Flamands roses

Dynamique spatiale et temporelle littorale de la Réserve de Camargue (2026)

Wed, 28 Oct 2026 15:44:14

de Elodie Potier
La Rochelle : Université de La Rochelle, 2026, 127

Les côtes sableuses représentent 26 % du linéaire côtier méditerranéen en France. Elles sont très fragmentées dans la partie orientale de la région PACA, où l’on trouve plutôt des plages de poches. La majeure partie des cordons dunaires sont situés sur les côtes languedociennes et à l’ouest des Bouches du Rhône, ainsi que le long de la plaine orientale de Corse (UICN, 2020). L’enjeu est donc fort sur la Réserve de Camargue de comprendre et préserver un système littoral sableux aujourd’hui protégé des pressions urbanistiques et touristiques. Le présent travail a permis à la fois de valoriser des connaissances existantes sur la Réserve, de produire des jeux de données actualisés et utilisables et de poser les bases d’un suivi à long terme. Ce dernier pourrait consister en trois volets : - la poursuite des suivis topographiques plages et dunes par la technique validée dans le présent travail, avec une fréquence annuelle ou saisonnière (avant/après tempêtes) - l’actualisation régulière (tous les 10 ans par exemple) des données LiDARs et ortho photos produites afin de surveiller l’évolution des variables retenues comme pertinentes (volumes de sable des dunes et barycentres des masses de sable, dynamiques d’érosion/accrétion, surface couverte par la végétation) en reproduisant les méthodes ici établies - L’entretien des ganivelles et le suivi de leur impact sur l’apport sédimentaire des dunes et leur couvert végétal 56 Par ailleurs, les données produites pourront constituer la base de futurs travaux complémentaires sur la gestion des ganivelles et l’impact éolien notamment. Naturellement dynamiques, les dunes et les plages se situent aujourd’hui dans un contexte de changement climatique, avec en particulier la montée du niveau marin et l’augmentation d’événements extrêmes (tempêtes). Actuellement, une stratégie littorale est en cours d’élaboration en Camargue, portée par le SYMADREM. Avec un volet submersion et un volet trait de côte, les orientations globales de gestion influenceront le littoral de la Réserve. Pour le gestionnaire de la Réserve, il apparait nécessaire de poursuivre l’installation et l’entretien de ganivelles dans les zones d’érosion. Ainsi, le stage aura permis de mettre à jour et de développer une base de données destinée au suivi des profils topographiques, ainsi qu’en posant les bases d’étude de la géomorphologie du littoral de la Réserve et de l’évolution de son couvert végétal.

Etude des facteurs influençant la dynamique de population de la Glaréole à collier (Glareola pratincola) en Camargue, issus de 25 années de suivi (2026)

Mon, 31 Aug 2026 16:43:28

de Alexis Cartier
Rennes : Université de Rennes, 2026, 33

La Camargue est l’une des plus vastes zones humides méditerranéennes (150 000 hectares), abritant une richesse exceptionnelle d’espèces à enjeu de conservation. Ces habitats restent malgré tout soumis aux activités anthropiques, la majorité restant exploitée par des acteurs privés. La Glaréole à collier est un oiseau limicole se reproduisant en France uniquement en Camargue, nichant à même le sol sur des habitats agricoles (labours) ou naturels (sansouires), rendant la réussite de la reproduction très dépendante des dérangements humains ou naturels. De faible effectif, la population nicheuse française est suivie tous les ans depuis 2000, témoignant ainsi de l’évolution des effectifs reproducteurs sur les 25 dernières années. Des actions de sensibilisation et de protection ont été entrepris au cours de cette période afin de favoriser la reproduction des oiseaux sur des colonies exemptes de dérangement. L’objectif de cette étude était d’analyser la tendance de la population camarguaise au cours de ces 25 dernières années et de comprendre les facteurs principaux influençant cette tendance. Ainsi, les résultats ont montré une croissance annuelle de la population française de 4,3±0,3%, avec une récente explosion de la population par 2 sur les cinq dernières années, passant de 94 couples en 2020 à 205 couples en 2026. Si l’augmentation de l’utilisation des sites protégés pour la nidification couplée à l’efficacité des mesures de protection et de sensibilisation, bénéfiques à l’augmentation du succès reproducteur semblent pouvoir expliquer en partie la croissance observée, d’autres facteurs semblent plus influents dans la tendance observée. La mise en place d’une analyse matricielle a révélé la contribution plus importante de la survie adulte, par rapport au succès reproducteur ou la survie juvénile sur les taux de croissance asymptotiques observés entre 2008 et 2020. La survie adulte, dépendante des conditions climatiques hivernales au Sahel semble être le facteur majeur influençant la dynamique de la population française.

Bilan carbone d'un institut de recherche : approche combinée Labos 1point5 et diagnostic agricole (2026)

Mon, 31 Aug 2026 16:43:17

de Massinissa Sadji
Toulouse : Université de Toulouse, 2026, 25

Le changement climatique, largement dû aux émissions anthropiques de gaz à effet de serre, impose aux organisations d’évaluer leur empreinte carbone pour orienter leur actions de réduction. Ce stage a eu pour objectif de réaliser le premier bilan carbone des émissions de gaz à effet de serre de la Fondation Tour du Valat (TDV), institut de recherche pour la conservation des zones humides méditerranéennes, pour l’année de référence 2024. L’étude s’appuie sur l'outil GES 1.5, développé par le collectif Labos 1.5, complété par l'outil ‘Je diagnostique ma ferme’ pour évaluer les émissions et le stockage de carbone liés aux activités agricoles de l’institut. Les données d’achats, de déplacements, d’alimentation et de consommations énergétiques ont été collectées, vérifiées et structurées à partir des fichiers comptables et de questionnaires diffusés au personnel. Hors activités agricoles, l’empreinte carbone de la TDV s'élève à 522 tCO2e, les achats, les déplacements professionnels et domicile-travail constituent les principaux postes émetteurs. En intégrant les activités agricoles (818 tCO2e brut), l’empreinte totale atteint 1 340 tCO2e, en partie compensée par un stockage de carbone estimé à 461 tCO2e, ramenant le bilan net à 879 tCO2e. Les scénarios de réductions explorés avec l'outil Scénario 1.5 ainsi qu'une réflexion plus large autour d'autres pistes d'amélioration permettraient une réduction globale de 6 à 7 % des émissions. Ce travail permet également d'identifier des pistes concrètes pour faciliter la réalisation et l'actualisation des futurs BGES de la TDV.

Caractérisation des tourbières du delta du Rhône (2025)

Wed, 14 Jan 2026 10:46:26

de Violette Perret
Montpellier : Université de Montpellier, 2025, 69

Grâce à un engorgement en eau quasi permanent, les tourbières accumulent de la matière organique très peu dégradée sous forme de tourbe. Elles jouent alors, lorsqu’elles sont intactes, un rôle de puits de carbone, et constituent le principal stock de carbone des sols à l’échelle mondiale. Pourtant, 10 % des tourbières mondiales et 48 % des tourbières européennes sont dégradées, principalement à cause du drainage, qui entraîne la minéralisation de la matière organique. Ces tourbières drainées sont actuellement responsables d’environ 5 % des émissions anthropiques de gaz à effet de serre. Il est donc essentiel de mieux les connaître pour limiter leur dégradation. Néanmoins, en France, les données manquent, notamment dans la région du delta du Rhône, où aucune tourbière n’est recensée malgré plusieurs indices de présence. Notre étude a permis d’estimer la surface en tourbières et leurs stocks de carbone dans le delta du Rhône. L’inventaire réalisé recense pour l’instant sept tourbières et porte ces estimations à 2010 ha, et entre 3,1 et 3,4 Mt C ; soit respectivement 1,5% et 2% des valeurs obtenues à l’échelle nationale. A travers des analyses de densité apparente de la tourbe, notre étude a également permis de dresser pour six tourbières, leur profil de dégradation en fonction de la profondeur, révélant différentes priorités de restauration ou de conservation.

Revisiter les relevés phytosociologiques des marais tourbeux de Raphèle (2025)

Fri, 12 Sep 2025 16:13:49

de Simon Galmiche
Lille : Université de Lille, 2025, 43

Les végétations tourbeuses des marais de Raphèle, au moins sur les bordures externes, ont subi de profondes modifications au cours des 70 dernières années. En cause : le changement d’usage des terres, notamment dû à l’agriculture et à l’installation de nouvelles infrastructures routières, mais aussi l’appropriation des ressources en eau douce et l’invasion par des espèces exotiques. L’accélération des impacts des facteurs de changements globaux n’est pas prévue de s’arrêter au cours du XXIe siècle. Ainsi, sans mesures de conservation adaptées et une réelle volonté politique, les tourbières alcalines méditerranéennes risquent de continuer à se dégrader. Cependant, à l’échelle locale, le projet de classement des marais de Raphèle en Réserve Naturelle Régionale et le processus déjà en cours de rachat des parcelles du marais par le Conservatoire du Littoral permettent d’être optimistes. Néanmoins, les habitats liés aux tourbières alcalines en Méditerranée restent encore très mal connus et il est important de poursuivre les études allant dans ce sens afin de préserver ce patrimoine exceptionnel.

Dynamique de population de Lestes macrostigma en Camargue (2025)

Fri, 5 Sep 2025 15:54:20

de Sibylle Roger
Dijon : Université de Bourgogne, 2025, 30 p.-VII p.

Lestes macrostigma est une demoiselle classée « En danger » en France et « Vulnérable » en Provence-Alpes-Côte-d’Azur. Son aire de répartition est large mais très fragmentée. Cette espèce sténoèce dépend d’habitats rares : les eaux temporaires saumâtres, caractérisées par l’alternance de phases d’inondation et d’assèchement au cours de l’année. Elle est également connue pour les fortes fluctuations de ses effectifs d’une année à l’autre. Pour mieux comprendre ces variations, nous avons modélisé sa dynamique de population en Camargue, en étudiant si le ciblage de l’espèce dans un plan de gestion effectuée dans des aires protégées a un effet sur l’occurrence et l’abondance de l’espèce, indépendamment et en plus des régimes de précipitations. Ce travail repose sur des données de suivi collectées au cours des 15 dernières années, par des protocoles standardisés ou dans le cadre de sciences participatives. Elles ont été confrontées à des facteurs explicatifs comme les bilans hydriques automnale et printanier, ainsi que la gestion hydraulique des aires protégées. Trois modalités de gestion hydraulique ont été distinguées : absence de gestion, gestion favorable à L. macrostigma, et gestion non ciblée sur l'espèce. Nos modélisations montrent l’influence des conditions climatiques sur la probabilité de présence de L. macrostigma. L’espèce est davantage observée si l’automne est sec ou le printemps humide. Toutefois, indépendamment des conditions climatiques, sa probabilité de présence reste nettement plus élevée et régulière dans les sites bénéficiant d’un plan de gestion ciblé en faveur de l’espèce. Ce ciblage, associé à une gestion hydraulique présente dans ces sites, atténue les bilans hydriques, surtout printaniers, et maintient une présence régulière de l’espèce même lors d’années sèches. En effet, en dehors des sites ciblant l’espèce, L. macrostigma n’est observé que lors de printemps très humides. Ces résultats sont corroborés par l’analyse des preuves d’autochtonie. De plus, l’abondance suit une dynamique similaire. Elle est plus stable dans les milieux à gestion favorable et particulièrement élevée dans les aires protégées après un automne sec. La combinaison d’une gestion favorable et d’un printemps humide crée des conditions optimales pour l’espèce. Ces résultats montrent que les aires protégées et leur gestion hydraulique ciblée jouent un rôle essentiel pour la conservation de L. macrostigma. Face aux changements climatiques, marqués par une plus grande imprévisibilité des pluies et une hausse de l’évaporation liée aux températures, cette gestion garantit la présence d’eau dans les habitats clés. Elle permet ainsi de maintenir les effectifs, d’assurer l’autochtonie et de préserver les cœurs de population.

Mise en place et calibration d’un modèle XBeach : modélisation d’overwash sur un littoral restauré (2024)

Fri, 18 Oct 2024 09:55:34

de Thomas Faraon
[S.l.] : Université de Montpellier, 2024, 35

La restauration des écosystèmes côtiers, tels que le littoral camarguais, nécessite une compréhension fine des dynamiques sédimentaires et des processus hydrodynamiques. Ce mémoire présente la mise en place et la calibration du modèle XBeach pour simuler l’ ́évolution d’un littoral restauré et évaluer les effets des phénomènes d’overwash face aux tempêtes. Ce travail illustre le processus de calibration permettant d’obtenir des projections fiables des scénarios d’ évolution littorale. Bien que XBeach possède des limites numériques, il s’avère particulièrement adapté pour modéliser des évènements extrêmes. L’ ́etude met en ́evidence la nécessité de disposer de nombreuses données de calibration et de validation, qui font actuellement défaut. Des campagnes d’acquisition de données in-situ supplémentaires seraient nécessaires pour valider pleinement le modèle. Les résultats obtenus offrent des perspectives intéressantes pour la gestion et la protection des littoraux face aux changements climatiques et aux tempêtes.

Suivi de la macrofaune benthique et évaluation de l’état écologique des milieux lagunaires des étangs et marais des salins de Camargue (2024)

Fri, 18 Oct 2024 09:55:30

de Flavien Jouan
[S.l.] : Université Lumière, Lyon 2, 2024, 71

Les lagunes sont des écosystèmes fragiles et importants pour leurs nombreux services écosystémiques. La transformation de ces milieux en exploitation salicole a, selon le concept de confinement, pour conséquence la création d’un milieu paralique confiné. Ces altérations résultant des aménagements et de la gestion pour la production de sel, engendrent des dégradations de l’état écologique des milieux. Dans l’objectif de l’atteinte du bon état des masses d’eau de la DCE, il est important de restaurer ces milieux et de les évaluer. L’évaluation des milieux lagunaires, des étangs et marais des salins de Camargue s’effectue notamment en utilisant les indices AMBI et M-AMBI, indicateurs de la pollution des milieux côtiers, qui s’appuient sur les macroinvertébrés benthiques. La réalisation de l’étude pour quatre étangs du site des EMSC, qui sont Beauduc, Sablons, Rascaillan et Galabert, montre que les modifications apportées par la dynamique littorale jouent au moins à court terme un rôle très positif dans la restauration, car les Sablons et Beauduc ont des états écologiques en Bon ou Très Bon état. Leur communauté est en constante évolution, ce qui est normal considérant que l’écosystème lagunaire, en particulier en domaine climatique méditerranéen est par définition très instable. Les états écologiques mesurés pour les étangs de Galabert et Rascaillan ne montrent quant à eux pas d’évolution majeure dans leurs peuplements. D’après les indices AMBI et M-AMBI mesurés, leurs classes d’états écologiques sont maintenues à des niveaux pauvres, ce qui indique un milieu pollué. La salinité reste cependant le facteur principal expliquant cet état écologique. Ainsi, les travaux de restauration active n’auront pas permis de mettre en évidence leur succès pour cette année 2024, ce résultat va dans la continuité des précédentes campagnes d’échantillonnage. Finalement, le projet de restauration écologique s’inscrit sur un temps long, il est tout de même difficile d’assister à des changements significatifs dans les communautés, surtout lorsque le milieu a subi des périodes de sursalure et d’assèchement plusieurs années de suite, après les travaux visant à restaurer les habitats. Les étangs du sud des anciens salins ne nécessitent pas de nouvelles actions. Pour les étangs de Rascaillan et Galabert, il est prioritaire de trouver des solutions permettant un meilleur équilibre entre eau salée et eau douce, en veillant à la conservation de la qualité physico-chimique.

Conception d'une représentation numérique et spatialisée pour la modélisation intégrée de l'île de Camargue (2024)

Fri, 18 Oct 2024 09:55:26

de Aurore Moulin
[S.l.] : Université de Montpellier / Montpellier SupAgro, 2024, 43

L’Ile de Camargue est caractérisée par l’interdépendance hydrologique entre les milieux naturels et agricoles, avec l’irrigation artificielle qui s’est développée depuis l’endiguement de ce delta méditerranéen au 19ème siècle. Mais ce système socio-écologique fait face à des changements climatiques et des évolutions de pratiques agricoles qui influencent la gestion de l’eau. Il est alors nécessaire d’anticiper leurs impacts sur la durabilité des activités et des ressources pour garantir l’adaptabilité du territoire. La modélisation intégrée permet de considérer les interactions entre composantes d’un socio-écosystème, pour tester des scénarios prospectifs et révéler des tendances. Nous avons donc conçu un outil de modélisation numérique et spatialisé capable d’intégrer la complexité de l’Ile de Camargue. Cette représentation de la zone d’étude servira de référence pour modéliser les conséquences des changements climatiques, agricoles, et hydrologiques et ainsi favoriser une gestion adaptative de l’eau en Camargue.

Intelligence artificielle appliquée à la détection d’individus chez des populations ornithologiques (2024)

Fri, 27 Sep 2024 10:04:45

de Tom Bourbon
[S.l.] : Ecole des mines de Saint-Etienne, 2024, 35

Ce rapport porte sur l’application de l’intelligence artificielle, plus particulièrement la computer vision, dans le domaine de la conservation des zones humides méditerranéennes, au sein de l'institut de recherche de La Tour du Valat. En effet, celui-ci utilise des images satellites et des caméras pour collecter des données sur l'évolution des écosystèmes, mais l'analyse des images reste majoritairement manuelle. Le projet de stage visait à automatiser ce processus à l'aide de technologies d'apprentissage automatique, en développant un système capable d'analyser ces images visuelles.
L'auteur du rapport a travaillé sur l’ensemble du processus, depuis la récupération et la labellisation des données, jusqu’à l'entraînement des modèles d'intelligence artificielle et leur optimisation. Le projet lui a permis de comprendre les différentes étapes nécessaires à la mise en place d’un système intelligent, y compris son déploiement via une interface logicielle. Grâce à ce travail, l'institut pourrait à terme améliorer l'efficacité de l'analyse de données environnementales en s'appuyant sur des outils d'IA performants et automatisés.

Mise en œuvre de l’évaluation de l’état de conservation des lagunes côtières méditerranéennes (1150- 2) à l’échelle du site Natura 2000 ‘’Camargue’’ - 2023 (2023)

Mon, 2 Oct 2023 10:27:38

de Clara Lalauze
Arles (FRA) : Parc naturel régional de Camargue, 2023, 42
En ligne : pnr-camargue.n2000.fr[...]

La préservation et la conservation de la biodiversité et plus précisément des espèces et habitats naturels sont une urgente priorité des décennies à venir, notamment pour les services écosystémiques rendus (épuration de l’eau, contrôle des crues, stockage CO2…) mais également pour la richesse culturelle et patrimoniale. Les lagunes côtières méditerranéennes s’inscrivent dans cette dynamique puisqu’elles sont classées « habitat prioritaire » dans la liste des habitats de la Directive Habitat Faune et Flore (DHFF) de 1992. Les lagunes côtières méditerranéennes à l’étude dans ce rapport font partie de la zone Natura 2000 « Camargue » (classée ZPS et ZSC). Dans ce cadre là, l’état de conservation (EC) des lagunes doit être étudié et rapporté à l’échelle biogéographique tous les 6 ans pour la DHFF et à l’échelle du site Natura 2000 , tous les ans, à travers le Formulaire Standard de Données. L’EC des lagunes se définit à travers une méthodologie standardisée et selon 12 différents indicateurs dont 5 étudiés dans ce rapport : les espèces végétales exotiques envahissantes (EVEE), les espèces animales exotiques envahissantes (EAEE), la connectivité à la mer, la nature des berges et le fonctionnement hydrologique. L’EC de 9 des 16 lagunes d’intérêt est étudié en 2023 dans ce rapport. L’état de conservation global de chaque lagune sera normalement obtenu courant 2024. Cependant, il est d’ores et déjà possible de dire que 4 des 9 lagunes à l’étude ne présentent aucune perturbation pour les 5 indicateurs donnés, qu’aucune n’est colonisée par du cascail (EAEE), une seule est colonisée par des EVEE, les lagunes des EMSC (ancien salins) sont celles qui présentent le plus de perturbations (hydrologique, artificialisation des berges, connectivité à la mer) et enfin, les notes pour la connectivité à la mer sont hétérogènes sur le territoire. A l’échelle du site Natura 2000 , l’état de conservation global ne pourra être connu que l’année prochaine, quand l’EC du reste des lagunes aura été étudié. Cependant, même si l’EC est reporté à l’échelle du site entier, il est important de regarder l’EC de chaque lagune afin de définir des meilleures stratégies de gestion à l’échelle locale.

Etude du succès d’éclosion des flamants roses (Phoenicopterus roseus) en fonction des sites de nidification à Aigues-Mortes (2023)

Mon, 25 Sep 2023 11:24:21

de Julie Itty
Pau, France : Université de Pau et des pays de l'Adour, 2023, 52

La Tour du Valat effectue, depuis 1954, un suivi de la reproduction de la colonie de flamants roses (Phoenicopterus roseus) dans les Salins du Midi en Camargue, unique lieu de nidification de cette espèce en France. Le suivi par observations à la longue-vue est possible grâce au marquage des flamants, qui se voient équipés d’une bague en plastique avec un code alphanumérique lisible à 300m et d’une bague en métal. Les flamants nichent l’accoutumée sur des îlots et une digue mais il a été remarqué, en 2022 et 2023, que ces oiseaux se reproduisaient sur un nouveau site : le substrat gypseux (constitué d’un minéral appelé le gypse) qui affleure de l’étang. Seulement, cette stratégie semblait comporter des risques car les œufs peuvent être facilement submergés par l’eau. Les analyses ont permis, dans un premier temps, de montrer que la propension des individus à nicher sur le gypse dépendait de leur âge et de leur origine. Ensuite, il s’est avéré que le succès d’éclosion des flamants ne dépendait finalement pas du site de nidification. Mais les analyses devront être poursuivies en même temps que le suivi originel, afin de vérifier ces résultats. Enfin, des propositions de gestion du site ont été présentées.

Influence des conditions environnementales sur la dynamique de succession des communautés végétales de mares temporaires méditerranéennes (2023)

Fri, 22 Sep 2023 15:37:16

de Louise-Anne Audo
Clermont-Ferrand (FRA) : Université Clermont Auvergne, 2023, 54

Dans le cadre du projet MediCyn, porté par le Grand Port Maritime de Marseille (GPMM), la Tour du Valat (institut de recherche pour la conservation des zones humides méditerranéennes) a pour but d’améliorer l’état de conservation et la valeur écologique de deux sites à enjeux de conservation (le Grand Clos et le Relai) de la couronne agri-environnementale du GPMM. Un des objectifs fixés afin d’atteindre ce but a été l’étude de l’influence de la gestion et de certains facteurs environnementaux non maîtrisés sur la succession des communautés végétales des mares temporaires créées sur le site du Relai. La dynamique de la végétation a été comparée entre trois modes de gestion hydraulique. Pour cela on réalise des relevés de végétation sur le terrain ainsi qu'une analyse de la banque de graine de chaque mare. Les données obtenues ont été étudiées et comparées grâce à des analyses multivariées. Une comparaison des espèces présentes dans les relevés a complété l’analyse. Les résultats font ressortir deux facteurs environnementaux structurants pour la végétation des mares : la salinité et l'hydropériode. Ces deux facteurs sont à relier à la gestion des mares qui joue un rôle dans l’expression et la répartition des communautés végétales. On observe des communautés de mares temporaires dans les mares à gestion cynégétique. En revanche, on observe aussi des communautés typiques des milieux lagunaires dans les mares à gestion intermédiaires et méditerranéennes.

Etude de l’impact des contaminants et de caractéristiques individuelles sur différents biomarqueurs physiologiques chez la Cistude d’Europe (Emys orbicularis) (2023)

Mon, 11 Sep 2023 17:26:18

de Sidonie Girard
[S.l.] : AgroParisTech Paris, 2023, 50

Les zones humides, espaces sensibles et réservoirs de biodiversité, sont contaminées par des polluants d’origine variée. Les effets des contaminants sur la biodiversité restent encore peu ou mal connus et notamment les effets sublétaux sur la physiologie. Une meilleure évaluation de ces effets est primordiale et requiert l’utilisation de biomarqueurs pertinents à différentes échelles biologiques. L’objectif de cette étude est d’étudier les liens entre l’exposition aux pesticides et des marqueurs physiologiques sanguins chez 9 populations de Cistude d’Europe (Emys orbicularis), des départements des Bouches-du-Rhône, Gironde et Indre. La Cistude d’Europe est une espèce ectotherme longévive d’eau douce potentiellement indicatrice de la contamination des zones humides. Plusieurs marqueurs sont étudiés : le nombre total de leucocytes et la formule leucocytaire (nombre d’éosinophiles et ratio hétérophiles/lymphocytes). Les variations de ces marqueurs ont été examinées entre les 9 populations, entre les sexes et en fonction de la masse. Nous avons pu mettre en évidence un effet significatif de ces différents paramètres, notamment un dimorphisme entre mâles et femelles. Dans un second temps, les liens avec la contamination en pesticides dans le plasma des individus ont été étudiés pour 5 des 9 populations. Les variations des marqueurs ne sont pas expliquées par la contamination des individus, à l’exception du compte total de leucocytes, plus faible chez un individus contaminé par au moins deux pesticides que chez un individu non contaminé.

Contamination du milieu et niveau plasmatique de pesticides chez la Cistude d’Europe, Emys orbicularis : une étude comparative entre cinq populations en Camargue (2023)

Mon, 11 Sep 2023 16:14:01

de Mickaël Charriot
[S.l.] : Université de La Rochelle, 2023, 47

Les écosystèmes aquatiques sont exposés à de nombreux polluants, et notamment aux pesticides, fortement utilisés en agriculture. Les risques pour les espèces non-cibles, et particulièrement sur les reptiles, restent très peu évalués. La Cistude d’Europe, Emys orbicularis, est une espèce de tortue aquatique, sédentaire vivant dans les rivières et marais, longévive, omnivore, se nourrissant d’Ecrevisse de Louisiane. Le projet CISTOX vise à évaluer l’exposition aux pesticides chez cette espèce en fonction du contexte environnemental, agricole et hydraulique de sites d’échantillonnage ainsi que les effets à différents niveaux physiologiques et écologiques. La première année du projet (2022) s’est focalisée sur la Camargue, une région particulièrement concernée par l’agriculture et les rejets d’importantes quantités de pesticides dans l’environnement. Cette étude vise à (i) explorer les différences de contaminations et d’occurrence aux résidus de pesticides entre les sites d’étude, (ii) étudier la contamination de l’environnement (eau, sédiments) et la mettre en lien avec celle des cistudes, (iii) expliquer les variations interindividuelles des niveaux de pesticides circulant dans le sang en fonction du sexe, des stades d’usure du plastron (âge) et de la condition corporelle des individus. Les résultats de cette étude montrent que les cistudes vivant dans les canaux de drainage sont plus contaminées que les cistudes capturées dans les canaux d’irrigation. Cette contamination est principalement due à un herbicide, la bentazone, fortement utilisé en riziculture. Aucun effet du stade d’usure du plastron (proxy de l’âge), de la condition corporelle ou du sexe des individus n’a été observé sur la contamination des cistudes. Une corrélation nette entre la contamination de l’eau et celle des cistudes a été observée : plus l’eau est contaminée plus le nombre de cistudes contaminées est grand. Cette étude met ainsi en avant la voie principale d’exposition au pesticide : l’eau. L’alimentation ne semble pas être une voie de contamination car aucune Ecrevisse de Louisiane n’est contaminée par la bentazone. Le projet se poursuit actuellement avec la recherche des effets potentiels à différentes échelles biologiques, ainsi que le prélèvement d’échantillons dans d’autres régions pour affiner les comparaisons entre les sites.

Optimiser la plantation de haies en Camargue dans le cadre de la conservation de la Glaréole à collier (Glareola Pratincola) (2023)

Fri, 7 Jul 2023 17:58:46

de Sébastien Thomas
Marseille, France : Université Aix-Marseille, 2023, 41

L’objet de ce mémoire est de préciser la corrélation négative qui semble exister entre la fermeture du paysage par les haies et l’installation de colonies de Glaréoles à collier en s’intéressant à deux éléments : • la présence ou l’absence de colonies de Glaréoles à collier sur des sites identifiés comme potentiellement favorables à sa nidification ; • la taille des colonies mesurée en nombre de couples nicheurs. En fonction des résultats, nous discuterons de la pertinence d’intégrer à CAMGIS des critères permettant la prise en compte dans le choix des emplacements les plus propices à la plantation de haies des besoins écologiques des espèces, telle la Glaréole à collier, qui recherchent des habitats ouverts pour nicher.

Suivi scientifique d’une colonie de Flamants roses en Camargue (2022)

Fri, 3 Feb 2023 19:09:03

de Lucas Benaiche
[S.l.] : Ecole de la gestion et de la protection de la nature, 2022, 54

Un effort particulier est mis en place sur l’observation des individus bagués, ainsi que sur la mise en place d’un marquage annuel des poussins, au travers d’un programme de Capture-Marquage-Recapture avec des bagues Darvic. Plusieurs programmes de baguage de l’espèce sont déployés simultanément depuis plusieurs décennies en Méditerranée (France, Espagne, Italie, Algérie, Turquie, Tunisie), permettant d’étudier les déplacements individuels des flamants et leur écologie. En complément du suivi de terrain, certaines analyses photogrammétriques sont utilisées, au moyen d’images aériennes prises par drone. Pour la première fois cette année, certains poussins sont équipés avec des balises GPS en complément du marquage Darvic, dans le cadre d’une étude réglementaire portant sur le golfe du Lion.

Comparaison des sous-populations d’anguille européenne dans quatre milieux contrastés de Camargue par otolithométrie (2022)

Tue, 13 Sep 2022 17:27:01

de Hugo Vey-Payre
Saint-Étienne : Université Jean Monnet, 2022, 44

La forme des otolithes, l'âge et la croissance de l'anguille européenne (Anguilla anguilla) provenant de quatre sites hétérogènes de l'hydrosystème du Vaccarès en Camargue ont été analysés sur un échantillon de 198 individus, capturés entre octobre et décembre 2021. La forme des otolithes a été décrite en utilisant les coefficients de Fourier et les indices de forme. L'âge a été déterminé par la lecture des stries de la paire sagittale des otolithes, concrétions calcaires dans l'oreille interne des poissons. Les longueurs aux âges antérieurs ont été calculées par des méthodes de rétrocalcul à partir des mesures des stries de croissance des otolithes. Le modèle de croissance de Von Bertalanffy appliqué aux longueurs rétrocalculées a permis de comparer le facteur de croissance K et la longueur asymptotique Linf entre les sites. Nous avons montré que les quatre sites semblent avoir des conditions environnementales assez contrastées pour induire des différences dans la forme des otolithes, offrant des conditions de vie différentes pour les individus. Les anguilles sont plus petites, plus jeunes et avec une croissance plus rapide dans l'Etang du Vaccarès et le Marais des Grandes Cabanes que dans le canal du Fumemorte et le canal de la Sigoulette. Ces différences proviennent probablement des caractéristiques spécifiques des milieux. La croissance est accélérée dans les milieux où la salinité est la plus élevée. Le site de Vaccarès (lagune) et le site des Grandes Cabanes (marais) sont des milieux productifs permettant une production accélérée de futurs géniteurs par rapport aux deux autres sites en eau douce. Si les anguilles provenant du Vaccarès sont capables de dévaler pour rejoindre la mer, celles provenant de Grandes Cabanes n'ont pour seule voie de sortie que le canal de la Sigoulette. Ces sites, dits poldérisés, n'ont pas de connexion à la mer, empêchant les anguilles de rejoindre le stock de reproducteurs. Les futures analyses de microchimie et les données de télémétrie permettront de connaître l'histoire de vie des individus et mieux comprendre les migrations inter-sites.

Evolution géomorphologique de dépôts d’overwash sur le site de Véran (Camargue, France) (2022)

Wed, 7 Sep 2022 14:42:38

de Roxane Angleraud
Marseille, France : Université Aix-Marseille, 2022, 95

La digue de Véran, ouvrage de défense côtière camarguais des années 1970, est laissée à l’abandon en 2012 pour des questions économiques d’une part, mais surtout, car cette décision fait partie d’un plan de gestion adaptative du trait de côte dans le cadre du projet REST-COAST, qui a la volonté de mettre en place un repli stratégique depuis 2010 en passant par la renaturation et restauration d’espaces côtiers. Au Sud de la lagune de Beauduc, une plage s’est formée suite à l’abandon de la digue de Véran il y a une dizaine d’années, ce site fait partie des 9 sites pilotes choisis par le programme REST-COAST. Ce cordon littoral composé de dépôts sédimentaires est divisé par des chenaux qui évoluent rapidement. Ce travail a pour but d’étudier les dynamiques morphologiques de cette plage afin de disposer de nouveaux éléments de compréhension sur les réactions sédimentaires qui suivent l’abandon d’un ouvrage de protection, et notamment sur le rôle du transport éolien dans la répartition sédimentaire. La compréhension de ces mécanismes est importante, d’autant plus dans le contexte actuel de changement climatique, car les dunes éoliennes constituent une protection naturelle du littoral face aux aléas de la mer, agissant comme une digue sans ses inconvénient (coût, entretien, impact visuel et paysager, changement anthropique des mécanismes littoraux…).

Suivi de la macrofaune benthique et évaluation de l’état écologique des milieux lagunaires des anciens salins du delta de Camargue (2022)

Wed, 7 Sep 2022 11:24:52

de Clara Bettoni
[S.l.] : Université de Lorraine, 2022, 60

Quatre lagunes côtières du delta du Rhône, ayant un degré de communication avec la mer qui diffère et impactées plus ou moins fortement par les activités humaines, ont été étudiées dans le cadre du suivi des Etangs et Marais des Salins de Camargue (EMSC) réalisé par la Tour du Valat et financé par le programme Rest-Coast. La physico-chimie a été mesurée, et les invertébrés benthiques ont été échantillonnés dans le cadre du suivi de la Directive Cadre sur l’eau (DCE) des EMSC. L’objectif était notamment de voir si les travaux hydrauliques réalisés en 2019 ont eu un impact de déconfinement des lagunes visible sur les communautés de macro-invertébrés. Pour ce faire, une analyse des communautés et le calcul de l’indice biotique M-AMBI ont été réalisés. Les résultats de l’indice ne montrent pas de changement de classe d’état des deux lagunes situées au nord du site (Galabert et Rascaillan) pouvant être le signe d’un déconfinement. Cependant, la baisse de salinité moyenne annuelle et la découverte d’un bivalve marin (Macomangalus tenuis) auparavant absent sur Rascaillan sont les signaux d’une tendance au déconfinement de celle-ci. Les deux étangs au sud du site (Beauduc et Sablons) ont un bon état écologique, mais une marinisation de Beauduc semble se produire, avec la découverte de nouvelles espèces de bivalves. Différents liens entre les facteurs abiotiques et la répartition des macro-invertébrés ont pu être établis et sont à confirmer lors des prochains suivis.

Restauration de roselière sur le domaine de la Tour du Valat : évaluation du potentiel d’accueil pour l’avifaune paludicole (2022)

Thu, 1 Sep 2022 16:20:43

de Mathilde Bach
Clermont-Ferrand (FRA) : Université Clermont Auvergne, 2022, 37

Dans le contexte actuel de réchauffement climatique et de destruction d’habitats, les roselières sont en fort déclin. Etant des milieux avec une importance patrimoniale pour la reproduction de l’avifaune paludicole, il est primordial de les conserver. Suite à l’endiguement du Rhône, la Camargue est parcourue par des réseaux de roubines (canaux) et de martellières (vannes) rendant la gestion hydraulique mécanique. Par conséquent, la gestion hydraulique doit être réalisée finement pour être adaptée au cycle de l’avifaune. C’est pour cette raison qu’en 2021, certaines roselières du Domaine de la Tour du Valat ont bénéficié d’aménagements afin d’améliorer la gestion hydraulique. Nos résultats suggèrent que les aménagements ont eu des effets positifs sur la diversité en ressources alimentaires des Ardéidés mais également une augmentation de la richesse spécifique du cortège de passereaux paludicoles. Plus généralement, les travaux ont permis d’avoir des niveaux mieux gérés modifiant favorablement la structure des roselières pour la nidification de l’avifaune.

Étude de la reproduction de la colonie du flamant rose (Phoenicopterus roseus) en Camargue (2021)

Fri, 3 Feb 2023 18:23:31

de Ethel Mery
Besançon : Université de Franche-Comté, 2021, 35

Suivi spatiotemporel des eaux de surface dans les lagunes côtières méditerranéennes (France) (2021)

Mon, 22 Nov 2021 16:42:24

de Priyashani Oswatte Liyanage
Paris (FRA) : AgroParisTech, 2021, 74

L’objectif principal du stage est de mettre en place un système de suivi de l’habitat 1150 « Lagunes côtières méditerranéennes » (selon la définition donnée par la typologie européenne EUNIS), à l’échelle des trois régions méditerranéennes françaises. Ce système de suivi sera basé sur les outils d’Observation de la Terre (OT) et permettra, notamment, de mieux délimiter spatialement cet habitat et de caractériser les dynamiques spatiotemporelles de ses eaux de surface (intra- et interannuelles). L’approche méthodologique se base sur l’utilisation des séries temporelles des images optiques Sentinel-2 (gratuites et faciles d’accès), couvrant l’hydropériode allant de janvier 2018 à décembre 2020. A l’aide d’un algorithme de segmentation (multi-date), les enveloppes délimitant les lagunes côtières ont été définies par photo-interprétation et les dynamiques spatio-temporelles de leurs eaux de surface ont été caractérisées à partir de ces mêmes images, traitées avec l’indice spectral Water In Wetlands (WIW). Une fois ces informations extraites, elles ont été compilées au sein d’une base de donnée géoréférencée couvrant les trois régions, afin de mieux rendre compte des caractéristiques hydrologiques des lagunes côtières méditerranéennes (ex. type et durée d’inondation).

Diversification des exploitations agricoles et conditions d‘émergence de l’agroécologie en Camargue (Septembre 2021)

Mon, 8 Nov 2021 10:35:25

de Juliette Migairou-Leprince
Paris (FRA) : AgroParisTech, Septembre 2021, 88

Ces dernières années, le climat social en Camargue s’est dégradé avec de nettes oppositions entre les agriculteurs, les acteurs environnementaux et les acteurs publics. Chacun a des enjeux à préserver en priorité qui sont souvent opposés à ceux des autres acteurs. L’agroécologie pourrait être une voie qui rassemble ces enjeux du fait qu’elle vise à une productivité et une viabilité des systèmes agricoles en trouvant des solutions fondées sur la nature et en préservant la biodiversité.
L’étude technico-économique met en lumière une période de transition agraire de la Camargue vers un système moins rizicole, plus diversifié et l’arrivée de nouveaux acteurs. Dans l’histoire cette région s’est montrée apte à effectuer des grands changements agricoles selon la conjoncture politique et économique. Actuellement, la superficie cultivée en riz diminue du fait de l’allongement des rotations au sein des systèmes de culture. Les éleveurs voient dans la viande, une source de revenu en plus des jeux taurins. Le maraichage de plein-champ se développe et occupe de plus en plus de surface.
La modélisation économique des systèmes de production montre que les exploitations disposent de ressources financières importantes (le revenu agricole est souvent complété par une pluriactivité de mise en location de marais de chasse et d’accueil touristique). Cet atout par rapport à d’autres régions agricoles pourrait être un facteur d’adoption de l’agroécologie. Cependant, le mode de fonctionnement patronal ou capitaliste génère un besoin de rentabilité financière en plus de la rémunération du travail et de création d’un revenu agricole. La rentabilité financière [...] suit le principe de l’actualisation qui exprime une préférence pour le présent et la rentabilité à court terme pour chaque investissement. Ainsi cette organisation économique freine les agriculteurs à s’engager dans des processus de développement de l’agroécologie où la réflexion se fait sur le long-terme et dans lesquels une augmentation des résultats économiques n’est pas assurée. L’objectif de transmission d’un système productif pérenne malgré les changements climatiques à venir n’est alors par une priorité.
Aujourd’hui des connaissances en écologie des effets sur la biodiversité de changement de pratiques et en agronomie sur les applications techniques semblent pertinentes à construire. Les compétences en écologie de la Tour du Valat, pourront aider à la compréhension des phénomènes biologiques dans le but d’aboutir à une synergie entre les enjeux agricoles et les enjeux de protection de la biodiversité. Un partage de connaissances et d’expériences ainsi que l’instauration de conditions propices à un dialogue fécond entre les différents acteurs de Camargue semblent indispensables pour faciliter la mise en place de ces pratiques favorisant la biodiversité cultivée et sauvage sans compromettre la viabilité des exploitations agricoles.

Evaluation de l’efficacité du dispositif RFID pour le suivi de l’anguille d’Europe (2021)

Fri, 17 Sep 2021 16:36:17

de Jules Giraud
Montpellier : Montpellier SupAgro, 2021, 29

Pour pouvoir estimer des flux d’individus à travers les antennes RFID au sein d’un système il est nécessaire de connaitre l’écart entre le nombre de poissons détectés et le nombre de poissons ayant réellement franchit l’ouvrage. Pour cela il faut estimer l’efficacité du dispositif c’est-à-dire la probabilité qu’une antenne détecte et reconnaisse un individu qui la traverse, ainsi que sa variation au cours du temps.
Dans cette étude nous avons cherché dans un premier temps à mettre en avant la relation entre les variations d’efficacité de détection des différentes antennes du site et les conditions physico-chimiques de l’eau, notamment la conductivité qui peut s’avérer néfaste pour la détection. Afin de savoir si une quelconque relation entre ces différentes variables existe, nous avons utilisé les données des markers tags. Ce sont des tags accolés à l’antenne qui permettent de savoir si l’antenne est en mesure de détecter les transpondeurs qui passent à proximité. Dans un deuxième temps nous avons mis en place une méthode permettant de déterminer l’efficacité de chaque antenne du système RFID au cours du temps. Ceci dans le but d’en tirer une efficacité totale du dispositif afin d’estimer au mieux le flux d’anguilles réel. Le protocole d’évaluation de l’efficacité, expliqué ultérieurement, utilise une méthode dite « indirecte » qui n’utilise donc pas de poissons vivants.

Suivi démographique à long terme d’une espèce patrimoniale des zones humides de Camargue: la Cistude d’Europe Emys orbicularis (2021)

Wed, 8 Sep 2021 10:46:37

de Arthur de France
Montpellier : Université de Montpellier, 2021, 30

La tortue Cistude d’Europe, Emys orbicularis est une espèce de tortue d’eau douce, qui est menacée en Europe selon l’UICN. En Camargue, la Tour du Valat, institut de recherche privé pour la conservation des zones humides méditerranéennes suit et capture ces animaux depuis 1976. La Tour du Valat a mis en place depuis 1997 un suivi pérenne par Capture Marquage Recapture (CMR). Ce suivi par CMR mis en place à la Tour du Valat depuis 1997 permet une étude démographique à long terme de la population comprenant entre autres l’étude de la dispersion et des proportions de mâles et de femelles. Ce suivi permet aussi de mesurer les polluant présents dans le plasma des cistudes de différents environnements camarguais afin d’estimer leurs impacts. Il est aussi mené des recherches sur le type de bactéries altérants les carapaces de ces animaux ou encore les communautés d’algues présentes sur ces mêmes carapaces . Cette 25ème année consécutive de CMR a permis de poursuivre le suivi démographique à long terme. Dans le même temps, nous avons approfondi ces recherches éco toxicologiques, en capturant des individus d’une population située en dehors de la tour du Valat afin de comparer les résultats entre des milieux agricoles et les milieux protégés. Ainsi que de pouvoir suivre la dispersion et les potentiels résultats différents des noyaux de populations de la tour du Valat. Il est à noter que les deux semaines de captures à Grand Badons qui ne sont pas sur le domaine de la Tour du Valat, ne sont pas traitées dans ce rapport. Je pense que comparer les vingt – cinq ans de données de CMR avec ces deux semaines n’est pas judicieux. Je le ferai néanmoins lors de l’oral. Les résultats globaux de cette 25ème année de CMR apparaissent pour la plupart dans la continuité des précédents. Et ceux malgré moins de piégeage sur certains sites par rapport aux autres années. On observe tout de même des résultats toujours très différents entre les sites. Cela étant liés à des différences de biotope, particulièrement des réseaux hydrographiques, mais également de phénomène de saturation d’individus sur des sites et dispersions.

Exposition aux pesticides chez la cistude d’Europe (Emys orbicularis) au sein de la réserve naturelle régionale de la Tour du Valat en Camargue (2021)

Tue, 7 Sep 2021 14:41:59

de Yvann Foucault
Le Mans : Le Mans Université, 2021, 50

Cette étude fait ainsi suite à un premier volet d’analyse de la contamination des cistudes sur le domaine de la Tour du Valat qui était sur les PCBs et les pesticides organochlorés (Burkart et al., 2021). L’objectif principal est de caractériser les niveaux d’exposition et l’occurrence à une trentaine de pesticides et à leurs métabolites principaux dans le plasma de cistudes d’Europe en Camargue. Ce projet vise à étudier les facteurs qui influencent la contamination telles que les variations individuelles (âge, sexe, taille et poids), des variations spatiales (prélèvement des cistudes à Esquineau ou Faïsses) et des variations temporelles (fluctuation selon les mois lors d’une même année de prélèvement, et entre les années de prélèvements). Ceci nous permettra également de vérifier que la cistude d’Europe est une bonne espèce bioindicatrice.
Plusieurs hypothèses peuvent être envisagées : nous attendons des niveaux de pesticides persistants plus élevés chez les individus les plus âgés, en raison des processus de bioaccumulation des polluants. Ensuite, les cistudes capturées à Esquineau doivent être moins contaminées qu’à Faïsses car son eau provient de parcelles agricoles. Enfin, les tortues prélevées plus tard dans la saison (juillet/aout) doivent être plus contaminées que celles capturées tôt (avril/mai) dans la mesure où la contamination des masses d’eau (canal du Fumemorte) augmente au cours du temps et coïncide avec les périodes de traitement.

Caractérisation de la dynamique de dévalaison de l’anguille européenne dans un canal de drainage camarguais (2021)

Wed, 1 Sep 2021 17:41:24

de Esther Mollier
Rennes : Agrocampus ouest, 2021, 51

Afin de caractériser la dynamique de dévalaison des anguilles dans le canal du Fumemorte, deux approches seront développées dans cette étude, (i) l’une à partir des données de pêche acquises à proximité de l’embouchure du Fumemorte depuis 2001, (ii) l’autre à partir du suivi RFID déployé depuis début 2019. Les objectifs de l’analyse des 20 années de pêche visent à déterminer si des périodes de l’année sont plus favorables à la dévalaison et à étudier leur éventuelle variabilité inter- et intra-annuelle. Après avoir vérifié et évalué le fonctionnement et les efficacités de détections des stations d’écoute RFID, les enregistrements d’individus marqués seront analysés afin d’identifier d’éventuels pics de dévalaison et de tester l’influence de facteurs environnementaux. Des modèles Bayésiens seront développés dans les 2 approches afin de tester, respectivement, (i) les effets mois et années, et (ii) les effets de facteurs environnementaux. Cette étude, basée à la fois sur l’exploitation et la modélisation bayésienne de données de pêche scientifiques acquises sur 20 ans et d’un suivi télémétrique RFID déployé depuis 2 ans, a permis de mieux cerner la dynamique de dévalaison du canal du Fumemorte. Contrairement à ce qui était attendu, la migration de retour en mer des anguilles argentées apparaît s’étaler sur la période d’octobre à avril, avec des pics de dévalaison dans l’ensemble peu marqués. Ces résultats sont toutefois à approfondir, notamment pour le suivi télémétrique RFID qui a montré des faiblesses saisonnières dans les capacités de détection et qui dépend du nombre d’individus marqués encore vivant dans le système. L’amélioration du système et le maintien d’un effort de marquage permettra peut-être d’observer de nouvelles tendances à l’avenir. Par ailleurs, il sera intéressant de tester davantage de facteurs environnementaux pour appréhender et peut-être prédire d’éventuels pics de dévalaison. Ces résultats pourront par la suite éclairer le choix d’actions pertinentes et efficaces des gestionnaires pour faciliter le retour des anguilles argentées en mer, notamment en ce qui concerne l’amélioration des connectivités.

Évolution de la partie émergée et immergée du prisme littoral dans le secteur de Véran : impact de l’abandon de structures de défense côtière (2021)

Tue, 20 Jul 2021 13:30:03

de Lénaïg Hurtrez
[S.l.] : Université d'Aix-Marseille, 2021, 32

Depuis le début du XXe siècle, le site de Véran situé sur le littoral de Grande Camargue (Golfe du Lion, France) est confronté à une érosion côtière forte et durable. Dans le but de protéger l’activité salicole du site, pilier du développement économique local depuis la ﬁn du XIXe siècle, des ouvrages de défense côtière ont été mis en place, en particulier une digue longitudinal construite en 1972. Bien que cette digue ait répondu aux problématiques locales en ﬁxant le trait de côte, les conséquences néfastes de cet aménagement ainsi que la modiﬁcation des enjeux socioéconomiques et environnementaux du site ont conduit à l’abandon de celle-ci en 2012. Outre la question économique du coût d’entretien de cette digue, cette décision fait partie d’un plan de gestion adaptative du trait de côte. Ce dernier prône le rétablissement d’un fonctionnement naturel du site et de sa résilience de façon à lutter de manière naturelle et eﬃcace contre les conséquences du réchauﬀement climatique: la montée du niveau marin et la recrudescence des tempêtes. Ce travail a pour but d’évaluer la réponse morphodynamique du prisme littoral du site de Véran suite à la mise en place et à la destruction progressive de la digue. L’analyse de la bathymétrie de la plage immergée montre que la digue est responsable d’une érosion accrue et d’un ralentissement voir d’une ﬁxation des barres d’avant-côte. Sa destruction facilite les intrusions marines sur la plage émergée à l’origine d’une accrétion liée aux dépôts d’overwash mais également d’une érosion par la mise en place de chenaux d’écoulement et par la reprise du recul du trait de côte.

Suivi de la colonie de Flamant rose, Phoenicopterus roseus, installée à l'étang du Roi, Salins du Midi, Aigues-Mortes (Gard) (2020)

Fri, 3 Feb 2023 18:23:34

de Camille Couderc
Montpellier : Université de Montpellier, 2020, 37

Malgré le confinement lié au Covid-19, le suivi de la colonie 2020 installée sur l’étang du Roi (Salins du Midi, Aigues-Mortes, Gard) a pu être effectué. C’est l’une des années record de la reproduction en France avec 20 885 couples comptabilisés pour un total de plus de 12 000 juvéniles à l’envol. 5 886 lectures de bagues provenant de 3 047 individus différents ont pu être relevées. Les individus proviennent de l’ensemble du bassin méditerranéen dont la Camargue, la Catalogne, l’Andalousie, la Sardaigne, l’Italie, l’Algérie et la Turquie. L’interconnexion entre ces différents sites de reproduction semble être de plus en plus forte. De plus, les Flamants observés en tant que reproducteurs ont entre 5 et 43 ans avec un effectif important d’individus ayant 10 ans et moins. Ainsi, il se pourrait que l’installation à l’étang du Roi ait facilité l’accès à la reproduction des jeunes Flamants. A l’inverse les individus ayant plus de 40 ans sont moins nombreux ce qui pourrait signifier la sénescence de leur reproduction. Toutefois ces hypothèses restent à confirmer puisque les individus observés à la colonie sont très peu recontactés, ne permettant pas toujours de les identifier en tant que reproducteurs confirmés. Mots clés : Flamant rose, Phoenicopterus roseus, colonie, CMR, bague Darvic

Comment l’hétérogénéite paysagère influence l’avifaune patrimoniale des milieux agricoles camarguais ? (2020)

Mon, 19 Apr 2021 14:52:54

de Thomas Dagonet
Paris : Ecole pratique des hautes études, 2020, 12

Dans le système agricole camarguais, la riziculture occupe désormais une place importante et constitue un habitat de substitution pour les oiseaux des zones humides. Les modifications paysagères liées à cette pratique ont influencé la présence des espèces patrimoniales sur les exploitations. En effectuant un inventaire sur les oiseaux et une cartographie sur 45 parcelles agricoles, nous avons voulu observer quels paramètres de la composition paysagère influent sur les espèces à enjeux. Nos résultats montrent que seule la présence de haie influe négativement sur la présence des oiseaux patrimoniaux. Après une analyse plus précise des espèces concernées, on observe que la présence de haie à une incidence sur les espèces liées aux zones humides mais est au contraire favorable aux espèces inféodées à ce milieux. L’hétérogénéité du paysage dans les exploitations agricoles semble donc être le meilleur moyen de préserver les espèces patrimoniales.

Diagnostic écologique de l’Habitat « Roselière >> vis-à-vis de l’avifaune paludicole. Application sur Ies roselières du site Natura 2000 "Camargue" (2020)

Mon, 22 Mar 2021 16:04:56

de Emilie Igersheim
Rennes : Université de Rennes, 2020, 55

La médiation comme outil pour appréhender les conflits : élaboration d’une stratégie de communication pour le site des étangs et marais des salins de Camargue (2020)

Thu, 10 Sep 2020 17:25:36

de Lucie Pichot
[S.l.] : Université d'Aix-Marseille, 2020, 83

Plus vaste zone humide de France, la Camargue est sujette à des pressions humaines considérables. Ce territoire, sous l’influence de l’eau, est en constante évolution. Les zones humides sont devenues des espaces à enjeux et des espaces sources de conflits entre acteurs, pour la maitrise de leur accès et de leur gestion. Ce sont notamment, ces conflits d’usage qui semblent être à l’origine des tensions sociales et qui ont produit le paysage actuel de la Camargue. Le site des EMSC (Etangs et Marais des Salins de Camargue), est un bon exemple pour se rendre compte de la complexité de la gestion d’un espace naturel où les usages sont multiples. Valoriser et faire comprendre les enjeux et les mesures de gestion mises en œuvre sur le site aux acteurs locaux sont des actions primordiales pour appréhender les conflits. Construire un plan stratégique de communication dont l’objectif est de favoriser les échanges entre les acteurs est un processus de médiation complexe. La médiation n’a pas pour objet de résoudre les conflits, mais d’accompagner les différents acteurs impliqués localement à se concerter et à construire ensemble. La place du médiateur en territoire conflictuel se doit d’être modelable et réfléchie tout au long de ce processus de concertation. La Camargue étant un territoire changeant, la médiation se doit d’appréhender les origines des conflits afin d’atténuer les tensions entre les Hommes et entre l’Homme et son environnement.

Modélisation démographique et mouvements des Goélands leucophées de Camargue (2020)

Fri, 4 Sep 2020 12:01:04

de Charly Souc
2020, 46

Le Goéland leucophée (Larus michahellis) est une espèce commune sur la côte méditerranéenne, bien adapté à la présence de l'Homme, et qui peut être porteuse de toute une série d'agents infectieux, dont certains préoccupants pour la santé publique. La compréhension de ces mouvements peut fournir des informations essentielles pour prévoir le risque d’infection et l'émergence des maladies. Cette étude vise à caractériser les mouvements de cette espèce en utilisant un modèle capture-marquage-recapture multi-états. Les données comprennent les histoires de capture de 396 poussins marqués à l'envol en 2002 et 2003 dans une colonie de Camargue. Nos résultats confirment que les jeunes individus ont une probabilité de survie plus faible que les oiseaux plus âgés, mais aussi que ces jeunes ont une plus grande mobilité, avec un déplacement estimé à 45 % de la colonie natale vers des lieux éloignés en Méditerranée ou le long de la côte atlantique, contre environ 20 % chez les oiseaux plus âgés. Ces déplacements peuvent homogénéiser les agents infectieux chez cette espèce sur de grandes échelles spatiales. Afin de disposer d'informations plus détaillées sur les tendances temporelles et spatiales des mouvements et sur la manière dont ils peuvent impacter la transmission des agents infectieux, des données supplémentaires provenant d'autres colonies sont désormais nécessaires. /
The yellow-legged gull (Larus michahellis) is a common seabird species around the Mediterranean coast, well adapted to exploit human-associated resources. As this species can carry a range of infectious agents, some of specific public health concern, understanding its movement ecology can provide essential information for predicting disease risk and pathogen emergence. This study aims to characterize movement in this species using a multi-state mark- recapture modeling framework. The data include the encounter-histories of 396 chicks marked at fledging in 2002 and 2003 at a colony in the Camargue, south of France, and resighted for 10 years. Our results confirm that young individuals have a lower survival probability than older birds, but also that these young birds have greater mobility, with an estimated 45% moving from the natal colony to distant locations in the Mediterranean or along the Atlantic coast compared to ~20% in older birds. This long-range movement may homogenize infectious agents in this species across large spatial scales. In order to have more detailed information on general temporal and spatial trends in movement, and how these patterns may impact pathogen transmission, additional data from other colonies is now required.

Comment évaluer concrètement le succès de restauration des mares temporaires méditerranéennes en prenant en compte la variabilité spatio- temporelle des écosystèmes et leurs trajectoires potentielles sous l’influence des changements globaux ? (2020)

Thu, 3 Sep 2020 11:04:32

de Christian Marquis
2020, 93

Le but de cette étude est de construire une méthode pour évaluer le succès de la restauration/création des écosystèmes en prenant en compte leur variabilité spatio-temporelle et leurs trajectoires potentielles sous l’influence des changements globaux. Nos modèles biologiques sont les écosystèmes aquatiques temporaires méditerranéens doux à saumâtres en Camargue (sud de la France). Nous avons étudié 27 mares temporaires préservées de l’anthropisation. Ces 27 mares constituent une gamme d’écosystèmes de référence. Dans le même temps, nous avons étudié 29 mares artificielles creusées au XIXe, XXe et XXIe siècles. Un ensemble de relevés de terrain floristiques et mésologiques ont été réalisés, afin d’explorer la variabilité des mares de référence et des mares artificielles. L’échantillonnage a été mené au cours de différentes saisons et sur deux années, afin de prendre en compte aussi bien la variabilité interannuelle qu’intra-annuelle. Des analyses statistiques multivariées nous ont permis de classer les mares du panel de référence, en fonction de leurs communautés végétales, au sein d’une typologie intégrant leur variabilité. La distance entre chaque mare artificielle et le panel de référence a été évaluée par deux indices représentant respectivement le recouvrement végétal et la composition spécifique. Ces deux indices ont été synthétisés par un indicateur unique : le « coefficient d’éloignement ». L’interprétation de la valeur de ce coefficient a permis de répondre à la question de l’impact de l’âge de la création de la mare artificielle sur sa distance à la gamme de référence. Enfin, nous avons étudié les facteurs environnementaux conditionnant le plus ou moins grand éloignement d’une mare artificielle par rapport à la gamme de référence.

Etude de la biodiversité des milieux agricoles camarguais au regard des pratiques phytosanitaires et du paysage (2019)

Tue, 10 Sep 2019 17:26:24

de Pierre Mallet
Montpellier : Université de Montpellier, 2019, 50

Une part importante de la biodiversité est aujourd’hui menacée. Celle des oiseaux dans les milieux agricoles l’est particulièrement à cause de l’utilisation de produits phytopharmaceutiques (PPP) et de la simplification des paysages agricoles. L'auteur étudie les liens entre ces deux variables et la fréquentation des parcelles agricoles par les oiseaux en Camargue, où de nombreux oiseaux d’intérêts communautaires fréquentent les agroécosystèmes.
Pour ce faire, l’auteur a analysé les données récoltées lors du projet Farmland où les oiseaux des parcelles de riz et de blé dur ont été échantillonnés en 2013. L’utilisation de modèles à effets mixtes permet d’étudier les variables d’intérêt, ici l’indice de fréquence de traitement phytosanitaire (IFT) et la proportion de milieux semi-naturels et d’infrastructures agroécologique (IAE) dans le paysage. Grâce à ces analyses, une diminution de la richesse spécifique des oiseaux dans les parcelles de riz avec l’augmentation de l’IFT a été mise en évidence. Cela peut s’expliquer par l’impact qu’ont les pesticides sur les réseaux trophiques en diminuant la ressource alimentaire. L'auteur a également mis en évidence une augmentation de la diversité et de la richesse spécifique des oiseaux avec la proportion de milieux semi-naturels et d’IAE dans le paysage. Cette tendance s’explique par le rôle de zones refuges exercé par ces milieux. Ceux-ci vont réussir à atténuer l’impact négatif des PPP car pour des IFT faible, les parcelles implantées dans des paysages avec de nombreux milieux semi-naturels vont garder une abondance en oiseaux élevée.

Dynamiques des hôtes intermédiaires et des hôtes définitifs impliqués dans les trématodoses en Camargue (2019)

Mon, 9 Sep 2019 17:29:31

de Clémentine Leroy
Montpellier : Université de Montpellier, 2019, 33

Ce travail s’inscrit dans un projet sur les risques épidémiologiques de la fasciolose et autres trématodoses dans un contexte de biologie de la conservation et de perturbations anthropiques, initié depuis quelques années (Sabourin, 2018) et dont les acquis et les suivis permettent de répondre à des problématiques prégnantes dans le système camarguais. Dans le cadre de ces problématiques globales, le stage vise à (1) étudier l’écologie parasitaire des trématodes au sein de l’hôte définitif bovin, sur cette base, (2) identifier les habitats regroupant les conditions favorables pour abriter les mollusques d’eau douce impliqués dans la transmission des trématodes, (3) caractériser les dynamiques spatio-temporelles des populations de ces mêmes mollusques.
Pour ce faire, l'auteur a combiné un échantillonnage systématique des parasites du foie lors des abattages des bovins et un suivi de la dynamique des communautés de mollusques d’eau dans des zones hydrologiquement différentes.

Réhabilitation expérimentale de mares temporaires méditerranéennes par gestion hydraulique : état initial des communautés végétales des mares cibles et témoins (2019)

Tue, 3 Sep 2019 15:49:42

de Ékatérina Mutalapova
[S.l.] : Université de Perpignan Via Domitia, 2019, 34

Cette étude visait à établir l’état initial des communautés végétales de mares temporaires en amont d’un projet de réhabilitation dont l’objectif est de tester un nouveau mode de gestion hydraulique. Un plan d’échantillonnage, concernant six mares temporaires actuellement gérées pour la chasse, avait été mis en place en concertation avec les chasseurs. Ce plan avait été établi sans tirage aléatoire mais en définissant trois mares en tant que réplicats tests et les trois autres en tant que réplicats témoins. En se basant sur les données de relevés floristiques in situ et d’étude de la banque de graines du sol, nous avons évalué la variabilité entre ces mares et montré que le plan actuel n’équilibre pas les réplicats entre les traitements ; nous proposons un plan d’échantillonnage alternatif. Ensuite, nous avons comparé la végétation « potentielle » de la banque de graines à la végétation exprimée sur le site. Les différences significatives existant entre ces deux types de végétation soulignent l’intérêt de suivre la banque de graine au cours du projet de réhabilitation. Enfin, nous avons comparé les communautés végétales présentes à celles qui caractérisent les mares temporaires méditerranéennes d’après la littérature. Nous montrons alors l’existence d’un impact négatif de la gestion cynégétique appliquée jusqu’à présent sur la conservation des communautés végétales patrimoniales. / The object of this study was to establish the initial state of the plant communities of temporary ponds before the settlement of a habitat rehabilitation project, which aimed to test a new mode of water management. A sampling scheme, concerning six ponds currently managed for waterfowl gaming, has been designed in accordance with hunters but without randomisation. However, this scheme defined three of these ponds as tested replicates and the three others as control. Based on the data collected from field floristic surveys and from a soil seed bank study, we assessed the variability in plant communities between the ponds. We show that replicates are not properly balanced between treatments and propose an alternative scheme. Then, we compared the “potential” vegetation of the seed bank to the “real” vegetation of the field surveys. The significant differences between these vegetations highlight the importance of monitoring the seed bank along the rehabilitation project. Finally, we compared the observed communities to those of Mediterranean temporary ponds described by the literature. This allowed us to underline the negative impact of gaming water management on the conservation of heritage plant communities.

Effet de la salinité sur les traits d’histoire de vie des larves et adultes de deux espèces d’Odonates : Lestes macrostigma et Lestes sponsa (2019)

Tue, 3 Sep 2019 15:36:08

de Tamara Antonini
[S.l.] : Université d'Aix-Marseille, 2019, 47

Dans un contexte d’écologie évolutive nous cherchons à comprendre pourquoi L. macrostigma, une espèce de demoiselle (Zygoptera) inféodée aux milieux saumâtres arrivent à se développer dans des milieux d’eaux douces. Différents traits d’histoire de vie sont étudiés sous l’influence de la salinité et comparés à une espèce congénère L. sponsa. De l’éclosion ah l’émergence, 830 individus sont suivis et nourris le long d’un gradient de salinité. Nous mesurons chez les larves la survie, la vitesse de croissance, la durée de développement ; chez les adultes, la taille et la masse à l’émergence, le succès d’émergence et de vol. Les résultats ont montré que L. macrostigma est capable de supporter de grande variation de salinité ce qui justifie un caractère d’espèce euryèce et son occupation dans des niches réalisées variées. La salinité a eu un effet sur la survie et le développement, d’autres mécanismes physiologiques/morphologiques seraient à étudier par la suite. / In a context of the ecological evolution, we are trying to find out why L. macrostigma, a species of damselfish (Zygoptera) that is subservient to brackish environments, is also able to grow in freshwater environments. Various features of intrinsic life history are studied under the influence of the salinity and compared to a congenic L. sponsa species. From hatching to emergence, 830 individuals are monitored and fed along a salinity gradient. We measure in larvae survival, growth rate, larval development; in adults, size and mass at emergence, emergence and fly success. The results have shown that L. macrostigma can withstand large variations in salinity, which justifies a Euryec species and its occupation in various niches. Salinity has had an effect on survival and development. Other physiological / morphological mechanisms would be studied later.

Etude de l'influence de l'ordre d'arrivée des espèces dans une communauté végétale sur le germination, la survie et la croissance d'une plante invasive problématique en France (Ambrosia artemisiifolia) (2019)

Tue, 3 Sep 2019 12:05:00

de Nathan Haveneers
Avignon : Université d'Avignon, 2019, 25

Les espèces invasives sont nombreuses en France et sont à l’origine de nombreux problèmes économiques, écologiques ou encore sanitaires, et font l’objet de nombreuses études. Ce rapport est écrit dans le cadre d’une expérience qui vise à étudier l’impact de l’ordre d’arrivée des espèces dans une communauté végétale sur la production de biomasse végétale de cette communauté, et est-ce que cette production de biomasse à un effet sur le succès d’invasion (installation, croissance et survie) d’une espèce invasive problématique en France : Ambrosia artemisiifolia. Pour réaliser cette étude, six types de communautés végétales sont mises en place, au sein desquelles certaines espèces sont semées en avance par rapport aux autres. Les espèces natives choisies pour constituer les communautés sont : Lolium perenne, Dactylis glomerata, Trifolium repens, Onobrychis viciifolia, Plantago lanceolata et Poterium sanguisorba. Aucunes différences significatives n’ont été obtenues entre les communautés pour la germination et la mortalité d’A. artemisiifolia, en revanche des différences significatives pour la production de biomasse racinaire et aérienne sont observées entre les différentes communautés végétales. La croissance de A. artemisiifolia (nombre de feuilles et longueur de la plus grande feuille) semble être réduite par les communautés dans lesquelles L. perenne a été semée en avance, cette communauté ayant produit la biomasse racinaire la plus importante. A. artemisiifolia semble également avoir une croissance ralentie au sein des communautés où toutes les espèces ont été semée en même temps et qui ont produit la biomasse aérienne la plus importante au moment du semis de l’espèces invasive.

Impacts de la gestion de l'eau en Camargue sur les services écosystémiques (2019)

Tue, 3 Sep 2019 11:29:54

de Mélanie Trémoureux
[S.l.] : Université d'Aix-Marseille, 2019, 40

Cette étude se focalise sur le socio-écosystème méditerranéen de la Camargue : Ici, la riziculture, par son apport conséquent en eau douce, pourrait contribuer activement à la conservation de la biodiversité et aux services écosystémiques associés. À travers cette étude, nous avons identifié un ensemble de 16 services écosystémiques afin de déterminer l’impact d’une réduction de l’eau douce sur l’ensemble du socio-écosystème de la Camargue. Les méthodes appliquées incluent le développement d’une représentation visuelle de chacun des services, une recherche bibliographique approfondie, une phase d’échange avec 16 experts scientifiques et techniques dans différents domaines et une phase d’entretiens avec huit acteurs locaux visant à valider les représentations de ces services et à étudier les évolutions de ces derniers dans le contexte de notre scénario.
Cette étude a permis d’identifier et visualiser les flux de services et les éléments principaux (biophysiques, bénéficiaires et responsable de gestion) dont ils dépendent. Les résultats démontrent que la plupart des services sont liés en s’appuyant sur des éléments communs pour leur flux. Ceci démontre bien la complexité du socio-écosystème camarguais. Cette complexité est la source et le facteur moteur de la richesse culturelle et de la biodiversité qui se trouve actuellement en Camargue.

Evaluation de la connectivité hydrobiologique entre le milieu marin et le complexe lagunaire du Vaccarès via les étangs et marais des salins de Camargue (2019)

Tue, 3 Sep 2019 11:03:47

de Maude Parent
Rennes : Agrocampus ouest, 2019, 37

En plein coeur du parc naturel régional de Camargue dans le Sud de la France, d'anciens salins rachetés par le Conservatoire du littoral, les Étangs et Marais des Salins de Camargue (EMSC), constituent actuellement une zone en cours de restauration pour retrouver un fonctionnement plus naturel et jouer à nouveau un rôle tampon face aux tempêtes de la mer et à l'érosion du territoire. Plusieurs séries de travaux hydrologiques sont menées depuis les années 2010 afin d'améliorer les écoulements et faciliter les échanges biologiques entre la mer au sud et l'hydrosystème du Vaccarès au nord. Afin d'évaluer l'efficacité de ces travaux et le degré de connexion entre la mer et le système du Vaccarès via ces EMSC, un suivi mensuel de la macrofaune aquatique a été réalisé d'octobre à juin pendant 3 ans — de 2016 à 2019 - en différents points de ce vaste territoire. L'objectif de ce stage est de développer une méthodologie pour caractériser la connectivité écologique pour les poissons à écailles (actinoptérygiens) et de qualifier et quantifier les potentiels obstacles à la circulation. Différents taxons ont été sélectionnés en se basant essentiellement sur leur utilisation écologique des systèmes lagunaires, leur tolérance à la salinité et leur capacité de nage : une espèce sédentaire supportant70g/tsalinités allant jusqu'à 70g/L, l'athérine (Atherina boyeri), et les juvéniles de 4 taxons migrateurs marins aux caractéristiques biologiques et écologiques contrastées, la civelle (Anguilla anguilla), la dorade royale (Sparte' aurata), la sole commune (Solea solea), et les muges (Liza spp et Mugli cephalus). Une première approche a consisté à catégoriser les conditions hydrologiques et physico-chimiques mesurées en continu à différents ouvrages de connexion afin de caractériser si elles permettent théoriquement le passage des taxons présélectionnés. Dans la deuxième approche, des modèles linéaires généralisés mixtes ont été utilisés pour identifier et quantifier l'influence de différentes covariables abiotiques sur les captures de pêche, considérées en présence/absence — distribution binomiale — ou en CPUE supérieure à zéro — distribution log-normale. Ces deux approches mettent en évidence des points de blocage spatiaux et temporels liés à une conductivité (salinité) trop élevée et, en moindre mesure, à des conditions hydrologiques et météorologiques trop intenses (température, tempête) ou trop faibles (assèchement).

Contamination plasmatique chez la Cistude d'Europe dans une zone humide méditerrannéenne (2019)

Mon, 24 Jun 2019 16:56:35

de Louisiane Burkart
Montpellier : Université de Montpellier, 2019, 24

La dégradation des zones humides et l’incidence sur les organismes sont des sujets d’actualité car il s’agit d’écosystèmes menacés subissant de multiples pressions anthropiques. Pour déterminer les niveaux de contamination et l’exposition actuelle des organismes, cette étude propose d’étudier la contamination plasmatique d’une espèce « sentinelle » en Camargue, la cistude d’Europe, par les polluants organiques persistants (POPs) historiques (polychlorobiphényles et pesticides organochlorés) et au N,N-Diéthyl-méta-toluamide (DEET), une substance actuellement utilisée dans les répulsifs anti-moustiques. Nous avons examiné si la concentration et l’occurrence des polluants dans le plasma dépendent des caractéristiques des tortues (sexe, âge, stade croissance), de la période d’échantillonnage et du site de capture. Des prises de sang sont réalisées chez des tortues issues de populations suivies depuis plus de 20 ans au sein de la Réserve Naturelle de la Tour du Valat. Les dosages de polluants sont faits dans des extraits purifiés de plasma à l’aide d’une chromatographie en phase gazeuse et spectrométrie de masse en tandem. Nous observons une différence significative de contamination entre les sites de capture et une corrélation négative de la concentration générale avec l’âge. On ne détecte globalement pas de différence entre mâles et femelles. Les POPs sont retrouvés à l’état de trace et, pour la plupart, en dessous des limites de quantification. Seul le DEET atteint des concentrations élevées (535 ng/mL). Au vu de ces résultats, les prospections de la contamination du plasma des cistudes devraient approfondir la piste du DEET et se concentrer sur des pesticides actuellement utilisés./
The degradation of wetlands and the incidence on organisms are topical issues because wetlands are threatened ecosystems affected by multiple anthropic pressures. To determine the contamination levels and the current exposition of organisms, this study proposes to study the plasmatic contamination of a “sentinel” specie in Camargue, the European pond turtle, by historic persistent organic pollutants (POP) (polychlorobiphenyls and organochlorine pesticides) and by N,N-Diéthyl-méta-toluamide (DEET), a substance currently used in mosquito repellents. We examined if the concentration and the occurrence of pollutants in plasma depends on turtles’ characteristics (gender, age, growth stage), the sampling period and the capture site. Blood samples taken on turtles coming from populations followed for more than 20 years within the Natural Reserve of the Tour du Valat. The dosages of pollutants made in purified plasma extracts obtained by gas chromatography and tandem mass spectrometry. We observe a significant difference of contamination between capture sites and a negative correlation of the global concentration with the age. Difference between male and female is not globally detected. The POP are found as traces and, mostly, under the limits of quantification. Only the DEET reaches high concentrations (535 ng/mL). Following these results, researches of contamination of the turtles’ plasma should explore DEET issues and should focus on currently used pesticides

Influence de l'ordre d'arrivée des espèces dans une communauté végétale sur la résistance à l'invasion (2019)

Mon, 24 Jun 2019 16:19:01

de Benoit de Freitas
[S.l.] : Université de Lille, 2019, 27

Malgré des efforts de prévention et de lutte, le nombre de plantes exotiques envahissantes est en constante augmentation, traduisant un manque d’efficacité des méthodes de contrôle et d’éradication actuelles. Après une perturbation, il est de plus en plus préconisé de restaurer activement un couvert végétal de façon à limiter l’établissement d’espèces exotiques envahissantes. Bien que divers mécanismes contribuent à la résistance à l’invasion, on en sait encore peu sur les effets de priorités générés par l’ordre d’arrivée des espèces dans les communautés végétales. Dans une expérience en serre, nous avons établi des communautés indigènes qui diffèrent par l’ordre d’arrivée des espèces, l’espèce installée en premier ayant quatre semaines d’avance sur le reste de la communauté. Deux semaines après l’établissement de l’ensemble de la communauté, une espèce exotique envahissante commune en France (Ambrosia artemisiifolia) a été introduite. Le succès de son installation, évalué par un suivi de la germination et de la croissance des feuilles, a été évalué en fonction du type de communauté receveuse. Modifier l’ordre d’arrivée des espèces indigènes a impacté la structure des communautés, en terme de contribution des différentes espèces, sans incidence majeure sur la production de biomasse totale de la communauté. Ces différences de structure n’ont pas impacté le taux de germination de A. artemisiifolia mais ont eu une influence sur son développement. Il semblerait en effet que lorsque les Fabaceae s’installent en premier dans un milieu, la communauté limite plus faiblement le développement de A. artemisiifolia qui présente une longueur de feuilles plus importante. Cependant, il est nécessaire d’attendre la fin de l’expérimentation afin d’obtenir davantage de résultats et de pouvoir observer l’influence du développement des communautés dans le temps, les premiers jours n’étant peut-être pas décisifs pour la résistance à l’invasion. /
Despite prevention and control efforts, the number of invasive plants is constantly increasing, reflecting a lack of effectiveness of current control and eradication methods. After a disturbance, it has been increasingly advocated to reassemble a resistant plant community. While many mecanisms contribute to invasion resistance, little is known about priority effects generated by the order in arrival of species in a plant community. In a greenhouse experiment, we established communities that differed in the order of arrival of native species. The first established species had a month ahead of the rest of the community. Three weeks after the establishment of the entire community, an invasive alien species common in France (Ambrosia artemisiifolia) was introduced. The success of its installation, evaluated by monitoring germination and leaf growth, was evaluated according to the type of recipient community. Changing the order of arrival of native species has impacted the community structure, in terms of the contribution of the different species, with no major impact on the total biomass production of the community. These differences of structure do not impact the germination rate of A. artemisiifolia but influenced its development. When Fabaceae are established first, the community limits less the development of A. artemisiifolia which shows a greater leaf length in these communities. However, it is necessary to wait until the end of the experiment in order to obtain more results and to be able to observe the influence of the development of the communities over time, perhaps the first days being not decisive for invasion resistance.

Modélisation du devenir des virus Influenza A au sein des zones humides : coupler hydrodynamique et épidémiologie (2018)

Mon, 3 Feb 2020 17:39:09

de Hélène Baudel
Toulouse, France : Université Paul Sabatier, 2018, 29

Les oiseaux sauvages sont le principal réservoir des virus influenza A (VIA) et peuvent les transmettre aux volailles d’élevage, chez lesquelles certaines souches hautement pathogènes entraînent des pertes économiques considérables. La connaissance de la transmission et de la persistance des VIA dans le milieu naturel demeure lacunaire. Nous avons développé un modèle mathématique qui tient compte à la fois de l’épidémiologie des VIA chez leurs hôtes et de leur circulation et persistance dans l’eau. Les paramètres sur lesquels se base notre modèle sont les effectifs de colverts et leur distribution, les volumes d’eau, les températures et salinité de l’eau et la prévalence d’infection virale dans la région Camargue, site majeur d’hivernage pour les oiseaux sauvages. L’originalité du modèle est la précision spatiale et temporelle avec laquelle notre système, l’hydro-système Vaccarès, est décrit. Les résultats suggèrent que la voie de transmission qui influe majoritairement sur la dynamique d’infection sur notre site d’étude est la voie oro-fécale via l’ingestion d’eau contaminée par des fèces de canards infectés. Quelques zones spatialement réduites expliquent la plupart de la dynamique de transmission sur le site, associant effectifs importants et concentration de virus élevée. Les flux d’eau ainsi que les conditions de température et de salinité de l’hydrosystème, extrêmement variables, influent de façon notable sur la dynamique de transmission. Ces résultats soulignent l’importance d’intégrer le compartiment aquatique à la surveillance de la circulation du virus au sein des populations d’oiseaux sauvages afin d’optimiser la détectabilité du virus.

Etude de la variabilité temporelle de l’écologie trophique du silure glane (Silurus glanis) et de l’anguille européenne (Anguilla anguilla) dans un canal de drainage en Camargue (2018)

Tue, 25 Sep 2018 14:36:13

de Stéphane Mutel
Tours (France) : Polytech Tours, 2018, 35

La présente étude se propose d’analyser la variation temporelle de l’écologie trophique du silure et de l’anguille dans un canal de drainage en Carmargue. Tout au long de l’année 2017, les poissons du canal ont été échantillonnés afin d’obtenir leurs ratio isotopiques. A partir des ratios isotopiques nous avons pu évaluer la variabilité des niches trophiques et des régimes alimentaires du silure et de l’anguille, en fonction des saisons et des classes de tailles. Les analyses relèvent une compétition trophique importante sur les écrevisses de Louisiane entre les deux espèces. La mise en place d’un plan de régulation du silure sur une portion du canal en 2009 permet d’envisager un impact indirect d’une densité élevée de silure sur les anguilles. Ces derniers pourraient entrainer la modification du comportement alimentaire des anguilles. Ces observations seront à vérifier à l’aide des données de 2018, incluant notamment un échantillonnage plus large et se basant sur une année humide contrairement à l’année 2017 qui fût particulièrement sèche.

Etude de la situation des mares littorales temporaires des anciens salins de Camargue à travers l’analyse de leur occupation par une espèce d’amphibien (2018)

Fri, 14 Sep 2018 16:16:47

de Aurore Fayard
[S.l.] : Université de Montpellier, 2018, 53

Le site des anciens salins de Giraud (Bouches-du-Rhône, France) est en cours de renaturation depuis l’arrêt de l’exploitation salicole. L’ouverture de brèches de plus en plus longues dans les digues artificielles, amène les lagunes à être reconnectées à la mer. Le Crapaud calamite (Epidalea calamita) est une des espèces du patrimoine les plus à même d’être directement affectées par ces modifications, car elle se reproduit dans des mares littorales temporaires potentiellement soumises au risque de salinisation. Afin d’évaluer cette vulnérabilité, les données sur les caractéristiques physiques de ces mares ainsi que la présence de reproduction du crapaud (méthode site occupancy) ont été analysées. Durant quatre ans, 50 parcelles d’un hectare ont été prospectées au cours de trois passages couvrant le printemps. Plus de la moitié des mares échantillonnées en 2015 ont accueilli des populations reproductrices dans les massifs dunaires de Beauduc. Le taux de détection de l’espèce sur le site au début du printemps est estimé entre 0.58 et 0.87, cependant, les observations suggèrent que le succès de reproduction est anecdotique. De faibles précipitations annuelles sont observées durant cette même période, et des épisodes de submersions marines semblent faire monter les niveaux d’eau des lagunes et saliniser les mares. L’occurrence de ces phénomènes et leur aggravation, dans un contexte de changement climatique et d’élévation du niveau marin, rendent incertain l’avenir de la population sur cette frange littorale./
The old salt pans of Giraud (Bouches-du-Rhône, France) are under renaturaturalization since the halting of saline exploitation. Recent breaches in artificial dyke are likely to reconnect lagoons to the sea. The Natterjack toad (Epidalea calamita) is a heritage species that is most likely going to be directly affected by such modifications due to the fact that it breeds in the temporary coastline ponds potentially exposed to a risk of salinization. In order to assess this vulnerability, physical parameters of these ponds and reproduction data (site occupancy method) have been analysed. For four years, 50 one-hectare patches have been surveyed three times during spring. More than half of the ponds host reproductive populations in Beauduc’s dune landscapes. The detection probability of the species on the site in the beginning of spring is estimated to be between 0.58 and 0.87, however observations suggest a low breeding success. We have witnessed low annual precipitation rates and it seemed that rising water levels in lagoons are resulting from marine input which seems to increase the ponds’ salinity. The future of the species population is uncertain on this coastline in the context of climate change and sea level rise, and will depend on the occurrence and amplitude of these phenomena.

Suivi de la macrofaune benthique et évaluation de l'état écologique des milieux lagunaires des anciens salins de Camargue (2018)

Fri, 14 Sep 2018 15:22:21

de Baptiste Segura
[S.l.] : Université de Lorraine, 2018, 59

Le projet LIFE + MC-SALT est un programme européen visant à renaturer l’espace naturel que sont les étangs et marais des salins de Camargue, longtemps exploités pour la saliculture et fortement dégradés. Ce projet donne suite au rachat en 2012 de 6500ha de salins par le Conservatoire du Littoral, qui a vocation à sauvegarder ces milieux. Une série de travaux fait en 2014 et 2015 ainsi qu’une gestion des digues volontairement passive, a permis d’augmenter les connexions entre les lagunes. Deux précédentes campagnes de suivi de la macrofaune benthique en 2015 et 2016 ont été effectuées et montraient déjà une amélioration de la qualité de l’eau et des peuplements au cours des années. En 2018, cette tendance se confirme avec certaines stations atteignant de très bonne qualité d’eau lors de l’utilisation du M-AMBI, ou lors de l’évaluation du confinement. Toutefois, certaines lagunes ont l’air toujours peu reliées à la mer et à l’hydrosystème en général, ce qui encourage la seconde phase de travaux prévue fin 2018, qui devrait aider au déconfinement de ces lagunes au Nord, et permettre le renforcement de l’axe Etang de Vaccarès/Mer. C’est un axe de migration important pour les juvéniles de poissons et notamment pour l’anguille, qui trouvent dans cet hydrosystème, une zone de repos et de croissance./
The LIFE + MC-SALT project is a European program designed to restore the natural environment of the Etangs et marais des salins de Camargue (lakes and salt marshes of the Camargue), which have long been used for salt evaporation, and thus, are severely degraded. This project follows the 2012 purchase of 6,500 hectares of salt works by the Conservatoire du Littoral, an organization which aims to safeguard these environments. A series of restoration projects in 2014 and 2015, as well as voluntary passive dike management, have increased connections between the lagoons. Two previous benthic macrofauna monitoring campaigns in 2015 and 2016 were carried out and there has already been an improvement in water quality. In 2018, this trend continues with some stations achieving very good water quality when using the M-AMBI index, or when assessing containment. However, some lagoons still have little connection to the sea and the rest of the hydrosystem. Accordingly, the second phase of work planned for the end of 2018 aims to increase connections to the lagoons in the North and allow the strengthening of the Vaccarès lagoon/Mediterranean sea axis. This is an important migration route for juvenile fish, and especially for the European eel, which use this hydrosystem as an area of rest and growth.

Cartographie des habitats naturels sur le domaine de la Tour du Valat (2018)

Fri, 14 Sep 2018 09:35:04

de Amélie Granger
Toulouse, France : Université Paul Sabatier, 2018, 62

La mission a consisté en la réalisation d’une nouvelle carte des habitats naturels sur l’ensemble du domaine de 2545 hectares de la Tour du Valat, quatorze ans après la précédente en fonction des typologies réglementaires existantes : Natura 2000 et EUNIS. Utilisée comme référence depuis 2004 il paraissait nécessaire d’actualiser le travail de cartographie et de faire l’état des lieux actuels des végétations du domaine. L’objectif final étant de mettre à disposition des gestionnaires un outil d’aide à la décision pour les accompagner dans la préservation des milieux naturels à enjeux aussi bien que dans des actions de protection et de gestion. Combinant relevés de terrain, outils informatiques récents et photo-interprétation d’orthophotographies l’étude a permis de mettre à jour les connaissances sur les habitats naturels.
L’objectif principal du stage était de proposer et tester une méthodologie de cartographie et d’inventaire des habitats s’appuyant sur les outils de segmentation. Le processus de segmentation de la BD-Ortho 50 cm a consisté à regroupé dans des segments les pixels adjacents qui présentent des caractéristiques spectrales similaires. Développés dans le cadre du projet SWOS (The Satellite-based Wetland Observation Service), les outils du logiciel de télédétection de la cartographie des zones humides GEOclassifier ont été utilisés pour établir autant que possible une carte cohérente, détaillée et actuelle des habitats naturels sur la Tour du Valat.
Les milieux camarguais sont complexes et très hétérogènes. Ils sont gouvernés essentiellement par deux paramètres, le recouvrement en eau au cours de l’année et le taux de salinité. Une comparaison des surfaces des habitats a été réalisée avec les travaux de 2004 et 2018. Elle a permis d’évaluer qualitativement l’intérêt et les limites de la méthode de cartographie utilisée ou encore les évolutions réelles du terrain.

A dark future? The spread and genetic variation of the Dark Spreadwing , Lestes magrostigma (2017)

Wed, 25 Oct 2017 10:35:44

de Nils Krause
Hanover : Gottfried Wilhem Leibniz University, 2017, 22 p.

The loss of biodiversity is a much-discussed issue. Due to climate change and anthropogenic influence, the earth is confronted with the event of mass extinction. Species and nature conservation gain consequently more in relevance and necessity. This study establishes the population structure, spread and genetic variation of the endangered damselfly Lestes macrostigma. Based on markers of the mitochondrial cytochrome oxidase I, the analyses of 164 individuals from 31 different sample sites and ten different countries display the relevance of habitat quality and connectivity for genetic diversity. Furthermore, the results reveal the genetic impoverishment of the Dark Spreadwing and it geographical distribution pattern. Besides, two mitochondrial DNA markers (barcodeC01 and OdoC01) and one nuclear ribosomal DNA marker were compared to each other. Consulting the comparison of the three different markers, this study illustrates: (i) an east-west clustering of the generated haplotypes, (ii) that geographical barriers have more impact on gene flow than geographical distances, exclusively, (iii) that the combination of the barcodeC01 and OdoC01 presents higher resolution than one marker per se and (iv) that character-based barcoding allows to identify the geographical locations or clusters of haplotypes. Since the decreasing trend of population size, further research on lestes macrostigma is highly recommended.

Suivi démographique à long terme d'une population de Cistudes d'Europe (2017)

Wed, 25 Oct 2017 10:01:44

de Maëlys Marage
Avignon : IUT Génie biologique, 2017, 40 p.

La Cistude d'Europe figure parmi les espèces de reptiles les plus menacées en Europe. Cette tortue d'eau douce, à forte valeur patrimoniale, connait depuis plusieurs siècles une forte régression dans l'ensemble de son aire de répartition. Elle est de ce fait intégralement protégée en France depuis 1979. La Tour du Valat, Institut de recherche pour la Conservation des zones humides méditerranéennes, a mis en place un suivi à long terme par Capture-Marquage-Recapture (CMR) sur cette espèce en Camargue. Pour ce faire, deux sites caractéristiques d'habitats fréquentés par les Cistudes ont donc été sélectionnés sur le domaine de la Tour du Valat : le site de l'Esquineau et le site des Faïsses. Le suivi mis en place depuis 1997, permet d'étudier la dynamique des deux noyaux de population présents au sein de ces derniers sites. Depuis 2015, une zone dénommée, le site du Rendez-Vous, située entre le site de l'Esquineau et celui des Faïsses est également échantillonnée. Le site du Rendez-Vous semble ainsi être une zone de déconnexion entre les deux noyaux de population présents au sein de la Tour du Valat. Ce travail a permis de poursuivre le suivi à long terme par l'étude de certains critères démographiques de l'espèce (sexe-ratio, âge-ratio, recrutement de nouveaux individus, dispersion). L'échantillonnage au cours de la période 2017 a également permis de détecter le troisième cas de déplacement d'une femelle ayant changé de noyaux de population. Celui-ci a également permis la découverte de trois cadavres de Cistudes. Il serait donc intéressant dans l'optique de la conservation de la Cistude, d'étudier plus précisément les aspects éco-toxicologiques chez cette espèce à capacité de dispersion limité. La gestion durable de son habitat ainsi que la connaissance des paramètres qui influent sa vulnérabilité représentent des moyens efficaces pour lutter contre la régression de cette tortue protégée.
/The European pond turtle is one of the most threatened reptile species in Europe. Its range has been facing a sharp decline for centuries. Therefore, it has been fully protected in France since 1979. Tour du Valat, as a Research Institute for the Conservation of Mediterranean Wetlands, has set up long-term monitoring by means of Capture-Marking-Recapture (CMR) on this species in Camargue. To this end, two sites, characteristic of habitats frequented by European pond turtle, have been selected on the domain of Tour du Valat, the site of the Esquineau and the site of the Faïsses. The monitoring, implemented since 1997, allows for the study of the dynamics of the two populations of these sites. Since 2015, a new site called the Rendez-Vous, located between the two sites, is also sampled. This site seems to be connecting the two populations on the two other sites. This work allowed long-term follow¬up to continue as demographic criteria of the species such as sex ratio, age-ratio, recruitment of new individuels and dispersion were studied. The 2017 sampling also detected the third case of displacement of a female that changed her original population. It also allowed the discovery of three corpses of European pond turtle. Therefore, it would be interesting to study the eco-toxicological aspects of this species which has a limited dispersion capacity. Sustainable habitat management and the knowledge of parameters that influence its vulnerability are effective ways to combat the regression of this protected turtle.

Gestion de pièges à moustiques pour une évaluation de la nuisance et une estimation des paramètres environnementaux entourant les pièges (2017)

Tue, 24 Oct 2017 16:46:36

de Corentin Rollet
Clermont-Ferrand : IUT Génie biologique, 2017, 22 p.

La Tour du Valat a eu l’idée de mettre en place une barrière protectrice autour des zones habitées grâce à des pièges à moustiques Techno-Bam. L’année dernière, une étude a été menée sur cette nouvelle technique de démoustication. Elle a ainsi révélé une baisse de 82% de la nuisance, un impact quasiment nul sur la faune environnante et pour un prix moins important que pour une démoustication au Bti.
L’étude décrite dans ce rapport met en corrélation le taux de capture des pièges selon différents facteurs environnementaux. Elle a pour objet de déterminer l’influence de ces facteurs sur le pouvoir attractif des pièges. Trois paramètres ont été retenus : l’influence du vent, de l’ensoleillement et du typed’environnement entourant les pièges

Evaluation du plan de gestion des marais du Verdier (2017)

Tue, 24 Oct 2017 16:30:04

de Arnaud Guille
[S.l.] : Université d'Aix-Marseille, 2017, 39 p.

Le moustique du Sambuc (2017)

Tue, 24 Oct 2017 16:07:49

de Yseult De Dreuille
Trois-Rivières : Université du Québec, 2017, 22 p.

To mitigate the nuisance that represents mosquitoes in the Camargue in southern France, the Tour du Valat, in cooperation with the Qista company, has developed trap mosquito repellent. These traps, which attract and capture mosquitoes by releasing CO2 and octenol, have been placed around the village of Sambuc to create a barrier of protection and improve the comfort of the inhabitants. This device reduced the nuisance by a factor of 70% in 2016, this value increasing to 85% The species Anopheles hyrcanus is excluded from the analyzes. The objective of the training course carried out in 2017 was to test the impact of two olfactors used alone or in combination on the catch rate of the different mosquito species, in particular on the effectiveness of the Anopheles device. Octenol has proven to be the most effective olfactory as a rule, the lactic acid compound used for use, including in combination with octenol. Others are expected to be able to improve the performance of the Anopheles traps.