves Kayser
Arles : Tour du Valat, 2022, 24

La Glaréole à collier Glareola pratincola présente une aire de reproduction morcelée, centrée sur le bassin méditerranéen En France, l’essentiel de la population se trouve en Camargue et ses environs. Ce document présente les résultats obtenus lors du suivi de la reproduction de l’année 2020. Les données récoltées sont comparées à celles des années précédentes. Il aborde également quelques aspects liés à la conservation de l’espèce avant de conclure sur les principaux éléments de la nidification de 2020 et sur les perspectives à venir.

Comptage des oiseaux d'eau à la mi-janvier en France. Résultats 2022 du comptage Wetlands International (2022)

Thu, 24 Nov 2022 10:17:33

de Caroline Moussy, Gwenael Quaintenne, Clémence Gaudard
Rochefort : LPO, 2022, 16
En ligne : www.lpo.fr[...]

Avec 2 611 435 oiseaux d’eau recensés lors de cette dernière édition, les effectifs dénombrés à la mi-janvier 2022 en France sont en léger recul.

Les effectifs de Canard colvert et Foulque – soit les deux espèces contribuant le plus aux effectifs du groupe « Anatidés & Foulque » – retrouvent en 2022 des niveaux observés au début des années 2000. Faibles effectifs également pour les Garrot à œil d’or, Fuligules, Eider à duvet, Oie des moissons ou encore Harle huppé qui continuent de décliner. Très bonne année en revanche pour le Canard souchet (1er rang depuis 1967) avec près de 55 000 individus dénombrés dont 12 719 en Camargue ou encore pour le Canard pilet (4e rang) avec de bons effectifs rapportés sur la façade Atlantique, dans les marais du Cotentin et du Bessin ou encore du Golfe du Morbihan à l’estuaire de la Gironde. Du côté des plongeons, record absolu pour le Plongeon catmarin avec près de 7 600 ind. dénombrés et une augmentation observée sur l’ensemble des sites, mais surtout 5 200 ind. comptés rien que sur le littoral picard et 1 320 sur le secteur d’Ecaut à Berk. Si les effectifs de grèbes demeurent dans la moyenne des 10 précédentes années, les effectifs de Grèbe à cou noir (5 151 ind.) rapportés en 2022 sont au plus bas depuis 1993, notamment en PACA, Occitanie et région Auvergne-Rhône-Alpes. Progressions et records d’effectifs pour l’Ibis falcinelle (3 899 ind.), la Spatule blanche (2 290 ind.), ou encore la Cigogne blanche (2 246 ind.) et 2e rang pour le Flamant rose (50 635 ind.) ou encore la Grue cendrée (132 632 ind. ). Du côté des ardéidés, augmentation sur toute la façade Ouest depuis les Hauts-de-France et en particulier en Nouvelle-Aquitaine alors que dans les régions Centre[1]Val de Loire, Bourgogne-Franche-Comté ou encore en Auvergne-Rhône-Alpes, les effectifs sont en net recul, en lien probable avec les conditions météorologiques rencontrées lors du dénombrement. Les effectifs de limicoles rapportés en 2022 demeurent dans la moyenne des 5 précédentes années sans différence particulière si ce n’est les records d’effectifs d’espèces à tradition récente d’hivernage et encore peu abondantes comme le Gravelot à collier interrompu (x2 versus 2021 avec près de 800 individus rapportés) ou encore les Chevaliers culbanc (870 ind.), guignette (659 ind.) ou aboyeur (613 ind.). Les effectifs de Bécasseau violet rapportés en Bretagne (1 207 ind.) progressent par rapport à l’an passé comme, plus modestement, en Nouvelle-Aquitaine (113 ind.), soit la 2e meilleure année pour l’espèce depuis 1978.

La Camargue est une nouvelle fois le site qui accueille le plus grand nombre d’oiseaux d’eau en 2022 (193 121 ind.), avec une majorité d’anatidés.

Gestion du site des étangs et marais des salins de Camargue (2022)

Mon, 19 Sep 2022 11:24:53

de Tour du Valat
Arles (FRA) : Tour du Valat, 2022, 72

Comparaison des sous-populations d’anguille européenne dans quatre milieux contrastés de Camargue par otolithométrie (2022)

Tue, 13 Sep 2022 17:27:01

de Hugo Vey-Payre
Saint-Étienne : Université Jean Monnet, 2022, 44

La forme des otolithes, l'âge et la croissance de l'anguille européenne (Anguilla anguilla) provenant de quatre sites hétérogènes de l'hydrosystème du Vaccarès en Camargue ont été analysés sur un échantillon de 198 individus, capturés entre octobre et décembre 2021. La forme des otolithes a été décrite en utilisant les coefficients de Fourier et les indices de forme. L'âge a été déterminé par la lecture des stries de la paire sagittale des otolithes, concrétions calcaires dans l'oreille interne des poissons. Les longueurs aux âges antérieurs ont été calculées par des méthodes de rétrocalcul à partir des mesures des stries de croissance des otolithes. Le modèle de croissance de Von Bertalanffy appliqué aux longueurs rétrocalculées a permis de comparer le facteur de croissance K et la longueur asymptotique Linf entre les sites. Nous avons montré que les quatre sites semblent avoir des conditions environnementales assez contrastées pour induire des différences dans la forme des otolithes, offrant des conditions de vie différentes pour les individus. Les anguilles sont plus petites, plus jeunes et avec une croissance plus rapide dans l'Etang du Vaccarès et le Marais des Grandes Cabanes que dans le canal du Fumemorte et le canal de la Sigoulette. Ces différences proviennent probablement des caractéristiques spécifiques des milieux. La croissance est accélérée dans les milieux où la salinité est la plus élevée. Le site de Vaccarès (lagune) et le site des Grandes Cabanes (marais) sont des milieux productifs permettant une production accélérée de futurs géniteurs par rapport aux deux autres sites en eau douce. Si les anguilles provenant du Vaccarès sont capables de dévaler pour rejoindre la mer, celles provenant de Grandes Cabanes n'ont pour seule voie de sortie que le canal de la Sigoulette. Ces sites, dits poldérisés, n'ont pas de connexion à la mer, empêchant les anguilles de rejoindre le stock de reproducteurs. Les futures analyses de microchimie et les données de télémétrie permettront de connaître l'histoire de vie des individus et mieux comprendre les migrations inter-sites.

Habitat Use and Selection: Is Habitat Management the Key to Restore Red-Legged Partridge Populations? (2022)

Tue, 13 Sep 2022 16:30:20

de Fabián Casas, Jesus Duarte, David Gonçalves, Alberto Meriggi, Manuel B. Morales, Francoise Ponce, Luis Reino, Juan Traba, Juan Mario Vargas, Fabián Casas, et al.
Cham : Springer International Publishing, 2022, 45-67 (Wildlife Research Monographs)
En ligne : doi.org[...]

Red-legged partridge is a very adaptable species that can be found in a wide variety of habitats and climates. Nevertheless, it is in agrarian pseudo-steppes of the Mediterranean basin where partridges reach their highest densities. In this chapter we reviewed habitat preferences for red-legged partridges during their life cycle along their range. Red-legged partridge habitat use and selection during non-breeding season vary among regions, selecting mostly areas dominated by a mosaic of crops with longer availability of field boundaries and small interspersed patches of natural vegetation. Red-legged partridges select nesting places with dense and tall vegetation cover, and habitat use would vary according to availability, although field boundaries play an important role in nesting success. Overall, habitat diversity and heterogeneity (areas dominated by a mosaic of cropped and non-cropped habitats and interspersed patches of short Mediterranean shrubland), along with high surface availability of field boundaries, define habitat quality for red-legged partridges, but it has been strongly affected by agricultural intensification, being considered the main cause of the decline of red-legged partridge population. Therefore, an “eco-friendly” CAP (Common Agrarian Policy), acting over arable lands and agricultural practices that would favour partridges and diversity in farmland ecosystems, introducing new commitments and incentives for beneficiaries can be essential, and it should be considered a priority to maintain and improve biodiversity and the use of natural resources by humans in agrarian ecosystems. The maintenance and increase of field boundaries surfaced in arable ecosystems, vegetated fallows, beetle banks and mixed crops for game and other wildlife could be positive habitat management actions for partridges and biodiversity in general, in farmland ecosystems.

Au-delà des pathogènes, l’écologie de la santé au service de la conservation en Camargue (2022)

Tue, 13 Sep 2022 16:30:12

de Marion Vittecoq, Michel Gauthier-Clerc
Versailles, France : Editions Quae, 2022

PNA 2020-2030 en faveur des libellules – Rapport d’activités 2021 coordination Provence-Alpes-Côte d’Azur (2022)

Tue, 13 Sep 2022 14:26:50

de Philippe Lambret
Arles : Tour du Valat, 2022, 3

Projet MediCyn - Rapport d’activités 2021 (2022)

Tue, 13 Sep 2022 14:23:43

de Philippe Lambret, Hugo Fontes, L. Quoniam, C. Reljic
Arles : Tour du Valat, 2022, 25 + annexes

Le projet MediCyn, porté par le Grand port maritime de Marseille (GPMM) et monté en partenariat avec la Tour du Valat (TdV), vise à améliorer l’état de conservation et la valeur écologique de deux sites d’un des secteurs « à enjeux » du Plan Rhône- Saône 2015-2020 : Le Grand clos et le Relai, tous deux en zone Natura 2000 et au sein de la couronne agri-environnementale du GPMM.
Trois modes de gestion hydraulique seront testés, avec les modes 1 et 2 visant à contrôler si les effets du mode 3 sont ceux attendus :
▪ mode 1 – gestion actuelle « type marais de chasse traditionnel » avec une mise en eau en juillet et un maintien du niveau d'eau jusque novembre par pompage, puis assèchement naturel dont la période dépend des précipitations ;
▪ mode 2 – gestion type « marais temporaire méditerranéen », avec une mise en eau naturelle (les précipitations ont lieu essentiellement à l’automne) et éventuellement par pompage en décembre afin d’éviter les conditions d'une année particulièrement défavorable (faible probabilité), et veille au maintien du niveau d'eau jusque début mai (éventuellement par pompage), puis assèchement naturel ;
▪ mode 3 – gestion intermédiaire : mise en eau début octobre et maintien du niveau d'eau par pompage jusque fin avril, puis assèchement naturel. L'hypothèse générale est que cette gestion innovante (mode 3) favorise la conservation de la nature et la valeur pastorale des milieux sans modifier de façon significative leur intérêt cynégétique. Pour ce faire, la réalisation de travaux de réfection du réseau hydraulique et des aménagements a été programmée sur le Grand clos et le Relai. Ceux-ci permettront la mise en place de l’expérimentation décrite ci-dessus dont les effets seront mesurés à travers différents suivis. Ces suivis concerneront des paramètres de milieux (niveaux d’eau, conductivités, gestion hydraulique, niveaux trophiques abiotiques), les activités cynégétique et pastorale (tableaux de chasse, calendrier et pression de pâturage, végétation fourragère, satisfaction des usagers des sites i.e. chasseurs et manadiers), des compartiments de la biodiversité (plantes émergées et immergées, macro-arthropodes dont les libellules, oiseaux d’eau chassables

Evolution géomorphologique de dépôts d’overwash sur le site de Véran (Camargue, France) (2022)

Wed, 7 Sep 2022 14:42:38

de Roxane Angleraud
Marseille, France : Université Aix-Marseille, 2022, 95

La digue de Véran, ouvrage de défense côtière camarguais des années 1970, est laissée à l’abandon en 2012 pour des questions économiques d’une part, mais surtout, car cette décision fait partie d’un plan de gestion adaptative du trait de côte dans le cadre du projet REST-COAST, qui a la volonté de mettre en place un repli stratégique depuis 2010 en passant par la renaturation et restauration d’espaces côtiers. Au Sud de la lagune de Beauduc, une plage s’est formée suite à l’abandon de la digue de Véran il y a une dizaine d’années, ce site fait partie des 9 sites pilotes choisis par le programme REST-COAST. Ce cordon littoral composé de dépôts sédimentaires est divisé par des chenaux qui évoluent rapidement. Ce travail a pour but d’étudier les dynamiques morphologiques de cette plage afin de disposer de nouveaux éléments de compréhension sur les réactions sédimentaires qui suivent l’abandon d’un ouvrage de protection, et notamment sur le rôle du transport éolien dans la répartition sédimentaire. La compréhension de ces mécanismes est importante, d’autant plus dans le contexte actuel de changement climatique, car les dunes éoliennes constituent une protection naturelle du littoral face aux aléas de la mer, agissant comme une digue sans ses inconvénient (coût, entretien, impact visuel et paysager, changement anthropique des mécanismes littoraux…).

Rapport semestriel n°5 –janvier – juin 2022, projet FFEM « gestion durable des zones humides en méditerranée » (2022)

Wed, 7 Sep 2022 11:24:52

de Christian Perennou, Laura Dami
2022, 48

Suivi de la macrofaune benthique et évaluation de l’état écologique des milieux lagunaires des anciens salins du delta de Camargue (2022)

Wed, 7 Sep 2022 11:24:52

de Clara Bettoni
[S.l.] : Université de Lorraine, 2022, 60

Quatre lagunes côtières du delta du Rhône, ayant un degré de communication avec la mer qui diffère et impactées plus ou moins fortement par les activités humaines, ont été étudiées dans le cadre du suivi des Etangs et Marais des Salins de Camargue (EMSC) réalisé par la Tour du Valat et financé par le programme Rest-Coast. La physico-chimie a été mesurée, et les invertébrés benthiques ont été échantillonnés dans le cadre du suivi de la Directive Cadre sur l’eau (DCE) des EMSC. L’objectif était notamment de voir si les travaux hydrauliques réalisés en 2019 ont eu un impact de déconfinement des lagunes visible sur les communautés de macro-invertébrés. Pour ce faire, une analyse des communautés et le calcul de l’indice biotique M-AMBI ont été réalisés. Les résultats de l’indice ne montrent pas de changement de classe d’état des deux lagunes situées au nord du site (Galabert et Rascaillan) pouvant être le signe d’un déconfinement. Cependant, la baisse de salinité moyenne annuelle et la découverte d’un bivalve marin (Macomangalus tenuis) auparavant absent sur Rascaillan sont les signaux d’une tendance au déconfinement de celle-ci. Les deux étangs au sud du site (Beauduc et Sablons) ont un bon état écologique, mais une marinisation de Beauduc semble se produire, avec la découverte de nouvelles espèces de bivalves. Différents liens entre les facteurs abiotiques et la répartition des macro-invertébrés ont pu être établis et sont à confirmer lors des prochains suivis.

Restauration de roselière sur le domaine de la Tour du Valat : évaluation du potentiel d’accueil pour l’avifaune paludicole (2022)

Thu, 1 Sep 2022 16:20:43

de Mathilde Bach
Clermont-Ferrand (FRA) : Université Clermont Auvergne, 2022, 37

Dans le contexte actuel de réchauffement climatique et de destruction d’habitats, les roselières sont en fort déclin. Etant des milieux avec une importance patrimoniale pour la reproduction de l’avifaune paludicole, il est primordial de les conserver. Suite à l’endiguement du Rhône, la Camargue est parcourue par des réseaux de roubines (canaux) et de martellières (vannes) rendant la gestion hydraulique mécanique. Par conséquent, la gestion hydraulique doit être réalisée finement pour être adaptée au cycle de l’avifaune. C’est pour cette raison qu’en 2021, certaines roselières du Domaine de la Tour du Valat ont bénéficié d’aménagements afin d’améliorer la gestion hydraulique. Nos résultats suggèrent que les aménagements ont eu des effets positifs sur la diversité en ressources alimentaires des Ardéidés mais également une augmentation de la richesse spécifique du cortège de passereaux paludicoles. Plus généralement, les travaux ont permis d’avoir des niveaux mieux gérés modifiant favorablement la structure des roselières pour la nidification de l’avifaune.

L’espace humide de référence : un nouveau référentiel en appui à la gestion des zones humides. Concept, méthode, résultats, utilisation (2022)

Fri, 29 Jul 2022 12:28:48

de François Chambaud, Pierre Bouscary
Lyon (FRA) : Agence de l’eau Rhône Méditerranée Corse, 2022, 112 (Collection Eau & Connaissance)
En ligne : www.rhone-mediterranee.eaufrance.fr[...]

Contribution Suzanne Catteau
Un nouveau référentiel à la gestion des zones humides dans le bassin Rhône Méditerranée.Concept, méthode, résultats, utilisation.
Ce document présente l’espace humide de référence du bassin Rhône-Méditerranée (EHR). Il est illustré par des travaux de recherche et des résultats spécifiques au bassin. Son objectif est de faire connaitre et de faciliter l’appropriation de ce nouveau référentiel technique.
Il présente une analyse de l’emprise de l’artificialisation et des pressions agricoles dans l’espace humide de référence.
Pour la première fois, est évaluée la proportion de l’espace humide de référence disparue ou altérée par ces deux principaux facteurs d’anthropisation des bassins versants. Le référentiel technique sert également à une qualification des fonctions hydrologiques, biogéochimiques et biologiques des zones humides et de leur altération par les pressions décrites précédemment. Ces fonctions sont à la base des services offerts gratuitement par les zones humides à la société.
Ce référentiel technique est mis à disposition des acteurs : techniciens des structures locales et des agences d’urbanisme, des gestionnaires des zones humides, des services de l’Etat et ses établissements publics.

Assessment of the protection of Important Bird and Biodiversity Areas for seabirds by Special Protection Areas of the Natura 2000 network (2022)

Wed, 15 Jun 2022 15:34:51

de Daniel Mitchell, Antonio Vulcano, Maria Dias
2022, 39
En ligne : www.birdlife.org[...]

Sixty-seven seabird species, including endemic and threatened species, breed and/or spend the winter in the European Union. Although they return to land to breed, seabirds depend on the marine environment for food and spend long periods out at sea. These charismatic and ecologically important species are affected by threats both on land, such as invasive alien species and disturbance at their colonies, and at sea, including bycatch, overfishing, energy installations and pollution. The effective protection of seabird breeding colonies and the coastal and offshore marine areas that they use is vital for safeguarding their future. Special Protection Areas (SPAs) designated under the Birds Directive—which form part of the European Natura 2000 network—provide essential spatial protection for the most important areas for seabirds. The EU Biodiversity Strategy to 2030 aims to increase to 30% the protection of the sea in the EU. This will require a significant expansion of the Marine Protected Area (MPA) network as only 11% of the sea in the EU was protected by 2019. The completion of the marine Natura 2000 network—which has lagged far behind the terrestrial network—will make an important contribution to the achievement of this goal. Important Bird and Biodiversity Areas (IBAs) identified by the BirdLife Partnership represent a network of sites that are significant for the long-term viability of birds. They are identified using scientifically robust and standardised criteria1 and have consistently been used as a scientific reference list for the designation of SPAs2. This report assesses the extent to which IBAs that are important for seabirds (Seabird IBAs) are currently protected by the SPA network in the 22 coastal EU Member States. The results are presented in individual country sheets which highlight progress made with SPA designation in the marine environment since 2014, when BirdLife undertook a similar assessment3, and identify gaps that need to be filled to complete the SPA network at sea. The graphs and figures in the country sheets summarize the results of the analysis, whilst the text provides an overview of the current situation in the country.

A comparative study of biodiversity between natural, urban and agriculture environments in the Gediz Delta, Turkey (2022)

Mon, 30 May 2022 16:18:28

de Dilara Arslan
[S.l.] : Avignon Université, 2022, 162

Economic growth, demographic pressures, and lack of enforcement of environmental laws and protections have caused important levels of land-use changes and habitat destruction, threatening wetlands and their biodiversity around the world. Land-use changes have been the most important driving force on species composition changes in the last century. Mediterranean wetlands have been transformed by human activities over last the century and one-third of their surface area has been lost in the last decades. Understanding and quantifying the community-level responses to the land-use cover changes is essential for creating sustainable conservation management to protect species and ecosystems. The Gediz Delta is located in the Mediterranean basin of Turkey and offers the opportunity to understand better how agriculture and urbanization affect biodiversity with a good potential for generalization in other wetlands in the Mediterranean basin. This study's main objective is to better understand how land cover affects bird and reptile community assembly processes and which habitats in the Gediz Delta need special conservation attention. The study is divided into 3 components: First, we (a) evaluated the avian biodiversity changes in Gediz Delta from the 1980s-2019, and (b) compared bird and reptile communities in natural, agricultural, and urban environments. Finally, we (c) made a threat analysis and identified possible conservation actions for future management to reduce the effects of threats and improve the sustainable management of the delta.

Caractérisation du recrutement et de la dynamique migratoire des civelles d'anguilles Européennes dans le delta de Camargue (2022)

Wed, 6 Apr 2022 11:14:30

de Colin Bouchard, Olivier Boutron, Delphine Nicolas
Arles (FRA) : Tour du Valat, 2022, 156

L’anguille Européenne (Anguilla anguilla) colonise les eaux littorales et les cours d’eaux côtiers Européens pour y accomplir sa croissance. Comme de nombreuses autres espèces de poissons migrateurs, la population subit un déclin depuis les années 1980. Les états Européens ont maintenant l’obligation de mettre en place et appliquer des politiques de gestion qui permettent de retrouver les niveaux d’échappement (i.e., anguilles argentées migrant en mer) observés avant le déclin. Une partie des nécessités de ces politiques réside dans le suivi du recrutement en civelles (i.e., abondance en civelles migrant en eaux douce ou saumâtre), de mieux comprendre le comportement migratoire des civelles dans les hydro-systèmes littoraux, et d’identiﬁer des actions pour améliorer à la fois le recrutement et la migration des civelles.
L’historique exploitation de ce jeune stade, ainsi que la mise en place de suivis scientiﬁques, a permis d’avoir des séries temporelles du recrutement dans plusieurs estuaires Français et Européens. En France, la majorité de ces séries temporelles correspondent à des estuaires localisés le long des côtes Atlantiques. Or les civelles arrivant sur les côtes Européennes colonisent une diversité d’hydro-systèmes littoraux. Ainsi, la colonisation d’hydro-systèmes particuliers comme des marais, étangs, ou delta, est peu connue et suivie. Il existe également un manque de connaissances sur le recrutement et le com- portement migratoire des civelles le long des côtes Méditerranéennes.
De part sa localisation le long des côtes Méditerranéennes et sa spéciﬁcité de réseau complexe d’étangs, lagunes, et canaux, le delta du Rhône représente un hydro-système riche, disponible, et adéquat pour la colonisation des civelles et la croissance d’individus. Quelques précédentes études sur la dynamique de recrutement en civelles ont été accomplies sur de courtes périodes ou quelques sites indépendamment mais aucune analyse globale de la colonisation à l’échelle de la Camargue n’avait encore été réalisée. Au cours des dernières décennies (10-30 ans), de plus en plus d’eﬀorts ont été réalisés par les gestionnaires locaux (Parc Naturel Régional de Camargue, Société Nationale de Protection de la Nature/Réserve Nationale Naturelle de Camargue, Tour du Valat, Association Migrateurs Rhône Méditerranée, Oﬃce Français de la Biodiversité, Conseil départe- mental des Bouches du Rhône, Association des Amis des Marais du Vigueirat, Grand Port Maritime de Marseille, Conservatoire du Littoral, Syndicat Mixte Inter-régional d’Aménagement des Digues du Delta du Rhône et de la Mer, collectivités locales, ...) pour améliorer le fonctionnement naturel des marais, la gestion des ouvrages relatifs à la gestion des niveaux d’eau, et le suivi des espèces piscicoles patrimoniales. Ainsi, il apparaissait nécessaire de mieux évaluer le recrutement en civelle dans cet hydro-système au travers d’une approche globale en mutualisant les données acquises sur plusieurs sites de suivis, mais aussi d’une approche locale pour mieux identiﬁer des paramètres environnementaux et des actions de management propres à chaque site. Enﬁn, il apparaissait nécessaire de commencer à mieux comprendre le comportement migratoire des civelles dans ces hydro-systèmes particuliers mais aussi au passage d’ouvrages d’art permettant la gestion des niveaux d’eau, et sur lesquels les gestionnaires peuvent appliquer des poli- tiques de gestion. Ainsi ce projet visait à améliorer la caractérisation du recrutement et de la dynamique migratoire des civelles d’anguilles Européennes dans le delta de Camargue.
Des données de recrutement en civelles provenant de cinq sites diﬀérents dans le delta de Camargue et acquises depuis 1993 jusqu’à 2021 ont été utilisées pour répondre à cet objectif. Ces données correspondaient à des abondances de civelles capturées par des pièges passifs (ﬁlets verveux) ou des passes à civelles mais aussi des données individuelles (biométrie et stades pigmentaires) sur une partie des individus capturés. Ainsi, diﬀérents modèles ont pu être réalisés. Chaque modèle avait un objectif particulier : la caractérisation de la variabilité spatio-temporelle du recrutement à l’échelle globale (chapitre 1, page 15), l’estimation de la vitesse de migration des civelles à l’intérieur du delta (chapitre 2, page 45), la caractérisation du recrutement à l’ouvrage de la Fourcade et l’eﬀet de sa gestion et de variables environnementales sur la migration des civelles à cet endroit (chapitre 3, page 71), et enﬁn, l’utilisation du recrutement en civelles pour évaluer la connectivité écologique au sein d’une partie du delta de Camargue, les étangs et marais des Salins de Camargue (chapitre 4, page 107).
Bien que des données de plusieurs sites ont été utilisées tout au long du projet et que certaines analyses ne sont pas aﬃchées dans ce présent rapport, il apparait que la première des pistes d’améliorations du suivi de l’anguille Européenne dans le Delta de Camargue passe par une meilleure homogénéisation des suivis entre les sites (pression d’observation, méthode d’observation) et l’adoption d’une distribution des suivis le long des potentielles voies de migration (e.g., accès à des marais, étangs, connexions à la mer). La mise en commun des suivis de plusieurs sites a permis de mettre en évidence, comme pour le suivi à l’échelle Européenne, que les variations inter-annuelles sont peu marquées avec seulement un dernier pic observé en 2013-2014 et qu’il n’y avait aucune tendance récente, qu’elle soit positive ou négative. La méta-analyse des suivis du recrutement en civelles (chapitre 1, page 15) a aussi permis de mettre en évidence des périodes cruciales pour suivre le recrutement en Camargue, à savoir la période Janvier-Avril même si le proﬁl du pic de migration en civelles dans le delta varie entre les années. Enﬁn, les diﬀérents sites suivis peuvent présenter une saisonnalité particulière dépendamment de leur distance à la mer ou de leur spéciﬁcité (e.g., station de pompage), rendant nécessaire des suivis localisés et spéciﬁques répartis dans le delta.
Deux sites ont fait l’objet d’une attention particulière dans ce travail de part leur spéciﬁcité et leur importance dans le Delta de Camargue. Premièrement, le recrute- ment au Grau de la Fourcade a été particulièrement étudié pour mettre en évidence les variations temporelles de celui-ci (chapitre 3, page 71), mais aussi pour relier les variations du recrutement et ses caractéristiques (i.e., stades pigmentaires) à des variables environnementales : température de l’eau, niveau d’eau de part et d’autre de l’ouvrage, débit d’eau, et nombre de martelières ouvertes. Ce dernier facteur “environnemental" était particulièrement important car il résulte directement des politiques de gestions appliquées à la Fourcade. Il a ainsi été observé un fort recrutement pendant les mois de Février-Mars, et une plus forte proportion de jeunes stades lors des captures pendant les mois de Janvier, Février, et Octobre, indiquant que la période Janvier-Mars était bien à sanctuariser et à privilégier pour permettre un bon recrutement via le Grau de la Fourcade. Nos modèles ont également permis de montrer que les captures en civelles augmentaient lorsque les débits d’eau sortante diminuaient ou que la hauteur d’eau entre la mer et les étangs était nulle ou élevée (i.e., le niveau des étangs étant alors plus bas que celui de la mer). Ainsi cibler une ouverture d’un grand nombre de martelières lorsque les niveaux de part et d’autre de l’ouvrage sont égaux ou que l’eau rentre dans les étangs apparaît être une mesure de gestion plus favorable pour le recrutement en civelles. Lorsque l’eau sort des étangs, il faudrait jouer sur la hauteur d’ouverture des martelières et le nombre de martelières ouvertes pour diminuer la vitesse de courant dans le chenal, et ainsi faciliter sa remontée par les civelles. Cependant, il pourrait être envisagé de tester diﬀérents scénarios de gestions des martelières dans des conditions environnementales similaires pour évaluer leur eﬃcacité. Il apparait en tout cas opportun d’aﬃner la gestion des martelières en jouant sur le nombre de martelières ouvertes mais également leur degré d’ouverture, comme c’est le cas sur d’autres ouvrages en Europe.
Le deuxième site pour lequel une attention particulière a été portée correspond aux Étangs et Marais des Salins de Camargue, qui sont localisés au Sud-Est du delta (EMSC, chapitre 4, page 107). Une politique de gestion visant à re-naturaliser ces anciens marais salants s’y applique depuis 2011 pour viser un fonctionnement le plus naturel possible. Plusieurs stations de suivis du recrutement en civelles ont permis d’étudier pendant cinq années la connectivité au sein de ce site, permettant de relier la mer aux étangs intérieurs du delta de Camargue. Il en résulte que les niveaux de captures au sein des EMSC étaient faibles mais qu’aucun point de blocage n’est apparu. Mais une analyse des stades pigmentaires tend à montrer que les individus capturés en amont des EMSC (Comtesse) proviendraient surtout d’une migration rapide, probablement par des brèches plus à l’Ouest. Des études complémentaires pour étudier le comportement migratoire des civelles au sein des EMSC semblent pertinentes à envisager, ainsi qu’un meilleur appel d’eau douce en amont du site et un suivi de la connexion entre l’amont du site et les étangs intérieurs.
Ce dernier point met en lumière la nécessité de mieux comprendre le comportement migratoire des civelles au sein des hydro-systèmes. Ainsi, les données de recrutement à la Fourcade et à la Capelière, ont permis une première étude de la migration au sein de l’hydro-système entre la mer et l’étang intérieur du Vaccarès (chapitre 2, page 45). Ainsi, une vitesse de migration des individus a été estimée et elle coïncide avec une migration active sans aide des mouvements de masses d’eau comme ce peut être le cas dans des estuaires avec une migration accélérée par le courant de marée. Des études plus ﬁnes sur la migration interne, avec quels habitats sont utilisés, quels facteurs permettent de maximiser l’eﬃcience de cette migration pourraient être envisagées.
Globalement, cette première étude intégrant des données de recrutement obtenues à plusieurs sites et en adoptant une vision globale mais aussi locale, a permis d’identiﬁer des axes de travaux pour adopter une stratégie mêlant point de vue global et point de vue local. Il s’agit d’une première pierre pour aﬃner les connaissances dans ces milieux très particuliers. Il en résulte également la nécessité de tenir compte de la globalité du cycle de vie de l’anguille Européenne se déroulant dans cet hydro-système particulier qu’est le delta de Camargue.

Disentangling ongoing hybridization and cryptic species of the submerged macrophyte genus Ruppia, using ecological and molecular insights (2022)

Tue, 29 Mar 2022 16:22:07

de Lise Beirinckx
Brussels, Belgium : Vrije Universiteit, 2022, 313

Aquatic plants are an ecologically and taxonomically diverse group that plays key role in continental and coastal aquatic habitats worldwide. However, despite their ecological importance in aquatic ecosystems, they are relatively poorly studied. Aquatic plant genera are generally assumed to have only few species, but they occupy broad geographical and ecological ranges. Only recently, evidence with different types of molecular markers suggested that macrophytes are taxonomically more complex than previously considered, due to either cryptic species or hybridization and polyploidization. The salt-tolerant macrophyte genus Ruppia is one of these aquatic genera with a simple and slender morphology and difficult species identification. It occurs in brackish to saline waterbodies all over the world that are characterized by variations in water level and salinity. Taxonomy within this genus has always been difficult because it combines high morphological variability with the lack of unambiguous identification criteria. Two European species are generally recognized, R. spiralis and R. maritima, although they are sometimes difficult to distinguish morphologically. As a result of wrong species identification, our ecological understanding of these species remained limited. In this thesis we used a combination of molecular markers and germination experiments to unravel locally co-existing Ruppia lineages. First, microsatellite markers combined with chloroplast and nuclear sequence data were used to detect and delineate different Ruppia lineages that co-exist within a Mediterranean and a North-sea wetland area. Second, seed germination experiments were carried out to understand how these lineages can locally co-exist. We found that R. maritima and R. spiralis are two well-diverged species that can be easily distinguished genetically and ecologically. R. spiralis is a perennial, outcrossing species. Seeds either germinate under freshwater conditions at summer temperatures, or saltwater conditions under early spring temperatures. This broad germination niche coincides with the wide environmental distribution in different types of (semi-)permanent waterbodies. R. maritima on the other hand is a diploid, selfing species. Seeds only germinated under low salinities, which partly explains its very restricted habitat of temporary ditches in the studied areas. However, genetic markers also revealed that Ruppia taxonomy is complicated by several hybrid lineages that could not be distinguished morphologically. A Mediterranean hybrid lineage of an ancient origin may present an emerging species and occupies a distinct pond type. This lineage likely results from a cross between a currently unknown taxon and R. maritima, probably followed by frequent backcrossings with R. maritima as the pollen donor. This led to chloroplast capture, a phenomenon where the nuclear and chloroplast DNA have different origins. In case of these ancient Mediterranean hybrids, the chloroplast DNA -which is inherited maternally- probably descends from the unknown taxon and is distinct form any other known European Ruppia species, whereas the nuclear DNA is resembles R. maritima. In addition, more recent lineages of a hybrid origin were detected, involving R. spiralis and this ancient Mediterranean hybrid lineage, where the latter acted as the pollen donor. In wetlands along the North-sea however, recent R. spiralis x R. maritima hybrids were encountered. The detection of several morphologically similar but genetically and ecologically diverged Ruppia lineages, suggests that we must reconsider Ruppia species diversity and distributions. Our findings support the hypothesis that macrophyte genera might be more diverse and complex than previously thought. Considering the high threats aquatic ecosystems currently face, this complexity should be more thoroughly investigated, both taxonomically and ecologically

Rapport d'activité 2021 (2022)

Tue, 29 Mar 2022 11:42:02

de Pôle-relais lagunes méditerranéennes
Arles (FRA) : Tour du Valat, 2022, 23
En ligne : pole-lagunes.org[...]

Crossroad for bird migration: France should improve the conservation of its key-wetland sites used by 6 million waterbirds

Tue, 18 Jan 2022 10:44:55

de Julien Birard, Pierre Defos du Rau, Clémence Gaudard, François Guerquin, François Lamarque, Jean-Philippe Siblet, Jean-Yves Mondain-Monval
In European Journal of Wildlife Research, 68(1) (January, 2022), 8
En ligne : link.springer.com[...]

Abundance of wild species is generally used to prioritize and evaluate networks of protected areas (PAs). Waterbird abundance information, collected through the International Waterbird Census (IWC), is widely used to identify key sites for migratory waterbirds, which are listed in the Critical Site Network (CSN) database. We reviewed IWC information, as well as national and local surveys of breeding populations, for each significant wetland and each waterbird species in all French territories within the African-Eurasian Migratory Waterbird Agreement range. We used this review to update the French network of critical sites. We then confronted these waterbird data with the corresponding site-specific data provided by the CSN in order to assess its accuracy for French critical sites. In addition, these waterbird data were used to assess the efficiency of the current network of French PAs to encompass these critical sites, with a particular focus on Ramsar wetlands. We updated the French list of critical sites from the outdated 129 sites listed by the CSN to only 97, including 32 sites not previously detected by the CSN. We also showed that only one French critical site out of five benefits from the strongest category of protection over more than three-quarters of its area. Furthermore, almost one critical site out of five has no protection at all over more than half of its area. The French network of critical sites thus lacks adequate protection, including for some of the most important ones in terms of waterbird abundance and diversity. We advocate for a renewed French effort in wetland conservation and support to the CSN tool maintenance.

Threat Ranking to Improve Conservation Planning: An Example from the Gediz Delta, Turkey

Wed, 15 Dec 2021 16:21:19

de Dilara Arslan, Kerim Cicek, Ömer Döndüren, Lisa Ernoul
In Land, 10(12) (December, 2021), 16
En ligne : www.mdpi.com[...]

Mediterranean wetlands are among the most threatened natural areas. The needs and demands of an increasing human population are modifying land use and converting natural habitats into artificial areas. In order to combat these trends, effective conservation planning needs to provide clear, systematic identification of threats to find sustainable conservation strategies. In this case study, we evaluated current threats in the Gediz Delta (Turkey) using a multi-method approach. First, we did a comprehensive literature review and stakeholder interviews to identify existing threats. We then did a complete survey of the Delta through intensive fieldwork. The threats were coded and ranked using the conservation standards. We used the threat ranking and field survey to map the most vulnerable areas of the Delta. The most commonly observed threats in the field were pollution and agriculture and aquaculture activities. According to the threat ranking, the most important threats are climate change and residential and commercial development. The habitats that are most at risk are agricultural grassland habitats. The results indicate a need to extend conservation actions in the inner part of the Delta. In addition, the multi-method threat ranking approach could serve as a model to improve conservation planning in other sites worldwide.

Long-Term Changes in the Wintering Population of the Dalmatian Pelican along the Black Sea-Mediterranean Flyway

Wed, 2 Feb 2022 18:03:55

de Christos Barboutis, Christina Kassara, Olga Alexandrou, Giorgos Catsadorakis
In Ardea, 109(2) (December, 2021)
En ligne : bioone.org[...]

The future of temporary wetlands in drylands under global change

Thu, 18 Nov 2021 17:44:01

de Gema Parra, Francisco Guerrero, Javier Armengol, Luc Brendonck, Sandra Brucet, C. Max Finlayson, Luciana Gomes-Barbosa, Patrick Grillas, Erik Jeppesen, Fernando Ortega, et al.
In Inland Waters, Online (November, 2021), 1-12
En ligne : www.tandfonline.com[...]

The Andalusian International University held a workshop entitled Temporary wetlands’ future in drylands under the projected global change scenario in March 2020 in Baeza, Spain, with 26 participants from 10 countries. The workshop objectives were to promote international cooperation and scientific exchange on the conservation and protection of temporary wetlands. The participants highlighted the extreme conditions that temporary and permanent wetlands, ponds, and shallow lakes are currently facing and predicted a dismal future for these systems due to climate change. To foster a holistic view of these ecosystems, the workshop included wetland watersheds. It was concluded that the main threats are those affecting water quality and quantity as well as egg-seed banks, species population dynamics, and food webs. The inherent characteristics of waterbodies in drylands, including high resilience and resistance to harsh conditions, are already negatively impacted by direct human actions and climate change. Another threat is the time lag between scientific warnings about threats and the social and political concern leading to mitigating actions. Thus, more effective actions to protect and conserve temporary wetlands are essential. Research networks could help stimulate the necessary conservation actions, but the global recession due to the COVID-19 pandemic will pose a challenge as economies are burdened with urgent expenditure. This special issue of the journal Inland Waters is the outcome of the workshop presentations and is composed of the ensuing papers on wetlands in drylands.

Phenology and diurnal behavior of common shelduck Tadorna tadorna at Sebkhet (El-Eulma, Nouth-East of Hauts Plateaux, Algeria)

Mon, 25 Oct 2021 14:36:45

de Leila Bouaguel, Nabil Charchar, Moussa Houhamdi
In Acta Biologica Sibirica, 7 (October, 2021), 293-306
En ligne : abs.pensoft.net[...]

This work aims to study phenology and daytime budget of common shelduck Tadorna tadorna (Anatidae) for two wintering seasons (2017/2018, 2018/2019) at Sebkhet Bazer (El-Eulma) North-East of Algeria from September to March. The obtained results show that common shelduck has the status of a wintering species. It was observed presently in the site during the study period. Common shelduck numbers begin to increase from the first decade of September to reach the maximums between late December and early January, where we had recorded the peaks of abundance 840 for the first season and 930 for the second. During our monitoring, budget time results showed that feeding is the dominant activity (surface water feeding, feeding on banks, and feeding by tipping), which take a ratio of more than 68%, the second activity is swimming with 18.71%, followed by preening which holds 9.14%, sleeping activity with a ratio of 2.38%, flight take the five range with a ratio of 0.82%. Finally, courtship and agonistic behavior recorded the lowest ratio on all budget time – 0.42% and 0.38% respectively. We can conclude that Sebkhet Bazer is a diurnal grazing ground for this Anatidae species.

Water Birds as Indicators of Ecological Conditions in a Ramsar Wetland (Sebkhet Bazer, East of Algeria)

Wed, 20 Apr 2022 16:10:01

de Sabrina Djerboua, Sofia Djerdali, José Guerrero-Casado, Abdelkrim Si Bachir, Ali Guendouz
In Agricultural Science Digest, Online (October, 2021)
En ligne : arccjournals.com[...]

Background: Wetlands are the highly complex ecosystems due to various interactions between the components, where, the most iconic of ecological changes are the water birds. The current study was aimed to examine the interactions between the water birds diversity, abundance and the abiotic factors in Sebkhet Bazer.
Methods: The investigation was conducted between March 2013 and December 2014 in Sebkhet Bazer (Sétif, Algeria, 36°05'N and 5°45'E), by monitoring water birds abundance (grouped into 4: Anatidae, Rallidae, Phoenicopteridae and Shorebirds) and measuring the physico-chemical water parameters (depth, temperature, pH, salinity and vegetation cover). All statistical analysis was performed using the InfoStat software (2017), it was carried out in two steps, by testing of fixed linear models; first of the seasonal differences in water body variables and second of the seasonal differences in bird abundance for the 4 water bird groups.
Result: The results showed that the physico-chemical parameters of water varied considerably from season to season. The four groups of birds reached their lowest abundance in summer, with Rallidae and Phonicopteridae being more abundant in spring, Anatidae in winter and Shorebirds in autumn, suggesting that this variation is attributed to changes in water body characteristics between the four seasons. Therefore, the abundance of the different water bird group could be used as an ecological indicator of this wetland’s characteristics. If these features are altered by climate change, the water bird community would be also affected.

Characterization and diversity of Babesia sp. YLG, a new member of the Peircei group infecting Mediterranean yellow-legged gulls (Larus michahellis)

Mon, 25 Oct 2021 14:36:39

de Claire Bonsergent, Marion Vittecoq, Carole Leray, Louisiane Burkart, Karen D. McCoy, Laurence Malandrin
In Ticks and Tick-borne Diseases, Online (October, 2021), 101852
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

Avian infecting piroplasms are largely under-studied compared to other hemoparasites, and this paucity of information has blurred our phylogenetic and biological comprehension of this important group as a whole. In the present study, we detected and characterized Babesia from yellow-legged gull (Larus michahellis) chicks from a colony in southern France. Based on morphological and molecular characterizations, a new Babesia species belonging to the Peircei group, a clade of avian-specific piroplasms, was identified. Due to the complexity of species delineations and the low number of parasites characterized in this clade to date, a species name was not yet attributed; we refer to it for now as Babesia sp. YLG (Yellow-Legged Gull). High prevalence (85% and 58% in 2019 and 2020, respectively) and high parasitemia (up to 20% of parasitized erythrocytes) were recorded in chicks, without any obvious clinical signs of infection. Although the 16 isolates had identical 18S rRNA gene sequences, 6 genetic variants were described based on partial cox1 sequencing, with evidence of chicks co-infected by two variants. Transmission of Babesia sp. YLG via the soft tick Ornithodoros maritimus is discussed.

Effect of inter-annual meteorological fluctuations and wild boar disturbance on the vegetation of Mediterranean temporary ponds

Thu, 16 Dec 2021 10:47:33

de Maria Carmela Caria, Patrick Grillas, Giovanni Rivieccio, Simonetta Bagella, Péter Török
In Applied Vegetation Science, 24(4) (October, 2021)
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

Which are the effects of inter-annual meteorological fluctuations on plant species richness and vegetation dynamics in Mediterranean temporary ponds, shallow wetlands characterized by alternating phases of drought and flooding? Which are the effects of wild boar disturbance? How do the responses of specialist or non-specialist species of the habitat differ?
Location: NW Sardinia Island (Italy).
Methods: We assessed plant cover during six years within one 60 cm × 60 cm quadrat in each of five areas. To measure the effect of inter-annual meteorological fluctuations on vegetation, we used two indices: the evapotranspiration and the synthetic agrometeorological indicator. To quantify the effect of disturbance by boars, we compared two treatments: disturbed and non-disturbed (located outside and inside 1.5 m × 1.5 m exclosures respectively). As a whole, we monitored 60 plots (6 years × 2 treatments × 5 replications). We analyzed data using ANOVA, PERMANOVA and BIO-ENV.
Results: Plant species richness and composition showed significant differences between years and treatments. Species composition was correlated with the evapotranspiration before the vegetative peak during the last period and with the agrometeorological indicator during the whole vegetative period. Specialist species showed much weaker growth, quantified as cover, in the drier years. Starting from the third survey year, plant richness and cover of specialist species were significantly higher in disturbed than in not-disturbed plots. The extent of bare soil generally was not affected by the treatment.
Conclusion: Meteorological fluctuations affect plant species composition and vegetation dynamics in Mediterranean temporary ponds. The sensitivity of specialist species could make them particularly vulnerable to climate change. Nevertheless, they are resilient to unpredictable disturbances such as burrowing by wild boar. However, our results concerning the positive impact of wild boar disturbance on the vegetation cannot be generalized. Elsewhere, the lack of hunting activity could also be a problem for these habitats.

Grazing in temporary paddocks with hardy breed horses (Konik polski) improved species-rich grasslands restoration in artificial embankments of the Rhône river (Southern France)

Fri, 15 Oct 2021 08:27:18

de Cannelle Moinardeau, François Mesléard, Hervé Ramone, Thierry Dutoit
In Global Ecology and Conservation, Online (October, 2021), 16
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

Extensive horse grazing with hardy breeds is largely used in conservation management for restoring species-rich semi-natural grasslands in Europe. As an example, the Donzère-Mondragon Rhône river embankments (south-eastern France) where horse grazing with Konik polski succeeded to maintain high species richness in patches of open and short grassland, but failed for patches of tall grassland dominated by the grass tussock species Brachypodium phoenicoides. In response, an increase of herd density by the creation of temporary paddocks was applied in tall grassland patches. Grazing pressure over time between patches was estimated via GPS fixed to mares, biomass, plant species richness measurements and from multispectral photographs, the normalized Difference Vegetation Index (NDVI) was calculated. Finally, telemetric data were collected. We wondered if the use of extensive horse grazing with temporary paddocks occupation, increase plant species richness. After three years, our results show that the increase in stocking rate enabled a significant increase of plant species richness in the tall grassland patches, with a significant decline of B. phoenicoides in all paddocks. The NDVI was strongly correlated with herbaceous biomass and plant species richness, while the number of GPS points indicating the position of the mares was higher in areas where the NDVI was high. These results are discussed for improving horse grazing conservation systems efficiency on grasslands established in anthropized sites such as embankments and the use of the NDVI as an appropriate tool to help decision-making for large-scale applications.

Foreseen impact of climate change on temporary ponds located along a latitudinal gradient in Morocco

Mon, 27 Sep 2021 09:36:30

de Patrick Grillas, Laïla Rhazi, Gaëtan Lefebvre, Mohammed El Madihi, Brigitte Poulin
In Inland Waters, Online (Septembre, 2021), 1-16
En ligne : www.tandfonline.com[...]

Wetlands have been declining worldwide, with an estimated 64–71% loss over the last century. Climate change is increasing pressure on wetlands, aﬀecting their hydrology, and Mediterranean temporary ponds could be particularly vulnerable to these changes. We studied the expected changes in hydrology and plant community according to climatic change scenarios in 18 temporary ponds distributed in 6 areas along a latitudinal and climatic gradient in Morocco (750 km; 4° latitudinal gradient). Richness of pond species was signiﬁcantly correlated with water level and pond hydroperiod and showed a strong decline from north to south along with increased water stress. Using the Mar-O-Sel software (mar-o-sel.net), we simulated the future evolution of water balance and wetland hydroperiod (duration and frequency of ﬂooding) in these ponds for mid- and late-21st century. Climate projections were estimated based on 2 Representative Concentration Pathway (RCP) scenarios assuming a stabilization (RCP4.5) or increase (RCP8.5) in greenhouse gas emissions. The mean water deﬁcit of the ponds currently ranges between −1380 and −1812 mm/yr and would increase by 16–67% in 2100 under the RCP8.5 scenarios. Pond richness is expected to decrease by 8–15 species in 2100, depending on area, as a result of shorter projected hydroperiods. Severity of change was not related to location of the ponds along the latitudinal (aridity) gradient, but rather to the interaction between the size of their catchment area and the thickness of the permeable soil layer.

La Grue cendrée en france. Migration et hivernage. Saison 2020-2021

Thu, 14 Oct 2021 09:16:52

de Jocelyn Champagnon, Collectif Grus Gascogna, Patrick Dulau, Alain Gendeau, Sébastien Merle, Alain Salvi
In La Grue cendrée en France (Septembre 2021), 16
En ligne : champagne-ardenne.lpo.fr[...]

Ce document retrace succinctement la migration et fait un point précis sur les effectifs hivernants en France pour la saison 2020-2021.

Diversity and Structure of Nesting Birds in the Coastal Riparian Zones of Great Kabylia in Algeria

Wed, 1 Sep 2021 16:37:46

de K. Hachour, N. Talmat-Chaouchi, R. Moulai
In Zoodiversity, 55(4) (25/08/2021), 10
En ligne : ojs.akademperiodyka.org.ua[...]

Diversity and Structure of Nesting Birds in the Coastal Riparian Zones of Great Kabylia in Algeria. Hachour, K., Talmat-Chaouchi, N., Moulaï, R. — The study of the nesting birds of the coastal riparian zones in Great Kabylia in Algeria, allowed us to identify 45 species of birds, belonging to 12 orders and 26 families. The richest site in terms of species is Takdempt (31 species). The lowest diversity is noted at the level of Boudouaou wadi with 16 species. The values of the Shannon-Weaver diversity index (H’) for all sites are quite high (≥ 3 bits). Concerning the global abundance of avifauna, the site that represents the highest centesimal frequency is that of Takdempt (20.87 %) and this is due to the presence of a colony of Bubulcus ibis (Linnaeus, 1758). The bird communities of the sampled sites are not identical, but the degree of similarity, in general, is quite high (≥ 50 %). The main factors controlling the diversity and the structure of the avifauna of Great Kabylia coastal riparian zones are represented by vertical and horizontal vegetation structure.

Coastal riparian zones
nesting birds
Algeria

Assessing the age of the Red-crested Pochard ducklings Netta rufina (Anatidae, Anseriformes) based on photo comparisons

Fri, 20 Aug 2021 15:11:02

de Abdeslam Rihane, Sidi Imad Cherkaoui
In Journal of Materials and Environmental Sciences, 12(8) (August, 2021), 1021-1035
En ligne : www.jmaterenvironsci.com[...]

The assessment of the size of the Red-crested Pochard ducklings Netta rufina in the wild was undertaken in the Hassar Dam on two late broods, one recently hatched and the second slightly older and was used to test the validity of the proposed model. This evaluation is done by comparing all chicks to the size of the mother (on several photographs). The use of the evolution of the measurements (body size, head size and bill size) in relation to the mother's size based on the photographs allowed the development of a model that helps to determine the age of the ducklings in the wild in comparison to the mother's size. This model of the evolution of the ducklings' growth was verified on the second brood and allowed to determine, within a few days, the age of the ducklings.

Gap analysis of the Ramsar site network at 50: over 150 important Mediterranean sites for wintering waterbirds omitted

Wed, 7 Jul 2021 14:08:13

de Nadège Popoff, Elie Gaget, Arnaud Béchet, Laura Dami, Pierre Defos Du Rau, Ilse Geijzendorffer, Anis Guelmami, Jean-Yves Mondain-Monval, Christian Perennou, Marie Suet, et al.
In Biodiversity and conservation, 30 (July, 2021), 19
En ligne : link.springer.com[...]

The Mediterranean Basin is a biodiversity hotspot. Wetlands make a key contribution to this status, but many of them remain outside the Ramsar network fifty years after the establishment of the Ramsar Convention. Here we evaluate the extent to which the Mediterranean Ramsar network covers wetlands of international importance for wintering waterbirds using the Ramsar Convention criteria 2 (species of conservation concern), 5 (> 20,000 waterbirds) and 6 (1% of a population). These criteria were applied to 4186 sites in 24 Mediterranean countries using counts of 145 wintering waterbird species from 1991 to 2017. We identified 161 sites of international importance for waterbirds that have not yet been declared as Ramsar sites, which could be added to the 180 current Mediterranean Ramsar sites established based on waterbird criteria (criteria 5 and/or 6). Among these sites, a subset of 32 very important sites reached double the required level for at least one criterion and 95 were not protected by any site conservation status. Coastal wetlands represented half of the Ramsar gap for waterbirds. We identified that an additional 1218 monitored sites could be provisionally considered as internationally important and thus require more survey efforts to assess their status. This study highlights a lack of participation of the Mediterranean countries to build the Ramsar network for wetland protection. Our results should help policymakers and managers to prioritize future Ramsar site designation, notably in the Middle East and Western European region where important gaps were identified.

Evidence for the existence of a new genus Chlamydiifrater gen. nov. inside the family Chlamydiaceae with two new species isolated from flamingo (Phoenicopterus roseus): Chlamydiifrater phoenicopteri sp. nov. and Chlamydiifrater volucris sp. nov.

Mon, 23 Aug 2021 12:34:43

de F. Vorimore, M. Hölzer, E. M. Liebler-Tenorio, L. -M. Barf, S. Delannoy, Marion Vittecoq, R. Wedlarski, A. Lécu, S. Scharf, Y. Blanchard, et al.
In Systematic and Applied Microbiology, 44(4) (July, 2021), 15
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

The family Chlamydiaceae currently comprises a single genus Chlamydia, with 11 validly published species and seven more taxa. It includes the human pathogens Chlamydia (C.) trachomatis, C. pneumoniae and C. psittaci, a zoonotic agent causing avian chlamydiosis and human psittacosis, as well as other proven or potential pathogens in ruminants, birds, snakes, reptiles and turtles. During routine testing of 15 apparently healthy captive flamingos in a zoo in 2011, an atypical strain of Chlamydiaceae was detected by real-time PCR of cloacal swab samples. Sequence analysis of the 16S rRNA gene revealed high similarity to the uncultured Chlamydiales bacterium clone 122, which previously had been found in gulls. As more samples were collected during annual campaigns of the flamingo ringing program in southern France from 2012 to 2015, Chlamydiaceae-specific DNA was detected by PCR in 30.9% of wild birds. From these samples, three strains were successfully grown in cell culture. Ultrastructural analysis, comparison of 16S and 23S rRNA gene sequences, whole-genome analysis based on de novo hybrid-assembled sequences of the new strains as well as subsequent calculation of taxonomic parameters revealed that the relatedness of the flamingo isolates to established members of the family Chlamydiaceae was sufficiently distant to indicate that the three strains belong to two distinct species within a new genus. Based on these data, we propose the introduction of Chlamydiifrater gen. nov., as a new genus, and Chlamydiifrater phoenicopteri sp. nov. and Chlamydiifrater volucris sp. nov., as two new species of the genus.

Microlépidoptères nouveaux ou peu connus de la faune de France. (Lepidoptera, Bucculatrigidae, Gracillariidae, Elachistidae, Coleophoridae, Gelechiidae, Pterophoridae)

Fri, 20 Aug 2021 15:10:50

de Jacques Nel, Gérard Labonne, Lionel Taurand, Marc Thibault, Thierry Varenne
In RARE. Revue de l'Association roussillonnaise d'entomologie, 30(3) (2021), 171 – 181

Cinq espèces sont nouvelles pour la France : Bucculatrix phagnalella Walsingham, 1907 [Bucculatrigidae], Kasyniana griseosericeella (Ragonot, 1879) [Oecophoridae], Depressaria albarracinella Corley, 2017 [Depressariidae], Coleophora changaica Reznik, 1975 [Coleophoridae] et Monochroa niphognatha (Gozmány, 1953) [Gelechiidae]. La présence de trois autres espèces est confirmée : Elachista wieseriella Huemer, 2000 [Elachistidae], Scrobipalpa clintoni Povolný, 1968 [Gelechiidae] et Aproaerema azosterella (Herrich-Schäffer, 1854) [Gelechiidae]. Aproaerema sangiella (Stainton, 1863) [Gelechiidae] est une nouvelle espèce pour la Corse. Le statut de « bona ssp. » est discuté et restauré pour Phyllonorycter baetica lobeliella Nel, 2009 [Gracillariidae]. Enfin, des précisions sont apportées sur la morphologie des genitalia mâles de Pterophorus ischnodactylus (Treitschke, 1835) [Pterophoridae].

Ecology, phenology and wintering behavior of Anatidae in the wetlands of Souk–Ahras (north–eastern Algeria)

Wed, 7 Jul 2021 14:08:19

de N. Bouali, A. Baaloudj, M. Touarfia, I. Houhamdi, M. C. Maazi, M. Houhamdi
In Arxius de Miscel-lània Zoològica, 19 (July, 2021), 135-149
En ligne : amz.museucienciesjournals.cat[...]

Understanding the spatial and temporal niche of waterfowl is essential for effective management and conservation. To determine the ecology and phenology of Anatidae in North Africa, we carried out a 12–month study (2019–2020) in three wetlands that constitute a winter refuge for waterbirds in the Souk–Ahras region in north–east Algeria. We surveyed species richness, the seasonal pattern of the number of Anatidae, and their wintering diurnal behavior using regular counts and scans. We recorded thirteen species: six wintering species (Anas clypeata, Anas penelope, Anas strepera, Tadorna tadorna, Aythya ferina, and Anas crecca crecca) and three sedentary nesting species (Anas platyrhynchos, Oxyura leucocephala, and Aythya nyroca), the latter two having national and international protection status. The survey showed that the wintering behavior of all these species is dominated by sleep, which on average accounts for almost half of the total time (48.91 %). Our results indicate that the three wetlands host a complex waterfowl community that includes species of conservation concern and that these sites likely play an essential role in providing the essential resources for wintering.

Dataset published through GBIF (Doi: 10.15470/fozdot)

Specificity of diatom communities attached on the carapace of the European pond turtle (Emys orbicularis)

Tue, 6 Jul 2021 10:31:19

de Vincent Roubeix, Lucie Attia, Rémy Chavaux, Frank Very, Anthony Olivier, Luc Ector, Véronique Vassal
In Advances in Oceanography and Limnology, 12(1) (July 2021)
En ligne : www.pagepressjournals.org[...]

Periphytic diatoms growing on aquatic turtle carapaces provide an interesting example of biofouling on an animal substrate. This study dealt with the question of the specificity of epizoic diatom communities for the case of the European pond turtle (Emys orbicularis) and across five water bodies in South-Eastern France. 375 diatom taxa have been identified on the European pond turtle carapace. The results showed that the epizoic communities of the five sites were significantly different from each other. The epizoic diatom communities could be clearly distinguished from epilithic and epiphytic communities only in two out of five sites. The differences in composition at the two sites resulted from the greater abundance of some species and life forms. However, the characteristic pattern of diatom communities on the carapaces was not the same at the two sites. It therefore appeared that the European pond turtle’s carapace did not harbour specific diatom communities and can rather be considered a neutral substrate.

Endorheic Waterbodies Delineation From Remote Sensing as a Tool for Immersed Surface Topography

Wed, 30 Jun 2021 15:30:26

de Carole Delenne, Jean-Stephane Bailly, Antoine Rousseau, Renaud Hostache, Olivier Boutron
In IEEE Geoscience and Remote Sensing Letters, Online (May, 2021), 1-5
En ligne : ieeexplore.ieee.org[...]

For several decades, it becomes possible to delineate waterbodies and their dynamics from optical or radar images, that are now available at high spatial and temporal resolutions. We present here an interpolation approach that takes benefits from this waterbodies delineation in endorheic areas. It consists in computing isovalue contour lines to improve topography estimates classically obtained from measurement points only. The approach, based on a minimization problem, uses thin plate spline (TPS) interpolation functions, the coefficients of which are determined along with the unknown water level of each curve. Results obtained on a generated topography show that this approach, applied with three contour-line curves, yields a lower root mean square error (RMSE) using only one measurement point compared to the one obtained with nine points and the classical approach.

Does salinity have an influence on the diversity and structure of the wintering waterbirds of the Saharan wetlands in Algeria?

Tue, 8 Jun 2021 10:32:46

de F. Khirani–Betrouche, R. Moulai
In Arxius de Miscel-lània Zoològica, 19 (July, 2021), 99–111
En ligne : amz.museucienciesjournals.cat[...]

Between 2017 and 2019, 42 species of wintering waterbirds were recorded in the wetland complex of the Oued Righ valley in the Algerian Sahara. The intersite amplitudes of salinity explained the variations in species richness and distribution of waterbirds in the various wetlands studied. Oligohaline (0.5-5 ‰) and mesohaline (5-18 ‰) environments, represented by Lake Ayata, Lake Sidi Khelil and Oued Kherouf, were the most favorable to Anatidae with the exception of the tadornes where their presence was noted in the euhaline (30-40 ‰) and hyperhaline stations (> 40 ‰). The presence of the greater flamingo Phoenicopterus roseus and the slender-billed gull Chroicocephalus genei stood out in the most holomorphic areas of the complex, such as Chott Merouane.

Plant dispersal syndromes are unreliable, especially for predicting zoochory and long‐distance dispersal

Wed, 30 Jun 2021 15:30:19

de Andy J. Green, Christophe Baltzinger, Ádám Lovas‐Kiss
In Oikos, No number (2021-06-24), oik.08327
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

Plant dispersal syndromes are allocated based on diaspore morphology and used to predict the dominant mechanisms of dispersal. Many authors assume that only angiosperms with endozoochory, epizoochory or anemochory syndromes have a long-distance dispersal (LDD) mechanism. Too much faith is often placed in classical syndromes to explain historical dispersal events and to predict future ones. What is usually recorded as the ‘endozoochory syndrome' is in reality a ‘frugivory syndrome' and this has often diverted attention from endozoochory by non-frugivores (e.g. waterbirds and large herbivores) that disperse a broad range of angiosperms, for which they likely provide the maximum dispersal distances. Neither the endozoochory nor the epizoochory syndromes provide helpful predictions of which plants non-frugivores disperse, or by which mechanism. We combined data from previous studies to show that only 4% of European plant species dispersed by ungulate endozoochory belong to the corresponding syndrome, compared to 36% for ungulate epizoochory and 8% for endozoochory by migratory ducks. In contrast, the proportions of these species that are assigned to an ‘unassisted syndrome' are 37, 31 and 28%, respectively. Since allocated syndromes do not adequately account for zoochory, empirical studies often fail to find the expected relationship between syndromes and LDD events such as those underlying the colonization of islands or latitudinal migration rates. We need full incorporation of existing zoochory data into dispersal databases, and more empirical research into the relationship between plant traits and the frequency and effectiveness of different dispersal mechanisms (paying attention to unexpected vectors). Acknowledging the broad role of non-frugivores in facilitating LDD is crucial to improve predictions of the consequences of global change, such as how plant distributions respond to climate change, and how alien plants spread. Networks of dispersal interactions between these vertebrates and plants are a vital but understudied part of the Web of Life.

Global economic costs of aquatic invasive alien species

Wed, 26 May 2021 10:39:16

de Ross N. Cuthbert, Zarah Pattison, Nigel G. Taylor, Laura Verbrugge, Christophe Diagne, Danish A. Ahmed, Boris Leroy, Elena Angulo, Elizabeta Briski, César Capinha, et al.
In Science of The Total Environment, 775 (2021), 10
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

Much research effort has been invested in understanding ecological impacts of invasive alien species (IAS) across ecosystems and taxonomic groups, but empirical studies about economic effects lack synthesis. Using a comprehensive global database, we determine patterns and trends in economic costs of aquatic IAS by examining: (i) the distribution of these costs across taxa, geographic regions and cost types; (ii) the temporal dynamics of global costs; and (iii) knowledge gaps, especially compared to terrestrial IAS. Based on the costs recorded from the existing literature, the global cost of aquatic IAS conservatively summed to US$345 billion, with the majority attributed to invertebrates (62%), followed by vertebrates (28%), then plants (6%). The largest costs were reported in North America (48%) and Asia (13%), and were principally a result of resource damages (74%); only 6% of recorded costs were from management. The magnitude and number of reported costs were highest in the United States of America and for semi-aquatic taxa. Many countries and known aquatic alien species had no reported costs, especially in Africa and Asia. Accordingly, a network analysis revealed limited connectivity among countries, indicating disparate cost reporting. Aquatic IAS costs have increased in recent decades by several orders of magnitude, reaching at least US$23 billion in 2020. Costs are likely considerably underrepresented compared to terrestrial IAS; only 5% of reported costs were from aquatic species, despite 26% of known invaders being aquatic. Additionally, only 1% of aquatic invasion costs were from marine species. Costs of aquatic IAS are thus substantial, but likely underreported. Costs have increased over time and are expected to continue rising with future invasions. We urge increased and improved cost reporting by managers, practitioners and researchers to reduce knowledge gaps. Few costs are proactive investments; increased management spending is urgently needed to prevent and limit current and future aquatic IAS damages.

Estimation of Bathymetry and Benthic Habitat Composition from Hyperspectral Remote Sensing Data (BIODIVERSITY) Using a Semi-Analytical Approach

Fri, 21 May 2021 09:16:30

de Audrey Minghelli, Sayoob Vadakke-Chanat, Malik Chami, Mireille Guillaume, Emmanuelle Migne, Patrick Grillas, Olivier Boutron
In Remote Sensing, 13(10) (May, 2021), 17
En ligne : www.mdpi.com[...]

The relevant beneﬁts of hyperspectral sensors for water column determination and seabed features mapping compared to multispectral data, especially in coastal areas, have been demonstrated in recent studies. In this study, we used hyperspectral satellite data in the accurate mapping of the bathymetry and the composition of water habitats for inland water. Particularly, the identiﬁcation of the bottom diversity for a shallow lagoon (less than 2 m in depth) was examined. Hyperspectral satellite data were simulated based on aerial hyperspectral imagery acquired above a lagoon, namely the Vaccarès lagoon (France), considering the spatial and spectral resolutions, and the signal-to-noise ratio of a satellite sensor, BIODIVERSITY, that is under study by the French space agency (CNES). Various sources of uncertainties such as inter-band calibration errors and atmospheric correction were considered to make the dataset realistic. The results were compared with a recently launched hyperspectral sensor, namely the DESIS sensor (DLR, Germany). The analysis of BIODIVERSITY-like sensor simulated data demonstrated the feasibility to satisfactorily estimate the bathymetry with a root-mean-square error of 0.28 m and a relative error of 14% between 0 and 2 m. In comparison to open coastal waters, the retrieval of bathymetry is a more challenging task for inland waters because the latter usually shows a high abundance of hydrosols (phytoplankton, SPM, and CDOM). The retrieval performance of seabed abundance was estimated through a comparison of the bottom composition with in situ data that were acquired by a recently developed imaging camera (SILIOS Technologies SA., France). Regression coefﬁcients for the retrieval of the fractional species abundances from the theoretical inversion and measurements were obtained to be 0.77 (underwater imaging camera) and 0.80 (in situ macrophytes data), revealing the potential of the sensor characteristics. By contrast, the comparison of the in situ bathymetry and macrophyte data with the DESIS inverted data showed that depth was estimated with an RSME of 0.38 m and a relative error of 17%, and the fractional species abundance was estimated to have a regression coefﬁcient of 0.68.

Importance of Lake Tonga for the wintering of Eurasian wigeon (Anas penelope) and gadwall (Anas strepera)

Wed, 30 Jun 2021 15:30:09

de Azarnia Sabah, Ziane Nadia, Benyacoub Slim
In Ecology, Environment and Conservation, 27(May Suppl. Issue) (May, 2021), 244-250
En ligne : www.envirobiotechjournals.com[...]

The monitoring of the numbers of Eurasian wigeon and gadwall ducks during two winter cycles (2014/ 2015 and 2015/2016) at Lake Tonga, shows that Eurasian wigeon is an early overwinter; this duck is very sensitive to the cold wave. . The gadwall is a late overwinter. Lake Tonga is classified as a nationally and internationally important wintering site for both species. The numbers recorded in 2014/2015 are higher than in 2015/2016, the drop in numbers is explained by climate change (the heat wave that reigned in Europe this year). The study of the diurnal behavior of the two species of Anatidae during their wintering at Lake Tonga showed that the two ducks exploit the studied site as a foraging area.

Wind tides and surface friction coefficient in semi-enclosed shallow lagoons

Tue, 25 May 2021 11:17:05

de Caroline Paugam, Damien Sous, Vincent Rey, Samuel Meulé, Vincent Faure, Olivier Boutron, Emilie Luna-Laurent, Emmanuelle Migne
In Estuarine, Coastal and Shelf Science, 257 (2021)
En ligne : hal.archives-ouvertes.fr[...]

The present paper is specifically focused on enclosed or semi-enclosed basins where the wind is the dominant driver of water surface tilting, leading to the so-called wind tide contributing to water levels rise. Wind-induced free surface tilting is studied using the 1-D steady form of the depth-averaged shallow water (Saint-Venant) momentum equation which reflects the depth-averaged local balance between surface slope and wind stress. Two contrasted field sites, the Berre and Vaccarès lagoons, have been monitored providing water level data along a reference axis. This study highlighted the occurence of wind tides at the two field sites. The bimodal wind exposure ensured the robustness of the observations, with non-linear but symmetric behaviors patterns observed in winds from opposite directions. It is observed that the higher the wind speed, the steeper the slope of the free surface in accordance with the well known basic trend. In addition, a significant effect of depth is observed, with greater surface tilting in the shallower lagoon. The data analysis confirmed the robustness of such a simple approach in the present context. Using the additional assumption of constant, i.e. wind-independent, drag coefficients (C D) allowed a good match with the observations for moderate wind speeds for both sites. However, the depth effect required the C D to be increased in the shallower basin. Classical empirical wind-dependent C D parameterizations provide better wind-tide predictions than the constant-C D approach in very strong wind conditions but totally failed in predicting surface tilting in the shallower site, suggesting that physical parameters other than wind speed should be taken into account for the C D parameterization in very shallow lagoons.

Spatial Patterns of Macrozoobenthos Assemblages in a Sentinel Coastal Lagoon: Biodiversity and Environmental Drivers

Tue, 27 Apr 2021 11:39:14

de Soilam Boutoumit, Oussama Bououarour, Reda El Kamcha, Pierre Pouzet, Bendahhou Zourarah, Abdelaziz Benhoussa, Mohamed Maanan, Hocein Bazaïri
In Journal of Marine Science and Engineering, 9(5) (May, 2021), 17
En ligne : www.mdpi.com[...]

This study presents an assessment of the diversity and spatial distribution of benthic macrofauna communities along the Moulay Bousselham lagoon and discusses the environmental factors contributing to observed patterns. In the autumn of 2018, 68 stations were sampled with three replicates per station in subtidal and intertidal areas. Environmental conditions showed that the range of water temperature was from 25.0 °C to 12.3 °C, the salinity varied between 38.7 and 3.7, while the average of pH values fluctuated between 7.3 and 8.0. In vegetated habitats, biomass values of the seagrass Zostera noltei Hornemann ranged between 31.7 gDW/m² and 170.2 gDW/m² while the biomass of the seagrass Ruppia cirrhosa (Petagna) Grande between 54.2 gDW/m² and 84.7 gDW/m². Sediment analyses showed that the lagoon is mainly composed of sandy and silty sediments. We recorded 37,165 individuals of macrofauna distributed in 63 taxa belonging to 50 families, with a mean abundance value of 4582.8 ind/m² and biomass average of 22.2 g/m². Distance-based linear modeling analysis (DISTLM) identified sediment characteristics, water parameters and habitat type (biomass of Z. noltei) as the major environmental drivers influencing macrozoobenthos patterns. Our results clearly revealed that the hydrographic regime (marine and terrestrial freshwater), sediment distribution and characteristics and the type of habitat (vegetated vs. unvegetated substrate) are the key factors determining the species composition and patterns of macrozoobenthos assemblages.

The impact of salinity on a saline water insect: Contrasting survival and energy budget

Mon, 12 Apr 2021 11:14:18

de Philippe Lambret, Lizanne Janssens, Robby Stoks
In Journal of Insect Physiology, 131 (May, 2021), 9
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

Water salinity is a major driver of aquatic insects’ distribution. Saline species are usually generalists with high survival and performance at both low and high salinity levels. Yet, costs of high salinity may be underestimated as these are most often measured in terms of larval life history traits, while effects of larval stressors may only be detectable when looking at physiological traits and traits in the adult stage. Here, we assessed the lethal and sublethal physiological effects of embryonic and larval exposure to a range of salinity levels in the damselfly Lestes macrostigma, both during and after metamorphosis. This species inhabits temporary freshwaters where salinity increases during the drying phase. Salinity had no effect on egg hatching success within the range 2–9.5 g/L sea salt (conductivity range 3.45–14.52 mS/cm). With increasing salinity (up to 16 g/L, 23.35 mS/cm), growth rate decreased and larvae took longer to emerge and did so at a smaller size. Larval survival to metamorphosis increased with salinity up to 8 g/L (12.45 mS/cm) and then declined at 16 g/L. Exposure to salinity in the larval stage had no effect across metamorphosis on both the adult thorax muscle mass and flight performance, and the investment in immune function. Increasing salinity in the larval stage also had no effect on the energy available but increased the energy consumption in the adult stage, resulting in a lower net energy budget. These negative sublethal effects of increasing salinity hence bridged metamorphosis and contrasted with the mortality data, suggesting that the higher mortality at the low salinity levels selected for larvae with the best body condition. Our results highlight the importance of taking into account other life-history and physiological traits, besides mortality, ideally across different life stages, to better understand and predict consequences of increasing salinization on freshwater insects.

Towards a better understanding of grass bed dynamics using remote sensing at high spatial and temporal resolutions

Mon, 1 Mar 2021 14:50:29

de Marion Menu, Guillaume Papuga, Frédéric Andrieu, Guilhem Debarros, Xavier Fortuny, Samuel Alleaume, Estelle Pitard
In Estuarine, Coastal and Shelf Science, 251 (April, 2021), 11
En ligne : linkinghub.elsevier.com[...]

Wetlands conservation and resilience capacities are key issues in many places over the globe. Understanding these issues will benefit from a precise knowledge of seagrass species occupancy and coverage over time and over space. Such information can be obtained from remote sensing images and their classification thanks to a vege tation index, to be used in a complementary manner to field work inventories. Sentinel-2 data, which are available with a frequent revisit time (<5 days) and a high spatial resolution (10m pixel size) can be used to map grassbeds at the surface or slightly below the surface of permanent lagoons, hence enabling the characterization of its seasonal dynamics, which was not possible with previous remote-sensing tools. We have proved the feasibility of such a method in the natural reserve of the Bagnas (Herault, France) where Stuckenia pectinata coverage can be tracked over a full year thanks to Sentinel-2 images and field work. Inter-annual dynamics (seasonal growth and senescence) can be mapped over time with 10m resolution and will be extended to plu riannual studies thanks to the long-term objective of the Sentinel-2 mission. This opens the way to a concerted management of natural reserves based on data analysis and field knowledge, a better understanding of seagrass coverage with fluctuating environmental conditions, and predictive mechanistic and/or stochastic models of future qualitative trends.

A powerful long metabarcoding method for the determination of complex diets from faecal analysis of the European pond turtle (Emys orbicularis, L. 1758)

Thu, 18 Mar 2021 16:02:04

de Charlotte Ducotterd, Julien Crovadore, François Lefort, Jean-Francois Rubin, Sylvain Ursenbacher
In Molecular Ecology Resources, 21(2) (2021), 433-447
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

High-throughput sequencing has become an accurate method for the identification of species present in soil, water, faeces, gut or stomach contents. However, information at the species level is limited due to the choice of short barcodes and based on the idea that DNA is too degraded to allow longer sequences to be amplified. We have therefore developed a long DNA metabarcoding method based on the sequencing of short reads followed by de novo assembly, which can precisely identify the taxonomic groups of organisms associated with complex diets, such as omnivorous individuals. The procedure includes 11 different primer pairs targeting the COI gene, the large subunit of the ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase gene, the maturase K gene, the 28S rRNA and the trnL-trnF chloroplastic region. We validated this approach using 32 faeces samples from an omnivorous reptile, the European pond turtle (Emys orbicularis, L. 1758). This metabarcoding approach was assessed using controlled experiments including mock communities and faecal samples from captive feeding trials. The method allowed us to accurately identify prey DNA present in the diet of the European pond turtles to the species level in most of the cases (82.4%), based on the amplicon lengths of multiple markers (168–1,379 bp, average 546 bp), and produced by de novo assembly. The proposed approach can be adapted to analyse various diets, in numerous conservation and ecological applications. It is consequently appropriate for detecting fine dietary variations among individuals, populations and species as well as for the identification of rare food items.

Reliability of animal counts and implications for the interpretation of trends

Thu, 28 Jan 2021 14:00:43

de David Vallecillo, Michel Gauthier-Clerc, Matthieu Guillemain, Marion Vittecoq, Philippe Vandewalle, Benjamin Roche, Jocelyn Champagnon
In Ecology and Evolution, 11(5) (January, 2021)
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

Population time series analysis is an integral part of conservation biology in the current context of global changes. To quantify changes in population size, wildlife counts only provide estimates because of various sources of error. When unaccounted for, such errors can obscure important ecological patterns and reduce confidence in the derived trend. In the case of highly gregarious species, which are common in the animal kingdom, the estimation of group size is an important potential bias, which is characterized by high variance among observers. In this context, it is crucial to quantify the impact of observer changes, inherent to population monitoring, on i) the minimum length of population time series required to detect significant trends and ii) the accuracy (bias and precision) of the trend estimate. We acquired group size estimation error data by an experimental protocol where 24 experienced observers conducted counting simulation tests on group sizes. We used this empirical data to simulate observations over 25 years of a declining population distributed over 100 sites. Five scenarios of changes in observer identity over time and sites were tested for each of three simulated trends (true population size evolving according to deterministic models parameterized with declines of 1.1%, 3.9% or 7.4% per year that justify respectively a “declining,” “vulnerable” or “endangered” population under IUCN criteria). We found that under realistic field conditions observers detected the accurate value of the population trend in only 1.3% of the cases. Our results also show that trend estimates are similar if many observers are spatially distributed among the different sites, or if one single observer counts all sites. However, successive changes in observer identity over time lead to a clear decrease in the ability to reliably estimate a given population trend, and an increase in the number of years of monitoring required to adequately detect the trend. Minimizing temporal changes of observers improve the quality of count data and help taking appropriate management decisions and setting conservation priorities. The same occurs when increasing the number of observers spread over 100 sites. If the population surveyed is composed of few sites, then it is preferable to perform the survey by one observer. In this context, it is important to reconsider how we use estimated population trend values and potentially to scale our decisions according to the direction and duration of estimated trends, instead of setting too precise threshold values before action.

Site de Brasinvert secteurs de Brasinvert et de l’étang d’Icard Commune des Saintes-Maries-de-la-Mer (13). Inventaire floristique. Inventaire, caractérisation et cartographie des habitats (2021)

Fri, 12 Sep 2025 16:13:51

de Hugo Fontes, Loic Willm
Arles : Tour du Valat, 2021, 39

Les inventaires floristiques ont permis de collecter 900 données, permettant l’identification de 247 taxons au total, dont 110 taxons sur le site de Brasinvert (24 taxons de la bibliographie non revus et 52 taxon nouvellement observés) et 189 sur le site d’Icard (1 taxon de la bibliographie non revu et 181 taxons nouvellement observés). Il s’agit pour l’essentiel d’espèces liées aux milieux littoraux, halophiles et aquatiques ou humides. Parmi ces taxons, 32 présentent un intérêt patrimonial du fait de leur statut de menace ou réglementaire en particulier.
Le secteur de Brasinvert est une ancienne relique dunaire associée à des complexes lagunaires au fonctionnement hydrologique naturel. Ce site abrite nombre d’espèces et habitats à enjeux de conservation élevés. Si les milieux terrestres ont été biens prospectés, les milieux aquatiques mériteraient des compléments d’inventaires en conditions de précipitations favorables. Le fort développement du pin d’Alep est à surveiller car il représente ici un risque de banalisation des milieux dunaires à l’échelle du site. Malgré son apparente uniformité, le site d’Icard affiche un grande diversité d’habitats, allant des milieux dunaires, aux rives du Rhône, en passant par les habitats de sansouires et de lagunes. Cette diversité de milieux permet l’expression de nombreuses espèces dont bon nombre présentent un fort enjeu de conservation. Le fonctionnement hydrologique des lagunes et leurs connexions au Rhône constituent ici le principal élément déterminant leur état de conservation (jugé moyen sur le site). Toutefois cette connexion au Rhône peut constituer un enjeu pour d’autres composantes du patrimoine naturel (ex : oiseaux d’eau, poissons marins migrateurs). La compréhension dans le détail du fonctionnement du réseau hydraulique et des modalités de gestion de ces pièces d’eau est le principal levier pour assurer leur préservation, voire améliorer leur état de conservation.

Note d’étude préliminaire sur les espèces de soudes sauvages en Camargue, en vue de leur culture et de leur utilisation dans l’agroalimentaire (2021)

Fri, 12 Sep 2025 16:13:46

de Hugo Fontes
Arles : Tour du Valat, 2021, 12

L’année 2021 a été l’occasion de dresser un premier bilan des connaissances sur les soudes de Camargue. Ce premier travail bibliographique nécessite d’être compilé avec le travail de recherche déjà réalisé par la famille MARTIN, en particulier pour les aspects historiques. Les connaissances sur l’écologie de la germination de ces espèces pourraient également être améliorées par une démarche expérimentale utilisant des populations locales de soudes. Les premières collectes constituent une approche exploratoire et ne peuvent pas, en l’état, fournir de données statistiques sur les concentrations en soude des espèces. Aussi, l’utilisation des salicornes pour la production de soude est une piste qui ne mérite pas d’être exclue a priori. Evaluer l’effet du milieu (salinité du sol notamment), de la date de collecte et de l’espèce sur la concentration en soude des plantes restent à explorer en détail. Cette première approche exploratoire pourrait toutefois orienter sur les espèces les plus intéressantes en vue d’une mise en culture et de l’extraction de la soude.

Artificial Wetlands and Waterbirds. A Literature Review (Septembre 2021)

Thu, 31 Aug 2023 15:53:21

de Amal Chantoufi
Angers : Université d'Angers, Septembre 2021, 49

Wetlands are considered as one of the most threatened habitats worldwide. In the Mediterranean basin, they are of major concern, facing a 45% loss since 1970. In this context, artificial wetlands such as dam reservoirs are playing an important role in maintaining avian diversity. Waterbird communities using reservoirs are generally less diverse than those using natural wetlands. However, the conservation value of these habitats needs further exploration given the current major resurgence in dam construction within the Mediterranean region. Here, we evaluated wintering waterbird community composition within dam reservoirs for 22 Mediterranean countries between 1993 and 2017. We characterized dam reservoirs that encompassed waterbird surveys, and tested the dissimilarities in both species and functional group composition between dam sites and other wetland types. The waterbird community within reservoirs was dominated by dabbling ducks in terms of number of individuals. We found that there were significant differences in both functional and species composition between dams and other wetland types. Diving ducks showed a close association to dam sites, whereas small wading birds were more abundant in other wetland types. Our results also highlight the importance of dam reservoirs for waterbird species of high conservation value such as Oxyura leucocephala and Vanellus vanellus, and provide evidence that under arid climates, dam reservoirs may play a major role in hosting waterbird communities, even when they are originally associated to other wetland types. We conclude, from our results, that conservation actions should prioritize the protection of biodiverse reservoirs in regions where natural wetlands are the most unavailable. This study should be further extended to include Algeria, Spain, and Libya to assess the conservation value of dam reservoirs at the Mediterranean scale.

Étude de la reproduction de la colonie du flamant rose (Phoenicopterus roseus) en Camargue (2021)

Fri, 3 Feb 2023 18:23:31

de Ethel Mery
Besançon : Université de Franche-Comté, 2021, 35

Counting Birds: Protecting European Avifauna and Habitats (2021)

Fri, 13 Jan 2023 19:21:41

de Anna-Katharina Wöbse, Anna-Katharina Wöbse, Patrick Kupper
Oldenbourg : De Gruyter, 2021, 17-46
En ligne : www.degruyter.com[...]

This chapter sheds light on the environmental history of European birdpolitics and shifting human-animal relations in the long twentieth centuryby focusing on two overarching foci: the relations and interactions betweenhuman and non-human actors and between biology, geographies, and politics.The agency of migrating birds caused activities of ornithologists,preservationists, and policy-makers and both nourished and challenged ideasof European distinctiveness. Looking at the history of bird politics notonly provides insights into the Europeanization of routines, practices, andregime-building that were shaped by natural dynamics as well as human madeprocesses, but also reflects the fundamental changes that took place inEuropean land management during the twentieth century

Multi-Temporal Inundated Areas Monitoring Made Easy: The Case of Kerkini Lake in Greece: (2021)

Thu, 6 Oct 2022 10:32:28

de Ioannis Manakos, Malak Kanj, Michail Sismanis, Ioannis Tsolaikidis, Chariton Kalaitzidis
2021, 48-55
En ligne : www.scitepress.org[...]

Satellite data may support management of wetland areas for monitoring of the inundation seasonality. Previously successful in Doñana and Camargue Biosphere Reserves, this study examines the transferability of unsupervised inundation mapping through automatic local thresholding in discriminating inundated areas from non-inundated ones in Kerkini Lake. Nine different alternatives of this approach are employed on Sentinel-2 (S2) Level-2A images (2016-2019). The best fit alternative was derived by the validation against local and on-site registered attributes. To overcome unfavourable atmospheric conditions, Sentinel-1 (S1) images were examined in tandem with derived S2 inundation maps (S2m), using the best fit alternative. Two S2m, one preceding and one following a target S1 image, were used to train random forest models (per pixel) to be applied to the target S1 image and derive the respective inundation map (S1m). S1m was validated against a S2m for the same date; not previously used in the training process. Classification performance reached k [0.77-0.94] and overall accuracy [88.05-97.16%] for the S2m. The evaluation of S1m showed k of 0.99 and overall accuracy between 99.71-99.88%. Automation of the process and minimum human interference supports its usage by non-specialists, e.g. for Protected Areas management.

Etude de l’effet de l’écobuage sur les cladiaies des marais Bondoux, du Retour et du Coucou (Port-Saint- Louis-du-Rhône) (2021)

Tue, 13 Sep 2022 16:14:17

de Hugo Fontes, Fany Jariod
Arles : Tour du Valat, 2021, 17

Les cladiaies constituent un habitat remarquable à échelle européenne et particulièrement sous climat méditerranéen où il est rare. Cette formation végétale dominée par le marisque Cladium mariscus est inscrit en annexe I de la directive européenne 92/43/CEE dite « directive Habitat » sous le nom de « Végétations à marisque 7210-1 » (Bensettiti et al. 2002). Dans les Bouches du Rhône cette formation est bien connue dans les marais de la Crau humide où elle bénéficie des résurgence d’eau douce de la nappe de la Crau, zone d’interface entre la Crau sèche et la Camargue. On y retrouve diverses espèces végétales et animales remarquables, notamment en ce qui concerne les arthropodes terrestres. Les cladiaies, en l’absence de perturbation produisent une biomasse importante ainsi qu’une accumulation des parties végétatives mortes, excluant les autres espèces végétales (Conway 1942). Ces accumulations, combinées avec un fonctionnement hydrologique caractérisé par des faibles amplitudes de fluctuations des niveaux d’eau, conduisent à la formation de sol tourbeux. Dans le site Natura 2000 FR9301596 « Marais de la vallée des Baux et marais d'Arles » cet habitat fait l’objet d’une gestion par brûlage dirigé qui a pour effet de réduire la biomasse produite par le marisque et ainsi « d’ouvrir » le milieu, favorisant également les repousses plus appétences pour le bétail. Cette gestion est notamment liée à la vocation cynégétique et pastorale de ces marais. Bien que certains de ses effets aient été étudiés localement (effet sur Baccharis halimifolia : Gortot 2003, effets sur le Butor étoilé : Poulin et al. 2005, effets sur les araignées : Vajda 2004), l’impact du brûlis sur le marisque et les communautés végétales associées est encore mal connu et mérite une étude spécifique. C’est dans ce cadre que la Tour du Valat a réalisé la présente étude, commandité par le Parc Naturel Régional de Camargue. Elle vise à évaluer l’impact de l’écobuage, via une approche synchronique, sur (1) la structure de la Cladiaie et (2) les communautés végétales à marisque. La question générale posée est celle de la résilience au feu des formations à marisque et par conséquent celle de la durabilité de ce mode de gestion ainsi que ses conséquences sur l’état de l’habitat au sein du site NATURA 2000.

Les fonctions hydrologiques, biogeochimiques et biologiques des zones humides. Etat des connaissances (2021)

Fri, 29 Jul 2022 12:28:42

de Anne Rapin, Fanny Fontanel, François Chambaud
Lyon (FRA) : Agence de l’eau Rhône Méditerranée Corse, 2021, 192 (Collection Eau & Connaissance)
En ligne : www.rhone-mediterranee.eaufrance.fr[...]

Ce document de connaissance des zones humides essentiellement continentales est rédigé dans une démarche de synthèse bibliographique construite principalement à partir de la littérature scientifique. Des références techniques, d’instances de bassin par exemple, sont rapportées. Pour simplifier la lecture et les dissocier de la documentation scientifique, les références techniques sont présentées en note de bas de page. Cette synthèse n’a pas pour ambition d’être exhaustive au regard des thématiques « fonctions des zones humides », puisque certains sujets ne sont pas développés notamment pour ce qui concerne les services écosystémiques (sociaux et économiques par exemple). Ces choix assumés sont précisés dans le texte et renvoient vers de la documentation complémentaire quand elle est disponible.

CD-HAB 3759, Association à Ruppia spiralis (Syn. Ruppia cirrhosa) et/ou Ruppia maritima (2021)

Sun, 30 Jan 2022 16:52:43

de Noëmie Michez, Nicolas Cimiterra, Valerie Derolez, Patrick Grillas, Vincent Ouisse
Paris : UMS PatriNat (OFB-CNRS-MNHN), 2021, 151-154
En ligne : inpn.mnhn.fr[...]

CD-HAB 3742, Faciès des salines (2021)

Sun, 30 Jan 2022 16:52:40

de Noëmie Michez, Gérard Bellan, Patrick Grillas
Paris : UMS PatriNat (OFB-CNRS-MNHN), 2021, 61-63

CD-HAB 986, Biocénose des laisses à dessiccation lente en contact avec les salicornes (LDL) (2021)

Sun, 30 Jan 2022 16:52:21

de Noëmie Michez, Patrick Grillas, Gérard Bellan
Paris : UMS PatriNat (OFB-CNRS-MNHN), 2021, 13-14

Avifauna diversity and phenology in a Ramsar site: Lake Tonga (Northeastern Algeria) (2021)

Wed, 26 Jan 2022 14:47:39

de A. Gherib, A. Lazli, S. Naili, A. Boucheker, D. Ikhlef, N. I. Mechaka
2021, 321–344
En ligne : amz.museucienciesjournals.cat[...]

Between 2013 and 2016 we conducted an inventory and characterization of aquatic avifauna at Lake Tonga, a Ramsar site. We identified 61 species belonging to 17 families, dominated by Anatidae with 14 species. The inventoried species have different phenological status. Some are known for their regular wintering and some for their summer concentrations, while others are residents year round. Population analysis showed the presence of endangered species such as Oxyura leucocephala, Marmaronetta angustirostris and Aythya nyroca, that are protected by national and/or international laws. Bird counts showed monthly variations in total abundance and richness, peaking during winter. Peak numbers were recorded in February and January, reflecting gatherings to prepare for prenuptial migration. Analysis of diversity and equitability indices indicated that maximum values were generally recorded during the pre– and post–nuptial passages (H'= 3.51 and E = 0.72). Our results reflect the importance of this wetland as a wintering site and nesting site for numerous waterbirds species.

Ecologie et restauration de la Petite massette (Typha minima Hoppe) (2021)

Thu, 16 Dec 2021 10:47:28

de Nadège Popoff
Grenoble, France : Université Grenoble Alpes, 2021, 175
En ligne : www.theses.fr[...]

La dynamique de la végétation riveraine est étroitement liée aux régimes de perturbation du cours d’eau, notamment les crues, ainsi qu’aux processus physiques et biologiques qui en découlent. L’impact des activités humaines sur les rivières comme l’endiguement, la chenalisation ou l’exploitation hydroélectrique et sédimentaire, a fortement modifié ces régimes. Cela se traduit, entre autre, par une stabilisation du milieu et une régression des stades pionniers de l’habitat riverain due au manque de rajeunissement de celui-ci par les crues. A l’échelle de l’arc alpin, Typha minima Hoppe (la petite massette) est une espèce herbacée clonale qui colonise les habitats pionniers des cours d’eau de piémont. Cette espèce a vu ses populations fortement décroître au cours du siècle dernier, lui valant le statut d’espèce protégée dans plusieurs pays européens. En France, de nombreuses menaces pesant sur cette espèce persistent tel que la chenalisation, la modification du régime de crue et la destruction de son habitat par des travaux menés dans le lit et sur les berges des cours d’eau. C’est notamment le cas des travaux menés depuis 2004 par le Symbhi (Syndicat Mixte des Bassins Hydrauliques de l'Isère) dans le cadre du projet « Isère Amont » qui ont impacté des stations de T. minima sur l’Isère. Des mesures de compensations en ont résulté et ont accompagné la mise en place d’un projet de restauration de l’espèce dans la zone d’emprise des travaux.
L’objectif de ce travail de thèse est de produire des connaissances sur la niche écologique et la dynamique spatiotemporelle d’une espèce clonale colonisant le stade pionnier de l’habitat riverain : la petite massette (Typha minima Hoppe), afin de servir de base théorique aux futurs projets de conservation et de restauration. Pour ce faire, la problématique suivante a été formulée : Quelles sont les variables environnementales et les processus écologiques qui affectent la dynamique spatio-temporelle de T. minima et en quoi ces connaissances peuvent-elles être appliquées à sa restauration et sa conservation?
i) La première étape est de déterminer quels sont les facteurs biotiques et abiotiques liés aux processus sédimentaires et de succession écologique qui affectent la dynamique locale des taches de T. minima. Les résultats montrent que la progression des taches de T. minima est liée au caractère pionnier des bancs (sédiments fins, faible altitude et couvert végétal). Le maintien et la régression des taches sont au contraire liés à la maturité de l’habitat, induits par un processus de succession écologique plus avancé, avec un développement de la végétation et une amplification du phénomène d’accrétion.
ii) Dans une seconde partie nous avons testé les effets de la compétition interspécifique avec des saules (Salix alba) et de l’ensevelissement par les sédiments sur la compétitivité et l’investissement dans la reproduction de T. minima. Bien que souvent mentionnée comme la principale cause de régression de l’espèce, la compétition interspécifique avec les saules n’affecte que peu T. minima alors que l’effet de l’ensevelissement par les sédiments est important.
iii) Enfin, dans le but d’améliorer les protocoles de restauration de T. minima, plusieurs expérimentations visant à tester l’effet de différentes biomasses initiales transplantées, hauteurs par rapport à l’eau, types de berge, formes des placettes et associations avec d’autres espèces pionnières ont été réalisées entre 2013 et 2016. Les résultats montrent que transplanter T. minima avec une biomasse initiale importante sous forme de placette linéaire parallèle au cours d’eau à des hauteurs comprises entre +1.00m et +1.55m est optimal.
Ces travaux caractérisent d’une part les facteurs environnementaux et les processus en jeu dans la dynamique de T. minima et d’autre part, optimisent les protocoles de restauration, contribuant ainsi à alimenter les futurs projets de restauration et de conservation de l’espèce.

Dynamics of reedbed vegetation and impacts of management in Lesser Prespa Lake wetlands. Final report and synthesis 2017 - 2021. Report within the LIFE15 NAT/GR/000936 Bird conservation in Lesser Prespa: benefiting local communities and building a climate change resilient ecosystem (2021)

Mon, 4 Oct 2021 17:56:18

de Patrick Grillas, Fane Sakellarakis, Gaëtan Lefebvre, Loic Willm, Hugo Fontes, Clémence Pechinot
Arles (FRA) : Tour du Valat, 2021, 105

During the course of the LIFE Prespa Waterbirds project (2017-2021), and regarding the actions regarding the vegetation management and ecology, the main objectives were:
I. The identification of the spatial occupancy and dynamics of T. angustifolia and P. australis with emphasis given on the understanding of their ecological niches as well as detecting the main driving factor(s) for vegetation change, and II. Monitoring the effects of the management actions (cutting and/or grazing) applied towards the restoration of wet meadow communities along the shoreline of Lesser Prespa.
In this framework the detailed objectives set for our study were further divided in:
Assessing the current dynamics in the reedbeds (Phragmites australis / Typha angustifolia) of Lesser Prespa through drone derived orthophotomosaics.
Synthesis of annual mapping of areas burnt by wildfires during the LIFE Prespa Waterbirds using remote sensing techniques on Sentinel-2 and UAV derived orthophotomosaics.
Identification of the ecological niches of T. angustifolia and P. australis.
Effects of submergence after winter cutting on Phragmites australis.
Spatial and structure dynamics of P. australis and T. angustifolia at their patches interface.
Effects of management (mowing + cutting) on the restoration of wet meadows communities.

PNA 2020-2030 en faveur des libellules – Rapport d’activités 2020 coordination Provence-Alpes-Côte d’Azur (2021)

Wed, 22 Sep 2021 11:04:54

de Philippe Lambret
Arles : Tour du Valat, 2021, 4

Movement ecology of Yellow-legged Gulls (Larus michahellis) of the French Mediterranean coast (2021)

Thu, 16 Sep 2021 09:17:41

de Charly Souc
[S.l.] : Université de Montpellier, 2021, 58

The Yellow-legged Gull (Larus michahellis) is a common seabird species around the Mediterranean coast, well adapted to exploit human-associated resources. This study aimed to characterize movement in this species using a multi-event mark-recapture modeling framework. The data included the encounter histories of 5158 birds marked at fledging between 1999 and 2004 at 14 colonies in southern France and resighted for 10 years. Our results show that young individuals have a greater mobility than older ones; 53% of juveniles are migratory during the non-breeding period and move to areas more than 50 km from the natal colony compared to only 24% in older birds that return to the breeding colony. However, the spatial extent of juvenile movements depends on colony location, with a 45% difference in the proportion of sedentary individuals between colonies 50 km apart. These differences may be explained by colony quality or population dynamics. Indeed, young birds from colonies with strong juvenile survival probabilities (~0.75) appear to be more sedentary than those from colonies with low survival probabilities (~0.36). These results indicate that young birds are likely to be more important dispersers of avian disease than older birds and that this propensity may be conditioned by local breeding success and the location of food resources./

Le Goéland leucophée (Larus michahellis) est une espèce commune autour de la côte méditerranéenne. Cette étude visait à caractériser les mouvements de cette espèce en utilisant un modèle de capture-marquage-recapture multi-événements. Les données comprenaient les histoires des rencontres de 5158 oiseaux marqués à l'envol entre 1999 et 2004 dans 14 colonies du sud de la France, et ré observé pendant 10 ans. Nos résultats montrent que les jeunes individus ont une plus grande mobilité que les plus âgés ; 53% des juvéniles sont migrateurs en dehors de la période de reproduction et se déplacent vers des zones situées à plus de 50 km de la colonie natale, contre seulement 24% chez les oiseaux plus âgés qui retournent à la colonie de reproduction. Cependant, les mouvements des juvéniles dépendent de la localisation de leur colonie, avec une différence de 45% dans la proportion d'individus sédentaires entre des colonies distantes de 50 km. Les jeunes oiseaux des colonies ayant une forte probabilité de survie juvénile (~0,75) semblent être plus sédentaires que ceux des colonies ayant une faible probabilité de survie (~0,36). Ces résultats indiquent que les agents infectieux sont probablement plus dispersés par les jeunes oiseaux et que cette propension peut être conditionnée par le succès local de la reproduction et la localisation des ressources alimentaires.

Mapping wild fires in Prespa reedbeds. Use of BAIS2 Index and drone images (2021)

Wed, 8 Sep 2021 14:13:56

de Loic Willm, F.-N Sakellarakis, Patrick Grillas
Arles (FRA) : Tour du Valat, 2021, 21 + annex.

Remote sensing techniques can provide tools for mapping hazards in natural ecosystems, including wildfire events, targeting accurate mapping of distribution as well as post-event monitoring and recovery. Since 2019, whole lakeshore mapping of wildfire events and distribution in Lesser Prespa is implemented targeting solely the effects on reedbeds within the LIFE project Prespa Waterbirds. Based on previous work done in the area, fieldwork data coupled with sentinel-2 satellite images and remote sensing methodologies were used as a workflow pipeline in order to improve the delineation of wildfires in Prespa reedbeds. The implementation of the method used in 2019 (Burn Area Index for Sentinel-2 BAIS2) gave poor results in 2020. Therefore, a derivative of BAIS2, namely the deltaBAIS2, was created and is used since 2020. This derivative index is calculated as the difference before and after fire events of the value for each pixel of the BAIS2 index.
For 2021, at the same time as this analysis of satellite images, the use of oblique aerial images from drone missions to map burnt areas was tested, with a georeferencement tool from ArcMap. Both analysis (dBAIS2 and drone images) gave quite equivalent results and could be complementary. The satellite method is used to identify fire zones and map them while the drone method can be used to refine the delineation of burned areas.
A step-by-step methodological framework of drone photo analysis is also presented, to guide post-LIFE mapping of wildfire events.

Des impacts visibles du changement climatique sur la biodiversité en Provence-Alpes-Côte d'Azur (2021)

Tue, 1 Jun 2021 15:19:31

de (GREC PACA) Groupe régional d’experts sur le climat en Provence-Alpes-Côte d’Azur, J. Dulac, C. Vignon, E. Charbonnel, R. Bonet, L. Imberdis, D. Chavy, M. Peirache, Jocelyn Champagnon, Thomas Galewski, et al.
Marseille,France : Observatoire de la biodiversité en Provence-Alpes-Côte d’Azur, 2021, 16
En ligne : www.observatoire-biodiversite-paca.org[...]

La région Provence-Alpes-Côte d’Azur est un concentré exceptionnel de biodiversité, riche en espèces animales et végétales et en milieux marins et terrestres diversifiés. Ce patrimoine naturel est fragilisé par de nombreuses pressions telles que l’artificialisation du territoire, les espèces exotiques envahissantes, la pollution et la surexploitation des ressources naturelles. En plus de ces pressions, la France, notamment la région Provence-Alpes-Côte d’Azur, connaît un changement climatique se traduisant par un réchauffement avéré ces dernières décennies qui impacte la biodiversité régionale. Cette publication, réalisée par l’Observatoire de la biodiversité en Provence-Alpes-Côte d’Azur, montre des exemples déjà visibles chez des gestionnaires d’espaces naturels du Réseau régional des espaces naturels en région (RREN)

La restauration et la gestion des milieux tourbeux alcalins – utilisation du pâturage (2021)

Fri, 9 Apr 2021 18:17:33

de Patrick Duncan, Patrick Grillas, Nigel G. Taylor, Thierry Lecomte
Arles : Tour du Valat, 2021, 42

Les tourbières alcalines recouvrent plusieurs habitats d’intérêt communautaire, globalement en mauvais état de conservation en Europe, et caractérisés par leurs conditions environnementales et leur richesse spécifique. Dans les zones humides tourbeuses alcalines non perturbées, les conditions environnementales et en particulier hydrologiques maintiennent la végétation ouverte favorisant une grande richesse spécifique végétale et incluant de nombreuses espèces à enjeux de conservation, tant végétales qu’animales. La saturation en eau du sol joue un rôle essentiel dans le fonctionnement écologique, l’anoxie des sols qui en résulte contrôle les cycles biogéochimiques, détermine le biote souterrain, sélectionne les espèces végétales des communautés, contrôle la dynamique de la végétation et réduit la vitesse de décomposition de la matière organique favorisant ainsi l’accumulation de tourbe.
En Europe de l’Ouest moins de 10% des tourbières existent encore et celles qui restent sont profondément perturbées par des siècles de gestion pour l’exploitation de la tourbe et l’agriculture. Le drainage, plus ou moins prononcé, est une caractéristique commune à la plupart des perturbations, visant à augmenter la production végétale et la portance des sols. La baisse du niveau d’eau altère les conditions déterminantes pour le maintien de la production de tourbe (par l’oxydation des sols, la reprise de la minéralisation), et conduit à l’augmentation de la production primaire et la mise en place d’une succession vers des végétations à forte biomasse et faible richesse (notamment grandes herbes ou forestiers). Pour contrer cette tendance à la fermeture des milieux dans les tourbières alcalines, les principales méthodes de gestion sont le pâturage domestique, le fauchage et le débroussaillement ou déboisement, le feu, l’étrépage, … Le pâturage comme les autres modes de gestion apparaissent ainsi comme des moyens de gérer les conséquences d’une perturbation plutôt qu’une méthode indispensable à la conservation des tourbières alcalines en bon état de fonctionnement. La gestion avec des grands herbivores est considérée nécessaire par les experts consultés, surtout pour résoudre des pertes de biodiversité des plantes, et en cascade, des insectes, oiseaux et autres taxa patrimoniaux. Les objectifs secondaires cités sont le stockage du carbone, l'implication des voisins dans la gestion, le contrôle des espèces exotiques envahissantes, ou la réduction du risque d'inondation de zones urbanisées.

The future for Mediterranean wetlands: 50 key issues and 50 important conservation research questions

Wed, 27 Jan 2021 10:11:49

de Nigel G. Taylor, Patrick Grillas, Hazem Al Hreisha, Özge Balkız, Maud Borie, Olivier Boutron, Ana Catita, Jocelyn Champagnon, Semia Cherif, Kerim Cicek, et al.
In Regional Environmental Change, Online (2021), 25

Wetlands are critically important for biodiversity and human wellbeing, but face a range of challenges. This is especially true in the Mediterranean region, where wetlands support endemic and threatened species and remain integral to human societies, but have been severely degraded in recent decades. Here, in order to raise awareness of future challenges and opportunities for Mediterranean wetlands, and to inform proactive research and management, we identified (a) 50 key issues that might affect Mediterranean wetlands between 2020 and 2050, and (b) 50 important research questions that, if answered, would have the greatest impact on the conservation of Mediterranean wetlands between 2020 and 2050. We gathered ideas through an online survey and review of recent literature. A diverse assessment panel prioritised ideas through an iterative, anonymised, Delphi-like process of scoring, voting and discussion. The prioritised issues included some that are already well known but likely to have a large impact on Mediterranean wetlands in the next 30 years (e.g. the accumulation of dams and reservoirs, plastic pollution and weak governance), and some that are currently overlooked in the context of Mediterranean wetlands (e.g. increasing desalination capacity and development of antimicrobial resistance). Questions largely focused on how best to carry out conservation interventions, or understanding the impacts of threats to inform conservation decision-making. This analysis will support research, policy and practice related to environmental conservation and sustainable development in the Mediterranean, and provides a model for similar analyses elsewhere in the world.

Des moustiques et des hommes.

Tue, 9 Feb 2021 10:16:51

de Brigitte Poulin
In La Cistude, 132 (Décembre 2020), 24-27
En ligne : fr.calameo.com[...]

Avifauna composition of two natural and artificial wetlands in Jijel region of North-eastern Algeria (The Beni Haroun Dam and Redjla Marsh)

Fri, 8 Jan 2021 09:32:54

de Chabou Sarra, Khammar Hichem, Hadjab Ramzi, Saheb Menouar
In Ecology, Environment and Conservation, 26(4) (December, 2020), 15
En ligne : www.researchgate.net[...]

This study was carried out in the north-eastern part of Algeria on two wetlands, one artificial (Beni Haroun Dam) and the other natural (Redjla Marsh) from November 2017 to October 2018. Forty seven species from 16 families and 9 orders and four guilds have been identified. The richest family in species and abundance is the Anatidae family (11 species at the Beni Haroun Dam and 12 species at the Redjla Marsh). From an effective point of view, the Great Cormorant Phalacrocorax carbo (Phalacrocoracidae) is the species most represented in the Beni Haroun Dam and the Macroule Coot Fulica atra (Rallidae) is the most represented in Redjla Marsh. Some species frequenting these environments have a national conservation status such as the Great Cormorant Phalacrocorax carbo, the Marbled Teal Marmaronetta angustirostris and the White Spoonbill Platalea leucorodia. Some species are classified as threatened and vulnerable on the IUCN Red List, such as the Marbled Teal and the Ferruginous Duck Aythia nyroca.

Comparing the diversity and composition of waterbird functional traits between natural, restored, and artificial wetlands

Thu, 8 Oct 2020 11:52:33

de Bia A. Almeida, Esther Sebastián‐González, Luiz Dos Anjos, Andy J. Green
In Freshwater Biology, 65(12) (December, 2020)
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

The restoration of degraded areas and the creation of artificial ecosystems have partially compensated for the continuing loss of natural wetlands. However, the success of these wetlands in terms of the capacity of supporting biodiversity and ecosystem functions is unclear. Research is needed to improve our understanding of the value of restored and constructed wetlands for functional diversity of freshwater fauna. We compared natural, restored, and artificially created wetlands present within the Doñana Natural Space, Spain and valued as important for waterbirds. We evaluated if these wetlands are equivalent in terms of waterbird functional trait diversity and composition, during both the wintering and breeding seasons. We modelled functional diversity measures and functional group species richness describing species diet, body mass, and foraging techniques with generalised linear mixed models in 20 wetlands monitored between 2006 and 2011. We used three different statistical approaches to evaluate the robustness of our results. Artificial wetlands constructed for conservation failed to reach the functional diversity of natural and restored wetlands. Unexpectedly, artificial ponds constructed for fish production performed better, and even exceeded natural wetlands for functional richness during winter. Fish ponds stood out as having a unique functional composition, connected with increase in richness of opportunistic gulls and decrease of species sensitive to high salinity. Overall, the functional structure of breeding communities was more affected by wetland type than wintering communities. Our findings suggest that compensating the loss of natural wetlands with restored and artificial wetlands results in systems with altered waterbird-supported functions, such as seed dispersal or nutrient cycling. Protection of natural Mediterranean wetlands is vital to maintain the original diversity and composition of waterbird functional traits. Furthermore, restoration must be prioritised over the creation of artificial wetlands, which, even when intended for conservation, may not provide an adequate replacement.

Lestes macrostigma (Eversmann), the Dark Spreadwing

Fri, 20 Nov 2020 16:38:18

de David Chelmick, Philippe Lambret
In Journal of the British Dragonfly Society, 36(2) (November, 2020), 84-108

Lestes macrostigma (Dark Spreadwing) occurs across the southern Palearctic from the Atlantic coast as far east as Mongolia. It is locally common in the central part of its range, including Greece and Bulgaria, but becomes increasingly rare in the western parts of the region where, with notable exceptions, it is essentially coastal. It is very much associated with temporary, brackish and and saline habitats and, very often, with Bolboschoenus maritimus (Sea Club Rush). Many of its coastal habitats are under threat, especially from wetland transformation schemes of various types and, for tnat reason, the species is listed as Endangered in the European Red list.

Evaluating Functional Dispersal in a Nest Ectoparasite and Its Eco-Epidemiological Implications

Mon, 25 Oct 2021 14:36:36

de Amalia Rataud, Marlene Dupraz, Céline Toty, Thomas Blanchon, Marion Vittecoq, Remi Choquet, Karen D. McCoy
In Frontiers in Veterinary Science, 7 (October, 2020), 722
En ligne : www.frontiersin.org[...]

Functional dispersal (between-site movement, with or without subsequent reproduction) is a key trait acting on the ecological and evolutionary trajectories of a species, with potential cascading effects on other members of the local community. It is often difficult to quantify, and particularly so for small organisms such as parasites. Understanding this life history trait can help us identify the drivers of population dynamics and, in the case of vectors, the circulation of associated infectious agents. In the present study, functional dispersal of the soft tick Ornithodoros maritimus was studied at a small scale, within a colony of yellow-legged gulls (Larus michahellis). Previous work showed a random distribution of infectious agents in this tick at the within-colony scale, suggesting frequent tick movement among nests. This observation contrasts with the presumed strong endophilic nature described for this tick group. By combining an experimental field study, where both nest success and tick origin were manipulated, with Capture-Mark-Recapture modeling, dispersal rates between nests were estimated taking into account tick capture probability and survival, and considering an effect of tick sex. As expected, tick survival probability was higher in successful nests, where hosts were readily available for the blood meal, than in unsuccessful nests, but capture probability was lower. Dispersal was low overall, regardless of nest state or tick sex, and there was no evidence for tick homing behavior; ticks from foreign nests did not disperse more than ticks in their nest of origin. These results confirm the strong endophilic nature of this tick species, highlighting the importance of life cycle plasticity for adjusting to changes in host availability. However, results also raise questions with respect to the previously described within-colony distribution of infectious agents in ticks, suggesting that tick dispersal either occurs over longer temporal scales and/or that transient host movements outside the breeding period result in vector exposure to a diverse range of infectious agents.

Geographic variation in body size among French populations of the European pond turtle

Thu, 15 Oct 2020 15:37:34

de Fabien Mignet, Jean-Yves Barnagaud, Laurent Barthe, Albert Bertolero, Valerie Bosc, Florine Escot, Romain Fleuriau, Laurent Joubert, André Joyeux, Damien Lerat, et al.
In Amphibia-Reptilia, 42(2) (October, 2020), 1-11
En ligne : brill.com[...]

The processes underlying macroecological gradients in body size are widely debated, in part because their intraspecific variability remains poorly described even in well-studied taxa such as vertebrates. In this study, we investigated how climate, habitat, genetic lineage and sex explain body size variations in French populations of the European pond turtle (Emys orbicularis). We measured 7016 adult individuals captured in 41 populations, covering most of the species’ distribution in metropolitan France, including Corsica. Body size variation in our sample was wide and comparable to that found across the species’ worldwide range. Variation was similar in magnitude at regional and local levels, suggesting that body size is influenced by local factors as much as by regional factors such as climate or genetic lineage. Smaller sizes were associated with Mediterranean or altered oceanic climates, and with two lineages (E. o. galloitalica and E. o. galloitalica/E. o. orbicularis), while larger sizes were associated with northern environments and the orbicularis lineage. Body size variations recorded at local level reflect an adaptive response to environmental constraints, suggesting that habitat is also an important factor in understanding size variation.

Waterbird seed-dispersal networks are similarly nested but less modular than those of frugivorous birds, and not driven by functional traits

Thu, 8 Oct 2020 11:52:45

de Esther Sebastián‐González, Ádám Lovas‐Kiss, Merel B. Soons, Bas van den Broek, Andy J. Green
In Functional Ecology, n/a(n/a) (2020)
En ligne : besjournals.onlinelibrary.wiley.com[...]

Frugivory is widely recognized as vital for the dispersal of many plants. Moreover, plant species and their frugivorous dispersers form seed-dispersal assemblages whose structure has important implications for the persistence and stability of the community. However, dispersal interactions between plants and non-frugivorous animal groups such as waterbirds remain largely understudied. We aimed to characterize the structure of waterbird seed-dispersal networks, assess if this structure is similar to that of networks formed between frugivorous birds and fleshy-fruited plants, and identify bird or plant functional traits important for the maintenance of network structure. We used network analyses and data from four community-level studies on waterbird gut contents, including 12 bird and 88 plant species. We compared the network structure of waterbirds to those from previous studies of frugivorous birds. We also related the contribution of each species to the network structure with functional traits (e.g. size, habitat requirements, diet). Waterbird seed-dispersal networks are similarly nested (i.e. specialists interact with a subset of those species that interact with generalists) but less modular (i.e. fewer semi-independent groups of highly interacting species) than those of frugivores. Dabbling ducks, diving ducks and rallids did not separate into modules. The contribution of bird or plant species to network structure was not related to any functional trait. Seed-dispersal networks of waterbirds share some organizational patterns with those of frugivores, but the underlying processes are not related to functional traits. This is probably related to fundamental differences between waterbirds and frugivores in how seeds are ingested. Differences in the functional role of waterbirds for seed dispersal are likely driven by other processes such as differences in population size, movement, ecology or gut processing of seeds. A free Plain Language Summary can be found within the Supporting Information of this article.

Changes in Bacterial Diversity, Composition and Interactions During the Development of the Seabird Tick Ornithodoros maritimus (Argasidae)

Tue, 13 Oct 2020 18:11:39

de Yann Gomard, Olivier Flores, Marion Vittecoq, Thomas Blanchon, Céline Toty, Olivier Duron, Patrick Mavingui, Pablo Tortosa, Karen D. McCoy
In Microbial Ecology, Online (October, 2020)
En ligne : doi.org[...]

Characterising within-host microbial interactions is essential to understand the drivers that shape these interactions and their consequences for host ecology and evolution. Here, we examined the bacterial microbiota hosted by the seabird soft tick Ornithodoros maritimus (Argasidae) in order to uncover bacterial interactions within ticks and how these interactions change over tick development. Bacterial communities were characterised through next-generation sequencing of the V3–V4 hypervariable region of the bacterial 16S ribosomal RNA gene. Bacterial co-occurrence and co-exclusion were determined by analysing networks generated from the metagenomic data obtained at each life stage. Overall, the microbiota of O. maritimus was dominated by four bacterial genera, namely Coxiella, Rickettsia, Brevibacterium and Arsenophonus, representing almost 60% of the reads. Bacterial diversity increased over tick development, and adult male ticks showed higher diversity than did adult female ticks. Bacterial networks showed that co-occurrence was more frequent than co-exclusion and highlighted substantial shifts across tick life stages; interaction networks changed from one stage to the next with a steady increase in the number of interactions through development. Although many bacterial interactions appeared unstable across life stages, some were maintained throughout development and were found in both sexes, such as Coxiella and Arsenophonus. Our data support the existence of a few stable interactions in O. maritimus ticks, on top of which bacterial taxa accumulate from hosts and/or the environment during development. We propose that stable associations delineate core microbial interactions, which are likely to be responsible for key biological functions.

Above- and below-ground effects of an ecosystem engineer ant in Mediterranean dry grasslands

Wed, 23 Sep 2020 14:13:49

de Tania De Almeida, François Mesléard, M. Santonja, Raphael Gros, Thierry Dutoit, O. Blight
In Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences, 287(1935) (September, 2020), 10
En ligne : royalsocietypublishing.org[...]

Within a local assemblage, ecosystem engineers can have major impacts on population dynamics, community composition and ecosystem functions by transforming or creating new habitats. They act as an ecological filter altering community composition through a set of environmental variables. The impact of ants on their environment has been widely studied, but their multi-component effects (both trophic and non-trophic) have been rarely addressed. We investigated the roles of Messor barbarus, one of the commonest harvester ant species in south-western European Mediterranean grasslands. We analysed soil physico-chemical parameters, above-ground vegetation (e.g. species richness, plant community, micro-local heterogeneity, plant biomass) and above- and below-ground fauna (macrofauna, Collembola, Acari and nematodes). A clear and strong local impact of M. barbarus on soil, vegetation and fauna compartments emerges. The environmental filter is altered by modifications to soil physico-chemical properties, and the biotic filter by changes to plant communities and altered above- and below-ground fauna abundance, occurrence and community structure. The engineering activity of M. barbarus affects not only these separate ecosystem components but also the trophic and non-trophic relationships between them. By altering ecological filters at a local scale, M. barbarus creates habitat heterogeneity that may in turn increase ecological niches in these highly diverse ecosystems.
Keywords :

Ecology of avian settlements in Lake Tonga (Northeast Algeria)

Wed, 23 Sep 2020 14:14:22

de K. Loucif, M. Bara, A. Grira, M. C. Maazi, A. Hamli, M. Houhamdi
In Zoodiversity, 54(4) (September, 2020), 275-284
En ligne : ojs.akademperiodyka.org.ua[...]

Lake Tonga is an integral reserve within the El-Kala National Park, Biosphere Reserve and Ramsar site. This study consists in determining the diversity and phenology status of waterbirds in this reserve over an entire annual cycle (2017–2018). The census was carried out from fixed observation points. Of the 35 species recorded, wintering birds dominate with 12 species (34 %), followed by breeding sedentary species with 11 species (32 %). The breeding water bird populations are dominated by the common coot Fulica atra, (with a maximum of 6,033 birds) followed by the Anatidae, Herons and Grebes. Lake Tonga is a breeding area for several avian species and a recruitment site for a multitude species bird during the wintering period. Three Anatidae nest at Lake Tonga: the white-headed duck Oxyura leucocephala, the ferruginous duck Aythya nyroca and the mallard Anas platyrhynchos.

When survival matters: is decreasing survival underlying the decline of common pochard in western Europe?

Fri, 18 Sep 2020 14:34:14

de Benjamin Folliot, Guillaume Souchay, Jocelyn Champagnon, Matthieu Guillemain, Maurice Durham, Richard Hearn, Josef Hofer, Jacques Laesser, Christophe Sorin, Alain Caizergues
In Wildlife Biology, 2020(3) (September, 2020)
En ligne : bioone.org[...]

In western Europe, common pochard populations have experienced a sharp decline over the last two decades, together with an increasing proportion of males. Both of these changes were suggested to result from decreasing survival of nesting females (i.e. survival of adult females) owing to increasing predation pressure. To test this hypothesis, we used capture–mark–recapture/recovery data of common pochard ringed during autumn–winter (October–February) in three countries of western Europe (Switzerland, United Kingdom and France). We found no evidence for decreasing survival of individuals ringed in the United Kingdom or in Switzerland over the long term (1977–2011). In France, adult males and juvenile females experienced significant decreasing survival over a shorter interval (2004–2017). Overall, females displayed lower survival than males, although this was only weakly supported by the French dataset. In contrast, only sex differences and no age differences in survival rates were recorded in the UK and Switzerland (females 0.67 ± 0.03 and 0.69 ± 0.03; males: 0.81 ± 0.01 and 0.75 ± 0.01, respectively), while both age and sex differences were recorded for France (adult females 0.62 ± 0.07, adult males 0.66 ± 0.07, juvenile females 0.49 ± 0.08, juvenile males 0.54 ± 0.08). Therefore, decreasing survival of adult females was unlikely the underlying cause of the decline of common pochard populations in western Europe. Using an age-structured two-sex matrix population model, we show that when adult males experience higher survival than adult females (as it is the case for common pochards), decreasing survival of nests and/or juveniles can trigger decreasing population size and increasing proportions of males at the same time.

Presence of the introduced ctenophore Mnemiopsis leidyi A. Agassiz, 1865 in a lagoon system within the River Rhône delta (southeast France)

Fri, 11 Sep 2020 15:06:25

de Guillaume Marchessaux, Delphine Nicolas, Alain Jean Crivelli, Silke Befeld, Pascal Contournet, Delphine Thibault
In BioInvasions Records, 9(3) (2020), 471-481
En ligne : www.reabic.net[...]

The introduced ctenophore Mnemiopsis leidyi A. Agassiz, 1865 was observed in the Vaccarès Lagoon (River Rhône delta, southeast France) for the first time in 2016. Large blooms had been observed during the summer in 2016, with monthly zooplankton community monitoring carried out from November 2016 to October 2017. This was done to better understand the dynamics of this ctenophore within this brackish Lagoon. In parallel, we report the first record of Mnemiopsis leidyi in another Mediterranean lagoon near Camargue delta (Estomac Lagoon) in 2019.

Winter diet and lead poisoning risk of Greater Spotted Eagles Clanga clanga in southeast Spain

Tue, 13 Oct 2020 18:10:56

de Juan Manuel Pérez-García, Jana Marco-Tresserras, Adrian Orihuela-Torres
In Bird Study, 67(2) (July, 2020), 224-231
En ligne : doi.org[...]

Capsule: Diet analysis revealed high lead exposure for Greater Spotted Eagles Clanga clanga wintering in southeast Spain. Aims: To describe the diet composition of the endangered Greater Spotted Eagle in a wintering area located in southeast Spain, and determine lead ammunition exposure through analysis of regurgitated pellets and prey remains. Methods: Between 2008 and 2018, a total of 26 pellets, 29 prey remains and 10 direct predation observations were collected in El Hondo Natural Park, Spain. All the pellets and 10 prey remains were analysed with X-ray in order to detect metal from ammunition. Results: Greater Spotted Eagles fed mainly on birds, with 18 different species accounting for 73.1% of prey items and 66.1% of biomass consumed. The most frequent species identified were Common Moorhen Gallinula chloropus (23.1%), rats Rattus spp. (15.4%) and Common Teal Anas crecca (8.9%). Ammunition was detected in 42.3% of regurgitated pellets and in 40.0% of prey remains analysed. Of those containing ammunition, lead shot was found in 63.9% of pellets and 25.0% of prey remains. Conclusion: High lead shot presence in pellets and prey remains of wintering Greater Spotted Eagles in southeast Spain warns of a high risk of lead poisoning. Factors such as feeding behaviour, the large space–time overlap between the raptor presence and the waterbird hunting season and non-compliance with the ban on the use of lead ammunition are likely contributing to high lead exposure.

Ecological and biological behavior of nesting colony of Bubulcus Ibis in north-western Algeria

Tue, 6 Oct 2020 11:12:19

de Ahmed Mohammedi, Mohamed Kouidri, Abdelhak Mahmoudi, Adda Ababou
In Lebanese Science Journal, 21(1) (2020), 1–11
En ligne : lsj.cnrs.edu.lb[...]

Feeding habits of the European pond turtle (Emys orbicularis) in the Lake Tonga, Algeria

Thu, 22 Oct 2020 10:03:55

de Nadia Ziane, Samira Fediras, Rachid Rouag, Anthony Olivier, Slim Benyacoub
In Herpetology Notes, 13 (June, 2020), 875-881
En ligne : www.biotaxa.org[...]

We studied the feeding habits of Emys orbicularis in the Lake Tonga, situated in north-eastern of Algeria. The ecology of this turtle is little known in Maghreb, and in this study, detailed data on the diet composition are presented. Food data were recovered by faecal pellet analysis. In total, 43 faecal pellets were collected in 2017 and analysed, and 353 prey items were identified from 22 females, 21 males. The food habits of this population seemed more specific than those of other E. orbicularis populations in other regions. Emys orbicularis feeds on a wide range of food categories and is also a specialist of freshwater snails. The turtles were eating more animal than plant material, aquatic molluscs being the most conspicuous diet item found. There are no differences in the consumption of food items among the sexes categories.

Intérêt de la chasse à l'arc dans un espace protégé camarguais

Tue, 9 Jun 2020 15:20:12

de Anthony Olivier, Olivier Pineau
In Chasser en Provence, 51 (avril-mai-juin 2020), 41-'1

How Cortaderia selloana, an ornamental plant considered highly invasive, fails to spread from urban to natural habitats in Southern France

Wed, 15 Jul 2020 13:45:21

de Anne Charpentier, Marine Kreder, Aurélien Besnard, Perrine Gauthier, Claudine Bouffet
In Urban Ecosystems, Online (2020-05-11), 10
En ligne : doi.org[...]

The role of urban areas in the introduction of alien plant species, and their subsequent spread in the countryside, has long been identified. However, it was mainly considered indirectly due to the lack of data on the frequency of planting of alien species and their early stages of colonization. In this study, we took advantage of the spectacular flowering of the pampa grass (Cortaderia selloana), a tall ornamental plant, visible from afar, to study the spatial dynamics of planted and naturalized stands (i.e. those resulting from seed dispersal) over 600 km2 and over an 11-year period. Using distance sampling methods, we detected 216 and 241 planted stands in 2002 and 2013, respectively. In 2002, we also detected 853 naturalized stands, closely associated with anthropogenic habitats around urban areas. Such spatial association could have represented the initial stages of a spread from urban areas to natural habitats. However, 11 years later, this very close association between naturalized stands and urban areas has not weakened, suggesting a persistent pattern. In both 2002 and 2013, less than 15% of naturalized individuals grew up in natural habitats, almost all limited to the edges of reed beds where they did not threaten local biodiversity. Our study shows that the massive introduction of an alien plant into urban areas, and its subsequent massive naturalization, does not necessarily means its spread to natural habitats. On the contrary, it can remain closely associated with anthropogenic habitats.

A fine-grained bird Atlas as tool for spatial monitoring: a case study from a remnant wetland during the breeding period (Torre Flavia, central Italy)

Thu, 12 Nov 2020 14:37:13

de Corrado Battisti, Giuseppe Dodaro, Mario Vannuccini
In Rivista Italiana di Ornitologia, 90(1) (March, 2020)
En ligne : sisn.pagepress.org[...]

During the 2019 breeding period we carried out a bird atlas for a small coastal natural reserve (Torre Flavia wetland, Special Protection Area IT6030020, central Italy), comparing quantitative data of spatial occurrences with records from an analogous study carried out in 2005. From 2005 to 2019 some water-related species increased their frequency of occurrence (Fulica atra, significantly). Among the reed and rush-bed species, Acrocephalus scirpaceus spatially increased and Cisticola juncidis decreased significantly. Among ecotonal, synanthropic and open habitat species, we registered a significant increase of Chloris chloris. A decreasing trend of Passer italiae, Saxicola torquatus, Emberiza calandra, although not significant, may be probably linked to regional or continental factors. Both causes at local (reedbed expansion, rushbed reduction, water-level management) and at larger scale (decline in their continental range) can explain the observed changes in spatial occurrences during this medium-long temporal range. Local atlases can be quick tools useful to drive management strategies in remnant wetlands.

Morphological and physiological traits of Mediterranean sticklebacks living in the Camargue wetland (Rhone river delta)

Mon, 20 Apr 2020 19:02:43

de Khalid Rind, Quentin Rodriguez‐Barucg, Delphine Nicolas, Patricia Cucchi, Jehan-Hervé Lignot
In Journal of Fish Biology, On line (12/03/2020), 13
En ligne : onlinelibrary.wiley.com[...]

Three-spined sticklebacks (Gasterosteus aculeatus L.) living at the southern limit of the species distribution range could possess specific morphological and physiological traits that enable these fish to live at the threshold of their physiological capacities. Morphological analysis was carried out on samples of sticklebacks living in different saline habitats of the Camargue area (Rhone delta, northern Mediterranean coast) obtained from 1993 to 2017. Salinity acclimation capacities were also investigated using individuals from freshwater-low salinity drainage canals and from mesohaline–euryhaline lagoons. Fish were maintained in laboratory conditions at salinity values close to those of their respective habitats: low salinity (LS, 5‰) or seawater (SW, 30‰). Fish obtained from a mesohaline brackish water lagoon (BW, 15‰) were acclimated to SW or LS. Oxygen consumption rates and branchial Na+/K+-ATPase (NKA) activity (indicator of fish osmoregulatory capacity) were measured in these LS or SW control fish and in individuals subjected to abrupt SW or LS transfers. At all the studied locations, only the low-plated “leiurus” morphotype showed no spatial or temporal variations in their body morphology. Gill rakers were only longer and denser in fish sampled from the LS–freshwater (FW) drainage canals. All fish presented similar physiological capacities. Oxygen consumption rates were not influenced by salinity challenge except in SW fish transferred to LS immediately and 1 h after transfer. However, and as expected, gill NKA activity was salinity dependent. Sticklebacks of the Camargue area sampled from habitats with contrasted saline conditions are homogenously euryhaline, have low oxygen consumption rates and do not appear to experience significantly greater metabolic costs when challenged with salinity. However, an observed difference in gill raker length and density is most probably related to the nutritional condition of their habitat, indicating that individuals can rapidly acclimatize to different diets.

Pond turtle carapaces, an alternative natural substrate for the use of a diatom-based water quality index

Tue, 25 Feb 2020 17:07:24

de Véronique Vassal, Luc Ector, Bart Van de Vijver, Vincent Roubeix, Anthony Olivier, Samuel Pauvert, Cédric Roy, Stéphanie Fayolle
In Botany Letters, Online (February, 2020)
En ligne : www.tandfonline.com[...]

Benthic diatoms are widely used as bio-indicators in water quality monitoring of rivers and streams, but less commonly in lentic waterbodies such as pools and lakes. Currently, a new method for assessing the ecological status of lakes is being tested in France to meet the requirements of the European Water Framework Directive (WFD) 2000/60/EC. This new method uses epilithic and epiphytic diatoms growing on stones and aquatic plants. Alternatively, freshwater turtles and the epizoic algae found on their carapaces may provide an excellent substrate for estimating water quality. Our study proposes an original diatom-based method for assessing the quality of water bodies in which turtles live. The main objective was to compare the Biological Diatom Index (BDI) values measured from epizoic diatom samples taken on the carapace of turtles with classical epilithic or epiphytic samples. Epizoic samples were taken from the carapaces of the turtle Emys orbicularis in two shallow French Mediterranean wetlands. Our results indicate that diatom assemblages differ slightly within the three substrates studied with limited variations in index value. However, some variability among epizoic samples from the same site suggests that several turtle individuals should be sampled for water quality biomonitoring.

Perception et adaptation au changement climatique dans les deltas méditerranéens

Tue, 21 Jan 2020 14:02:10

de Lisa Ernoul, Camille Roumieux, Alain Sandoz
In Géoconfluences, Online (Janvier 2020), 5
En ligne : geoconfluences.ens-lyon.fr[...]

Les deltas méditerranéens sont des espaces dont les milieux dépendent des aménagements anthropiques des fleuves qui les alimentent. En tant que côtes basses à climat méditerranéen, ils sont particulièrement vulnérables aux effets probables des changements climatiques. L'étude de trois deltas (Rhône, Vardar et Gediz) montre que les pratiques de leurs habitants associent adaptation locale et prise de conscience globale, mais aucune adaptation efficace n'est possible sans gestion concertée à plusieurs échelles.

Cohort effect on discriminant rate: the case of greater flamingo (Phœnicopterus roseus) chicks sexed with morphological characters

Tue, 24 Sep 2024 09:46:11

de Abdennour Boucheker, Riad Nedjah, Roger Prodon, Mark Gillingham, François-Xavier Dechaume-Moncharmont, Arnaud Béchet, Boudjema Samraoui
In Web Ecology, 20(2) (2020), 153
En ligne : univ-lyon1.hal.science[...]

We used a large dataset of greater flamingo chicks banded and measured at Camargue, France, to verify the applicability of discriminant function analysis to sex this species. Males and females sexed genetically differed significantly in all of the morphological characters measured (body mass, tarsus and wing length), with males being significantly larger than females. Although the discriminant rate varied substantially from one year to another, we found that it increased with the sample size of genetically sexed individuals. Our results suggest that discriminant function analysis (DFA) does not provide an efficient tool to sex greater flamingo chicks as these relationship are highly variable across years, requiring the genetic determination of sex on a large number of individuals every year for calibrating the DFA and still providing an overall low accuracy in sex determination. Indeed, conditions at breeding seasons can vary between years and can be considered proximate causes affecting the correct discriminant rate. Like previous studies, we recommend caution in dealing with discriminant equations computed from small datasets, and our simulation suggests that 325 genetically sexed individuals are needed to obtain 80 % correctly classified greater flamingo chicks.

Conservation et exigences écologiques des populations de passereaux paludicoles méditerranéens (2020)

Thu, 11 May 2023 10:11:35

de Nicolas Bastide
[S.l.] : Université Rennes 1, 2020, 40

Dans cette étude, nous avons analysé, à l’aide de données de baguage, la tendance des populations de passereaux paludicoles en Méditerranée. Nous avons montré que ces populations ont subi un déclin de près de 40 % entre 2011 et 2019. Certaines de ces espèces apparaissent sur les listes rouges avec des statuts défavorables. Ainsi, les roselières constituent un enjeu fort de conservation en France. Dans le but de favoriser un compromis entre conservation patrimoniale et usages socio-économiques, nous avons corrélé l’abondance de certaines de ces espèces, pendant la période hivernale et de nidification, avec les caractéristiques des roselières gérées. Nous avons trouvé que les exigences écologiques variaient en fonction de la saison et des espèces. L’abondance des espèces spécialistes était positivement corrélée avec des caractéristiques de vieilles roselières, c’est-à-dire avec une certaine densité de tiges fleuries et des tiges vertes hautes ayant un diamètre conséquent. Les vieilles roselières semblent ainsi avoir un rôle non négligeable pour la conservation des espèces spécialistes. Toutefois, une gestion optimale d’un habitat nécessite de prendre en compte les aspects sociaux, environnementaux et économiques de celui-ci. Nous préconisons, ainsi, de favoriser une mosaïque de parcelles coupées, pâturées et de roselières vieillissantes, permettant le maintien de l’utilisation de la roselière, mais également la conservation des espèces vulnérables.

L'espace et le temps en Camargue (2020)

Fri, 3 Mar 2023 18:12:20

de Bernard Picon
4ème édition revue et augmentée. Arles : Actes Sud, 2020, 384

Etude du processus de mise en valeur du pays camarguais et réflexions sur les rapports symboliques que la société entretient avec la nature

Suivi de la colonie de Flamant rose, Phoenicopterus roseus, installée à l'étang du Roi, Salins du Midi, Aigues-Mortes (Gard) (2020)

Fri, 3 Feb 2023 18:23:34

de Camille Couderc
Montpellier : Université de Montpellier, 2020, 37

Malgré le confinement lié au Covid-19, le suivi de la colonie 2020 installée sur l’étang du Roi (Salins du Midi, Aigues-Mortes, Gard) a pu être effectué. C’est l’une des années record de la reproduction en France avec 20 885 couples comptabilisés pour un total de plus de 12 000 juvéniles à l’envol. 5 886 lectures de bagues provenant de 3 047 individus différents ont pu être relevées. Les individus proviennent de l’ensemble du bassin méditerranéen dont la Camargue, la Catalogne, l’Andalousie, la Sardaigne, l’Italie, l’Algérie et la Turquie. L’interconnexion entre ces différents sites de reproduction semble être de plus en plus forte. De plus, les Flamants observés en tant que reproducteurs ont entre 5 et 43 ans avec un effectif important d’individus ayant 10 ans et moins. Ainsi, il se pourrait que l’installation à l’étang du Roi ait facilité l’accès à la reproduction des jeunes Flamants. A l’inverse les individus ayant plus de 40 ans sont moins nombreux ce qui pourrait signifier la sénescence de leur reproduction. Toutefois ces hypothèses restent à confirmer puisque les individus observés à la colonie sont très peu recontactés, ne permettant pas toujours de les identifier en tant que reproducteurs confirmés. Mots clés : Flamant rose, Phoenicopterus roseus, colonie, CMR, bague Darvic

Chapitre 3 : Biodiversité et systèmes écosystémiques (2020)

Thu, 27 May 2021 15:18:53

de Daniel Cebrian, Nelly Bourlion, Dania Abdul Malak, Katia Aikas, Elisa Alcázar, Julie Belmont, Florence Descroix-Comanducciv, Maria Mar, Kelly Fouchy, Elie Gaget, et al.
Marseille; France : Plan Bleu Regional Activity Centre, 2020, 83–119
En ligne : planbleu.org[...]

Les écosystèmes côtiers et marins de la Méditerranée présentent un niveau élevé de biodiversité et d'endémisme. La mer Méditerranée est considérée comme un point chaud de la biodiversité, représentant seulement 0,3% du volume global des océans tout en abritant 7% des espèces marines identifiées dans le monde, avec le plus haut taux d'endémisme (20-30%) des espèces marines dans le monde. Sous l'effet des activités humaines des dernières décennies, la biodiversité méditerranéenne a subi des pressions croissantes d'origine humaine telles que la pollution, la surexploitation des ressources biologiques, le changement d'affectation des terres et le développement des infrastructures côtières, les modifications de la dynamique fluviale, l'augmentation de l'utilisation de la mer et les effets du changement climatique. Ces pressions ont réduit l'étendue des zones sauvages et des écosystèmes naturels sur terre et en mer, et ont altéré la capacité des écosystèmes à fournir des services écosystémiques vitaux pour l'homme. Environ 11 % des espèces marines et 14 % des espèces terrestres et côtières sont menacées d'extinction, la plupart étant endémiques. Les espèces non indigènes sont de plus en plus présentes dans la mer Méditerranée, avec un total de plus de 1 000 espèces marines non indigènes recensées, dont plus de 100 sont invasives. Le Programme des Nations Unies pour l'environnement/Plan d'action pour la Méditerranée (PNUE/PAM) a fait de la biodiversité l'un des principaux piliers de son approche écosystémique, dans le but de parvenir à un bon état écologique (BEE) de la mer Méditerranée et de soutenir le développement d'actions efficaces pour sauvegarder et restaurer la biodiversité. Ces actions doivent être entreprises de toute urgence pour éviter des pertes irréversibles en termes de services écosystémiques et de biodiversité. Une mesure qui s'est avérée efficace, si elle est mise en œuvre correctement, consiste à créer des aires marines protégées (AMP). La couverture des AMP a augmenté au cours de la dernière décennie, et est proche de la couverture de 10% fixée comme objectif pour 2020 dans les objectifs d'Aichi. Cependant, l'efficacité de la gestion et l'application de la loi restent un défi.

Passive Restoration of the Tourtoulen Riverine Woodland (2020)

Wed, 12 May 2021 10:47:04

de Tour du Valat
Arles (FRA) : Tour du Valat, 2020, 4
En ligne : tourduvalat.org[...]

Vers une meilleure connaissance des lagunes temporaires méditerrannéennes : un habitat naturel menacé (2020)

Fri, 15 Jan 2021 18:36:02

de Aubin Allies
Rapport d'étude scientifique et technique. Montferrier sur Lez : Conservatoire botanique national méditerranéen de Porquerolles, 2020, 40

Les lagunes côtières abritent une grande biodiversité et offrent des services écosystémiques clés. Dans le bassin méditerranéen, du fait des conditions climatiques particulières, certaines de ces lagunes s’assèchent en été. Ces Lagunes Temporaires Méditerranéennes (LTMS) ont été jusqu’à présent peu étudiées. Elles abritent pourtant des espèces ﬂoristiques sténoèces rares impliquant d’importants enjeux de conservation. Pour y répondre, un Plan Régional d’Action (FRA) a été mis en œuvre par le Conservatoire Botanique National Méditerranéen. Dans ce cadre, une analyse bibliographique a permis de mieux déﬁnir l’habitat LTMs tant vis- à—vis des standards scientiﬁques qu’institutionnels. Une méthode de cartographie par télédétection haute résolution et modélisation & été développée pour connaître la distribution des LTMs sur le littoral continental méditerranéen français. En parallèle, une campagne de terrain a été menée pour collecter des données hydrologiques, pédologiques et inventorier les macrophytes sur 130 lagunes représentatives durant l’année hydrologique 2019-2020. L’exploitation de ce jeu de données permettra de comprendre l’écologie des espèces ﬂoristiques caractéristiques des LTMs. Les connaissances scientiﬁques acquises au cours de cette étude permettront ainsi d’identiﬁer des leviers efﬁcients pour assurer une conservation et une gestion concertée des LTMS.

Résistance à l'invasion de communautés végétales établies après une perturbation - Rôle de la dynamique de colonisation et des effets de priorité (2020)

Thu, 12 Nov 2020 11:41:38

de Manon C.M. Hess
Avignon : Université d'Avignon, 2020, 222
En ligne : tel.archives-ouvertes.fr[...]

Les plantes invasives posent d’importants problèmes environnementaux et de santé publique, et leur contrôle est aujourd’hui un défi majeur. Elles rencontrent des conditions particulièrement favorables après des perturbations conduisant à une suppression du couvert végétal et une remobilisation des ressources disponibles. La mise en place d’un couvert végétal séquestrant rapidement ces ressources parait alors une réponse probante pour réduire l’invasion. Néanmoins, les caractéristiques des communautés nécessaires pour exercer une résistance efficace, notamment dans les premières phases d’installation, sont encore peu connues. Dans cette thèse, je me suis intéressée à deux mécanismes qui pourraient influencer la résistance à l’invasion des communautés végétales herbacées lors des premiers stades d’installation après une perturbation majeure, que sont (1) la ‘limiting similarity’, impliquant que la coexistence d’espèces partageant la même niche écologique est limitée par l’exclusion compétitive, et (2) les effets de priorité, qui surviennent lorsque l’installation d’une espèce affecte la performance ou la survie d’une espèce arrivant par la suite. L’examen de la littérature confirme que l’application de la ‘limiting similarity’ pour lutter contre les plantes invasives est complexe et n’a, jusqu’à aujourd’hui, fait preuve d’efficacité. Elle apparait inadaptée aux situations les plus communes. Intégrer les effets de priorité aux méthodes de contrôle des plantes invasives après une perturbation semble d’avantage prometteur. Une des stratégies consiste en la mise en place d’un couvert végétal exerçant de forts effets de priorité négatifs, diminuant le succès d’installation des plantes invasives. Deux expérimentations en serre ont été réalisées à cet effet. Elles visent à jouer sur les effets de priorité de la communauté native receveuse composée d’espèces classiquement utilisées en revégétalisation, afin d’en comprendre l’implication dans la résistance à l’invasion. Dans une première expérimentation, le temps d’avance de la communauté receveuse sur l’arrivée de trois espèces invasives (i.e. Ambrosia artemisiifolia, Bothriochloa barbinodis et Cortaderia selloana), la composition en espèces et la densité des semis ont été manipulés. Une meilleure résistance à l’invasion a été observée lorsque les communautés produisent une forte biomasse aérienne, cette dernière étant associée à la présence d’espèces productives. Retarder l’arrivée des espèces invasives a également réduit le succès d’invasion, mais ceci uniquement lorsque la production de biomasse était suffisamment importante. Une seconde expérimentation a porté sur l’influence de l’identité de la première espèce installée (deux poacées : Dactylis glomerata ou Lolium perenne et deux fabacées : Onobrychis viciifolia ou Trifolium repens) dans la communauté receveuse ainsi que l’ordre de semis des espèces (semis simultané de la communauté ou séquentiel) sur la structuration de la communauté et les conséquences sur sa résistance à l’invasion par A. artemisiifolia. Des différences minimes dans la dynamique de colonisation de la communauté receveuse a substantiellement affecté sa structure, sa production de biomasse, la concentration du sol en nutriments, ainsi que sa résistance précoce à l’invasion. Le semis séquentiel a généralement diminué la résistance à l’invasion par rapport au semis simultané de l’ensemble de la communauté. Les espèces installées en premier ont généré des effets de priorité d’intensité variable, vraisemblablement par le biais de la compétition racinaire, impactant le succès d’invasion par A. artemisiifolia. L’introduction précoce de la fabacée fixatrice d’azote T. repens a particulièrement stimulé la performance de A. artemisiifolia. En conclusion, tandis que l’application de la ‘limiting similarity’ se révèle être incompatible avec la conception de communautés résistantes à l’invasion précoce, manipuler la dynamique de colonisation et les effets de priorité semble d’avantage prometteur. La dynamique de colonisation a considérablement influencé le succès d'invasion en induisant, chez la communauté receveuse, des différences de production de biomasse et de préemption des ressources. Les effets de priorité des communautés récemment établies et la résistance à l'invasion associée pourraient être améliorés en (1) maximisant le temps d’avance à la communauté receveuse par rapport aux espèces invasives, (2) introduisant des espèces capables de produire rapidement de la biomasse et de préempter les ressources du sol, et (3) évitant le semis séquentiel, en particulier lorsque les premières espèces installées sont des espèces productives fixatrices d'azote. /

Invasive plant species cause serious environmental and sanitary issues and their control is today a major challenge. Disturbances involving vegetation removal and an increase in resource availability offer particularly favorable conditions for invasive plant colonization. Establishing a plant cover rapidly sequestering resources could be a relevant strategy to limit invasion. However, little is known about the characteristics enabling newly established communities to exert strong invasion resistance, especially in the early growth stages. In this thesis, I focused on two potential determinants of invasion resistance of herbaceous plant communities in the early growth stages after a major disturbance, which are (1) the concept of limiting similarity, stating that the coexistence of species sharing the same ecological niche is limited by competitive exclusion, and (2) priority effects, which occur when the establishment of a species affects the performance or survival of later arriving species. The application of limiting similarity to control invasive plants appears complex, ineffective and unsuitable for the most common situations. In contrast, integrating priority effects into invasive plant management strategies seems more promising. One strategy consists in restoring a plant cover exerting strong negative priority effects, decreasing the success of subsequent invasive plant establishment. In two greenhouse experiments, I explored the role of priority effects in early invasion resistance. In a first experiment, I manipulated species composition, sowing density and the elapsed time between community sowing and invasion by Ambrosia artemisiifolia, Bothriochloa barbinodis and Cortaderia selloana. A higher invasion resistance was observed when communities produced a high aboveground biomass, which was associated with the presence of productive species. Delaying invasive species arrival also decreased invasion success, but only if it allowed a sufficient increase in biomass production. A second experiment investigated how the identity of the first native colonizer (one of two grasses: Dactylis glomerata and Lolium perenne, or one of two legumes: Onobrychis viciifolia and Trifolium repens) and the timing of species establishment (synchronous vs. sequential sowing) influenced the structuration of the recipient community and its resistance to invasion by A. artemisiifolia. Small differences in assembly history of the recipient community substantially affected community structure, biomass production, soil nutrient content, as well as early invasion resistance. Sequential sowing generally decreased invasion resistance compared with a synchronous sowing. Early colonizers generated priority effects of variable strength most likely via belowground competition, which affected A. artemisiifolia’s invasion success. A prior establishment of the N-fixing legume T. repens particularly boosted A. artemisiifolia’s performance. In conclusions, this thesis work highlights the inadequacy of revegetation strategies based on limiting similarity and reveals promising perspectives of manipulating assembly history and priority effects for designing invasion resistant communities. Assembly history significantly influenced early invasion success by inducing differences in biomass production and resource preemption by the recipient community. Priority effects of newly established communities and associated invasion resistance could be enhanced by (1) giving as much time advance as possible to the recipient community over invasives, (2) introducing species displaying an ability to rapidly produce biomass and preempt soil resources, or (3) avoiding sequential sowing especially when early colonizers are nitrogen-fixing, productive species.

Chapter 3: Biodiversity and ecosystem services (2020)

Fri, 23 Oct 2020 12:43:31

de Daniel Cebrian, Nelly Bourlion, Dania Abdul Malak, Katia Aikas, Elisa Alcázar, Julie Belmont, Florence Descroix-Comanducciv, Maria Mar, Kelly Fouchy, Elie Gaget, et al.
Marseille; France : Plan Bleu Regional Activity Centre, 2020, 83–118
En ligne : planbleu.org[...]

Mediterranean Coastal and marine ecosystems have a high level of biodiversity and endemism. The Mediterranean Sea is considered a biodiversity hotspot, representing just 0.3% of the global ocean volume while hosting 7% of identified global marine species, with the highest rate of endemism (20-30%) of marine species in the world. Driven by human activities in recent decades, Mediterrane- an biodiversity has experienced increasing human-induced pressures such as pollution, the overexploitation of biological resources, land-use change and coastal infrastructure development, changes in fluvial dynamics, increasing sea use and climate change effects. These pressures have reduced the extent of wild areas and natural ecosystems on land and at sea, and have altered the ecosystems’ capacity to provide ecosystem services that are vital to humans. Around 11% of marine species and 14% of coast- al terrestrial species are threatened with extinction, most of which are endemic. Non-indigenous species are increasingly present in the Mediterranean Sea, with a total of more than 1,000 non-indigenous marine species record- ed, of which more than 100 are invasive. United Nations Environment Programme/Mediterranean Action Plan (UNEP/MAP) has made biodiversity one of the main pillars of its Ecosystem Approach, with the aim of achieving Good Environmental Status (GES) of the Mediterranean Sea and supporting the development of effective action to safeguard and restore biodiversity. Such action must be undertaken urgently to avoid irreversible losses in terms of ecosystem services and biodiversity. One measure that has been proven effective, if implemented correctly, consists in setting up Marine Protected Areas (MPAs). MPA coverage has increased throughout the past decade, and is close to the 10% coverage set as a 2020 objective in the Aichi Targets. However, management effectiveness and enforcement remain challenging.

Paramètres influençant la répartition des anatidés et de la Foulque macroule hivernant sur la réserve naturelle nationale de Camargue (2020)

Thu, 15 Oct 2020 16:45:59

de Nicolas Malevre
2020, 68

La Réserve naturelle nationale de Camargue se situe en plein cœur du delta du Rhône. Elle est gérée par la Société nationale de protection de la nature dont l’un des objectifs est de conserver de nombreuses espèces patrimoniales et de leurs habitats associés. L’accueil de onze espèces d’Anatidés et de la Foulque macroule chaque hiver constituent des enjeux forts pour le gestionnaire. Bien que l’écologie de ces espèces soit très documentée, les connaissances sur les facteurs influençant la répartition de leurs populations au sein de la zone d’étude restent limitées. Cette étude analyse les variations d’effectif de ces douze espèces regroupées en guilde d’après leurs habitudes alimentaires. Le jeu de donnée repose sur 30 années de dénombrement aérien d’oiseaux d’eau, des relevés de niveaux d’eau et de salinité collectés in-situ et de variables issue de la télédétection. L’utilisation de modèles linéaires généralisés mixtes permet de tester les variations d’effectif à l’échelle d’un site selon 5 facteurs : le niveau d’eau, la salinité, la superficie en eau, la date de mise en eau et les surfaces de gagnages potentiels accessibles depuis ce site. Les résultats montrent une sensibilité des populations étudiées au fonctionnement hydraulique de la zone d’étude avec des différences voir des divergences entre les réponses de chaque guilde. Bien que difficile à mettre en place, les solutions pour offrir des conditions favorables à ces populations d’oiseaux passe par la gestion hydraulique de la Réserve naturelle. Elle serait toutefois à mettre en place au regard des autres enjeux de la zone d’étude. Enfin, cette étude a mis en évidence certains biais inhérents au jeu de données qu’il sera nécessaire de corriger pour analyser la dynamique spatiale et temporelle des Anatidés et de la Foulque macroule à l’échelle de la Camargue complète.

Dynamique de la végétation des Etangs et Marais des Salins de Camargue (2020)

Thu, 15 Oct 2020 15:37:33

de Brigitte Poulin, Julie Campagna, Loic Willm, Patrick Grillas
Arles : Tour du Valat, 2020, 43

Le site des Etangs et Marais des Salins de Camargue fait partie des derniers territoires gagnés sur la mer lors de la formation géomorphologique du delta. Dans la partie sud, et notamment dans le secteur de la pointe de Beauduc qui est en accrétion, la dynamique de la végétation est principalement liée à la formation de dunes et leur recouvrement graduel par la végétation. L’analyse d’anciennes photographies aériennes montre que les massifs dunaires correspondent en fait à des lignes de rivage antérieures. La dérive sédimentaire entraînant leur formation, puis leur végétalisation jusqu’au stade de dune grise peut être observée sur une période aussi courte que 80 ans. Sur le reste du site, et notamment dans la partie nord, la dynamique de la végétation résulte de la restauration d’un calendrier d’inondation conforme au climat méditerranéen. Ainsi, depuis l’arrêt de l’exploitation salicole, les casiers qui sont dorénavant inondés principalement par les pluies sont rapidement recolonisés par la végétation halophile de type salicornaie. Les délais de colonisation après la restauration des cycles naturels et de quelques mois à deux ans pour la salicornes annuelles et de trois à cinq ans pour la salicore pérennne.

Projet MediCyn - vers une gestion hydraulique durable conciliant biodiversité méditerranéenne et usages cynégétiques et pastoraux (2020)

Thu, 1 Oct 2020 11:37:43

de Philippe Lambret, Lisa Ernoul, Hugo Fontes, Anis Guelmami
Arles : Tour du Valat, 2020, 22 + annexes

Le projet MediCyn, porté par le Grand port maritime de Marseille (GPMM) et monté en partenariat avec la Tour du Valat (TdV), vise à améliorer l’état de conservation et la valeur écologique de deux sites d’un des secteurs « à enjeux » du Plan Rhône- Saône 2015-2020 : Le Grand clos et le Relai, tous deux en zone Natura 2000 et au sein de la couronne agri-environnementale du GPMM.
Trois modes de gestion hydraulique seront testés, avec les modes 1 et 2 visant à contrôler si les effets du mode 3 sont ceux attendus :
▪ mode 1 – gestion actuelle « type marais de chasse traditionnel » avec une mise en eau en juillet et un maintien du niveau d'eau jusque novembre par pompage, puis assèchement naturel dont la période dépend des précipitations ;
▪ mode 2 – gestion type « marais temporaire méditerranéen », avec une mise en eau naturelle (les précipitations ont lieu essentiellement à l’automne) et éventuellement par pompage en décembre afin d’éviter les conditions d'une année particulièrement défavorable (faible probabilité), et veille au maintien du niveau d'eau jusque début mai (éventuellement par pompage), puis assèchement naturel ;
▪ mode 3 – gestion intermédiaire : mise en eau début octobre et maintien du niveau d'eau par pompage jusque fin avril, puis assèchement naturel. L'hypothèse générale est que cette gestion innovante (mode 3) favorise la conservation de la nature et la valeur pastorale des milieux sans modifier de façon significative leur intérêt cynégétique. Pour ce faire, la réalisation de travaux de réfection du réseau hydraulique et des aménagements a été programmée sur le Grand clos et le Relai. Ceux-ci permettront la mise en place de l’expérimentation décrite ci-dessus dont les effets seront mesurés à travers différents suivis. Ces suivis concerneront des paramètres de milieux (niveaux d’eau, conductivités, gestion hydraulique, niveaux trophiques abiotiques), les activités cynégétique et pastorale (tableaux de chasse, calendrier et pression de pâturage, végétation fourragère, satisfaction des usagers des sites i.e. chasseurs et manadiers), des compartiments de la biodiversité (plantes émergées et immergées, macro-arthropodes dont les libellules, oiseaux d’eau chassables

Rapport de l'étude : Modélisation de scénarios de gestion prospectifs du Vaccarès (2020)

Thu, 24 Sep 2020 13:50:12

de Olivier Boutron
Arles : Tour du Valat, 2020, 29

Suivi démographique à long terme d’une population de Cistude d’Europe (Emys orbicularis) en Camargue (2020)

Fri, 18 Sep 2020 12:35:16

de Louis Spinner
2020, 45

La Cistude d’Europe (Emys orbicularis) est une tortue d’eau douce menacée de disparition, présente principalement en Europe, elle figure parmi les espèces de reptiles les plus menacées du continent. Son aire de répartition s’est fortement réduite depuis des dizaines d’années, depuis 1979 elle est intégralement protégée en France. Le suivi à long terme des populations de cet animale, par Capture Marquage Recapture (CMR), permet d’étudier leur évolution démographique (sex-ratio, âge- ratio, taux de survie, dispersion). Mais cela permet aussi de mieux connaître le mode de vie de cette tortue, afin de mettre en place une protection efficace grâce à une gestion adaptée Pour cette étude, deux sites de capture sont échantillonné sur la Réserve Naturelle Régionale de la Tour du Valat, le site de l’Esquineau et celui des Faïsses. Dans ce rapport est développé la 24 ème session annuelle du suivi, avec les données, les résultats et les analyses récupérés lors de cette année 2020

La médiation comme outil pour appréhender les conflits : élaboration d’une stratégie de communication pour le site des étangs et marais des salins de Camargue (2020)

Thu, 10 Sep 2020 17:25:36

de Lucie Pichot
[S.l.] : Université d'Aix-Marseille, 2020, 83

Plus vaste zone humide de France, la Camargue est sujette à des pressions humaines considérables. Ce territoire, sous l’influence de l’eau, est en constante évolution. Les zones humides sont devenues des espaces à enjeux et des espaces sources de conflits entre acteurs, pour la maitrise de leur accès et de leur gestion. Ce sont notamment, ces conflits d’usage qui semblent être à l’origine des tensions sociales et qui ont produit le paysage actuel de la Camargue. Le site des EMSC (Etangs et Marais des Salins de Camargue), est un bon exemple pour se rendre compte de la complexité de la gestion d’un espace naturel où les usages sont multiples. Valoriser et faire comprendre les enjeux et les mesures de gestion mises en œuvre sur le site aux acteurs locaux sont des actions primordiales pour appréhender les conflits. Construire un plan stratégique de communication dont l’objectif est de favoriser les échanges entre les acteurs est un processus de médiation complexe. La médiation n’a pas pour objet de résoudre les conflits, mais d’accompagner les différents acteurs impliqués localement à se concerter et à construire ensemble. La place du médiateur en territoire conflictuel se doit d’être modelable et réfléchie tout au long de ce processus de concertation. La Camargue étant un territoire changeant, la médiation se doit d’appréhender les origines des conflits afin d’atténuer les tensions entre les Hommes et entre l’Homme et son environnement.

Modélisation démographique et mouvements des Goélands leucophées de Camargue (2020)

Fri, 4 Sep 2020 12:01:04

de Charly Souc
2020, 46

Le Goéland leucophée (Larus michahellis) est une espèce commune sur la côte méditerranéenne, bien adapté à la présence de l'Homme, et qui peut être porteuse de toute une série d'agents infectieux, dont certains préoccupants pour la santé publique. La compréhension de ces mouvements peut fournir des informations essentielles pour prévoir le risque d’infection et l'émergence des maladies. Cette étude vise à caractériser les mouvements de cette espèce en utilisant un modèle capture-marquage-recapture multi-états. Les données comprennent les histoires de capture de 396 poussins marqués à l'envol en 2002 et 2003 dans une colonie de Camargue. Nos résultats confirment que les jeunes individus ont une probabilité de survie plus faible que les oiseaux plus âgés, mais aussi que ces jeunes ont une plus grande mobilité, avec un déplacement estimé à 45 % de la colonie natale vers des lieux éloignés en Méditerranée ou le long de la côte atlantique, contre environ 20 % chez les oiseaux plus âgés. Ces déplacements peuvent homogénéiser les agents infectieux chez cette espèce sur de grandes échelles spatiales. Afin de disposer d'informations plus détaillées sur les tendances temporelles et spatiales des mouvements et sur la manière dont ils peuvent impacter la transmission des agents infectieux, des données supplémentaires provenant d'autres colonies sont désormais nécessaires. /
The yellow-legged gull (Larus michahellis) is a common seabird species around the Mediterranean coast, well adapted to exploit human-associated resources. As this species can carry a range of infectious agents, some of specific public health concern, understanding its movement ecology can provide essential information for predicting disease risk and pathogen emergence. This study aims to characterize movement in this species using a multi-state mark- recapture modeling framework. The data include the encounter-histories of 396 chicks marked at fledging in 2002 and 2003 at a colony in the Camargue, south of France, and resighted for 10 years. Our results confirm that young individuals have a lower survival probability than older birds, but also that these young birds have greater mobility, with an estimated 45% moving from the natal colony to distant locations in the Mediterranean or along the Atlantic coast compared to ~20% in older birds. This long-range movement may homogenize infectious agents in this species across large spatial scales. In order to have more detailed information on general temporal and spatial trends in movement, and how these patterns may impact pathogen transmission, additional data from other colonies is now required.

Comment évaluer concrètement le succès de restauration des mares temporaires méditerranéennes en prenant en compte la variabilité spatio- temporelle des écosystèmes et leurs trajectoires potentielles sous l’influence des changements globaux ? (2020)

Thu, 3 Sep 2020 11:04:32

de Christian Marquis
2020, 93

Le but de cette étude est de construire une méthode pour évaluer le succès de la restauration/création des écosystèmes en prenant en compte leur variabilité spatio-temporelle et leurs trajectoires potentielles sous l’influence des changements globaux. Nos modèles biologiques sont les écosystèmes aquatiques temporaires méditerranéens doux à saumâtres en Camargue (sud de la France). Nous avons étudié 27 mares temporaires préservées de l’anthropisation. Ces 27 mares constituent une gamme d’écosystèmes de référence. Dans le même temps, nous avons étudié 29 mares artificielles creusées au XIXe, XXe et XXIe siècles. Un ensemble de relevés de terrain floristiques et mésologiques ont été réalisés, afin d’explorer la variabilité des mares de référence et des mares artificielles. L’échantillonnage a été mené au cours de différentes saisons et sur deux années, afin de prendre en compte aussi bien la variabilité interannuelle qu’intra-annuelle. Des analyses statistiques multivariées nous ont permis de classer les mares du panel de référence, en fonction de leurs communautés végétales, au sein d’une typologie intégrant leur variabilité. La distance entre chaque mare artificielle et le panel de référence a été évaluée par deux indices représentant respectivement le recouvrement végétal et la composition spécifique. Ces deux indices ont été synthétisés par un indicateur unique : le « coefficient d’éloignement ». L’interprétation de la valeur de ce coefficient a permis de répondre à la question de l’impact de l’âge de la création de la mare artificielle sur sa distance à la gamme de référence. Enfin, nous avons étudié les facteurs environnementaux conditionnant le plus ou moins grand éloignement d’une mare artificielle par rapport à la gamme de référence.

Politiques du flamant rose. Vers une écologie du sauvage (2020)

Fri, 24 Jul 2020 11:52:54

de Raphael Mathevet, Arnaud Béchet
Marseille : Wildproject Editions, 2020, 137 (Le monde qui vient)

A partir d'une réflexion historique, écologique et politique sur l'une des plus vastes et emblématiques zones humides d'Europe, cet ouvrage propose une nouvelle vision pour la protection de la nature. Le réensauvagement des territoires s'impose à la fois comme un constat et comme un projet. "Il s'agit d'un problème de géographie politique : comment la mobilité animale rebat les cartes de l'aménagement du territoire.
Le sauvage sort des zones où l'on pensait depuis longtemps l'avoir confiné, s'immisce dans le territoire des humains, y provoquant des désagréments divers qui révèlent des conflits de souveraineté. " Le flamant rose nichait régulièrement dans le sud de la France, en Camargue, jusqu'aux années 1960. Après de nombreux efforts de surveillance, de comptage, de baguage, de création de site de reproduction, de gestion de l'eau, de communication, l'espèce se reproduit à nouveau et a retrouvé des effectifs importants : elle n'est plus menacée.
Mais un îlot créé à la pelle mécanique, surveillé de près par scientifiques et gardiens, dans un bassin de pré-concentration tiré au cordeau d'une exploitation industrielle du sel de mer, ce n'est pas vraiment ce que la plupart d'entre nous considérons comme la nature. L'histoire du sauvetage du flamant rose révèle un vaste réseau d'acteurs qui participent à la protection de la nature, en particulier dans le cadre du plus grand projet de restauration écologique d'Europe.
Dans l'ombre de ce succès, se dissimulent de nombreuses questions sur l'état de la nature et des relations que nous entretenons avec elle. Politiques du flamant rose raconte, au plus près du terrain, les histoires, les conflits et les alliances d'un territoire, et invite à penser le territoire des autres et les conditions de la coexistence avec les autres-qu'humains. Un ouvrage destiné à tous les publics.

Modélisation sous Telemac-2D de la dispersion de bactéries antibiorésistantes au sein d'un réseau hydrographique en Camargue (2020)

Wed, 15 Jul 2020 17:31:17

de Florian Ferchiche
2020, 53

L’antibiorésistance est un des problèmes majeurs de santé publique à gérer dans les prochaines décennies. L’objectif de ce stage a été d’étudier la dispersion de ces bactéries particulières dans un compartiment complexe qu’est l’eau au travers du milieu hydrographique camarguais. L’établissement d’un modèle hydraulique sous Telemac-2D et BlueKenue a été nécessaire pour cela. La dispersion a été modélisée sur des données environnementales réelles récupérées à l’aide d’une campagne de jaugeage pour les débits et d’une campagne d’échantillonnage microbiologique. Les bactéries ont été cultivées sur des milieux sélectifs comportant des antibiotiques. Les simulations ont été lancées selon l’hypothèse de la station d’épuration en tant que source avec différents indices d’abattement des bactéries. Les résultats ont montré que le pouvoir de dispersion était relativement faible sur un milieu hydrographique présentant un régime de débits particulier (flux et reflux). Les pousses de colonies de bactéries ont été importantes, présentes sur tous les sites et diversifiées. Cette étude a permis de mettre en lumière qu’il existait une grande variété de BAR sur le domaine d’étude, mais là, ou les, sources de ces bactéries n’ont pu être précisément identifiées. L’utilisation de données ponctuelles de jaugeages s’est avérée compliquée au vu du régime très particulier des canaux changeant selon les conditions de vent. Au final, il a été possible de simuler la dispersion de BAR, mais le modèle pourra être renforcé par la mesure en continu des hauteurs d’eau en différents points via des sondes CTD et par des analyses microbiologiques plus avancées.

Comparaison de deux méthodes d’estimation du succès reproducteur et évaluation des conditions météorologiques sur la reproduction d’Ibis falcinelle, de Hérons garde-boeufs et d’Aigrettes garzette en Camargue (2020)

Fri, 12 Jun 2020 17:35:15

de Justine Costa
Rennes : Université de Rennes, 2020, 22

L’estimation du succès reproducteur chez les oiseaux est important pour comprendre quels facteurs peuvent influencer la dynamique des populations. Cette étude s’intéresse à la reproduction d’Aigrettes garzettes (Egretta garzetta), d’Ibis falcinelle (Plegadis falcinellus) et de Hérons garde-boeufs (Bubulcus ibis) nicheurs dans une colonie mixte en Camargue. Dans un premier temps, deux méthodes d’estimation du succès reproducteur des Ibis sont comparées sur quatre saisons de reproduction. L’une à partir du nombre de jeunes par nid au cours d’une visite dans la colonie, et l’autre à partir d’un échantillon de nids suivis à plusieurs reprises dans la colonie. Dans un second temps, l’impact du vent et de la pluie sur le taux de survie des nids est évalué pour les trois espèces nicheuses. La comparaison des deux méthodes donnent des résultats très corrélés, mais avec une incertitude élevée à cause du faible nombre d’années de suivi et de la forte variabilité intraannuelle. Ensuite, le vent a un effet positif sur le taux de survie des nids, probablement car en Camargue, le mistral (vent fort local) est accompagné d’un temps plutôt sec et ensoleillé. En revanche, la pluie a un effet négatif sur la survie des nids des trois espèces confondues, mais positif sur les nids d’Ibis falcinelle seuls. Ces résultats s’expliquent par le fait que la pluie induit une perte d’énergie et une diminution de la température corporelle des poussins, mais qu’elle augmente la surface de nourrissage dans les marais, principaux lieux de nourrissage des Ibis et des Aigrettes garzettes en Camargue. Le Héron garde-boeuf est lui, moins dépendant des marais d’eau douce pour la recherche de nourriture, et ne tire pas autant les bénéfices de l’augmentation des niveaux d’eau.

Etude de la connectivité hydrobiologique entre le milieu marin et le complexe lagunaire du Vaccarès via les étangs et les marais des salins de Camargue, suivis ichtyologiques d’octobre 2016 à mai 2019 (2020)

Mon, 20 Apr 2020 19:02:58

de Delphine Nicolas, Pascal Contournet, Samuel Hilaire, Emilie Luna-Laurent, Florian Leborne, Maude Parent, Olivier Boutron, Brigitte Poulin, Marc Thibault
Arles : Tour du Valat, 2020, 99
En ligne : 85.31.222.100[...]

Les étangs et marais des salins de Camargue (EMSC), acquis par le Conservatoire du Littoral entre 2008 et 2012, constituent une nouvelle voie de migration potentielle pour la faune aquatique entre la mer et l’hydrosystème du Vaccarès. Pendant 3 années consécutives, d’octobre 2016 à mai 2019, la Tour du Valat a conduit un suivi ichtyologique mensuel, d’octobre à juin, en différents points du site, afin d’évaluer le degré de connexion de cette nouvelle voie de migration. En parallèle, l’évolution des conditions hydrologiques et physico-chimiques ont été suivies grâce à un réseau d’enregistreurs continus et de relèves manuelles maintenu par les 3 co-gestionnaires du site : le Parc naturel régional de Camargue, la Société nationale de protection de la nature et la Tour du Valat.

Do Dialytrichia mucronata and D. saxicola share the same ecological preferences? A case study in the Rhône Valley (France) and possible application for river incision biomonitoring.

Wed, 4 Nov 2020 13:42:01

In Cryptogamie, Bryologie, 40(13) (2019), 141-152
En ligne : sciencepress.mnhn.fr[...]

Anthropization has led to severe river incision in several parts of Europe. Biomonitoring is of interest to characterize this incision or, conversely, the effectiveness of ecological restoration. Mosses of the upper flood zone are good candidates for such biomonitoring as they are small organisms with limited water-intake ability. Here we studied the Dialytrichia mucronata (Brid.) Broth. - D. saxicola (Lamy) M.J. Cano species pair, both mostly encountered in the upper flood zone; the latter was hypothesized to be more resistant to water stress. We analysed 179 bryosociological relevés in the French Rhône River watershed, distributed along a wide ecological interval. We performed Pearson’s Chi-square test to determine whether the latitude, altitude, substrate, and phorophyte had an effect on Dialytrichia (Schimp.) Limpr. species distribution. Assemblages between D. mucronata and D. saxicola and other moss species were tested using a multivariate procedure. Also we compiled a preliminary French departmental scale distribution map for both species. The results showed that the two species differ ecologically and might be more stenoecious than suggested by their wide synecological spectrum. Eighty-three bryophyte species were documented to be associated with the studied species of Dialytrichia. The cumulative projected inertia for the first three axes of the factorial correspondence analysis was only 23.26%, with no clear structuration. It is concluded that neither the relative occurrence of D mucronata and D. saxicola, nor the communities with these species can be used to monitor incision driven changes in vegetation.

The Settlement of Glossy Ibis in France

Fri, 29 Nov 2019 16:04:13

de Jocelyn Champagnon, Yves Kayser, Jérémiah Petit, Loïc Marion, Sebastien Reeber, Thomas Blanchon, Samuel Hilaire, Irene Badone, Pierre Crouzier, Regis Purenne, et al.
In SIS Conservation, 1 (December, 2019), 50-55
En ligne : storkibisspoonbill.org[...]

The Glossy Ibis Plegadis falcinellus was very rarely breeding in France until its settlement in Camargue in 2006, in a colony of ardeids. From then, the number of breeding pairs increased exponentially to reach 2,087 breeding pairs in 2017 distributed over ten colonies mainly in Camargue but also in others sites over the French Mediterranean coast. In parallel, breeding attempts occurred regularly in other regions, with some successes in Loire Atlantic on the Atlantic coast. Here we present some preliminary results on the ringing programme of chicks conducted in Camargue since 2006 and on the diet of the breeding birds. Finally, we discuss factors that influence the settlement of new colonies.

Les étangs de Provence sous surveillance

Tue, 3 Dec 2019 10:27:21

de Guillaume Marchessaux
In Courrier de la Nature (Le), 319 (Nov-dec 2019)

Estimating biodiversity changes in the Camargue wetlands: An expert knowledge approach

Mon, 28 Oct 2019 11:50:23

de Sara Fraixedas, Thomas Galewski, Sofia Ribeiro-Lopes, Jonathan Loh, Jacques Blondel, Hugo Fontes, Patrick Grillas, Philippe Lambret, Delphine Nicolas, Anthony Olivier, et al.
In PLOS ONE, 14(10) (24 oct. 2019), e0224235
En ligne : journals.plos.org[...]

Mediterranean wetlands are critical strongholds for biodiversity and the provision of ecosystem functions and services; yet, they are being severely degraded by a number of socio-economic drivers and pressures, including climate change. Moreover, we still lack comprehensive understanding of the extent to which biodiversity loss in Mediterranean wetlands will accelerate change in ecosystem processes. Here, we evaluate how changes in biodiversity can alter the ecosystem of the Camargue (southern France). We collected data on species presence/absence, trends and abundance over a 40-year period by combining observations from the scholarly literature with insights derived from expert knowledge. In total, we gathered more than 1500 estimates of presence/absence, over 1400 estimates of species abundance, and about 1400 estimates of species trends for eight taxonomic groups, i.e. amphibians, reptiles, breeding birds, fish, mammals, dragonflies (odonates), orthopterans and vascular plants. Furthermore, we used information on recently arrived species and invasive species to identify compositional changes across multiple taxa. Complementing targeted literature searches with expert knowledge allowed filling important gaps regarding the status and trends of biodiversity in the Camargue. Species trend data revealed sharp population declines in amphibians, odonates and orthopterans, while birds and plants experienced an average increase in abundance between the 1970s and the 2010s. The general increasing trends of novel and invasive species is suggested as an explanation for the changing abundance of birds and plants. While the observed declines in certain taxa reflect the relative failure of the protection measures established in the Camargue, the increasing exposure to novel and invasive species reveal major changes in the community structure of the different taxonomic groups. This study is the first attempt to assess changes in biodiversity in the Camargue using an expert knowledge approach, and can help manage the uncertainties and complexities associated with rapid social-ecological change in other Mediterranean wetlands.

Effects of research disturbance on nest survival in a mixed colony of waterbirds

Fri, 18 Oct 2019 14:11:25

de Jocelyn Champagnon, Hugo Carré, Lisa Gili
In PeerJ, 7 (October, 2019), e7844
En ligne : peerj.com[...]

Background Long-term research is crucial for the conservation and development of knowledge in ecology; however, it is essential to quantify and minimize any negative effects associated with research to gather reliable and representative long-term monitoring data. In colonial bird species, chicks are often marked with coded bands in order to assess demographic parameters of the population. Banding chicks in multi-species colonies is challenging because it involves disturbances to species that are at different stages of progress in their reproduction. Methods We took advantage of a long term banding program launched on Glossy Ibis (Plegadis falcinellus) breeding in a major mixed colony of herons in Camargue, southern France, to assess the effect of banding operation disturbance on the reproductive success of the three most numerous waterbirds species in the colony. Over two breeding seasons (2015 and 2016), 336 nests of Glossy Ibis, Little Egrets (Egretta garzetta) and Cattle Egrets (Bubulcus ibis) were monitored from a floating blind in two zones of the colony: one zone disturbed twice a year by the banding activities and another not disturbed (control zone). We applied a logistic-exposure analysis method to estimate the daily survival rate (DSR) of nests and chicks aged up to three weeks. Results Daily survival rate of Glossy Ibis was reduced in the disturbed zone while DSR increased for Little and Cattle Egrets in the disturbed zone. Nevertheless, DSR was not reduced on the week following the banding, thus discarding a direct effect of handling on breeding success of Glossy Ibis. The protocol and statistical analysis presented here are robust and can be applied to any bird species to test for the effect of a research disturbance or other short and repeated temporal events that may affect reproductive success over one or more breeding seasons.

Automatic Inundation Mapping Using Sentinel-2 Data Applicable to Both Camargue and Doñana Biosphere Reserves

Thu, 8 Oct 2020 11:52:17

de Georgios A. Kordelas, Ioannis Manakos, Gaëtan Lefebvre, Brigitte Poulin
In Remote Sensing, 11(19) (Septembre, 2019), 2251
En ligne : www.mdpi.com[...]

Flooding periodicity is crucial for biomass production and ecosystem functions in wetland areas. Local monitoring networks may be enriched by spaceborne derived products with a temporal resolution of a few days. Unsupervised computer vision techniques are preferred, since human interference and the use of training data may be kept to a minimum. Recently, a novel automatic local thresholding unsupervised methodology for separating inundated areas from non-inundated ones led to successful results for the Doñana Biosphere Reserve. This study examines the applicability of this approach to Camarque Biosphere Reserve, and proposes alternatives to the original approach to enhance accuracy and applicability for both Camargue and Doñana wetlands in a scientific quest for methods that may serve accurately biomes at both protected areas. In particular, it examines alternative inputs for automatically estimating thresholds while applying various algorithms for estimating the splitting thresholds. Reference maps for Camargue are provided by local authorities, and generated using Sentinel-2 Band 8A (NIR) and Band 12 (SWIR-2). The alternative approaches examined led to high inundation mapping accuracy. In particular, for the Camargue study area and 39 different dates, the alternative approach with the highest overall Kappa coefficient is 0.84, while, for the Doñana Biosphere Reserve and Doñana marshland (a subset of Doñana Reserve) and 7 different dates, is 0.85 and 0.94, respectively. Moreover, there are alternative approaches with high overall Kappa for all areas, i.e., at 0.79 for Camargue, over 0.91 for Doñana marshland, and over 0.82 for Doñana Reserve. Additionally, this study identifies the alternative approaches that perform better when the study area is extensively covered by temporary flooded and emergent vegetation areas (i.e., Camargue Reserve and Doñana marshland) or when it contains a large percentage of dry areas (i.e., Doñana Reserve). The development of credible automatic thresholding techniques that can be applied to different wetlands could lead to a higher degree of automation for map production, while enhancing service utilization by non-trained personnel.

Introducing WIW for Detecting the Presence of Water in Wetlands with Landsat and Sentinel Satellites

Tue, 24 Sep 2019 11:36:54

de Gaëtan Lefebvre, Aurélie Davranche, Loic Willm, Julie Campagna, Lauren Redmond, Clément Merle, Anis Guelmami, Brigitte Poulin
In Remote Sensing, 11(19) (Septembre, 2019), 18
En ligne : www.mdpi.com[...]

Many wetlands are characterized by a vegetation cover of variable height and density over time. Tracking spatio-temporal changes in inundation patterns of these wetlands remains a challenge for remote sensing. Water In Wetlands (WIW) was predicted using a dichotomous partitioning of reflectance values encoded based on ground-truth (n = 4038) and optical-space derived (n = 7016) data covering all land cover types (n = 17) found in the Rhône delta, southern France. The models were developed with spectral data from Sentinel 2, Landsat 7, and Landsat 8 sensors, hence providing a monitoring tool that covers a 35-year period (same sensor for Landsat 5 and 7). A single model combining the near infrared (NIR ≤ 0.1558 to 0.1804, depending on sensors) and short-wave infrared (SWIR2 ≤ 0.0871 to 0.1131) wavelengths was identified by three independent analyses, each one using a different satellite. Overall accuracy of water maps ranged from 89% to 94% for the training samples and from 90% to 94% for the validation samples, encompassing standard water indices that systematically underestimate flooding duration under vegetation cover. Sentinel 2 provided the highest performance with a kappa coefficient of 0.82 for both samples. Such tool will be most useful for monitoring the water dynamics of seasonal wetlands, which are particularly sensitive to climate change while providing multiple services to humankind. Considering the high temporal resolution of Sentinel 2 (every 5 days), cumulative water maps built with the WIW logical rule could further be used for mapping a wide range of wetlands which are either periodically or permanently flooded.

Le Grand-duc d'Europe (Bubo bubo) prédateur du flamant rose (Phoenicopterus roseus) en Camargue (France) et indications sur le régime alimentaire

Fri, 20 Sep 2019 13:47:42

de Yves Kayser, Antoine Arnaud, Arnaud Béchet
In Nos Oiseaux, 66(3) (Septembre, 2019)

Increasing crop heterogeneity enhances multitrophic diversity across agricultural regions

Fri, 30 Aug 2019 17:01:17

de Clelia Sirami, Nicolas Gross, Aliette Bosem Baillod, Colette Bertrand, Romain Carrié, Annika Hass, Laura Henckel, Paul Miguet, Carole Vuillot, Audrey Alignier, et al.
In Proceedings of the National Academy of Sciences, 116(33) (2019-08-13), 16442-16447
En ligne : www.pnas.org[...]

Agricultural landscape homogenization has detrimental effects on biodiversity and key ecosystem services. Increasing agricultural landscape heterogeneity by increasing seminatural cover can help to mitigate biodiversity loss. However, the amount of seminatural cover is generally low and difficult to increase in many intensively managed agricultural landscapes. We hypothesized that increasing the heterogeneity of the crop mosaic itself (hereafter “crop heterogeneity”) can also have positive effects on biodiversity. In 8 contrasting regions of Europe and North America, we selected 435 landscapes along independent gradients of crop diversity and mean field size. Within each landscape, we selected 3 sampling sites in 1, 2, or 3 crop types. We sampled 7 taxa (plants, bees, butterflies, hoverflies, carabids, spiders, and birds) and calculated a synthetic index of multitrophic diversity at the landscape level. Increasing crop heterogeneity was more beneficial for multitrophic diversity than increasing seminatural cover. For instance, the effect of decreasing mean field size from 5 to 2.8 ha was as strong as the effect of increasing seminatural cover from 0.5 to 11%. Decreasing mean field size benefited multitrophic diversity even in the absence of seminatural vegetation between fields. Increasing the number of crop types sampled had a positive effect on landscape-level multitrophic diversity. However, the effect of increasing crop diversity in the landscape surrounding fields sampled depended on the amount of seminatural cover. Our study provides large-scale, multitrophic, cross-regional evidence that increasing crop heterogeneity can be an effective way to increase biodiversity in agricultural landscapes without taking land out of agricultural production. / Cet article est issu du projet Farmland (2011-2015) financé par Biodiversa et réalisé sur 7 sites Européens dont la Camargue. Cette étude s’appuie sur deux saisons intensives de terrain pour échantillonner les plantes, insectes et oiseaux sur les parcelles agricoles. Ces données, combinées à une numérisation précise du paysage sur SIG, ont permis de démontrer qu’il était possible d’augmenter la biodiversité et les services qu’elle rend aux agriculteurs (pollinisation, contrôle des ravageurs) en diversifiant le nombre de cultures et en réduisant la taille des parcelles, sans nécessairement diminuer la surface agricole utile.

Geographic origin of migratory birds based on stable isotope analysis: the case of the greylag goose (Anser anser) wintering in Camargue, southern France

Fri, 30 Aug 2019 17:01:46

de Matthieu Guillemain, Léo Bacon, Kevin J. Kardynal, Anthony Olivier, Michal Podhrázský, Petr Musil, Keith A. Hobson
In European Journal of Wildlife Research, 65(5) (August, 2019), 67
En ligne : doi.org[...]

Proper delineation of flyways is a prerequisite for adequate management of migratory birds. The implementation of coordinated international management for greylag goose (Anser anser) is currently underway in Europe for the north-west/south-west (NW/SW) population. Some uncertainty remained as to whether greylags wintering in Camargue, Southern France, belonged to this population and bred in Norway, Sweden and Finland, or rather originated from the Central European population, especially since most neck collar observations were of birds ringed in the Czech Republic. Stable hydrogen isotope (δ2H) analyses of feathers from 147 individuals hunted or trapped during winter in Camargue provide some insight into this question and suggest north-central Europe as a more likely area of origin. This indicates that greylags wintering along the Mediterranean coast may be largely separate from the birds of the NW/SW European population breeding in Fennoscandia, although some individuals may also come from the Polish or German regions of the NW/SW flyway, since the combined ringing and stable isotope analyses suggest these birds are mostly breeding and moulting in an isotopic area consistent with the Czech Republic, Poland and northern Germany. Earlier studies show birds wintering in other French regions rather originate from Sweden and Norway. These results should be considered for the management plan currently being developed for greylag goose in Europe. More generally, they question whether birds from two distinct populations/flyways should be applied similar or potentially different management plans within a given country.

Using social media, machine learning and natural language processing to map multiple recreational beneficiaries

Tue, 23 Jul 2019 10:22:28

de Arjan S. Gosal, Ilse R. Geijzendorffer, Tomáš Václavík, Brigitte Poulin, Guy Ziv
In Ecosystem Services, 38 (August, 2019), 100958
En ligne : linkinghub.elsevier.com[...]

Information and numbers on the use and appreciation of nature are valuable information for protected area (PA) managers. A promising direction is the utilisation of social media, such as the photo-sharing website Flickr. Here we demonstrate a novel approach, borrowing techniques from machine learning (image analysis), natural language processing (Latent Semantic Analysis (LSA)) and self-organising maps (SOM), to collect and interpret > 20,000 photos from the Camargue region in Southern France. From the perspective of Cultural Ecosystem Services (CES), we assessed the relationship between the use of the Camargue delta and the presence of natural elements by consulting local managers. Clustering algorithms applied to results of the LSA data revealed six distinct user groups, which included those interested in nature, ornithology, religious pilgrimage, general tourists and aviation enthusiasts. For each group, we produced high-resolution spatial and seasonal maps, which matched known recreational attractions and annual festivals in the Camargue. The accuracy of the group identification, and the spatial and temporal patterns of photo activity, in the Camargue delta were evaluated by local managers of the Camargue regional park. This study demonstrates how PA managers can harness socialmedia to monitor recreation and improve their management decision making.

A demographic model for the conservation and management of the European eel: an application to a Mediterranean coastal lagoon

Fri, 30 Aug 2019 17:01:36

de Daniele Bevacqua, Paco Melià, Marcello Schiavina, Alain Jean Crivelli, Giulio A De Leo, Marino Gatto, Caroline Durif
In ICES Journal of Marine Science, fsz118 (July, 2019), 15
En ligne : academic.oup.com[...]

We present a general size- and age-structured demographic model of the continental phase of catadromous eels’ life cycle, allowing for the incorporation of (i) ﬂuctuations of juvenile recruitment, (ii) density-dependent settlement and sex determination, (iii) plastic body growth and sexual dimorphism, and (iv) vital rates driven by body size rather than age. The model can be used to assess (i) standing stock, (ii) ﬁshing yield, and (iii) spawner production under different recruitment and management scenarios. We demonstrate the model by applying it to a European eel stock (Camargue lagoons, southern France) that was continuously monitored for 17 years (1993–2009). Results indicate that the upper limit to settlement in the Camargue water system is $419 eels haÀ1 per year. A balanced sex ratio occurs for a settlement of $94 eels haÀ1, shifting towards males at higher densities. Catchability is higher in adult silver eels than in sub-adult yellow eels, possibly due to behavioural differences. Estimated standing stock ranged between 7 and 19 kg haÀ1. Fishing yield was 5–7 kg haÀ1 per year, while spawner escapement ranged between 0 and 13 kg haÀ1 per year (<30% of what would occur in the absence of ﬁshing and obstacles to migration).

Expériences de gestion cynégétique innovantes en Camargue : des pistes pour la chasse au gibier d’eau de demain ?

Fri, 30 Aug 2019 17:00:53

de David Vallecillo, Pierre Defos du Rau, Anthony Olivier, Jocelyn Champagnon, Matthieu Guillemain, Nicolas Croce, Gregoire Massez, Jérémiah Petit, Nicolas Beck, Jean-Yves Mondain-Monval
In Faune sauvage, 323 (Avril-Juin, 2019), 33-39

En Camargue, plusieurs groupes de chasseurs ont expérimenté des changements dans leurs modalités de gestion des habitats et des prélèvements, dans l'objectif de pratiquer une activité cynégétique à la fois plus durable et plus favorable à la biodiversité. Quelques exemples de ces différentes pratiques mises en oeuvre sur cinq territoires sont présentés dans cet article.

Description de Metzneria fulva sp. nov., découverte dans le sud de la France, proche de M. torosulella (Rebel, 1893) (Lepidoptera, Gelechiidae, Anomologinae)

Mon, 17 Jun 2019 13:32:04

de Gérard Labonne, Peter Huemer, Marc Thibault, Jacques Nel
In RARE. Revue de l'Association roussillonnaise d'entomologie, 28(1) (2019), 44-51

Une nouvelle espèce du genre Metzneria Zeller, 1839, Metzneria fulva sp. nov., découverte dans l’Hérault et les Bouches-du-Rhône (France méridionale) est décrite ; elle est comparée à M. torosulella (Rebel, 1893) (études morphologique et ADN-barcoding)

Le Pélobate cultripède Pelobates cultripes (Cuvier, 1829) sur le pourtour du Golfe de Fos (Bouches-du-Rhône) : distribution actuelle, caractérisation des habitats et menaces

Mon, 17 Jun 2019 13:31:53

de Vincent Rivière, Anthony Olivier, Éric Durand
In Nature de Provence (Juin 2019), 1-14
En ligne : www.cen-paca.org[...]

A l’échelle de la région PACA, la répartition fragmentée et le déclin du Pélobate cultripède Pelobates cultripes (Cuvier, 1829), ont conduit à son classement en tant qu’espèce “En Danger” dans la Liste Rouge Régionale des Reptiles et Amphibiens. Face à ce constat, et au regard de l’importance des populations qu’accueille le littoral du Golfe de Fos, une synthèse des connaissances à l’échelle de ce territoire semblait nécessaire. Des prospections ciblées menées par les auteurs depuis la fin des années 1990, auxquelles s’ajoutent les données collectées dans les différentes bases de données naturalistes, ont été mises à profit pour réaliser ce travail. à l’instar du constat régional, la situation de l’es- pèce sur le littoral du Golfe de Fos est particulièrement précaire, conséquence de la mutation industrielle de ce territoire sous l’impulsion du développement de l’activité portuaire, conduisant ainsi à restreindre ses biotopes de prédilection et à isoler la plupart des sites de reproduction, dont la majorité est située au sein de secteurs à vocation industrielle. Au regard de cette situation alarmante, la mise en place d’un plan de conservation paraît urgente. / The fragmented distribution of Western spadefoot (Pelobates cultripes) populations has led to its classification as an «Endangered» species on the IUCN regional red list of reptiles and amphibians for the PACA Region. Consequently, a synthesis was made of the state of conservation of the species on a local scale for the observations made in the Golfe de Fos. Targeted surveys were carried out by the authors since the end of the 1990s and data was collected in various naturalistic databases. Similar to the regional observations, the local distribution is particularly fragmented due the industrial development of port activities causing an isolation of breeding sites. This is aggravated by the fact that among the six known breeding sites in the Golfe de Fos, four are located in industrial areas and are not covered by any protection status. Given these alarming threats, the i

Dynamics of the seagrass Zostera noltei in a shallow Mediterranean lagoon exposed to chemical contamination and other stressors

Tue, 7 May 2019 11:27:11

de Diane Espel, Noël J. Diepens, Olivier Boutron, Evelyne Buffan-Dubau, Yves Chérain, Eric Coulet, Patrick Grillas, Anne Probst, Jérôme Silvestre, Arnaud Elger
In Estuarine, Coastal and Shelf Science, 222 (June, 2019), 1-12
En ligne : linkinghub.elsevier.com[...]

Seagrass decline due to a variety of stressors has been observed worldwide. In the shallow Vaccarès lagoon, Camargue, France, the dominant macrophyte species, Zostera noltei, has suﬀered two major declines since 1996. The ﬁrst decline was well explained by salinity and turbidity variations, while the second one could not be explained by these parameters. Other stressors such as chemical contamination, eutrophication or temperature increase could be explanatory variables for this most recent decline. The aim of our study was to understand, via scientiﬁc monitoring from 2011 to 2015, the inﬂuence of chemical contamination and its possible interactions with other biological and environmental pressures, on seagrass physiology and population dynamics in the Vaccarès lagoon.

Seventy-year chronology of Salinas in southern France

Wed, 17 Apr 2019 10:20:50

de Rutger de Wit, Alice Vincent, Ludovic Foulc, Mario Klesczewski, Olivier Scher, Claudine Loste, Marc Thibault, Brigitte Poulin, Lisa Ernoul, Olivier Boutron
In Journal for Nature Conservation, 49 (June, 2019), 95-107
En ligne : www.sciencedirect.com[...]

After World War II, twenty-nine coastal Salinas (122 km2), located in the vicinity of coastal lagoons and in deltas, were exploited along the Mediterranean coastlines in South France. Today, only five of these are still actively producing salt, currently representing 175 km2. Concomitant with the abandonment of many of the smaller Salinas, the larger Salinas in the Rhône delta (Camargue) strongly increased their surfaces at the expense of natural ecosystems, of which a part has also been abandoned after 2009. This paper documents these changes in landscape use by chronological GIS mapping and describes the fate of the 91 km2 of abandoned Salina surfaces. The majority of this area (88 km2) is included in the Natura 2000 network, among which most (74 km2) has been acquired by the French coastal protection agency (Conservatoire du Littoral) to be designated as Protected Areas. Only a very minor part (<1%) has been lost for industry and harbour development. Managing abandoned Salinas as Protected Areas is a challenge, because of the different landscape, biodiversity conservation, natural and cultural heritages issues at stake. In two cases, abandoned Salinas have been brought back again into exploitation by private initiative thus allowing for the protection of original hypersaline biodiversity. In other cases, the shaping of the landscape by natural processes has been privileged. This has facilitated the spontaneous recreation of temporal Mediterranean wetlands with unique aquatic vegetation, and offered opportunities for managed coastal re-alignment and the restoration of hydrobiological exchanges between land and sea. In other areas, former salt ponds continue to be filled artificially by pumping favouring opportunities for waterfowl. This has often been combined with the creation of artificial islets to provide nesting ground for bird colonies protected from terrestrial predators.

Modelling climate influences on population dynamics and diurnal time budget of the Shelduck (Tadorna tadorna) wintering in Ramsar wetlands of Algeria

Thu, 14 Mar 2019 10:28:38

de Adel Bezzalla, Moussa Houhamdi, Mohamed Cherif Maazi, Haroun Chenchouni
In Avian Biology Research, 10.1177/1758155919835122 (2019), 1 –19
En ligne : journals.sagepub.com[...]

Several North African wetlands are classified as wetlands of international importance (Ramsar sites and Important Bird Area) because thousands of Shelducks (Tadorna tadorna) winter in these habitats. However, Shelduck’s patterns of habitat use in these protected wetlands during the wintering season are still hindered by lack of information in arid and semi-arid regions regarding population dynamics and the effects of climate variables. This ornithological survey aims to study population dynamics and temporal patterns of diurnal activities of the Shelduck at two Ramsar and Important Bird Area sites (Chott Tinsilt and Sebkhet Ezzemoul) with respect to the effect of climatic parameters of the habitat in order to deepen our understanding of wintering strategies and habitat use. Populations were weekly censused from 06:00 to 19:00 during the entire wintering season (September 2015–May 2016). Diurnal behavioural activities were monitored at the same rate, and then the variation of time budget was tested using generalized linear model to determine the effects of climate variables and population size dependency. The Shelduck was observed at both sites from the end of November and remained there until the total desiccation of both lakes in early May. Trends of Shelduck’s population dynamics differed between the two sites. Generalized linear models revealed the significant effects of temperature, wind speed and number of snowy days on population dynamics. Feeding was the main diurnal activity of the Shelduck at both sites with 80.2% of time budget at Chott Tinsilt (mainly feeding at lake shores) and 82% at Sebkhet Ezzemoul (mainly feeding in water). The generalized linear models showed that the variation of time budget allocated to different diurnal activities was not population dependent, but rather it was negatively affected by the increase of air temperature. Significant effects of the interaction between population size and some climatic variables were found and discussed. During the whole wintering season, Chott Tinsilt and Sebkhet Ezzemoul play an important ecological role since they offer a wide-ranging diurnal forging habitat and a shelter for thousands of this waterfowl.

Offspring Microbiomes Differ Across Breeding Sites in a Panmictic Species

Wed, 6 Feb 2019 16:45:32

de Mark Alan Frank Gillingham, Arnaud Béchet, Frank Cézilly, Kerstin Wilhelm, Manuel Rendón-Martos, Fabrizio Borghesi, Sergio Nissardi, Nicola Baccetti, Hichem Azafzaf, Sebastian Menke, et al.
In Frontiers in Microbiology, 10 (2019-2-6), 35
En ligne : www.frontiersin.org[...]

High dispersal rates are known to homogenize host’s population genetic structure in panmictic species and to disrupt host local adaptation to the environment. Long-distance dispersal might also spread micro-organisms across large geographical areas. However, so far, to which extent selection mechanisms that shape host’s population genetics are mirrored in the population structure of the enteric microbiome remains unclear. High dispersal rates and horizontal parental transfer may homogenize bacterial communities between breeding sites (homogeneous hypothesis). Alternatively, strong selection from the local environment may differentiate bacterial communities between breeding sites (heterogeneous hypothesis). Furthermore, selection from age-specific environmental or physiological factors may differentiate the microbiome between juveniles and adults. Here, we analyzed the cloacal bacterial 16S rRNA gene of fledgling greater flamingos, Phoenicopterus roseus, across nine western Mediterranean breeding sites and four breeding seasons (n = 731) and adult birds (n = 27) from a single site. We found that fledgling cloacal microbiome, as measured by alpha diversity, beta diversity, the relative abundance of assigned sequence variants (ASVs) belonging to a phylum and genus composition within phylum, varied significantly between sampling sites and across time within site despite high adult dispersal rates. The spatio-temporal effects were stronger on individual ASV absence/presence than on ASV abundance (i.e., than on core microbiome composition). Spatial effects had a stronger effect than temporal effects, particularly on ASV abundance. Our study supports the heterogeneous hypothesis whereby local environmental conditions select and differentiate bacterial communities, thus countering the homogenizing effects of high-dispersing host species. In addition, differences in core microbiome between adult vs. fledgling samples suggests that differences in age-specific environmental and/or physiological factors result in differential selection pressure of core enteric microbiome between age classes, even within the same environment. In particular, the genus Corynebacterium, associated with both seasonal fat uptake and migration in previous studies, was much more abundant in high-dispersing fledglings than in more resident adults. To conclude, selection mechanisms that shape the host’s genetic structure cannot be extended to the genetic structure of the enteric microbiome, which has important implications regarding our understanding of both host local adaptation mechanisms and enteric microbiome population genetics.

Détectives à plumes. Ce que les oiseaux nous apprennent sur leur environnement

Thu, 14 Mar 2019 10:29:53

de David Grémillet, Marion Vittecoq, Thierry Boulinier
In Les dossiers d'Agropolis International, 24 (Février 2019), p. 37
En ligne : www.agropolis.fr[...]

Visibles de tous, les oiseaux nous renseignent sur l’état de leurs milieux de vie. Ils y sont exposés aux pollutions plastiques et chimiques, aux agents pathogènes, aux conséquences des changements climatiques et à la surexploitation des ressources naturelles. Bioindicateurs avérés, les oiseaux marins présentent des réponses qualitatives et/ou quantitatives aux changements globaux et émergent comme d’excellentes sentinelles environnementales

Conservation of the island wetlands of the Mediterranean Basin (MedIsWet) .The Island wetlands of Sardinia (Italy). A technical report on the project and its outcomes (December, 2019)

Thu, 18 Nov 2021 17:44:08

de Mauro Fois, Alba Cuena-Lombraña, Gianluigi Bacchetta
Cagliari, Italy : Centro conservazione biodiversita, December, 2019, 30 + annexes
En ligne : medwet.org[...]

In general, factors responsible for losses and degradation of wetlands areas in Sardinia (and also worldwide) include disconnecting floodplain wetlands from flood flows, eutrophication, pollution, overgrazing, harvesting plants and animals, global warming, invasions of exotics, and the practices of filling, dying and draining, and habitat fragmentation due to the construction of road and harbour facilities. Eutrophication is widespread, which, together with effects of invasive species, reduces biotic complexity. The effects of urbanization will be detailed below in this section. For their multiple ecosystem services, the need for wetland conservation is widely recognized (i.e. the Ramsar Convention, Ramsar 2013) but has long been challenged by national development policies and short-term economic/politics priorities. Thus, drainage and conversion to an extensive agriculture are presently turning wetlands into deep anthropogenic landscapes and doing habitats change at too accelerating pace to have the chance of resilience. Generalizations and trends gleaned from this project should be considered as a starting point for developing world-scale data sets.

Regenerative Empathy (2019)

Thu, 3 Sep 2020 16:37:40

de Teresa Gali-Izard
Cambridge, Massachusetts : Harvard University Graduate School of Design, 2019, 150
En ligne : www.gsd.harvard.edu[...]

Regenerative Empathy is a Studio Report from the Fall 2018 semester at the Harvard University Graduate School of Design based on the option studio “Rhizosphere,” taught by Teresa Galí-Izar It explores the relationship between humans and the natural world; it begins to answer the question of how to construct intelligent synergies between people, their cultures and economies, and the natural world in order to recuperate the fundamental sources of life on earth. The projects in this report touch on a broad range of disciplines: students translated their fieldwork, research on geological and climate data, research on food production, and surveys of scientific literature into drawings focusing on the “rhizosphere”—a term defined by agronomist Lorenz Hiltner in 1904 as the soil microbiology around the root system of plants. The investigations and drawings that comprise these reveal new potential assemblages for La Camargue in France, proposing new forms of association between the people, animals, and plants that inhabit the region

Empathie régénérative (2019)

Wed, 2 Sep 2020 17:29:57

de Teresa Gali-Izard
Cambridge, Massachusetts : Harvard University Graduate School of Design, 2019, 150
En ligne : issuu.com[...]

Ce document est le résultat d'un travail mené dans le cadre du séminaire d'automne 2018 "Rhizosphère", conduit par Teresa Galí-Iza à la Graduate School of Design de l'Université de Harvard, basé sur l'option studior
Il explore la relation entre les humains et le monde naturel ; il commence à répondre à la question de savoir comment construire des synergies intelligentes entre les personnes, leurs cultures et leurs économies, et le monde naturel afin de récupérer les sources fondamentales de la vie sur terre.
Les projets présentés dans ce rapport touchent un large éventail de disciplines : les étudiants ont traduit leurs travaux de terrain, leurs recherches sur les données géologiques et climatiques, leurs recherches sur la production alimentaire et leurs études de la littérature scientifique en dessins axés sur la "rhizosphère" - terme défini par l'agronome Lorenz Hiltner en 1904 comme la microbiologie du sol autour du système racinaire des plantes. Les recherches et les dessins qui les composent révèlent de nouveaux assemblages potentiels pour la Camargue en France, proposant de nouvelles formes d'association entre les hommes, les animaux et les plantes qui habitent la région.

Canard colvert (Anas platyrhynchos) (2019)

Wed, 8 Jan 2020 16:07:02

de Jocelyn Champagnon, Jean-Pierre Trouillas, Jean-Baptiste Mouronval
Saint-Chaptes (30190) : COGard, 2019, 48

Nette rousse (Netta rufina) (2019)

Wed, 8 Jan 2020 16:03:49

de Jean-Baptiste Mouronval, Jean-Pierre Trouillas, Jocelyn Champagnon
Saint-Chaptes (30190) : COGard, 2019, 52-53

Canard pilet (Anas acuta) (2019)

Wed, 8 Jan 2020 16:01:27

de Jocelyn Champagnon, Jean-Pierre Trouillas, Jean-Baptiste Mouronval
Saint-Chaptes (30190) : COGard, 2019, 49

Sarcelle d'été (Spatula querquedula) (2019)

Wed, 8 Jan 2020 15:34:18

de Jean-Pierre Trouillas, Jocelyn Champagnon
Saint-Chaptes (30190) : COGard, 2019, 51

Tadorne de Belon (Tadorna tadorna) (2019)

Wed, 8 Jan 2020 15:27:20

de Jean-Pierre Trouillas, Jocelyn Champagnon, Jean-Baptiste Mouronval
Saint-Chaptes (30190) : COGard, 2019, 44

Rousserolle turdoïde (Acrocephalus arundinaceus) (2019)

Tue, 17 Dec 2019 17:22:23

de Yves Kayser
Saint-Chaptes (30190) : COGard, 2019, 262

Rousserolle effarvate (Acrocephalus scirpaceus) (2019)

Tue, 17 Dec 2019 17:21:00

de Yves Kayser
Saint-Chaptes (30190) : COGard, 2019, 261

Rousserolle verderolle (Acrocephalus palustris) (2019)

Tue, 17 Dec 2019 17:19:34

de Yves Kayser
Saint-Chaptes (30190) : COGard, 2019, 260

Phragmite aquatique (Acrocephalus paludicola) (2019)

Tue, 17 Dec 2019 17:13:36

de Yves Kayser
Saint-Chaptes (30190) : COGard, 2019, 259

Glaréole à collier (Glareola pratincola) (2019)

Tue, 17 Dec 2019 17:11:47

de Yves Kayser, P. Cramm
Saint-Chaptes (30190) : COGard, 2019, 136

Flamant rose (Phoenicopterus roseus) (2019)

Tue, 17 Dec 2019 17:07:19

de Antoine Arnaud, P. Cramm
Saint-Chaptes (30190) : COGard, 2019, 86-87

Spatule blanche (Platalea leucorodia) (2019)

Tue, 17 Dec 2019 17:00:19

de Thomas Blanchon, Jean-Pierre Trouillas, Jocelyn Champagnon
Saint-Chaptes (30190) : COGard, 2019, 85

Ibis sacré (Threskiornis aethiopicus) (2019)

Tue, 17 Dec 2019 16:58:10

de Jean-Baptiste Mouronval, Yves Kayser, Jocelyn Champagnon
Saint-Chaptes (30190) : COGard, 2019, 84

Ibis falcinelle (Plegadis falcinellus) (2019)

Tue, 17 Dec 2019 16:55:29

de Yves Kayser, Jean-Pierre Trouillas, Thomas Blanchon
Saint-Chaptes (30190) : COGard, 2019, 83-84

Héron cendré (Ardea cinerea) (2019)

Tue, 17 Dec 2019 16:31:43

de Yves Kayser, Jean-Pierre Trouillas, G. Bousquet
Saint-Chaptes (30190) : COGard, 2019, 79

Grande aigrette (Ardea alba) (2019)

Tue, 17 Dec 2019 16:29:52

de Yves Kayser, Jean-Pierre Trouillas
Saint-Chaptes (30190) : COGard, 2019, 78

Aigrette garzette (Egretta garzetta) (2019)

Tue, 17 Dec 2019 16:27:10

de Yves Kayser, Jean-Pierre Trouillas
Saint-Chaptes (30190) : COGard, 2019, 77

Crabier chevelu (Ardeola ralloides) (2019)

Tue, 17 Dec 2019 16:24:28

de Yves Kayser, G. Bousquet, Rémi Tiné
Saint-Chaptes (30190) : COGard, 2019, 74

Héron garde boeuf (Bubulcus ibis) (2019)

Tue, 17 Dec 2019 16:21:39

de Yves Kayser, Jean-Pierre Trouillas, G. Bousquet
Saint-Chaptes (30190) : COGard, 2019, 75

Bihoreau gris (Nycticorax nycticorax) (2019)

Tue, 17 Dec 2019 16:19:48

de Yves Kayser, Jean-Pierre Trouillas, G. Bousquet
Saint-Chaptes (30190) : COGard, 2019, 73

Blongios nain (Bixobrychus minutus) (2019)

Tue, 17 Dec 2019 16:15:38

de Yves Kayser, Jean-Pierre Trouillas, G. Bousquet
Saint-Chaptes (30190) : COGard, 2019, 72

Butor étoilé (Botaurus stellaris) (2019)

Tue, 17 Dec 2019 16:12:39

de Yves Kayser, Brigitte Poulin
Saint-Chaptes (30190) : COGard, 2019, 71

Atlas des oiseaux du Gard (2019)

Tue, 17 Dec 2019 10:18:37

de Ouvrage collectif
Saint-Chaptes (30190) : COGard, 2019, 400

Après huit années de travail depuis la première édition de 1993, l’ouvrage dresse un nouveau bilan détaillé et illustré de nombreuses cartographies de la présence dans le Gard des 321 espèces nicheuses, hivernantes ou migratrices observées, sur la base de plus de 730 000 données fournies par plus de 1700 observateurs.

Bilan de suivi de la reproduction de la Glaréole à collier en Camargue et ses environs - Année 2019 (2019)

Thu, 31 Oct 2019 10:40:44

de Julien Birard
Arles : Tour du Valat, 2019, 24

La Glaréole à collier Glareola pratincola présente une aire de reproduction morcelée, centrée sur le bassin méditerranéen
En France, l’essentiel de la population se trouve en Camargue et ses environs.
Ce document présente les résultats obtenus lors du suivi de la reproduction de l’année 2019. Les données récoltées sont comparées à celles des années précédentes. Il aborde également quelques aspects liés à la conservation de l’espèce avant de conclure sur les principaux éléments de la nidification de 2019 et sur les perspectives à venir.

Proceedings of the IX Workshop of the AEWA Eurasian Spoonbill International Expert Group (2019)

Thu, 3 Oct 2019 15:55:08

de Jocelyn Champagnon, Jelena Kralj, Luis Santiago Cano Alonso, K. S. M. Gopi Sundar
Arles : IUCN-SSC Stork, Ibis and Spoonbill Specialist Group, 2019, 68 (Special Publication 2)
En ligne : storkibisspoonbill.org[...]

Articles
An Overview of Eurasian Spoonbill Trends 9
Ten-year Evaluation of the Implementation of the AEWA Eurasian Spoonbill International Action Plan 13
Recent trends of the Breeding Population of Spoonbill in France 2012-2018 19
The Return of the Eurasian Spoonbill to the United Kingdom and the First Modern Colony at Holkham National Nature Reserve 24
Monitoring Breeding Spoonbill Population in Croatia During 2016-2018 Period 31
Spoonbills from the Netherlands. Where Do They Go and When? 35
Eurasian Spoonbill Platalea leucorodia in Camargue: History, Trends and First Results 38
The Ontogeny of Migration: the Importance of Genes and the Early-Life Environment in Shaping Migration Strategies of Spoonbills 41
Delayed Recruitment of First Natives 43
Estimate the Number of Birds Using a Stopover Area: a Study Case with Eurasian Spoonbill During Fall Migration 46

Abstracts
Status of the Eurasian Spoonbill Platalea leucorodia in Numidia, Northeast Algeria 48
Breeding Biology of the Eurasian Spoonbill Platalea leucorodia leucorodia in a New Colony at Ouedel-Maleh Dam, Casablanca, Morocco 48
Ecological Study of the Eurasian Spoonbill Platalea leucorodia leucorodia in Its Atlantic Coastal Migration Areas of Senegal 49
Is There a Differential Age-Migration Timing in Spoonbills? Preliminary Analysis on a Crucial Migratory Corridor in the Iberian Southwestern Coast During Autumn 50
Dispersal and Survival of Adult Eurasian Spoonbills in Croatia 51
Spoonbill-Tracking in Hungary: What Do We Know, and What Are the Missing Data? 52
Importance of Tunisia as Wintering and Stopover Area for the Eurasian Spoonbill Platalea leucorodia Analyses of 20 years of Data Collection (1998-2018) 53
The Split of the Central and South-east European Populations 54
Spatio-Temporal Factors Affecting Habitat Use by Eurasian Spoonbill Platalea leucorodia in the Gulf of Gabès, Tunisia 55
First Breeding Record of Eurasian Spoonbill Platalea leucorodia archeri (Newman, 1928) at Dungonab Bay Marine Park on the Sudanese Red Sea Coast 56
Foraging Success and Group-feeding Size in Eurasian Spoonbills 57
Working with an Ex Situ Population of Eurasian Spoonbill in Amsterdam Royal Zoo in the Netherlands 57
Underpinning the Conservation of Spoonbills and other Migrating Waterbirds: Monitoring the Weak Links in ‘Chains’ of Wetland Habitats 58

Eurasian Spoonbill Platalea leucorodia in Camargue: History, Trends and First Results (2019)

Thu, 3 Oct 2019 15:54:23

de Thomas Blanchon, Michel Gauthier-Clerc, Antoine Arnaud, Yves Kayser, Jocelyn Champagnon
Arles : IUCN-SSC Stork, Ibis and Spoonbill Specialist Group, 2019, 38-40 (Special Publication 2)
En ligne : storkibisspoonbill.org[...]

While the Eurasian Spoonbill Platalea leucorodia was only observed twice during the first half of the 20th century in Camargue, Spoonbill become regular since 1980 and the first breeding took place in 1998. The population has recently increased with an exponential growth until 2015 (median growth rate of +27 % year, 1st quartile (5%), 3rd quartile (50%). We observed since 2015 an apparent stabilisation of the population size around three hundred breeding pairs in 2018 (Figure 1). In Camargue two recurrent breeding sites have been used with success until 2017 and three in 2018.

Delayed Recruitment of First Natives (2019)

Thu, 3 Oct 2019 15:54:07

de Jocelyn Champagnon, Thomas Blanchon, Lina Lopez-Ricaurte, Michel Gauthier-Clerc, Stefano Volponi
Arles : IUCN-SSC Stork, Ibis and Spoonbill Specialist Group, 2019, 43-45 (Special Publication 2)
En ligne : storkibisspoonbill.org[...]

Strong pressure exists on wetlands as a consequence of urbanisation, agriculture, fish farming, industry, hunting, recreation, forestry or military activities. As a result, the birds breeding sites are regularly destroyed or abandoned. However, new colonies can potentially emerge to compensate lost ones. As such, we can identify four critical aspects essential for new colonies formation: 1) Natal or breeding dispersal (De le Court & Aguilera 1997, El Hamoui et al. this volume); 2) suitable new sites that provide protection from disturbance and feeding grounds (Marion, this issue); 3) colony growth and 4) stabilization. Here we focused on the Eurasian Spoonbill Platalea leucorodia Camargue colony located in Southern France that is growing exponentially (Blanchon et al. this volume) to document the process of colonization. Specifically, we quantified early-life demographic parameters and compared them with those from older new born colony from Italy.

L'agroécologie en Camargue (2019)

Fri, 20 Sep 2019 17:18:44

de Nicolas Beck, Thomas Galewski
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 158-159

L'exploitation du roseau (2019)

Fri, 20 Sep 2019 17:06:32

de Raphael Mathevet, C. Mundler, Brigitte Poulin
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 149-150

Recolonisation par les poissons des étangs et marais des anciens salins (2019)

Fri, 20 Sep 2019 17:02:36

de Delphine Nicolas
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 121

Renaturation et adaptation au changement climatique des anciens salins (2019)

Fri, 20 Sep 2019 17:00:39

de Marc Thibault, Gaël Hemery, A. Cheiron, Brigitte Poulin
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 120-121

L'évolution des paysages (2019)

Fri, 20 Sep 2019 16:57:35

de Jean-Emmanuel Roché, Alain Sandoz
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 116-119

Les poissons envahissants (2019)

Fri, 20 Sep 2019 16:55:26

de Alain Jean Crivelli
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 110-111

Les oiseaux envahissants (2019)

Fri, 20 Sep 2019 16:42:58

de Jean-Baptiste Mouronval, Yves Kayser
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 110

Les mammifères envahissants (2019)

Fri, 20 Sep 2019 16:41:33

de Françoise Poitevin, Anthony Olivier
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 109-110

Les plantes envahissantes (2019)

Fri, 20 Sep 2019 16:40:15

de Patrick Grillas, Nicole Yavercovski
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 108-109

La sécurité sanitaire (2019)

Fri, 20 Sep 2019 16:38:04

de Michel Gauthier-Clerc, Marion Vittecoq
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 107-108

Le crapaud calamite menacé par l'élévation du niveau de la mer (2019)

Fri, 20 Sep 2019 16:29:13

de Anthony Olivier, Marc Thibault, Arnaud Béchet
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 105-106

les moustiques (2019)

Fri, 20 Sep 2019 16:21:20

de Brigitte Poulin
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 94-96

les libellules (2019)

Fri, 20 Sep 2019 16:18:25

de Damien Cohez
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 93-94

Les papillons de nuit (2019)

Fri, 20 Sep 2019 16:16:49

de Olivier Pineau
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 88

Les poissons (2019)

Fri, 20 Sep 2019 16:14:15

de Alain Jean Crivelli
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 88

Les amphibiens (2019)

Fri, 20 Sep 2019 16:13:12

de Anthony Olivier, Marc Cheylan
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 85-86

Les reptiles (2019)

Fri, 20 Sep 2019 16:11:30

de Marc Cheylan, Anthony Olivier
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 85-86

Le fonctionnement démographique des migrations hivernantes de canards (2019)

Fri, 20 Sep 2019 15:47:47

de Matthieu Guillemain, Jocelyn Champagnon, Gregoire Massez, Michel Gauthier-Clerc
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 82-85

Evolution de l'avifaune en Camargue au cours des deux derniers siècles (2019)

Fri, 20 Sep 2019 15:42:27

de Thomas Galewski
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 80-82

Le Flamant rose (2019)

Fri, 20 Sep 2019 15:37:13

de Arnaud Béchet, Alan R. Johnson
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 79-80

Les mammifères (2019)

Fri, 20 Sep 2019 15:34:45

de Anthony Olivier, Françoise Poitevin
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 74-75

Les modifications récentes de la flore camarguaise (2019)

Fri, 20 Sep 2019 15:31:27

de Patrick Grillas, Hugo Fontes, Nicole Yavercovski, Sara Fraixedas
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 69-70

La dynamique de la végétation (2019)

Fri, 20 Sep 2019 15:27:24

de Patrick Grillas, Nicole Yavercovski
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 67-68

A la découverte de quelques espèces emblématiques (2019)

Fri, 20 Sep 2019 15:25:36

de Nicole Yavercovski, Jean-Baptiste Mouronval, Patrick Grillas
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 64-67

La flore et la végétation (2019)

Fri, 20 Sep 2019 15:16:10

de Patrick Grillas, Nicole Yavercovski
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 61-63

Les pelouses (2019)

Fri, 20 Sep 2019 15:13:46

de François Mesléard, Nicole Yavercovski
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 57-58

Les roubines (2019)

Fri, 20 Sep 2019 15:09:39

de Damien Cohez
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 51-52

Les mares temporaires (2019)

Fri, 20 Sep 2019 15:06:06

de Patrick Grillas, Nicole Yavercovski
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 50-51

Le milieu lagunaire (2019)

Fri, 20 Sep 2019 14:41:53

de Alain Jean Crivelli
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 49

Les marais d'eau douce (2019)

Fri, 20 Sep 2019 14:24:26

de Patrick Grillas, Nicole Yavercovski
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 48-49

L'encyclopédie de la Camargue (2019)

Wed, 18 Sep 2019 17:29:38

de Jacques Blondel, Guy Barruol, Régis Vianet
Paris : Buchet-Chastel, 2019, 368

Etude de la biodiversité des milieux agricoles camarguais au regard des pratiques phytosanitaires et du paysage (2019)

Tue, 10 Sep 2019 17:26:24

de Pierre Mallet
Montpellier : Université de Montpellier, 2019, 50

Une part importante de la biodiversité est aujourd’hui menacée. Celle des oiseaux dans les milieux agricoles l’est particulièrement à cause de l’utilisation de produits phytopharmaceutiques (PPP) et de la simplification des paysages agricoles. L'auteur étudie les liens entre ces deux variables et la fréquentation des parcelles agricoles par les oiseaux en Camargue, où de nombreux oiseaux d’intérêts communautaires fréquentent les agroécosystèmes.
Pour ce faire, l’auteur a analysé les données récoltées lors du projet Farmland où les oiseaux des parcelles de riz et de blé dur ont été échantillonnés en 2013. L’utilisation de modèles à effets mixtes permet d’étudier les variables d’intérêt, ici l’indice de fréquence de traitement phytosanitaire (IFT) et la proportion de milieux semi-naturels et d’infrastructures agroécologique (IAE) dans le paysage. Grâce à ces analyses, une diminution de la richesse spécifique des oiseaux dans les parcelles de riz avec l’augmentation de l’IFT a été mise en évidence. Cela peut s’expliquer par l’impact qu’ont les pesticides sur les réseaux trophiques en diminuant la ressource alimentaire. L'auteur a également mis en évidence une augmentation de la diversité et de la richesse spécifique des oiseaux avec la proportion de milieux semi-naturels et d’IAE dans le paysage. Cette tendance s’explique par le rôle de zones refuges exercé par ces milieux. Ceux-ci vont réussir à atténuer l’impact négatif des PPP car pour des IFT faible, les parcelles implantées dans des paysages avec de nombreux milieux semi-naturels vont garder une abondance en oiseaux élevée.

Dynamiques des hôtes intermédiaires et des hôtes définitifs impliqués dans les trématodoses en Camargue (2019)

Mon, 9 Sep 2019 17:29:31

de Clémentine Leroy
Montpellier : Université de Montpellier, 2019, 33

Ce travail s’inscrit dans un projet sur les risques épidémiologiques de la fasciolose et autres trématodoses dans un contexte de biologie de la conservation et de perturbations anthropiques, initié depuis quelques années (Sabourin, 2018) et dont les acquis et les suivis permettent de répondre à des problématiques prégnantes dans le système camarguais. Dans le cadre de ces problématiques globales, le stage vise à (1) étudier l’écologie parasitaire des trématodes au sein de l’hôte définitif bovin, sur cette base, (2) identifier les habitats regroupant les conditions favorables pour abriter les mollusques d’eau douce impliqués dans la transmission des trématodes, (3) caractériser les dynamiques spatio-temporelles des populations de ces mêmes mollusques.
Pour ce faire, l'auteur a combiné un échantillonnage systématique des parasites du foie lors des abattages des bovins et un suivi de la dynamique des communautés de mollusques d’eau dans des zones hydrologiquement différentes.

Réhabilitation expérimentale de mares temporaires méditerranéennes par gestion hydraulique : état initial des communautés végétales des mares cibles et témoins (2019)

Tue, 3 Sep 2019 15:49:42

de Ékatérina Mutalapova
[S.l.] : Université de Perpignan Via Domitia, 2019, 34

Cette étude visait à établir l’état initial des communautés végétales de mares temporaires en amont d’un projet de réhabilitation dont l’objectif est de tester un nouveau mode de gestion hydraulique. Un plan d’échantillonnage, concernant six mares temporaires actuellement gérées pour la chasse, avait été mis en place en concertation avec les chasseurs. Ce plan avait été établi sans tirage aléatoire mais en définissant trois mares en tant que réplicats tests et les trois autres en tant que réplicats témoins. En se basant sur les données de relevés floristiques in situ et d’étude de la banque de graines du sol, nous avons évalué la variabilité entre ces mares et montré que le plan actuel n’équilibre pas les réplicats entre les traitements ; nous proposons un plan d’échantillonnage alternatif. Ensuite, nous avons comparé la végétation « potentielle » de la banque de graines à la végétation exprimée sur le site. Les différences significatives existant entre ces deux types de végétation soulignent l’intérêt de suivre la banque de graine au cours du projet de réhabilitation. Enfin, nous avons comparé les communautés végétales présentes à celles qui caractérisent les mares temporaires méditerranéennes d’après la littérature. Nous montrons alors l’existence d’un impact négatif de la gestion cynégétique appliquée jusqu’à présent sur la conservation des communautés végétales patrimoniales. / The object of this study was to establish the initial state of the plant communities of temporary ponds before the settlement of a habitat rehabilitation project, which aimed to test a new mode of water management. A sampling scheme, concerning six ponds currently managed for waterfowl gaming, has been designed in accordance with hunters but without randomisation. However, this scheme defined three of these ponds as tested replicates and the three others as control. Based on the data collected from field floristic surveys and from a soil seed bank study, we assessed the variability in plant communities between the ponds. We show that replicates are not properly balanced between treatments and propose an alternative scheme. Then, we compared the “potential” vegetation of the seed bank to the “real” vegetation of the field surveys. The significant differences between these vegetations highlight the importance of monitoring the seed bank along the rehabilitation project. Finally, we compared the observed communities to those of Mediterranean temporary ponds described by the literature. This allowed us to underline the negative impact of gaming water management on the conservation of heritage plant communities.

Effet de la salinité sur les traits d’histoire de vie des larves et adultes de deux espèces d’Odonates : Lestes macrostigma et Lestes sponsa (2019)

Tue, 3 Sep 2019 15:36:08

de Tamara Antonini
[S.l.] : Université d'Aix-Marseille, 2019, 47

Dans un contexte d’écologie évolutive nous cherchons à comprendre pourquoi L. macrostigma, une espèce de demoiselle (Zygoptera) inféodée aux milieux saumâtres arrivent à se développer dans des milieux d’eaux douces. Différents traits d’histoire de vie sont étudiés sous l’influence de la salinité et comparés à une espèce congénère L. sponsa. De l’éclosion ah l’émergence, 830 individus sont suivis et nourris le long d’un gradient de salinité. Nous mesurons chez les larves la survie, la vitesse de croissance, la durée de développement ; chez les adultes, la taille et la masse à l’émergence, le succès d’émergence et de vol. Les résultats ont montré que L. macrostigma est capable de supporter de grande variation de salinité ce qui justifie un caractère d’espèce euryèce et son occupation dans des niches réalisées variées. La salinité a eu un effet sur la survie et le développement, d’autres mécanismes physiologiques/morphologiques seraient à étudier par la suite. / In a context of the ecological evolution, we are trying to find out why L. macrostigma, a species of damselfish (Zygoptera) that is subservient to brackish environments, is also able to grow in freshwater environments. Various features of intrinsic life history are studied under the influence of the salinity and compared to a congenic L. sponsa species. From hatching to emergence, 830 individuals are monitored and fed along a salinity gradient. We measure in larvae survival, growth rate, larval development; in adults, size and mass at emergence, emergence and fly success. The results have shown that L. macrostigma can withstand large variations in salinity, which justifies a Euryec species and its occupation in various niches. Salinity has had an effect on survival and development. Other physiological / morphological mechanisms would be studied later.

Etude de l'influence de l'ordre d'arrivée des espèces dans une communauté végétale sur le germination, la survie et la croissance d'une plante invasive problématique en France (Ambrosia artemisiifolia) (2019)

Tue, 3 Sep 2019 12:05:00

de Nathan Haveneers
Avignon : Université d'Avignon, 2019, 25

Les espèces invasives sont nombreuses en France et sont à l’origine de nombreux problèmes économiques, écologiques ou encore sanitaires, et font l’objet de nombreuses études. Ce rapport est écrit dans le cadre d’une expérience qui vise à étudier l’impact de l’ordre d’arrivée des espèces dans une communauté végétale sur la production de biomasse végétale de cette communauté, et est-ce que cette production de biomasse à un effet sur le succès d’invasion (installation, croissance et survie) d’une espèce invasive problématique en France : Ambrosia artemisiifolia. Pour réaliser cette étude, six types de communautés végétales sont mises en place, au sein desquelles certaines espèces sont semées en avance par rapport aux autres. Les espèces natives choisies pour constituer les communautés sont : Lolium perenne, Dactylis glomerata, Trifolium repens, Onobrychis viciifolia, Plantago lanceolata et Poterium sanguisorba. Aucunes différences significatives n’ont été obtenues entre les communautés pour la germination et la mortalité d’A. artemisiifolia, en revanche des différences significatives pour la production de biomasse racinaire et aérienne sont observées entre les différentes communautés végétales. La croissance de A. artemisiifolia (nombre de feuilles et longueur de la plus grande feuille) semble être réduite par les communautés dans lesquelles L. perenne a été semée en avance, cette communauté ayant produit la biomasse racinaire la plus importante. A. artemisiifolia semble également avoir une croissance ralentie au sein des communautés où toutes les espèces ont été semée en même temps et qui ont produit la biomasse aérienne la plus importante au moment du semis de l’espèces invasive.

Impacts de la gestion de l'eau en Camargue sur les services écosystémiques (2019)

Tue, 3 Sep 2019 11:29:54

de Mélanie Trémoureux
[S.l.] : Université d'Aix-Marseille, 2019, 40

Cette étude se focalise sur le socio-écosystème méditerranéen de la Camargue : Ici, la riziculture, par son apport conséquent en eau douce, pourrait contribuer activement à la conservation de la biodiversité et aux services écosystémiques associés. À travers cette étude, nous avons identifié un ensemble de 16 services écosystémiques afin de déterminer l’impact d’une réduction de l’eau douce sur l’ensemble du socio-écosystème de la Camargue. Les méthodes appliquées incluent le développement d’une représentation visuelle de chacun des services, une recherche bibliographique approfondie, une phase d’échange avec 16 experts scientifiques et techniques dans différents domaines et une phase d’entretiens avec huit acteurs locaux visant à valider les représentations de ces services et à étudier les évolutions de ces derniers dans le contexte de notre scénario.
Cette étude a permis d’identifier et visualiser les flux de services et les éléments principaux (biophysiques, bénéficiaires et responsable de gestion) dont ils dépendent. Les résultats démontrent que la plupart des services sont liés en s’appuyant sur des éléments communs pour leur flux. Ceci démontre bien la complexité du socio-écosystème camarguais. Cette complexité est la source et le facteur moteur de la richesse culturelle et de la biodiversité qui se trouve actuellement en Camargue.

Evaluation de la connectivité hydrobiologique entre le milieu marin et le complexe lagunaire du Vaccarès via les étangs et marais des salins de Camargue (2019)

Tue, 3 Sep 2019 11:03:47

de Maude Parent
Rennes : Agrocampus ouest, 2019, 37

En plein coeur du parc naturel régional de Camargue dans le Sud de la France, d'anciens salins rachetés par le Conservatoire du littoral, les Étangs et Marais des Salins de Camargue (EMSC), constituent actuellement une zone en cours de restauration pour retrouver un fonctionnement plus naturel et jouer à nouveau un rôle tampon face aux tempêtes de la mer et à l'érosion du territoire. Plusieurs séries de travaux hydrologiques sont menées depuis les années 2010 afin d'améliorer les écoulements et faciliter les échanges biologiques entre la mer au sud et l'hydrosystème du Vaccarès au nord. Afin d'évaluer l'efficacité de ces travaux et le degré de connexion entre la mer et le système du Vaccarès via ces EMSC, un suivi mensuel de la macrofaune aquatique a été réalisé d'octobre à juin pendant 3 ans — de 2016 à 2019 - en différents points de ce vaste territoire. L'objectif de ce stage est de développer une méthodologie pour caractériser la connectivité écologique pour les poissons à écailles (actinoptérygiens) et de qualifier et quantifier les potentiels obstacles à la circulation. Différents taxons ont été sélectionnés en se basant essentiellement sur leur utilisation écologique des systèmes lagunaires, leur tolérance à la salinité et leur capacité de nage : une espèce sédentaire supportant70g/tsalinités allant jusqu'à 70g/L, l'athérine (Atherina boyeri), et les juvéniles de 4 taxons migrateurs marins aux caractéristiques biologiques et écologiques contrastées, la civelle (Anguilla anguilla), la dorade royale (Sparte' aurata), la sole commune (Solea solea), et les muges (Liza spp et Mugli cephalus). Une première approche a consisté à catégoriser les conditions hydrologiques et physico-chimiques mesurées en continu à différents ouvrages de connexion afin de caractériser si elles permettent théoriquement le passage des taxons présélectionnés. Dans la deuxième approche, des modèles linéaires généralisés mixtes ont été utilisés pour identifier et quantifier l'influence de différentes covariables abiotiques sur les captures de pêche, considérées en présence/absence — distribution binomiale — ou en CPUE supérieure à zéro — distribution log-normale. Ces deux approches mettent en évidence des points de blocage spatiaux et temporels liés à une conductivité (salinité) trop élevée et, en moindre mesure, à des conditions hydrologiques et météorologiques trop intenses (température, tempête) ou trop faibles (assèchement).

Conservation de la Glaréole à collier (Glareola pratincola) en Camargue (2019)

Thu, 29 Aug 2019 14:00:28

de Xabi Darthayette
Montpellier : Université de Montpellier, 2019, 56

Le suivi à long terme de la population camarguaise a été initié en 2000, afin d’améliorer les connaissances sur la reproduction de l’espèce en Camargue (tendances des effectifs de la population, causes d’échecs de reproduction…), nécessaires à la mise en place de stratégies de conservation et de gestion efficaces.
Chaque année, la première phase du suivi consiste à détecter les colonies de Glaréoles par prospection sur le territoire de la Camargue et ses alentours. En France, les individus reproducteurs arrivent de migration prénuptiale en avril et les couples se forment puis s’installent en colonies à partir du mois de mai sur les sites de nidification. Un site de nidification (aussi appelé site de reproduction) correspond à une zone d’habitat homogène abritant une colonie, caractérisé par la présence d’œufs pondus, que l’on appellera aussi parcelle de nidification. Cette première phase de suivi consistant à rechercher des colonies par prospection s’avère importante, car les Glaréoles colonisent régulièrement de nouveaux sites de reproduction.
La deuxième phase du suivi consiste à évaluer le succès de reproduction des colonies. Lors de cette deuxième phase de suivi, il s’agit alors de dénombrer par recensement à distance, les couples en couvaison, les couples en élevage de poussins et le nombre de poussins.

Le village de la Capelière en Camargue (4 avril 2019)

Mon, 29 Jul 2019 16:08:21

de Corinne Landuré, Gilles Arnaud-Fassetta, Xavier Delestre
Aix-en-Provence : Presses de L'Université de Provence, 4 avril 2019, 456

Le site de la Capelière, localisé en Camargue, sur les rives du Rhône d'Ulmet, l'un des bras majeurs du fleuve dans l'Antiquité, a fait l'objet d'opérations géo-archéologiques menées par une équipe pluridisciplinaire de 1997 à 2002. Au travers de l'analyse de l'ensemble des données archéologiques, environnementales ainsi que des ressources agro-pastorales ou halieutiques, ces travaux illustrent les évolutions culturelles successives de ce village durant une période de dix siècles, du Ve siècle avant notre ère au VIe siècle de notre ère, entrecoupée de moments d'abandon. L'étude critique et comparative de ce village implanté en milieu difficile car inondable montre des évolutions culturelles successives, et permettent de le percevoir comme un poste avancé du commerce d'Arles, regroupement de navigateurs ou passeurs fluviaux, parmi les premiers nautes arlésiens.

Oiseaux nicheurs à la Tour du Valat 1995-2019 (2019)

Wed, 17 Jul 2019 15:14:32

de Tour du Valat
Arles : Tour du Valat, 2019, 2

Dénombrement des communautés d'oiseaux nicheurs sur le domaine de la Tour du Valat 2000-2019 (2019)

Wed, 17 Jul 2019 15:14:26

de Tour du Valat
Arles : Tour du Valat, 2019, 2

Agro-ecological project of Petit Saint-Jean (2019)

Wed, 26 Jun 2019 10:40:25

de Lisa Ernoul, Brigitte Poulin, Marc Thibault
[S.l.] : IUCN Centre for Mediterranean Cooperation, 2019, 46-47

Since 2012, the Tour du Valat has been leading an innovative agro-ecological project in Petite Camargue, on the land of Petit Saint-Jean, which is located in the Gard Camargue, mid-way between Arles and Montpellier, and a few kilometres away from the historic city of Aigues-Mortes. The Petit Saint-Jean estate covers 100 hectares made up of three main components: pine forests (which have mostly disappeared from the rest of the territory) a mosaic of wetlands and sandy agricultural land. The Tour du Valat aims to put in place a showcase of land management practices that demonstrate the compatibility and advantages of integrating agricultural and nature conservation activities. The showcase also includes social and economic components to ensure the sustainability of the actions. The project is based on the principles of agro-ecology and permaculture; two complementary approaches founded on respect of the functioning of natural ecosystems, and in particular taking into account the rich and complex interactions that characterize them, in order to make agricultural production more respectful of the environment as well as more efficient in the long-term. At Petit Saint-Jean, chemical inputs are reduced to a minimum, while the use of renewable energies and materials are favoured (animal traction, solar pump, reuse of biomass, etc.) In the context of climate change, special attention is also given to water use for agricultural irrigation. The use of traditional and innovative water retention practices (mulching, drip, etc.) are being implemented as well as the selection of drought resistant varieties (southern France grape varieties for the vines, fruit trees adapted to Mediterranean climate, for example)

Adaptation of the Camargue’s former saltworks to climate change (2019)

Wed, 26 Jun 2019 10:39:46

de Lisa Ernoul, Brigitte Poulin, Marc Thibault
[S.l.] : IUCN Centre for Mediterranean Cooperation, 2019, 48-49

The area now owned by the Conservatoire du littoral was dyked between 1950-1970 and converted into salt pans. A restoration process through adaptive management was put in place by the Regional Natural Park of the Camargue working in partnership with the Tour du Valat Research Institute, the National Society for Protection of Nature, and the Conservatoire du Littoral. The management methods being set up are intended to create a buffer zone to the sea level rise process induced by climate change and to restore the functionality of the lagoon habitats, taking into account coastal dynamics, restoration of ecosystems (coastal lagoons, Mediterranean halophilous scrubs), the conservation of colonial waterbirds, and the regulation of human activities. It is an opportunity to reinforce the wildness of the coast (rare case in the Mediterranean coastline). An economic benefit is to re-establish the fish migrations, including those of exploited and threatened species such as the European Eel. The on-going restoration and management project started in 2011. Hydraulic works were made in 2014-2015 and in 2019.

Contamination plasmatique chez la Cistude d'Europe dans une zone humide méditerrannéenne (2019)

Mon, 24 Jun 2019 16:56:35

de Louisiane Burkart
Montpellier : Université de Montpellier, 2019, 24

La dégradation des zones humides et l’incidence sur les organismes sont des sujets d’actualité car il s’agit d’écosystèmes menacés subissant de multiples pressions anthropiques. Pour déterminer les niveaux de contamination et l’exposition actuelle des organismes, cette étude propose d’étudier la contamination plasmatique d’une espèce « sentinelle » en Camargue, la cistude d’Europe, par les polluants organiques persistants (POPs) historiques (polychlorobiphényles et pesticides organochlorés) et au N,N-Diéthyl-méta-toluamide (DEET), une substance actuellement utilisée dans les répulsifs anti-moustiques. Nous avons examiné si la concentration et l’occurrence des polluants dans le plasma dépendent des caractéristiques des tortues (sexe, âge, stade croissance), de la période d’échantillonnage et du site de capture. Des prises de sang sont réalisées chez des tortues issues de populations suivies depuis plus de 20 ans au sein de la Réserve Naturelle de la Tour du Valat. Les dosages de polluants sont faits dans des extraits purifiés de plasma à l’aide d’une chromatographie en phase gazeuse et spectrométrie de masse en tandem. Nous observons une différence significative de contamination entre les sites de capture et une corrélation négative de la concentration générale avec l’âge. On ne détecte globalement pas de différence entre mâles et femelles. Les POPs sont retrouvés à l’état de trace et, pour la plupart, en dessous des limites de quantification. Seul le DEET atteint des concentrations élevées (535 ng/mL). Au vu de ces résultats, les prospections de la contamination du plasma des cistudes devraient approfondir la piste du DEET et se concentrer sur des pesticides actuellement utilisés./
The degradation of wetlands and the incidence on organisms are topical issues because wetlands are threatened ecosystems affected by multiple anthropic pressures. To determine the contamination levels and the current exposition of organisms, this study proposes to study the plasmatic contamination of a “sentinel” specie in Camargue, the European pond turtle, by historic persistent organic pollutants (POP) (polychlorobiphenyls and organochlorine pesticides) and by N,N-Diéthyl-méta-toluamide (DEET), a substance currently used in mosquito repellents. We examined if the concentration and the occurrence of pollutants in plasma depends on turtles’ characteristics (gender, age, growth stage), the sampling period and the capture site. Blood samples taken on turtles coming from populations followed for more than 20 years within the Natural Reserve of the Tour du Valat. The dosages of pollutants made in purified plasma extracts obtained by gas chromatography and tandem mass spectrometry. We observe a significant difference of contamination between capture sites and a negative correlation of the global concentration with the age. Difference between male and female is not globally detected. The POP are found as traces and, mostly, under the limits of quantification. Only the DEET reaches high concentrations (535 ng/mL). Following these results, researches of contamination of the turtles’ plasma should explore DEET issues and should focus on currently used pesticides

Influence de l'ordre d'arrivée des espèces dans une communauté végétale sur la résistance à l'invasion (2019)

Mon, 24 Jun 2019 16:19:01

de Benoit de Freitas
[S.l.] : Université de Lille, 2019, 27

Malgré des efforts de prévention et de lutte, le nombre de plantes exotiques envahissantes est en constante augmentation, traduisant un manque d’efficacité des méthodes de contrôle et d’éradication actuelles. Après une perturbation, il est de plus en plus préconisé de restaurer activement un couvert végétal de façon à limiter l’établissement d’espèces exotiques envahissantes. Bien que divers mécanismes contribuent à la résistance à l’invasion, on en sait encore peu sur les effets de priorités générés par l’ordre d’arrivée des espèces dans les communautés végétales. Dans une expérience en serre, nous avons établi des communautés indigènes qui diffèrent par l’ordre d’arrivée des espèces, l’espèce installée en premier ayant quatre semaines d’avance sur le reste de la communauté. Deux semaines après l’établissement de l’ensemble de la communauté, une espèce exotique envahissante commune en France (Ambrosia artemisiifolia) a été introduite. Le succès de son installation, évalué par un suivi de la germination et de la croissance des feuilles, a été évalué en fonction du type de communauté receveuse. Modifier l’ordre d’arrivée des espèces indigènes a impacté la structure des communautés, en terme de contribution des différentes espèces, sans incidence majeure sur la production de biomasse totale de la communauté. Ces différences de structure n’ont pas impacté le taux de germination de A. artemisiifolia mais ont eu une influence sur son développement. Il semblerait en effet que lorsque les Fabaceae s’installent en premier dans un milieu, la communauté limite plus faiblement le développement de A. artemisiifolia qui présente une longueur de feuilles plus importante. Cependant, il est nécessaire d’attendre la fin de l’expérimentation afin d’obtenir davantage de résultats et de pouvoir observer l’influence du développement des communautés dans le temps, les premiers jours n’étant peut-être pas décisifs pour la résistance à l’invasion. /
Despite prevention and control efforts, the number of invasive plants is constantly increasing, reflecting a lack of effectiveness of current control and eradication methods. After a disturbance, it has been increasingly advocated to reassemble a resistant plant community. While many mecanisms contribute to invasion resistance, little is known about priority effects generated by the order in arrival of species in a plant community. In a greenhouse experiment, we established communities that differed in the order of arrival of native species. The first established species had a month ahead of the rest of the community. Three weeks after the establishment of the entire community, an invasive alien species common in France (Ambrosia artemisiifolia) was introduced. The success of its installation, evaluated by monitoring germination and leaf growth, was evaluated according to the type of recipient community. Changing the order of arrival of native species has impacted the community structure, in terms of the contribution of the different species, with no major impact on the total biomass production of the community. These differences of structure do not impact the germination rate of A. artemisiifolia but influenced its development. When Fabaceae are established first, the community limits less the development of A. artemisiifolia which shows a greater leaf length in these communities. However, it is necessary to wait until the end of the experiment in order to obtain more results and to be able to observe the influence of the development of the communities over time, perhaps the first days being not decisive for invasion resistance.

Spring migratory routes and stopover duration of satellite-tracked Eurasian Teals Anas crecca wintering in Italy

Tue, 22 Jan 2019 17:31:33

de Dimitri Giunchi, Natale E. Baldaccini, Alfonso Lenzoni, Paolo Luschi, Michele Sorrenti, Giulia Cerritelli, Lorenzo Vanni
In Ibis, 161(1) (January, 2019), 117-130

Identifying an organism's migratory strategies and routes has important implications for conservation. For most species of European ducks, information on the general course of migration, revealed by ringing recoveries, is available, whereas tracking data on migratory movements are limited to the largest species. In the present paper, we report the results of a tracking study on 29 Eurasian Teals, the smallest European duck, captured during the wintering period at three Italian sites. The departure date of spring migration was determined for 21 individuals, and for 15 the entire spring migratory route was reconstructed. Most ducks departed from wintering grounds between mid-February and March following straight and direct routes along the Black Sea-Mediterranean flyway. The breeding sites, usually reached by May, were spread from central to north-Eastern Europe to east of the Urals. The migratory speed was slow (approximately 36 km/day on average) because most birds stopped for several weeks at stopover sites, mainly in south-eastern Europe, especially at the very beginning of migration. The active flight migration segments were covered at much higher speeds, up to 872 km/day. Stopover duration tended to be shorter when birds were closer to their breeding site. These results, based on the largest satellite tracking effort for this species, revealed for the first time the main features of the migratory strategies of individual Teals wintering in Europe, such as the migration timing and speed and stopover localization and duration.

La Reserve naturelle de la petite Camargue alsacienne, haut lieu du râle d’eau Rallus a. aquaticus en période de reproduction, dans la plaine du Rhin méridionale - Est de la France

Wed, 17 Apr 2019 10:21:50

de Benoît Wassmer
In Annales scientifiques de la Réserve de la Petite Camargue Alsacienne (2018), 1-26

Petite Camargue Alsacienne Nature Reserve, Water Rail top breeding area in the meridional part of the Rhine valley. Water Rail is one of the most poorly known species of the French avifauna. 30 years after the first census in the area, a new survey was conducted from autumn 2013 to summer 2014. Using playback (announcement call referred as «pig squealing»), about 40 % of the responses were duets in spring and summer (n = 179). Cumulative values for the four seasons were 46 % higher than the first time. A difference probably due to a better water level during the breeding period and survival rate after a mild winter. Site fidelity rate 2013-14 compared to 1990-91 was remarkable, reaching 64 and 61 % of inhabited areas in autumn and spring. During the four seasons, the distribution was uniform (0,752 ≤ GMASD ≤ 0,944). The NND (ind. or pairs) has varied significantly between autumn (116,6 ± 61,7 m) and spring (204,7 ± 99,8 m). The lowest density of 0,14 ind. / ha recorded in winter attests to the departure of some of the local birds, females essentially. A minimum of 13 breeding pairs were counted (Kirchenerkopf excluded) but the whole population was probably greater than 20 pairs (about 10% of the Alsatian population). So density was > 0,13 bp. / ha. a higher value having been obtained in the hearth of the area (1 bp. / ha). Water Rail occurred in heterogeneous wet habitat : 78 % of the pairs were established in mixed vegetation Phragmites, Carex and Salix bushes. Water depth was between 1-5 (15) cm. The major component was reed (89 %) than sedge (74 % – cover > 50 % within a 3 m radius observation–plot, n = 27). The laying period has been established from April 15th to August 9th. Observed in mid July, groups of non-flying youngs of different ages was a serious indication of two annual broods. In autumn, an influx of foreign birds could explain a real sensitivity to the intrusion (spontaneous vocalizations in response to the presence of the observer or response as soon as the playback begins). During this season, the sexe ratio was highly biased in favour of males (12,3 : 1). In Alsace, Water Rail is classified Vulnérable in the Red List. In a cross-border conservation strategy, to improve connectivity between small and highly isolated wetlands is of prime importance. Given the reduced extend of wet reedbeds (between 100 and 200 ha in Alsace), recognizing the rule of ecological managment of gravelpits and other waterbodies would be helpfull.

Cartographie des forêts humides dans la région d’El Kala (algérie) à l’aide des outils d’observation de la terre

Thu, 10 Jan 2019 17:01:51

de Asma Kahli, Ghania Belhadj, Elie Gaget, Clément Merle, Anis Guelmami
In La Terre et la Vie, 73(4) (2018), 431-445
En ligne : hdl.handle.net[...]

Les forêts humides sont parmi les écosystèmes humides les plus dégradés et les plus menacés dans le monde. En Algérie, elles représentent un ensemble d’habitats forestiers singuliers, fragiles et rares. La région d’El Kala, à l’extrême nord-est du pays, abrite de nombreuses zones humides uniques (lacs, marais, prairies humides, lagunes, etc.), parmi lesquelles quelques-unes des plus importantes formations de forêts humides en Afrique du Nord. L’objectif de cette étude est de développer une nouvelle approche cartographique afin de localiser et de délimiter ces formations à l’aide des outils d’observation de la Terre. Elle se base sur une combinaison d’indices topographiques et hydro-géomorphologiques, issus des Modèles Numériques de Terrain (MNT), de variables spectrales calculées à partir des images Landsat-8 et de données collectées sur terrain.

Fasciola hepatica-Pseudosuccinea columella interaction: effect of increasing parasite doses, successive exposures and geographical origin on the infection outcome of susceptible and naturally-resistant snails from Cuba

Mon, 29 Oct 2018 16:20:33

de Annia Alba, Antonio A. Vázquez, Jorge Sánchez, David Duval, Hilda M. Hernández, Emeline Sabourin, Marion Vittecoq, Sylvie Hurtrez-Boussès, Benjamin Gourbal
In Parasites & Vectors, 11(1) (October 2018)
En ligne : parasitesandvectors.biomedcentral.com[...]

Pseudosuccinea columella is one of the most widespread vectors of Fasciola hepatica, a globally distributed trematode that affects humans, livestock and wildlife. The exclusive occurrence in Cuba of susceptible and naturally-resistant populations to F. hepatica within this snail species, offers a fascinating model for evolutionary biology, health sciences and vector control strategies. In particular, resistance in P. columella is characterized by the encapsulation of the parasite by host’s immune cells and has been experimentally tested using different Cuban F. hepatica isolates with no records of successful infection. Here, we aimed to explore for the first time, the effect of different parasite doses, successive exposures and different parasite origins on the infection outcomes of the two phenotypes of P. columella occurring in Cuba.

Research studies on herons in the Camargue (Southern France)

Mon, 29 Oct 2018 15:36:10

de Jocelyn Champagnon, Jérémiah Petit, Yves Kayser
In Journal of Heron Biology and Conservation, 3(5) (2018), 13-14
En ligne : www.heronconservation.org[...]

Estimation of Rice Height and Biomass Using Multitemporal SAR Sentinel-1 for Camargue, Southern France

Tue, 4 Dec 2018 09:34:21

de Emile Ndikumana, Dinh Ho Tong Minh, Hai Thu Dang Nguyen, Nicolas Baghdadi, Dominique Courault, Laure Hossard, Ibrahim El Moussawi
In Remote Sensing, 10(9) (2018/9), 1394
En ligne : www.mdpi.com[...]

The research and improvement of methods to be used for crop monitoring are currently major challenges, especially for radar images due to their speckle noise nature. The European Space Agency’s (ESA) Sentinel-1 constellation provides synthetic aperture radar (SAR) images coverage with a 6-day revisit period at a high spatial resolution of pixel spacing of 20 m. Sentinel-1 data are considerably useful, as they provide valuable information of the vegetation cover. The objective of this work is to study the capabilities of multitemporal radar images for rice height and dry biomass retrievals using Sentinel-1 data. To do this, we train Sentinel-1 data against ground measurements with classical machine learning techniques (Multiple Linear Regression (MLR), Support Vector Regression (SVR) and Random Forest (RF)) to estimate rice height and dry biomass. The study is carried out on a multitemporal Sentinel-1 dataset acquired from May 2017 to September 2017 over the Camargue region, southern France. The ground in-situ measurements were made in the same period to collect rice height and dry biomass over 11 rice fields. The images were processed in order to produce a radar stack in C-band including dual-polarization VV (Vertical receive and Vertical transmit) and VH (Vertical receive and Horizontal transmit) data. We found that non-parametric methods (SVR and RF) had a better performance over the parametric MLR method for rice biophysical parameter retrievals. The accuracy of rice height estimation showed that rice height retrieval was strongly correlated to the in-situ rice height from dual-polarization, in which Random Forest yielded the best performance with correlation coefficient R 2 = 0.92 and the root mean square error (RMSE) 16% (7.9 cm). In addition, we demonstrated that the correlation of Sentinel-1 signal to the biomass was also very high in VH polarization with R 2 = 0.9 and RMSE = 18% (162 g·m − 2 ) (with Random Forest method). Such results indicate that the highly qualified Sentinel-1 radar data could be well exploited for rice biomass and height retrieval and they could be used for operational tasks.

Histoire de la vigne sauvage, Vitis vinifera ssp. sylvestris, en Camargue

Mon, 19 Nov 2018 15:57:13

de Annik Schnitzler, Claire Arnold, Frédéric Guibal, Jean-Michel Walter
In Ecologia Mediterranea, 44(1) (2018), 53-66
En ligne : ecologia-mediterranea.univ-avignon.fr[...]

The Eurasian wild grapevine Vitis vinifera ssp. sylvestris ([Gmelin] Hegi) is currently distributed in a few alluvial and colluvial forests around the Mediterranean basin between the 30th and 49th northern parallels, from sea level up to an altitude of 2000m. These areas are refugia where grapevine pest (phylloxera) and fungi diseases (oïdium; mildew) have a restricted spread. These pest and diseases were imported with the American Vitis species at the end of the 19th century. Phylloxera entered floodplains massively thanks to large-scale hydraulic works, which have deprived
riparian forest, dendrochronology,
light dynamics, ecology, genetics, Vitis vinifera ssp.
sylvestris.

Doñana Wetlands (Spain) (2018)

Tue, 2 Mar 2021 17:43:34

de Andy J. Green, Javier Bustamante, Guyonne F. E. Janss, Rocío Fernández-Zamudio, Carmen Díaz-Paniagua, C. Max Finlayson, G. Randy Milton, R. Crawford Prentice, Nick C. Davidson
Dordrecht : Springer Netherlands, 2018, 1123-1136
En ligne : doi.org[...]

The Doñana wetlands in SW Spain constitute what remains of the original 180,000 ha of marshland in the Guadalquivir delta. The natural wetlands are protected in the National Park and World Heritage Site (54,252 ha), and include more than 3,000 temporary dune ponds fed mainly from groundwater and 30,000 ha of seasonal marshes dependent on surface flows. They are particularly famous for their avifauna, and hold more wintering waterfowl than any other European wetland. Wading birds exploit surrounding ricefields and fishfarms, and their breeding numbers are increasing. Doñana holds a high diversity of herpetofauna, mammals, invertebrates and plants, with several endemic species. The wetlands have high value for ecotourism and are the setting for the El Rocío pilgrimage. Alien fish and crayfish have had a significant impact. The quantity and quality of water entering the wetlands is under threat from groundwater extraction and other effects of agricultural and urban development.

Modélisation du devenir des virus Influenza A au sein des zones humides : coupler hydrodynamique et épidémiologie (2018)

Mon, 3 Feb 2020 17:39:09

de Hélène Baudel
Toulouse, France : Université Paul Sabatier, 2018, 29

Les oiseaux sauvages sont le principal réservoir des virus influenza A (VIA) et peuvent les transmettre aux volailles d’élevage, chez lesquelles certaines souches hautement pathogènes entraînent des pertes économiques considérables. La connaissance de la transmission et de la persistance des VIA dans le milieu naturel demeure lacunaire. Nous avons développé un modèle mathématique qui tient compte à la fois de l’épidémiologie des VIA chez leurs hôtes et de leur circulation et persistance dans l’eau. Les paramètres sur lesquels se base notre modèle sont les effectifs de colverts et leur distribution, les volumes d’eau, les températures et salinité de l’eau et la prévalence d’infection virale dans la région Camargue, site majeur d’hivernage pour les oiseaux sauvages. L’originalité du modèle est la précision spatiale et temporelle avec laquelle notre système, l’hydro-système Vaccarès, est décrit. Les résultats suggèrent que la voie de transmission qui influe majoritairement sur la dynamique d’infection sur notre site d’étude est la voie oro-fécale via l’ingestion d’eau contaminée par des fèces de canards infectés. Quelques zones spatialement réduites expliquent la plupart de la dynamique de transmission sur le site, associant effectifs importants et concentration de virus élevée. Les flux d’eau ainsi que les conditions de température et de salinité de l’hydrosystème, extrêmement variables, influent de façon notable sur la dynamique de transmission. Ces résultats soulignent l’importance d’intégrer le compartiment aquatique à la surveillance de la circulation du virus au sein des populations d’oiseaux sauvages afin d’optimiser la détectabilité du virus.

Campagne de surveillance 2017 de l’état DCE des lagunes méditerranéennes oligo- et mésohalines françaises pour la physico-chimie, le phytoplancton et les macrophytes. consolidation de l’indicateur macrophytes (2018)

Thu, 21 Mar 2019 16:43:31

de Patrick Grillas, Samuel Hilaire, Hugo Fontes, Béatrice Bec
Arles : Tour du Valat, 2018, 79

Ce rapport présente le bilan des résultats en 2017 des actions programmées dans le cadre du Suivi des Lagunes Oligo- et Méso-halines. Il concerne les diagnostics de l’eau, du phytoplancton et des macrophytes sur 7 masses d’eau : Campignol, Vendres, Bagnas, Marette, Charnier-Scamandre-Crey, La Palissade et Bolmon.

Les solutions fondées sur la nature dans les anciens salins de Camargue (2018)

Thu, 14 Mar 2019 16:58:41

de Lorena Segura, Marc Thibault, Brigitte Poulin
Arles : Tour du Valat, 2018, 35 (Sciences et gestion)
En ligne : tourduvalat.org[...]

Face aux conséquences des changements climatiques amenées à s’amplifier au cours du 21ème siècle, les solutions fondées sur la nature (Nature-Based Solutions) apparaissent désormais comme un moyen à la fois efficace à long-terme, peu dispendieux pour les finances publiques, et positif pour les milieux naturels d’en limiter les impacts négatifs.
Cette brochure présente plus en détail ce concept de « solutions fondées sur la nature » et détaille la façon dont il est concrètement mis en place dans la zone des étangs et marais des anciens salins de Camargue, par les gestionnaires du site dont la Tour du Valat fait partie

Comptage des oiseaux d’eau à la mi-janvier en france résultats 2018 - Annexes (2018)

Thu, 14 Mar 2019 12:04:07

de Clémence Gaudard, Gwenael Quaintenne, Jérémy Dupuy
Rochefort : LPO, 2018, 22
En ligne : www.lpo.fr[...]

Les Solutions fondées sur la Nature pour lutter contre les changements climatiques et réduire les risques naturels en France (2018)

Fri, 15 Feb 2019 15:21:47

de UICN France
[S.l.] : UICN France, 2018, 48
En ligne : ofb.gouv.fr[...]

Dans le prolongement de son document produit à l’occasion de la COP214, le Comité français de l’UICN présente ici de façon plus détaillée le concept de Solutions fondées sur la Nature dans le cadre de la lutte contre les changements climatiques et de la réduction des risques naturels, et illustre ce concept par différentes initiatives menées sur le territoire français afin de dégager des recommandations pour faciliter la mise en place de ces solutions.

Limicoles séjournant en France (littoral) 2018 (2018)

Fri, 1 Feb 2019 13:58:13

de Roger Maheo, Sophie Le Dréan Quenech’du
[S.l.] : Wetlands International (NLD) & Office National de la Chasse et de la Faune Sauvage, 2018, 50p ill cartes tabl

Nature-based solutions in the Camargue’s former saltworks (2018)

Thu, 24 Jan 2019 11:37:42

de Lorena Segura, Marc Thibault, Brigitte Poulin
Arles : Tour du Valat, 2018, 40 (Sciences et gestion)
En ligne : tourduvalat.org[...]

In order to mitigate the consequences of climate change that are predicted to increase in the 21th century, Nature-Based Solutions appear more and more as an efficient answer on a long-term basis, economical for public finances, and positive for natural ecosystems.
This leaflet introduces to this concept and presents the way it is implemented in the Lagoons and Marshes on the former Camargue Saltworks by the managers of the site, of which the Tour du Valat.

Dynamique de la fasciolose dans un système fortement anthropisé : la Camargue / (2018)

Wed, 16 Jan 2019 16:30:42

de Emeline Sabourin
[S.l.] : Université Montpellier, 2018
En ligne : tel.archives-ouvertes.fr[...]

L’émergence et la ré-émergence de maladies que nous connaissons depuis ces cents dernières années représentent une véritable crise sanitaire en grande partie due aux perturbations anthropiques qui modifient les écosystèmes et les interactions entre les parasites et leurs hôtes. La prévention et le contrôle des maladies infectieuses nécessitent la compréhension de leur dynamique dans l’ensemble des compartiments dans lesquels elles circulent. Parmi ces maladies, la fasciolose est une maladie particulièrement sensible aux changements liés à l’Homme. Cette zoonose causée par le parasite Fasciola hepatica, est communément reconnue comme un problème vétérinaire, mais aussi de santé publique, dans certaines régions du monde. Notre étude vise à comprendre la dynamique de circulation et les risques d'émergence de la fasciolose dans un contexte de forte anthropisation. Il s'agit (1) d'étudier la dynamique de l’hôte intermédiaire, un mollusque de la famille des lymnaieidae. (2) de comprendre la dynamique et la diversité du parasite entre et au sein de ses différents compartiments hôtes définitifs. Ces travaux ont été menés sur le territoire camarguais sur le domaine de la Tour du Valat, nous permettant d’avoir accès aux hôtes définitifs, sauvages (ragondins et sangliers), domestiques (taureaux traités et non traités) et à l’hôte intermédiaire, Galba truncatula appelé communément limnée tronquée. Dans un premier temps, nous avons caractérisé la végétation des habitats favorables à la présence du mollusque et nous avons trouvé que les mares semblaient être des zones présentant un risque plus important que les canaux d’irrigation pour la transmission de la fasciolose. Puis, nous nous sommes intéressée à l’influence des habitats sur la dynamique de G. truncatula par des approches de génétique des populations. Nos résultats ont permis de montrer que la permanence des habitats et la connectivité influencent le mode de reproduction, la structuration des populations et la dispersion des limnées en Camargue. Dans un second temps, nous avons étudié la dynamique et la circulation du parasite au sein du compartiment hôte définitif. Nos résultats de la génétique des populations du parasite chez les hôtes définitifs, nous ont indiqué qu’il existait sur notre site d’étude plusieurs sites de transmission constituant un seul grand foyer global. Par ailleurs, l’étude de la circulation du parasite entre les hôtes définitifs suggère le rôle des sangliers dans la dispersion de la maladie et le rôle des ragondins dans le maintien du cycle de la fasciolose. Cette étude met en évidence l’intérêt de mener des études à long terme et l’importance de prendre en compte tous les compartiments impliqués pour comprendre l’épidémiologie d’une maladie. Elle souligne également le rôle des activités humaines et de l’écosystème dans la dynamique de la fasciolose. Le but final de cette étude est de proposer une gestion intégrée adaptée au contexte camarguais afin de limiter l’impact sanitaire de la fasciolose mais aussi des autres maladies liées à l’élevage dans cette région. / he emergence and re-emergence of diseases encountered over the last hundred years represent a real health crisis largely due to anthropic disturbances that affect the ecosystems as well as the interactions between parasites and hosts. The prevention and control of emerging infectious diseases require an in-depth understanding of their dynamics in all the compartments in which they occur. Among these diseases, Fasciolosis is particularly sensitive to human related changes. This zoonosis caused by the parasite Fasciola hepatica, is commonly recognized as a veterinary problem and major public health issue in certain countries. Our study aims to understand the circulation dynamics and risks of fasciolosis emergence in a context of high anthropization. Our objective is (1) to study the dynamics of the intermediate host, a mollusc of the lymnaieidae family. (2) to understand the dynamics and diversity of the parasite between and within its different definitive host compartments. This work was carried out in the Camargue in the Tour du Valat estate, allowing us to have access to the definitive hosts, wild (nutria and wild boars), domestic (treated and untreated bulls) and the intermediate host, Galba truncatula. First, we characterized the habitats that are favorable to the intermediate host G. truncatula, presence in Camargue and we found that ponds appear to be areas of higher risk than irrigation channels for fasciolosis transmission. Then, we became interested in the influence of habitats on the dynamics of G. truncatula through population genetics approaches, our results showed that habitat permanence and connectivity influence the reproduction mode, population structure and dispersal of G. truncatula in the Camargue. In a second step, we studied the dynamics and circulation of the parasite within the definitive host compartment. Our results of the population genetic analyses of definitive hosts indicated that there were several transmission sites on our study area that constituted a single large global outbreak. In addition, the study of the circulation of the parasite between wildlife and domestic animals suggests the role of wild boars in the spread of the disease and the role of nutrias in maintaining the fasciolosis cycle. Our work highlights the value of long term studies and the importance of taking into account all the compartments involved to understand the epidemiology of a disease. They also emphasize the role of human activities and ecosystem in the dynamics of fasciolosis. The ultimate goal of this study is to propose integrated management measures adapted to the Camargue context in order to limit the health impact of fasciolosis and other livestock diseases in the region.

Importance des politiques de conservation pour faciliter l'ajustement des communautés d'oiseaux d'eau hivernants au réchauffement climatique en Méditerranée (2018)

Wed, 16 Jan 2019 16:30:12

de Elie Gaget
Paris : Muséum national d'histoire naturelle, 2018, 205
En ligne : www.theses.fr[...]

Les activités humaines menacent gravement la biodiversité. Sous le terme de changements globaux, la sur-exploitation des populations et la destruction/dégradation des habitats arrivent en tête de liste des facteurs responsables de l’érosion de la biodiversité. Le changement climatique gagne en magnitude et ajoute une pression supplémentaire sur les espèces. En réponse à l’augmentation des températures du globe, les communautés se réorganisent suite au déplacement de la distribution géographique des espèces vers les pôles. Mais l’accumulation des pressions anthropiques est susceptible de produire des effets d’interaction limitant l’ajustement des communautés au réchauffement climatique. Dans ce contexte critique, la biologie de la conservation a pour but de concilier les activités humaines avec la conservation de la biodiversité. Dans cette thèse j’ai cherché à comprendre comment l’accumulation des pressions anthropiques peut limiter l’ajustement des communautés au réchauffement climatique et à identifier les solutions qui pourraient être mises en place pour faciliter leur adaptation à ce réchauffement. J’ai pris pour modèle d’étude les espèces d’oiseaux d’eau hivernants dans les pays du bassin méditerranéen. Ces espèces emblématiques bénéficient d’un dénombrement international destiné à suivre leurs populations en réponse aux prélèvements par la chasse et à la dégradation des zones humides dont elles dépendent. La Méditerranée est une région fortement anthropisée où l’utilisation des ressources naturelles exerce d’importantes pressions sur les zones humides et leur biodiversité. En réponse, les pays ont différentes stratégies pour protéger ces écosystèmes, ce qui fait de cette région un plan expérimental intéressant pour mesurer l’impact dans changements globaux sur l’assemblage des espèces en fonction des mesures de conservation mises en oeuvre. En étudiant la réponse des communautés au réchauffement climatique sous un gradient de perte/dégradation d’habitat, je montre que l’ajustement des communautés est réduit, voire empêché, par la dégradation des zones humides. La Convention Ramsar vise justement à protéger les zones humides et leur biodiversité en maintenant une exploitation raisonnée des ressources naturelles. En évaluant l’effet de cette convention, je montre que son efficacité à conserver les populations d’oiseaux est dépendante de l’implémentation d’autres outils de protection, mais que son rôle est crucial dans les pays où la législation environnementale est faible. Enfin, j’évalue la capacité des conventions internationales à faciliter l’ajustement des communautés au réchauffement climatique grâce à la réduction des pressions qui s’exercent sur les populations. J’ai comparé la réponse des communautés entre les pays ayant ratifié la Convention de Berne, ceux ayant engagé son application strictement réglementaire sous la Directive Oiseaux (Union Européenne) et ceux n’ayant pas ratifié ces conventions. Le résultat est clair, plus la réglementation est précise et strictement réglementaire, plus les communautés et les espèces strictement protégées s’ajustent à l’augmentation des températures.
En conclusion, les activités humaines sont une menace pour la biodiversité, mais les mesures de conservation, en réduisant les pressions sur les populations facilitent leur adaptation au changement climatique. La conservation des oiseaux d’eau nécessite une collaboration internationale et l’établissement de lois strictement réglementaires protégeant les zones humides et les espèces, tout en assurant une utilisation durable des ressources.

Suivi de la reproduction de la Glaréole à collier Glareola pratincola en Camargue et ses environs et actions de conservation pour l’année 2018 (2018)

Wed, 12 Dec 2018 13:33:53

de Yves Kayser
Arles : Tour du Valat, 2018, 24 p.

La Glaréole à collier Glareola pratincola présente une aire de reproduction morcelée, centrée sur le bassin méditerranéen
En France, l’essentiel de la population se trouve en Camargue et ses environs.
Ce document présente les résultats obtenus lors du suivi de la reproduction de l’année 2018. Les données récoltées sont comparées à celles des années précédentes. Il aborde également quelques aspects liés à la conservation de l’espèce avant de conclure sur les principaux éléments de la nidification de 2018 et sur les perspectives à venir.

Analyse critique du jeu d’indicateurs de la réunion thématique "Milieux humides" de l’Observatoire national de la biodiversité (2018)

Mon, 15 Oct 2018 14:11:51

de Christian Perennou
Arles : Tour du Valat, 2018, 52

Le Ministère en charge de l'Ecologie pilote et anime le 3ème Plan national d'action en faveur des milieux humides, dont l'une des actions est le développement d’indicateurs « Milieux humides » par l’Observatoire national de la biodiversité (ONB). Au sein de l’ONB, et notamment de sa Réunion thématique « Milieux humides » (RT-MH), des indicateurs « Milieux humides » sont en cours de développement depuis 2013, afin de suivre l'évolution de ces milieux et d'orienter les décisions en faveur de leur conservation et de leur gestion durable. Sont notamment visés le bon état des fonctions, les processus de fonctionnement et les services qu’ils soutiennent. Dix-neuf indicateurs ont été développés à ce jour, et figurent au site web des indicateurs ONB1 (dont neuf sont strictement issus de la RT-MH). Cinq ans après le début du développement de ces indicateurs, le ministère a confié en 2017 à la Tour du Valat, qui coordonne l’Observatoire des Zones Humides Méditerranéennes, une analyse critique du jeu d’indicateurs « Milieux humides » de l’ONB assortie de propositions d’évolution – sans pour cela lancer d’enquête large -, demande à laquelle répond ce rapport.

Nuisibles d’hier et d’aujourd’hui : le lapin, le sanglier et le flamant dans la réserve de biosphère de Camargue. (2018)

Tue, 9 Oct 2018 11:12:21

de Raphael Mathevet, Anthony Olivier, Arnaud Béchet
Rennes, France : Presses Universitaires de Rennes, 2018, 173-187

Dans le cadre d'un travail à long terme sur les rapports homme/nature et sur l'histoire de la chasse en Camargue, cette communication propose une approche historique et socioécologique de la notion de nuisible, à travers l'analyse comparée de trois espèces animales qui alimentent régulièrement la chronique camarguaise : le lapin de garenne(Oryctolagus cuniculus, le sanglier (Sus scrofa) et le flamant rose(Phoenicopterus roseus.

Mediterranean Wetlands: a Gradient from Natural Resilience to a Fragile Social-Ecosystem (2018)

Thu, 27 Sep 2018 11:57:22

de Ilse R. Geijzendorffer, Thomas Galewski, Anis Guelmami, Christian Perennou, Nadège Popoff, Patrick Grillas
[S.l.] : Springer International Publishing, 2018
En ligne :

Which ecosystem services are addressed? Hazard regulation (flooding) is the most important one For the rest we mention: Provisioning: fishing, freshwater Regulating: habitats for biodiversity Cultural: bird watching

What is the research question addressed?
How is the resilience of ecosystem services provided by Mediterranean wetlands changing over time?

Which method has been applied? Literature review

What is the main result?
Examples of how different aspects of ES flows are being affected on the one hand through changes in the ecosystems and on the other hand through changes in the societal demand What is concluded, recommended? The general trends of declining biodiversity and reducing water availability, as well as an increase in demand for ecosystem services, make Mediterranean wetlands and the people that depend on them less resilient and increasingly exposed and vulnerable to physical and economical hazards that naturally occur in the Mediterranean basin

Etude de la variabilité temporelle de l’écologie trophique du silure glane (Silurus glanis) et de l’anguille européenne (Anguilla anguilla) dans un canal de drainage en Camargue (2018)

Tue, 25 Sep 2018 14:36:13

de Stéphane Mutel
Tours (France) : Polytech Tours, 2018, 35

La présente étude se propose d’analyser la variation temporelle de l’écologie trophique du silure et de l’anguille dans un canal de drainage en Carmargue. Tout au long de l’année 2017, les poissons du canal ont été échantillonnés afin d’obtenir leurs ratio isotopiques. A partir des ratios isotopiques nous avons pu évaluer la variabilité des niches trophiques et des régimes alimentaires du silure et de l’anguille, en fonction des saisons et des classes de tailles. Les analyses relèvent une compétition trophique importante sur les écrevisses de Louisiane entre les deux espèces. La mise en place d’un plan de régulation du silure sur une portion du canal en 2009 permet d’envisager un impact indirect d’une densité élevée de silure sur les anguilles. Ces derniers pourraient entrainer la modification du comportement alimentaire des anguilles. Ces observations seront à vérifier à l’aide des données de 2018, incluant notamment un échantillonnage plus large et se basant sur une année humide contrairement à l’année 2017 qui fût particulièrement sèche.

Tolypella salina (2018)

Thu, 20 Sep 2018 12:02:58

de Jean-Baptiste Mouronval
[S.l.] : Biotope, 2018, 389-390 (Flores remarquables)
En ligne : www.leclub-biotope.com[...]

Tolypella hispanica (2018)

Thu, 20 Sep 2018 12:01:52

de Jean-Baptiste Mouronval
[S.l.] : Biotope, 2018, 387 (Flores remarquables)
En ligne : www.leclub-biotope.com[...]

Chara galioides (2018)

Thu, 20 Sep 2018 12:00:29

de Jean-Baptiste Mouronval
[S.l.] : Biotope, 2018, 386 (Flores remarquables)
En ligne : www.leclub-biotope.com[...]

Les characées, des algues singulières (2018)

Thu, 20 Sep 2018 11:47:56

de Jean-Baptiste Mouronval
[S.l.] : Biotope, 2018, 384-85 (Flores remarquables)
En ligne : www.leclub-biotope.com[...]

Zostera noltei (2018)

Thu, 20 Sep 2018 11:45:32

de Patrick Grillas, Hugo Fontes, Nicole Yaverkovski, Charles F. Boudouresque
[S.l.] : Biotope, 2018, 382-383 (Flores remarquables)
En ligne : www.leclub-biotope.com[...]

Zostera marina (2018)

Thu, 20 Sep 2018 11:36:48

de Patrick Grillas, Hugo Fontes, Nicole Yaverkovski, Charles F. Boudouresque
[S.l.] : Biotope, 2018, 380-381 (Flores remarquables)
En ligne : www.leclub-biotope.com[...]

Teucrium aristatum (2018)

Thu, 20 Sep 2018 11:34:03

de Nicole Yavercovski, Henri Michaud, Patrick Grillas, Bénédicte Meffre
[S.l.] : Biotope, 2018, 354 (Flores remarquables)
En ligne : www.leclub-biotope.com[...]

Scorzonera parviflora (2018)

Thu, 20 Sep 2018 11:30:51

de Hugo Fontes, Patrick Grillas
[S.l.] : Biotope, 2018, 339-340 (Flores remarquables)
En ligne : www.leclub-biotope.com[...]

Pulicaria sicula (2018)

Thu, 20 Sep 2018 11:27:20

de Hugo Fontes, Patrick Grillas
[S.l.] : Biotope, 2018, 300 (Flores remarquables)
En ligne : www.leclub-biotope.com[...]

Lythrum tribracteatum (2018)

Thu, 20 Sep 2018 11:23:45

de Charlotte Ravot, Antoine Gazaix, Hugo Fontes, Patrick Grillas
[S.l.] : Biotope, 2018, 300 (Flores remarquables)
En ligne : www.leclub-biotope.com[...]

Lythrum thymifolia (2018)

Thu, 20 Sep 2018 11:22:40

de Charlotte Ravot, Antoine Gazaix, Hugo Fontes, Patrick Grillas
[S.l.] : Biotope, 2018, 299 (Flores remarquables)
En ligne : www.leclub-biotope.com[...]

Imperata Cylindrica (2018)

Thu, 20 Sep 2018 11:15:50

de Hugo Fontes
[S.l.] : Biotope, 2018, 278 (Flores remarquables)
En ligne : www.leclub-biotope.com[...]

Gagea lacaitae (2018)

Thu, 20 Sep 2018 11:10:49

de Hugo Fontes
[S.l.] : Biotope, 2018, 266 (Flores remarquables)
En ligne : www.leclub-biotope.com[...]

Gagea apulica (2018)

Thu, 20 Sep 2018 11:07:01

de Hugo Fontes
[S.l.] : Biotope, 2018, 264 (Flores remarquables)
En ligne : www.leclub-biotope.com[...]

Callitriche lenisulca (2018)

Thu, 20 Sep 2018 10:57:41

de Patrick Grillas
[S.l.] : Biotope, 2018, 220 (Flores remarquables)
En ligne : www.leclub-biotope.com[...]

Le Rhône (2018)

Thu, 20 Sep 2018 10:39:47

de Hugo Fontes, Célia Grillas, Nicole Yavercovski, Patrick Grillas
[S.l.] : Biotope, 2018, 72-78 (Flores remarquables)
En ligne : www.leclub-biotope.com[...]

La Camargue et le golfe de Fos (2018)

Wed, 19 Sep 2018 17:14:06

de Hugo Fontes, Nicole Yaverkovski, Patrick Grillas
[S.l.] : Biotope, 2018, 56-71 (Flores remarquables)
En ligne : www.leclub-biotope.com[...]

Opérationnalisation de l'indicateur de suivi des services culturels, récréatifs et éducatifs, des zones humides en Méditerranée : Analyse des résultats sur 19 sites (2018)

Fri, 14 Sep 2018 16:39:27

de Soukaina Anougmar
[S.l.] : Institut Agronomique Méditerranéen Montpellier, 2018, 100

La présente étude représente la continuité du travail M2 sur le « La mise en œuvre du suivi de l’indicateur des services culturels des zones humides en Méditerranée ». Elle a pour objectif d’analyser les résultats d’opérationnalisation de cet indicateur. Ce dernier, élaboré en 2016, est basé sur l’approche des capitaux multiples portant sur: un capital naturel (représenté par la zone humides disposant d’un centre d’accueil de visiteurs), un capital construit (représenté par les infrastructures et services proposés par les gestionnaires des sites sur la zone humide), un capital humain et un capital social. L’objectif de l’indicateur est de mesurer l’impact des capitaux naturel et construit (capitaux de condition) sur les capitaux humain et social (capitaux d’impact).
Cette étude porte sur 19 zones humides, réparties sur 10 pays dans 4 sous-régions méditerranéennes. Elle est basée sur la conduite de deux types d’enquêtes : avec le(s) gestionnaire(s) et avec les visiteurs des sites. Les données des questionnaires sont analysées sur deux niveaux : un niveau agrégé à l’échelle régionale méditerranéenne et à l’échelle sous-régionale (Moyen Orient, Maghreb, Union Européenne et Balkans) et un niveau désagrégé par site.
Au niveau agrégé, l’analyse porte sur le calcul de l’indice moyen sur les 19 sites qui est de l’ordre de 0.671. Les indices par sous-régions et par sites sont comparés à cet indice moyen pour avoir une idée sur leurs performances et la compactibilité de leurs résultats avec la logique de construction de l’indicateur. Pour le niveau désagrégé, l’analyse porte sur les 12 variables qui composent l’indicateur dans trois sites : Réghaia en Algérie, Anjar Kfar Zabad au Liban et Ghar el Melh en Tunisie. Cette analyse montre les capitaux de performance de l’indicateur./

This study represents the continuity of the M2 on the "Implementation of the monitoring of the indicator of cultural services of wetlands in the Mediterranean". It aims to analyze the results of operationalization of this indicator. The latter, developed in 2016, is based on the multi-capital approach. This approach gathers four types of capitals: natural capital (represented by wetlands with a visitor center), constructed capital (represented by infrastructure and services proposed by site managers in the wetland), human capital and social capital. The objective of the indicator is to measure the impact of natural and constructed capital (conditional capital) on human and social capital (impact capital).
This study covers 19 wetlands spread over 10 countries in 4 Mediterranean sub-regions. It is based on two types of surveys: with the manager (s) and with the visitors of the sites. The data is analyzed on two levels: an aggregated level at the Mediterranean and sub-regional scales (Middle East, Maghreb, European Union and Balkans) and a level disaggregated by site.
At the aggregate level, the analysis focuses on the calculation of the average index on the 19 sites (0.671). Indexes by sub-regions and by sites are compared to this average index to get an idea on their performance and the compactibility of their results with the construction logic of the indicator.
For the disaggregated level, the analysis covers the 12 variables of the indicator in three sites: Réghaia in Algeria, Anjar Kfar Zabad in Lebanon and Ghar el Melh in Tunisia. This analysis level shows the performance capital of the indicator.

Rôle des macrophytes dans la restauration des milieux lagunaires : successions écologiques (2018)

Mon, 11 Jun 2018 16:09:49

de Ines Le Fur
Montpellier : Université de Montpellier, 2018, 224
En ligne : www.theses.fr[...]

La prise de conscience des risques liés à la dégradation de la qualité des milieux lagunaires vis-à-vis de l'eutrophisation a abouti à la mise en œuvre d'actions de gestion visant à réduire les apports en nutriments. Certaines lagunes sont aujourd'hui en phase de restauration, avec une amélioration notable de la qualité de l'eau liée notamment à la réduction des biomasses phytoplanctoniques. En revanche, la réponse des macrophytes benthiques semble plus complexe et non linéaire. A travers une approche complémentaire basée sur l'analyse statistique des données d'observations acquises de 1998 à 2015 et sur des mesures in situ, cette thèse vise à identifier la dynamique temporelle et spatiale des macrophytes ainsi que leur rôle fonctionnel au cours du processus d'oligotrophisation. Au sein des lagunes méditerranéennes, la salinité et les teneurs en nutriments dans la colonne d'eau sont les principaux paramètres qui structurent la distribution des macrophytes benthiques. L'analyse statistique menée sur 21 lagunes polyhalines et euhalines a permis d'illustrer les premières étapes de restauration. La réduction des apports externes a conduit à un basculement rapide (3-4 ans) d'un système totalement dominé par le phytoplancton vers un système dominé par les macroalgues opportunistes et notamment les ulves. La réduction de la disponibilité en azote dans la colonne d'eau liée au développement des ulves favoriserait le développement des gracilaires (algue rouge) et des chaetomorphes (algue verte filamenteuse). Bien plus que la seule conséquence de la restauration, la présence d'espèces clés jouerait ainsi un rôle central dans la restauration en régulant les flux d'azote et de phosphore au sein du système et en créant les conditions favorables à l'apparition d'autres espèces plus pérennes. Bien que notre théorie décrive une tendance vers le retour des macrophytes pérennes pour les trajectoires de re-oligotrophisation, nous n'avons pas encore pu documenter ce retour dans les lagunes après une longue période d'absence. Ceci, montre l'importance de prendre en compte, entre autres, l'importance des sources internes d'éléments nutritifs et de la connectivité pour la recolonisation des angiospermes dans les lagunes. / The growing awareness of the negative impacts of the degradation of the water quality in coastal lagoons because of eutrophication has resulted in public action aiming at the reduction of the nutrient loadings into these lagoons. Hence, some of these coastal lagoons are currently undergoing ecological restoration and have shown a clear improvement of their water quality linked to decreasing phytoplankton biomass in the last 10 years. However, the response of the benthic macrophytes appears more complex, particularly by showing non-linear behaviour. By using complementary approaches including statistical analyses of long-term observations (1998-2015) and in situ measurements, this thesis aims to describe the dynamics of the macrophytes in space and time and to study their functional role during the oligotrophication process. Salinity, depth and nutrient concentrations in the water column represent the main factors that statistically explain the distribution of the benthic macrophyte communities in Mediterranean coastal lagoons. The first steps of the ecological restoration in eutrophied polyhaline and euhaline lagoons has been inferred from the statistical analysis of time series in 21 coastal lagoons. The reduction of the external nutrient loading results in a rapid regime shift (3-4 years) from a phytoplankton-dominated system to a macroalgae-dominated system, with particularly Ulva species. The decreasing inorganic nitrogen concentrations due to uptake by Ulva spp. in the water column appears to facilitate the development of Gracillaria spp. (red algae) and Chaetomorpha spp. (green filamentous algae). While the appearance of these macroalgal species is the result of the ecological restoration, these species also play a central role in this process by regulating the biogeochemical element fluxes. This way these species create more favourable conditions for perennial species. Although for re-oligotrophication trajectories in coastal lagoons our theory describes a tendency towards the return of perennial species, so far, we have not been able to document their return after a long period of absence. This shows, that among other factors, the internal nutrient loading and ecological connectivity are important factors to take into account for the recolonization of angiosperms in coastal lagoons.

Insights on dispersal and recruitment paradigms: sex- and age-dependent variations in a nomadic breeder

Wed, 14 Feb 2018 17:03:49

de Paul Acker, Charlotte Francesiaz, Arnaud Béchet, Nicolas Sadoul, Catherine M. Lessells, Agata S. Pijl, Aurélien Besnard
In Oecologia, 186(1) (2018), 85-97
En ligne : link.springer.com[...]

Sex- and age-dependence in recruitment and dispersal are often explained by costs arising from competition for holding a breeding territory over the years—a typical feature of species living in stable habitats. For instance, long-lived birds with male territoriality often exhibit large variation in recruitment age and higher dispersal in females and young individuals. As a corollary, we expected that species with ephemeral habitat suitability, and hence nomadic breeding, would show weak age- and sex-dependence in dispersal and low variation in recruitment age, because territory ownership is not maintained over the years. In addition, the higher cost of reproduction in females might not be (over)compensated for by costs of territoriality in males. Accordingly, females would recruit later than males. We explored these variations using multievent capture–recapture models over 13 years, 3479 (2392 sexed) slender-billed gulls (Chroicocephalus genei) and 45 colony sites along the French Mediterranean coast. As expected, variability in recruitment age was low with males recruiting earlier than females. Nonetheless, dispersal in and out of the study area decreased with age and was slightly higher in males than in females. Decreased dispersal with age might result from foraging benefits associated with increased spatial familiarity. Higher dispersal in males might be explained by a male-biased sex ratio or higher philopatry benefits in females (arising from their higher cost of reproduction). Sex- and age-dependent dispersal and recruitment may thus occur in the absence of year-to-year breeding territory ownership, which stresses the importance of considering other processes in shaping recruitment and dispersal patterns.